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LotjaGi5g1v0202600.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0202600
Transcript ID LotjaGi5g1v0202600.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase; TAIR: AT1G65580.1 Endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein; Swiss-Prot: sp|Q84W55|IP5PF_ARATH Type II inositol polyphosphate 5-phosphatase 15; TrEMBL-Plants: tr|I1NII6|I1NII6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0202600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:50276917..50302150) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACGTAATAACAGTTTTAGGAATGTTGTGCACATTAAAGAGACAAAAATGTAGGTAAAAAAATATCTCATTATTTTTTCAT AAAATCGCTGTTAATCACTTAAAAAAAAATGAAAGGTGGTTCACTAGTTCGTACGTTCATTCATCTGTTTCAGAAGCTGT GACACTGTGTTTTTGTCCTAATCCTCTGAAAAAATCCATGTTCTTCGCTTCATCACAACGCTAGATTCTCTCCTCGCGTT TCGATCTCTTTCAATTCCAATGGATCCATGGTCACTCCTCCAAAACGACGCCGCATCCTCCAAAACGACGCCGCGTCCGT TATACTCACACTCACACTCCTCTTCTTCTTCCGACGACGACGACGCCGTTTCACCCTCCACCTCCATCCAATCCACCAAC CGTCGTCTCGACTGCATGCTCCAGTTCCTCGACCGGAAACTCTCCGCCGACCACCACCACGAGACTTCACTTTCCGGTCC CGCACCTCTGCCGGAGTTCATCGCGAACGGCGGAGGCGCCGGCATCTTCCGACCACCGGCTCGCGCGGCGGTGCATCCCT CACGCCCTCCGAGTCTCGAATTGAGGCCGCATCCTCTGCGGGAGACGCAGATTGGGCGGTTTTTGAGGAACATTGTGGCT ACCGAGACGCAGCTGTGGGCTGCGTCGGAGTGCGGGATTCGGTTTTGGAGCTTCAAGGATCTGTACGCGTCGTGGTGTGG GGTCGGGGAAGGTGGTGTGGATGTGAGGAGCGGTGGCGATGAGGAGAGTGCGCCGTTTCGGGAGTCGGTGTGGACTCCGC CGGCGTTGTGTTTGGTTCCGGATGAGGGGAATAGGTTGGTGTGGAGTGGGCATAAGGATGGGAAGATTCGGTGTTGGCAG ATGGATTATCAGAGTTTGGATGATCACAAATGGAGTAATCGCTTCAAGGAATGCTTGTCTTGGCAAGCTCATCGTGGCCC 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GTCCTATCATGTAGGACCGGGTTGTGTGCAATAGATATTGCAGACTTGTTGTCACAATAAAGCTTTATTGGAGGAGAATT GAAAACCTTTAATTCCTGTAGAAGCTTTTCCACCCATAATGCCTCACAAATTCCATGAGCAACTGCTCTAAATTCAGCTT CTGCACTACTCCTTGCTACAACGGTTTGTTTTTTACTTCTCCAACTAACCAAGTTTCCTCCAACAAAGGTGCAATAGCCT GATGTTGATCTTCGGTCTGTCACACTCCCTGCCCAGTCTGCATCAGTGTAGGCTTCTACCTGAAGGTGCCCACGGTTTTT ATAAAGAAGCCCCTTCCCAGGTGATCCCTTCAAGTATCTTAAGATTCTAAAAACTGCCTCCAAGTGTTCATGACCTGGTG CATGCATAAACTGGCTTACCATGCTTACAGCAAAGGCAATGTCTGGACGGGTGTGAGATAAGTATATTAGCCTTCCCACT AGTCGCTGATACCTTCCTTTGTCCACCATATTTTCTGTTTCAGCTGGTTGCAGCTTTAAGTTGGGCTCCATGGGTGTTTC TACAGCTTTGCATCCAAGTAATCTTGTTTCTTTTAAAAGATCCAGAATATACTTTCGCTGGTTCATAAAGATACCTTCCT TTGATCTTGCAAACTCAATTCCAAGGAAGTATTTCAATGGGCCAAGTTCCTTGATTTCAAAAACTTTAGCAAGTTTCTCC CTCAGATTTTTGAGTTCCAAGCTATCATCACCTGTCAGAATAATATCATCAACATATACAATCAAGATAGCAACCTTATT ATCTGCTGAATGTTTATAGAACAATGTGTGATCAGCTTGGCTTTGGATATATCCAAGCCCTTTTACCACTGTTCCAAACC TCTCAAACCATGCTCTTGGAGATTGCTTCAGCCCATATAATGACTTCTTTAGTCTACACACCTTATTTCTTCCAAGTTCT TCTTCAAATCCGGGGGGAAGACTCATAAACACTTCTTCCTCTAACTCCCCATTCAGGAAAGCATTCTTTACATCCAATTG ATGTAAAGGCCAGTTGTAACTTGCAGCAAGGGATATAAGAATCCGAACAGAGTTAAGTTTAGCAACTGGAGCAAACGTCT CTTGATAGTCTACTCCATAAGTTTGAGTGAACCCTTTTGCCACCAATCTCGCCTTGTACCTCTCTACACTTCCATCGGCC TTGCACTTAATGGTAAATACCCACTTACAACCCACCTGTTTTTTGTCACGTGGTAGGTCTGTTATTTCCCAAGTTTCATT CTTTTTCAGTGCACTCAACTCTTCTAAGACTGCTAAATTCCAATTGGGATCATCTAGTGCTTCCTCAATGTTTCTAGGCA CAAACAGATCTGTTATTTTAGAGGTAAAAGCTTTGTGATTCGGTGAAAGATTTTGGTAGGAAACATATTGGGAAATGGGA TGGTTTGTGCTAGATTTTTCTGATTTTTGGGTGCAGGTTCTGGTTCCTTTTCTAATAGCTATGGGTAATTCAATAGTAGA AGTGAAAATGTCAGTGTTACCTCGAATTTCTTGTGGTATTCTTACTTGGCCTTCTTCCGGGATTTCTGGTTGGCTTGGTG CAGAGATGATGGATTGGTCTTTGGTCCTTTTAGGATACTTCCGAGTATAAACATGGAACTCCTTTTTTGACTGTGGTATT TCTTTCTCTGTTTGGGCTCCACCTAAGTCTGGCATAAGATTTTCTTTAGAAATTTCAGAACTTGTTTCCACATGTTCTTC CTTGTTGCATTCATCAATAAAATTTGTATTCCCTGTGTCTACAATAGGAATGGGCAGCGGTTCATGCAAAAAATTGTCTT CACTCACATTATTATTCTCCCCCTGAAGGGAATTTTTTTGAAAAAAAGGTTGATGTTCAAGAAAGGTAACATCCATGCTA ACACAAAGCTTCTTTGTGATAGGATTAAAGACTCTATATCCTTTTTGGTTTGGAGAATAACCAACAAAAATGCATTTTTC TGCCCTTGGGTCTAGTTTGGACCGAGATGTGGAAGGTTTATGCATAAAAACTGTACAACCAAACACCTTTAAAGGCATAT CAGTATGTAATCGACATGCTGGAAAAATGGTTTTGAAATTTTCCAAAGGTGTGCGATAATTCAATACACGAGTGGGCATT CTATTTATAAGATAGGCTGCTGTTAGGACAGCATCTCCCCACAAATACTTTGGAACATTACTCTCAAACATAATGGCACG AGCTACTTCAAGGAGATGTTTATTTTTTCTTTCAGCGGTGCCATTTTGTTGAGGAGTATTTGGACATGTCGATTGATGCT GAATGCCTTTATTTTTCAGAAACTCATTGAGATTTTGGTTGAAGTACTCAGTTCCATTATCACTCCTCAAAATGGAGATC TTTGTATCAAATTGAGTTTCTACCATTTGTGAAAAACTTTTAAATATATTAGGAACTTCAGATTTTTCATGCATAAGGTA GACCCAACACAACCGGGTGTGATCATCTATGAAGGTTACAAACCACCTTTTTCCAAATTGAGTTGTAATTTTTGAAGGCC CCCAAACATCACTATGGATTAAGTAAAAAGGTCTAGATGCATGATAAGGTTGAGAATAATAAGGAGCTCTTTGATTTTTT GCAAGAACACAACTTTCACATTCAAGAGAAGAACAATTAACATTTTTGAATAAATCTGGAAACAAATGCCTAAGATATTG AAAATTCGGGTGCCCTAGTCTGTTATGCCAGAGCATTATTTGGTCCCTAACAGAGGTGCAACTCATACCACAAAGACCCT GAGCTGCTTTATTTCTGAAAGTATCCTCAAAGTAGTAAAGTCCATCCTTCATCTTAGCACTGCCAATCATCTTCCCCGAA ATCCGGTCCTGAAAAACACAATGAGTGTCAAAGAATGTCACACTGCAATTGGAATCTTTGCAGATTTTGCTAATAGAAAG AAGGTTGCAAGATAGTTTGGGCACATGTAAAACTTTTCCTAAGTCAATGTTATTGGATAAGGTAATCTTCCCCTTCCCTG CAATTGCGGAAAAAGAACCATCTGCAATTCTAATTTTTCCATTTCCAGAACAAGGAGAATAGGTTTTAAATAAAGGAGAA AGGCTAGTCATATGATCTGAAGCACCTGAATCAATGATCCATGGTGCATGAATATTTGAGGTGCAATTAAGGGAGCTAGG GGTAGAAAAATTACCTGTTTGTGCCACAGAACCACTAGGAGTACCAGATAAAAAATTAGAATTTAACAACCTTATGAGTT CCTCAACTTGTTCCTTTTTCAAGGAAGTCTTTTCTGCCTCATGAGCTGTAGGGAAAGATTTTTGATTTTTAGGACCTGAC TTGCCACCCTTTAGATGTGCTGGCCTCCCAATAATTTTCCAGCAACTTTCCCGAGTATGACCGGGTCTGTTGCAGTGATC ACACCAGCGGTTTGAGAAGTTCTTCTGGTTAGTAGAAGTCTTAAGGGCAACAGTTTCTACAGCAAGAGCATTGGTCTCAG AAGGAGGTGCATCCGTTTTGGACTTTCCCATCATCACACTTCTGCGAGTTTCCTCTCTTCTAACTTCAGCAAAGACCTCA CCCAATGAAGGTAAGGTTGCTCTCCCAATGATTCTGCCACGAACTTCATCTAGCTCTTCATTCAGACCAGCAAGAAACTG AAATATTCTACCTTCTTCCACGGTTTGTCGATGGTGTTTGGCATCCTCTGCAGAGTTCCACTTGTAAGTGTTGAAGAGAT CTAGATCATGCCAAACTCGCTTCAAAGAGTGGAAGTATTTTGTCACGTTATTACCTCCCTGCCGAATTTCTCTGACTTTC AAGGTGAGTTCATAGATCTGAGATTTGTTCTCAAGATCTGAATACATTTCCGTGACACTATCCCATAGCTCTTTGGCTGT GGAATAACACATGTAATTGCTGCTAATGTCCTCCTCCATGGAGTTTACCAGCCATGTCATCACCATGGAGTTTTCAGCGT CCCAAACAGCATATTGTGGATCAGCAATATCTGGCATGGGTTTCTCACCAGTGAGATACCCAAGTTTTCCTCTGCCACGA ATATACAACTGGACAGATTGGGACCACCGGAAATAGTTCGACCCATTGAGTCGAAAAGTGGTGATTTGGACAGAATGAGA TTCACCGAACAGGACTCGCTGCTCCTGCCTTGGAGGCACAGAATGAGATTCGCCGAACAGGACTCGCTGCTCCTGCCTTG GAGGCTGCGAGACTTTGGGAACCACAATCTCCTCCGTATTCTGATCATCGCTGGCTGAGGAACTGTCAGCCATGGATGCA AATCAGATGCGCAGAGATCTTTGCTCTGATGCCAAGTTGAAATATTTGGTAATATTATTGATATGAAAAACTGTACAGGG ATTCCTCTTCTTATAGAGGGAATTACATAATGTGATTGATCAAAGTCAAAGAAGGAAATCCTTGACTAAAGAGAGAATTA GGGAGAATGAATGAAAATAAGAAACTACCTAAAATAAACTAAGTACAAACAGGAAACAACATAATTATATACAAACAAAA ATATAACTGCTAATTAAGAGCATTAAATGCTCTATTTCACAGTCTGTTGACAAAAATATTTTTTCTATAAAATCTTTAAT TGTTTATGGGTTCAGAAGGATTTTTTTATTATATTCTTTCTTTCTATGAACATATTCCACTTTTTAAAGAAAGTTTAAAG TTTTAGGGAAACAGCAAGTTTGTCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACATTGGGGAGATTAAGTTAC AACGGTGGAAGACTTTTAATAGTCTTACGCCGTTAGAAACATGAGATAGAATGAGTTTTATTTATTCAATCGTTGAATTA TAACTAGTCTTGACATTGGTTGTTTGTGTCTAATCTCATCAAAGTTAATTAACAGTAAGTGCATAATCAAATGATTCCTA TTTTTATATATTTTAAAATGTCTGTTTGACATTAATCTTACTGTACCTCAATGATGTGTTAAATTATTTTAGATTGATAT AAAAATTCATAGATATGGTCTACATGATAGCAACTTGCAATCCAGCAGTGAATTTAAGAATACAATCTGATAGAGGTGGC AAAACGGGTCACTTACATGCCTAAGAATAGGCGGGATGTGCTGGACTCTTGTCCCATCCCACACCAGATGACCAGAGTCT TATACTTCTCATGTTAGACTCTAGTCCCATACCTTACAATTGGATCCTAAGACAGCTATATGATAAAAAGTTAATGAATG GTGTAAGACTACTAAAGTTCTACAGCGGTATAATTTGTTCCCTTTCAATTATACTTAGATACTTGAAAAACTTTAAATGC TAACTAAATTATTCAAAATTTAATCTGTTCTAATGTTGAGAAGTAATAAAAATATGGCATTTGTATTCACATATTGAGAG TAGATCAAGGCAAAAGACCTATATATTAAAGTACAAAAAAACCCTATATATAGTTATATGCTCTTTCAGCAGCCACACTA GCTGAGATGTTCAATTGCATCATGTGATGTAGTCTGCGATTTAAATCCTTGTGAAAATTAATCAAAATCTCCCCTATGAA AAATTGGCTCTGATATTTGGATTAAGTATATAAATGTTAGTCCTAGAACTTATTTTTTTTGTGTGTGTATCAACATTAAT ATTTATTTTTAGACAAGCATATCTCCTTTGCAATGCACCGCATGATAATTACCTGCACATTTTATGATTCAGGTAAGTCC TGCAACTGGTATTATAAGACCAGATGAAATTGTTGAGGTATCAGTACATGATGAGGAATTTCAGACTCTTGAAGAGTTTG TTGATGGGGTTGTACAAAACTCTTGGTGTGAAGACTCCAGAGACAAGGAAGCTATATTGGTTGTTAAGGTGCATGGCAAT TACACTGTGCAGGCAAGAGACCACCGTGTCCGTGTTCACCACTGTTATTCATCGAAGAAAAACCAAATGATAGACCCTCA ATCAAACGGCTCCAGGCATATCCAAGGAAGTGCACTACACCGATCCGATTTCCAACGTTTCAGCAGTTCCTTAGATGTGG TTGACCAGCTACAGAAATTGAAAAGCCCTTAAAGCAGCAGTTTATGTGAGTGCATGTAACTATTTTATTTTATTGTTTTG GTGGAAGAGCAAATGATTGGTAGATGGTTTTGGAACACGCACAAGGTCTTGTTTATACATGCTGTAATAAGCATCTTGAT CATGTTTGTTAATTTTTTCCCCCATAGGGAGCTTGGGGTCCAACTTGTAATCATCAAGCTGATTGAACTGTACAGAGAAA GCAAATACATGGCAAAAAAAATGTAGAGACAGCTTTTTCTAGATTATTTGATTTATTCAGAAATGACCCCAATTTATTGT GTAAATGACTATGTGCCTTACAACACAACCTGCAACTGAAGGGGAAAACCTAATGACATGTTGCTACTGCAACATTGTTT TGTTTGTTCATTACAATAAATATTTGATACTTTTCTAGTTACAACTTTGTATTTTTTGTCTGGAATTGTGTAATGGAAAA GTCCATTTTGTTTATCGACTTCTGTTGTATGTGGCCTTTGTTAAATACAAAAACATACTAAAAGATGGGTTTGATTACTG AATTTTTTACTTTTTCTTATATGTATCATAAGTTCAAGTATTTGCCGTTAAAATTAAAATTAGTTATGTTACAGTGTAGT TATTCTAATAACCACCGGAGAAATAGCTTAATGAAAATGTCTAATGTTAAAACTATGGCATCTATGGCTAAAATCTAACA CGGGATAGTACCACTATTTTTTTTATATAATTTTAACAGATAGTTTAACTTCAATTTTTTAACTTAAAGTCCACATCTCC CCGTAAAACTCCAGATTTCGACATTCCATATTCCCCTTTGCATTACTTTTGCACTTTCAGCTCATTCTTGATACTTCAGC ACCATGGAGGTGTTGGGAGACAAGGAGAGCACCA 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0202600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATCCATGGTCACTCCTCCAAAACGACGCCGCATCCTCCAAAACGACGCCGCGTCCGTTATACTCACACTCACACTC CTCTTCTTCTTCCGACGACGACGACGCCGTTTCACCCTCCACCTCCATCCAATCCACCAACCGTCGTCTCGACTGCATGC TCCAGTTCCTCGACCGGAAACTCTCCGCCGACCACCACCACGAGACTTCACTTTCCGGTCCCGCACCTCTGCCGGAGTTC ATCGCGAACGGCGGAGGCGCCGGCATCTTCCGACCACCGGCTCGCGCGGCGGTGCATCCCTCACGCCCTCCGAGTCTCGA ATTGAGGCCGCATCCTCTGCGGGAGACGCAGATTGGGCGGTTTTTGAGGAACATTGTGGCTACCGAGACGCAGCTGTGGG CTGCGTCGGAGTGCGGGATTCGGTTTTGGAGCTTCAAGGATCTGTACGCGTCGTGGTGTGGGGTCGGGGAAGGTGGTGTG GATGTGAGGAGCGGTGGCGATGAGGAGAGTGCGCCGTTTCGGGAGTCGGTGTGGACTCCGCCGGCGTTGTGTTTGGTTCC GGATGAGGGGAATAGGTTGGTGTGGAGTGGGCATAAGGATGGGAAGATTCGGTGTTGGCAGATGGATTATCAGAGTTTGG ATGATCACAAATGGAGTAATCGCTTCAAGGAATGCTTGTCTTGGCAAGCTCATCGTGGCCCTGTTCTTTCCCTTACCATC ACTTCTTATGGGGATCTATGGTCGGGTTCGGAAGGAGGGGTAATCAAAATATGGCCTTGGGAGGCTGTTGAAAAATCTAT TCATATGTCGGAGGAGGAAAGGCCCATGGCTGCAATACATGTGGAGAGGTCCTATGTTGATTTGAGGAGCCAGCTGTCTA CAAGTGGCTTTGGTAACATGCTAACGTCAGATATAAAGTACTTAGTATCGGACACTTCAAGGGCAAAGGTGTGGAGTGCT GGTTATTTTTCATATGCTTTGTGGGATGCTCGCTCTAGAGAGTTACTGAATGTTTTGAATTCAGATGGCCAGATGGAGAA TCGGTCGGACTTGTCCTCAATACAAGACTTTCCAGTTGAGCTTGTTGCAAGTTCTAGGAAAGACAAAACACAAAGTTCTA TTGGGTTCTTTCAACGCTCACGTAATGCCTTAATGGGGGCAGCAGATGCTGTTCGTCGGGTTGCAACAAAGGGAGGCTTT GGGGATGATAATCGAAGAACTGAAGCTCTAGTTGTAACAATAGATGGAATGATTTGGACAGGGTATTCAAGTGGGTTACT GGTGCAATGGGATGGAAATGGTAATCGCATGCAAGAGTTTCTTTACCATTCATTTGCCGTTCAGTGCTTTTGTACTTTTG GCATGCAAATTTGGGTAGGTTATGTCTCTGGTACTGTCCAAGTATTGGACCTGAAGGGTAATCTGATTGGGGGATGGATG GCTCATAGCAGTCCAATTGTAAAAATGACGGTTGGAGCTGGTTATGTATTTGCATTGGCTAGCCATGGTGGCATACGTGG ATGGAACATCACTTCCCCAGGACCTCTTGACAACGTATTGCATTCAGAGTTGAGCGGCAAAGAATTTTTATATACTAAAA TAGAAAATATAAAAATATTGACTGGCACTTGGAATGTTGGACAAGAAAAAGCATCTCAAGATTCCCTTGCTTCATGGCTA GGTTCTGTGGCCTCAGATGTTGGCCTAGTTGTTGTTGGGTTGCAAGAGGTTGAAATGGGTGCTGGATTTCTTGCAATGTC CGCAGCTAAAGAAACTGTTGGATTGGAAGGAAGTTCTGTTGGACAGTGGTGGCTGGATATGATAGACAAAACATTGGATG AAGGTTCAACATTTGAACGTATTGGATCTAGGCAACTTGCAGGCATGGTTATTGCTGTGTGGGCTAAAACCAACATAAGA TTCCATGTTGGGGATGTTGACGTGGCAGCAGTTCCATGTGGCTTTGGACGTGCTATTGGCAACAAGGGTGCTGTTGGTCT GAGGATTAGAGTGTATGATCGGATAATGTGCTTTGTTAATTGTCACTTTGCTGCACATTTAGATGCAGTTAATCGTCGCA ATGCAGATTTTGATCATGTATACCGGACAATGTCTTTTGGCCGGCCAACAAACCTCTTAAATGCTACAGCTGCTGGCACT TTATCTTCTATTCCGATATTCCGTGGTACAAATTCCGCAGAAGGGATGCCCGAGTTATCTGAGGCAGACATGATTATATT TCTCGGTGATTTTAATTATCGCCTTGATGACATTTCATATGATGAAGCAAGAGATTTTGTTTCCCAAAGATGCTTTGATT GGCTAAGAGAAAAGGATCAACTTCGAGCAGAAATGGAAGCTGGGAATGCCTTCCAAGGAATGCGTGAAGCAATTATAACA TTTCCTCCCACATACAAGTTTGAACGGCACCAAGCTGGTTTGGCAGGGTATGATTCTGGTGAAAAGAAACGTATACCTGC CTGGTGCGACAGAATTTTGTATCGTGATAATCGCTCTTCTTCGGTGGCCGAATGCAGTTTACAGTGTCCTGTAGTCTCTT CAGTATTGCAGTACGAAGCCTGCATGGATGTAACAGATAGTGACCACAAACCTGTGCGCTGCATCTTTTCTACAGATATT GCTCGAGTGGATGAATCAATCCGGAGACAGGAGTTTGGGGAGATTCTTGAGTCAAATGAGAAAATTAAATGTCTTCTGAA AGAATTATACAAGATTCCTGAAACTATCATTAGTACGAACAACATAATTCTTCAAAACCAGGACACATTGATTTTGCGTA TTACAAATAAATCTGCAGAAGACAATGCTTTGTTTGAAATACTTTGTGAAGGTCAGTGTACTGTTATGGAGCATCAGAAG GCTACTAACCATCAGTTGAGAGGTTCCTTTGGCTTGCCAAGGTGGCTTGAGGTAAGTCCTGCAACTGGTATTATAAGACC AGATGAAATTGTTGAGGTATCAGTACATGATGAGGAATTTCAGACTCTTGAAGAGTTTGTTGATGGGGTTGTACAAAACT CTTGGTGTGAAGACTCCAGAGACAAGGAAGCTATATTGGTTGTTAAGGTGCATGGCAATTACACTGTGCAGGCAAGAGAC CACCGTGTCCGTGTTCACCACTGTTATTCATCGAAGAAAAACCAAATGATAGACCCTCAATCAAACGGCTCCAGGCATAT CCAAGGAAGTGCACTACACCGATCCGATTTCCAACGTTTCAGCAGTTCCTTAGATGTGGTTGACCAGCTACAGAAATTGA AAAGCCCTTAA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0202600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDPWSLLQNDAASSKTTPRPLYSHSHSSSSSDDDDAVSPSTSIQSTNRRLDCMLQFLDRKLSADHHHETSLSGPAPLPEF IANGGGAGIFRPPARAAVHPSRPPSLELRPHPLRETQIGRFLRNIVATETQLWAASECGIRFWSFKDLYASWCGVGEGGV DVRSGGDEESAPFRESVWTPPALCLVPDEGNRLVWSGHKDGKIRCWQMDYQSLDDHKWSNRFKECLSWQAHRGPVLSLTI TSYGDLWSGSEGGVIKIWPWEAVEKSIHMSEEERPMAAIHVERSYVDLRSQLSTSGFGNMLTSDIKYLVSDTSRAKVWSA GYFSYALWDARSRELLNVLNSDGQMENRSDLSSIQDFPVELVASSRKDKTQSSIGFFQRSRNALMGAADAVRRVATKGGF GDDNRRTEALVVTIDGMIWTGYSSGLLVQWDGNGNRMQEFLYHSFAVQCFCTFGMQIWVGYVSGTVQVLDLKGNLIGGWM AHSSPIVKMTVGAGYVFALASHGGIRGWNITSPGPLDNVLHSELSGKEFLYTKIENIKILTGTWNVGQEKASQDSLASWL GSVASDVGLVVVGLQEVEMGAGFLAMSAAKETVGLEGSSVGQWWLDMIDKTLDEGSTFERIGSRQLAGMVIAVWAKTNIR FHVGDVDVAAVPCGFGRAIGNKGAVGLRIRVYDRIMCFVNCHFAAHLDAVNRRNADFDHVYRTMSFGRPTNLLNATAAGT LSSIPIFRGTNSAEGMPELSEADMIIFLGDFNYRLDDISYDEARDFVSQRCFDWLREKDQLRAEMEAGNAFQGMREAIIT FPPTYKFERHQAGLAGYDSGEKKRIPAWCDRILYRDNRSSSVAECSLQCPVVSSVLQYEACMDVTDSDHKPVRCIFSTDI ARVDESIRRQEFGEILESNEKIKCLLKELYKIPETIISTNNIILQNQDTLILRITNKSAEDNALFEILCEGQCTVMEHQK ATNHQLRGSFGLPRWLEVSPATGIIRPDEIVEVSVHDEEFQTLEEFVDGVVQNSWCEDSRDKEAILVVKVHGNYTVQARD HRVRVHHCYSSKKNQMIDPQSNGSRHIQGSALHRSDFQRFSSSLDVVDQLQKLKSP 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 44 44 -
MobiDBLite 7 44 38 -
PANTHER 57 1083 1027 0.0
PANTHER 57 1083 1027 0.0
Gene3D 126 296 171 3.1E-8
SMART 166 207 42 47.0
SUPERFAMILY 183 516 334 5.13E-19
SMART 221 259 39 0.081
Gene3D 326 528 203 1.8E-5
SMART 433 470 38 160.0
SMART 472 509 38 320.0
SUPERFAMILY 515 901 387 4.68E-58
Gene3D 530 889 360 4.0E-98
SMART 535 884 350 7.0E-99
CDD 537 876 340 7.25781E-105
Pfam 542 869 328 7.2E-17

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process Phosphatidylinositol dephosphorylation The process of removing one or more phosphate groups from a phosphatidylinositol.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0202600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…