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LotjaGi6g1v0024300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0024300
Transcript ID LotjaGi6g1v0024300.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description protein kinase family protein; TAIR: AT3G07700.1 Protein kinase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|P73627|Y1770_SYNY3 Uncharacterized protein sll1770; TrEMBL-Plants: tr|V7BLS3|V7BLS3_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0024300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:4439354..4451563) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGGAATTCACCGCTTTGGCCAATACAACATGCAAATTCTGACATGATTGGAGCCTTCCCTGTCACACAAAGAGTACCT TACATTACATTACATTTAGTTTCAGCGAAGAAATTAGATACGTGCGGTTCAAAGAGACCCACATGAGCCAAACCCTCTGA ATGGCACATGTTGAAAGCACCTACTTCTCTCTTGTCTTTTCTTTTATGCCAATATTAAACAAAATTAAAACAGAATATTA ATCAAACCACTCATTAGTGTTTCATGTTCAACTTCCCTCACAGTTTACAAAACATCCTAGTACCTCTGTGCTAGTCCTTT GAGTTGAGGGTGTCTCTGTAATCCAAGGTTTGCATCAACCTTCCTCTTTCACTCTTCTTCAACTTTGAATTGTTTGTATA TCAGCTGTTAATGTTGTTCTGTGAGTTTTATCAAGATGATATGTGATTTCCCCTGTAAATTTGGTCATGATTATTTGCTG ATTTAATCTTTCTGATTTATAGCATCCTCCCTCCCCTTTTATTGCTGGAGAAATTTTTGTGAGCTTATCTTCAATTAAGA GTCAAAGGGTTGTGTTTCAATGTTTTGATTCCAGTTGTTTAAATTTCATTATTAAATTTTTCTTAGTCAATGGAAGATGA TTATATACTCTACTTAGTTCTACAATACGCTTCTGTTTGGCCTTTTTAATAATTACTGATTGCTGGATAACTGATGTTGG ACTCTAAGCTTTTCATGGTTGGCTGTAAGATTTGCTTTTACTTGTTTGATACATGATAACGAATTATCTGAGATGGAGTT ACAATATTATTATTTAGTTTCCTGTTATGCATATTATATATTAGAAAAATCTTTCAACACAAAATATTATGTTCACCAAG TTCTTTGAAACTTGTTAGGAGAAAGATATGACATTTGAATGGATTCTAAATTAATTAAATTTCATTCATTTAAGGATGAA 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TTATTTTCTCTAACCACTTGCGTCATATTGCGCATTGCAATTGAAACCGGAGAAGCTTTTGTGAGCAGTGTGTAGCACTT GTTTGAAGGCATGGCAACTGTTGCAAGTATGTTTGTTTCCCCAGTTTGTGCATTTTGCTTTTCCATTGCTGGTTTCTGCA CCAAAACCCCAAGGTTTCTTCCTTGCATCCAAAAATAGCATCATCCATCTACATTTTACCTGTTTTAATGCCCTCAATAC TCTTGATTATTTTTTAAAAGATTTTATTTTTAGCAAGCTTAAAGCTTAGTAAGATTAGGTTCGGGAAATTATTGAAAATA TGAAAATCTTACAATGTCTTGATTGTATCTAAGCAACTTTATCTGTAAGGATTAATTTTTATATTTATTTATATGTCATG ATTTTTAGCACTTGACCTTGTCACGATTTTTGTTTTTATTTTTCAGATTATCAAGTTATCCGAAAACACAGTAGTTAGAG TGAATCTCCTATTGTGAAAGAACCTATCTATTCAGCAATTCACATTTGTAAAAGAGCCTATCTCTTAGCAACGCTCACCC CTAAGCTAGCTTTTGTGTAGAGTTAGGCCTAACCTGAATTCTAATAGATATGTAGAAATGTTAGATAAAAAATTAAGTGG TTCTGAAAGTAATATTATCAAACAATGTGATAATGAATACACATAATATATATAATATTGAGAAAAGAAAAATCCTTGTG GGGGCAATGCCCCACAATGTAATATGTCTTCCCCTGAGTAGTGACACAATTTCTCTCAAGCACTTTAGTTTTAATAGTAA ATTCACTGTTGACTTGATTAACTTCCTAACCAGCGAAAATTTTAAATAAAGAATCTGATGTTACTCTGAAATTGAAGTTA CCACTTCGGGGGGCCCTTTTACATTAACTTTAACTTCCAATTGACAATGGTGCAGGTTATGCAATGCCTTATAGATCTTG GTGCACTCCAACCTACTGGGGACCTGACATCAGTAAGTACATTAAGATTCCGTTTGGATGCGGACCAAATGACACTCATT GCAGCTTATTAACCAAGAAAAGCACTAAATAAGCTCAAATTAGTGCTCTTTAATCTGCATTCAAATATACTCTAAGTACC CGTCTCTTTTATAAGATGCTCACTTAACGGTTTAAAATTATGATCCATATCTTGATCTTATAAATGTTTTAACATGACTT CCAGGTGAGGAGATCTGTACAGTTTTTCTTGGACAATCTTCTAAGCCAGACACCAGATCAACAGCAGACTTTGTCCGCAA TTGGAGAGGTACATGGGTGTTTAGCTATGTTGGATCATTAAATTCTTAGTTCCTTCATGAATATCTTCGGTGATTGTTTC TTTTGGGAGTGAGAATAATTTGAAGATGGCAAATCATTGTTTTACTATGCCGTTCACAATTTTATTATTGATGGAATTTT GTGGCAGGATTTATTTGCAATAGCACAAGATCAGCCATTCCGTTTTCCATCTACTTTCACCTTTGTTATTAGAGCATTTT CTACCCTAGAAGGTTTGCCCCTTTACTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACCATTGGTG ATTACTCCTTGAAGATTCTTCTTAACGAAGCCATTGTGTATTATTAATGTGATTTCACGTTAGTTTGGACATCATAAAAT CATTAATCCACCCTTTCCTATGAATAGTGCTGTAATATACCATGCTTAAAATAATTGTGTAATTATTGTGATTTTATGGT TATTAGGACAGATCCTAAGTTATTTCTCTCAGTTTTGTCTATCCCAGACGCATTTATTTACTTTCAAACATATTATAGGG GTGGTTCAGTTTCCCTCCCTCATTACCATATTACATGACACACAATGAATAATTACCCTATTTACATTCTCAAGATATTA 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CATTGAGACTTCGATACCGTGTCACGAACCAACTACTCCAAAAGTTTAACTTGTTGGGTGAAAACACATTAAAAAATTTA TATTTATATTATACTTCTAACGCTGTATTCATTCTGCAACTTATTTTTCTCATTTGAAACTGTAACTTGATTTGCTAGTC TGAAAGAGCAGCTCGGAAAGCAACAGTTTTACAAATGGGTACAATATATACAGTATTTGGAGGAACCCTGCTAAATCTTG GTCTCACTTTGAGTAGCCAAGGCAATCAAAGTTTTGCAAATGGATCATTCCTTGGTGCAGGTGGCTTTTCTTCTATCTTA TAGCTTTATCTCCTAACATTGTCTAATCATGTTTAGTTTTACATCATCTTTTATTCTATATGCAGGTGTTTTCTTGACCC TGTTTTTAAGGTCTATGCAAAGGGTAAAGAAGCTTGATAAGTTTGAGAACATGATATAATTCGTTCGCAACAAATTCCTT AAAGCATAAATAGTCTTCATCTCCATTTAAGCTCAGGTTACCATATAAGTTTTTGCAGTGATTTCAGTTTTATTTTTTTG ATAAGCCCATATAATTCAGATACCTACCTCTCAAGTTATACCCTTCACTACTGCCAAAAATCCAAAAAAGCTTCATAGAC GAAACGCTTACAGTAAAATTTTCACCACAATAGTGATTGATCCTGGTCTCACATTGAACATAGAAGTTGTATATAGGATT CATATATTTCCAATGACATAAATAAAGCCTCAATTGGATAAATTTATCTCAATATACCACGCCTTTTAGGTGCTACAAAG GTCATCATGTCCGAGAGCATCAAATGATACAATTTGTAACTAGCTATTCTCCTAAATAGAAGTTGATTCATCTTTGGACT TGAACGTGAAAGTTTTAGAACCATGTAACCATGTAATGAAGACCTTATTTCAAGGAGTTTTACTTCAGTTATGACCTACA GAAGAAGACATTGTTTGTGTCAACAATTTTGAAATCACATTTCAGTTTTTCTAACGCTAAAATGAAGTTTATTTCCAGTA AGCAGCCTGTTACTTTTTTTATTTCAAAATCCAGTTTTGATTCTCCTTATATAATTTTACTACGTTACACCCCCTCATTT TAAACTAAAAGTTTTGTCTTATTTTATTTGATTAAATTAATCTTGAATTTAATTCTTTAAATTACTGAATAATATCTTAC GCATCATTTTTCAATTATTTTAATAAAAAATCTCTATATTAAATGATTATAAACATTAGCTAATTAAAATAATTAAATAA TAAAAAATTAATATTGTATAATTGAATAATAAATTGATACGATATGACTTGCATTCTGTAAATTATTTAAATTAAGAAAA ACTAATTTTATAAATTTTATCTCAAATTGGTTTCAATTTATCCTATCAAAATATTATTCACTTTTCTAAAGTTTATAACC ATTGTCTCCGAACGATAGCTCAAGTGGTAAGAGTCAGGGGACGTGTGAGTTGGGTGGGGGAGATCTAGAGATCAATCTCT GGTGGGTGCAACTTATCTTTTCAATGTACCAAAAAATGTTATTACCATTAGCAAGCACATATTTGAGCGCAGTAGCAGCA GCCCTGCGCAAGGAGCTTTGCCTGCAATGGGGTGCTTGGTACACCTGAAATGAATAAATAAAATCAGCCGTAATATAATT TGTAATGCAGCATATGAAGAGATAAGTTGATTGTACGCACCATGTGATTCAGAATAAACGTTAATTGTTATTGCAGATGG AATTGGAGATGCAAGGAAAAGAGGTGTTATCGGTTGTTCAATGTTAGCGTCAAATGCACTTTCTACTTCCATGTCAGACA AAACTCATCAAGAATGTCACATTCATAACGTTCATCCTCATCTTTTGAAACAATGACATAAGCATCCACTTTATGGTCGA TTTGGTGATCATCATTGGCCAAGTTAACCGTGGGATCCACAATGCAATATTCTGCTCTAGAAACTCACTGCTCGATACAT CTATCACCTTCATCGTTTAATGTCTGTGCATTTATCGGATTCATTGTGACAAATATTGATGAACTTCCAACCTGATCAAT ATCAACGTGCAACTCCAACACTATCATCAATAATTGCTGCTTAAAGTCATTGATCATGCATTCCACGTCCTCGTCATCAA ATACTTGAAGACTTTGTAGATTTACTTGGATTATGTGAAACCAAAAATCTACAAGTCATGCTAGAAGTAACTTGGTTATG TCCAAGCTTCAACTTGTTATGAATTTTCTTCTTTCGATTTTTTTTTTGAAAGTAATTTTCTTCTTTAGATTATTCTTTCT CATGTCGCGTTTTAGTTTTTTTTTATAGGCAAATGTTAGTCGTTAGTTGTTAGTAATTACAAATGCTCCTCCTCAGGGTT CGAACCTTGGACCTCCATCTCCAACACCTATGTTGCGTTTTAGTTGCATGGACCTCTTCTCACCTTTAAACAATACCATA ATAATGCACGAAAGCAACTAATAGACTCATTATGTAAGAAAAAGGTTTGAGAAAAGTGTAGGAGAGAGAATAAGAGTGTG GGAGTAGTGTGAATTCTTGCGGTTGGGGACTCATGTATTTATAGGGTTAG 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0024300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCAGTAACGATGGCTTTGCATGGTTGTTATTATAACAATCTAGAGTTGCCAAATCACCGAAGAGCACTAGACAATCT CGGTTTTACTGGCTCAATTTCTGCCCATAAATTGTCAAATAATAAAAGGTCAACATCTGATAAGTCCGGGAAAGATAAAT TTACTAGATTCCTGGTGGAAATGCGACAGACGGAATTGCCTCCATCGAAATACGGTACCAATGGTAGATCTGTTAAAATG GTACCAGCAAATGAGGTAATGAACCGAAAGACAATCTCAGAGAATAAAGTGCAGACGGTGAATGGTTCAAAGCAAGTTGT TAACGGAGCAAGTTTGGTAAGAAGAGATTCTACACCAGCCTTGACAACTACAATGAAATCTAGAACCTCTAAAGAACTTC CACCATTGGAAGAGCTAAAAGTTTTACCCTCAGACGAAAGCTTCAGTTGGGCCAATGAAAATTACAATTCCTGGCAGAGG TCTATTGATGTTTGGTCTTTTGTTATTTCTTTACGTGTTCGTATTCTGTTGGATAATGCAAAATGGGCCTATTTGGGTGG CTTTACAGAAGAAAAGCAGATAGGTAGAAGGCGGAAAACTGCTTCATGGCTAAGGGAGTGTGTATTACAGCTTGGTCCAA CTTTCATTAAACTTGGACAATTATCATCAACAAGGTCAGATCTATTTCCCCGTGAATTTGTGGATGAACTCGCGAAATTG CAGGACAAGGTCCCTGCTTTCTCCCCAAAGAAAGCAATAGGCTTTATTGAGAGTGAATTAGGAGCTCCCATTAATGTATT GTTTAAAGAGTTTGAAGATCGGCCAATTGCTGCTGCTAGTCTTGGTCAGGTTCATCGTGCTATTCTGCACAATGGAGAAA AAGTAGTTGTCAAAGTTCAAAGGCCTGGACTAAAGAAGCTCTTTGACATCGACTTGCGAAACTTAAAGCTAATTGCAGAG TATTTTCAGAAAAGTGAAACACTAGGTGGTCCAACAAGAGATTGGCTTGGTATCTATGAAGAATGTGCAACGATTTTGTA TCAAGAAATTGATTATATAAATGAAGGGAAGAATGCTGATAAGTTTCGCCGAGATTTTCGAAACATAAAATGGGTCCGAG TACCTCTGGTTTATTGGGATTATACTGCAAAAAAGGTGTTGACCTTGGAGTATGTGCCAGGTATCAAAATAAATCAAATA GATACGTTAACTTCACGTGGTTACAATCGCTTACGGATCTCATCACGTGCTATTGAGGCATACTTAATTCAGATATTGAA GACAGGTTTCTTTCATGCTGATCCACATCCCGGAAATCTTGCAATTGATGTTGATGAATCTATCATTTATTATGACTTTG GCATGATGGGGGAGATAAAATCATTCACCCAAGAGAGGCTGCTAGAACTCTTCTATTCTGTTTATGAGAAGGATGCCAAA AAGGTTATGCAATGCCTTATAGATCTTGGTGCACTCCAACCTACTGGGGACCTGACATCAGTGAGGAGATCTGTACAGTT TTTCTTGGACAATCTTCTAAGCCAGACACCAGATCAACAGCAGACTTTGTCCGCAATTGGAGAGGATTTATTTGCAATAG CACAAGATCAGCCATTCCGTTTTCCATCTACTTTCACCTTTGTTATTAGAGCATTTTCTACCCTAGAAGGCATAGGCTAC ATACTCAATCCAGATTTCTCCTTTGTGAAGATTGCTGCACCTTATGCGCAGGAGCTTTTGGATGTAAGAACAAAGCAGCG CACGGGGACACAATTCGTGGAGGAGATAAGGAAGCAAGCAGATGATGTAAGAACCAATTCCATTTCAATGCCATACAGAG TTCAAAGAATAGAGGAGTTTGTAAAGCAAGTTGAAGCAGGCGATCTGAAACTCCGAGTTCGGGTGCTTGAGTCTGAAAGA GCAGCTCGGAAAGCAACAGTTTTACAAATGGGTACAATATATACAGTATTTGGAGGAACCCTGCTAAATCTTGGTCTCAC TTTGAGTAGCCAAGGCAATCAAAGTTTTGCAAATGGATCATTCCTTGGTGCAGGTGTTTTCTTGACCCTGTTTTTAAGGT CTATGCAAAGGGTAAAGAAGCTTGATAAGTTTGAGAACATGATATAA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0024300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAVTMALHGCYYNNLELPNHRRALDNLGFTGSISAHKLSNNKRSTSDKSGKDKFTRFLVEMRQTELPPSKYGTNGRSVKM VPANEVMNRKTISENKVQTVNGSKQVVNGASLVRRDSTPALTTTMKSRTSKELPPLEELKVLPSDESFSWANENYNSWQR SIDVWSFVISLRVRILLDNAKWAYLGGFTEEKQIGRRRKTASWLRECVLQLGPTFIKLGQLSSTRSDLFPREFVDELAKL QDKVPAFSPKKAIGFIESELGAPINVLFKEFEDRPIAAASLGQVHRAILHNGEKVVVKVQRPGLKKLFDIDLRNLKLIAE YFQKSETLGGPTRDWLGIYEECATILYQEIDYINEGKNADKFRRDFRNIKWVRVPLVYWDYTAKKVLTLEYVPGIKINQI DTLTSRGYNRLRISSRAIEAYLIQILKTGFFHADPHPGNLAIDVDESIIYYDFGMMGEIKSFTQERLLELFYSVYEKDAK KVMQCLIDLGALQPTGDLTSVRRSVQFFLDNLLSQTPDQQQTLSAIGEDLFAIAQDQPFRFPSTFTFVIRAFSTLEGIGY ILNPDFSFVKIAAPYAQELLDVRTKQRTGTQFVEEIRKQADDVRTNSISMPYRVQRIEEFVKQVEAGDLKLRVRVLESER AARKATVLQMGTIYTVFGGTLLNLGLTLSSQGNQSFANGSFLGAGVFLTLFLRSMQRVKKLDKFENMI 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 675 675 -
PANTHER 61 702 642 2.0E-258
PANTHER 61 702 642 2.0E-258
CDD 239 486 248 4.42486E-108
SUPERFAMILY 241 481 241 3.67E-27
Pfam 259 378 120 2.1E-37
Phobius 676 693 18 -
Phobius 694 708 15 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0024300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…