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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0173200 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0173200.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | VAC14-like protein; TAIR: AT2G01690.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9ZU97|VAC14_ARATH Protein VAC14 homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VR25|A0A072VR25_MEDTR VAC14-like protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0173200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:46165277..46195805) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCAAGCTTTGGCCTTTGTGTGTTGTGCTGTGTTTTCCTTCACGTAAACGCCGTTAGAAGCTGTCTATTTTCCATCCATCC ATTTTCAAATTCCATTTCTCCCTTCATTTTCATCCCTCCTTTTTCTCTCCCTTTTCCCTTTCTTTTCCACTCTAGGGGTT TTCAATCTTCCTCAAATTCCCAATTCAACGACGTCGTTTCAAGATGATACCCCCGGGCCTCGAAGCGCTTCTCAACCGGA AACCCCCCAAGAACCACCGCAGTCCACAAACGAAAACGCTTCTTCCGGCGAGGAACAGCGATGGGGTTGAATCCCCTGGC CTCGTTGAAGCTCTTGTTCAACAAGGTCTCTACAATGTCCGCAATGTCTGCGTTCCTCAACATTCTCATGGGTTTGCGTT TCTCCAACAAGGCAACAACCATGGTGGACGTTCTCTTGGTGGTTACGGCAGCCGTGCTCTGCACCCTCGCGCGCAAGAAT GCTGCCCTCGAGGTTTTTCGATTTCCCTTTTCCTTTTCCTCGAGGTTAATAATGCAATTGCAACTTGGGGAATGCTTAGG GTTTTGTGGTGCGGGTTCTTGGAAATAGGTTAATAATGCAATACTGAAGCAGCTTGCTACTGCTGTGATCAATTTGCTGA CTACAGAATACACTTATTATTCCAGTTGATTCAATTTAGGGAGGGTTAATAGGCTTGGCTGCATGAAGCTTTAAGGTTTG CCCACTAGTTACTGGAATGTATAGTTTTTGAAGTCTGTATTTTTTTTCTTTTATTAGGTTGTTTTTGTTTCTGTTTTAAA CTTGTGTACGATGGGTTGCAATTTGAACCGTTTCCACTCGTGACATTATGCAAATTCATTCTGAGTATATCTTAGAAACT TGGGAGTAGTAATTGGGTCTAGTGGAAGAGAATATATGAGCTCTGTGTGTGTTTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGGAA 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GAATGTGAGTCCATAAATCGGATCCCTAAGCCGAGATGGTTAATGACGTGAACAATGACCCTAAAGTCGTGAGATGACTA ATTCTCAATATGGACCCTAGTTGCCTTTCAGATAATGATAATTTGAGGGCTAACAGTTTTGATGGAAATCATTATCGCGA GTCCCTCAAACGAGTCCCTTAAACAAGATGGCTAATCATGTGAACAATGACCTTGAAGTTAAGGGAATGCTATTTCAGAT TATGGACCATTAATAATAATTCCAGGCCTGACTGTTTTGATGGAAATCATCAATAAATAAGTCCCTAAAACGAGATTGTT AATCATGTAAACAATGACCTTAAAGTCATAAGAATGCTAATTCTGATTATGGATCCTTGTTGCCTTTCGATTAATAATTT TGGGTTGACCCTTTTGAAGGAAATCATCAATGCGAGTCCCTAAACAAGTCCCTAAAACGAGATGGTGAATCATGTGAACA ATGACCCTAAAGCCGTTAGATTGCTAATTCTAATTATTAACCCTTGCTGCCTTTTTAATAACAATTTGAGAGATGACCCT TTTGACGGAAATCATCATTGTGAGCCCCTAAATTGAGTCCCTAAATTATGAAGGTTAATCATGTGAACAATGATACCAAA GTTGTGAGATTGCAAATTCAGATTATGACTCTTGTTGCCTTTCAAATAATGATAATTTTAGGGCGGACACTTTTTATGGA AATCATCAATGCGAGTCCCTAAAACGAGATGGTTAATGAAGTGAACATTAAGACCCTAAAGTTGCAAGAATGCTAATTCT GATTATGGACCCTTGTTGCCTTTTGAATAATAATTTGAGAGATGACCCTTTTGACGGATATTATCAATGCGAGTCTCTAA AATAAGTCCCTAAATTATGATGGTTAATCATGTGAACAATGATACCAACAGTCGTGAGAATGAAAATACTTATTATGGAC CGTTGTTTGTTTTCGAATGATGATAATTTGAGGTCTGACCCTTTTGACGGAAATCATTAATGCGAGTCCATAAAACAAGT CCCTAAAGCGAAATGGTTACTCATGTGAACAATGACCCTAAAGTAGTCAAATGGCTAAATGAGATGGCTAATTCTAATTT GAGGGCTGACACTTCTGATGGAAATCATCAATGTGAGTCCCTAAACAAGCGCCTAAAACGAGATAGTTAATCATGTGAAT AATGACCCTAACGCCGTTAGATTGCTAATTCTGATTATTGACCCTTGTTGCCTTTTTAATAATAATTTGAGAGATGACTC TTTTGACGGTTGCGAGTCCCTAAATTATAATGGTTAATTACGTGAACAATGATACCAAAAGTGGGGAAATTGCAAGTTCA GATTGTGGACCCTTGTTGGCTTTCGAATGATAAAAATTTGAGGGCTAACCCTTTTGATGGAAATCATCATTGTGAATCCC TAAAATGAAATAATTAATCATTTGAACAATGTCCCCTAAAGTCGCGAGAATGCTTATTCTGATTTGGGACTCTTGTTGCA TTTCGGATAATGATAATTTGAGGGCTAATACTTTTGACTGAAATCATTAATGCGAGTCCCTAAAAAGAGTCCTTTAACAG TGTGGTTAATCATGTGAACAATGACCCTAAAGTCTCGAGAATGCTATTTGTGATTATGGACATTTGTTGCCCTTCCAATA ATGATAATTTGAGGGAGGGCACATTTGATGGAAATCTTCAATGCGAGTCCCTTAAACGAGATGGTTAATCTTTTTAGCAA TGTCCCTGAAGTCGCAAGAACGCTAATTCATATTACGGACCCTTGTTGCCTTTTGAATAATTATTTGAGAGATGACCCTT TTGACGGATATTATCAGTGCGAGTGCCTAAATTATGATGGTTAATCTTGTGAACAATGATACCAAAAGTCGTGAGCATGA 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AAACAAGTCCCTAAAACGAGATTGTTAATCATGTGAACCATGACCTTAAAGCTGTTCGATTGCTAATTCTGATTATTGAC CCTTGTTGCATTTTTAATTATAATTTGAGAGACGACCCTTTTGATGGAAATCATCATTGCGTGCCTCTGAATTATGATGG TTAATCATGTGAACAATGATACCAAAAGACGTGAGATTGCAAATTCAGATTATGGATCCTTGTTGGCTTTCGAATGATGA TAATTTGAGGGCTGACCCTTTTGATGGAAATCATCAATGTGAATCCCAAAAGTTAGATAGTTAATCATGTGAACAATGAC CCTAAAGTCGCGTGAATGCGTATTCTGATTTGGGACTCTTGTTGCCTTTCGGATAATGATTATTTGAGGTCTAATACTTT TGATTGAAATCATCAATGCGAGCCCCTAAAATGAGTCCCTGTAACAATATGCAATATGGCTAATCATGTGAACAATGACA CTAAAGTCGTGAGAATGCTATTTGTGATAATGGACATTTGTTGCCTTTCAAATAATGATAATTTGAGGGCGGACACTTGA TTGAAATCATCAATGCGAGTCTCCTAAACGAGTTTGTTATTGAAGTGTACAATAAGACTCTAAAGTCGCAAGAATGCGTA TTCTGATTGCGTATTCTTGTTGCCTTTTGAATAATAATTGGAGAGATGACTCTTTTGACAGAAATCATCATTGCGAGTCC CTAAATTATGATGGTTAATCATGTGAAATGATACCAAAAGTCGTGAGATTGCAAATTCAGATTATGGACCCTTTTTGGCT TTCGAAGGATGATAATTTGAGTGAAGACCCTTTTGATGGAAATCATCTATGTGAATCCCTAAAATGAAATAATTAATCAC ATGAACAATGACCCAAAAGTCGCTTGAATTGAGGGCTGATCATTTTGATGGAAATTATCAATGCATTTCCCTAAAACGAG ATGGTTAATCATGTGTACAATGATTCCAAAAGTCCTTAGAATGTTAATTTTGATTATAGGTCCGTGTTGCCTTTCGAATA ATAATTTGAGAGATGACTCTTTTGACAGATATTATCAATGCGAGTCCCTAAATTATGATGGTTAATCATGTGAACAATGA TACCAAAATTCTTGAGAATGAAAATTCTTATTATGGATCATTGTTGGTTTTCGAATGATGAAAATTTGAGGTCTGACCCT TTTGACGGAAATCATCAATGGAAGTCCATAAAACAAGTCCATAAAGCGAAATGGTTAATCATGTGAACAATGACCCTAAA GTCGTGAGATGGCTAATTCTCATTTTTGGACCCTTGTTGCCTTTCGGGTAATAATAATTTGAGGGCTGAGACTTTTGATG AAATTATCATTGCGAGTCCCTCAAACGAGTCCATATAACAAGATGGCTTAATCATGTGAATAATGGCCTTGAAGTCTCTA GAATGTCATTTCTGATTATGCACCATTATTGCTTTTCGGATAATGGTAATTTTAGTCCTGACCCTTTTGATGAAAATCAT AAATAAATAAGTCCCTAAAACGAGATGGTTAATCATGTGAACAATGATACTAAAGTCATGAGAATGCTAATTCTGATTAT GGACCCTTTGTTGCCTTTCGGATAATAATAATTTTAGGCTAACCTTTTTGAAGGATATCATCATTGCGAGTCCCTAAAAG GAGATGGTTAATCATGTAAACAATGACCCTAAAGCCGTGAGATTGCTAATTCGTTTTATGGACCCTTGTTGCATTTTGAA TAATAATTTGAGAGATGCCGCTTTTCCCGGAAATCATCAATGTAAGTCCCTAAATTGAGTCCCTAAATTATGATGGTTAA TCATTTGAACAATGATACCGAAAGTCGTGAGATTGCAAATTTTGATTACGGACCCTTGTTGGCTTTCGGATAATGATAAT 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GGCTGACAGTTTTATTAAAATCATCATTGTGAGTTTGTTGCCTTTCGAATAATGATATTATGAGGGCTGACAATTTTATT AAAATCATCATTGTGAGTCCCTCATACGAGTCCCTAAAACAAGATGACTAATCATGTGTACAATGACCTTAAAGTCGCGA GAGTGTTATTTTGGATTATGCACTTTTATTGCCTTTCAGATAATTATAAATTTAGGGCTGACCGATTTGATGGAAATAAT CAATAAATAAGTATCTAAAATGAGATGGTTAATCATGTGAACAATGACCCTAATGTCGCAGGAATTGTAATTCAAATTAT GGATCTTTGTTGCCTTTCGAATAATGATAATTGAGGGCTGACCCTTTTGTGGAAATCATCAATTCGAGTCCTTAAAACAA GATCCTAAAACAAGATGGTTAATCATGTGAATAATAATTCCCAAAGTCACGAGAATGCTAATTATGATTATGGACCTTTG TTGTCTTTCGAATTATGATAATTTGAGGGCTGACCATTTTGTTGGAATTTGGAAATCATCAATGCGAGTCCACTAAAACG AAATGGTTAATTTGTGAACATTGACCCTGATGTCGTGGAAATGATAATTCTAATTTTGGACCTTTGTTGTCTCTCAGATA ATGATAATTTGAAGGCCGAAACTAATGCGAGTCCCTAAAACGAGATGGTTATTCAAGGAACAATGACCCTAAAGTTGTGA GAATGCTAATTCTGATTATAGACCCTTGTTGCCTTTCGAATAATGATAATTTGAGGGTTCATTCAAATTTGGTGCGAGAC TAGTTTTCTACCATGGTTCCTTTCTTAATTGTACTTGTGTCTTAGTCTCTTTCCGTCATTGTTTTCTTTTAAACCATGTA TGTGTATGAGCGGCCTTTCGAAATCATGTGTCGTTTTTCTTAGGCTTTTGTCCATTGCAGAAGAGGCTTTAGCAAAATAT ATTTCCAAGGCCACCGCTGGAACTGCTGTTGAGTGGTTCTGATGCCTGGAATGAAGGTGATCCAATAACTATTAATTCTT TTATTCAGAAAATTATTTTCTTATCACACAGAGTGGCTAACTATGAACCAAATTGACACCTTTAAATAACACACCCCAAA CTGCTGATAGTTTTCTTTGTTAATAAGGGTTTTTCTTCTATTTATAAATTGTTGTGCTTGTATTTAAGGATGGCATAATC AACAACAGTCTCTAAAGGTTGCCGAAATCCTTAAAGATAGGCCTTCCCGATATTGTGATAGCTAAGCAGTCGACGTTTTA AATGTGCTTCCCATAGCAAATGGTGGATAGAGCTTCTATATATACAGGTAAAGCTACTCAGTGTGTATGAATGATGATTC CATTACTTAACGGACTATATGTCTTGCATGGTTGGATTATGACTCTCTGTGACTTCACAAACTAAATCTCTTATTTGCAT CCTTTACTCCTTGATGATAAGCTATATCACCAATCACACTGTCACCTGCTCATGACTTCTGGTGGTGCGCTACAAATCTG GAACAGGGGAAGAAGGTGAGTGTCGTGCCCTTCATTAGCTCCAAAGAAACAAGGGATGATGAAGTCCCACCTGTCTTTTC AAGCAAAGTTGCTTAATTTCTTATTTATGTGAATTTGCAGATGGTTTTCTGTCTCCTTGAAGCTGGGAATTAGACAAGCA AGCTTGCTGTGCAGAGACAACTTCAAATCTTGTTGATTTATTTGGTAATTTTTCTCACTTTTATTTTATTTTGACGTTAT GATTTTTATGATAACATGTAAATTGGGAGAGGTGCCTTCAAAGATGTGATTTTTAACCATAAGGAAATGTAAATCTTGTT CTCAGTCCTTTTAATATAATGTTTGTAGTGTTTCTTCCTATTCATTTTATGCAAAAATGTATGTTCTTTTGAACTTGGCT TCATGGAAATGCTATGTATAAAGTTTCCGTGCTTTAGTTGCTGATCTTGGTGTTATCTCTTTCTTTATTGTATTTTTTAT TCTTAGAAATATTGTGCTTACCTCAAATTTGGTGCCAGACAGTTTTTCTACTATGGTTCCTTTCTACTATGGTTGCCTTT CTGTGTCCTGCTTGGTGCGTATATGTGTGTCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAACAGTTTCTGTTACGC TCTATTGGTTGTGGGTGTGTGTGTCCAAATTGCCCTTATAATTTCAACAAGTATAGAACAGCTGATCCAGTTAATTATAT CCTCATTCAGTACATGTTGAACCTGAACAAGCTCTCACAATTCCAGAGATGATTAGTTGAATGAGGCATAAGTATTGTGT AGAAATATACTTATGGTTTGTATAAAGAAAAAGATAATCGTAAGTTAGAAAATATAAGTGTTGTATATAAAAATAATCCA TATATGCCTGACATCCCACTATAGGCAGTTCATGACGTGTACAATCTTTCTTTTTCAGATATGCTGCACCAGAACAGTAC ATCATGAGAACGCCAACCACATTTACACCTTCAGCTCCAGTTGCAAAACTGCATTGTCCGCTGTCTCATGGCAGGTTAAA CATTTTTTATGAATGATCCATGGCTTTAGAAGATAAATAACTTACTTTATCTTGTCATAATATTTCCTTATGTTACTTGT CATGGTTTTCTTGTTTCAAACAACTGAATTTATAGTGCTGGTCTAATCGTTCTTCAAATGGTAAGTATCAAATAGTATTG AAACTGATAGCAAGCTTCTATTTCTGTTATTCGAACTAATTGGTCAATTTCCATAATAAGTCCCCTTGATATTCCGTAAA TTAATATTAGTAATTTCGAAGTTAAAATGAGTTTGGTAATGTATTACACCCTTAGATTTGATTGTGTTGATCTATTAAGA ACTTCTATTTAATGAAAACCTTTCTACAGGTATGTCTAGATTTTCTACAACCCAACTGACTTTGCACTTAATCAACTCCG AAGTTTCTTTTGCAAAATGCAAATGGTGTGTCTATGTATCTATCTGTACATTCATGGTTTGTGTTTCTCATACCTTTGCA GTGTCAATAGTTTTTTTTCTTTTGCAATTCAGTGATCGGATTCTTAATTTCTTTGTCAATGCTGATATGCTTCTCGTTAG TTTTCTATTTGCTTACTAATATTCAGTTTATGTGCAGTAACTTAGCATCTCCGGCAACCCTCCAGACTTTATTTTCTATT CGTTTTCAGTAAGCTCTTCACTTCTTGCACTCGTTTCCATGCTCTAATCACACACGCACGGCGGCACGGGAGAGTTCAAG TTCAAGTTCTTCTTATTGAGAACCAGGTTTAGATAGCAAAAGAAAAGTAAACTGAATTGAGTTTTGTTACTGATATTCTA ACCAAATACTAGAGGTGTCTCTTAATATATAGGTACTAGAGAGTGAGAGAAGCTAAATACAGGAACTAAAAAATCTAACT AAAAAATCAGTTACAAAGAGTAAACTGACTCATCAACTAACAGCTCGTAACATCCAGTTGACACTATAACTAACTAGCTC TATTCTCTAATAGTACCCCTCAAACTCAAGGTGGGAGAGAAAGAGTTTGTTGACCACATTGAGTTTGTCCCTTACAGCCT CATACCGAGTTGGAGATAGTGACTTAGTGAAAATATATGTCTAGGGTATGTGATGCAAACAGTGTATTGTTGAGAACCTT TTCTCGAAAGGAAGAACATGTCTAACTCCATGTGTTTTTTTGTTTGTTGGCTTCTTGGTAGTTTTATTGCACTTTTTCAT CTTTGGGTAGTCCTTGTTGAGCTTTTCTTGATTGTCTTTGTGCTACCCATTGTTTTGTCATATGTTTGTTTTCTATTTTA CCTCTGAAGTTTGTAAAGTGTTTGAAGGGACTCCATAAGACCACCTTTAATCTCACACTTCGTTACATCTTCAAGTGTGG TTTTCTTTTGAGAAAAGGTGGAAAAGAGATAAGAAGCGGAACAAAGTCATAAAAAGTATGATACAAGAGTGAGGGGCAGG TGAGTGAGAGGAAATTAAAAAGAAAAAAGTGAGATTCTCATGTTGAATATTCACTAGTTTGCCACTTTTTCCATTTATTT TATTTTCTCTTATTTTCTCCTTTTACAATTGTATTGTTTGTTATAGTACGTTTGTATTAGGAATTCTCATTGTAATTTTT CTTGCTAGATTGTATCTAGGATCAAATCTTTGTACTTTATAGTTCCTTTGTATTATGATATAGTTTTGTACTTTTCTTTT TCTCTCTTGTAAGAGGACTTTGGACATTCTTTTGGGATCATATGGTTGATCCCTACATGTTTGCTTTGTTTGTGTGTGGG TGAGTAAATACATTGGACATTGGTCCTCTAGGCTGAAATATTATTCTTTGCGATGTTTCTTTAGGGTTGATTTTGATTGT TTTTGTTTTTTGTATTTCCTTTGGCATTTTGTATGCTCTTGTGATGGCCAGTTTGTTTAGGAGCTATTCTTTTCTGTCTA CTAGTCAAGCCATATTCATGGACTTGCAGCATCAAGTCCAAAAGTTGACCATGCATTTAGATGCAAAAGAAAAAGGTGAC AATGGGAAAAATGAGAGATTGTTGAATATGCTTTAAAGCACATTATAAG
CDS sequence (LotjaGi6g1v0173200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTGAAATTCTGGTCCAGAGGGCAGGTTCTCCAGATGAATTTACGAGGTTAACCGCTATCACATGGATAAATGAGTT TGTCAAACTTGCAGGAGACCAGCTTGTTCCATATTATGCTGACATTCTTGGAGCCATTTGGCCTTGCATATCTGATAAAG AGGAGAAAATTAGAGTGGTTGCCCGGGAAACCAATGAAGAGTTACGAGCAATCAAGGCTGATCCAGTAGAAGTTTTTGAT GCAGGAGCAATCCTATCCATTACTAGGCAACTGTCTAGTGAATGGAAAGCCACTCAAATTGAAGCATTGCATTGGATATC AACCCTTTTAAGCATACATTGTACTGAGGTTTTGACATACCTTGATGACATATTTGACACCCTACTCAAAGCACTTTCCG ATCCATCTGATGAGGTCTCTCGAAGTGCCTAG
Protein sequence (LotjaGi6g1v0173200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAEILVQRAGSPDEFTRLTAITWINEFVKLAGDQLVPYYADILGAIWPCISDKEEKIRVVARETNEELRAIKADPVEVFD AGAILSITRQLSSEWKATQIEALHWISTLLSIHCTEVLTYLDDIFDTLLKALSDPSDEVSRSA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 139 | 139 | 1.5E-80 | – | |
| PANTHER | 1 | 139 | 139 | 1.5E-80 | ||
| SUPERFAMILY | 3 | 143 | 141 | 7.56E-19 | ||
| Gene3D | 4 | 143 | 140 | 2.7E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Phosphatidylinositol biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of phosphatidylinositol, any glycophospholipid in which the sn-glycerol 3-phosphate residue is esterified to the 1-hydroxyl group of 1D-myo-inositol. | ||
| Cellular component | PAS complex | A class III phosphatidylinositol 3-kinase complex that contains a phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase subunit (Fab1p in yeast; PIKfyve in mammals), a kinase activator, and a phosphatase, and may also contain additional proteins; it is involved in regulating the synthesis and turnover of phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate. In mammals the complex is composed of PIKFYVE, FIG4 and VAC14. In yeast it is composed of Atg18p, Fig4p, Fab1p, Vac14p and Vac7p. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0173200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…