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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0215500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0215500.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein; TAIR: AT5G27970.3 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9VLT1|MON2_DROME Protein MON2 homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2Q805|A0A0B2Q805_GLYSO Protein MON2 like; Found in the gene: LotjaGi5g1v0215500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:52105046..52131007) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCACATCACAGAGGATCTATGCTTCTCTCCCCTTTGCTCAAGATCTACGAGCACCGCGCTTCCATCCATCGACGCACTT CCGAGAGATGGCTTTCATGGCGGTCTTGGAATCCGACCTCCGCGCCCTCTCCGCCGAAGCTCGCCGTCGCTACCCTGCTG TCAAAGACGGCGCCGAGCACGCAATCCTCAAGGTTATACACTCTCCACTCCACACATTTCTTCTCATAGTAGTGATTCTG AATTGCATCTGGTTTTGTCTGTTAGTTATTCTGCTTGCATTGAGTGTTTGGTTAGTCTAGGAGCTGAGTTTGAAGGTAGG AAAATGTGATTAGATTTCAATTTCCACTACTTTGCTTGTAGATCATCGTGATTATTGTAATGGCATAGGATTGAATTGAA TTGAATTGAATTGTAGGTTTTAGCTTAGAGTAAGCTCAATGCTGAAATTTTGGATGCTCGGAAAATGAGGAACATGACAA TTTTTGTTTCCTTCAATTTTTGAACAATGCTTTTAGGGAAGCCTATAATTCAATACTGTTCGATGCAACGGTCTGAAATT ATCTTGTTCGATGCACAAGTGTAATACTAAGAAGTGAAACAGTTTTTTTTTAAAGTGGCGCTTGTTTGCTTGTTTTTGTT CATTTTTTTTTCGTTCTAGATAAATACGGGATTTCTAAGATGTTTACGTTCCTTGCAGCTTCGATCGTTATCAAGTCCTG ATGAAATTGCGCATAATGAGGACATATTACGAATCTTTTTGATGGCGTGTGAGGTCCGAACAGTCAAGCTTAGCATTATT GGGCTTTCGTGTCTGCAGAAACTGATATCTCATGATGCTGTTTCTCCATCAGCTCTGAGGGAGATTTTATCTACGCTGAA AGATGTGAGCATAGATATATAGTTTTATCGTATTAAGGTTTCAAAACTTTTAGCAGGATCTTACTTTTGGCTTTACTCTT 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GACAATCAAAGGGAAATCCGGAGGGAAAGTTTAGCCACGTGGGTTATAAGAAAAAAGATGGGGGAGAAGATAGAGGCAGG GAAATAAGTAGAGGAGAGTGCAGGGTTTCATGAATATCCACGTATTATCCTTTTCTTTAATAGTTTCAGTCTTTGTCGAT ATTGTAAGCCATTGATACTGCTAACATACTGGTACTAGTATTCTCTGAGGAATTATACAGTATATTTACCCCATCTGAGA ATGTTTTGTTCATTTTCTAGCAGACTGATGGATTGAAGATATTTACCCTGTTGATTACTTGATGTGTGTTTAATGTCATC CTTTTGTCTTTAGTTGTGTGAGTATTGTGGAATAAAACTGTTGTTACTTTTCAGGTGTATGACAACAAGAAGAGAAAATC CAGATAGTGCACTTTGGAGGTTAGCTGTTGAGGCGTTCAATCGTGTTGTTGTTGACTATGTCACCAAATTAACCAACAAA GGGCTAGATTCAAGCATTAGTAAACCTGTCAGAACACGTATATGGAAAGAAATTGCTGATGTTTATGAAATATTCCTTGT CGGATATTGTGGACGAGCTCTTCCTTCAAATTCTCTCTCAGCAGTTGTCTTAGAGGCTGATGAGTCCCTAGAGATGTCTA TCTTAAATATTCTTGGTGACTCAGTCCTTCAATTGCCAATTGACACCCCTTTCGATGTAAGTATTTCACCAATAATATTG ATAATTGTAGTTGGTACCCCATGTTATGGACATGCACATCCAATGTATTACTGGTAGTGTATTAAAGAAAGACAGGCTTG GCTGGTGTAGGCATCAGGTGGTGTGTTGCTTGTTTAGGCGTAAGCTTGACCAAGGCTTACGAGGCTGCAGGAAGAAAACA AAACTCCAAGGGAGTATGTTTTATGTTGTTATATTCCTGTGACTGCATGTTAGAAATATAATTTAAAATCATTCACTTGG 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0215500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTTCATGGCGGTCTTGGAATCCGACCTCCGCGCCCTCTCCGCCGAAGCTCGCCGTCGCTACCCTGCTGTCAAAGA CGGCGCCGAGCACGCAATCCTCAAGCTTCGATCGTTATCAAGTCCTGATGAAATTGCGCATAATGAGGACATATTACGAA TCTTTTTGATGGCGTGTGAGGTCCGAACAGTCAAGCTTAGCATTATTGGGCTTTCGTGTCTGCAGAAACTGATATCTCAT GATGCTGTTTCTCCATCAGCTCTGAGGGAGATTTTATCTACGCTGAAAGATCATGCTGAAATGGTGGATGAGGGTGTTCA GCTGAAGACACTTCAAACAATATCAATAATATTTCAGTCACGTTTACTCCCTGAAAACGAGGATACTATGTCTCAAGCTC TCGGTATATGTCTCAGGCTTCTTGAAAACACTCGTTCTTCTGACAGCGTGCGGAATACTGCTGCAGCTACCTTCAGGCAA GCTGTGGCCTTAATTTTCGATCGCGTAGTTTTGGCTGAGTCTCTTCCTGCCGGAAAATTTTCTTTTGGAGGCCAGCTCTC TCGGACAAGTTCAGTTACTGGTGATGTTAACCGTAGCATCAATTTATCCGATTCATTAGATCATGAATCTATTTCTGGAG GGCCTCCTGAGAGGAGGGATACATTAACTGAAACTGGAAAACTTGGGCTGCGCTTGCTTGAAGACTTGACATCTCTTGCC GCAGGTGGATCTGCGATCTGGTTACGTGTTAATATTCTTCACAGGACATTCGCACTTGATATTCTTGAGTTCATTTTGTC AAATTATGTGGCTGTTTTCAGAATCCTGTTACCCTATGAACAAGCTTTACGACGGCAGATATGTTCTCTTCTCATGACAT CACTTCGTACCAATGCTGAGCTTGAAGGAGAAACTGGTGAGCCTAGCTTTCGTCGTTTGGTCTTGCGCTCGGTTGCTCAT 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TCTCAGGTGAAACATGATTCAGAAAATGGGGCTACCCCAGGATTGCCTAATAAAGTTGTAGTGTCTCCAGGTTCTAGATC AACCGCATCTATAAATGCAGGCATTCCTAGTTTTATATTTGCAGAAAAGCTAGTTCCTATGCTGGTTGATCTTTTCCTGC AGGCACCTGCGGTTGAAAAGTATACTATATACCCTGAAATTATCCAAAGCCTTGGAAGGTGTATGACAACAAGAAGAGAA AATCCAGATAGTGCACTTTGGAGGTTAGCTGTTGAGGCGTTCAATCGTGTTGTTGTTGACTATGTCACCAAATTAACCAA CAAAGGGCTAGATTCAAGCATTAGTAAACCTGTCAGAACACGTATATGGAAAGAAATTGCTGATGTTTATGAAATATTCC TTGTCGGATATTGTGGACGAGCTCTTCCTTCAAATTCTCTCTCAGCAGTTGTCTTAGAGGCTGATGAGTCCCTAGAGATG TCTATCTTAAATATTCTTGGTGACTCAGTCCTTCAATTGCCAATTGACACCCCTTTCGATGTTCTGCAGCGACTGGTCTC CACATTGGATCGTTGTGCATCACGTACTTGCTCATTGCCTGTTGAGACAGTAGAGCTTATGCCTCCGCACTGCAGCAGAT TTTCGTTGACTTGCTTACAGAAGTTATTTTTGTTGAGCAGTTATTCTGATGAAGTCCATTGGAATTTGACAAGATCTGAA GTCAGCAAAATCTCAATTACAGTGCTCATGACCAGATGTGAATACATCTTGAGCAGGTTTCTGACAGATGAAAATAACTT AGGAGAGTGTCCATTACCAAAAGCAAGACTTGAAGAAATTGTTTACGTTCTCCAAGAACTGGCCCGTCTTGTAATTCATC CAGATGCGGCATCCATTATCCCTTTACAGCCATGGCTGAGAACTGGCCTAGCAGAGAACAAAGAGAAGCATGACTATCGT CCCCATCTGTTTGTGCTATTACCTTCCTTTTGTGAGCTTGTTACATCGAGAGAATTAACAATACGGGAGCTAGTGCAAGT ACTACTTCGATTAGTCACCAAGGAATTGTCTCTGGAAAAACTCAGCTTAGTGAGTGAATCCAGATAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0215500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAFMAVLESDLRALSAEARRRYPAVKDGAEHAILKLRSLSSPDEIAHNEDILRIFLMACEVRTVKLSIIGLSCLQKLISH DAVSPSALREILSTLKDHAEMVDEGVQLKTLQTISIIFQSRLLPENEDTMSQALGICLRLLENTRSSDSVRNTAAATFRQ AVALIFDRVVLAESLPAGKFSFGGQLSRTSSVTGDVNRSINLSDSLDHESISGGPPERRDTLTETGKLGLRLLEDLTSLA AGGSAIWLRVNILHRTFALDILEFILSNYVAVFRILLPYEQALRRQICSLLMTSLRTNAELEGETGEPSFRRLVLRSVAH IIRLYSSSLITECEVFLSMLLKVTFLDLPLWHRILVLEILRGFCVEARTLRILFQNFDMNPKNTNVVEGMVKALARVVSS IQVQESSEESLAAVAGMFSSKAKGIEWSLDNDASNAAVLVASEAHAITLAVEGLLGVVFTVATLTDEAIDVGDLESPRCD KDPLVICTGKTAVLCISMVDSLWLTILDALSLILSRSQGEAIVLEILKGYQAFTQACGILRAVEPLNSFLASLCKFTINF PVETEKRSSALPSPISKRSELSVDLRDNIVLTPKNVQALRTLFNIAHRLHNVLGPSWVLVLETLAALDRAIHSPHATTQE VSTPVPKFTRQSSTQYSDFNILSSLNSQLFESSALMNVSAVKSLLSALCQLSHQCMCDASSGPGPTTSQKIGSISFSVER MISILVNNVHRVEPFWDQVVSHFLELADHSNPHLKNMALDALDQSMSAVLGSDRFQDYKQSKSLETSPEMEANLDKLRTL ECSVISPLKVLYFSTQSIDVRVGSLKILLHVLERYGEKLHYSWPNILELLRYVAADVSEKDLVTLGFQSLRVIMNDGLST LPSDCLQVCVDVTGAYSAQKTELNISLTAVGLLWTMTDFIAKGLLDGPLKEKETGAGSIVKQIDNEKMGDQTHNLSNNVR DDCTDFEKLLFSVFSLLQNLGADERPEVRNSAVRTLFQTLGTHGQKLSKSMWEDCLWNYVFPTLDRASFMAATSSKDEWQ GKELGTRGGKAVHMLIHHSRNTAQKQWDETLVLVLGGIARILRFFFPFFTTLSNFWSGWESLLQFVEKSISYRSKEVALA AINCLQTTVNSHSSKGNMPMPYLVSVVDVYELVLKTPSNFSGNSTDKVKQEILHGLGELYVQAQGLFNDVMYTQLIAIID LAVKQAMLTNDNFEIEFGSVPPVLRTILEIIPLLRPTEHISSMWPVFLQEFLQYLPRQDSHVQNEDGKIDQARGSDLIPD SQVKHDSENGATPGLPNKVVVSPGSRSTASINAGIPSFIFAEKLVPMLVDLFLQAPAVEKYTIYPEIIQSLGRCMTTRRE NPDSALWRLAVEAFNRVVVDYVTKLTNKGLDSSISKPVRTRIWKEIADVYEIFLVGYCGRALPSNSLSAVVLEADESLEM SILNILGDSVLQLPIDTPFDVLQRLVSTLDRCASRTCSLPVETVELMPPHCSRFSLTCLQKLFLLSSYSDEVHWNLTRSE VSKISITVLMTRCEYILSRFLTDENNLGECPLPKARLEEIVYVLQELARLVIHPDAASIIPLQPWLRTGLAENKEKHDYR PHLFVLLPSFCELVTSRELTIRELVQVLLRLVTKELSLEKLSLVSESR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Pfam | 3 | 170 | 168 | 3.5E-39 | ||
| SUPERFAMILY | 72 | 1249 | 1178 | 2.56E-18 | ||
| Pfam | 230 | 386 | 157 | 6.8E-34 | ||
| PANTHER | 639 | 1642 | 1004 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 639 | 1642 | 1004 | 0.0 | – | |
| Pfam | 803 | 870 | 68 | 1.3E-5 | ||
| Pfam | 876 | 1133 | 258 | 3.3E-48 | ||
| MobiDBLite | 1263 | 1283 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 1263 | 1298 | 36 | - | – | |
| Pfam | 1318 | 1572 | 255 | 4.7E-17 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0215500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…