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LotjaGi6g1v0042300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0042300
Transcript ID LotjaGi6g1v0042300.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Insulin-degrading enzyme; TAIR: AT1G06900.1 Insulinase (Peptidase family M16) family protein; Swiss-Prot: sp|F4HNU6|NRDC_ARATH Nardilysin-like; TrEMBL-Plants: tr|A0A072UY22|A0A072UY22_MEDTR Insulin-degrading enzyme; Found in the gene: LotjaGi6g1v0042300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:8111124..8126764) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAATGGATCTAAGACTATAAAATCATTCATCAATCTTCATATCGTGTCATAAGTCAATTTTTTTTTTTTCATTTTGCACA TGATGAAAAATATATGATAATGAATATAATTACACAAAATAATGGACTTTAATTTTGAAGGGGTTTGAAAATTGAGTTTA GGCTTGGGGCCTGGTGCCCTTATTGCTTCTTTCAAAAGCCGCACACTGCACACTCCACTCTGCGAGTTCAGAGTTGATAG CACTCTGAATCAAACAAGAGAAACAAATCCCTTTGTTGCTGCTGCTACTGCTAGCTAGTGTCGCTGCAATGAAGAGTGCA CCCATCATCACTTTCTCCTCCGACGACGTTGTTGTCAAGTCACCGAACGACCTTCGTCTTTACCGCCTCATCGAACTCCA TAACGGCCTTCAAGCTTTGCTCGTTCATGATCCTGAGATTTACCCAGATGGCCCTCCCAAGCCTGTTCAAACCGACAATG AAGAAGAAGAAGATGATGATGAAGAGGAAGATGATGAAGATGAAGATGAAGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT GATGATGATGATGGGGAGGAAGAAGAAGATGATGATGATGATGAGGAAGAAGAGGGAAGTGAAGAAGTAGAAGTTGAAGG AAAAGAAGGGGCCAAGGGTGCTGCTGCTCAGACCAAAAAGGTTATTTTTTTTATGTCATTTTCTGCGTGTTCTGCCAATT TGATGGATACCCATTTCGATTTTTGCTTCGTTTTTCAAAGCTTTGATCAGGTGGCTTCGTGGGTCTTTTGTTTTGATGTT GATGGGAAATAGTGGGAACAGTGTTAGGGAGATGTAGTCTGGATTCTGTGTGTAAATGTAGTGATGTTTATGGAGATTGG AGAACAATTATATTATGTGTGATTTGGTTTGTTGCTTTGATTATTGATGCATTCGCGTGTTTTGTTGTTTGCACTTTGCA 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CAATCAAATGAAGAACATGGACACTTAAAGTGATTCAAGCAAAAAATCAAAGATGAAAAATGAATAAAACCGTATCTAGT AGAGATGTAAACACGAATGTTGTGGCCACCGGAGAGCAAGAAGTTGAAGACTGGAAGTCCCATTTATTCATCTCTACCAC TAATTCAAAGTATATTATAAAAAGAAGTATATTATGCTCAATATTACCCTTATTTAATTGAAATTTTTATCTCCCTCATT TTTTTTAGCGAAACAACAAAATAACGCAAACGAAAATGTTG 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0042300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAAGAGTGCACCCATCATCACTTTCTCCTCCGACGACGTTGTTGTCAAGTCACCGAACGACCTTCGTCTTTACCGCCT CATCGAACTCCATAACGGCCTTCAAGCTTTGCTCGTTCATGATCCTGAGATTTACCCAGATGGCCCTCCCAAGCCTGTTC AAACCGACAATGAAGAAGAAGAAGATGATGATGAAGAGGAAGATGATGAAGATGAAGATGAAGATGATGATGATGATGAT GATGATGATGATGATGATGATGATGGGGAGGAAGAAGAAGATGATGATGATGATGAGGAAGAAGAGGGAAGTGAAGAAGT AGAAGTTGAAGGAAAAGAAGGGGCCAAGGGTGCTGCTGCTCAGACCAAAAAGGCTGCAGCGGCTATGTGGGTAGGAATTG GCAGCTTCTCTGACCCGAATGAAGCACAAGGACTAGCACATTTTTTAGAACACATGCTCTTCATGGGGAGTGATGAATTT CCAGATGAAAATGAGTACGATAGCTATTTGTCCAAGCATGGTGGCTCATCAAATGCGTATACAGAAACTGAATATACTTG CTACCATTTTGAAGTGAAGCGAGAGTTTCTAAAGGGTGCCTTGGGAAGATTTTCTCAGTTCTTTATTTCACCCCTTGTAA AAATGGAGGCCATGGAGCGAGAAGTACTTGCAGTAGATTCAGAATTTAACCAGGTTTTACAAAGTGATGCTTGCCGTCTT CAACAACTTCAGTGTCATACATCCGCACTTAATCATCCTTTAAATAAATTCTTTTGGGGGAATAAAAAGAGCCTGGTTGA TGCAATGGAGAAAGGTATTAATTTGCGGGAGAAAATATTGAAATTATACGAGGATTATTACCATGGTGGATTAATGAAGC TTGTTGTTATTGGTGGAGAGTCTCTGGATGTGCTTGAGAGCTGGGTTGTGGAACTGTTTAGTGCTGTCAAGAAGGGTCCT CAGGTAAACCCAGAGTTCACTGTGGAAGGTCCTATCTGGAAATCTGGTAAAGTTTATCGGCTAGAAGCCGTCAAAGATGT TCATATCCTTGACTTAGCATGGACCCTGCCCTGTTTACACAAAGAGTATCTAAAGAAACCACAAGATTATTTAGCTCATC TCCTTGGGCATGAGGGCAGGGGAAGCTTGCATTTCTTTCTCAAAGCTAGAGGGTGGGCTACATCTCTATCTGCTGGTGTT GGGGATGAAGGCATTTATTGTTCAACTATAGCCTATGTGTTTGTCATGTCCATGCACCTAACTGACTCTGGTATAGAAAA GATCTATGATATTATTGGCTTTGTCTATCAATACCTTAAGTTGTTGCGTCAAGTTTCTCCACAAGAATGGATATTTAAGG AACTTCAGAATATTGGAAACATGGAATTCAAATTTGCAGAAGAGCAGCCTCAAGATGATTATGCTGCTGAGCTTGCAGAA AATTTGAACTTCTATCCACCAGAGCATGTCATTTATGGTGACTATCTGTACAAGACATGGGATGGGCAGTTGCTCGAACA AGTTCTTGGTTTCTTCATTCCTGAAAATATGAGGGTTGGCGTTGTGTCAAAGGTTCTTAAGTCAGAAGATTTCAAATATG AAACTTGGTTTGGTTCACGTTATATTGTGGAAGATATTGCTCAAAATTTGATGGAGTTATGGAGAAATCCTCCAGAAATT GATGCCTCACTCCATCTTCCGTCCAAGAATGAGTTTATTCCAAGTGACTTTTCTATACGTGCTGGTGACACGTCTGATGA TGATTCTGCAAATTTGACTTCTCCTAAATGTATAGCTGATGAAGCATTGATAAAATTCTGGTACAAGCTGGACAGTACTT TCAAAGTTCCTCGTGCCAATACATATTTTCGAATTAACTTGAAGGGTGGATATGATAACGTGAAGAGTTGTGTATTGTCT GAATTGTTCATTCACCTTCTTAAAGATGAGTTGAATGAAGTCATATATCAGGCTAGTGTTGCCAAGTTAGAAACTTCTGT CTCTTATTTTGGTGACATGCTTGAGCTGAAGGTCTATGGTTTCAATGAGAAGCTTCCTGTTCTCCTATCTAAAATTTTGT CAGTGGCTAGATCTTTTATGCCAACTGAAGATCGATATAAAGTAATAAAAGAAGACGTGGAGAGAACTTTAAAGAATACC AACATGAAGCCTCTAAGCCATTCATCATATTTAAGATTACAAATTTTGTGCGAGAGCTTTTATGATGCTGATGACAAGTT GCATTGTCTAAATGATCTGTTTCTTGACGATCTGAAGGCATTTATCCCTGAGCTTCGCTCACAGTTATACATTGAGGGCT TGTGTCATGGAAACCTGTCAGAAGATGAAGCAATTAACATATCCAATATCTTTAAGATGAACTTTCCAGTAAATCCACTC CCCATTAAGTTGAGGCATGCTGAACGTGTAATTTGCCTCCCTTCCAATGCCAATTTAGTTAGAGATGTTGGTGTGAAGAA CAAGTTGGACAAAAACTCTGTGGTTGAGCTCTATTTTCAAATTGAACAAGATTTTGGTATGGGGTCAATGAAGTTGAAAG CTTTGATTGATCTTGTTGATGAAATTGTGGAGGAGCCACTTTATAATCAGCTGAGAACGAAGGAGCAGCTTGGTTATGTT GTTGAATGCAGTCCGCGAGTAACATACCGTGTTTTTGGATTTTGTTTCTGCATTCAGTCATCTGAGTACAACCCAGTTTA CTTACAAGGTAGAGTTGATAACTTCATAAATGGCCTGGAAGAATTGTTGGATGGCCTTGATGACGATTCCTTTGAGAATT ACAAAAGTGGGTTAACGGCAAAGCTGCTGGAGAAAGATCCTTCACTCACATATGAAAGCAACAGATTGTGGAATCAGATT GTTGATAAAAGGTACATTTTTGACGTTTCAGAGAAGGAAGCAGAAGAATTGAGGAACATAAGCAAGAATGATGTTGTAGA GTGGTACAAGACGTATTTGAAACCATCATCTCCGAAATGTAGGAGGCTACTTGTTCGTGTATGGGGTTGCAACACAGACT TGAAAGATGCTGAAGCACTTTCCAAATCTGAGCAGGTCATCACTGATCCAGCAGCTTTCAAGAAGGAATCTGAGTTTTAT CCAAGTTTTTGTTAA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0042300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MKSAPIITFSSDDVVVKSPNDLRLYRLIELHNGLQALLVHDPEIYPDGPPKPVQTDNEEEEDDDEEEDDEDEDEDDDDDD DDDDDDDDGEEEEDDDDDEEEEGSEEVEVEGKEGAKGAAAQTKKAAAAMWVGIGSFSDPNEAQGLAHFLEHMLFMGSDEF PDENEYDSYLSKHGGSSNAYTETEYTCYHFEVKREFLKGALGRFSQFFISPLVKMEAMEREVLAVDSEFNQVLQSDACRL QQLQCHTSALNHPLNKFFWGNKKSLVDAMEKGINLREKILKLYEDYYHGGLMKLVVIGGESLDVLESWVVELFSAVKKGP QVNPEFTVEGPIWKSGKVYRLEAVKDVHILDLAWTLPCLHKEYLKKPQDYLAHLLGHEGRGSLHFFLKARGWATSLSAGV GDEGIYCSTIAYVFVMSMHLTDSGIEKIYDIIGFVYQYLKLLRQVSPQEWIFKELQNIGNMEFKFAEEQPQDDYAAELAE NLNFYPPEHVIYGDYLYKTWDGQLLEQVLGFFIPENMRVGVVSKVLKSEDFKYETWFGSRYIVEDIAQNLMELWRNPPEI DASLHLPSKNEFIPSDFSIRAGDTSDDDSANLTSPKCIADEALIKFWYKLDSTFKVPRANTYFRINLKGGYDNVKSCVLS ELFIHLLKDELNEVIYQASVAKLETSVSYFGDMLELKVYGFNEKLPVLLSKILSVARSFMPTEDRYKVIKEDVERTLKNT NMKPLSHSSYLRLQILCESFYDADDKLHCLNDLFLDDLKAFIPELRSQLYIEGLCHGNLSEDEAINISNIFKMNFPVNPL PIKLRHAERVICLPSNANLVRDVGVKNKLDKNSVVELYFQIEQDFGMGSMKLKALIDLVDEIVEEPLYNQLRTKEQLGYV VECSPRVTYRVFGFCFCIQSSEYNPVYLQGRVDNFINGLEELLDGLDDDSFENYKSGLTAKLLEKDPSLTYESNRLWNQI VDKRYIFDVSEKEAEELRNISKNDVVEWYKTYLKPSSPKCRRLLVRVWGCNTDLKDAEALSKSEQVITDPAAFKKESEFY PSFC 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 8 1042 1035 0.0
PANTHER 8 1042 1035 0.0
SUPERFAMILY 13 320 308 3.32E-46
MobiDBLite 41 120 80 -
MobiDBLite 56 108 53 -
Pfam 120 244 125 5.6E-34
ProSitePatterns 134 157 24 -
Pfam 276 457 182 1.2E-12
Gene3D 333 556 224 3.4E-73
SUPERFAMILY 336 568 233 4.03E-65
Pfam 463 748 286 1.6E-82
SUPERFAMILY 570 801 232 4.44E-45
Gene3D 592 807 216 2.0E-55
Pfam 755 937 183 1.5E-9
SUPERFAMILY 810 1040 231 3.84E-45
Gene3D 812 1044 233 2.7E-73

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Catalytic activity Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic.
Molecular function Metalloendopeptidase activity Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a mechanism in which water acts as a nucleophile, one or two metal ions hold the water molecule in place, and charged amino acid side chains are ligands for the metal ions.
Biological process Proteolysis The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds.
Molecular function Metal ion binding Interacting selectively and non-covalently with any metal ion.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0042300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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