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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0244900 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0244900.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | WD-repeat protein, putative; TAIR: AT2G47410.5 WD40 domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8WWQ0|PHIP_HUMAN PH-interacting protein; TrEMBL-Plants: tr|I1JBG5|I1JBG5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0244900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:55341921..55356587) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAATGCATCAATATGCCCAAAAACTACACATTTTCATTATTTGCTATTATTATTATTTCATTTGATTCAATTTTTTTTTC ATGAACATATTTCCTTGAAATGAAATAATAAATAAACATATTTTTTGACTTCCAATTTGGTATAAATCCCTTGATTTTCA TCCACCTCCGTCCTCCTCCCTGGCTCCGTCGCAGACACAGCCAGATTCCGTGCCCTCTTCTTCTTCTTTCAATTCGTTCC ACACAAGCACAAAACCACATTCATTTCACCCTTATCCACTTTCCAAACACATCCTTAACCCAAAAACCAACTCATGAAAA CGCGATTAATCTTCTACACTTACCAGATTTGCTTTTCTCAGAACCCGTATGTATGTATAATCGATTCCCCTAACCTAAAC CCTATCTCGATTTTCGGTGCATTGATCTCTCTCCTCAATCTTTTGTACGCTGCGTTTTGAATGGACTTTGGTGCTTCTGC ACTCATAGCTGCTCATCAATCTTCAACGTTTTCCAGGTTTTAACGCTTCCCACCACTTTTTTATGCATGCCCATTTTCCT TTACTTTGGATTCAGTAGCTTTTGACCATTTTTCGCCCAATTTCGAAGCATCCCTGTGTTGCCACATGCCCACTTTGATT TTCTCTTTCAGTTTGATTTCATTTAGGTTTTCAATTTCATCACAGTCATTTAATCTCTTTGTTATGGATTCCCTTGAATT CTGCGGAATCGAGATTGAAAATCGATGTTACTATTGAATTGTTGCAGCTTTTAGTTAGGAAATCCGAACTAGTATGCGAT AGTGCTCTATTTATTATGTGATGGTGAACTATATGATAGAGCTCTGGTTTTTAGGGTTTGGTTTTTGAATCTTGTAGTAA TTAGTACTTTATTTTGCTTGTGCTGTAGCTTGATATGTTCTTTTGCTGTAGGGTGTTTCCGGAACATGGATTCGCGCAAG 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0244900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATTCGCGCAAGTGCAAACCTTCTTCTGGTCGTGTGAGTGTTGCACCTGCGCCTGCTGTGAGTGTTGCGAATCAGGT GGATGAGGTGGCTCGTTCCCTCAGGGAGGTGGGGCGTGTTGGGACTGATGTGGATATAGACCTCAGGGAGGTTTACTTTT TGATCATGCACTTTTTGTCTGCCGGGCCGTGCCAGAAGACTTTTGTGCAGCTCGGGAATGAACTTTTAGAGCATCAGCTG CTACCCAGAAGATATCATGCTTGGTATTCTAGAAGTGGTGAGGCTAGCGGGAATGATGTTGACAATGATGATGGCATCTC TTTGCCTTTAAATTACGATGATTTGGCTAACAGGTATCCCCACATAGCTAAGGATCACTTGGTAAAGCTTCTGAAGCAAT TAATGCTGAGTATGACCCATCCTCTGCATGGAAAACTTGGAGGAAGCAGTCCTAACGCAGCCGATGTTCCTACTTTACTT GGACATGGTTCTTTTTCGCTTCTTGATACTGATGGAAAAACAGCAGACAAGCCGGTGAAGCCTCTCCCACTTTACCTTCG CTGGCCACACATGAAGGCTAATCAGGTTCAGGGTTTAAGCTTAAGGGAAATTGGAGGTGGTTTTACAAAGCATCATCGTG CTCCATCTATTCGCAGTGCATGTTATGCTATTGCCAAACCATCTACTATGGTGCAAAGGATGCAAAATATTAAAAAGTTA AGGGGTCACCGTGTGGCTGTCTATTGTGCCATATTTGATGGATCAGGGCGATATGTTATCAGTGGTTCAGATGATCGCCT TGTCAAGATTTGGTCTATGGAAACTGCATTTTGTTTAGCTAGTTGCCGTGGACATGAAGGTGATATTACTGACATGGCCG TAAGCTCAAATAATGCTTTGGTGGCATCTGCTTCAAATGATTTTGTCATTAGAGTTTGGCGCTTACCAGATGGGATGCCA ATCTCCGTTTTGCGGGGACATACTGGAGCCGTTAATACCATTGCATTCAGTCCTAGGCCTACTGCTGTATACCAGCTGCT ATCGTCATCTGATGATGGAACTTGTAGAATATGGGATGCAAGAAATTCACACAATCCACGCATATATGTGCCTCGACCTT CCGATTCTGTAACTGGGAAGGGTAATGCTCCACCAGCTAATTTACCGTCCTCGAGTAATGGTCAACATAGCTATCAAATA CTTTGCTGTGCGTATAATGCAAATGGAACTGTTTTTGTTACTGGTAGCGCTGATACTTTTGCCAGGGTGTGGAGTGCTTT AAAGCCTAACAACAGTGACTCAGAACAACCAGTACATGAGATAGATTTATTATCTGGTCACGAGAATGATGTTAATTATG TACAGTTTAGTGGTTGCTCTGTGGCTTCAAAATTGGTGACATCTGATTCTTGGAGAGAAGAAAATACGCAGAAGTTCCGG AATTTCTGGTACTGTCATGATAACATAGTTACTTGTTCTCGTGATGGAAGCGCAATTATATGGGTTCCCAGATCACGAAG ATCTCATGGAAAAGTAGGACGTTGGACTCGCGCATATCATCTTAAAGTTCCCCCTCCACCCCTGCCTCCTCAACCTCCGC GAGGGGGTCCAAGACAGAGATTGTTACCAACTCCTCGCGGTGTTAACATGATTGTATGGAGTCTGGACAATCGCTTCGTA CTTGCAGCTATTATGGACTGCAGAATATGTGTATGGAACGCAGTTGATGGCAGCTTAGTGCACAGTTTGACCGGTCATAC AGCATCCTCTTATGTATTGGATGTTCATCCTTTCAACCCTCGCATAGCTATGAGTGCTGGGTATGATGGGAGAACTATTG TGTGGGATATATGGGAAGGCATACCTATTCGGACGTATGAAATTGGACGTTTTAAGTTGGTTGATGGAAAGTTTTCTCCG GATGGAACATCAATTATACTTTCAGATGATGTTGGTCAGATATATTTTCTGAATACAGGTCAAGGCGAGTCCCAGAAGGA TGCAAAATATGATCAGTTTTTTCTTGGTGACTATCGACCCCTTATTCAAGATACTCAGGGAAATGTTCTTGATCAGGAAA CTCAACTTCCGCCACACCGAAGAAACATTCAGGAACCTCTATGTGACTCTAGTATGGTGCCATATCCAGAACCTTACCAG AGTCAATTTCAGCAACGCCGGCTTGGTGCTCTTGGCATTGAATGGCGTCCGTCAATGATAAAATATGCTGTTGGGCCAGA ATTTAGTGTTGATCAGGACTACCCGTTGATACCTTTGATAGATTTGGAAGGAATGTTTGAGCTGCAACCAGAGCTCACAG ATGCCATGTTCTGGGAGCCAGAGTATGACATTGCAAGTGATGATAATAATGACTCTGAGTACAATGTGAACGAGGATAAT TCTAGTGCAGCTGAGCAAGGGAGCGTTAGTGCTATCTCTTCTAGTGACCTAGAGTGCAGTGAAGATGACTCTAGTAGTAG GGATGGTCTTCGAAGATCAAGGAGGAAGAAACATAAGGTTGAAGTTGAGGTAATGACTTCTTCTGGAAGGCGTGTCAGGA AAAGGAATTTGGATGAGTGTAATGGTAATACTTCTGGAAGTAACAGAACTATCAAATCCAAAGGAAGCTTAAAATCATCG AGAAGGAAATCTTCCAAAACTAAGAAATTAAGGCCCCAGAGAGTTGCTGCACACAATGCTCGTAATATGTTGTCTCAAAT TGGTGAAACGTCTACTGATGAAGAAGATAATGATTCTGAAGATGAATTGTCAGAAAGTTTCCAAAATTCAGACGATCTAA GTGAACCTGAGAGAAAAAGGCATAATAATCGTGATGAACATAAAAAACCCATTTTGGAAGAGTTGGATGATGTGTCCAAG CCTTCTGCATATCCTGAGGTGCCTGCAATTGCTGAAAGACCAAGGCTGGTTGTTAAGATCTCACTTCCTAAGAGAAATGT GACCTTAGAGGGCACAAGACTTGCACGTGAGACTGAGGTTAATGTGGCATCTCAATCTTCTGGTCCCCAACTCCAAGAAA GTGTTCAAAATACTTTGCCAGACAGAAATACTGTGGATCTAGCATTATCTTTTGCAAATTCAACTAATGCTAAACTTGCC CAAAGCCACAAAAATGAAGATGATGATAATATACAAGCTGATAGTGCTGCAAATAATCTGGACACATCTGAATGTGTGGA GGGGAACACAGTTCAGTGCAGACAGATGAGAAGAGACACACATGAACTGTCAAGATCCGGGGATGCTTTGCTGACAGATG CTAAAGTTGATGACCATCTGGAATACACTGCCAATGGGAGATCAGAACATATGACAAGGGAGTTGGAGACTGTTGGTAGC ATGATTAATACAGTGGTGGAAGATTTTGATAATGCACCTAAGTTTTCATCACTTGAACCTTCAACGCTTGGCAATCATCA GCCAAATGCTAACATCTCCATGACATCTGGTTATGATAAGTTGAATGGTGGTTATAACGGCAGATCTGGATCCAACAAAT GCACAGAAGAGTCACTGGAAAATGTTGTTCACTCAAGCCAATTTCACGACCTTAAAATGAAAGCACCTATGAAAGCAAGG AAGTTAGTGATTAAAAAGAAACAGCTTTCAGCAGACACTGGAAGTTCTGGCAAACTGAAATTTTCTAGTTCTGAGGCAGA TCCTGTAGGTAGTAGAGGTGATGTGAACTCTCGAAATTCCTCTTTCATGGGGCCTAATCTAGTAACAGAAGTACCAGAAG GTGAAGATGGCAGGAATTTAAGTTCTCCACAGCTACTGCATTCGTATTCTGAGCAAAGAAGTTACGATCACGTCCTTGAA GGGGACAATTCATATAAAAGGGAAGTCATTCCAGATGGTCTTGAAGAAAATACCTCAGTTTTTGGAATTAAACATGGTTT AGGGAGTAGTTTATCTAATGTTGTTAAGGATCCAATCCGTCGAACACGGTCTATCAGGATGAAGACCACTCCTGAGGAGC CAAACACTTTGAACACAAAGATTAAAATTCGAGGGGGCCAAAGTTCCAGGGGCATATCCACTTGGGAAGGTTCTTCTATC AAAGCATGTGATCAAGTTCATCAAAGAACAAGGTCTGCTAGAAACGGGTTTGATGAATATACTGCCAATGACCGTAGTAT TTCAACTCAAAGGGTGGTGTCAAATCACCATGTTAAAAAATTGTCATGGCTAATGCTCTCAGAGCATGAGGAGGGTTACC GTTACATTCCTCAACTTGGAGATGAAGTTGTGTACTTGAGACAGGGTCATCAAGAGTATATAGAGTCTTGTGCACCATCT GAATCAGGTCCTTGGAGTTCATTTAAAGGACTAAGTGCTTCTGAAATTTGCAAGGTTGAAAAGCTTGAGTATGCAGAGCT CCCAGGGTCTGGGGATAGCTGTTGTAAACTTAAACTCCAGTTTATAGATCCTTCTTCATCTGTGTATGGCAAATCCTTTA AATTAACTCTGCCTGAATTGATTAACTTCTCTGATTTTGTTGTTGAGAGAACGTGGTATGATTCTGCCATGAAGAGAAAT TGGACTTCAAGAGATAAATGTATGGTCTGGTGGAAAAATGAAGATGGGGAAAGTGGAAGTTGGTGGGAGGGTCGAATTAC TGCAGTGGAAGCCAAATCTCATGAGTTCCCTGACAGTCCTTGGGAAAGGTATTCGATCCAGTACAAGACTGATCCAAATA TTCATAAGCATAGTCCGTGGGAACTAAATGACCCTGAGATGCTGTGGGAGCACCCCCACATTGATCATGAGACCAGGGAT AAGCTGCTTTCTTATTTTGCTAAATTAGATCGCAGGGAGAAGTATGATATCCAGGCATTGAACCAAGTAGCTGGGAAGCT AGAGTTTTCAAACAGGTTTCCGGTCTCATTATATCCTGAACTGATTCAGATAAGGCTAAAGAATGACTACTATCGGTGTG TGGAAGGTGCCAAGCATGATATAATGGTAATGTTATCAAATGCTGAAGAATTCTTTACAATTGCAAAAAATATTCAGCTG TTGGGCAAGACCAGGCGAATATCCGAATGGTTTAGAAGAAAACTTGAAAGGATATGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0244900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDSRKCKPSSGRVSVAPAPAVSVANQVDEVARSLREVGRVGTDVDIDLREVYFLIMHFLSAGPCQKTFVQLGNELLEHQL LPRRYHAWYSRSGEASGNDVDNDDGISLPLNYDDLANRYPHIAKDHLVKLLKQLMLSMTHPLHGKLGGSSPNAADVPTLL GHGSFSLLDTDGKTADKPVKPLPLYLRWPHMKANQVQGLSLREIGGGFTKHHRAPSIRSACYAIAKPSTMVQRMQNIKKL RGHRVAVYCAIFDGSGRYVISGSDDRLVKIWSMETAFCLASCRGHEGDITDMAVSSNNALVASASNDFVIRVWRLPDGMP ISVLRGHTGAVNTIAFSPRPTAVYQLLSSSDDGTCRIWDARNSHNPRIYVPRPSDSVTGKGNAPPANLPSSSNGQHSYQI LCCAYNANGTVFVTGSADTFARVWSALKPNNSDSEQPVHEIDLLSGHENDVNYVQFSGCSVASKLVTSDSWREENTQKFR NFWYCHDNIVTCSRDGSAIIWVPRSRRSHGKVGRWTRAYHLKVPPPPLPPQPPRGGPRQRLLPTPRGVNMIVWSLDNRFV LAAIMDCRICVWNAVDGSLVHSLTGHTASSYVLDVHPFNPRIAMSAGYDGRTIVWDIWEGIPIRTYEIGRFKLVDGKFSP DGTSIILSDDVGQIYFLNTGQGESQKDAKYDQFFLGDYRPLIQDTQGNVLDQETQLPPHRRNIQEPLCDSSMVPYPEPYQ SQFQQRRLGALGIEWRPSMIKYAVGPEFSVDQDYPLIPLIDLEGMFELQPELTDAMFWEPEYDIASDDNNDSEYNVNEDN SSAAEQGSVSAISSSDLECSEDDSSSRDGLRRSRRKKHKVEVEVMTSSGRRVRKRNLDECNGNTSGSNRTIKSKGSLKSS RRKSSKTKKLRPQRVAAHNARNMLSQIGETSTDEEDNDSEDELSESFQNSDDLSEPERKRHNNRDEHKKPILEELDDVSK PSAYPEVPAIAERPRLVVKISLPKRNVTLEGTRLARETEVNVASQSSGPQLQESVQNTLPDRNTVDLALSFANSTNAKLA QSHKNEDDDNIQADSAANNLDTSECVEGNTVQCRQMRRDTHELSRSGDALLTDAKVDDHLEYTANGRSEHMTRELETVGS MINTVVEDFDNAPKFSSLEPSTLGNHQPNANISMTSGYDKLNGGYNGRSGSNKCTEESLENVVHSSQFHDLKMKAPMKAR KLVIKKKQLSADTGSSGKLKFSSSEADPVGSRGDVNSRNSSFMGPNLVTEVPEGEDGRNLSSPQLLHSYSEQRSYDHVLE GDNSYKREVIPDGLEENTSVFGIKHGLGSSLSNVVKDPIRRTRSIRMKTTPEEPNTLNTKIKIRGGQSSRGISTWEGSSI KACDQVHQRTRSARNGFDEYTANDRSISTQRVVSNHHVKKLSWLMLSEHEEGYRYIPQLGDEVVYLRQGHQEYIESCAPS ESGPWSSFKGLSASEICKVEKLEYAELPGSGDSCCKLKLQFIDPSSSVYGKSFKLTLPELINFSDFVVERTWYDSAMKRN WTSRDKCMVWWKNEDGESGSWWEGRITAVEAKSHEFPDSPWERYSIQYKTDPNIHKHSPWELNDPEMLWEHPHIDHETRD KLLSYFAKLDRREKYDIQALNQVAGKLEFSNRFPVSLYPELIQIRLKNDYYRCVEGAKHDIMVMLSNAEEFFTIAKNIQL LGKTRRISEWFRRKLERI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 39 | 1696 | 1658 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 39 | 1696 | 1658 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 218 | 390 | 173 | 1.2E-39 | ||
| SUPERFAMILY | 231 | 660 | 430 | 1.83E-66 | ||
| SMART | 233 | 272 | 40 | 1.9E-7 | ||
| Pfam | 235 | 272 | 38 | 1.5E-6 | ||
| CDD | 236 | 616 | 381 | 7.75387E-55 | – | |
| ProSiteProfiles | 240 | 281 | 42 | 13.884 | ||
| ProSiteProfiles | 240 | 434 | 195 | 32.799 | ||
| SMART | 275 | 314 | 40 | 6.7E-8 | ||
| Pfam | 278 | 313 | 36 | 6.6E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 282 | 323 | 42 | 12.48 | ||
| SMART | 317 | 359 | 43 | 6.8E-8 | ||
| Pfam | 320 | 359 | 40 | 7.2E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 324 | 368 | 45 | 13.382 | ||
| ProSitePatterns | 346 | 360 | 15 | - | ||
| MobiDBLite | 368 | 391 | 24 | - | – | |
| SMART | 386 | 425 | 40 | 0.0035 | ||
| Gene3D | 391 | 527 | 137 | 5.0E-12 | ||
| ProSiteProfiles | 393 | 425 | 33 | 9.907 | ||
| Pfam | 395 | 425 | 31 | 0.13 | ||
| SMART | 434 | 502 | 69 | 3.0 | ||
| SMART | 534 | 573 | 40 | 3.2 | ||
| Gene3D | 535 | 671 | 137 | 4.3E-18 | ||
| ProSiteProfiles | 541 | 625 | 85 | 12.763 | ||
| ProSitePatterns | 560 | 574 | 15 | - | ||
| SMART | 576 | 616 | 41 | 1.9E-4 | ||
| Pfam | 577 | 616 | 40 | 0.095 | ||
| ProSitePatterns | 603 | 617 | 15 | - | ||
| MobiDBLite | 784 | 960 | 177 | - | – | |
| MobiDBLite | 795 | 819 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 839 | 858 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 859 | 874 | 16 | - | – | |
| MobiDBLite | 875 | 895 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 911 | 928 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 931 | 960 | 30 | - | – | |
| MobiDBLite | 1213 | 1262 | 50 | - | – | |
| MobiDBLite | 1229 | 1246 | 18 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0244900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…