Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0216700 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0216700.1 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | WD repeat-containing protein-like protein; TAIR: AT3G05090.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q5F3K4|WDR48_CHICK WD repeat-containing protein 48; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VMJ6|A0A072VMJ6_MEDTR Transducin/WD40 repeat protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0216700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:52270916..52285321) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAATCCGGGAGCAAAACATGGATTTTCCTTAAACAGATTTATCCCTCATTGAAAAGACAATCTTATCCTCAATTCTGCAA AAAATAAAATAAAAAAAACTGAGTCAAATCATCAAATGACCTTCCACAATAAAATTGAAAGTCGCATTTACATTTTCATC TTCCATCTTCTTCTTCTTTTTCCCATCTCTCTAACTTTCCCGGAAAATAACAACACATTTTCTCTGCAATTTCGGAGCTT CCAAACAGCATACAAGTTCATCAACAGAGCCACACATTCGTCACTGATCGAGGTTCGGACTTCGTTTTCTCACGTTCCAT CTTCCGATTTTTGTTTTCCGATTGTTTGTTTATTCGTATTGATTGTGAATTTTTTTGATGAGGCTAGGCTAGTTAATATG TGTTGCGGTTTAAGATTTACTGTTATCGTTTTAATTTGTTGTTTCTGCTTATCTGGAATGAATGATTTCGGACATTCGGC TGGCTTTGAATCTCTTCTAGGTTCGGTTTTGGTGATTGATTATGTTACCGTGGTGTTTAGGTTTGGATTTTCATAGTAAG CTTTTGATGATTGGAATTTACGACCATGCTCGAGGTTGAATTAGTCATGTTTCTTGCGTTTCAGTGAAATTATTGGTTCT ACTTGGCTCATGTTTTTGCATTTTAGGAGCTTTTAGACTTTAGTATTTGACTTTGTTGTTTTTGCGTTATTTCTGTACTC CTGCGTTATGCAAAATGCGCTGGTATAGCTGGCACTTTCTCGGAAGCTGATTGTGCCCTTAAGACTAGAGAGTTCTTCTG TTTGATGAACTGCTAGGATTGACCATGCGCAAATTGTTATCTGTTCAGTTATGATGGTGGCTTTAATAAGTGTGGATATA TTTCCTTTTGTCTGTTTGATATTTTGTTACTGGGTTGGGTTTGTCGAAGACATTTTGAAAATTCAGTTTGTGGAATTTTT TGGAGTTTTAGGGTTGATAGTTCAGGTATACAAGGTGTTAGAAACTTAGAATAGTTTTCTCTTTTGTAACACCTTTGAAC TGCAGTAAATATTCCACTGAAAGTACCGCCTCTCTGCATCTTGCTAACCTTTTTGAATATTAATTATATATTTTTTATGT CTGAGGACTTGTGTTTGTTTGGAGCTAATAATTTAATTTAGTATAGCACCTTTTCATCATTTTTAATTTACTCCTGGATA TGCTATTCATGCTATGTGATTTATCTTTTATGAACTGTCGCAGTTTTGGCAATGCACCGCGTGGGTAGTGCAGGGAACAC AAACAGTTCAACTCACCCGCGTAAGGAGAAGAGATTAACATATGTGTTGAATGATTCTGATGACACAAAGGTGAACTTAT TATTGCTTTATTCTATCTGTTTCATGAAAGAGGCCAAGTTTCGTGTTTTTGGTGACTGACATCTTTATCCCCTTAGATAT TTTCTTTGGGCTTTTGTCTGCTAGATGAGATTGATAGTGTTGTTATTTATGTTAACTACATGATATTCATATTGTTCTAT ATCTTTCAATATTAGATCCTTTGGTGGAATACATACTTTCCTCCTTCCTGTCAATAGTTATCATCATTTTACCTCATCAT CAGTGATAGCTTTATCAATAGTTTGATGTATACAATGGTGCCAGTTACATTTTGACTAGGTATTTACATGTAGACATGTA GTAGATGCTACTTCTGCATCCATCTTGCAGCTTTTAGCTGGACGTGGAACTCTTTAAAGTTTGACAATTTTCTTTGTTGG TTTATCTATATTCACTTGAAAGTTGGTTCTTTTCCACAGCATTGCGCAGGCATAAATTGTTTGGCCGTACTTAAGTCTGC AGTATCTGATGGGTCTGATTATCTCTTCACTGGGAGCCGTGATGGCAGGCTAAAACGGTGGGCACTAGGTGAGGATGCAG CAACATGCTCTGCTACCTTTGAAGCTCATGTGGACTGGGTAATACTTCTCTCTATCTCTGTGCGCCACACACACACACGC AAACGTTTGTTTGTACATCCTCCATTTGTCTGGTGACTCATGGTTTACTAGGAATAACCTCATGAATGCTACAATTTTAT TTTCTACGGTTACATTATGATGCTTCAGCTTCTATGTTTACTGTTCTCCAATTTTTTCATAAGATGGATGTCTAAGTGAA GTTCAACTTAAACCCCAAACTTTGTGGTCGGTTTTAAAGCTGTAGCAGTGGGAAACTATTCACTAGGCTAGGTGCAAAAT ATGTATCATTGAGATGAATATAGTTTTCTTAATTTCTTGCCTTAAAGGTGGTCTGGTCTGCAATTGTTGAAACTTGAAAG TAAAATTTATTTTACTTATTTTGTATAGTGCATATACTGTTATTTTTCTTTTGTGTTTAAGAGGTCAGTAGCCTTAAGTC CTTTGGTTTTGCTTGTGCTCAAAATTTAATCCCACAATTGAGATTTGTTTTAATATTGAAAGAGACAACAACGGTCACTG AATTCGTGAACCTCTTTGACTGTGGTTTCATCATGTTTCCTTTTATTGCCATGTAATAGAGGATATAGATAGTATATACA TACACTTGTTAAATATGTAGATGTTACTTTTTATGTTTACAGGTTAATGATGCCGTTCTTGTGGGTGATAGTACCCTTGT TTCTTGTTCGTCAGATACAACCCTTAAGGTTTGTTGCCTGTTAGTTATTTATTGTAATCAATCATTGCCCTTTTGCTGTG CTAGCAGCACTGATATAATTTTACTCCTTTCCGGCTGTTGTATGTTTATGCCAGACATGGGATGCCTTTTCCACTGGAAC ATGTACTAGGACGCTCCGCCAACACTCAGATTATGTTACTTGCCTTGCAGCATCTGAAAAAAATGTAATGTACTTTGAAC TTTCCATGCTTCTTACTAAGTGCTTCAAGCATTTTTTTTTCTGTGTTTGACGTTACAGCTAGTTTGATTGGTTTTAAAGT TTGAATCTTATCAAATCCATTTTCTGATCCTTTAATAGTGTCGTGACTTTTAGAGCAATATTGTTGCCTCTGGTGGCCTC GGTGGAGAGGTTTTCGTATGGGATCTTGAAGCTGCACATGCTTCAGCTGCAAAGTGCATTGATGCTACGGATGATGATAC TTCAAATGGTATCAATGGTTCTGGGAACTCATTACCATTGACTAGCTTACGTAGCATCAGCTCAAGTAACAGTATATCTG TGCACACTACTCAAAATCAAGGATACATTCCAATTGCTGCTAAAGGCCATAAGGAATCTGTTTATGCATTGGCAATGAAT GAAGGTGGAACACTTCTTGTCTCTGGTGGTACAGAAAAGGTACAATGGGATTCATGCTAACATACATGTTCCAATTTAGT GTGGCTTCTGTCTGTTATTACCCTTGGAATTTTAGAGCATGGTTTACTTTTGTTTTATTTTATTTTTTGTTTCTCCAGGT TGTGCGTGTTTGGGATCCAAGATCTGGATCAAAGACTATGAAACTAAAAGGGCATACAGATAACATCAGGGCTTTGCTTC TGGATTCTACTGGCAGGTTTGTTGATTGGACACATACTTTTTAATTTACATTTGTATTTTTTAGAGTCTTTCCTCATACC TGCATTGTTTCTTCTATTCTGCTCAAATTACTGTTAACAAACATTAGAGTTAGGAACTTGTTTATGAATTTTTTATTATC ATAAAATTCCCACTATATCTGCTTCAGTGTTTCTCCTATGACATTTGTGTATTATGACAACACACAACTAAGCACATAAA TAACACAAAGCAAACCACTATCTTAGTCCTCCAAAGATTTAGGCATTACCGCATGATCACTTCAGTGCCCAAAAGATTTT TGTCAACAATTTAGTCCCTCGATAGTTAAAATTGTCATCATTTTGGTCCTTTTGTCACCCTATATTAAAAGTCTGTTCAA CGAGACCTTGATATGGTCTGTTATCTACTTGGATGCTGATGTGGTCCATTATCTACTTGCCATGTCAATGCCTATTAGAC AGCCTTCTAAGAAACGGGAATCTAGGACCAAAATGGTGACTCTTTGAGTTATTGAGGGACTCATAGCATGTCCATTTTAA ATATTATCTAATACCAACTGGCGCTTGATAGAAGGGGGGTCTTTATTTCTCTCCAGTCAATGGGATTGGAATTTGTGCCA CATTTATTTATGGCCATTGGATTTGCATGAAATGCTGTGCCAGGTGAGTCATATCTCAAACTATTAGAGTAGAGTACACA TTACTCTGATTAAGAAGTTAGTTACTGTTAGTAGTATAGTTAATATTTGAGTTAGTTACATTCTGTTAGAATGAGCTGTC AATACAGCTGTCATGTGAGCTGTCATTACAGCTGTCACATAACTGATTCTGTTAGAGTTGGTAGCTTGCTTAGCAAGCCT TGTATTCTCTATAAATACTGAGATCACTCATTGTAATCTTTAGCTTTTCAATAATGAAATTCAGTTACATATCTTAGAGA GTTTAACATGGTATCAGAGCGCTGAACGATCCTTGGGATCTTTCTCTCTGATTTTTCTCGCTTTTTCCTCTTCTTCTTCA TCATCGCCATGGCATGCTGTGAACAAAGTTTGTCAATTTCTAAGTCAGCCATTGGAAGATCATTGGAAGGCTGTTAAGAG AATATTAAGGTATCTTAAGGGTACTCTTCATCATGGGCTGCATCTTAAGCCTTGTTCCCTCTTCTCCTGTTGGGCCTTCA CCTCCAGTGGGCAATATTCATCCTATGCAGACAAGAGCAAAATCTGGCATAATCATGCCCAGATTGCATCCAACCTTGCT CCTCACTCAGGCAGAACCTACTACAGCCAAGCAAGCACTCAAAGACCCTAAGTGGTTGGCAGCCATGAAGGCTGAGTATA ATGCATTACTAGCTAATGATACCTGGACATTGGTTCCTCTACCCAAAGATCGGACACCAATAGGATGCAAATGGGTGTTT AGAGTGAAGGAGAATGCAGATGGTTCTATCAATAGATATAAAGCAAGGCTTGTAGCCAAAGGTTATCATCAAGTGAAGGG TTTTGATTATTCTGAGACATTTTCCCCTGTGGTCAAACCTGTTACTATTAGGCTCATTCTTTCTCTTGCAATCACTAAAC AGTGGCATATTCATCAGCTTGATGTCAATAATGCCTTTCTCAATGGTGCACTTCAGGAGGAGGTGTACATGACACAACCT TCTGGATTTCAGAATGAGGATAAGACTCTTGTTTGCAAGTTGAACAAAGCTCTCTATGGCCTCAAACAGGCCCCTAGAGC TTGGTTTGAAAGGTTAAAGTCAGCTCTTGTGAAGTATGGCTTCAAACCTAGTAGATGTGACCCATCTTTGTTCACTTTCC ACAATGCAACTTGCTGCATTTACATCCTAGTCTATGTAGATGATATCATCATTACAGGCAACTCTTTGCCTCTTGTGCAG AAAGTGGTTGAGAATCTCAATTCTGAGTTCTCTTTGAAGCAGCTAGGACTGCTAGATTATTTCCTTGGTGTTCAGGTGCA TCATCTTCAGGACAGGTCATTATTGTTGACCCAGACAAAGTACATTACTGATCTCCTTGAAAGAGCAGATATGGGAGAAG CAAAGGGCATTTCTACTCCTATGGTTGGTGGTGCCAAATTGAGCAAATATGGAGCAGATTACTTTGCTGATCCTACCCTT TACAGATCCATTGTAGGAGCACTTCAATATGCCACCTTAACCAGACCTGAGATAAGCTTTGCTGTGAACAAAGTTTGTCA ATTTCTAAGTCAGCCATTGGAAGATCATTGGAAGGCTGTTAAGAGAATATTAAGGTATCTTAAGGGTACTCTTCATCATG GGCTGCATCTTAAGCCTTGTTCTCTTCATTCTCCTGTTTCTCTAGTGGCCTTTTGTGATGCTGATTGGGCATCAGATCCT GATGACAGAAGGTCAACATCAGGATCATGTGTTTTCTTTGGCCCTAATCTTGTGTCTTGGAGCTCCAAGAAGCAGACCTT AGTGGCTCGTTCCAGTACTGAAGCAGAATACAGAAGCCTAGCCAATACCTCTGCTGAGCTGCTATGGGTTCAGTCACTTT TGCAGGAGTTGCAGATTCCTTTTTCTCCTCCTACAATCTTTTGTGACAACATGGGTGCAGTGGCTTTGACCCATAATCCA GTTCTACACACCCGCACTAAACACATGGAGCTTGACATCTTCTTTGTGAGGGAAAAAGTTCTCAACAAGTCTCTTTTTGT GCATCACATTCCTTCAGTTGATCAACTGGCAGATCTCTTTACAAAGGCTCTTTCGCCTCTTCGTTTTGAAACTCTTCGTG ACAAACTCAATGTGATTGAGAAATCCATTTCTCACCCACCTTGAGTTTGAGGGGGCCTATTAGAGTAGAGTACACATTAC TCTGATTAAGAAGTTAGTTACTGTTAGTAGTATAGTTAATATTTGAGTTAGTTACATTCTGTTAGAATGAGCTGTCAATA CAGCTGTCATGTGAGCTGTCATTACAGCTGTCACATAACTGATTCTGTTAGAGTTGGTAGCTTGCTTAGCAAGCCTTGTA TTCTCTATAAATACTGAGATCACTCATTGTAATCTTTAGCTTTTCAATAATGAAATTCAGTTACATATCTTAGAGAGTTT AACACAAACAAACAGACTATAAATTGGTCGCAAAAATATTGAGGACTGAACTGATGACACCTCATACTTGTATCTTTGAA GGATGAAAATGAGGTTTACTTAATGTCCCAATTAATGGGCAATAGTATACTGAATGAAATGCTGTTTGGTTCTCTTTACC ATTGCTGACAGCCATGCATCTTTTCTTTGCGCAAGTTTTGTGAGCTTGAATTAAGTAATGTTTTTTTCCCTACAACTGCT GAGATATTTTTAACATTTATCTTTGCAGGTTTTGTTTATCAGGATCTTCAGACTCCATGATAAGGTAGTGTATATTTTTT TTAGATCATAAGGTGGTGCATGTCTATGGTGTTAATAATAATTTCCATTTGTTTGTTTTATGTTTGGCTGATGTCACCAT CTTTCCTCAGGCTTTGGGATCTTGGTCAGCAACGTTGCTTGCATTCATATGCCGTTCACACAGATTCTGTGTGGGCTCTT GCTTGCACTTCAACATTTAGTCATGTTTATAGTGGTGGTAGAGACTTCTCGGTAAGTGCTGTTTTCCTTAAAAAGTAACA TGAATTCTTAAATGTCGTGGTTTTCTTTTTCGTGAGGTCTCATTGTTTTCTGATGTCTCATTGTTCTGTTTAACTTGTGA AGCTCATCTTCTTCTGATGCATCATTCTTTATTTGTCCAGTTATACTTGACAGACTTGCAGACAAGAGAGAGCGTTTTGC TTTGCACTGGCGAACACCCTATTTGTCAATTGGCTTTGCATGATGATAGCATATGGGTTGCATCAACAGATTCTTCAGTT CATAGATTGCCTGCTGAAGGACGAAATCCTCAAAAGATTTTCCAAAGAGGCAATTCTTTTTTAGCTGGAAATTTGTCATA TTCAAGAGCAAGACTGTCACTAGAAGGATCTACCCCTGTATGTATATTCATTTCTCAGAAGTTCAACTTATGGATTTTAT TATTTTATTTACCAAGTAGTGTATTGCTCCGGAAACACATAGCTGGTTCCATAAGTGATATGTATGTCCATGTAAAGATG AAACATATTTTTTTTATATGTCCCTCTTTAGCGCTTTCTTTTTGCAAATATGATGGGCTCTGTCTTCCTAAGTTTCTGTT CAAAAATAAATGTTCTTTTGTTTCTTTCTTTTCTAGGGCACTAATGATTTTTCTTTTTGTTACCAAATTACAAATATCAA TAGGTTCCTGCATATAAACAACCAACTTTAACTATTCCTGGCATCCCTGCAATAGTTCAGCATGAAGTTTTAAATAATAG GAGGCATGTCCTGACAAAGGTAATCATGGTGTTTTCTGTTCATATTATTATTATGCCAAATATGTTAATATTGTTATCTG TTCTGTTGTTTGGTTGATAATCTCTGACTGTTATCTTTTGAGCTGATAAATGGCTGTTTTTATAGGATACTTCTGGTTCA GTCAAGTTGTGGGAAATTACAAAAGGTGTTGTAGTTGAAGATTTTGGAAAGGTGAGAACTGGCTGTATTTTCATTTGACA ATCTGCATGACAAACTTGTTTGTCAGGAAAGACACTTAATTGTACTGATTATTGTTTTTGAAGTTCAAATATAGCTAACA GCGCTCATTTGTGAGTTCAAAATAGCTCATGCTTTACATGTGAACTAATATAGGTTTCTTTCGAGGAGAAAAAGGAAGAG CTTTTTGAGATGGTATGATTACTTAAAGTCATTATCAATTTATCATCACTTTTTTTTTTTTTTTGTAAATTATACTTGTT TTTAACTATACTAGTTTGTCTATTCTTGCTGGTTTATATTTTCTTTCCATACAATTTCAGGTTAGCATTCCTACATGGTT CACAGTTGATACTAGGCTTGGAAGTTTGTCTGTACATTTGGACACTCCCCAGTGCTTTTCTGCAGAGATGTATTCAGTAG ATCTTAGTATTGTGGGCAAACCGGAAGATGATAAGGTAAATGAATTTATTTTCACTAGCAATTTACATGTCAAGTTCATC CAATTGTTTATGCCATTCATCTTCATGCATGCTGGATTTGTTACTGTTAGGGAAAAGTAATGATCTTCCTAATATACTCT TTTCTTGCTCAATCTGAAATGATGTTTCTTTTGCCCCTTTTTGACAATTGGCTATAATAATTAATGATGTCAAGTTGATA CAATTGTTTACGTCATTCATCTTCATAAATGTGGGATCCATTACTGTCAGTGAAATGTAACAATCTTCCTATTTTACTTT GTTCCTGGCTTCTTGCTGAACCTGAATGATGCTTGCGGTGTTACTATTATCATGGACATGGTAGTATTTACGTAGAAGTT ATATTTCTGTGGAGGTATTCTGTTATGTATTTCTGCAGTTTTCTAATGTAGGATGTCCATGCAAACAATGTCAAATGTCA TTCTGAAAATGCTTACGCACCGTAGTTTACCATCAATTGCCAAAATCAGTTCTTGTTAGTTTCTTTAGATATATGGAAGC AGTAAATAGTCTTCCTGTTACTCTGCAGATTAACTTGGCTCGAGAAACCCTCAAAGGGCTCTTGGCTCATTGGTTGGTAA AACGAAAGCAAAGAATGGGAAATCCTAGTCCGGCTAATGGGGAATTATTACCTGGAAATGATAATGGTACTAGAAGTTTT ACACATTCAAGAATCGAGGTTGATGGAAATTCTGAGAATGATGCTATGGTTTATCCTCCATTCGAGTTCTCAATCGTTTC CCCTCCTTCAATTGTTACTGAGGGAACTCATGGAGGTCCCTGGAGGAAAAAAATTACTGATCTTGATGGAACTGAAGATG ATAAAGACTTTCCCTGGTGGTGTCTGGACTGCTTATTGAATAATCGATTACCTCCTAGAGAAAATACCAAGTAATATTGC CTTCCTGTTCTTTTTTGCATTCTCTTAATTGTTGCACGCTACCCATGCTTGTAGTAGCAAGCAAGAAAGATTGCTCACGT GTCATGACACTTTCCATTTTTGTTATAGCTTGGTTGAATCATTGTTTTTTGAAGCTATTATTGATACTAGGGCTCAAAGT CATATCATAGGCATGTTTTGATGATTTAAATTTGCTGTTTTCCTTGTTTTATGGATGAGAACTTGGCTCTTGATAGTTTA TATGATGATGGTACATTATAACATCCCAAAAAAATGTGCTACTTTACAAAGCAATTATAATGGAAGCAGACTTGTGATTT TCTTAAGTTGCAGTGGTCTGTTTCCTATTAGTCTAGTGGCATCTATTGCTTGGTGTTCTGCATTTGTTATATCATCTCTA AGCTTTTTCTTTTGTTGCACTTCTGGTGGTTTTGGTCATAAAAAGATTGAAATCTGTTCGTTCTTACCTAGACTTAGAAA ACCAGTGGAGTGTTACTTATGGATTTGAGTTTCGACCATGGTGGCTATCTTATAATTGTGGAAATGTCTATGATTATTAT GTCTTGTACCAGTTACATTATGTTCTCCTTAATATAGATTCTTTTATGGTAACCTTTGCAGATGCAGTTTCTATTTACAT GCTTGTGAAGGCACTCTCCAAATCCACACTCAAGGGAAGCTAAGTGCTCCACGCGTATTAAGAATTACTAAAGTAAGATT TATTTTTTTGACAGTAATTGACAAATAGGAAATAATAGCTTCATGTTCGCTCTCAGTCTTTCCTCATTTCATTATGAAAT AGAAATGTTTCTGTAGTAAGAGAACAATGAGCTGTACCTTTTTCCTTGAGGTGGTGAATTGGTTTAAACATCAAATTTTA GAATTTCCTTTAAATTGCTTGTTAATCTATATTATCTGTTTAATGCTGGCAGTCAGGACTCAAGGAATTTTTTTTATCTT GTCAAGATGCTAAATCATATTTGTAAAATACAGTTCCCCTGTAGTTGAACATGTCTACATGAATAGTTTCACAATTGTGT CTTTTTTCCTCTGTTTGATTGTCCATCCCTGATGGGGCATGGAAAATGAATTGTGGGATATGGGAGATGAAGCAGTTGTT CAAGGTGTCTGGTGCCAAGCCTCAGAGCTGCCATGGTGGCTTCCATGTTGTTTATTGAAAGAAATAGAAAAGTATATTAA ATAAACATAAAAATAGTGAATATGAAGAGGGGAAAAAGATATACGTTCCATATTTTCAGAAGAAATTGAATAAAGAGAGA CAAACAACGTAATAAGACAGTTTTTTTGGAAGTTATCAAAGAAATGATGGGGGAACAAGATATGAGGAAGAACATACATG AAAATTGTTGGACTGACTGAGGATTTCAGTGTTCTTTCAGTGTTGGGGAACAGGGTGGGGCGAGTAAGCTCAGTGGAGCT CTCTGCAAGAGTCCAAGTGTCAGATTTTCCTGTCAGGGATAACCTGATGTTCTGGAATGTTTTTTCTTTTAAATTTATTG CTATGTTTTTTTGCTGAGACAACTGAAAGACACATTTACCTCTTCAATTAAGAAGCGGACTACACACATGATAAACAGGA ATGGACACAGAAATTGTCATCCATCAGCTATCTTCACTGTGGTGATGTCCACTGATGAATTTATAGGGTTGTCTTTAAGA CATAGAAGGTGGAAAAATGAATACTGAGAATTGTGTAAATAATGAGACAGAAAATAAGAGAAAATGAGAGGAAGAGTAAG AAAACTTTCCTGATTCTGAAGTCAAGAGATTAAACTTTGATGGTCTGTTGAGGACTATGACAGGAAAAGCTGTATTTTTG GGTCTGTATTCATAATGTCTGATACTCTCATTTCTTGGTTGTGCTTTAGTATCAAAGTGGCTTATGTGGGAGGTACTGAG GAAGGCTTTAAGAGGCTTAGGGAAAACATTTTTTTAGCATCCTCATCTTTTGTCTGTAGTGAGGTGTACAGTGAACACAA ACATAATTGATAAAAAAAATAATGGTAGGGTTTCAGTTCTGTTGGCTTTATGAGACAAACTTCTTTCCTTTTGGTTGTCT GAAGGCTTTAAGAGACTAAGGGAAAACAATTTTTTAGCATCCTCATCTATTGACTGTAACACAAACATAATTGATAAAAT AATTGTGGTAGGGTATTTTCAGTTCTGTAATTAACTTCTTATGAGACAAACTTCTTTCTTTTTGGTTGATTGCTTCAATC ACTTGTCTAAGTTATATCCATAGAATTATAGTTCTTTACTGTGCGTTGTGTTGTTCATTACTTTGTTTTTGGATAGATGC TGTTGGAATATTTCTCCCCGATTGATTTACATTTCAGAATGTTCAACTGAGTTTTCCCCCTTCGTGTCTAGGTTATTAAT TATATTGTCGAAAAGCTAGTTCTTGACAAATCTTCGGATATTGTCAATGCTGATGTTAATTTCCCCCCTGGAATTGGTGG GTCACAGTCACAGCTCCATGCAATTGGGGATGGATCTTTCCGATCTGGGTTGAAACCTTGGCAAAAGATTAGACCTTCTA TTGAGATATTGTGCAACAACCAGGCAAGCTTTATGTTCTTATAGATGCAGTCTTAATGCAATGTGTAATAAAATTTTCTA TATGCTAAGTTTGAGCAAGTTCATGCTTTATGTTGTTACAGTTGACCTACTCTTCAATTCATGCATATGCTTCTTGGAGT TTGTTTGCTATCCTTATTGCCATTTTTGATTACCCAATGTGGTATTTCCTGCATGTCAATAAAGACAATTCCCTTGAACT CCCTTCGATGGCTAGGATTATAATTATAAAGTTGCAACTTTAATCAGCTCCTATAATCTGTAGTTTAGAGTTAATTGACA AAGTCCTGGCCAATACCTTGAAGTGTTGTGGTGTAATTATCCCAAAATTTAGTTCATATACTTTTGCCAATGATACTTTG AAATGATCAGTTAAAAAATGTGCACAGAGGCAACAATACTCAGCAGAAACTTTATTCATCAAATTCTAGGATCTCTTCAC TTGAGGTAGTAAGATGAACAAATAATGAAACATGAAAGAATTATGTTTTCAGACTTAAATGCATGATGTAATGCTATGCC CTGGTCGATATCTGGACCTTAATCATTATGTAGGAGAGATGACTTGGTAGTTCAAGTTGTAGCATTGGAATTGCTTTTTA GACTATTTGTTACCCTGGGTTAGAATCTGTCTCTTTTTGCACCTTTAACAAATTTACCAATGTTTCTGACCATAATAAAT TTGTATCCAGATATTATATGCTCCTAATTGAAAATCAAACAATTATATTGAAGTCTTTAAATAGATAAAAGTAATTGTAT TTCATCTGTTGTTTTAGCTGTGTTCTTCCAACTTTGTTCCAGATATTCTATGAAGTTTTTCAACTCATGCCTTCTGATTG GTTTGATGATCACAGTACCAAATTGTTTGTTTATTGTTTGACCCTAACTAATCGGAAGGGTTTGTTTGATTTAAGCTAGG CTTTGATTTAATCTGATATTATGCATTTAGCGATCCTTTCTGATTATTTCCAGGTATTGTCTCCTGAAATGAGCTTAGCT ACAGTGCGAGCTTATATATGGAAGAAGACAGATGACCTGATCCTAAATTACAGATCAATTCAAGGGAGGTGACTGCAAAT TTCCCTTGCTTCAGTGGTGGTATTGCATCTTGAACTTTGCTTAGCTTTTCTTGGCTATAATATGATATTAATGCTTTCAC AGTATATGTGCCTGGATATTGTTTTACATATTTTACATCCAACTGGATAGCGAAAGGTCTAGTAGGGTGGTATTTTGTAT TTCTTCTTTTATTGATGCCAATGTTGCTACCCAAATTTAGAAGGTTTTAGCCAGTTTGTTGCAGCTTGACTTCTGAGAGA AGTAATTAGGTTAAAACCAAACCGTTATCAATAAAATTTTCTCTCAATCTGTGGGAAAATATTCTGCAAGTTTTGCCAGT GTCTGAATGGTTGTTATTGCTATCACAATTCGCAAATTCTAGACACTTAGGATGGACTGCATTTAAATTTTCCCTTCTTT CAGGCTCAATTATTTGATTAATGTCTCAGCAAGGTTTGCAGACTTCATTATTATTAATACTTGCAGGTTTTATTGTGATT GTGCACAACACTTCTAAGCAATGATTCTTCTGGCATGGCTGCTTTGCTCAATGTCATTGCAAGAGATTTGTAAATTCCAA GTCCTCATTAATCACCAAATTTAATGGCATTAGAACCTGCTTGGATAGATTTTACTTCGTCAGAGCGATCTTACTTACTA GTTTTGGATTATATCTAGCTGGTGCATACTCTCAGGTGTTGTTACTATAACATTTTGAATTATTTCTAGCTGGTGCATAT TTTCAGTCGACGTGACCGGACTCGTGGACATGGATTATGTCTCTGCAAGATAAAGGTTTCCTAATTTGCTCATTAGTGGG GATCATATGGGATGTTTCCCAGGAAATAGGTAGTAAATTTAGACATAACAACGAAAACATTGTACATTTAAATTTTGCGT TAAATACCTATAGAAGGTACTTTTCTAACAGTGTATCTCCATTCTTTACATCTTCGCCTGTTTTTTATTTTTTCTTCTTT ATTTTAAAATTTTGTTTATTGTTAATTGCAAGTAATGTTATATTCGTTGTTTAGAATCAGTCACATCTCCCTGCCCTTGG AGCTGACTGTTCGGTCTTAATGTCCTGGGTTGTGTTGTGGATTTATGGTCACAAATTCTCAAACAATGGAAGTTGCTGCT GTTAACTAGTGATAATTATGGTTATTTATTTGTGTTGATTAAATTTTCTATGACTTCCATTTTGTATTATAGACGAACAA GTTTTT
CDS sequence (LotjaGi5g1v0216700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCACCGCGTGGGTAGTGCAGGGAACACAAACAGTTCAACTCACCCGCGTAAGGAGAAGAGATTAACATATGTGTTGAA TGATTCTGATGACACAAAGCATTGCGCAGGCATAAATTGTTTGGCCGTACTTAAGTCTGCAGTATCTGATGGGTCTGATT ATCTCTTCACTGGGAGCCGTGATGGCAGGCTAAAACGGTGGGCACTAGGTGAGGATGCAGCAACATGCTCTGCTACCTTT GAAGCTCATGTGGACTGGGTTAATGATGCCGTTCTTGTGGGTGATAGTACCCTTGTTTCTTGTTCGTCAGATACAACCCT TAAGACATGGGATGCCTTTTCCACTGGAACATGTACTAGGACGCTCCGCCAACACTCAGATTATGTTACTTGCCTTGCAG CATCTGAAAAAAATAGCAATATTGTTGCCTCTGGTGGCCTCGGTGGAGAGGTTTTCGTATGGGATCTTGAAGCTGCACAT GCTTCAGCTGCAAAGTGCATTGATGCTACGGATGATGATACTTCAAATGGTATCAATGGTTCTGGGAACTCATTACCATT GACTAGCTTACGTAGCATCAGCTCAAGTAACAGTATATCTGTGCACACTACTCAAAATCAAGGATACATTCCAATTGCTG CTAAAGGCCATAAGGAATCTGTTTATGCATTGGCAATGAATGAAGGTGGAACACTTCTTGTCTCTGGTGGTACAGAAAAG GTTGTGCGTGTTTGGGATCCAAGATCTGGATCAAAGACTATGAAACTAAAAGGGCATACAGATAACATCAGGGCTTTGCT TCTGGATTCTACTGGCAGGTTTTGTTTATCAGGATCTTCAGACTCCATGATAAGGCTTTGGGATCTTGGTCAGCAACGTT GCTTGCATTCATATGCCGTTCACACAGATTCTGTGTGGGCTCTTGCTTGCACTTCAACATTTAGTCATGTTTATAGTGGT GGTAGAGACTTCTCGTTATACTTGACAGACTTGCAGACAAGAGAGAGCGTTTTGCTTTGCACTGGCGAACACCCTATTTG TCAATTGGCTTTGCATGATGATAGCATATGGGTTGCATCAACAGATTCTTCAGTTCATAGATTGCCTGCTGAAGGACGAA ATCCTCAAAAGATTTTCCAAAGAGGCAATTCTTTTTTAGCTGGAAATTTGTCATATTCAAGAGCAAGACTGTCACTAGAA GGATCTACCCCTGTTCCTGCATATAAACAACCAACTTTAACTATTCCTGGCATCCCTGCAATAGTTCAGCATGAAGTTTT AAATAATAGGAGGCATGTCCTGACAAAGGATACTTCTGGTTCAGTCAAGTTGTGGGAAATTACAAAAGGTGTTGTAGTTG AAGATTTTGGAAAGGTTTCTTTCGAGGAGAAAAAGGAAGAGCTTTTTGAGATGGTTAGCATTCCTACATGGTTCACAGTT GATACTAGGCTTGGAAGTTTGTCTGTACATTTGGACACTCCCCAGTGCTTTTCTGCAGAGATGTATTCAGTAGATCTTAG TATTGTGGGCAAACCGGAAGATGATAAGATTAACTTGGCTCGAGAAACCCTCAAAGGGCTCTTGGCTCATTGGTTGGTAA AACGAAAGCAAAGAATGGGAAATCCTAGTCCGGCTAATGGGGAATTATTACCTGGAAATGATAATGGTACTAGAAGTTTT ACACATTCAAGAATCGAGGTTGATGGAAATTCTGAGAATGATGCTATGGTTTATCCTCCATTCGAGTTCTCAATCGTTTC CCCTCCTTCAATTGTTACTGAGGGAACTCATGGAGGTCCCTGGAGGAAAAAAATTACTGATCTTGATGGAACTGAAGATG ATAAAGACTTTCCCTGGTGGTGTCTGGACTGCTTATTGAATAATCGATTACCTCCTAGAGAAAATACCAAATGCAGTTTC TATTTACATGCTTGTGAAGGCACTCTCCAAATCCACACTCAAGGGAAGCTAAGTGCTCCACGCGTATTAAGAATTACTAA AGTTATTAATTATATTGTCGAAAAGCTAGTTCTTGACAAATCTTCGGATATTGTCAATGCTGATGTTAATTTCCCCCCTG GAATTGGTGGGTCACAGTCACAGCTCCATGCAATTGGGGATGGATCTTTCCGATCTGGGTTGAAACCTTGGCAAAAGATT AGACCTTCTATTGAGATATTGTGCAACAACCAGGTATTGTCTCCTGAAATGAGCTTAGCTACAGTGCGAGCTTATATATG GAAGAAGACAGATGACCTGATCCTAAATTACAGATCAATTCAAGGGAGGTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0216700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MHRVGSAGNTNSSTHPRKEKRLTYVLNDSDDTKHCAGINCLAVLKSAVSDGSDYLFTGSRDGRLKRWALGEDAATCSATF EAHVDWVNDAVLVGDSTLVSCSSDTTLKTWDAFSTGTCTRTLRQHSDYVTCLAASEKNSNIVASGGLGGEVFVWDLEAAH ASAAKCIDATDDDTSNGINGSGNSLPLTSLRSISSSNSISVHTTQNQGYIPIAAKGHKESVYALAMNEGGTLLVSGGTEK VVRVWDPRSGSKTMKLKGHTDNIRALLLDSTGRFCLSGSSDSMIRLWDLGQQRCLHSYAVHTDSVWALACTSTFSHVYSG GRDFSLYLTDLQTRESVLLCTGEHPICQLALHDDSIWVASTDSSVHRLPAEGRNPQKIFQRGNSFLAGNLSYSRARLSLE GSTPVPAYKQPTLTIPGIPAIVQHEVLNNRRHVLTKDTSGSVKLWEITKGVVVEDFGKVSFEEKKEELFEMVSIPTWFTV DTRLGSLSVHLDTPQCFSAEMYSVDLSIVGKPEDDKINLARETLKGLLAHWLVKRKQRMGNPSPANGELLPGNDNGTRSF THSRIEVDGNSENDAMVYPPFEFSIVSPPSIVTEGTHGGPWRKKITDLDGTEDDKDFPWWCLDCLLNNRLPPRENTKCSF YLHACEGTLQIHTQGKLSAPRVLRITKVINYIVEKLVLDKSSDIVNADVNFPPGIGGSQSQLHAIGDGSFRSGLKPWQKI RPSIEILCNNQVLSPEMSLATVRAYIWKKTDDLILNYRSIQGR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 763 | 763 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 763 | 763 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 7 | 182 | 176 | 4.3E-24 | ||
| SMART | 19 | 68 | 50 | 2.0 | ||
| ProSiteProfiles | 31 | 339 | 309 | 37.149 | ||
| CDD | 34 | 365 | 332 | 2.605E-51 | – | |
| Pfam | 34 | 67 | 34 | 0.11 | ||
| SUPERFAMILY | 36 | 452 | 417 | 1.19E-62 | ||
| SMART | 73 | 111 | 39 | 1.8E-4 | ||
| Pfam | 75 | 111 | 37 | 0.13 | ||
| PRINTS | 98 | 112 | 15 | 6.1E-6 | ||
| ProSitePatterns | 98 | 112 | 15 | - | ||
| SMART | 115 | 155 | 41 | 1.2E-7 | ||
| Pfam | 116 | 155 | 40 | 5.1E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 122 | 164 | 43 | 10.475 | ||
| SMART | 207 | 246 | 40 | 5.8E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 214 | 255 | 42 | 14.719 | ||
| Pfam | 215 | 246 | 32 | 0.0044 | ||
| PRINTS | 233 | 247 | 15 | 6.1E-6 | ||
| SMART | 249 | 288 | 40 | 2.5E-7 | ||
| Pfam | 252 | 288 | 37 | 1.7E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 256 | 297 | 42 | 14.585 | ||
| ProSitePatterns | 275 | 289 | 15 | - | ||
| PRINTS | 275 | 289 | 15 | 6.1E-6 | ||
| SMART | 291 | 330 | 40 | 0.0018 | ||
| Pfam | 615 | 758 | 144 | 1.0E-26 | ||
| CDD | 634 | 758 | 125 | 7.59818E-33 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0216700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…