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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0270300 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0270300.2 |
Related isoforms 2 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Protein MOR1; TAIR: AT2G35630.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q94FN2|MOR1_ARATH Protein MOR1; TrEMBL-Plants: tr|K7LKK4|K7LKK4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0270300 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:58339046..58359241) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCGTCGGAGGAAGAGAAGCTGTTGAAGGAGGCCAAGAAACTGCCGTGGGAGGATCGCCTCTTCCACAAGAACTGGAAGGT TCGCAGCGAGGCTAACGTCGATTTAGCCTCCCTCTGTGACTCCATTTCTGATCCCAAGGACTCTCGCATCCGTGAATTCG GTCGGTACTTTTGAATTTTTAGGGTTTTTGTGTTTTCCGATTTGGTCTTGATCTCCGGATGGTGGATCTAGTTGCTGGTT TCTGTTGAGATTGTGGTTGTTGTGCTGCATTTTGATTTTGATTTGGATCTTGATGCTGATGTGTTTGTATGTGTGTGTGT TGTTTTTCTCTGAAATTTGTAGGTCCTTTTTTTAGAAAGACTGTGGCGGATTCGAATGCTCCGGTGCAGGAGAAAGCGCT CGATGCATTGATTGCTTACTTGCGAGCTGCAGATGCTGATGCCGGCAGGTGAGAATTTCGTGTGGTTAATTTTTTCTATG CTTTTCATATTTAGTTGCATGCGTTTTTTTTTTGAGAATGAATGAAGTTACCGTTCTGACTTGAGTTTGAATTTGAATTT GAATTTCGGGGTAGGTTCGGTAAGGAAGTTTGTGATGCGATTGTGGCCAAGTGTATGACGGGAAGGCCTAAGACGGTGGA GAAGGCTCAAGCAGTGTTTATGCTTTGGGTGGAATTGGAGGCTGTGGATGCATTTCTGGTACATTTCTTTCCTACTTGGT TTCTTTGGCATTGAGTGGTTTTCCTTCCTGTTTTTTTGGGGGGTAGGTTACTAGGTTGTTGTCGTTTGCTGTTTTAGCTT GGCATTTGTGTCTAGCTGACTATAGGGTTGCTCACATGTTTTGTTCCGGTAGGGAGGCTTATCCTGTTTACCTAGCTTAA TGTATATTTACAGAATACAATGCGTGCCGGGAAAAAAAAAACTTCTGGCAGTTGTAATCACAATGCAAATTTTCAGCCTG 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TTGTGAGGAACTCATCTTTTGATTCATTTGTTTATTTTCTCCTTTTTCTGTAAAAATAAAGTCTCACATTGTTGTAATAT AATGGTGTTGTTTTTGTGTATACTTGAAAACATTATATGATAAGTTAATCGCCTGACTAGTGATTGTCAATACAGGATAA TGCAGATCGGACATCATCCTTTGTCGTCCTAATCAATCTTTTACGTCCTCTAGATCCATCAAGGTGGCCTTCCCCAGCAT CAAATGAGTCATTTGCCTCCAGGAATCAGAAATTTTCTGATTTGGTTGTCAAATGCCTTATCAAGCTTACAAAGGTAACT TTCACAGTCAGCAGTATAATCCTGAAGATCAGATAAATTCTTTGTTTGGGTATTATTCTCTCATTAGTGTGGTGCTGTGT GCCTGTGTTTTGATAAGTTTAATTACATATCGTACTGGTCTAAATAATATTTCCCATTTTAATTGAATCCCGTTATTTTG CCGACTGCATTGAAATAAATTTTCTACATGTTCACTTTATGGAGGCTTTGGTGATTTTTCAGTACTAAGTTAAGTTTAGA GGGACCATTACTAGCTCTGATACCATCTTAGAATTGGGTTTAGGCCTAACTCTACCCCCAAAAGCTAGCTTAGAGGTGAG GGTTGCTTTGACCTTTATAAACACTTATTTGGTCATAGCTGTAGTTAGTGTGAGATTTCTCAAGAGAGAGATCTAGGTCT CTCCCAATGCCCAGTTACAATTATCCCCAAAAGATAATATTTCACACTAACTCTTATTTATAACATTTTCTCAAACTAAC CCAAGCTACCTCAACTAACTAACTATGGGTACCTATCATGTTTGTTGGATATTTAATTAGAAACCAATTTATTCAACTTA TAATAAAGCCGTGCGTAACGGTAAAAAGTTGTTGCCATGTGACTGAGGTCATGGGCTCAAGACCTGGAAACAACCTCCGC GAACCCGCTCATTGTGAGAGCTTGGATGCCCTGGGCTGCGCTTTTTTTTAATATAATAAATAGTTCTATTTAGTGTTTAG AAACAGTGCGTGATATTTAGTATTTAGCCACGTATTGGTAAATTGTATATAATATTTGGCCTCATGAACTGTAGCATGTA ATAGTTTTTTTTTCATTATCAAGAAGAGGTGTTTGCAAGAGCTGTAATGTATTTGCAAAAAATTATCTGGATGGAATTGG TCTTCCAAATACTTGTTGCTCAGTACTATTTTACATACATTTTCCTGTGCTTCAGGTTCTTCAGAGCACCATCTATGATG TTGATCTAGATCGCATTCTTCAAAGTATCCATTTGTATCTTCAAGACTTGGGAATGGAGGAAATTAGGAGAAGGTATAAC TATTGTTGGATATAGTTACTACGTAGTACATACCACTATTTGCTTTTCATTTTCTGACGTTCGATTTTCTTAGGGCTGGT GCTGATGACAAACCCTTGCGAATGGTAAAAACTGTTCTGCATGAGCTTGTCAAGCTTCGTGGTGCAGCTATAAAAGGTCA TCTTTCAATGGTTCCTATTGATACGAAACCTCAGCCTATCATCCTTGCCTACATTGAACTTAATCTTGAGGTATGCATTA ATTTCTTTTTAATTCCATTTTATGGGGGGTTGATTTCTTTATACTTCATATCTATTCTTGATTTCCAGACTTTGGCTGCT GCAAGAATGTTGACTGCATCTGGGCCTGGGGGACAAAACCACTGGAGCGATTCAGCAGCCAATAATTCAGCCTCTGGAAC ACATTCTGCTGATGCCCAATTGAAGGTAACAAACATATGCTTCATAATTTTCGAAGGTTAATTTATTCAGTTTTTACTGT ATTATATCCTGCTTTACTGTAAATTCAAATGCCCTCATGCCTTTATTGTTGTCTCTTTGTATCCTCAAAAATAAATTAAA TCTCAGCAAGAGTTGGCTGCAATATTTAAGAAGATTGGGGAGAAGCAAACTTGCACAATTGGTTTATATGAACTATATCG GATTACCCAGTTGTATCCGAAGGTAAGAATTAAAAATGTATTTAAGTTTTATGTTAATTTATCAAACAAGATGTTATGAT TAATTAATGAACTATTATTGTGCTTTATCTTAGGTTGACATATTTTCTCAGCTTCAAAATGCTAGTGAGGCATTCCGCAC TTACATAAGAGATGGCCTTGCCCAGGTCGAGTTAAATTATGAGTATTACTAAAAATGCTTAATTAAACTTGCATTGTATT TTTCAACTTGCACAACTGTGAGCAATATAACTGAGTCTTCCATAACATTTTGACAGATGGAGAAAAATGCTGCAGCTGGC AGAACACCGTCAAGTTTGCCGATGCCTACTCCTCCACCAGCATCTTTAAATAATTCTTCCCCAGATTTTGCACCTCTTTC TCCTATAAATGCAAATCCATTGGGGGATGCTAAATTAAATGTGAAAACTGATCTGACAAATTTCAATTTACCCCCGTCCT ACAATGAGGAGAATAGGAGAGCATTAAATTCTGACTACACTTTAGGTGACCAACGAAATGATAAATATATGACCGGAGGT ATGTGAAAGTTTGTTTGTTTTGCATCTAAATTGTATATTAGAAAATAATGTTGACTGGGAGAAGTTACATATGAACTGCA GTAACGACTGGAACGTTGGATGCAATCAGAGAGAGGATGAAGAGCATGCAATTAGCAGCTGCTGCTGGGAGTACAGATTC TGCTGCTAGACCATTGACAAGTATTAACGACAACATGAATCATGGGCATCCTCATAGTCAGATTCCTCATGCATCCGAGC ATGTTGCTATGGAGAATGCTTTGCAAGGTGGAGTCCTTCCCATGGATGAGAAAGCTTTATCCGGGCTTCAAGCGCGGATG GAAAGACTGAAAAGTGGATCCCTTGAACCTCTGTAA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0270300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACGGGAAGGCCTAAGACGGTGGAGAAGGCTCAAGCAGTGTTTATGCTTTGGGTGGAATTGGAGGCTGTGGATGCATT TCTGGATGCAATGGAGAAAGCGATAAAACACAAAGTTTCTAAAGCAGTTGTACCTGCAATAGATGTTATGTTTCAAGCTT TAAGTGAATTTGGAGCAAAAGTTGTGCCTCCAAAAAGAATTTTGAAGATGCTTCCAGAACTCTTTGAACATCAAGATCAA AATGTTCGTGCATGTTCTAAGGGGTTGACTCTTGAGCTATGTCGCTGGATTGGTAAAGATAGTGTAAAATCAATTTTGTT TGAGAAAATGAGAGACACAATGAAAAAAGAGTTGGAAACGGAGCTTGTAAATGTCTTGGGAGCAGGAAAGCCATCTCGCA AAATAAGATCGGAGCAAGACAAAGAACCAGAACTTGAAGCTGTATCAGAGACTGTAGGTCCTGGCCCTTCTGAAGAATCT GGGACAGATGCTCCTCAAGAAATAGATGAATATGAGCTTGTGGATCCTGTTGATATATTGACTCCTTTGGAGAAATCAGG ATTTTGGGATGGAGTGAAAGCTACCAAATGGTCTGAACGGAAGGAGGCTGTCGCGGAGCTAACAAAGCTTGCATCAACTA AAAGAATTTCTCCTGGGGATTTTTCAGAAGTTTGCCGTACCTTAAAGAAGCTCATTACAGATGTGAATATTGCTGTTGCT GTTGAAGCTATCCAGGCTATTGGCAATCTTGCTCGTGGATTACGAACTCACTTTTCTGCGAGTTGTCGTTTTTTACTGCC TGTTTTACTTGAAAAACTGAAAGAAAAGAAACCTACTTTGGCTGATGCATTGACTCAGACTCTTCAAGCAATGCACAAAG CTGGATGCATTGGTCTTATTGATGTTGTAGAAGATGTTAAGATAGCCACAAAAAACAAAGTCCCCCTTGTGCGATCGTTA ACTTTGACCTGGGTGACATTTTGTATTGAATCAAGTAACAAGGGCATCATTACAAAGATGCACAAGGATTATGTGCCAAT ATTAATGGAGTCCCTAAATGACGGTACTCCTGAAGTGAGGGATGCTGCCTTTTCTGCATTGGCCGCAATAGCTAAGTCTG TTGGCATGAGACCTCTAGAGAAATCCCTGGAGAAACTTGATGATGTCAGAAGAAAAAAACTTTCGGAAATGATTTCAGGT TCTGAAGATGCTTTGCCCGGTGGTTCTTCTACAGCTTTGGTGCAAAATACACGTGCAAGTGCATCTTCTGCGGAGACCTC TGAAAGTGCATTTGTTAAAAGGTCAGCTACAAGCATGCTTAGTGGAAAGAGACCTGTTCAGGCCGCTCCTGCTGTGAAGA AAGGGGGAACTGCAAAGTCTGGGACAAACAAAAAAGCAGATGGAAATGCACAGTCGAAGGTTTCAAAATCGATTGAACCA CCGGAAGATGTGGAGCCCACTGAGATGAGTCTTGATGAGATTGAAAGCCGAATAGGTTCTCTTATAAATCCAGATACCAT CAACCTATTAAAAAGTGCTGTCTGGAAGGAGCGACTTGAAGCCATTTCTTCACTGAAACAGCAAGTTGAAGGTTTACACG ACCTTGATAAATCAGTAGAAATTTTGATTCGTTTACTCTGCACCTTGCCTGGATGGGGCGAGAAAAACGTTCAGGTTCAG CAGCAGGTTATTGAAGTTATTACTCATGTAGCTTCGACTGCAACTAAATTCCCAAAGAAGTGTGTTGTACTTTGCCTTTC GGGACTAAGTGAACGTGTAGCAGATATTAAGACACGTGCACATGCTATGAAATGCCTTACTACCTTTTCTGAAGCAGTTG GTCCAGGATTCATCTTTGAAAGACTCTACAAGATCATGAAGGAGCATAAGAATCCAAAGGTTCTCAGTGAGGGAATTTTG TGGATGGTTTCTGCTGTTGAGGATTTCGGTGTATCACATTTAAAGCTTAAGGATTTAATCGATTTTCTTAAAGAAACTGG GCTGCAGTCAAGTGCAGCTGCTACTAGAAATGCTTCAACTAAGTTCTTGGGTGTTCTGCACAGATTTGTTGGTCCAGACA TTAAAGGGTTTCTTGCTGATGTTAAGCCTGCACTACTCAGTGCCCTTGATGCAGAGTATGAGAAGAATCCATTTGAGGGG GCATCTGCAATCCCCAAAAGAACTATTAAGGCAGCAGAGTCATCTTCATCTGTGGCGGCTGGTGGGCTGGATGGCTTGCC TCGTGAAGACATTAGTGGAAAGATCACTCCAACTCTCCTGAAGACCCTAGAAAGTCCTGACTGGAAGGTACGTATGGAGT CCGTTGATGCTGTAAACAAAATACTGGAAGAGGCTAATAAGCGCATTCAAGCTACTGGAACTGGTGAGTTATTTGGGGCT CTTAGGGGACGGCTCATTGACAGCAACAAAAACATAGTCATGGCTTCGTTGACAACCCTTGGTAATGTTGCATCTGCAAT GGGACCTGCTGTGGAGAAAGCGAGCAAGGGCACTCTGTCTGACATATTGAAATGTCTTAGTGACAATAAGAAGCACATGA GAGAATGTGTGCTGAATACTTTAGACTCTTGGCTAGCTGCTGTTCATCTTGATAAAATGGTTCCTTATGTTACAATTGCT TTGACGGATTCTAAACTTGGTGCGGAAGGGCGTAAAGATCTCTTTGATTGGTTATCTAGGCATCTTTCTGGGCTAAGTAG TTTTGCTGAAGCTGCGCAACTTCTGAAGCCAGCTTCTTCTGCGATGACAGATAAATCCTCCGATGTTCGCAAGGCAGCAG AGGCTTGCATTACTGAGATACTCAGAGTTAGTGGACATGAAATGATTGAAAAGATTGTCAAAGACATTCATGGACCAGCG CAAATACTAATTCTTGAGAAGTTGAAACCACATGGAGCTTTTCAAGAGTCATTTGAGCCAGGTAGAGCAGTTTCAGTGGG TGTAACATCGAAAGGTGTTTCAAAGGTTGGGAAATCAACTGCCAATGGTGTTGCAAAGCATGGAAATAGAGCTGTGTCTT CGCGGGTCGGGGCAACAAAGTTAACCAAGGCTGAATCAATATCTGTTCAAGATATAGCAGTCCAGTCTCAAGCCTTATTA AATATCAAGGATTCAAATAAGGAAGATAGAGAGAGAGTGGTGGTTCGAAGGTACAAGTTTGAGGATCCACGAATTGAGCA GATTCAAGATCTTGAGAATGATATGATGAAGTACTTCAGAGAGGATTTACATAGGAGACTCTTAAGTGCAGATTTTAAGA AGCAAGTTGATGGACTTGAAATGCTGCAGAAGGCACTTCCATCCATTGCTAAGGATGTTATAGAAGTTTTGGACATTCTT TTAAGGTGGTTTGTGTTGCAGTTCTGCAAATCAAATACAACATGTCTATTGAAGGTGCTTGAATTTCTTCCGGAACTGCT TGACACGTTGAAGGATGATGGGTACTCTTTGACAGAGTCTGAAGTGGCAATTTTTCTTCCATGCCTAGTAGAGAAGTTGG GGCATAACATCGAGAAAGTACGAGAAAAAATGCGAGAGCTGACCAAACAATTTGTTTCTGTATATTCTGCATCTAAATGT TTCCCTTACATATTGGAGGGTTTACGCTCTAAGAACAACCGAACTCGAATTGAATGCGCTGATCTTGTTGGTTTTATTGT TGATCATCATTCAGCTGAGATTAGCGGGCAGCTGAAGTCATTGCAAATTGTTGCAAGTTTGACAGCAGAACGGGATGGTG AAATTAGAAAAGCTGCATTAAATACACTGGCCACTGGTTATAAGATTCTAGGTGAGGACATATGGAGGTTTGTTGGGAAG CTAACTGATGCTCAAAAAAGCATGTTAGATGATAGATTTAAGTGGAAGATCCGGGAGATGGAAAAGAAGAAGGAAGGAAG ACCAGGCGAAGCAAGGGCCATTTTAAGGCGTTCTGTCAGGGAAAACGGGTCTGATGTCGCAGAGCAAAGCGGAGAAATAG CTAGATCTCTTGCTGGGCCAATATTGAGGAAAAATATTGGTCCATCTGATAATACCATTGAGAGACAATTGATGCCTCGT CCTGTAGCTGTTGCTAGTGGCCCCACAGATTGGAATGAAGCCCTTGATATTATATCTTTTGGTTCTCCTGAGCAGTCTGT TGAAGGAATGAAAGTTGTTTGTCATGAGTTGGCTCAGGCCACTAGTGAACCAGAAGGCAGTGCTATGGATGAGCTCGTGA AAGATGCAGATAGGCTAGTTTCATGTCTTGCAAATAAGGTTGCAAGAACTTTTGACTTCAGTTTGAGTGGGGCTTCATCA CGGTCTTGTAAATATGTGCTCAACACTCTGATGCAGACTTTTCAGAATAAAAGATTGGCACATGCTGTAAAGGAGAGCAC TCTTGATAGTCTGATTACTGAGCTTCTTCTGTGGCTCTTGGATGATAGGGTTCCTCATATGGATGATGGAAGCCAGTTGT TGAAAGCATTGAATGTATTGATGCTTAAGATCCTTGATAATGCAGATCGGACATCATCCTTTGTCGTCCTAATCAATCTT TTACGTCCTCTAGATCCATCAAGGTGGCCTTCCCCAGCATCAAATGAGTCATTTGCCTCCAGGAATCAGAAATTTTCTGA TTTGGTTGTCAAATGCCTTATCAAGCTTACAAAGGTTCTTCAGAGCACCATCTATGATGTTGATCTAGATCGCATTCTTC AAAGTATCCATTTGTATCTTCAAGACTTGGGAATGGAGGAAATTAGGAGAAGGGCTGGTGCTGATGACAAACCCTTGCGA ATGGTAAAAACTGTTCTGCATGAGCTTGTCAAGCTTCGTGGTGCAGCTATAAAAGGTCATCTTTCAATGGTTCCTATTGA TACGAAACCTCAGCCTATCATCCTTGCCTACATTGAACTTAATCTTGAGACTTTGGCTGCTGCAAGAATGTTGACTGCAT CTGGGCCTGGGGGACAAAACCACTGGAGCGATTCAGCAGCCAATAATTCAGCCTCTGGAACACATTCTGCTGATGCCCAA TTGAAGCAAGAGTTGGCTGCAATATTTAAGAAGATTGGGGAGAAGCAAACTTGCACAATTGGTTTATATGAACTATATCG GATTACCCAGTTGTATCCGAAGGTTGACATATTTTCTCAGCTTCAAAATGCTAGTGAGGCATTCCGCACTTACATAAGAG ATGGCCTTGCCCAGATGGAGAAAAATGCTGCAGCTGGCAGAACACCGTCAAGTTTGCCGATGCCTACTCCTCCACCAGCA TCTTTAAATAATTCTTCCCCAGATTTTGCACCTCTTTCTCCTATAAATGCAAATCCATTGGGGGATGCTAAATTAAATGT GAAAACTGATCTGACAAATTTCAATTTACCCCCGTCCTACAATGAGGAGAATAGGAGAGCATTAAATTCTGACTACACTT TAGGTGACCAACGAAATGATAAATATATGACCGGAGTAACGACTGGAACGTTGGATGCAATCAGAGAGAGGATGAAGAGC ATGCAATTAATGAATCATGGGCATCCTCATAGTCAGATTCCTCATGCATCCGAGCATGTTGCTATGGAGAATGCTTTGCA AGGTGGAGTCCTTCCCATGGATGAGAAAGCTTTATCCGGGCTTCAAGCGCGGATGGAAAGACTGAAAAGTGGATCCCTTG AACCTCTGTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0270300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTGRPKTVEKAQAVFMLWVELEAVDAFLDAMEKAIKHKVSKAVVPAIDVMFQALSEFGAKVVPPKRILKMLPELFEHQDQ NVRACSKGLTLELCRWIGKDSVKSILFEKMRDTMKKELETELVNVLGAGKPSRKIRSEQDKEPELEAVSETVGPGPSEES GTDAPQEIDEYELVDPVDILTPLEKSGFWDGVKATKWSERKEAVAELTKLASTKRISPGDFSEVCRTLKKLITDVNIAVA VEAIQAIGNLARGLRTHFSASCRFLLPVLLEKLKEKKPTLADALTQTLQAMHKAGCIGLIDVVEDVKIATKNKVPLVRSL TLTWVTFCIESSNKGIITKMHKDYVPILMESLNDGTPEVRDAAFSALAAIAKSVGMRPLEKSLEKLDDVRRKKLSEMISG SEDALPGGSSTALVQNTRASASSAETSESAFVKRSATSMLSGKRPVQAAPAVKKGGTAKSGTNKKADGNAQSKVSKSIEP PEDVEPTEMSLDEIESRIGSLINPDTINLLKSAVWKERLEAISSLKQQVEGLHDLDKSVEILIRLLCTLPGWGEKNVQVQ QQVIEVITHVASTATKFPKKCVVLCLSGLSERVADIKTRAHAMKCLTTFSEAVGPGFIFERLYKIMKEHKNPKVLSEGIL WMVSAVEDFGVSHLKLKDLIDFLKETGLQSSAAATRNASTKFLGVLHRFVGPDIKGFLADVKPALLSALDAEYEKNPFEG ASAIPKRTIKAAESSSSVAAGGLDGLPREDISGKITPTLLKTLESPDWKVRMESVDAVNKILEEANKRIQATGTGELFGA LRGRLIDSNKNIVMASLTTLGNVASAMGPAVEKASKGTLSDILKCLSDNKKHMRECVLNTLDSWLAAVHLDKMVPYVTIA LTDSKLGAEGRKDLFDWLSRHLSGLSSFAEAAQLLKPASSAMTDKSSDVRKAAEACITEILRVSGHEMIEKIVKDIHGPA QILILEKLKPHGAFQESFEPGRAVSVGVTSKGVSKVGKSTANGVAKHGNRAVSSRVGATKLTKAESISVQDIAVQSQALL NIKDSNKEDRERVVVRRYKFEDPRIEQIQDLENDMMKYFREDLHRRLLSADFKKQVDGLEMLQKALPSIAKDVIEVLDIL LRWFVLQFCKSNTTCLLKVLEFLPELLDTLKDDGYSLTESEVAIFLPCLVEKLGHNIEKVREKMRELTKQFVSVYSASKC FPYILEGLRSKNNRTRIECADLVGFIVDHHSAEISGQLKSLQIVASLTAERDGEIRKAALNTLATGYKILGEDIWRFVGK LTDAQKSMLDDRFKWKIREMEKKKEGRPGEARAILRRSVRENGSDVAEQSGEIARSLAGPILRKNIGPSDNTIERQLMPR PVAVASGPTDWNEALDIISFGSPEQSVEGMKVVCHELAQATSEPEGSAMDELVKDADRLVSCLANKVARTFDFSLSGASS RSCKYVLNTLMQTFQNKRLAHAVKESTLDSLITELLLWLLDDRVPHMDDGSQLLKALNVLMLKILDNADRTSSFVVLINL LRPLDPSRWPSPASNESFASRNQKFSDLVVKCLIKLTKVLQSTIYDVDLDRILQSIHLYLQDLGMEEIRRRAGADDKPLR MVKTVLHELVKLRGAAIKGHLSMVPIDTKPQPIILAYIELNLETLAAARMLTASGPGGQNHWSDSAANNSASGTHSADAQ LKQELAAIFKKIGEKQTCTIGLYELYRITQLYPKVDIFSQLQNASEAFRTYIRDGLAQMEKNAAAGRTPSSLPMPTPPPA SLNNSSPDFAPLSPINANPLGDAKLNVKTDLTNFNLPPSYNEENRRALNSDYTLGDQRNDKYMTGVTTGTLDAIRERMKS MQLMNHGHPHSQIPHASEHVAMENALQGGVLPMDEKALSGLQARMERLKSGSLEPL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Gene3D | 2 | 151 | 150 | 5.3E-28 | ||
PANTHER | 2 | 1890 | 1889 | 0.0 | – | |
PANTHER | 2 | 1890 | 1889 | 0.0 | – | |
SUPERFAMILY | 19 | 389 | 371 | 4.27E-23 | ||
MobiDBLite | 131 | 165 | 35 | - | – | |
MobiDBLite | 133 | 147 | 15 | - | – | |
Gene3D | 169 | 399 | 231 | 4.9E-62 | ||
SMART | 172 | 407 | 236 | 1.8E-63 | ||
Pfam | 195 | 373 | 179 | 1.0E-10 | ||
ProSiteProfiles | 344 | 382 | 39 | 11.894 | ||
MobiDBLite | 398 | 487 | 90 | - | – | |
MobiDBLite | 404 | 442 | 39 | - | – | |
MobiDBLite | 462 | 476 | 15 | - | – | |
SMART | 488 | 722 | 235 | 3.9E-54 | ||
Gene3D | 489 | 733 | 245 | 1.1E-50 | ||
SUPERFAMILY | 507 | 1581 | 1075 | 3.96E-55 | ||
Gene3D | 743 | 971 | 229 | 2.0E-56 | ||
SMART | 744 | 977 | 234 | 8.1E-39 | ||
ProSiteProfiles | 758 | 864 | 107 | 10.243 | ||
CDD | 762 | 864 | 103 | 6.40431E-4 | – | |
Gene3D | 1039 | 1296 | 258 | 4.4E-67 | ||
SMART | 1067 | 1303 | 237 | 1.7E-52 | ||
Coils | 1170 | 1190 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0270300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…