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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0203900 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0203900.1 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase; TAIR: AT2G40730.1 kinase family with ARM repeat domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q55GS2|SCY1_DICDI Probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1; TrEMBL-Plants: tr|I1NIJ6|I1NIJ6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0203900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:50434917..50449241) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAGCAAACATTTCTTTTTGTGTAAAGGCGACACACGAAGGTGGGTGATCTTTCCCTCCTCTGCTTACCAGTTGCTCGGT TCCTCGACGAGGGAAGGAAAATCCAATCCCTCCTCGTGAGATTCGCGTTCGTGAACGAAACCAGATCGCAACCAGTTCCA GTTCCAACAGCTATAGCCATAGCTTCAATCTTCTCCTCAATCACCACTCATCACAGATCAGAATTTCAGAATTGTGAATT CGGATCCAATCAACAATGTTCAAATTCCTGAAAGAAGTGGTCGGTGGATCTGGAACCGGCGTCAAGGATCTCCCTTACAC CATTGGCGAACCTTACCCTTCTGCTTGGGGCTCTTGGCTTCATCACCGTGGCACCTCCAAGGTAACAACAACAACCACCA TTCTTCAATTTCTACTGTAATTCTTCCCAAATTCCCATGTTGCCATGTGTTAGTTTTGTTCAATTTCAATACTTATTATT GCCAATTGATTCAATATGGAGATTAAGAAATTGGGGTTCGCTCATTTGGGCTTGATTTTTGGTTTCAGGATGATGGGTCA CCGGTGTCGATTTTTTCTCTATCTGGGAGCAATGCTCAGGATGGGCATTTAGCTGCGGGTCGTAACGGTGTTAAGCGTCT GCGAACTGTAAGCTGAGCTTGTGATTCACCTCACCTGATTGTTGCTGCTTTTGTTTTGTAGTGGCGAAAATTCGGTACCT TTTTTTGAGTGGTGCTCTTTTTTCAGGTTAGGCATCCGAATATTTTGTCATTTCTTCATAGTACCGAGATTGAGACTCAC GATGGTGGTTCTTTGAAGGTCACGATTTATATTGTGACTGAGCCTGTGATGCCGCTGTCTGATAAGATTAAGGAGTTAGG TCTTGAAGGGACTCAAAGGTATTGATAGATTGATGCTGCTGAACTCAATTACTTCCTTTTATTGCATATAATTTGATGTT 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TAGATTTTGTGTAAATTAAGGGTGCACTCTCCACCATAATTTTATACATGTTTCTTCCTCAATTTTTTTTTTACTTATTT ATGTGAATTCTAAAACATACTTGTCCAATCAGAAATGTTTGAATACGTGCTAGTTCCTATATTCTTTACATGATTTACAG AATACATGGTGGTTCCAGCATCGTTTACATGTCATCTCAAATTATTCATTTTACTAATGATATCCTTGTAAATGAGGCAT CATGTGTGAAGAAAGCACAATTTTTGCTGGCTGAATCTTCAACTCTAAGTTTAAAAGAATTGTTTCTGATGGTGTTAGTT CCCCCTGGTGATTTGTTATACTGATGTTCATGTTCTTGTCTGTCTTTCTGTTACAGACAAATACAGCTGAGGCAACTGGG GGGGCAGGCATGGGAATGTCATCAATTCCAGGAAATGCAAGTTTACTTGGGTAAGGCAGTCCAAACTTTGTGTCTCCAGG CCGTTCACATGTTAAGCAATAAAGAGAAAGCAGGAGTGTTCAATATGAGTTTGATTTCATTTAAATATTTATGAAGTTTC CCTTTTCCATTTTTTAAATTAATATTACCTAAAAATACACAGAATAATTGCTAATTCTTGATTACTTGTCTATATCGGTC ATAATAGTATTTAAACACTTGATTTAGTGGCCACATATAAATGCATTTGAATGCGGAGGATTGCTATTGGTTTCGCAGAA TAATTGCTAGTTGTAGGTTACCTATTTATGTAACTAACAATAATTGCGAATAACTTGCTTAGTGTCTCGTCTTAAAAATC TTAGGGTGCCTCATTTTTTAGTTGATCTTGAGTTCTCTTTAACTGCACATGTGCTGCTGAGAATTTTCTCTACATTTAAT GCATGGCTTCTGATGTAACTCTCATTCTATGCAGATGGGCTATGAGCTCCTTGACCCTGAAGGGTAAACCTTCTGATCAT 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AAGCTTGGGTGGTACTTTTCTATAGCAGATCGCACATGAAACATTTCTCCATGTCATCTACCTTGCTCAGTTTTTATGGT TGGCATCCCTCTCTATATCCATCATTTAGTGTGATAGACCTAACGTACTAAAAAATGTGAGATTTGTGATATTCTCCATT TTTTCACCTTCACTATCCGGTCTGGTCTACTTTTTAGTTAGGCAAAAACCATGTGTTTTGAAGACATTTCTCTGTATCTT TAACTTTCCTTTGATGTCTTCTTTTGACACTTTAACTGCATTATCCGCAAACAACATGTAAGGCACGGTCTTTTGGATGT GTCCAGGAAGCACATCTAGAACCATGATAAAAAGATAAGGCTGGACACTAACCCTTGGTGCACCCTTATAGTTATAGGGA AATTTTCATTATTCCCACTTTGTGTTCTTGATGAATGGATCAAGGTACCTTTCCTTCATTCCTGTATCCTCAGCATCCTC TTAACCTGATATTCTCGTTTAGCAAATTTGTAGGCCATCTTATATCTTTCTCACCTAACCCCTTTCATACCTCGATCATT ATATTATGTGGTCCAACTACCTTTAGCCAATTTCTTTCATGCTTCTCTCACCTTAGATTCTCCAATTATTAGGTAGTAGG ATTGATTTTGAGAATTTGATCCCCCCTATAGTGCCAAGTTTATTGGACTTGAGAGAAGACTTTAACGTTCATGGAAATAA CACTGCCATCTTTCATTGATATCTTGTTCTTTGACCAATATTCCCCCCTCATCATCTTTAATGTATTTTACCTGATTCAA GTCTCTTGTTTTTCTTTCCTGACTTTTGGCAAGTTTATAAATTCTATCTTCCCTACTTTGGTATCTATGGATAACTGGAT AAGTATAACCCATTAAATCCCCTCTCTCTAGCTTCACTACTGTATTTTTAGTTTCTTTCTTAGCTACCTTATGTTTAGTC 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0203900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTCAAATTCCTGAAAGAAGTGGTCGGTGGATCTGGAACCGGCGTCAAGGATCTCCCTTACACCATTGGCGAACCTTA CCCTTCTGCTTGGGGCTCTTGGCTTCATCACCGTGGCACCTCCAAGGATGATGGGTCACCGGTGTCGATTTTTTCTCTAT CTGGGAGCAATGCTCAGGATGGGCATTTAGCTGCGGGTCGTAACGGTGTTAAGCGTCTGCGAACTGTTAGGCATCCGAAT ATTTTGTCATTTCTTCATAGTACCGAGATTGAGACTCACGATGGTGGTTCTTTGAAGGTCACGATTTATATTGTGACTGA GCCTGTGATGCCGCTGTCTGATAAGATTAAGGAGTTAGGTCTTGAAGGGACTCAAAGGGATGAATATTATGCTTGGGGAC TGCATCAAATCGCGAAAGCTGTGAGCTTCTTAAACAATGATTGTAAACTTGTTCACGGTAATGTTTGCTTGGATAGTGTT GTCGTCACGCAAACTTTGGACTGGAAGCTCCATGCGTTTGATGTTCTGTCAGAGTTTGATGGGAGTAATGATGGTTCCGC TGGGCAGATGCTGCAATATGCATGGCTCATTGGATCACAGTACAAATCAATGGAGCTGGCAAAATCTGACTGGGCTGCAA TTAAGAAGTCTCCTCCATGGTCCATTGATTCTTGGGGCATGGGTTGTCTAATCTATGAGCTATTCTCTGGCGTGAAGTTG AGCAAAACAGAGGAGTTACGCAACACTGGCTCCATTCCTAAGTCTCTGCTTCCAGATTACCAGCGGCTGCTGAGTTCCAT GCCTTCTCGCCGATTAAATACATCAAAGCTTATAGAAAATAGTGAGTATTTTCAAAATAAGTTGGTAGACACAATACATT TCATGGAAATTCTCAGTTTGAAAGATAGTGTTGAGAAGGATACCTTCTTCCGCAAGCTTCCAAATTTAGCAGAGCAGCTT CCTCGTCCGATTGTGTTGAAGAAGTTACTTCCTTTATTAGCTTCTGCCCTTGAATTTGGTTCAGCTGCTGCCCCCGCTTT GACTGCATTGTTGAAAATGGGCTCCTGGCTTTCAGCTGACGAGTTTCGTGTCAAGGTGCTTCCAACAATTATTAAACTCT TTGCCTCCAATGACCGAGCTATTCGAGTTAGCCTTCTTCAACATATTGATCAATTTGGAGAGTCATTGTCTGTCCAAGTT GTTGACGAGCAGGTCTACCCTCATGTTGCTACTGGTTTCTCCGATACATCTGCTTTTCTGAGGGAACTTACTCTCAAGTC CATGTTAATTCTGGCTCCGAAGCTGTCTCAAAGGACCATTTCAGGATCATTACTAAAGCATCTGTCTAAGTTACAGGTTG ATGAAGAAGCAGCAATAAGAACAAATACTACCATCTTATTAGGAAATATTGCAAGCCACTTAAATGAAGGGACAAGAAAG AGAGTATTGATTAATGCATTTACAGTCCGTGCTCTGCGTGATACTTTTCCACCTGCTAGAGGAGCAGGGATTATGGCTTT ATGTGCCACCAGTTCTTACTATGACATCACTGAAATTGCTACACGAATTCTTCCTAATGTTGTTGTACTCACAATTGATC CTGACAGTGATGTTCGTTCTAAGGCATTTCAAGCTGTTGATCAGTTTCTGCAGATGGCGAAGCAATATTATGAAAAGACA AATACAGCTGAGGCAACTGGGGGGGCAGGCATGGGAATGTCATCAATTCCAGGAAATGCAAGTTTACTTGGATGGGCTAT GAGCTCCTTGACCCTGAAGGGTAAACCTTCTGATCATGCTGCTCCTGTTGCTTCTATGAGTTCTTCTGCTCTTACTCCAA CATCTTCGAATGCCAGCTCAGGTATTCTAGCTGTAGAAACTCCTTCAACAGCACCCGTCCGTGTAAGCTCCGCAACTGAT TTCGCTGAGCAACCTGTCCCTACGTCTCCTACGTCAACAGATGGCTGGGGGGAACTAGAGAATGGACTCGATGGGCCTGA GAATGACAAGGATGGGTGGGATGATCTGGAACCACTTGAAGAAACAAAGCCAGCTCCAGCTCTTGCGAACATTCAAGCAG CTCAAAGGCGGCCTGTATCTCAACCTGTTTCGCAGTCAAAACAAGCCTCAAGTTTGAAATCCAAAAACACGCCAAGGTTG AGCAAGGATGAAGATGATGATTTGTGGGGTGCCATAGCAGCTCCTGCTCCAAAAACATCTTTAAATTTGAAATCAACTAC GACTGAGGATGATGATCCCTGGGCTTCCATTGCTGCTCCTGCACCCACTACCAGGGCCAAACCCTTATCAGCTGGCAGAG GGAGGGGAGCCAAACCTGCTGCTCCGAAATTAGGTGCTCAGCGGATAAACCGGACGTCGTCATCCGGAATGTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0203900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFKFLKEVVGGSGTGVKDLPYTIGEPYPSAWGSWLHHRGTSKDDGSPVSIFSLSGSNAQDGHLAAGRNGVKRLRTVRHPN ILSFLHSTEIETHDGGSLKVTIYIVTEPVMPLSDKIKELGLEGTQRDEYYAWGLHQIAKAVSFLNNDCKLVHGNVCLDSV VVTQTLDWKLHAFDVLSEFDGSNDGSAGQMLQYAWLIGSQYKSMELAKSDWAAIKKSPPWSIDSWGMGCLIYELFSGVKL SKTEELRNTGSIPKSLLPDYQRLLSSMPSRRLNTSKLIENSEYFQNKLVDTIHFMEILSLKDSVEKDTFFRKLPNLAEQL PRPIVLKKLLPLLASALEFGSAAAPALTALLKMGSWLSADEFRVKVLPTIIKLFASNDRAIRVSLLQHIDQFGESLSVQV VDEQVYPHVATGFSDTSAFLRELTLKSMLILAPKLSQRTISGSLLKHLSKLQVDEEAAIRTNTTILLGNIASHLNEGTRK RVLINAFTVRALRDTFPPARGAGIMALCATSSYYDITEIATRILPNVVVLTIDPDSDVRSKAFQAVDQFLQMAKQYYEKT NTAEATGGAGMGMSSIPGNASLLGWAMSSLTLKGKPSDHAAPVASMSSSALTPTSSNASSGILAVETPSTAPVRVSSATD FAEQPVPTSPTSTDGWGELENGLDGPENDKDGWDDLEPLEETKPAPALANIQAAQRRPVSQPVSQSKQASSLKSKNTPRL SKDEDDDLWGAIAAPAPKTSLNLKSTTTEDDDPWASIAAPAPTTRAKPLSAGRGRGAKPAAPKLGAQRINRTSSSGM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 794 | 794 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 794 | 794 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 2 | 284 | 283 | 14.111 | ||
| Gene3D | 12 | 107 | 96 | 5.1E-27 | – | |
| SUPERFAMILY | 37 | 287 | 251 | 6.03E-17 | ||
| Gene3D | 114 | 280 | 167 | 2.9E-28 | – | |
| Gene3D | 282 | 562 | 281 | 1.3E-85 | ||
| SUPERFAMILY | 293 | 551 | 259 | 9.98E-31 | ||
| ProSiteProfiles | 366 | 404 | 39 | 8.663 | ||
| MobiDBLite | 596 | 619 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 602 | 619 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 638 | 656 | 19 | - | – | |
| MobiDBLite | 638 | 679 | 42 | - | – | |
| MobiDBLite | 693 | 797 | 105 | - | – | |
| MobiDBLite | 694 | 716 | 23 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0203900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…