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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0108500 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0108500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | N-alpha-acetyltransferase 25, NatB auxiliary subunit; TAIR: AT5G58450.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9VDQ7|NAA25_DROME Phagocyte signaling-impaired protein; TrEMBL-Plants: tr|K7LR08|K7LR08_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0108500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:24668163..24684023) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CACACCATTCTAAACCTCCAATCCAAAGCCCAGTAGAGTTCATTTTTATACTAACTTGTATTCTATTCTACTACTTCTAG CTAGGTTTTCTTTCTTCCCCTTCCTTTGGGATACTCTATCTCTACAACAGTCTCTTACCCTTCAACCATTTCAAAAGAAG AAGAAGAAGCAAAAACTCACACACTCACCTCAATTTTCTTCTTCTTCCTTCGATTCCAATGGCGTCCAAGTTCGGCTTAG CTGGTGGAATTCCAGAGCGCAAGGTTCGTCCCATATGGGACGCCATTGATTCTCGCCAGTTCAAGAGCGCTCTCAAGCAT GTCACCACTCTCCTCACCAAGCACCCTAATTCCCCTTACGTTCTCGTAAGATCCTCAACCTTCAATTCCTTTATCTCTTC TCATTTTCACATGTTTTTACCCTTTTTGGTGATGATGATGATGATGATTTCGGTTTTCCTTCATTAGGCTCTCAAAGCTC TCGTTTTGGAACGAATGGGGAAGCCCGACGAAGCGCTTTCGGTTACCCTCAATGCTAAGGAGCTTTTGTATGCCAAAGAA TCTCTCTTGATGGATGATCTCACTCTCAGCACACTGCAGATTGTTTTCCAGCGACTGGATCACTGTTAGTGTTGTTCAAT TTGGTTTTAATTTTTGGCTGCTTGTTGGGTGTGATTTTGTTACATGCAGTGTTTTGTTGTTGACTGAGTTTTGTTCATTT GATCAGTGGATTTTGCTACTGAGTGTTATGAACATGCCTGTGCTAAATTCCCCAATGACAAGGGATTAATGATGGGGTTG TTTAACTGCTATGTTCGCGAGTACTCATTTGTGAAGCAACAACAGGTTTGGCTTTGTGTGTGTTTATTTTATTCTGTTTG TTATTTTTATGATTTATGCTTTGTTGTTTTCTGATTGGCAGACAGCTATTAAAATGTACAAGCTCTTTGAAGAAGAAAGG 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CDS sequence (LotjaGi6g1v0108500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGTCCAAGTTCGGCTTAGCTGGTGGAATTCCAGAGCGCAAGGTTCGTCCCATATGGGACGCCATTGATTCTCGCCA GTTCAAGAGCGCTCTCAAGCATGTCACCACTCTCCTCACCAAGCACCCTAATTCCCCTTACGTTCTCGCTCTCAAAGCTC TCGTTTTGGAACGAATGGGGAAGCCCGACGAAGCGCTTTCGGTTACCCTCAATGCTAAGGAGCTTTTGTATGCCAAAGAA TCTCTCTTGATGGATGATCTCACTCTCAGCACACTGCAGATTGTTTTCCAGCGACTGGATCACTTGGATTTTGCTACTGA GTGTTATGAACATGCCTGTGCTAAATTCCCCAATGACAAGGGATTAATGATGGGGTTGTTTAACTGCTATGTTCGCGAGT ACTCATTTGTGAAGCAACAACAGACAGCTATTAAAATGTACAAGCTCTTTGAAGAAGAAAGGTTTCTTCTTTGGGCAGTT TGTAGCATCCAACTTCAGGTACTTTGCAGCAATGGAGGAGATAAGCTATTAGTTTTAGCTGAAGGCTTACTTAAGAAACA TGTTGTTTCACATAGCTTAGATGAGCCTGAAGCTCTTATGGTCTATATTTCCATATTGGAACGTCAAACTAAGTTTGGGG ATGCTTTGGAAATTCTTTCTGGGAAATTGGGATCGCTATTGATGATTGATGTTGACAAGCTACGGATGCAGGGGAGACTT CTGGCTCAGGCAGGTGACTACACCGCTGCTGCTGATATCTTTCACAAAATCCTAGAGTCATGTCCAGATGACTGGGAAGG TTTCCTGCATTACTTAGCCTGTTTGCTGGAAGATGGCAGCATTTGGTCTGATGAGGCTGTTAATGATCCAGTTCACCCCC CAAAATTTGTCAATTGCAAAGTTTCACACTTGACAGATGAACAGTTTGACAGTCAAATATCAACAGCATCAGTTTTTATA CAGAAGTTACAAGCTGATACTGTGAATAATTTGATAAGGTGTCCATACCTGGCATCTATAGAAATTGAAAGAAGAAAACA TTTACGTGGGAAGGAGAATGATGAGAACTTAATGGATAGCATTGTGCAGTACTTTTGCAGGTTTGGTCACTTGGCCTGCT TCACTTCTGATGTTGAGATGTTTGTTGAAGTCCTGTCTACCGATAGGAAGGCAGAGCTCTTGGAGAAGTTAATGAAAAAC AGAAGTGCTTTATCAGCTCCACCAAAGAAGACACTCGAGCTTTCTATAAGCCTTTTCAAAACTAAACAATTATTGCTAGG GGACATGTTCAAGTGTTCTGAAAGTGATCTTGGGGTCTTTTGTGTTCAAATGTTTGAAATGTATTGCAAGAACCTTCCGC TTTCAAAAGATTTGGATCCTCAAGAGAGTATGCATGGTGAGGAGCTGCTTTCAATGATATGTAATCTTTTGGTCCAGTTA TTCTGGCGTACTAAGAGTGCTGGCTACTTGATAGAGGCAATTGTGGTTTTGGAGTTCGGCTTAGCCATACGAAGATATGT ATCACAGTACAAGATCTTGCTGTTGCACTTGTATTGTCACTATGGCGCTCTTTCAGTAGCACATGAATGGTATAAATCAC TGGATGTGAAGAATATTTTGATGGAAAGTATGTTGCACCATATTTTGCCTCAGATGTTGGTATCTCCACTTTGGACTGAT TTAAACTGTCTGCTAAAGGATTACCTGAAGTTTATGGATGACCATTTCAGAGAATCTGCAGATTTAACATTTCTTGCATA TCACCATAAAAAGTACTCAAAAGTAATTGAATTTGTCCAGTTTAAGGATAGGTTGCAACACTCTAGTCAGTATTTAGCGG CTAGAGTTGAAACACCCATTTTACAGCTAAAGCAGAATGCAGATAACATCGAAGAAGAAGAGGGCATACTTCAAAGCTTG AAATGTGGTGTTCACTTCCTTGAGCTATCTAATGAGATTGGGTTGAAGTCTTTGACCTTCAATGAAGACTTGCAGACACG GCCCTGGTGGACACCAACTTTGGATAAAAATTACCTCTTAGGGCCATTTGAAGGGATTTCTTATTGTCCTCCTAGAGAAA TACCGACCAAAGAGAGGGAGGTGAGTTTAAAGAGGGTCATTCAGAAGAAATCCCTACTTCCTCGGATGATCTATCTTTCA ATTCAAAATGCCTCAGCATCAATCAAAGAGCATGTTGAGGTCAATGGTTCTGTTACACCAGACATCACTTTGGAGCTGAA ATTATTGCTTGAGCGCTATGCACAATATTTGGGCTTTTCTTTTAATGAAGCAATAGAAGTGGTCATGGATTTCTCTAATG GTCAACGTTCTTCCGTGGTCTCTGACTCCAACTTAATTGACTGGTTGAATTTCATGGTATTCTTAAATGCGTGGAGCCTA GGTTCCCACGAACTTGGGCACCCTGATAGCAATGGATGTAGGCCTCGTATTTGGAATACCTTAGACTCTTTGCTGGAGAA GTATATTTTGGAGAAGGTTAGGTCCATAGAGCCCCATCTCAGTTCTCCTTGTAGTGACATTCAACTTTTGATGCAATTAG TTACGGAACCTTTGGCCTGGCATGGACTTGTGATACAATCTTGCTTGAGATCATGTCTTCCATCGAGTAAAAAGAAAAAG AAAAGTGGATCCGCTCATCAGTCTAGCTCAAATCTGGTGCATGCAATCACAGATTCTGTCCAGAATTTATCTCTTGTCTT GGAGGATGTTATGAAATGGATAAGTGAATGGAACAGAAGGCCTGAAGATCAGAATTTGGAGGACATTCTCTTGCTTCTTC GGAAAGGTGGTCAAAGTGATGGGCCAGGGAAGGTCTTTCACATTTTAGAAACTTTCATTTCCTCTATGAATGATGAGGAA CTCGGTGATCGCATCTCCCAATCACTCAAGTCTTGGAGTCCTGCTGATGTTGCCAGGAAAATGATCACCGGGAAGCTTAA AGTGTTGACAGAATTTTCTGCCATCTGCGAGTCAAAATTGAAGTTATTACAATCTGTGAAACAGCAGCTTGCTCAACTTT GA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0108500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASKFGLAGGIPERKVRPIWDAIDSRQFKSALKHVTTLLTKHPNSPYVLALKALVLERMGKPDEALSVTLNAKELLYAKE SLLMDDLTLSTLQIVFQRLDHLDFATECYEHACAKFPNDKGLMMGLFNCYVREYSFVKQQQTAIKMYKLFEEERFLLWAV CSIQLQVLCSNGGDKLLVLAEGLLKKHVVSHSLDEPEALMVYISILERQTKFGDALEILSGKLGSLLMIDVDKLRMQGRL LAQAGDYTAAADIFHKILESCPDDWEGFLHYLACLLEDGSIWSDEAVNDPVHPPKFVNCKVSHLTDEQFDSQISTASVFI QKLQADTVNNLIRCPYLASIEIERRKHLRGKENDENLMDSIVQYFCRFGHLACFTSDVEMFVEVLSTDRKAELLEKLMKN RSALSAPPKKTLELSISLFKTKQLLLGDMFKCSESDLGVFCVQMFEMYCKNLPLSKDLDPQESMHGEELLSMICNLLVQL FWRTKSAGYLIEAIVVLEFGLAIRRYVSQYKILLLHLYCHYGALSVAHEWYKSLDVKNILMESMLHHILPQMLVSPLWTD LNCLLKDYLKFMDDHFRESADLTFLAYHHKKYSKVIEFVQFKDRLQHSSQYLAARVETPILQLKQNADNIEEEEGILQSL KCGVHFLELSNEIGLKSLTFNEDLQTRPWWTPTLDKNYLLGPFEGISYCPPREIPTKEREVSLKRVIQKKSLLPRMIYLS IQNASASIKEHVEVNGSVTPDITLELKLLLERYAQYLGFSFNEAIEVVMDFSNGQRSSVVSDSNLIDWLNFMVFLNAWSL GSHELGHPDSNGCRPRIWNTLDSLLEKYILEKVRSIEPHLSSPCSDIQLLMQLVTEPLAWHGLVIQSCLRSCLPSSKKKK KSGSAHQSSSNLVHAITDSVQNLSLVLEDVMKWISEWNRRPEDQNLEDILLLLRKGGQSDGPGKVFHILETFISSMNDEE LGDRISQSLKSWSPADVARKMITGKLKVLTEFSAICESKLKLLQSVKQQLAQL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 10 | 927 | 918 | 7.9E-265 | – | |
| PANTHER | 10 | 927 | 918 | 7.9E-265 | ||
| Gene3D | 20 | 287 | 268 | 2.6E-15 | ||
| SUPERFAMILY | 24 | 279 | 256 | 9.76E-11 | ||
| ProSiteProfiles | 231 | 264 | 34 | 8.519 | ||
| ProSiteProfiles | 231 | 264 | 34 | 8.673 | ||
| Pfam | 303 | 632 | 330 | 4.2E-51 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0108500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…