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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0218700 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0218700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Branched-chain-amino-acid aminotransferase-like protein; TAIR: AT5G27410.2 D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9ASR4|BCAL2_ARATH Branched-chain-amino-acid aminotransferase-like protein 2; TrEMBL-Plants: tr|I1JRF2|I1JRF2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0218700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:52474660..52493149) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTTTGTTCAAAAAGTTACAAGATACCTAAAAGAAATAACAAAATCCCTATTTATAGAGTTTCCAGCGGTAATCCACGCA TGTGCGTGGCCGCGTGGGCAAAACGCTCAAAATCGCACAATTCGCAGCATCAGATTTTGCCACCACGCATGTGCGTAGAT CAGACGGCGCACATGCGTGGGCATCAGGTTTTCCAACAGTAGCTCCACGCATGTGCGTGGGATACATGGCGCACATGCGT GGCTCATCTGATTTTTCTTCAATTTTGTAACTCTCACTTCAACTATCATCATGGCTCATTACTTTGCCTTCAACCATCAT CATTGGCCATCAAAATCACCTGAAACCTTCACAGAATCTCAAAAACCATCATTTCCCCAATGTAACTCATGGAAACACTC ATTTAATCACAATAATTCAGAAATCTTTCATTCAATTCATCAAATAAAACTTCTAATATGCAATCAACTCTCATATTCTC TCAAGACTCTAAATCAAACCTGACCTTAGGACTTAAACCTCGATAAAAACTAATTAAAAGATCATCTAAACAAATTAAAA ACACCTAAACTACTCAGATGCAAATATGAACTAAAAATGGACTTAACTTGACTTAAAACTCAATAAAAGACTCAAAAAGG AAGAAGAAAGAAACAAGAAGGACTCGACAAACATAGAATAAACCTCGGGTCATCATGTGTTCTTCACACTCCTCTGCGCT TGCATCATCATTGGCCATCTTCTTGAAGAGAACCGTTGGGCCAATGAATCCATCACTGCCCTCCTTCTGGTATTCTTTTG GTTTCCACATACAACTATGTGACTTTCTATCTCAATATGTTACATTATGTTGTGAATTTGCTTTTCTTGGTTAAATGAAT GAAGGGGTTGTGTTCTGGGGTGGTGGTGTTGCTGGTGACCAAGTTCCAGAGTACCAAGATTCTAACATTTAGTGAAGACT 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CTCAATCAGAGACCCACTTAACAAATTCAACTAGCTATGTTTTATGATTTATGATAGCCTTTTGCAACTGAATAATTAAT TCTTCAGGGTTGACGAATTTATCAATTGGTTTAATTTTTTTAACTTCATTTCTGCAATTTTAACCCCTACAACAAACAAT CAACCAACCCTTAAATTTACTTTTGCTAAGGTAAAATAATTAGACTCTATAAGAATTTGTTTTAATGATTTCAAGTTATT TTAAGTTGAT
CDS sequence (LotjaGi5g1v0218700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGGAGGTGGAGGTGATTCACTCATGGTCTGCTCCAAGATCCCTCAGTACCAGTCTCATGTACTCTTTTGCTCAGAG GGATGACATTGAAGTGCTGGATGAGCCTCTCTATGCTAACTTCCTTCGAGTCACTGGTCTTGATAGACCCTACAGGGATA TACTGCTTTCTAAAATGGAACCTGATGGTAATCAGATTGTTGAAGACACAATTTATGGTCCTGGAAACAAGAAGTATAGA TTCTGTAAGCATATATCAAAACAAAGGGTGGTTGGGTTGTCAAATGATCTGTTGAAGAAAGGAAAACACTTCATTCTCAT AAGAAATCCTCTTGACATATTGCCATCCTATGACAAGGTTGTCCCTCCATCTTTCTACGAGCTGGGTTTGGCAGATCTAG TTTGTATATACAATGAACTCCGCGAGTTAGGAAAACCACCCCCTGTTATTGATGCTGCAGAACTTCAAAAAGATCCCGAG GCTACTTTACGGGGTCTTTGCAACGATTTGGAAATTCCTTTTCAACCTGCAATGCTCAGTTGGGAAGCAGGTCCAAAGCC AATGGATGGGTGTTGGGCCCCTTGGTGGTATAAATCTGTACATAAATCAACTGGTTTTAAGGAAGGAAGAAAGTATCCTC AGCCATTTCCCTTTTCTCACTATGATTTGTTGGAGCAAAGTCTACCCTTGTACAATATGCTTCGGCGCCATGTGAAGAAG AAGTCATCTCTTTTGAGCCCTCCTTTACCTCCTCCTGATCTTCCAGTTCCTGCAAATGAGAAATTGCTTGCTTGGGTTGG TGATGAGATTGTGCCACGCGAGAATGCAAAGGTTTCTGTGTTTGATTCGGTTGTCCAAGGAGGTGACTCAGTTTGGGAGG GTCTTCGAGTGTATAATGGAAAGATATTTAAGCTCGAGGAACATCTAGATAGGATGTTCGATTCAGCAAAAGCTTTGGCT TTTGAAAATGTTCCAAATCGAGATGAGATTAAGGAAGCTATTTTCAAGACTCTAATTAGGAATGGGATGTTTGACAATTC CCACATCCGTCTTTCTCTAACAAGAGGAAAGAAGGTTACTTCTGGAATGAGCCCAGCATTAAATCTGTATGGATGCACAT TAATCGTACTTGCTGAATGGAAGCCCCCTGTTTATGATAATGAGCGCGGTATAGTTCTTGTTACTGCTACAACTCGCCGT AACTCTCCAAATAGTTTGGATTCAAAGATTCATCACAATAACCTCCTCAATAACATACTTGCGAAGGTTGAAGGCAATAA TGCAAAGGCAGATGATGCAATCATGCTTGACAAAGATGGCTTTGTTTCTGAAACCAATGCAACAAACATTTTCATAGTTA AAAAGGGTCGTGTGTTGACACCACATGCTGATTACTGTCTTCCTGGCATTACTCGAGCAACTGTAATGGATCTTGTGGTG AAGGAGCAGTTAATCTTAGAAGAGCGGAGAATCAGCCTGTCAGAAGTGCATACCGCAGATGAGATATGGACAACAGGAAC CATGGGAGAATTAAGCCCGGTAGTGAAGGTTGATGGACGCACAATTGGTACTGGAAAAGTAGGGCCGGTAACAAGAAAAT TGCAAGCTGCTTATAAAGAGCTGACAGAACAGTCTGGTATACCAATACAGAGCTACCTGGAGGCTTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0218700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAEVEVIHSWSAPRSLSTSLMYSFAQRDDIEVLDEPLYANFLRVTGLDRPYRDILLSKMEPDGNQIVEDTIYGPGNKKYR FCKHISKQRVVGLSNDLLKKGKHFILIRNPLDILPSYDKVVPPSFYELGLADLVCIYNELRELGKPPPVIDAAELQKDPE ATLRGLCNDLEIPFQPAMLSWEAGPKPMDGCWAPWWYKSVHKSTGFKEGRKYPQPFPFSHYDLLEQSLPLYNMLRRHVKK KSSLLSPPLPPPDLPVPANEKLLAWVGDEIVPRENAKVSVFDSVVQGGDSVWEGLRVYNGKIFKLEEHLDRMFDSAKALA FENVPNRDEIKEAIFKTLIRNGMFDNSHIRLSLTRGKKVTSGMSPALNLYGCTLIVLAEWKPPVYDNERGIVLVTATTRR NSPNSLDSKIHHNNLLNNILAKVEGNNAKADDAIMLDKDGFVSETNATNIFIVKKGRVLTPHADYCLPGITRATVMDLVV KEQLILEERRISLSEVHTADEIWTTGTMGELSPVVKVDGRTIGTGKVGPVTRKLQAAYKELTEQSGIPIQSYLEA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 552 | 551 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 2 | 552 | 551 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 10 | 192 | 183 | 2.17E-14 | ||
| Gene3D | 75 | 204 | 130 | 1.9E-5 | – | |
| Gene3D | 260 | 382 | 123 | 1.2E-30 | ||
| SUPERFAMILY | 263 | 541 | 279 | 1.14E-74 | ||
| CDD | 265 | 538 | 274 | 1.78885E-117 | – | |
| Pfam | 291 | 516 | 226 | 5.3E-44 | ||
| Gene3D | 383 | 549 | 167 | 1.7E-54 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Catalytic activity | Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0218700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…