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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0215500 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0215500.4 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein; TAIR: AT5G27970.3 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9VLT1|MON2_DROME Protein MON2 homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2Q805|A0A0B2Q805_GLYSO Protein MON2 like; Found in the gene: LotjaGi5g1v0215500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:52105078..52127851) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTTGCTCAAGATCTACGAGCACCGCGCTTCCATCCATCGACGCACTTCCGAGAGATGGCTTTCATGGCGGTCTTGGAAT CCGACCTCCGCGCCCTCTCCGCCGAAGCTCGCCGTCGCTACCCTGCTGTCAAAGACGGCGCCGAGCACGCAATCCTCAAG GTTATACACTCTCCACTCCACACATTTCTTCTCATAGTAGTGATTCTGAATTGCATCTGGTTTTGTCTGTTAGTTATTCT GCTTGCATTGAGTGTTTGGTTAGTCTAGGAGCTGAGTTTGAAGGTAGGAAAATGTGATTAGATTTCAATTTCCACTACTT TGCTTGTAGATCATCGTGATTATTGTAATGGCATAGGATTGAATTGAATTGAATTGAATTGTAGGTTTTAGCTTAGAGTA AGCTCAATGCTGAAATTTTGGATGCTCGGAAAATGAGGAACATGACAATTTTTGTTTCCTTCAATTTTTGAACAATGCTT TTAGGGAAGCCTATAATTCAATACTGTTCGATGCAACGGTCTGAAATTATCTTGTTCGATGCACAAGTGTAATACTAAGA AGTGAAACAGTTTTTTTTTAAAGTGGCGCTTGTTTGCTTGTTTTTGTTCATTTTTTTTTCGTTCTAGATAAATACGGGAT TTCTAAGATGTTTACGTTCCTTGCAGCTTCGATCGTTATCAAGTCCTGATGAAATTGCGCATAATGAGGACATATTACGA ATCTTTTTGATGGCGTGTGAGGTCCGAACAGTCAAGCTTAGCATTATTGGGCTTTCGTGTCTGCAGAAACTGATATCTCA TGATGCTGTTTCTCCATCAGCTCTGAGGGAGATTTTATCTACGCTGAAAGATGTGAGCATAGATATATAGTTTTATCGTA TTAAGGTTTCAAAACTTTTAGCAGGATCTTACTTTTGGCTTTACTCTTTGCCCTTTGGCCATATTGCGTCATACTTTTTA 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AAAGTTTTAAAGAAAGAATTTTCAATTTTAACAACTTTCACATGAATGCATTTTTCCATTTTTCTAGGGGAGTGTTCCAC CTGTGCTGCGGACAATACTGGAAATCATACCACTGTTACGTCCAACAGAGCACATTTCTTCTATGTGGCCTGTTTTTCTT CAAGAGTTTCTGCAATATCTTCCTAGACAGGATTCTCATGTACAGAATGAGGATGGTAAAATAGATCAAGCAAGAGGATC AGACCTTATCCCAGGTATCAAAGAATCTGGCTGTACCTAAGTTAGTTTCCAGTATTTCCTTTAGGTGAAAGTGTAATATC TATGTTATTTTTTGCAGATTCTCAGGTGAAACATGATTCAGAAAATGGGGCTACCCCAGGATTGCCTAATAAAGTTGTAG TGTCTCCAGGTTCTAGATCAACCGCATCTATAAATGCAGGCATTCCTAGTTTTATATTTGCAGAAAAGCTAGTTCCTATG CTGGTTGATCTTTTCCTGCAGGCACCTGCGGTTGAAAAGTATACTATATACCCTGAAATTATCCAAAGCCTTGGAAGGTA TTAATTGCTCTTAATTATTTTCACTTGTTTTCTGCTACTCTGCTGTTAAGGGGAAGGGTAGGATAACTTGCATAATGGGT GGTGAGGGCATTTTTTTTCATTTAAGTTTTTATTGGAAACTAGGGCAATGAAAAATTACTTAAGCTTGGGATGAATTCTA CTCATTCCAACCTCTATAGTAGCTCCTCCTAAAAGTAAGTTTTACCCTTGGAATTGACAGCTATGTACTTTCTAGTTTCT ACCACTTGATCAGATCTGGTTTCTACTGCGTAGAATATGGGACTCTTTTAGGAAACCTCCTACTACTAAGGTTTGTATTA GGAAAGGGCTCAAATAGGTTATCACGGTCACGGATAATTAAATGATTAGACAATCAAAGGGAAATCCGGAGGGAAAGTTT AGCCACGTGGGTTATAAGAAAAAAGATGGGGGAGAAGATAGAGGCAGGGAAATAAGTAGAGGAGAGTGCAGGGTTTCATG AATATCCACGTATTATCCTTTTCTTTAATAGTTTCAGTCTTTGTCGATATTGTAAGCCATTGATACTGCTAACATACTGG TACTAGTATTCTCTGAGGAATTATACAGTATATTTACCCCATCTGAGAATGTTTTGTTCATTTTCTAGCAGACTGATGGA TTGAAGATATTTACCCTGTTGATTACTTGATGTGTGTTTAATGTCATCCTTTTGTCTTTAGTTGTGTGAGTATTGTGGAA TAAAACTGTTGTTACTTTTCAGGTGTATGACAACAAGAAGAGAAAATCCAGATAGTGCACTTTGGAGGTTAGCTGTTGAG GCGTTCAATCGTGTTGTTGTTGACTATGTCACCAAATTAACCAACAAAGGGCTAGATTCAAGCATTAGTAAACCTGTCAG AACACGTATATGGAAAGAAATTGCTGATGTTTATGAAATATTCCTTGTCGGATATTGTGGACGAGCTCTTCCTTCAAATT CTCTCTCAGCAGTTGTCTTAGAGGCTGATGAGTCCCTAGAGATGTCTATCTTAAATATTCTTGGTGACTCAGTCCTTCAA TTGCCAATTGACACCCCTTTCGATGTAAGTATTTCACCAATAATATTGATAATTGTAGTTGGTACCCCATGTTATGGACA TGCACATCCAATGTATTACTGGTAGTGTATTAAAGAAAGACAGGCTTGGCTGGTGTAGGCATCAGGTGGTGTGTTGCTTG TTTAGGCGTAAGCTTGACCAAGGCTTACGAGGCTGCAGGAAGAAAACAAAACTCCAAGGGAGTATGTTTTATGTTGTTAT ATTCCTGTGACTGCATGTTAGAAATATAATTTAAAATCATTCACTTGGTTCTTTATCTTATTTTAAATTTTATTGCCTTC 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AGACTCTAGAGGCTTCACTAATAATAGCGTACATTTTTTAGAGTGTACAAATACAAATATAAACTAATTGCACGAGGCTA TACTCATGCATTCTATTCGTAAATTTCTATTAATGAGATCTTATCTACTCACCCTTGATAAAAATCGGACTAGCCATCTA TTCGGGAGTTACCCCTTGCTTTTATTTTAATATACATTCTGATCTTACTATACGTTATCTTGGTTATGTTGACCAATTTT ACATAATGTTCTTAGTTATTCTGATGAAGTCCATTGGAATTTGACAAGATCTGAAGTCAGCAAAATCTCAATTACAGTGC TCATGACCAGATGTGAATACATCTTGAGCAGGTTTCTGACAGATGAAAATAACTTAGGTGAGCTTCTTCTTTAATCTAAG ATAGTAGTCATTCATAATCTTTATTCTACCTCCCACTATTTGCCGCTTAACTATTTTCTTTTTCCTGCAGGAGAGTGTCC ATTACCAAAAGCAAGACTTGAAGAAATTGTTTACGTTCTCCAAGAACTGGCCCGTCTTGTAATTCATCCAGATGCGGCAT CCATTATCCCTTTACAGCCATGGCTGAGAACTGGCCTAGCAGAGAACAAAGAGAAGCATGACTATCGTCCCCATCTGTTT GTGCTATTACCTTCCTTTTGTGAGCTTGTTACATCGAGGTAAGTATAAATTTGAGCGGCCATGCTTTATATTCGGCCCGC ACACATTTGGAACCTTTTGCAATATAAATGCACAAAAAATTCAAAAGATGCTAAGCCATTTCACAATGTAAAATAAATGC CTGCTAGATTCTGACAATGTCAGACAAAGCATAGTTTGGCCTACGTGTCATCTTTTTTTAAATCCTATGAAGTGTTTCTC TCCAAACATAGACTAAATAATCTTGAAAGGGACTTTGACCTCTAGCAAAAACTGAGAAAACCTAGTTTTTCTTTTCTTTT CATTATATATTTCTTTCTTCTTCCATTTCTGTTTCTAAATTTTGTTCTTTTATGGACAGAGAATTAACAATACGGGAGCT AGTGCAAGTACTACTTCGATTAGTCACCAAGGAATTGTCTCTGGAAAAACTCAGCTTAGTGAGTGAATCCAGATAAGCTC ACTCTTAAAGTCCTTTACTTTAAAAAATTTAAGCTTATAGAAAGGTGTGTTTTTTCTCACCCCTTTATCTTGGCAAGTAT TGTATATTTTTTTTGTATAGACTAGACTTAGAACCACCAATAGAGGTTTGCCCAGTCTACTCTTGCTATTGCTTTTTCAT GAATTATGGTCAACCATACTGTCCCAGCTCCGTGAGCCACCTTCCCATACCTCACCTCAAGTTCTTTCGACATATCAAAG TATTCCATGCAGTCCCTTTGGAAAACAAATCGTGAACTTGAAGAGAACCCTACATCTTTGAAAAATTATTGAGCAGGTTA TAGAATTATGTGTGGTTTAACAGCAAAAGGGAGATGAAGAAACCAATTAAAAGAGTATTAGTGAGAGGATCTACAGTCCC CTTGCCTTGCCAATTTTGTTGTACCCAATCAGTGTGAAGTATGAGTCTGACGTTTCATTCAGGCTTTTTTTGTTTTTGTT TTTTTACATGAGCCCAGGCTTTTTTATTTTATTTTTTTTGAAATTTTTATACTA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0215500.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTTCATGGCGGTCTTGGAATCCGACCTCCGCGCCCTCTCCGCCGAAGCTCGCCGTCGCTACCCTGCTGTCAAAGA CGGCGCCGAGCACGCAATCCTCAAGCTTCGATCGTTATCAAGTCCTGATGAAATTGCGCATAATGAGGACATATTACGAA TCTTTTTGATGGCGTGTGAGGTCCGAACAGTCAAGCTTAGCATTATTGGGCTTTCGTGTCTGCAGAAACTGATATCTCAT GATGCTGTTTCTCCATCAGCTCTGAGGGAGATTTTATCTACGCTGAAAGATCATGCTGAAATGGTGGATGAGGGTGTTCA GCTGAAGACACTTCAAACAATATCAATAATATTTCAGTCACGTTTACTCCCTGAAAACGAGGATACTATGTCTCAAGCTC TCGGTATATGTCTCAGGCTTCTTGAAAACACTCGTTCTTCTGACAGCGTGCGGAATACTGCTGCAGCTACCTTCAGGCAA GCTGTGGCCTTAATTTTCGATCGCGTAGTTTTGGCTGAGTCTCTTCCTGCCGGAAAATTTTCTTTTGGAGGCCAGCTCTC TCGGACAAGTTCAGTTACTGGTGATGTTAACCGTAGCATCAATTTATCCGATTCATTAGATCATGAATCTATTTCTGGAG GGCCTCCTGAGAGGAGGGATACATTAACTGAAACTGGAAAACTTGGGCTGCGCTTGCTTGAAGACTTGACATCTCTTGCC GCAGGTGGATCTGCGATCTGGTTACGTGTTAATATTCTTCACAGGACATTCGCACTTGATATTCTTGAGTTCATTTTGTC AAATTATGTGGCTGTTTTCAGAATCCTGTTACCCTATGAACAAGCTTTACGACGGCAGATATGTTCTCTTCTCATGACAT CACTTCGTACCAATGCTGAGCTTGAAGGAGAAACTGGTGAGCCTAGCTTTCGTCGTTTGGTCTTGCGCTCGGTTGCTCAT ATTATAAGACTTTACAGTTCTTCCCTTATAACTGAATGTGAAGTTTTTCTTAGTATGTTACTGAAGGTTACTTTTCTTGA CTTGCCATTATGGCATCGCATTCTTGTTCTTGAGATTTTGAGGGGGTTTTGTGTTGAGGCTCGGACATTGCGGATTCTTT TCCAGAATTTTGACATGAACCCTAAGAATACAAATGTTGTGGAGGGAATGGTTAAAGCTCTTGCCAGGGTTGTTTCAAGT ATACAGGTTCAAGAATCAAGTGAGGAGAGCCTGGCAGCTGTTGCAGGAATGTTTAGTAGCAAGGCAAAAGGTATTGAGTG GAGTCTAGACAATGATGCATCTAATGCTGCAGTCTTAGTAGCTAGTGAAGCACATGCCATAACTTTGGCAGTTGAAGGCC TGTTAGGGGTTGTTTTCACTGTTGCGACTTTAACAGATGAAGCCATAGATGTTGGAGATCTTGAGTCCCCTAGATGTGAT AAAGATCCACTAGTAATATGTACTGGTAAAACTGCAGTTCTCTGCATCTCAATGGTTGACTCACTGTGGTTGACAATACT TGATGCGCTATCCCTTATTCTATCAAGGTCACAAGGAGAGGCCATTGTATTAGAAATATTAAAGGGATATCAGGCATTCA CTCAGGCTTGCGGGATTCTCCGAGCTGTAGAACCTTTAAACTCGTTTCTTGCATCCCTTTGCAAATTTACCATCAATTTT CCTGTTGAAACAGAAAAAAGGAGCAGTGCTTTGCCATCGCCTATATCAAAACGGTCAGAACTATCAGTTGACCTGAGGGA TAACATTGTGCTTACTCCCAAGAATGTACAGGCTTTGAGAACTCTTTTCAACATTGCTCACCGGTTGCATAATGTTTTAG GCCCATCCTGGGTTTTGGTGTTGGAAACTCTAGCAGCTTTAGATCGAGCAATTCATTCCCCACATGCTACCACTCAGGAG 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TGTACTGATTTTGAGAAGCTTCTATTCTCAGTTTTCTCATTACTTCAAAACCTTGGGGCAGATGAGAGACCAGAGGTTAG GAATTCTGCTGTGAGGACACTTTTCCAAACTTTAGGAACTCATGGGCAAAAGCTTTCAAAGAGCATGTGGGAAGATTGTC TTTGGAATTATGTATTTCCTACATTAGATCGTGCTTCTTTTATGGCTGCTACTTCATCAAAAGATGAATGGCAAGGTAAA GAACTTGGAACTCGCGGAGGAAAAGCAGTTCACATGCTCATACATCATAGTCGTAACACAGCTCAGAAGCAGTGGGATGA AACTCTTGTGCTTGTTCTTGGTGGAATAGCACGTATATTACGTTTCTTCTTTCCTTTTTTCACAACCTTGAGTAACTTCT GGTCTGGGTGGGAATCATTGCTTCAATTTGTTGAGAAGAGCATTTCATATCGTAGTAAAGAAGTAGCACTTGCAGCAATT AATTGTTTGCAGACAACTGTTAACTCCCATTCGTCAAAGGGAAATATGCCAATGCCCTACCTTGTTTCAGTGGTTGATGT TTATGAGCTTGTTCTGAAAACGCCTTCCAATTTCAGTGGCAATTCCACTGACAAGGTGAAGCAGGAGATTTTGCATGGCC TTGGGGAGCTTTATGTGCAGGCTCAAGGATTGTTCAATGATGTCATGTACACACAGTTGATAGCAATCATAGATTTGGCT GTGAAGCAAGCCATGTTAACTAATGATAACTTTGAAATAGAATTTGGGAGTGTTCCACCTGTGCTGCGGACAATACTGGA AATCATACCACTGTTACGTCCAACAGAGCACATTTCTTCTATGTGGCCTGTTTTTCTTCAAGAGTTTCTGCAATATCTTC CTAGACAGGATTCTCATGTACAGAATGAGGATGGTAAAATAGATCAAGCAAGAGGATCAGACCTTATCCCAGATTCTCAG GTGAAACATGATTCAGAAAATGGGGCTACCCCAGGATTGCCTAATAAAGTTGTAGTGTCTCCAGGTTCTAGATCAACCGC ATCTATAAATGCAGGCATTCCTAGTTTTATATTTGCAGAAAAGCTAGTTCCTATGCTGGTTGATCTTTTCCTGCAGGCAC CTGCGGTTGAAAAGTATACTATATACCCTGAAATTATCCAAAGCCTTGGAAGGTGTATGACAACAAGAAGAGAAAATCCA GATAGTGCACTTTGGAGGTTAGCTGTTGAGGCGTTCAATCGTGTTGTTGTTGACTATGTCACCAAATTAACCAACAAAGG GCTAGATTCAAGCATTAGTAAACCTGTCAGAACACGTATATGGAAAGAAATTGCTGATGTTTATGAAATATTCCTTGTCG GATATTGTGGACGAGCTCTTCCTTCAAATTCTCTCTCAGCAGTTGTCTTAGAGGCTGATGAGTCCCTAGAGATGTCTATC TTAAATATTCTTGGTGACTCAGTCCTTCAATTGCCAATTGACACCCCTTTCGATGTTCTGCAGCGACTGGTCTCCACATT GGATCGTTGTGCATCACGTACTTGCTCATTGCCTGTTGAGACAGTAGAGCTTATGCCTCCGCACTGCAGCAGATTTTCGT TGACTTGCTTACAGAAGTTATTTTTGTTGAGCAGTTATTCTGATGAAGTCCATTGGAATTTGACAAGATCTGAAGTCAGC AAAATCTCAATTACAGTGCTCATGACCAGATGTGAATACATCTTGAGCAGGTTTCTGACAGATGAAAATAACTTAGGAGA GTGTCCATTACCAAAAGCAAGACTTGAAGAAATTGTTTACGTTCTCCAAGAACTGGCCCGTCTTGTAATTCATCCAGATG CGGCATCCATTATCCCTTTACAGCCATGGCTGAGAACTGGCCTAGCAGAGAACAAAGAGAAGCATGACTATCGTCCCCAT CTGTTTGTGCTATTACCTTCCTTTTGTGAGCTTGTTACATCGAGAGAATTAACAATACGGGAGCTAGTGCAAGTACTACT TCGATTAGTCACCAAGGAATTGTCTCTGGAAAAACTCAGCTTAGTGAGTGAATCCAGATAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0215500.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAFMAVLESDLRALSAEARRRYPAVKDGAEHAILKLRSLSSPDEIAHNEDILRIFLMACEVRTVKLSIIGLSCLQKLISH DAVSPSALREILSTLKDHAEMVDEGVQLKTLQTISIIFQSRLLPENEDTMSQALGICLRLLENTRSSDSVRNTAAATFRQ AVALIFDRVVLAESLPAGKFSFGGQLSRTSSVTGDVNRSINLSDSLDHESISGGPPERRDTLTETGKLGLRLLEDLTSLA AGGSAIWLRVNILHRTFALDILEFILSNYVAVFRILLPYEQALRRQICSLLMTSLRTNAELEGETGEPSFRRLVLRSVAH IIRLYSSSLITECEVFLSMLLKVTFLDLPLWHRILVLEILRGFCVEARTLRILFQNFDMNPKNTNVVEGMVKALARVVSS IQVQESSEESLAAVAGMFSSKAKGIEWSLDNDASNAAVLVASEAHAITLAVEGLLGVVFTVATLTDEAIDVGDLESPRCD KDPLVICTGKTAVLCISMVDSLWLTILDALSLILSRSQGEAIVLEILKGYQAFTQACGILRAVEPLNSFLASLCKFTINF PVETEKRSSALPSPISKRSELSVDLRDNIVLTPKNVQALRTLFNIAHRLHNVLGPSWVLVLETLAALDRAIHSPHATTQE VSTPVPKFTRQSSTQYSDFNILSSLNSQLFESSALMNVSAVKSLLSALCQLSHQCMCDASSGPGPTTSQKIGSISFSVER MISILVNNVHRVEPFWDQVVSHFLELADHSNPHLKNMALDALDQSMSAVLGSDRFQDYKQSKSLETSPEMEANLDKLRTL ECSVISPLKVLYFSTQSIDVRVGSLKILLHVLERYGEKLHYSWPNILELLRYVAADVSEKDLVTLGFQSLRVIMNDGLST LPSDCLQVCVDVTGAYSAQKTELNISLTAVGLLWTMTDFIAKGLLDGPLKEKETGSIVKQIDNEKMGDQTHNLSNNVRDD CTDFEKLLFSVFSLLQNLGADERPEVRNSAVRTLFQTLGTHGQKLSKSMWEDCLWNYVFPTLDRASFMAATSSKDEWQGK ELGTRGGKAVHMLIHHSRNTAQKQWDETLVLVLGGIARILRFFFPFFTTLSNFWSGWESLLQFVEKSISYRSKEVALAAI NCLQTTVNSHSSKGNMPMPYLVSVVDVYELVLKTPSNFSGNSTDKVKQEILHGLGELYVQAQGLFNDVMYTQLIAIIDLA VKQAMLTNDNFEIEFGSVPPVLRTILEIIPLLRPTEHISSMWPVFLQEFLQYLPRQDSHVQNEDGKIDQARGSDLIPDSQ VKHDSENGATPGLPNKVVVSPGSRSTASINAGIPSFIFAEKLVPMLVDLFLQAPAVEKYTIYPEIIQSLGRCMTTRRENP DSALWRLAVEAFNRVVVDYVTKLTNKGLDSSISKPVRTRIWKEIADVYEIFLVGYCGRALPSNSLSAVVLEADESLEMSI LNILGDSVLQLPIDTPFDVLQRLVSTLDRCASRTCSLPVETVELMPPHCSRFSLTCLQKLFLLSSYSDEVHWNLTRSEVS KISITVLMTRCEYILSRFLTDENNLGECPLPKARLEEIVYVLQELARLVIHPDAASIIPLQPWLRTGLAENKEKHDYRPH LFVLLPSFCELVTSRELTIRELVQVLLRLVTKELSLEKLSLVSESR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Pfam | 3 | 170 | 168 | 3.4E-39 | ||
| SUPERFAMILY | 73 | 1264 | 1192 | 1.7E-15 | ||
| Pfam | 230 | 386 | 157 | 6.8E-34 | ||
| PANTHER | 639 | 1640 | 1002 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 639 | 1640 | 1002 | 0.0 | – | |
| Pfam | 803 | 870 | 68 | 1.3E-5 | ||
| Pfam | 876 | 1131 | 256 | 7.5E-49 | ||
| MobiDBLite | 1261 | 1296 | 36 | - | – | |
| MobiDBLite | 1261 | 1281 | 21 | - | – | |
| Pfam | 1316 | 1570 | 255 | 4.7E-17 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0215500.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…