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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0362300 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0362300.3 |
Related isoforms 3 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Callose synthase-like protein; TAIR: AT3G07160.2 glucan synthase-like 10; Swiss-Prot: sp|Q9SFU6|CALS9_ARATH Callose synthase 9; TrEMBL-Plants: tr|I1NJA0|I1NJA0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0362300 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:67620214..67658195) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCTGTTTTTCTCTTACGTTTCCTTCAGCATTTCATACTTTTATCGTTTTCTGAACTGGAACTCAATTTGCTTTGCAGTGG ATTATCTACTCGCGCTACTGATTTGGTGCTATAATAGGCTTAGGTTGAACTGGATCTACTTCATTGCTTCATGTTTTTCT GAACCTGAGTGGTTGTTCTGGTTTGTACTTGTGCACTTCCTGCTAGAATGGCTTTTGGTTCTACACTTTTGTTTTTCTAA ATTGTTAATTGTTAATTTCTCTGCTGTTAACTTTTTATTAATAGAATATGTCTCGAGCTGAGGAGCTTTGGGAGCGTTTG GTTCGTGCTGCATTGAGGAGGGAGAGGACCGGTGAAGATGCATTTGGGCGGCCTGTAGGTGGAATAGCTGGAAATGTACC CTCTGCGCTTGCTAAAAATAGGGATATCGATGAAATTTTAAGAGTTGCGGATGAAATTCAAGATGATGATCCTACTGTCT CTAGAATATGTATGTTCATGTTTTTGGTTTTTCATCTCTTGTATCTGTGTCCATTTTTTAAGAAAACTCAGCTATTATAT GGTCTAGAACCTTCACCGGTGCATCTATAGTTTAGAAGTGATTTGAAGTTTTGTTTATTATCTCCCAGCTTTCTTCTATG CCTATGGTGAACGATAGGTAAATGTGAAACAGTAAAAAATGTAGAAGTGCTTTTTATGATAATATTTTTTGTTTGAGAAT GGCAATATATCCTTTTATTTGACTTTGAAATCCTCTTGATACCTATTCTATTTTTTCTTTTTTGCAGTATGCGAACACGC GTATTCATTATCTCAAAATTTGGACCCTAACAGTGAAGGCCGAGGTGTTTTGCAATTCAAGACTGGTTTGATGTCTGTCA TTAAGGTATATATTGATAGTCTAGTTTTTATGTAAAATAAGAAGTTCTAATATAGTGTTATGTTTTTAATTTTCTGTGAC 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AGTTCTAAATATTCATAAATTATTCTTTCTGCAGGCCCATATCAGGAGCTTCGGTTCAAGGATAGCAGAGACCATACTGA GTCTAAGATTTTTCATCTTTCAGTATGGTATTGTGTATAAACTGGATGTTAAAGGAACTGATACTTCATTGACGGTATTA TATGCTGAATGTTTCTTTCTTGATTTCCTTTCTTGTATCCAACTGTTTCCATTAAAAACTGAATTTAGTTTGCATAATTT TACAACTCAGTTAGTAGATTCACTGCTTTTTGTTTTTTGGATGTCAACAGAAATTTATTTACTTTTGGTCTTTAATTTTT AATACTTGTTAGTTTTATAAGTTACATTCACACACGACAAAACCTTAAAGCCACTTAAGGTAATAGGTGTGTCATTTAAC TTCTTTGAGTCAAACTAGTGTTACTCTAATAATGCTCAATGATAGAATTTGTTTACGAGGTATGTGAATATATATGAATT TGCATCTTTGATGAGTATTTGATTTACATATTTACTCTGTGTTATTTAAGCATAGGTGTGGGGGCTCCATGTCCATACCT AACTTTATTAAATTTTTTGGACTAGATACGACTGCCTGCCATGTTTGTGCAGTTGCTTTATATATATATATATATATATA TATATATACTTATTGTAGTAGTTAGTGTAGTCTAGTTAGTATACATGACTAATAGACTAGGCAAAAAAAGATCATGAGGC CCTATATAATTCACGATCTACTCTGGTTGTGTTCTCTGTTTCCTGGTCCTGCACATGAACATCTTCATATGTAAAGGCCA TATAACAGTTATGGGATCATGGTAGGAGGCTAACTATCAGGCATATGGTATTCAGGTTAAGTGATAATAGTGAGCAGGTT TTTCCATGAGCGCTGCCAAAAACGGCAACCCTAGGACATATGGTGAGAGTATCTACAAATAAATGAACTAGTTTAAGTCA GACAAGGGCAGTTTTCATAAGCAACTCATATCTGTGCTGAATGCCAACTTTGCATTGGGGACATGTATTTTGGACTCGGC GTGTCTAACTCTAAACTACAAGCTTCAGCTTGAGATTACATATCGACTTGAAATATCACTTAGTTGGCTATATGTTTAAA CCATCCATACTTAGGTCGGAGTGGCTTGATTTGTTTCATTTTGACCAGTATGATTATGCAGATATTTTACATATTTACAT GTACAGAATACGAACTGGTTAGTCAACTAACTGCTTATGTTTGGAATTTCTTTTAGGTTTATGCATTCTCGTGGATTGTG CTGGCTGGGCTTATAATTCTTTTCAAGGTGGAAAAATGTGCATCATGTGTGGTCTTAGATTACATGTGTGTTGATTATTT CATATCTTGACTCTATCGTGTATTCTTGCTCAATAGGTTTTCACATTTAGCCAGAAGATATCAGTCAATTTCCAGCTTCT GTTGCGTTTTGTACAAGGCCTCTCCCTTTTGTTGGCATTGGCTGGCTTAGTTGTTGCAGTTATATTGACCGATCTATCTG TGGCTGACATATTTGCTGCTATGTTAGCTTTCATTCCTACTGGATGGGGAATTTTGTCTGTGAGTTCTTCTTTCCTTTGA TTGTACAGCTGTTTGTAGTTTAGTTTTATTTGTCCAAGTTTTGTTGCTTTTATCCGCATGGTGGCCTAGTTGGCAAACAG AGTTTAAGTTTGCTGTGTTTCTTCTTTTTATTTTCAGTTTATGTCTCTGTGTAATTATGAAAGTGCCACTTTTTAGCTGA ATCTCAGGGATTTATGTAAGTAAACCCATTGGTTGAAAAACCAAATTGGACCACGTGATTCGATTGGAATAGTGATTAAC TGGTCAAGTATCTTGTCCACTCAACCAAAAAATCAACTGATCTCATTATTAGTAAGATCTGTTCAAGCCAGTCAAAAACT GGTGATGAAGAATAAGTTTGAACTAGTCATTTTCTCACATTTACTCCTTTTTTTAGGAAAAACCAGGATATCTTGTCTCC TTTACATCATAATCTTTTCGTTAATGAAAATATTATTTCCATATGGATGTCAAATCTCATCCATTTAGACAATTTCTTTG TTTGACATCTAGAATCTGACACACTTGCAAACACTCTTAGGAGTTAGGATCAAAGTCCGAACACTATCCAATTTGCTGAA CATGAGTTTGACTATGCGTACAATGGTCTTGATATTTTATTTGTATAATGATTGCCCTTGTATAGATTGCTGCTGCTTGG AAGCCTGTGATGAAGAGGCTGGGACTATGGAAATCCATTCGATCAATTGCTCGCCTGTATGATGCTGGCATGGGAATGCT CATATTTGTACCCATCGCATTCTTTTCTTGGTTTCCATTTGTATCAACATTCCAAACTCGCCTCATGTTTAACCAGGCTT TCAGCCGAGGGTTGGAAATTTCTCTGATCCTTGCTGGGAACAATCCCAACACTGGGATATAG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0362300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTCGAGCTGAGGAGCTTTGGGAGCGTTTGGTTCGTGCTGCATTGAGGAGGGAGAGGACCGGTGAAGATGCATTTGG GCGGCCTGTAGGTGGAATAGCTGGAAATGTACCCTCTGCGCTTGCTAAAAATAGGGATATCGATGAAATTTTAAGAGTTG CGGATGAAATTCAAGATGATGATCCTACTGTCTCTAGAATATTATGCGAACACGCGTATTCATTATCTCAAAATTTGGAC CCTAACAGTGAAGGCCGAGGTGTTTTGCAATTCAAGACTGGTTTGATGTCTGTCATTAAGCAAAAGCTGGCGAAAAGAGA AGTTGGAACCATAGATAGAAGTCAGGATATTGCTCGATTACAAGAGTTCTACAGGAGTTACAGAGAGAAACATAATGTGG ATAAATTACAGGAGGAAGAAATGAAGTTGAGGGAATCTGGTGCTTTCAGCCGGAATCTTGGCGAGTTGGAGCGCAAGACT GTGAAGAGAAGAAGGGTTTTTGCAACCTTAAAGGTTTTAGGAACAGTACTTGAGCAACTGAGTGAAGAAATTCCTGATGA GCTTAAGCGGGTTATGGAATCTGATTCTGCATCGACAGAAGATTTGATTGCCTACAACATCATTCCTCTAGATGCTCCTT CAACAAATGCTATTGTTTCTTTCCCTGAGGTGCAAGCAGCAGTTTCAGCTTTGAAGTATTTCATTGGCTTGCCAGAATTG CCCGGAGGCTATTTCATTTCTTCTACAAGGGATGCTAACATGCTCGACTTTCTGCAGTATACTTTTGGATTTCAGAAAGA TAATGTAGCTAATCAGCGTGAACACATAATTCACCTGCTTGCAAATGAGCAATCTCGGCTTGGAATTCCAGATGAAAATG AACCTAAATTGGATGAAGCTGCTGTGCAGAAAGTATTCCTCAAGTCACTTGAGAATTACATAAAATGGCGTGAATACTTA TGCGTTCAGCCTGTTTGGAGCAGTTTGGAGGCTGTTAGTAAAGAGAAGAAATTGCTGTATGTTTCTCTATACTACCTAAT ATGGGGTGAATCCTCAAATATCAGGTTTCTACCAGAATGCTTGTGCTACATATTTCATCACATGGCGAGAGAGATGGATG AGATCCTAAGGCAACAGGTTGCACAGACAGCTAATAGTTGCACATCAGAGAACGGTGTCTCATTTCTTGATCATGTTATT CTTCCGTTGTATGAAGTTGTTGCTGCAGAAGCTGCAAACAATGATAACGGGAAGGCACCTCATTCTTCCTGGAGAAATTA TGATGATTTTAACGAGTCACTTCATTGCTTTGACCTTAGTTGGCCATGGCGTAGAAGTTCTTCATTTTTTCAAAAGCCAC AACCCAGATCAAAGAAAATGCTTATAACTGGTGGAAGTAAGCATCAGGGAAAAACATCTTTTGTGGAGCATCGGACTTTT TTCCATCTCTATCATAGCTTCCACCGACTGTGGATATTTCTTATCATGATGTTCCAGGGTCTAGCAATTATTGCTTTCAA TGATGAAAATTTTAATGCCAAGACCTTGAGAGAGCTTCTTAGTCTTGGACCGACATTTGTTGTGATGAAATTTTTGGAGA GTGTCTTGGACATTTTCATGATGTATGGTGCATATTCAACAACGAGGAGCTTAGCTGTCTCCCGAATTTTTCTACGATTT CTTTGGTTTAGCCTTACTTCAGTTTTCATAACTTTTCTTTACATAAAAGCACTCCAAGAAGAGAGTAAAAGAAATTCAAA TTCAGTAGTTTTCAGATTATATGTGATTATCATAGGTATTTACGCGGGTGTCCAAGTTTTCATTAGTTTCCTCATGCGGA TTCCTGCATGTCATCGTCTCACAAATCAATGTGATCATTGGCCTTTCATTCGTTTTGTGAAGTGGATGCGCCAGGAACGG CATTATGTTGGACGGGGCATGTATGAAAGGAGTTCTGATTTCATAAAGTATATGCTGTTTTGGCTTGTTGTTTTGAGTGG AAAATTTTCGTTTGCTTACTTTCTTCTGATCAAGCCACTGGTGGACCCCACGCGGGATATTGTAAAAGAGGATAATATTA TTTACTCTTGGCATGATTTGGTATCTAAAAATAATCATAATGCGTTGACTGTTGTTAGTGTTTGGGCTCCAGTGTTTGCT CTAGATATTTATATCTTTTATACACTTGTTTCGGCGGTCTGCGGGTTTTTGCTTGGGGCAAGAGATCGTCTGGGAGAGAT CAGGTCATTGGATGCACTGCACAAACTTTTTGAGGAGTTTCCTGGAGCGTTTATGGACACTCTTCATGTTCCTCTACCCA ACAGGAGCTCCCACCAGTCATCTGTTCAGGTTGTGGAGAAGAACAAGGTTGATGCTGCTCGATTCTCCCCGTTTTGGAAT GAGATCATGAGAAATCTCAGGGAGGAAGACTATATAACTAACTTTGAGATGGAGTTGCTTTTAATGCCAAGAAACTCTGG GGATCTTCCCTTGGTTCAGTGGCCACTTTTTCTACTTGCAAGCAAGATATTTTTGGCTAGGGATATTGCTGTTGAGAGTA AAGATACTCAAGATGAGCTTTGGGATAGGATTTCTCGAGATGACTATATGATGTATGCTGTTCAGGAGTGTTACTATGCT ATTAAACTCATTTTGACTGAAGTATTAGATGACACTGGAAGGATGTGGGTTGAAAGGATATATGATGATATTAATGATAG TATTACAAGAAGGAGTATTCCTGTGGACTTCCGACTTAATAAGTTGGCTCTTGTGGTATCAAGAGTAACTGCATTGATGG GGATTCTGAAAGAGACTGAAACACCTGAACTGGAAAGGGGTGCGGTGAGGGCTGTTCAAGATCTCTACGATGTTGTACGG CTTGATGTTCTTTCATTAAATATGAGGGAAAATTATGACACATGGAATTTACTGTCCAAAGCGAGGGATGAGGGACATTT GTTTGAAAAGTTGAAATGGCCCAATACCGACTTAAGAGTGCAAGTCAAAAGATTGTACTCTCTGCTGACTATCAAAGACT CAGCTTCAAGCATTCCTAAAAATCTTGAGGCTAGGCGAAGGCTGGAATTTTTCACAAACTCACTTTTTATGAAGATGCCT CGTGCAAAGCCAGTTCGAGAAATGTTATCCTTTAGTGTTTTCACCCCTTATTATTCTGAGGTTGTGCTTTACAGCATGGC TGAACTCCTAAAGAAAAATGAAGACGGCATTTCAATTTTGTTCTACCTGCAGAAGATATATCCAGATGAGTGGAAAAACT TTCTTGCCCGCATTGGCCGTGATGAAAATGCACTTGAAAATGAGCTTTATGATAGCCCTGCCGATATTCTTGAACTGCGT TTTTGGGCCTCTTATCGTGGGCAAACATTGTCCAGAACAGTCCGGGGCATGATGTATTATAGGAAAGCTCTTATGCTTCA AACCTATTTGGAGAGAATAACAGCTGGAGATTTGGAGGCTGCGACTAGTTTTGATGAAGTGACTGATACACGTGGCTTTG ATTTATCCCCGGAAGCACGTGCTCAGGCAGATCTTAAGTTTACTTATGTGGTGACATGTCAGATTTATGGTAAACAGAAA GAGGAGCAAAAACCTGAGGCTGCTGATATTGCTTTATTAATGCAAAGAAATGAAGCTCTCCGTGTCGCTTATATTGATGT TGTTGAAACTTTAAGAGATGGAAGAGTGAACACAGAATACTACTCTAAGCTCGTGAAAGCTGATATCAACGGGAAAGACA AGGAAATATACTCCCTGAAATTACCTGGAAATCCCAAAATTGGTGAAGGGAAGCCTGAGAACCAAAACCATGCAATTATA TTTACCCGTGGAAATGCAGTCCAGACAATTGATATGAATCAGGATAACTATTTTGAGGAGGCTTTGAAGATGAGAAATGT TCTTGAAGAATTTCATTCTGATCATGGGCTCCGTCCTCCTACCATACTTGGTATTAGAGAACATGTATTTACTGGAAGTG TCTCGTCTCTGGCCTCCTTCATGTCCAATCAAGAAACTAGTTTTGTGACTTTAGGCCAGCGTGTTTTAGCAAATCCATTG AAGGTCCGCATGCATTATGGTCATCCTGATGTTTTTGATAGAGTGTTCCACATCACCCGTGGTGGTATCAGCAAGGCTTC CCGTGTTATCAATATCAGTGAAGATATCTACGCAGGATTCAATTCGACCTTACGTCAAGGAAATATTACTCATCATGAAT ATATTCAGGTTGGTAAGGGAAGAGATGTTGGACTCAATCAGATTGCTCTATTTGAAGGGAAGGTTTCAGGTGGTAATGGG GAACAAGTTCTGAGCCGTGATGTATACAGACTTGGGCAACTTTTTGACTTCTTCCGCATGATGTCTTTTTACTTTACAAC AGTTGGATATTATTTTTGTACCATGTTAACTGTGCTGACGGTTTATGCCTTCCTTTATGGAAAAATGTATTTGGCACTAT CTGGTGTTGGTGAAACCATCGGGGAAAGGGCTAAGATTACCAAGAACACGGCCTTGAGCGCTGCTTTGAACACACAGTTT CTGTTTCAAATTGGTATCTTCACTGCTGTGCCAATGATCTTGGGTTTCATTCTCGAACAAGGTTTCTTGAGGGCCATTGT CAGTTTTGTCACAATGCAGTTCCAGCTCTGCTCAGTTTTTTTCACATTTTCGCTGGGTACTAGAACCCATTATTTTGGTC GGACCATTCTTCATGGTGGTGCAAGGTATCAAGCAACTGGCCGTGGATTTGTTGTCCGCCATATTAAATTTTCTGAGAAT TACAGACTCTACTCTCGTAGTCATTTTGTTAAAGGGTTGGAAGTTGTGCTTTTGTTGATAGTCTATCTTGCTTATGGCTA TAATGAAGGTGGTGCACTATCATACATTCTTCTGAGTATAAGCAGTTGGTTTATGGCTCTATCCTGGTTGTTTGCTCCAT ATTTATTCAACCCTTCCGGATTTGAGTGGCAAAAGGTAGTGGAAGACTTCCGAGATTGGACAAATTGGTTACTTTACAGA GGTGGTATTGGGGTTAAAGGAGAAGAAAGCTGGGAAGCTTGGTGGGAAGAAGAACTGGCCCATATCAGGAGCTTCGGTTC AAGGATAGCAGAGACCATACTGAGTCTAAGATTTTTCATCTTTCAGTATGGTATTGTGTATAAACTGGATGTTAAAGGAA CTGATACTTCATTGACGGTTTATGCATTCTCGTGGATTGTGCTGGCTGGGCTTATAATTCTTTTCAAGGTTTTCACATTT AGCCAGAAGATATCAGTCAATTTCCAGCTTCTGTTGCGTTTTGTACAAGGCCTCTCCCTTTTGTTGGCATTGGCTGGCTT AGTTGTTGCAGTTATATTGACCGATCTATCTGTGGCTGACATATTTGCTGCTATGTTAGCTTTCATTCCTACTGGATGGG GAATTTTGTCTATTGCTGCTGCTTGGAAGCCTGTGATGAAGAGGCTGGGACTATGGAAATCCATTCGATCAATTGCTCGC CTGTATGATGCTGGCATGGGAATGCTCATATTTGTACCCATCGCATTCTTTTCTTGGTTTCCATTTGTATCAACATTCCA AACTCGCCTCATGTTTAACCAGGCTTTCAGCCGAGGGTTGGAAATTTCTCTGATCCTTGCTGGGAACAATCCCAACACTG GGATATAG
Protein sequence (LotjaGi5g1v0362300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSRAEELWERLVRAALRRERTGEDAFGRPVGGIAGNVPSALAKNRDIDEILRVADEIQDDDPTVSRILCEHAYSLSQNLD PNSEGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKREVGTIDRSQDIARLQEFYRSYREKHNVDKLQEEEMKLRESGAFSRNLGELERKT VKRRRVFATLKVLGTVLEQLSEEIPDELKRVMESDSASTEDLIAYNIIPLDAPSTNAIVSFPEVQAAVSALKYFIGLPEL PGGYFISSTRDANMLDFLQYTFGFQKDNVANQREHIIHLLANEQSRLGIPDENEPKLDEAAVQKVFLKSLENYIKWREYL CVQPVWSSLEAVSKEKKLLYVSLYYLIWGESSNIRFLPECLCYIFHHMAREMDEILRQQVAQTANSCTSENGVSFLDHVI LPLYEVVAAEAANNDNGKAPHSSWRNYDDFNESLHCFDLSWPWRRSSSFFQKPQPRSKKMLITGGSKHQGKTSFVEHRTF FHLYHSFHRLWIFLIMMFQGLAIIAFNDENFNAKTLRELLSLGPTFVVMKFLESVLDIFMMYGAYSTTRSLAVSRIFLRF LWFSLTSVFITFLYIKALQEESKRNSNSVVFRLYVIIIGIYAGVQVFISFLMRIPACHRLTNQCDHWPFIRFVKWMRQER HYVGRGMYERSSDFIKYMLFWLVVLSGKFSFAYFLLIKPLVDPTRDIVKEDNIIYSWHDLVSKNNHNALTVVSVWAPVFA LDIYIFYTLVSAVCGFLLGARDRLGEIRSLDALHKLFEEFPGAFMDTLHVPLPNRSSHQSSVQVVEKNKVDAARFSPFWN EIMRNLREEDYITNFEMELLLMPRNSGDLPLVQWPLFLLASKIFLARDIAVESKDTQDELWDRISRDDYMMYAVQECYYA IKLILTEVLDDTGRMWVERIYDDINDSITRRSIPVDFRLNKLALVVSRVTALMGILKETETPELERGAVRAVQDLYDVVR LDVLSLNMRENYDTWNLLSKARDEGHLFEKLKWPNTDLRVQVKRLYSLLTIKDSASSIPKNLEARRRLEFFTNSLFMKMP RAKPVREMLSFSVFTPYYSEVVLYSMAELLKKNEDGISILFYLQKIYPDEWKNFLARIGRDENALENELYDSPADILELR FWASYRGQTLSRTVRGMMYYRKALMLQTYLERITAGDLEAATSFDEVTDTRGFDLSPEARAQADLKFTYVVTCQIYGKQK EEQKPEAADIALLMQRNEALRVAYIDVVETLRDGRVNTEYYSKLVKADINGKDKEIYSLKLPGNPKIGEGKPENQNHAII FTRGNAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNVLEEFHSDHGLRPPTILGIREHVFTGSVSSLASFMSNQETSFVTLGQRVLANPL KVRMHYGHPDVFDRVFHITRGGISKASRVINISEDIYAGFNSTLRQGNITHHEYIQVGKGRDVGLNQIALFEGKVSGGNG EQVLSRDVYRLGQLFDFFRMMSFYFTTVGYYFCTMLTVLTVYAFLYGKMYLALSGVGETIGERAKITKNTALSAALNTQF LFQIGIFTAVPMILGFILEQGFLRAIVSFVTMQFQLCSVFFTFSLGTRTHYFGRTILHGGARYQATGRGFVVRHIKFSEN YRLYSRSHFVKGLEVVLLLIVYLAYGYNEGGALSYILLSISSWFMALSWLFAPYLFNPSGFEWQKVVEDFRDWTNWLLYR GGIGVKGEESWEAWWEEELAHIRSFGSRIAETILSLRFFIFQYGIVYKLDVKGTDTSLTVYAFSWIVLAGLIILFKVFTF SQKISVNFQLLLRFVQGLSLLLALAGLVVAVILTDLSVADIFAAMLAFIPTGWGILSIAAAWKPVMKRLGLWKSIRSIAR LYDAGMGMLIFVPIAFFSWFPFVSTFQTRLMFNQAFSRGLEISLILAGNNPNTGI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Phobius | 1 | 486 | 486 | - | – | |
PANTHER | 46 | 1888 | 1843 | 0.0 | – | |
SMART | 335 | 444 | 110 | 6.6E-56 | ||
Pfam | 337 | 433 | 97 | 4.9E-30 | ||
TMHMM | 487 | 506 | 20 | - | – | |
Phobius | 487 | 506 | 20 | - | – | |
Phobius | 507 | 525 | 19 | - | – | |
TMHMM | 519 | 541 | 23 | - | – | |
Phobius | 526 | 545 | 20 | - | – | |
Phobius | 546 | 556 | 11 | - | – | |
TMHMM | 556 | 578 | 23 | - | – | |
Phobius | 557 | 577 | 21 | - | – | |
Phobius | 578 | 588 | 11 | - | – | |
Phobius | 589 | 612 | 24 | - | – | |
TMHMM | 590 | 612 | 23 | - | – | |
Phobius | 613 | 653 | 41 | - | – | |
Phobius | 654 | 676 | 23 | - | – | |
TMHMM | 658 | 677 | 20 | - | – | |
Phobius | 677 | 713 | 37 | - | – | |
TMHMM | 711 | 733 | 23 | - | – | |
Phobius | 714 | 738 | 25 | - | – | |
Phobius | 739 | 1462 | 724 | - | – | |
Pfam | 1018 | 1708 | 691 | 1.5E-234 | ||
TMHMM | 1463 | 1485 | 23 | - | – | |
Phobius | 1463 | 1485 | 23 | - | – | |
Phobius | 1486 | 1519 | 34 | - | – | |
TMHMM | 1513 | 1535 | 23 | - | – | |
Phobius | 1520 | 1538 | 19 | - | – | |
Phobius | 1539 | 1608 | 70 | - | – | |
TMHMM | 1545 | 1567 | 23 | - | – | |
TMHMM | 1603 | 1625 | 23 | - | – | |
Phobius | 1609 | 1627 | 19 | - | – | |
Phobius | 1628 | 1632 | 5 | - | – | |
Phobius | 1633 | 1656 | 24 | - | – | |
TMHMM | 1635 | 1657 | 23 | - | – | |
Phobius | 1657 | 1708 | 52 | - | – | |
TMHMM | 1704 | 1726 | 23 | - | – | |
Phobius | 1709 | 1726 | 18 | - | – | |
Phobius | 1727 | 1737 | 11 | - | – | |
TMHMM | 1736 | 1758 | 23 | - | – | |
Phobius | 1738 | 1758 | 21 | - | – | |
Phobius | 1759 | 1769 | 11 | - | – | |
Phobius | 1770 | 1793 | 24 | - | – | |
TMHMM | 1771 | 1793 | 23 | - | – | |
Phobius | 1794 | 1798 | 5 | - | – | |
TMHMM | 1798 | 1820 | 23 | - | – | |
Phobius | 1799 | 1820 | 22 | - | – | |
Phobius | 1821 | 1840 | 20 | - | – | |
TMHMM | 1841 | 1863 | 23 | - | – | |
Phobius | 1841 | 1862 | 22 | - | – | |
Phobius | 1863 | 1895 | 33 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Cellular component | 1,3-beta-D-glucan synthase complex | A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain. | ||
Molecular function | 1,3-beta-D-glucan synthase activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1). | ||
Biological process | (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds. | ||
Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0362300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…