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LotjaGi5g1v0138400.4

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0138400
Transcript ID LotjaGi5g1v0138400.4
Related isoforms 4
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Villin; TAIR: AT2G41740.1 villin 2; Swiss-Prot: sp|O81644|VILI2_ARATH Villin-2; TrEMBL-Plants: tr|K7K9D0|K7K9D0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0138400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:33271014..33298451) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTTTATTTATTTATTTAAATTTTCTTTCCTTCCTTCACATTCCATTTCATTGAGCACGTCGTCGTCATGATATCTCTGCA ACTCGTTTCACTTTCTCTCTGAATTGTAAATCTCAAAAGTCAGAGAGAGAAAGAAAGGTACGTCAATAATTCACTTCCCT TTTCAACTTTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCACACACACACAAACCCATCATCATCACCGCTGAGATCTCAGGTATTGGT CAATTCAATTATCACTCTGGTCAATTCGATTCCACTCTCTTCTGTTAACACTATTTGTAATCTCTGATCCCACTCATTGT TCTGTTATGTGATTCGATGCATTTCTAGTTTGATCTCAAGCTTGTCTGCGTTTACTGTGAATTTCAATTTTTATTTGCTC ATTTGGAGCTTCGATCAATTGTGTTTGCTTTGAAATTTGAGTGAGAAATGGTTGAAGGTGCATTCAACAAACGGTCATGG TAGATCTTACTAGTGTTTATGTGATAACTAATTCTAGTTTTGAATTATTTCTATGTTTTCCTTATTTAATTGTTACTTGA TCCATAGCTCCGATGAAGTAAAACTGTTAAAAAATCAGAGTTTGGATGGAATTTGAAAATATAGAATATTGGAATGCTTT TCCGAGTTGGCTATTCGCAAGTTCTATTTGGGAAATGTTGTATGGTGGAGCACACTTTGGAAGAGCTTATTTGAGTTTAT CTGATAGCATAACCGCTTATGTCAGTGTTTGGAAGAGCTTATGCAAACAGCTTATGGCCTACCATAAGCTGTTTTGAGCT TATTTTCATAAGCTATTCAGGATAGCTTATGAAAAAGAGCTGATGCTTATTAATGTATCAATATCTCTCGGGGCCTTATT TGCTGAAGTCTAATCAGAAATTTAGATGCAGAGCTCTTTACGGCCGCAGTGGTGCTCTTAGTTGCACTATCTGCCTAATT 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TCTGACAAATCTGACACTGCAAATTACGGCCGCGCCCACGGCCGCGTCCACCACCGCGTCCACCAGCAGGATAGCCACCA CGGCCATCGCCTGGTCCACGTGAATCATTCTGGTCATGATAGGTATCACGATTGTCACCAGAATCACGATAATTTGGACG TTGTTGATCATTCCGATAGTCACGTCCACCACGAAATTCAGCAGCATAATTGGCCTGAGACGGCGTCAAATCCACAGAAG GTGGCGGCGTTCGGGAGATCTGAGGTGAAATCGGAGCAGGAACCGATGCGAACGCATGTGTATGCGCAAGCAACGCAGAA GCAGTAGAATCGCTAAGGCTACGTTTCCGTGATCGTTCCAGGCGAGCATCATGAGTAATGATCATCGCTTCGACCTCAGA AATCGTGCTCGAAGAAGCATGAGTGAAGATAATCGTGCTTAAAGCACTATAATCTTCAGGTAAACCATCAAAAATCGCTT CAAGGTGATCGCGAAAACTTACGGGTTCACCAATGGAAACCAGAGTGTTGACGATCGTCTTGATGCGTCGAAGATATTCA GTGATCGACTTCGAACCTTTGGTTATGTTCTTCAGCTCAGATCTGAGCTGAGCAGACTGTGCGCGACACTGATTCTCAAA AAAGTCAAGGATCTCACGCCAAACCTGCGATGATCTCTCGCAGTTGATCACCGTTGGAAGAACAAACGGAGATAGAGTCG TCAAGAGCCATGTAAACACCATGGAATCTTGCTTAATCCAAGTCGTATAAGCTGGATTCTCAGTCGCAGCTACACGATCC TCTTCAGTCAGAAAACGTTGTGGAATTTCTGGATCAACCAGAAAATCATGAAGCTGATGCGATCGAATCGCACCTTCAAC TTGTTGACGCCAAGAATAGAAATTCGAATCATCAAGCTTGATTGTTGCAGTACGAGACAGAGACTCAAGAACATTGACAA CGGAAGCAGGTGCAGCAGCCATGTATCAAGGACCGATTGAAGCTCTGATTACCATGTTAAAATTAGAGAAGCAATGAGAG AGAGAAGAGAGAAATAGAAATATAACAGAAAATGTATTATTGATAATCTGAGTGATTACAGAAGATGTGATATCCTTATA TAGAAGAACAGGAGAATGCCAACAGCTGTAACATACAGCTGACATAAATAGGAGAATACCAACAGCTGACATAAATAGGA GAATACAAACAGCTGCATATGTCAGCTGTCATAACTACTCAAAAGATGATGCAGCAGCATAGTAAATACAAACTCAATGT ACTCTAACATTCAGGTACCGTCATCATTGAATTCCACTGAGTGCTTTCTCCTGCAATCTGGCTCTACAATTTTCATATGG CATGGGAATCAGTCTTCCTTTGAACAGCAGCAGCTAGCAGCAAAGGTCGCTGAATTTTTAAGGGTAAGATCCACTAATCT CGTGTTATGGACGTTCTGTTCAATTTTCCAAGTACTAATATAAAAATTTAAAGCATAACCAAATCTCAGTTTTATGGAAG AAGTTCAACTTTTTCCCTCATGAAAGCTTCATGTTGTTGATAGGCAGATATTAATAATTGGATTCATGTATCTACGGATT CATTTGTGTTGAAATAACAGTAGAAATTGGTAATTAGATTCTCGTACCTATAGGTTCATGAACATAGGAAGTAGCATCCT TGTTAATTATCTCTTAGACATAAGTTTTATTAGCTGTATACATATACACATGAATTTCATTATTAATTCCGTTGCAATTT CCAGCTTTTAAAATTACATCCGGGAATATCTTTATGTTTCTTTAATTAACAGATGAAATTTATTATATAGCATTGGTACT TCTACATTGACTCTTTTTACTGACTTGATTGAACCTAATTGCAATTATTGCATCACTCACAGTTTCCTGAGACTCCTCTT CCTTCTTCTTTCCACTTGTAAATTCAATGATTTTTGTAGCATGAAGATAAAAGAATAGAAGTATTAACATATTTGCTGAT ATGATATATGTTCATGTTCAGCCAGGAGTTGCTTTAAAGCATGCTAAAGAAGGTACAGAAAGCTCAGCTTTCTGGTTTGC ACTAGGAGGAAAACAAAGTTATACAAGCAAGAAAGTTACTAATGAGATTGTTAGAGACCCACATCTGTTTACTTTCTCAT TTAGTAAAGGTAGCATTTCTTTTCATGTTACTTCTAAAAATTTATGCAATAACATGCTATTTACTGCTAGTTTAACTTTA ATATACTGACTGCTATTGATTTTGTTTATTCTTTGTGTTGTGGATCTACCAGGAAAGTTACATGTGAGTTTGAGACTACA ACTTCATTATGCAATACTTCCTTGTCTTCAGGAAATTTCTTCGTCTTTTTGAGGTTCTTTATGTCCTTTAAATCTATTTT TTATATTTTACTCTGCAGGTAGAGGAGGTTTACAACTTTTCCCAAGATGATTTGTTAACGGAGGATATCCTAATACTTGA CACACATGCAGAAGTGTTTATTTGGATTGGTCACTCTGTTGACCCAAAAGAAAAGCAAAATACTTTTGAAATTGGCCAGG TAAACACGCTAAACAATTCACTTTTATTTCCCATATTTCCTCCTACTTGGATTGCTTTATTTATACTAGAAAATTTTCCT CAGAAATACATAGACATGGCTGCATCTCTGGAGGGACTATCTCTGCATGTACCGTTATATAAAGTAACAGAAGGGAATGA ACCTTGCTTTTTCACAACATACTTTTCATGGGATCATGCAAAAGCTTTGGTATGTCTTTGGACATCAAATTGTCCTTTCT CTGGTTTGTTATTTTCTTTTTTAAAAATCGATTGTTCTCACTCTATTCCTTATCTTCAACTGTAAAGTGACAAATATTTG CTTTTCAATGTTGGTTGAGAACAAGACATAATTATTGCCTGACTGGCTGGTTTAGCAAAATATTGTTGTCATCACATATA GATATCCATGATGAGTGAACTCAGAGAGTTTAGAGTAATCCGAGTATACTTATTACTATTCATGAGATCTGATATAAGAG GAATTTATAGTACTACACATGGGTTATGGAATGGATAGTTCGTTATTACTAACATAGCTACAACCAATTCTAACTCAAAC TATCTGTTTGGCTAACAAAACGAAATACAATTGTCAGTGAACAACTGATTTTGTAATACGACATTTGATATGTACACTAT CAACCAAGTAGAAGAGAATCACACACTCTGAGCTTGTTATTAAGAACCAAAAACCAAGTAGAAGAGAGAGCCTTATTGAG AAGATCAGCACATTGATCTTGTGTAGGAATGTGCTGCACCATCTCAACTGCTGTGGCTGCTAAACTTCTGTATTCAGCCT TGGTGCCTGCTTGATTGGTTAACCACGTTTGTAAATCAAATAAAGAATAGAGAAGCAGGGCCCAGCAAGTCATTGTAAAT CATAACTCAGGGAAAATTGTATATAGCAGCAGTGGAAGAGCACGCCAGCACTGAGTGCTTGTTAACCAGTGTAGGATTCA CCGCTAGTGGTGGAGGACAAAGATGAAGAGGATAATCTCCAAAATCCATGATTGGGGATCAATCTGATCTGAATGAGTGA GAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAAGTTAGACTGACCTGGTTTTTGTTTTACAACAAATCTAACCAACATATCTCAGTTT GACGAACACAACTGGATGCAACTGTCCGAACACAGTTATAAAATCAAAGACTGTTCCTACGTACGAGGCAGTGCTGGTTA ATGCTTTATTGTCTTTACATTGTAAAAGTTGATCTGATGTATGTGAGATTTGGAAAGTTGTGAGTTGATTGTGAGACTTT TGAAGAAGGAATTTACCATGAGAAGAGGGGCTTATGCAATTCAAGCACATGTTTTTAATGAAACTGGTACTTTAATTTGT TGATTATCCATGCTTTATTTACCTTATCAATTGCAGATTCAGGGAAACTCTTTCCAGAAAAAGGTGTCTCTACTCTTTGG GGTTGGCCATGCTGTGGAGGTATAATTTCAACTTTTTAAATTTTCTGAGAAAACTGATGCTGTTATAAGACTTGAACCAT ATGCCAACGTAATTCAGTTTACACTTCACAAAATATAGTTTCATATTTGCATTAAAACCAGCAGTTGAAACTTCTACTAT GACCATGTCTTTCTGGATCATCCAATAACTGAAGATTCTAGTTCATATCATGCTTCTTTAGATCCATTCATATTTTTCTT AGAACCATGCTGTGCAATAAAGTTCTTCTGAAGTTGTTATGATATCTGAATTTGTTGCAATAATTGTGTCTTAATCTGTG TAACATGGCTTTGCTGATTCTGGTGACAGGAAAAGTCAAATGGGTCAAGTCTAGGGGGAGCCAGACAAAGAGCAGAAGCA ATGGCTGCCTTATCATCTGCGTTTAGTTCATCATCGGAGAGAGCATCCACTATGGTATGGTTACTTGCTTATGCAAAAGA TTTTACTCCTCTTATTTTGTCAATGGTCTGTAACCAAAAGCAAATTCCCTGAATAGAAAACATGAGGCATGATAAGGTTT TAACCATGATTTAGATTTTAGATACTTTAAAGTAAGGATGCTCTTTGAACTTTGTAGAATAATGTAGACATGTAACCTTT GATGTGTTAACCAACTCAGTGCATTCTCCCATATCCATGATTTGTTACATTGGTGTGTGTCTTTTATAAAAAACCACTGT TTATCGAAGGAAAGTTATTAACTGTGCCCCTTACTTCTAAATATATTCTATGCTTTACAGGATCTCAATCCTTTAACACA TGCAGCAGCATGTGTTGCTCCTTACTTTTATACTACATTTTCTGTTAAAGGATGGATTGCTTTACACGTTAATCTTGGAA TCAGAGAATTCAGGATTCTCATATTTTGTGGGAAAAATATAAGGCTTTCCTATTCTCAGTCCCATTCCACAAATTTATAG AACCACTTTTCTGAGAAAAAACGTGAGATTGAAAGTGGTATTAGTGCTGGACCATGTCTAACAATTAAATATTTAAATCA AAATCTTTCTAATGATTTGTTTGGTTGATAAGAGAAAGTGACAAAAGAGTAGATGAGAAGAGAGAAGATGAGTAGAGAGA AAGTGATGAGAAAAAGAGTAGATTATTTAAGTTTTTTGGTATGAAAAAAAAAAGTGAAAGAGTGAGATAAAGGCTCTCTC CACTCAATTGGTTCAATAGAATATGAGAAGAGTGAACTTTTATTTGATCATTTCTTTTATAACTTTTTAATATTATTAAA TTTTAGAATTAATTTTTTTAAATTTTAGAATTTATCTTTACTTTATTATTTTTAATTAGTAAGAGTAATATGGTAATTAT GAAAAAAATCATTCACCCTCTCCCATTTCTTCTAATGGATGGAGAGACAAAAAAAATGAATCGGACCCACATTTATGTCA TCTCTCATGAGCATGCTTAAACAAAACAAGAGAGCGATTCCATCTCTCCTCTAACAGTCTAACACTCGCTCTTCTCTATT CTTTCTTCAAGTCACTGTCTACCAAACATAGTGTTAATGATATGGCCTAAAGTTTTCCTTGGTCTCCCGCTTCCTCTTAT GTTTTGAGTATCCCCATCTATGCCAGCCTCTTTACTTGTAATTTTATAGGTTTCTTCATGAATGATCAACCTATCTAAGA TGGAACTCTAGAATTTTTATGCAATGGGTACTACCCAGACACTCTCTCTAATTTTTTTCATTACATGTCGTATATTGTTT TTATGACCACCTTCCATCTTAACATTCTCATCTATGTAAAGTTGGACTTACTTCATGTAGTCTCTTACTGCTGTGCTCAG CATCCGATCACATACTACATTGCAAGTATTATAGTGGTGCAATATAATTTTCTTTAACTACATAAGTCTTCCATTCATCG TGCTTGGATCATCCTTATCATGTTATATGATGGACTCAAGAGTACGACATGCTCTCTATTTTTAAGTTAGAATTTGTGCA CCTCCGGGCCTAAACTTGCATTCCACATAAACGTTGTAGTTACTTAAATGAAAGCTTGTCTTGACACCTCTAACCATGAA AGCTTTTCTCCAATGATGGCTGTACAATAGCATGCTATGACGAAAGAAAAATAATTTCCAAGTTTCTCTTATTCAATTGT AGAATTAGTTTTCAATATACAACAATGATATTAAAAAATGGTTTTTATATATTCTAACAATATCACTTACATCAATTTGG TTTTCTTTCCATATTATATTCCATACATCCAACTGCGGAATACTTCCCATGCTCTTTTGTTTCTAATTGTTTGAAACTGT AGAAGCAGGGCTGGATTCGTATTATCATTTACTAATTCCTTTTCCATTATCTGGAATTCCATTCTTTGCACTGAAATAAA AGTTCACTGTCTAATGGAGATATATAATAGTTTCTAGGTACACCGTACATGTATTATGTTCAGCTATCTAGTATAAAAAA AATAACTCAAAGGAAGAATACCTGGTATTTTATATTGAACTTAGAATCTCTATATTTGATTATAGATATTGAGCATTTAA AATATCCCTACTTGAGTTGTAGTTGGAAAATTAACTGATTCCATCGACCCCTTAGAGCTATAAATTCAATTAAGAATTCA AAGGTTTCTTCTCTGATTTAACCATGATTTTAATTTTGGTTTCAATGGAGAAACCTCTGACAATGTGAGATACTTCTCCC TAAAAGTTGTAGGTAGTCCAGCGTTCAAGTGAGAATGGATGCCACTGTCATGAATTGTGAAGTTACTTGGAGTTTAATAT TTCTTCATATGCATTTACGAGTGCAACACTATTATTTCTTGATTTGTATTTAGGAATGCAACCCTGTAATCCTGTCAAAT TATGAAATTGAACACTTGAGTTATCAGGACTGAAGTGGTTATGTAATTTTTTAGTTTGCTACAATAAAATGAATCTTAAG GCTGAAAGAACAGTTTCTTTGCATGTTGTTTTCACTTATGAAGTAGGATGAATACATTATTCAATTCTAGCATTCCCTTA TTGTTTAAGTGGAAGTTATACTGGTGAATCTTTAACATTCCATTTTCTTTCTGAATGGATCCGAGAGAACCGATTCATAC CCGAGTGGCTTTGTTTTATTAAAGAAAGTTACATTTAATGTTGCTGGTGTTCTTTTGTGTTGTATTCTGAAGATTGCTCA TTTCTATGGGTTTTTATTCTCATTCATAATTTCTTTGTTTTGTTTTGGTTATCTGGTTTTCCTTTACTCAATTATGACCT ATGACCCAATTAATCGGTTGCACTCTCTCAGTCACAAGATAGATTGACTGGGCTAAACCAAGGAGGTCCAAGACAAAGGG CCGAAGCTTTAGCTGCTTTAAACTCTGCATTTAATTCATCTTCTGGGACGAAGACATATACTCCTAGGCCATCTGGAAAA GGTCAAAGAGCTGCTGCAGTAGCTGCTCTTTCATCTGTTCTTACTGCTGAAAAGAAGAAACCTGATGTTTCTCAAGTGGA TGGTGGTAGTCCTGTCGCAGAAAGTAGCACTTCTGGTAATGAATATAGTCATCTTTGAAAATGTGAGATGTTGCATACAC AGAATACCCACCCTTATTCCCTCTGCCTATGTTTTGCACAAAATATCACATCAGTTTTTCTGTGTTGAATGTTCCACAAC ACCCTACTTTTTTAAGTTTCGGTTATTTTATAGTCAATGCAAACCCTTTTAGTTATATTTAATTATGTATATTTTTCCAT CATAATTATGAATGCTGCAGTCACCTGTATTCATTTAAAAGACTTGTATTTGTACCTACAATTAAACTTAGTTGAGATCC TTAGGAGACTACATTTTGAGAATACTATTAAAACCCCTGGCTTTTTTCGATTTAAGAGAAGAAACTGGAAATAACAATTT AATGACTCTATAGCCTTGTCTTTCCCCCAAGAGAAATCTTCGTAGTCAAATTCCTGTGTTGCATTAAAAGATAAAGAAAA AAACCTGAATCAAGTTTGTGCTACCATTATTGTGTGTTTTACATGTTAAGAGTTCTTGTTGCAGAAACTGTGAGTGGAAA TGCCCATTTTGAGATCGAAAAAGCTGAAGAAGCCAATGAAACAGAAGAACTCGCCCCTGAAACTGGTAGCAATGGGGATT TGGAACCAAAACAAGAAGATATGGATGATGGTGATGATAGTCAAAGTAGTCAAAGGACGTTCAGTTATGATCAGTTAAAG ACTACATCTGGTAAAAATGTGCCTGGAATTGATCTTAAGCGTAGAGAGGTTAGTCTTGCTTTGTACTTTATAATTATATT CATATTAATTGTAGTTTGAAAAATGTATATCTCTCCTGAAGTGTTGAATTATGACAAACACCATAAAATGGCTACAAATT ACAAGCACTGTAATTTCCAGCGCATCTGCTTTTTACTAAGCTGTCTAAATTGTATTTCATTTTGGGCGTTATTTGTCATA CTTCATATTCTCAGGGAAGGTATATATGATTTATCTTTAGTGTTATGCTTTGCATAGATCTCACCCGTTCCTTTCTACTC TGCTTCTTATTTATTGGTCAGGCTTATTTGTCGGACGAAGAATTTGAAACTGTGATTGGAATGGTAAAAGATGCATTTTA TAAGTTGCCAAAATGGAAGCAAGACTTGCTGAAAAAGAAATTTGAATTGTTTTAGACACAATGAGTGACATATCTGCTTC TTTAACTAATCTGCCTTTCCTTGGTTATCTTGAAATGCACTTATCTGGTGGATAGTGTGGTTTTATTAGTATATACCATG GTCGATGCATAGCGTTTTGCTTTCGGCCATAATGGACATAGCTGTGGTTAGTATCCAAGTTTGAATGTGATGCTGCATGG AGAGTGAGTTTTGATTTCTCCTTTTAGTTGCTGCTGTCTCTTGCAATGTTTTCATTTTGTAGCAATGAAGATACTAGGCA GTGGACCGGTCCGATTCTTTCATTTTGTGAAGTATATATTCTAAACGTGGTTTTCTTTTCGTGTTATTGGTTAGAAATGC GGGTGTATATGTATGCATTTTATACTTTTTTTTTTGGTAACATGCATTTTATACTGAATCCCATTATAATGGAAAACAAA AAAAAGTGTTATTTTTACTCTCTTTTAATGACGTTTTTTTACTAATTTTCTGCACTTGTTGGTATTATAATTGTTAAG 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0138400.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTCTAGCACGACAAAAGTCTTGGATCCTGCATTCCAAGGAGTGGGTCAAAGATTAGGAACTGAAATATGGAGGATTGA AAATTTTCAGCCAGTTCCATTGCCCAAATCTGAATATGGGAAATTCTACATGGGAGATTCATACATCATCTTGCAGACAA GGCAAGGCAAAGGAGGAACTTATTTTTACGATTTACACTTCTGGATTGGAAAGGATACAAGTCAGGATGAAGCTGGAACT GCAGCCATTAAAGCTGTTGAACTTGATGCAGCTCTTGGAGGACGTGCAGTGCAACACAGGGAAATTCAAGGACATGAATC TGACAAATTTTTGTCATACTTTAAGCCTTGTATAATACCATTAGAGGGGGGTGTTGCATCTGGATTTAGAAAACCTGAAG AAGAGGAGTTTGAAACACATTTGTATGTCTGTAAAGGGAAAAGAGCAGTCAGATTGAAAGAGGTCCCTTTTGCAAGGTCT TCATTGAACCATGATGATGTATTCATCCTCAACACTCAAAATAAGATTTATCAGTTCAATGGTGCAAATTCAAATATTCA GGAAAGAGCCAAGGCTTTGGAAGTTATACAGTTTCTGAAAGAAAAATATCATGAAGGAAAATGCGATGTGGCAATTGTTG ATGATGGCAAGTTAGACACTGAGTCAGACTCGGGTGAATTTTGGGTCCTCTTTGGTGGTTTTGCGCCCATTGGGAAGAAG GTAATCAGTGAGGATGATAACATTCCAGAGGCAATTCCCGCTCAGTTGTATAGTATCGTTGATGGTGAGGTCAAGTCTAT TGAAGGTGAACTATCTAAATCACTGCTGGAAAACAACCAATGCTATTTATTGGACTGTGGTGCTGAAGTATTTGTCTGGG TTGGCCGAGTAACACAAGTTGAAGAACGAAAAGCAGCTTGCCAGGCAGCTGAGAAGTACGTTGCAAGCCAAAATAGACCA AAATCAACCAGGATAACCAGGATTATTCAAGGTTATGAAATACATTCATTCAAGTCCAACTTTGATTCTTGGCCATCAGG AACTACTAGTATCGGTGCTGACGAAGGAAGAGGAAAAGTTGCAGCATTGCTAAAGCAACAAGGTATGGGTGTTAAAGGAA TGTCAAAAAGTACACCGGTAAATGAGGAAATTCCACCATTGCTTGAAGGAGGTGGAAAGATGGAGGTATGGCGAGTCAAT GAAAGTGCGAAGAACCCATTGCTGAAGGAGGATATTGGTAAATTCTATAGTGGAGATTGTTACATTGTACTGTACACATA CCATTCTGGTGAGAGGAAAGAAGATTACTTCTTGTGCTGCTGGTTTGGAAAAGACAGCATTGAGGAGGACCAAACAATAT CTACTCAGCTAGCCAATAAAATGTCAAACTCATTGAAGGGTAGACCTGTTCAGGGTCGCATATTCGAAGGTAAAGAGCCA CCACAGTTTATTGCTCTTTTCCAGCCCATGGTAGTCCTTAAGGGAGGTTTGAGCACTGGATACAAAAAGTTAATAGCAGA AGACAATGGTTTACCAGATGAGACATACACATCTGAGAGTATTGCACTTATTCGAATTTCTGGAACTTCTATTCATAATA ACAAGGCAGTGCAAGTTGATGCAGTACCGTCATCATTGAATTCCACTGAGTGCTTTCTCCTGCAATCTGGCTCTACAATT TTCATATGGCATGGGAATCAGTCTTCCTTTGAACAGCAGCAGCTAGCAGCAAAGGTCGCTGAATTTTTAAGGCCAGGAGT TGCTTTAAAGCATGCTAAAGAAGGTACAGAAAGCTCAGCTTTCTGGTTTGCACTAGGAGGAAAACAAAGTTATACAAGCA AGAAAGTTACTAATGAGATTGTTAGAGACCCACATCTGTTTACTTTCTCATTTAGTAAAGGTAGCATTTCTTTTCATGTT ACTTCTAAAAATTTATGCAATAACATGCTATTTACTGCTAGTTTAACTTTAATATACTGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0138400.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSSTTKVLDPAFQGVGQRLGTEIWRIENFQPVPLPKSEYGKFYMGDSYIILQTRQGKGGTYFYDLHFWIGKDTSQDEAGT AAIKAVELDAALGGRAVQHREIQGHESDKFLSYFKPCIIPLEGGVASGFRKPEEEEFETHLYVCKGKRAVRLKEVPFARS SLNHDDVFILNTQNKIYQFNGANSNIQERAKALEVIQFLKEKYHEGKCDVAIVDDGKLDTESDSGEFWVLFGGFAPIGKK VISEDDNIPEAIPAQLYSIVDGEVKSIEGELSKSLLENNQCYLLDCGAEVFVWVGRVTQVEERKAACQAAEKYVASQNRP KSTRITRIIQGYEIHSFKSNFDSWPSGTTSIGADEGRGKVAALLKQQGMGVKGMSKSTPVNEEIPPLLEGGGKMEVWRVN ESAKNPLLKEDIGKFYSGDCYIVLYTYHSGERKEDYFLCCWFGKDSIEEDQTISTQLANKMSNSLKGRPVQGRIFEGKEP PQFIALFQPMVVLKGGLSTGYKKLIAEDNGLPDETYTSESIALIRISGTSIHNNKAVQVDAVPSSLNSTECFLLQSGSTI FIWHGNQSSFEQQQLAAKVAEFLRPGVALKHAKEGTESSAFWFALGGKQSYTSKKVTNEIVRDPHLFTFSFSKGSISFHV TSKNLCNNMLFTASLTLIY 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 637 637 0.0
PANTHER 1 637 637 0.0
Gene3D 5 131 127 3.2E-45
SUPERFAMILY 9 148 140 4.67E-39
CDD 12 124 113 2.33454E-65
SMART 19 117 99 5.5E-26
Pfam 29 111 83 6.4E-15
Gene3D 132 242 111 1.6E-30
SUPERFAMILY 134 238 105 2.37E-19
SMART 137 234 98 1.8E-23
CDD 138 232 95 1.38576E-32
Pfam 150 217 68 2.9E-10
SUPERFAMILY 223 345 123 8.99E-22
Gene3D 251 354 104 2.5E-24
SMART 251 344 94 3.6E-19
CDD 254 343 90 4.08175E-27
Pfam 268 337 70 2.6E-12
PRINTS 323 344 22 2.4E-39
SUPERFAMILY 383 529 147 3.04E-29
CDD 386 487 102 9.27867E-44
Gene3D 388 519 132 1.3E-33
SMART 392 490 99 7.8E-19
Pfam 409 484 76 2.5E-10
PRINTS 411 427 17 2.4E-39
PRINTS 437 455 19 2.4E-39
PRINTS 470 490 21 2.4E-39
SUPERFAMILY 511 616 106 3.97E-21
SMART 519 608 90 4.2E-15
Gene3D 520 614 95 3.2E-20
CDD 520 610 91 2.85127E-32
Pfam 533 584 52 9.3E-9
PRINTS 534 554 21 2.4E-39
PRINTS 594 613 20 2.4E-39

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Actin filament binding Interacting selectively and non-covalently with an actin filament, also known as F-actin, a helical filamentous polymer of globular G-actin subunits.
Biological process Actin filament bundle assembly The assembly of actin filament bundles; actin filaments are on the same axis but may be oriented with the same or opposite polarities and may be packed with different levels of tightness.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0138400.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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