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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0270300 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0270300.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein MOR1; TAIR: AT2G35630.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q94FN2|MOR1_ARATH Protein MOR1; TrEMBL-Plants: tr|K7LKK4|K7LKK4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0270300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:58336999..58359530) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGCCTCTTTCTCTCCACGCTCCTCACTCCCGCGCGTGGTTCTAAATAAAAACCTCCCTCTCTTCTCAAATGTATTTCTGA AGCGAAGATAAAAAAACCCATTTCCACGCTCTCTCCATTTCTTTTCCATTTTCTTTTCCCTCTCTCGCCGGCACTGCACC AAACAAAAAAAACCACCACACTCTATCCCTCTCTTGTTTCTCTCTCTAGAATCCGCCGCGCATTCGAGAAGATCGATAGG GTTCCGCCGTGCGACGATTCTGTAGATTGTTGCGACGCCACCAGCAATGTCGTCGGAGGAAGAGAAGCTGTTGAAGGAGG CCAAGAAACTGCCGTGGGAGGATCGCCTCTTCCACAAGAACTGGAAGGTTCGCAGCGAGGCTAACGTCGATTTAGCCTCC CTCTGTGACTCCATTTCTGATCCCAAGGACTCTCGCATCCGTGAATTCGGTCGGTACTTTTGAATTTTTAGGGTTTTTGT GTTTTCCGATTTGGTCTTGATCTCCGGATGGTGGATCTAGTTGCTGGTTTCTGTTGAGATTGTGGTTGTTGTGCTGCATT TTGATTTTGATTTGGATCTTGATGCTGATGTGTTTGTATGTGTGTGTGTTGTTTTTCTCTGAAATTTGTAGGTCCTTTTT TTAGAAAGACTGTGGCGGATTCGAATGCTCCGGTGCAGGAGAAAGCGCTCGATGCATTGATTGCTTACTTGCGAGCTGCA GATGCTGATGCCGGCAGGTGAGAATTTCGTGTGGTTAATTTTTTCTATGCTTTTCATATTTAGTTGCATGCGTTTTTTTT TTGAGAATGAATGAAGTTACCGTTCTGACTTGAGTTTGAATTTGAATTTGAATTTCGGGGTAGGTTCGGTAAGGAAGTTT GTGATGCGATTGTGGCCAAGTGTATGACGGGAAGGCCTAAGACGGTGGAGAAGGCTCAAGCAGTGTTTATGCTTTGGGTG 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0270300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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CCTGGGGATTTTTCAGAAGTTTGCCGTACCTTAAAGAAGCTCATTACAGATGTGAATATTGCTGTTGCTGTTGAAGCTAT CCAGGCTATTGGCAATCTTGCTCGTGGATTACGAACTCACTTTTCTGCGAGTTGTCGTTTTTTACTGCCTGTTTTACTTG AAAAACTGAAAGAAAAGAAACCTACTTTGGCTGATGCATTGACTCAGACTCTTCAAGCAATGCACAAAGCTGGATGCATT GGTCTTATTGATGTTGTAGAAGATGTTAAGATAGCCACAAAAAACAAAGTCCCCCTTGTGCGATCGTTAACTTTGACCTG GGTGACATTTTGTATTGAATCAAGTAACAAGGGCATCATTACAAAGATGCACAAGGATTATGTGCCAATATTAATGGAGT CCCTAAATGACGGTACTCCTGAAGTGAGGGATGCTGCCTTTTCTGCATTGGCCGCAATAGCTAAGTCTGTTGGCATGAGA CCTCTAGAGAAATCCCTGGAGAAACTTGATGATGTCAGAAGAAAAAAACTTTCGGAAATGATTTCAGGTTCTGAAGATGC TTTGCCCGGTGGTTCTTCTACAGCTTTGGTGCAAAATACACGTGCAAGTGCATCTTCTGCGGAGACCTCTGAAAGTGCAT TTGTTAAAAGGTCAGCTACAAGCATGCTTAGTGGAAAGAGACCTGTTCAGGCCGCTCCTGCTGTGAAGAAAGGGGGAACT GCAAAGTCTGGGACAAACAAAAAAGCAGATGGAAATGCACAGTCGAAGGTTTCAAAATCGATTGAACCACCGGAAGATGT GGAGCCCACTGAGATGAGTCTTGATGAGATTGAAAGCCGAATAGGTTCTCTTATAAATCCAGATACCATCAACCTATTAA AAAGTGCTGTCTGGAAGGAGCGACTTGAAGCCATTTCTTCACTGAAACAGCAAGTTGAAGGTTTACACGACCTTGATAAA TCAGTAGAAATTTTGATTCGTTTACTCTGCACCTTGCCTGGATGGGGCGAGAAAAACGTTCAGGTTCAGCAGCAGGTTAT TGAAGTTATTACTCATGTAGCTTCGACTGCAACTAAATTCCCAAAGAAGTGTGTTGTACTTTGCCTTTCGGGACTAAGTG AACGTGTAGCAGATATTAAGACACGTGCACATGCTATGAAATGCCTTACTACCTTTTCTGAAGCAGTTGGTCCAGGATTC ATCTTTGAAAGACTCTACAAGATCATGAAGGAGCATAAGAATCCAAAGGTTCTCAGTGAGGGAATTTTGTGGATGGTTTC TGCTGTTGAGGATTTCGGTGTATCACATTTAAAGCTTAAGGATTTAATCGATTTTCTTAAAGAAACTGGGCTGCAGTCAA GTGCAGCTGCTACTAGAAATGCTTCAACTAAGTTCTTGGGTGTTCTGCACAGATTTGTTGGTCCAGACATTAAAGGGTTT CTTGCTGATGTTAAGCCTGCACTACTCAGTGCCCTTGATGCAGAGTATGAGAAGAATCCATTTGAGGGGGCATCTGCAAT CCCCAAAAGAACTATTAAGGCAGCAGAGTCATCTTCATCTGTGGCGGCTGGTGGGCTGGATGGCTTGCCTCGTGAAGACA TTAGTGGAAAGATCACTCCAACTCTCCTGAAGACCCTAGAAAGTCCTGACTGGAAGGTACGTATGGAGTCCGTTGATGCT GTAAACAAAATACTGGAAGAGGCTAATAAGCGCATTCAAGCTACTGGAACTGGTGAGTTATTTGGGGCTCTTAGGGGACG GCTCATTGACAGCAACAAAAACATAGTCATGGCTTCGTTGACAACCCTTGGTAATGTTGCATCTGCAATGGGACCTGCTG TGGAGAAAGCGAGCAAGGGCACTCTGTCTGACATATTGAAATGTCTTAGTGACAATAAGAAGCACATGAGAGAATGTGTG 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GAGAAAGTACGAGAAAAAATGCGAGAGCTGACCAAACAATTTGTTTCTGTATATTCTGCATCTAAATGTTTCCCTTACAT ATTGGAGGGTTTACGCTCTAAGAACAACCGAACTCGAATTGAATGCGCTGATCTTGTTGGTTTTATTGTTGATCATCATT CAGCTGAGATTAGCGGGCAGCTGAAGTCATTGCAAATTGTTGCAAGTTTGACAGCAGAACGGGATGGTGAAATTAGAAAA GCTGCATTAAATACACTGGCCACTGGTTATAAGATTCTAGGTGAGGACATATGGAGGTTTGTTGGGAAGCTAACTGATGC TCAAAAAAGCATGTTAGATGATAGATTTAAGTGGAAGATCCGGGAGATGGAAAAGAAGAAGGAAGGAAGACCAGGCGAAG CAAGGGCCATTTTAAGGCGTTCTGTCAGGGAAAACGGGTCTGATGTCGCAGAGCAAAGCGGAGAAATAGCTAGATCTCTT GCTGGGCCAATATTGAGGAAAAATATTGGTCCATCTGATAATACCATTGAGAGACAATTGATGCCTCGTCCTGTAGCTGT TGCTAGTGGCCCCACAGATTGGAATGAAGCCCTTGATATTATATCTTTTGGTTCTCCTGAGCAGTCTGTTGAAGGAATGA AAGTTGTTTGTCATGAGTTGGCTCAGGCCACTAGTGAACCAGAAGGCAGTGCTATGGATGAGCTCGTGAAAGATGCAGAT AGGCTAGTTTCATGTCTTGCAAATAAGGTTGCAAGAACTTTTGACTTCAGTTTGAGTGGGGCTTCATCACGGTCTTGTAA ATATGTGCTCAACACTCTGATGCAGACTTTTCAGAATAAAAGATTGGCACATGCTGTAAAGGAGAGCACTCTTGATAGTC TGATTACTGAGCTTCTTCTGTGGCTCTTGGATGATAGGGTTCCTCATATGGATGATGGAAGCCAGTTGTTGAAAGCATTG AATGTATTGATGCTTAAGATCCTTGATAATGCAGATCGGACATCATCCTTTGTCGTCCTAATCAATCTTTTACGTCCTCT AGATCCATCAAGGTGGCCTTCCCCAGCATCAAATGAGTCATTTGCCTCCAGGAATCAGAAATTTTCTGATTTGGTTGTCA AATGCCTTATCAAGCTTACAAAGGTTCTTCAGAGCACCATCTATGATGTTGATCTAGATCGCATTCTTCAAAGTATCCAT TTGTATCTTCAAGACTTGGGAATGGAGGAAATTAGGAGAAGGGCTGGTGCTGATGACAAACCCTTGCGAATGGTAAAAAC TGTTCTGCATGAGCTTGTCAAGCTTCGTGGTGCAGCTATAAAAGGTCATCTTTCAATGGTTCCTATTGATACGAAACCTC AGCCTATCATCCTTGCCTACATTGAACTTAATCTTGAGACTTTGGCTGCTGCAAGAATGTTGACTGCATCTGGGCCTGGG GGACAAAACCACTGGAGCGATTCAGCAGCCAATAATTCAGCCTCTGGAACACATTCTGCTGATGCCCAATTGAAGCAAGA GTTGGCTGCAATATTTAAGAAGATTGGGGAGAAGCAAACTTGCACAATTGGTTTATATGAACTATATCGGATTACCCAGT TGTATCCGAAGGTTGACATATTTTCTCAGCTTCAAAATGCTAGTGAGGCATTCCGCACTTACATAAGAGATGGCCTTGCC CAGATGGAGAAAAATGCTGCAGCTGGCAGAACACCGTCAAGTTTGCCGATGCCTACTCCTCCACCAGCATCTTTAAATAA TTCTTCCCCAGATTTTGCACCTCTTTCTCCTATAAATGCAAATCCATTGGGGGATGCTAAATTAAATGTGAAAACTGATC TGACAAATTTCAATTTACCCCCGTCCTACAATGAGGAGAATAGGAGAGCATTAAATTCTGACTACACTTTAGGTGACCAA 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Protein sequence (LotjaGi5g1v0270300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSEEEKLLKEAKKLPWEDRLFHKNWKVRSEANVDLASLCDSISDPKDSRIREFGPFFRKTVADSNAPVQEKALDALIAY LRAADADAGRFGKEVCDAIVAKCMTGRPKTVEKAQAVFMLWVELEAVDAFLDAMEKAIKHKVSKAVVPAIDVMFQALSEF GAKVVPPKRILKMLPELFEHQDQNVRACSKGLTLELCRWIGKDSVKSILFEKMRDTMKKELETELVNVLGAGKPSRKIRS EQDKEPELEAVSETVGPGPSEESGTDAPQEIDEYELVDPVDILTPLEKSGFWDGVKATKWSERKEAVAELTKLASTKRIS PGDFSEVCRTLKKLITDVNIAVAVEAIQAIGNLARGLRTHFSASCRFLLPVLLEKLKEKKPTLADALTQTLQAMHKAGCI GLIDVVEDVKIATKNKVPLVRSLTLTWVTFCIESSNKGIITKMHKDYVPILMESLNDGTPEVRDAAFSALAAIAKSVGMR PLEKSLEKLDDVRRKKLSEMISGSEDALPGGSSTALVQNTRASASSAETSESAFVKRSATSMLSGKRPVQAAPAVKKGGT AKSGTNKKADGNAQSKVSKSIEPPEDVEPTEMSLDEIESRIGSLINPDTINLLKSAVWKERLEAISSLKQQVEGLHDLDK SVEILIRLLCTLPGWGEKNVQVQQQVIEVITHVASTATKFPKKCVVLCLSGLSERVADIKTRAHAMKCLTTFSEAVGPGF IFERLYKIMKEHKNPKVLSEGILWMVSAVEDFGVSHLKLKDLIDFLKETGLQSSAAATRNASTKFLGVLHRFVGPDIKGF LADVKPALLSALDAEYEKNPFEGASAIPKRTIKAAESSSSVAAGGLDGLPREDISGKITPTLLKTLESPDWKVRMESVDA VNKILEEANKRIQATGTGELFGALRGRLIDSNKNIVMASLTTLGNVASAMGPAVEKASKGTLSDILKCLSDNKKHMRECV LNTLDSWLAAVHLDKMVPYVTIALTDSKLGAEGRKDLFDWLSRHLSGLSSFAEAAQLLKPASSAMTDKSSDVRKAAEACI TEILRVSGHEMIEKIVKDIHGPAQILILEKLKPHGAFQESFEPGRAVSVGVTSKGVSKVGKSTANGVAKHGNRAVSSRVG ATKLTKAESISVQDIAVQSQALLNIKDSNKEDRERVVVRRYKFEDPRIEQIQDLENDMMKYFREDLHRRLLSADFKKQVD GLEMLQKALPSIAKDVIEVLDILLRWFVLQFCKSNTTCLLKVLEFLPELLDTLKDDGYSLTESEVAIFLPCLVEKLGHNI EKVREKMRELTKQFVSVYSASKCFPYILEGLRSKNNRTRIECADLVGFIVDHHSAEISGQLKSLQIVASLTAERDGEIRK AALNTLATGYKILGEDIWRFVGKLTDAQKSMLDDRFKWKIREMEKKKEGRPGEARAILRRSVRENGSDVAEQSGEIARSL AGPILRKNIGPSDNTIERQLMPRPVAVASGPTDWNEALDIISFGSPEQSVEGMKVVCHELAQATSEPEGSAMDELVKDAD RLVSCLANKVARTFDFSLSGASSRSCKYVLNTLMQTFQNKRLAHAVKESTLDSLITELLLWLLDDRVPHMDDGSQLLKAL NVLMLKILDNADRTSSFVVLINLLRPLDPSRWPSPASNESFASRNQKFSDLVVKCLIKLTKVLQSTIYDVDLDRILQSIH LYLQDLGMEEIRRRAGADDKPLRMVKTVLHELVKLRGAAIKGHLSMVPIDTKPQPIILAYIELNLETLAAARMLTASGPG GQNHWSDSAANNSASGTHSADAQLKQELAAIFKKIGEKQTCTIGLYELYRITQLYPKVDIFSQLQNASEAFRTYIRDGLA QMEKNAAAGRTPSSLPMPTPPPASLNNSSPDFAPLSPINANPLGDAKLNVKTDLTNFNLPPSYNEENRRALNSDYTLGDQ RNDKYMTGVTTGTLDAIRERMKSMQLAAAAGSTDSAARPLTSINDNMNHGHPHSQIPHASEHVAMENALQGGVLPMDEKA LSGLQARMERLKSGSLEPL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SMART | 1 | 234 | 234 | 1.5E-40 | ||
| Gene3D | 5 | 254 | 250 | 1.0E-52 | ||
| PANTHER | 7 | 2013 | 2007 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 7 | 2013 | 2007 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 19 | 815 | 797 | 1.02E-46 | ||
| MobiDBLite | 234 | 268 | 35 | - | – | |
| MobiDBLite | 236 | 250 | 15 | - | – | |
| Gene3D | 272 | 502 | 231 | 5.3E-62 | ||
| SMART | 275 | 510 | 236 | 1.8E-63 | ||
| Pfam | 298 | 476 | 179 | 1.1E-10 | ||
| ProSiteProfiles | 447 | 485 | 39 | 11.894 | ||
| MobiDBLite | 501 | 589 | 89 | - | – | |
| MobiDBLite | 507 | 545 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 565 | 579 | 15 | - | – | |
| SMART | 591 | 825 | 235 | 3.9E-54 | ||
| Gene3D | 592 | 836 | 245 | 1.2E-50 | ||
| SUPERFAMILY | 610 | 1684 | 1075 | 1.1E-54 | ||
| Gene3D | 846 | 1074 | 229 | 2.2E-56 | ||
| SMART | 847 | 1080 | 234 | 8.1E-39 | ||
| ProSiteProfiles | 861 | 967 | 107 | 10.243 | ||
| CDD | 865 | 967 | 103 | 7.10234E-4 | – | |
| Gene3D | 1142 | 1399 | 258 | 4.9E-67 | ||
| SMART | 1170 | 1406 | 237 | 1.7E-52 | ||
| Coils | 1273 | 1293 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0270300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…