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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0055200 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0055200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Kinesin light chain 3; TAIR: AT5G37590.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9NSK0|KLC4_HUMAN Kinesin light chain 4; TrEMBL-Plants: tr|K7MPT4|K7MPT4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0055200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:9940938..9964101) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTTTATTAAAAAAAAAATGGATGTTAAGAAAAGTGAAGAACTCAACTAAAACCCACGCTAAATCCTCTTTGAACTCTAC AGTAGCTGCCTCTGTTGTTCCTCGCCAGAAGCTATGTCTCTGCGGGTAGCAGCAGCAAATTTGCTCAAAAAATTTCGCTT TCCTTCTTCTCGAGCCTTCCCTGCCTCTACCGTACCCACAAATTCATTGCCCATCTCATTTTCTGGTACGCATAAAACTC TCAATGCCACTCTTGTTGTAATTTGATCACACCCCCTTATATTGTAATATTTCTGGGTATTCAACTTTTTCTGATGATTC AGATAGTAAGTTTTTTATTTTTGCTAATAAGGCAAATCCAAATGGGAACTGTGGTGCATTATTTGGGGTGTTGCATTGCA TGATGCATCCATGCTAGTTTGTACTATTCTAAGAAGGGGTTCTCTTATTCTATTTAAATTTGGTGTTTATTGGAATTCAA AACAGAATATATATTTGTCACTTCAAATTAGCCACAAAGTTCCTTTCTAGATTTTAAGGAAAGGAACTTTCTTTAGAAGT TGAATTTTTTGCACATCAACAGGTTTTATGCCTGAATGGTTGATTTTTTTTTTTTTTGAATAGGCAGATCTATTGTTAGT TAATTGCATGAACGATGATACGTGCTGCACGGCACAACTAAGATGATATTTGCATATTCTAAACTTTGTTATTCATTTTA TGTTATTTCAGGTAAAGTTAGACTTTCCCACTGGTATCAAACTAGAGCATACAGTTGCAGAGATCCTTGTCTTTGGATTG TTGTATCTGGATATGCAGGTATGCTTTTGTAAATGTAAGGGAAAGTTAGTTAGAATTTCAATTAACAGTTAGTTAGTTTT GGTAGTTATGATTCAGTTGTATTTTTGTTACTCGTGGTTATCATTCTGTTACTCATGATTGGTATTATATAAGTGTGGCT 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GATGTCACCAAATATTCTGGAAATCTCATGATTCATACTGCTGATGGCAACCAATTACCTATTACAGCCACTGGTGATAT TTCTTCAACTCTAACAGATGTTTTTGTGTCCCCTGGTCTCACTAGTAATCTTATTTCTGTTGGTCAGTTAGTTGACAATG ACTGTCGGGTAGAATTCTCAAAATCTGGTTGTCTTGTGCAGGATCAACACACGGGGAAGATGATCGTGAAGGGGCCTAAA GTTGGACGTCTTTTTCCACTCCATTTCCCTTTGTCTCAATGTCTTTCATTGCCTTCCGTTTCTTGTAATTCTGCTAATGT TGATTACCAAACGTGGCATAAACGTCTTGGTCATCCAAACTCAGTTGTACTTCATGACTTGCTGAAATCTGGTTTCCTTG AAAATAAAAAGATCCCATCTTTTAGTACTATTCGGTTTGATTGCAGTTCGTGTAAACTTGGCAAGAGTAAGATTCTACCT TTTCCAACTCATCATTCGAATGTAGAAAAACCTTTTGATATGATCCATAGTGATTTATGGGGGATGGCACCTGTTACATC TCATGCTAATTACAAATATTTTGTCACTTTTATTGACGATTATAGTCGTTTCACATGGATCTATTTTTTGCGCTCAAAAG CTGAAGTATTTTCTACATTCAAATTCTTCCATGCTTATGTTCAAACCCAATTTTCATCAAAAATTAAGATTCTTCGCTCT GACAATGGAGGGGAGTACACATCTCATTTGTTTCAAGAGTTCTTGCAAAATAATGGTATTCTATCTCAAAGGTCTTGCCC TTAAACTCCCCAACAAAACGGGGTAGCAGAAAGAAAAAACCGCCATTTGCTCGATGTTGTCCGCACCCTCTTGCTGGAAT CTTTTGTGCCAACTCGTTTTTGGTGTGAAGCTCTCTCCACTGCTGTGTATCTCATTAACCGCTTGCCTTCTCCATCTTTG AACAATGACACTCCTTTCACTCGGTTATTTGGTCATCCACCCACATATACTAACCTTCGCACCTTTGGTTGTGTGTGTTA CCTTCATCTTCCTCCCCAAGAACGCACAAAGCTCACTGCTCAATCTATTGAATGCGCTTTCCTTGGATACTCTACTCACC ATAAAGGTTTTCTATGTTATGATCCTAGTCAATGTCGGATTCGGGTCTCAAGAAATGTCATCTTTCAAGAAAATAAATAT TTTTTTGCATCTCACCTAGACCATAGCTCTCCTTTAATTTCTGTTTTGTCATTGTTTTCTAGCTCTGCTATAGGACCACA ATCAGCAAGACCTCTCTTGACGTATCAAAGGCGTGGTAATGTTACTCCAAATTTGCCACCAGAACCTCCAAAGCCTCTTC AAGATCCTTCCCTGCATGCTGATCCAGTACAGGCTGACCTTCTACGACGCAGTTCTCGCGTTCGTAAACCACCTGAAAAG TATGGTTTCACCTCTCCCTTGTCTTTGACAGCAACTTTATCTTCTGTTTCTATCCCTTCCTCTTATAAACAGGCAATGGA GCATGAATGTTGGCAAAAAGCTGTTGAAACAGAACTTCTAGCATTAGAAGAAAATCAGACATGGGATGTGGTTCCGTGTC CACCATCTGTCAAACATCTTGGCAGAAAGTTTGTGTTTTCTATAAAACTTCGTTCGGATGGCTCAATAGACCGGTACAAG GCTCGACTGGTTGTTCTTGGAAATAAGCAACAATATGGACTTGACTATGATGACACCTTTGCACCTGTCGCCAAGATGAC AACGGTGCGTACTATTCTTGCAATTGCTGCCTCCCAGTCTTGGACATTACATCAGATGGATGTCAAAAACGCCTTCTTGC ACGGTGATCTCAAGGAGGAAGTTTACATCAAACTTCCGAGTGGTATGCCCACACTCTCCCCTAATGAAGTTTGCAAACTG AAGCGCTCTTTGTATGGTTTGAAACAAGCACCAAGAGTCTGGTTCGAGAAGTTTCAATCCACACTACTTGGATTTTCCTT CACACAGAGCCAATATGATCCATCCCTTTTCTTACAAAGGACTTCAAAAGGTATCGTGGTACTCCTAGTTTATGTGGATG ATATTGTGGTGACAGGGTCTGATCAAGAGGCTATTTCTACAATTAAACAATTGTTGCATTCAACTTTTTGCATGAAAGAT CTTGGACAGCTCACTTACTTCTTGGGGTTAGAGGTACATTATCAGCCCAAAGGAATATTTTTAAATCAGCACAAGTATAT TCAAGACCTGATCCAATTAGCTAGCCTCACCAATGTGACCCCAGTTGACACCCCCATGGAAGTTAATGTGAAGTATAGAC GGGATGAAGGTGACCTTCTAGAAGATCCCACTTTATATCGCAAGCTGGTAGGTAGTCTTATCTACCTCACCACCACCCGA CCTGACATTTCTTTTGCTGTCCACACAGTCAGTAAGTTCATGCAATCACCTCGGCTAACTAACAAACTAATGCTCTCTAA TCACTCTTATCCAAAGTGAAAACAAAGATAACCTAATGCTCTCTAATCACTCTTATTTATAGGCAACATGCCTCTTAACC CTATAACTAACTAACAAACTACTGACCCCACTTAACTACTAACTAGCTAACCCCGGTTATCTATCATATACTATAACTGC TTAAGGTAGATTTTTGCACTTACATTTCTTCCCGATATTATAGGATTACAACAGTAATTTCTTGATTACATTTGAATTGT TATGTCCGTGCTTTTAGTTATATACACTAATATAATGTTTTAACTTTTAAGACCATCATATTTTGTAGGCTAGTGTTTGG TCTAAAGTTTATATCTTTATTAATTTGGCCTGCTCAACCATTACTAGCCTTCTCGTGAAAATTGATGAACTTGTGATTAG TTATGTTGAAGCACACCTTGTCCTAGCCCACATCTGCATTTTTGTTAGATATGTATAAAATATAGAATAGTACAACTTTA TCAGCAGGATCTTGATTATAAATTCTGCTGCACATAAATCAAATTAAAACAAACACACATTTAGGTCAACAAATAAGAAT GTGACAAGGTGATTTATTTTTCTGGGATAACGTCAATGCCAAGCTGATTTATCTAGGATCGTTGCGGGGTCTGGCTGATT TCTCTTGGAGAGCGGTACGACTTCATTTGGGATACCTTCGAGCCAGGTTGATTTATCTCGGACAGTTGTAGGTTCAGGCT GCATCTGGGATAGTGGTGAGAAACACAAAGGAGCATGCCTCGGGTTTTGCAAAGTTCCAAACAAGTGTAAATCAAAAGAG ATAGGGAGAGTGGACCTAGGAAAAGCAAGAAAAAGCTGAAATTGTTACAAGGAGACATGTCCAAACTGAGGAAAAGAAAA GAAAAGAATCAGGAAGATGACATTATCATAGTAGAATACCAAACTTTAAGGAGGTCATAGGGTACGATAATGCTCTCATA CCATATTGAAGTTAGTGTTTTTTAGATAAGGAGGGAATATAGTGTGGAGAGTTCAAGTGAGTTGGAGTCTCACATTGGTT AAGTATGGGTGAGGTAAAGACAATATAAGAGATGTGACCCATAAACCCAATGCCTCAAGGTTTTGGGTAAAGGTTTGGTG TCCAAATCTCTTGGTGGTCTTCGGTGTTGGTCCATTGGTGCTTTCGGCTCCCCCTGTCACCCCAACTTATAGTTGTTGTA CATTGCAAGAGAATAACTTTGTTGTGCCCGATTTTTCATTAATGCTTTTTTCGTAGAATAATAAAAAATTTCTGAAAAAT CCGTTTGGTCCCCCCTCTCCTCCTAACTTAAATCCAATAAAATTGTTACTTGTCATTTGAAACACGAAAATAGAGTATAA TTCAATTTCCTTGTATGCATTTCTCTTGTTCTTTCTCAGAATAGCACGCCAATTTCTCAATAAGATATTGAAACAAAAAG ATAAGCGGAAGAAATACAGTGTGCCAGGAGATGCTAGAAAGGAAGGCCAAGCTGCGTTGCTCATATTGGTTCAGTTCTTT TTCTCATTGTTCCTATTCTCTTATAGACTTGTGATTTGTATTGTACTCTTCTCTTTACAGCACCAGGTTGCTTGTTTTCT TGTTTTCAATAATGGAAATGAAATTTTCTTACAGTTGCAATCACTCAGTACTTTGTCATCATTGGAGTTGGCTATGGAAG AATTAACGGAAACTCAGGTTAGATTATAAGGCTTAATGTTAGTGCAACCAGATTTAAGGTCCAAAGAAATCAGAAAATTA CAAAGTTCATATTTGTACTTGGTTTATATATTGATGTCTTTTGCAAAGCAGGAAGGGAATATTAACCTTGAGGCTAAGGA GGCACTTGTTCAATGCATTTCTGCTTACAAGGAGGTAAATTTTAACTATTTACGTGCTAGTTTTTCGTGTGAGCAATGCA TATTGCATACTCTTAATTTGTTACACGAATTATTCATAATAGGTAGTTGAGATAGTAAGCAATAACCATAAAGGGACCAG AATAATTAGGAAATATTCTTAGAGCCTGCTTGGTAAAGTATGAAAATGGGAAAAAAACACATCCCGATGCACTTTTTGTT GAAGTCCTAAGCATTTGGAATACTGGATAATTTTTTGTTTTTCTTTGATGAAAGCATTGATATATACTTTCGCCAAGACT TTTTTCTTTATTGAGAAAGAAGAGAAGTTACGATGAGTGTCATAATTTATTTACGATCTCAAGTTTTTTCGGAAAAATAA AAAAAAGTTCTGTAGAAAATAAGGTTTTACATATGCGATGTTCTATTGATGGTTCCATTTCAGAACTCGCATACAATGGG CAATGGGGTAATTGGATCCCTATGAGATATCAAAGTAGGTAGTTGATCATTAAATTCTTGATATTCCAGAGATTTTACAT GCTAAGAAAATTTGATCAAGAAAATTTGTATGAAGGTGCACACATGGATATTGGTGATGAGGAATTATTTTTGAATCTCC TTAATTTTGTGTGTATGCATACAAATTTGTTGCTTCATGAATTACATGTAACATGAAATTAAACACAGCATCTGACCATT TACATTGTTTTGATCAAGCATATATTTGTCACATATTTCATCTCTTCACTTCCAGACTATTCCTATCCACTAATTTTACA GCTCTTGAATTCTAAAGTACTGTTTACATTTGGATAATAGAGATCATATATGCATTTGCATTCTGTTACATTCAGCATTT GCAAATAAGAATGTGAACATCTTTCATGTATGTCTTTGAGAAGGGATCTTGAAATTTTATCACAACTTTACTCTTACTCT ACAGTTTGTGCATGAGAAGTCAGTTGCTGATGCCCCTGAAATAAAGAACGAGCATCTTTCCTGTTTAAAGCGCATTCAAA ACTTGCTTGGCAATAAATTGGATTAAGAGCCAAGCAATCAAAGGGATTTCCAAAAGCTGAATCAAACATCTGATAATAAT TTTTTTGTATAAATTTTTGGGTTACTTGAAGTGGGAATTTTTACTCAAAGGAAATGAATAGACCAATCTTTGATACGAGC TCAATTTCTGCAGCAAAAACTCCTCTAAAGTGAGCTTATCTCCAAAGTGAGAAAATAAGAGTGTGTTTACTTTTGAATTT ATTGTTAAGATTACAATGTATTTTCAATTAAATCAACGATGAATGTATCTTTACTTGCTTAATTCAGGGACACTCTAATG TAAGCTTAACATGTTCAGATTAACTTTTTTTTTCCCAGAATTAATTGTAACACAGAAGCTACTCACATAAGCTTCTTCCT ATAGTTAATTTTGACTTAAAAATCAATTTTATAAATATTTCTAAACATACATTAATACAGGGGAGAGGTGTGGGAGAAAT TCTTGAGGATTTCAATTAATATCCCATTTATATCATATTATAAA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0055200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTCTGCGGGTAGCAGCAGCAAATTTGCTCAAAAAATTTCGCTTTCCTTCTTCTCGAGCCTTCCCTGCCTCTACCGT ACCCACAAATTCATTGCCCATCTCATTTTCTGGTAAAGTTAGACTTTCCCACTGGTATCAAACTAGAGCATACAGTTGCA GAGATCCTTGTCTTTGGATTGTTGTATCTGGATATGCAGCGGTGACTCTGGGGATTAGTGCCTCCACTGTTTTTGCTGAA GATGTATCAACTGAAACTTCCATTGATAATGACTCTGGGGATGAGTTAAATGGATTCAGAAAAATTGAGGATGGTTCTGT AGTATCAAATACACACACAGCAAAATGGAGAATCTTTACTGATAAAGCCAGAGATTTTTTCCTACAGGGAAAACTAGATG AAGCTGAAAAACTCTTCCTTTCTGCTGTGCAAGAAGCTAAAGAAGGTTTTGGCAAGCAAGATCCACATGTTGCATCTGCA TGCAACAATCTGGCAGAGTTTTACAGGATCAGAAAGGAATTTGACAAAGCAGAACCGTTGTATTTGGAAGCTATCAACAT ATTAGAGGAGTCTTTTGGTCCTGATGATATACGGGTTGGGGCTGCTGCTCATAACCTTGGGCAGTTCTACCTTGGACTGC GAAAGTTGGAAAAAGCCCGTCTTAGCTATGAGCGCGCTTTGAAGATAAAAAGGCGTGTTCTAGGATATGGCCATTCAGAA TGTTCAGATACAATGTATCATCTTGGGGTGGTGCTGAATCTTGAAGGAAAAGAAAGAGATTCTGAGTTACTGATTCAAGA CTCTATAAGGATGCTAGAGGACGGCGGGGAAGGGGAGTCATTTGCATGCATTAAAAGACTTCGGTACCTCTCAAAGATAT ATTTGAAATCACATCGTCTTGCTGAGGCAGAGATGGTGCAGAGAAAGATCCTGCATATTATGGAATTGTCAAAGGGATGG AATTCCTTGGATACAGTTATTGCAGCTGAAGCTTTGGCTCTTACCCTGCAAGCATCTTGCAATACAAAAGATTCAAAAGA GCTTCTTGAAAGATGCCTTGATGCCCGAAAAGCAGTACTTCCTGGTGACCATATTCAGATTGGTGCAAACCTACTTCATT TGGCAAGAGTGGCAATGCTTGATTCCAGCCAACATAAAAAAGGGGATGTTTCTAGAGCCAAATCTGAGCTCGAGACGGCA AAGGGCCATTTGCATAATTCCATAAGAATAGCACGCCAATTTCTCAATAAGATATTGAAACAAAAAGATAAGCGGAAGAA ATACAGTGTGCCAGGAGATGCTAGAAAGGAAGGCCAAGCTGCGTTGCTCATATTGTTGCAATCACTCAGTACTTTGTCAT CATTGGAGTTGGCTATGGAAGAATTAACGGAAACTCAGGAAGGGAATATTAACCTTGAGGCTAAGGAGGCACTTGTTCAA TGCATTTCTGCTTACAAGGAGTTTGTGCATGAGAAGTCAGTTGCTGATGCCCCTGAAATAAAGAACGAGCATCTTTCCTG TTTAAAGCGCATTCAAAACTTGCTTGGCAATAAATTGGATTAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0055200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSLRVAAANLLKKFRFPSSRAFPASTVPTNSLPISFSGKVRLSHWYQTRAYSCRDPCLWIVVSGYAAVTLGISASTVFAE DVSTETSIDNDSGDELNGFRKIEDGSVVSNTHTAKWRIFTDKARDFFLQGKLDEAEKLFLSAVQEAKEGFGKQDPHVASA CNNLAEFYRIRKEFDKAEPLYLEAINILEESFGPDDIRVGAAAHNLGQFYLGLRKLEKARLSYERALKIKRRVLGYGHSE CSDTMYHLGVVLNLEGKERDSELLIQDSIRMLEDGGEGESFACIKRLRYLSKIYLKSHRLAEAEMVQRKILHIMELSKGW NSLDTVIAAEALALTLQASCNTKDSKELLERCLDARKAVLPGDHIQIGANLLHLARVAMLDSSQHKKGDVSRAKSELETA KGHLHNSIRIARQFLNKILKQKDKRKKYSVPGDARKEGQAALLILLQSLSTLSSLELAMEELTETQEGNINLEAKEALVQ CISAYKEFVHEKSVADAPEIKNEHLSCLKRIQNLLGNKLD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 23 | 23 | - | – | |
| PANTHER | 3 | 518 | 516 | 2.5E-226 | – | |
| Gene3D | 109 | 282 | 174 | 4.2E-33 | ||
| SMART | 116 | 149 | 34 | 57.0 | ||
| ProSiteProfiles | 116 | 149 | 34 | 5.074 | ||
| SUPERFAMILY | 116 | 257 | 142 | 1.97E-20 | ||
| SMART | 158 | 191 | 34 | 0.0036 | ||
| ProSiteProfiles | 158 | 191 | 34 | 7.375 | ||
| ProSiteProfiles | 158 | 233 | 76 | 10.877 | ||
| Pfam | 159 | 231 | 73 | 3.9E-14 | – | |
| SMART | 200 | 233 | 34 | 0.3 | ||
| ProSiteProfiles | 200 | 233 | 34 | 8.29 | ||
| Gene3D | 283 | 487 | 205 | 5.9E-9 | ||
| Coils | 455 | 475 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0055200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…