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LotjaGi5g1v0362300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0362300
Transcript ID LotjaGi5g1v0362300.1
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Callose synthase-like protein; TAIR: AT3G07160.2 glucan synthase-like 10; Swiss-Prot: sp|Q9SFU6|CALS9_ARATH Callose synthase 9; TrEMBL-Plants: tr|I1NJA0|I1NJA0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0362300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:67619858..67661713) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTGGCTTTGACGAAGAGGAGAGAGAGCACCCCCAACCCAAACGCTATTGCGTGTCTGTAACCGGTAGATCCGGTTCCCCA CCACGTCCCCTTTTTTCCTTCAGACCTCTTCACCTTTTTTGTTCAAAACCGAAAAGAAATTCCAATAACCGCTTATTCTA TACAGATTCTGCTTCTCTTCAACTGCGGAACCCTACCTCGAGGGTTTTTCAGGTTCTCCATTTTCCTTTGCTTTGCTCAT GCTTGCTTCGTTTTTTCCTTACTACGGAAATGGAAGCTCTTCGATCATCTTTCTGATTTTTAATTTAACTTTTTCGAAAA TGGAACTTCCTTTCAGTTTGAATCATGTGATCTTGCGCTGTTTTTCTCTTACGTTTCCTTCAGCATTTCATACTTTTATC GTTTTCTGAACTGGAACTCAATTTGCTTTGCAGTGGATTATCTACTCGCGCTACTGATTTGGTGCTATAATAGGCTTAGG TTGAACTGGATCTACTTCATTGCTTCATGTTTTTCTGAACCTGAGTGGTTGTTCTGGTTTGTACTTGTGCACTTCCTGCT AGAATGGCTTTTGGTTCTACACTTTTGTTTTTCTAAATTGTTAATTGTTAATTTCTCTGCTGTTAACTTTTTATTAATAG AATATGTCTCGAGCTGAGGAGCTTTGGGAGCGTTTGGTTCGTGCTGCATTGAGGAGGGAGAGGACCGGTGAAGATGCATT TGGGCGGCCTGTAGGTGGAATAGCTGGAAATGTACCCTCTGCGCTTGCTAAAAATAGGGATATCGATGAAATTTTAAGAG TTGCGGATGAAATTCAAGATGATGATCCTACTGTCTCTAGAATATGTATGTTCATGTTTTTGGTTTTTCATCTCTTGTAT CTGTGTCCATTTTTTAAGAAAACTCAGCTATTATATGGTCTAGAACCTTCACCGGTGCATCTATAGTTTAGAAGTGATTT 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AGTGAGGCCGTGTGTGAATTGTGATGATGTAGTGATGTGAGTGTAAAAAGTGAGTAAAAAGTGAGTGAGGCTTGAGACTT GTGGCATTAAAGATGAGATTGCCACTTGCCCTTGGCTGTATTCAAGAGTGAGTGAGGTTGCCACTTGCCCTTGGCTTTAT TCAAGAGTGAAAAAATGAGAGAGAGTGAGTCTGAAAATGTCTGATAGTGTGAGTGAGAGTGAGAAGAAAGAAAAGGGAAA ATGGAATGTGCATAAGTGTATTGATGAGTGGTTCAATGACTTGATGATATGTTACAGCGGGAGATATTCAAGTCACTTAA TAATGTTGATATTCTTCAAACATTTACCGCAAAGACGATTCGGAGAGGGCATCTGCCTCATGGTTTTCTAAAAACTTAGC ACACTATTGGTATGCTACATTTTTTCTTATCTTGTATTGTCCTCTTGGACTTGTCTTTTTCTTATCTTGTATTGTCTAAT GAAATGGAACTCAAATTAGCTATACTTTAGTTGGTAAAATGATGAGTTTTTTTATTTTGATTTATAGCTATTTATATATA TATTGTGGCGTGTGAA 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0362300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTCTCGAGCTGAGGAGCTTTGGGAGCGTTTGGTTCGTGCTGCATTGAGGAGGGAGAGGACCGGTGAAGATGCATTTGG GCGGCCTGTAGGTGGAATAGCTGGAAATGTACCCTCTGCGCTTGCTAAAAATAGGGATATCGATGAAATTTTAAGAGTTG CGGATGAAATTCAAGATGATGATCCTACTGTCTCTAGAATATTATGCGAACACGCGTATTCATTATCTCAAAATTTGGAC CCTAACAGTGAAGGCCGAGGTGTTTTGCAATTCAAGACTGGTTTGATGTCTGTCATTAAGCAAAAGCTGGCGAAAAGAGA AGTTGGAACCATAGATAGAAGTCAGGATATTGCTCGATTACAAGAGTTCTACAGGAGTTACAGAGAGAAACATAATGTGG ATAAATTACAGGAGGAAGAAATGAAGTTGAGGGAATCTGGTGCTTTCAGCCGGAATCTTGGCGAGTTGGAGCGCAAGACT GTGAAGAGAAGAAGGGTTTTTGCAACCTTAAAGGTTTTAGGAACAGTACTTGAGCAACTGAGTGAAGAAATTCCTGATGA GCTTAAGCGGGTTATGGAATCTGATTCTGCATCGACAGAAGATTTGATTGCCTACAACATCATTCCTCTAGATGCTCCTT CAACAAATGCTATTGTTTCTTTCCCTGAGGTGCAAGCAGCAGTTTCAGCTTTGAAGTATTTCATTGGCTTGCCAGAATTG CCCGGAGGCTATTTCATTTCTTCTACAAGGGATGCTAACATGCTCGACTTTCTGCAGTATACTTTTGGATTTCAGAAAGA TAATGTAGCTAATCAGCGTGAACACATAATTCACCTGCTTGCAAATGAGCAATCTCGGCTTGGAATTCCAGATGAAAATG AACCTAAATTGGATGAAGCTGCTGTGCAGAAAGTATTCCTCAAGTCACTTGAGAATTACATAAAATGGCGTGAATACTTA TGCGTTCAGCCTGTTTGGAGCAGTTTGGAGGCTGTTAGTAAAGAGAAGAAATTGCTGTATGTTTCTCTATACTACCTAAT ATGGGGTGAATCCTCAAATATCAGGTTTCTACCAGAATGCTTGTGCTACATATTTCATCACATGGCGAGAGAGATGGATG AGATCCTAAGGCAACAGGTTGCACAGACAGCTAATAGTTGCACATCAGAGAACGGTGTCTCATTTCTTGATCATGTTATT CTTCCGTTGTATGAAGTTGTTGCTGCAGAAGCTGCAAACAATGATAACGGGAAGGCACCTCATTCTTCCTGGAGAAATTA TGATGATTTTAACGAGTATTTCTGGTCACTTCATTGCTTTGACCTTAGTTGGCCATGGCGTAGAAGTTCTTCATTTTTTC AAAAGCCACAACCCAGATCAAAGAAAATGCTTATAACTGGTGGAAGTAAGCATCAGGGAAAAACATCTTTTGTGGAGCAT CGGACTTTTTTCCATCTCTATCATAGCTTCCACCGACTGTGGATATTTCTTATCATGATGTTCCAGGGTCTAGCAATTAT TGCTTTCAATGATGAAAATTTTAATGCCAAGACCTTGAGAGAGCTTCTTAGTCTTGGACCGACATTTGTTGTGATGAAAT TTTTGGAGAGTGTCTTGGACATTTTCATGATGTATGGTGCATATTCAACAACGAGGAGCTTAGCTGTCTCCCGAATTTTT CTACGATTTCTTTGGTTTAGCCTTACTTCAGTTTTCATAACTTTTCTTTACATAAAAGCACTCCAAGAAGAGAGTAAAAG AAATTCAAATTCAGTAGTTTTCAGATTATATGTGATTATCATAGGTATTTACGCGGGTGTCCAAGTTTTCATTAGTTTCC TCATGCGGATTCCTGCATGTCATCGTCTCACAAATCAATGTGATCATTGGCCTTTCATTCGTTTTGTGAAGTGGATGCGC CAGGAACGGCATTATGTTGGACGGGGCATGTATGAAAGGAGTTCTGATTTCATAAAGTATATGCTGTTTTGGCTTGTTGT TTTGAGTGGAAAATTTTCGTTTGCTTACTTTCTTCTGATCAAGCCACTGGTGGACCCCACGCGGGATATTGTAAAAGAGG ATAATATTATTTACTCTTGGCATGATTTGGTATCTAAAAATAATCATAATGCGTTGACTGTTGTTAGTGTTTGGGCTCCA GTGTTTGCTATTTATCTCCTAGATATTTATATCTTTTATACACTTGTTTCGGCGGTCTGCGGGTTTTTGCTTGGGGCAAG AGATCGTCTGGGAGAGATCAGGTCATTGGATGCACTGCACAAACTTTTTGAGGAGTTTCCTGGAGCGTTTATGGACACTC TTCATGTTCCTCTACCCAACAGGAGCTCCCACCAGTCATCTGTTCAGGTTGTGGAGAAGAACAAGGTTGATGCTGCTCGA TTCTCCCCGTTTTGGAATGAGATCATGAGAAATCTCAGGGAGGAAGACTATATAACTAACTTTGAGATGGAGTTGCTTTT AATGCCAAGAAACTCTGGGGATCTTCCCTTGGTTCAGTGGCCACTTTTTCTACTTGCAAGCAAGATATTTTTGGCTAGGG ATATTGCTGTTGAGAGTAAAGATACTCAAGATGAGCTTTGGGATAGGATTTCTCGAGATGACTATATGATGTATGCTGTT CAGGAGTGTTACTATGCTATTAAACTCATTTTGACTGAAGTATTAGATGACACTGGAAGGATGTGGGTTGAAAGGATATA TGATGATATTAATGATAGTATTACAAGAAGGAGTATTCCTGTGGACTTCCGACTTAATAAGTTGGCTCTTGTGGTATCAA GAGTAACTGCATTGATGGGGATTCTGAAAGAGACTGAAACACCTGAACTGGAAAGGGGTGCGGTGAGGGCTGTTCAAGAT CTCTACGATGTTGTACGGCTTGATGTTCTTTCATTAAATATGAGGGAAAATTATGACACATGGAATTTACTGTCCAAAGC GAGGGATGAGGGACATTTGTTTGAAAAGTTGAAATGGCCCAATACCGACTTAAGAGTGCAAGTCAAAAGATTGTACTCTC TGCTGACTATCAAAGACTCAGCTTCAAGCATTCCTAAAAATCTTGAGGCTAGGCGAAGGCTGGAATTTTTCACAAACTCA CTTTTTATGAAGATGCCTCGTGCAAAGCCAGTTCGAGAAATGTTATCCTTTAGTGTTTTCACCCCTTATTATTCTGAGGT TGTGCTTTACAGCATGGCTGAACTCCTAAAGAAAAATGAAGACGGCATTTCAATTTTGTTCTACCTGCAGAAGATATATC CAGATGAGTGGAAAAACTTTCTTGCCCGCATTGGCCGTGATGAAAATGCACTTGAAAATGAGCTTTATGATAGCCCTGCC GATATTCTTGAACTGCGTTTTTGGGCCTCTTATCGTGGGCAAACATTGTCCAGAACAGTCCGGGGCATGATGTATTATAG GAAAGCTCTTATGCTTCAAACCTATTTGGAGAGAATAACAGCTGGAGATTTGGAGGCTGCGACTAGTTTTGATGAAGTGA CTGATACACGTGGCTTTGATTTATCCCCGGAAGCACGTGCTCAGGCAGATCTTAAGTTTACTTATGTGGTGACATGTCAG ATTTATGGTAAACAGAAAGAGGAGCAAAAACCTGAGGCTGCTGATATTGCTTTATTAATGCAAAGAAATGAAGCTCTCCG TGTCGCTTATATTGATGTTGTTGAAACTTTAAGAGATGGAAGAGTGAACACAGAATACTACTCTAAGCTCGTGAAAGCTG ATATCAACGGGAAAGACAAGGAAATATACTCCCTGAAATTACCTGGAAATCCCAAAATTGGTGAAGGGAAGCCTGAGAAC CAAAACCATGCAATTATATTTACCCGTGGAAATGCAGTCCAGACAATTGATATGAATCAGGATAACTATTTTGAGGAGGC TTTGAAGATGAGAAATGTTCTTGAAGAATTTCATTCTGATCATGGGCTCCGTCCTCCTACCATACTTGGTATTAGAGAAC ATGTATTTACTGGAAGTGTCTCGTCTCTGGCCTCCTTCATGTCCAATCAAGAAACTAGTTTTGTGACTTTAGGCCAGCGT GTTTTAGCAAATCCATTGAAGGTCCGCATGCATTATGGTCATCCTGATGTTTTTGATAGAGTGTTCCACATCACCCGTGG TGGTATCAGCAAGGCTTCCCGTGTTATCAATATCAGTGAAGATATCTACGCAGGATTCAATTCGACCTTACGTCAAGGAA ATATTACTCATCATGAATATATTCAGGTTGGTAAGGGAAGAGATGTTGGACTCAATCAGATTGCTCTATTTGAAGGGAAG GTTTCAGGTGGTAATGGGGAACAAGTTCTGAGCCGTGATGTATACAGACTTGGGCAACTTTTTGACTTCTTCCGCATGAT GTCTTTTTACTTTACAACAGTTGGATATTATTTTTGTACCATGTTAACTGTGCTGACGGTTTATGCCTTCCTTTATGGAA AAATGTATTTGGCACTATCTGGTGTTGGTGAAACCATCGGGGAAAGGGCTAAGATTACCAAGAACACGGCCTTGAGCGCT GCTTTGAACACACAGTTTCTGTTTCAAATTGGTATCTTCACTGCTGTGCCAATGATCTTGGGTTTCATTCTCGAACAAGG TTTCTTGAGGGCCATTGTCAGTTTTGTCACAATGCAGTTCCAGCTCTGCTCAGTTTTTTTCACATTTTCGCTGGGTACTA GAACCCATTATTTTGGTCGGACCATTCTTCATGGTGGTGCAAGGTATCAAGCAACTGGCCGTGGATTTGTTGTCCGCCAT ATTAAATTTTCTGAGAATTACAGACTCTACTCTCGTAGTCATTTTGTTAAAGGGTTGGAAGTTGTGCTTTTGTTGATAGT CTATCTTGCTTATGGCTATAATGAAGGTGGTGCACTATCATACATTCTTCTGAGTATAAGCAGTTGGTTTATGGCTCTAT CCTGGTTGTTTGCTCCATATTTATTCAACCCTTCCGGATTTGAGTGGCAAAAGGTAGTGGAAGACTTCCGAGATTGGACA AATTGGTTACTTTACAGAGGTGGTATTGGGGTTAAAGGAGAAGAAAGCTGGGAAGCTTGGTGGGAAGAAGAACTGGCCCA TATCAGGAGCTTCGGTTCAAGGATAGCAGAGACCATACTGAGTCTAAGATTTTTCATCTTTCAGTATGGTATTGTGTATA AACTGGATGTTAAAGGAACTGATACTTCATTGACGGTTTATGCATTCTCGTGGATTGTGCTGGCTGGGCTTATAATTCTT TTCAAGGTTTTCACATTTAGCCAGAAGATATCAGTCAATTTCCAGCTTCTGTTGCGTTTTGTACAAGGCCTCTCCCTTTT GTTGGCATTGGCTGGCTTAGTTGTTGCAGTTATATTGACCGATCTATCTGTGGCTGACATATTTGCTGCTATGTTAGCTT TCATTCCTACTGGATGGGGAATTTTGTCTATTGCTGCTGCTTGGAAGCCTGTGATGAAGAGGCTGGGACTATGGAAATCC ATTCGATCAATTGCTCGCCTGTATGATGCTGGCATGGGAATGCTCATATTTGTACCCATCGCATTCTTTTCTTGGTTTCC ATTTGTATCAACATTCCAAACTCGCCTCATGTTTAACCAGGCTTTCAGCCGAGGGTTGGAAATTTCTCTGATCCTTGCTG GGAACAATCCCAACACTGGGATATAG 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0362300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSRAEELWERLVRAALRRERTGEDAFGRPVGGIAGNVPSALAKNRDIDEILRVADEIQDDDPTVSRILCEHAYSLSQNLD PNSEGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKREVGTIDRSQDIARLQEFYRSYREKHNVDKLQEEEMKLRESGAFSRNLGELERKT VKRRRVFATLKVLGTVLEQLSEEIPDELKRVMESDSASTEDLIAYNIIPLDAPSTNAIVSFPEVQAAVSALKYFIGLPEL PGGYFISSTRDANMLDFLQYTFGFQKDNVANQREHIIHLLANEQSRLGIPDENEPKLDEAAVQKVFLKSLENYIKWREYL CVQPVWSSLEAVSKEKKLLYVSLYYLIWGESSNIRFLPECLCYIFHHMAREMDEILRQQVAQTANSCTSENGVSFLDHVI LPLYEVVAAEAANNDNGKAPHSSWRNYDDFNEYFWSLHCFDLSWPWRRSSSFFQKPQPRSKKMLITGGSKHQGKTSFVEH RTFFHLYHSFHRLWIFLIMMFQGLAIIAFNDENFNAKTLRELLSLGPTFVVMKFLESVLDIFMMYGAYSTTRSLAVSRIF LRFLWFSLTSVFITFLYIKALQEESKRNSNSVVFRLYVIIIGIYAGVQVFISFLMRIPACHRLTNQCDHWPFIRFVKWMR QERHYVGRGMYERSSDFIKYMLFWLVVLSGKFSFAYFLLIKPLVDPTRDIVKEDNIIYSWHDLVSKNNHNALTVVSVWAP VFAIYLLDIYIFYTLVSAVCGFLLGARDRLGEIRSLDALHKLFEEFPGAFMDTLHVPLPNRSSHQSSVQVVEKNKVDAAR FSPFWNEIMRNLREEDYITNFEMELLLMPRNSGDLPLVQWPLFLLASKIFLARDIAVESKDTQDELWDRISRDDYMMYAV QECYYAIKLILTEVLDDTGRMWVERIYDDINDSITRRSIPVDFRLNKLALVVSRVTALMGILKETETPELERGAVRAVQD LYDVVRLDVLSLNMRENYDTWNLLSKARDEGHLFEKLKWPNTDLRVQVKRLYSLLTIKDSASSIPKNLEARRRLEFFTNS LFMKMPRAKPVREMLSFSVFTPYYSEVVLYSMAELLKKNEDGISILFYLQKIYPDEWKNFLARIGRDENALENELYDSPA DILELRFWASYRGQTLSRTVRGMMYYRKALMLQTYLERITAGDLEAATSFDEVTDTRGFDLSPEARAQADLKFTYVVTCQ IYGKQKEEQKPEAADIALLMQRNEALRVAYIDVVETLRDGRVNTEYYSKLVKADINGKDKEIYSLKLPGNPKIGEGKPEN QNHAIIFTRGNAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNVLEEFHSDHGLRPPTILGIREHVFTGSVSSLASFMSNQETSFVTLGQR VLANPLKVRMHYGHPDVFDRVFHITRGGISKASRVINISEDIYAGFNSTLRQGNITHHEYIQVGKGRDVGLNQIALFEGK VSGGNGEQVLSRDVYRLGQLFDFFRMMSFYFTTVGYYFCTMLTVLTVYAFLYGKMYLALSGVGETIGERAKITKNTALSA ALNTQFLFQIGIFTAVPMILGFILEQGFLRAIVSFVTMQFQLCSVFFTFSLGTRTHYFGRTILHGGARYQATGRGFVVRH IKFSENYRLYSRSHFVKGLEVVLLLIVYLAYGYNEGGALSYILLSISSWFMALSWLFAPYLFNPSGFEWQKVVEDFRDWT NWLLYRGGIGVKGEESWEAWWEEELAHIRSFGSRIAETILSLRFFIFQYGIVYKLDVKGTDTSLTVYAFSWIVLAGLIIL FKVFTFSQKISVNFQLLLRFVQGLSLLLALAGLVVAVILTDLSVADIFAAMLAFIPTGWGILSIAAAWKPVMKRLGLWKS IRSIARLYDAGMGMLIFVPIAFFSWFPFVSTFQTRLMFNQAFSRGLEISLILAGNNPNTGI 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 489 489 -
PANTHER 46 1894 1849 0.0
SMART 335 447 113 1.7E-63
Pfam 337 444 108 8.9E-36
Phobius 490 509 20 -
TMHMM 490 509 20 -
Phobius 510 528 19 -
TMHMM 522 544 23 -
Phobius 529 548 20 -
Phobius 549 559 11 -
TMHMM 559 581 23 -
Phobius 560 580 21 -
Phobius 581 591 11 -
Phobius 592 615 24 -
TMHMM 593 615 23 -
Phobius 616 656 41 -
Phobius 657 679 23 -
TMHMM 661 680 20 -
Phobius 680 721 42 -
TMHMM 714 736 23 -
Phobius 722 746 25 -
Phobius 747 1468 722 -
Pfam 1024 1714 691 1.5E-234
TMHMM 1469 1491 23 -
Phobius 1469 1491 23 -
Phobius 1492 1525 34 -
TMHMM 1519 1541 23 -
Phobius 1526 1544 19 -
Phobius 1545 1614 70 -
TMHMM 1551 1573 23 -
TMHMM 1609 1631 23 -
Phobius 1615 1633 19 -
Phobius 1634 1638 5 -
Phobius 1639 1662 24 -
TMHMM 1641 1663 23 -
Phobius 1663 1714 52 -
TMHMM 1710 1732 23 -
Phobius 1715 1732 18 -
Phobius 1733 1743 11 -
TMHMM 1742 1764 23 -
Phobius 1744 1764 21 -
Phobius 1765 1775 11 -
Phobius 1776 1799 24 -
TMHMM 1777 1799 23 -
Phobius 1800 1804 5 -
TMHMM 1804 1826 23 -
Phobius 1805 1826 22 -
Phobius 1827 1846 20 -
Phobius 1847 1868 22 -
TMHMM 1847 1869 23 -
Phobius 1869 1901 33 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component 1,3-beta-D-glucan synthase complex A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain.
Molecular function 1,3-beta-D-glucan synthase activity Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1).
Biological process (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds.
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.

Expression data

Expression pattern

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