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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0193800 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0193800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Thaumatin-like protein; TAIR: AT4G36010.1 Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9FSG7|TP1A_MALDO Thaumatin-like protein 1a; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VJ74|A0A072VJ74_MEDTR Pathogenesis-related thaumatin family protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0193800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:49001075..49008725) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAAAAATGGAAAACATCTTGTTTTCACCATTTGTATATATCTATCTTTTTTTTTACTTTCTAAATTAGCAATTGTCAAA CAATTTATTGGCTAGTGATCACAAGGGCATTGCCACTGTGATCAATGGATGTTCAAGTGCTATTGTCATTTATGTTCCTC ACCATTTTTTTCTCAACAGGAAATGCTGCTGGAAAACCTGATCCATATGCTGGTAAAGTTGAAATCATGTTGCTAAATGG TGGTCATCAAACCATTTGGCCAGGTGTTCATACCAAAACAGGGCACCAAATAGTTCCCACAGGCTTCAAATTGGAGCCAA GAGATATATATCATATCAAAGTCCCTGATTCATGGTCAGGCACAATATGGGCAAGAACTGGATGCAGTGGAAACCCAAAC ACTACCTTTCATTGTGATGTTGGAGATTGTGGCACTCACAATATACATTGCCATCAAAGCCTACCAAAACCCCCTGCAAC TCTATTGAAGTTCAACTTGGCTCCAAAAGGTGGCACAAGTTCTTACAAAATAGACCTAAGATATGGCTTTAATATCCCAG CCACATTATCCACATTCACTAGCAAGTGCAAGGAAATAAATTGGGTCAGGGATATAAGGAGTGATTGCCCTGATTGGTTA GCTGTGTATAGTCATGAAGGTAGAAAGATTGGTTGCAAAAGTGCATGTTACACCACTGGTGAATCAAAGCATTGTTGCAC TGGTGCCTTTGCTTCTCCTCAAAAGTGTGAGCTGAATGAATACACACAACTTGTTGAGAACAATTGCCCCGATTCTGTTT CTAATGCCTTTGATGACACTCACTTCACATGCCATGGTGGGGCTAGTTTTCAGATAACATTTTGGGCATGGTGAAAGATT GCAATCAATCACTAGTGTATCACTATAGTACGTATATATGTTTACAATCTGTTAGGATGCAAACCAAAGATATTTGGTGC 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TAAAAAGAAAAATAAAAAAAGTCAAAGTTTATGGTCAAAGCAACTCCTATCGGTCCACATCACTCAGATATGATACAATT GTGGTATGATAACATTTATCAAGATGGATATTTATTAGATTGCAAATGGACTATTAAGTAGTGCATTATATGTATCATGG GTTGAGGGGTGGACATATATATATTATGCCCACTCTTCATTGATGTAAATATTTCTTGTTGCATTTGTTAAATTATTTTA TTATTTAGGTAATCTCAATTTATTGGACTTTGTCTCTTGTTTTTATTTGCTGTTTTCAACTTTGAAAAAGGGTTAATATA GTAGTATTTAGCAAGTTTCATGTATTAGTACGTGGAAAAAAAATCCATTCGGAGAGCTAGCACACTAAGATGTGAATGTT TTTTGCGAACACGGTTGCCTTCTTTCAGAAACACTTGTAATGGTACCAAAAGAGTAAACTATCCTAGCTAGGCTATGTTG GATGGCCACTGGGATTCTAGTTCTATTCATAGTAAAAATTTAAGGGCTATCCTATCAGGCATTTTTCAATAACCATGAAG AGCATTATTGATAGTCCCTCTCTTAATTTTTGAATAATTCCAATGAAAGCTTCAACTACGTACCTGTAGTTTGATATTAA GGCCTCAAATGCATGAGTTCAAAAAAGGCCTCAAAATGCATATTCGCCATTAGCTTGGTAATAATAATGTTCTTGAGAGT GTGATTTCATAATAAGATTCAAATCAAATAGATAAATCAGAACTTAAATTTTTATGACAACTCACTTCTAGAGACTTCTT CAACCTGATTATTCTCTCATTCCCCCAAAAAACAGTATATTTTACTTGACTGATCTACTTTCTTTTAGAAAAAAAATAAA AACACTACCCCTTTCAATTACGAATGAAAGACGCAAGAATGTCAAATTTGGAGTTCCTTTTTCTCAGCTTGGAATGTCAA ATTCATCATTCTAATATATTAGTGTGGAGTCCGTATAGAGAGTTTCATTTTCTTCAACTTTATCTGACTCGAAATTATAA ACATTCACTTATCATCAATCACAAAACACCATCATATATATATGTATCATGCATTGAGAAGTGACCATGTATCCCACCCC ACTCTTCATTTGAAGTTGAAGCAAATCTTTCTAGTTAAATTAATGTTACATTATTTCACTATTTATTTAATCTTTATTTG GTTTGATTTCATTGTACTGACAACCAATCACAACATACCATGTAGGTGAAATAATAACTTTCACCTTAAATTTTAATTAA AACAAAATTATATTTGCTGATGTGCCAGAATTCAATTGGGTGACTGTGTAAACAAAATTTACACTGACAATGCACACACA TTAAATTCTTAATTTTAATCCCTCAAGTCGCTTGTGTGAATTATATTGGATCTCATTTTTCTAAAACAAACGCAAAACAA AAATTAATTTCAACCACAATTTGAAATTATATAATTAATAGAGATCAAAATTAAAGAGCAATTGAGATCTTATCCATCAA TTAGACAGAGAGGCAGTGCTGGAAACATGGAAATCATCTCGTTTTCACCATTTACTAGCGTTTTTACCCCGTGTGTTGCA CGACAAATATTGATCTCATTATTTAGACATGTATTAATGAATTAAGATACAAAAAAAAAAGATGAGCATTCAACCAAACA AAATAAATCACAATGAGTATCACACCAATTGCAAAGTTTGACAAAAATTTCATATATATTTAATCCTAAAATTATTTAAA ATTATGAAAAATATATTTAAATTAGATGAAAAATTTGTTCTAGAGATTTAGTAAAAGTGGCAAGAGCTAGGAGACATAAG TGTTGGAGGGGAATGAAAAATAGTTGTGGAAATTTATGTGGTATATACTTCTATTTGTGATCGATTTGACAATTCCTCAA 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TCTTTAATTTCCTAATAAATAAAAAATTATTTATTAATTAATATATTATAACTTATAAAAGTTATATATATTGAAATAAT TTTAATTTGGAATGAGAATAAAAATAAATAAATTTTATAACTGTATATTGTCAGGGTGAAAATGAAAATAAATAAATTAT CTTATATTGTCAGGATAAGTTCTTAAACAACTCTCCACCCATGATAAGTCTTACACATGATAAATATGATATGATAAGAG TTAGGATTGTGTTATCATATCATGTTGCCACAACAAACAAAAAATTACTCAAAGTAATTATTACATTAACCTACCTTGTT GCTCAATGATGTGCCCTAAATGGTTTCTAATTTATCCTAATTGGCTAGTATAAAAAGCATTCAAAGATATTATTAAAAGA CAAGTGCATGCATTGTCACTGTGATCAATGGAGGTTCAAGTGCTATTGTCTTTTATGCTCCTCACCCTTTTGTTCTCAAA AGGAAATGGTGCTGGAAAGCCTTATCCACATGCAGGTAATGTTTGAAATTTTTAATTTTGTGCAATTTTTTTATATCGTA TAGGGCTTTTTTTACTTCAACTTAACATTCACTTGTCATCAATCACAACCATCATATGTATCATGGCTTGAGGAGTGACC ATGCATGTGTCCCCACGTACTCTTCATTTGAAAGTTGAAGCAAATCATCTTTTTTGTTTATTAGTTTTCATTGAATATGT TTGTAGCATGAATTTTTGATCAAATTTCTATGCGCATTTCTTTAGATTTACAAGAATAATTCAAAAATCAAATATTGAAA AGGAAAAAAAAACTGCACAACAACTAAAGCTTACTAACATCCATGAAATAAATAAATTAATTTCAATCCCAATTTAAAAT TACACAATTAATGGATGATTAATAGAGAAATGGAGATCTTATCCATCAATTTGACTGAAGCAATGCTGAAAAAATGGAAA ACATTTTGTTTTCACCATGTGTATATATCTATCTTTCTTTTTTTCTAAATTAGCAATTGTCAAGCAATTTATTGGCTAGT ATAAAAAAACATTCAAAAATATATAGTATTGAAAGGCAAGTGCATTGTCACTCTGATCAATGGATCGGAGGTTCATCAAG TGCTATTATCTTTAATGTTCCTTACCATTTTGTTCTCAACAGGAAATGCTACTGGAAAACCTGACCAATATGCTGGTAAT GTTGAAATCATGTTGCTAAATGGTGGTCATCAAACCATTTGGCCAGGTGTTTATACCAAAACAGGGCACCAAATACTTCC CACAGGGTTCAAATTGGAGCCTAGAGATATATATTATATCAAAGCCCCTGATTCATGGTCAGGCACAATATGGGCAAGAA CTGGATGCAGTGGAGACCCAAACGCTGCCTTTCGTTGTGATGTTGGAGATTGTGGCACTGGAAGTATACATTGCCATCAA AACCTACCAAAACCCCCTGCAACTCTATTGAAGTTCGACTTGGCTCCAAAAGGTGGCACAAGTTCTTACAAAATAGACCT AAGATATGGCTTCAATTTGCCAGTCTCATTATCCACATCCACTGGCGAGTGCAAGCAAATAAATTGTGTCAGGGATATGA GGAATGATTGCCCTGATTGGTTAGCTGTGTACAGTCATGAAGAGAGAAAGGTTGGTTGCAAGAGTGCATGTTATACCACT GGTCAAAAAAAGGATTGTTGCACTGGAGCCTTTGCTTCTCCTCAAAAGTGTGAGCTGAATGAATACACACAACTTGTTGA GAACAATTGCCCCGATTCTGTTTCTAATGCCTTTGATGATACTCACTTCACATGTTATGGTGGGTCTAGTTTTAGGATAA CATTTTGGGCATGGTGAAAGATTGCAATCAATCACTAGTGTATCACTATAG
CDS sequence (LotjaGi6g1v0193800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATGTTCAAGTGCTATTGTCATTTATGTTCCTCACCATTTTTTTCTCAACAGGAAATGCTGCTGGAAAACCTGATCC ATATGCTGGTAAAGTTGAAATCATGTTGCTAAATGGTGGTCATCAAACCATTTGGCCAGGTGTTCATACCAAAACAGGGC ACCAAATAGTTCCCACAGGCTTCAAATTGGAGCCAAGAGATATATATCATATCAAAGTCCCTGATTCATGGTCAGGCACA ATATGGGCAAGAACTGGATGCAGTGGAAACCCAAACACTACCTTTCATTGTGATGTTGGAGATTGTGGCACTCACAATAT ACATTGCCATCAAAGCCTACCAAAACCCCCTGCAACTCTATTGAAGTTCAACTTGGCTCCAAAAGGTGGCACAAGTTCTT ACAAAATAGACCTAAGATATGGCTTCAATTTGCCAGTCTCATTATCCACATCCACTGGCGAGTGCAAGCAAATAAATTGT GTCAGGGATATGAGGAATGATTGCCCTGATTGGTTAGCTGTGTACAGTCATGAAGAGAGAAAGGTTGGTTGCAAGAGTGC ATGTTATACCACTGGTCAAAAAAAGGATTGTTGCACTGGAGCCTTTGCTTCTCCTCAAAAGTGTGAGCTGAATGAATACA CACAACTTGTTGAGAACAATTGCCCCGATTCTGTTTCTAATGCCTTTGATGATACTCACTTCACATGTTATGGTGGGTCT AGTTTTAGGATAACATTTTGGGCATGGTGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0193800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDVQVLLSFMFLTIFFSTGNAAGKPDPYAGKVEIMLLNGGHQTIWPGVHTKTGHQIVPTGFKLEPRDIYHIKVPDSWSGT IWARTGCSGNPNTTFHCDVGDCGTHNIHCHQSLPKPPATLLKFNLAPKGGTSSYKIDLRYGFNLPVSLSTSTGECKQINC VRDMRNDCPDWLAVYSHEERKVGCKSACYTTGQKKDCCTGAFASPQKCELNEYTQLVENNCPDSVSNAFDDTHFTCYGGS SFRITFWAW
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 21 | 21 | - | – | |
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 21 | 21 | - | – | |
| Phobius | 1 | 4 | 4 | - | – | |
| Phobius | 1 | 21 | 21 | - | – | |
| PIRSF | 3 | 248 | 246 | 3.2E-60 | ||
| Phobius | 5 | 16 | 12 | - | – | |
| Phobius | 17 | 21 | 5 | - | – | |
| Phobius | 22 | 249 | 228 | - | – | |
| PANTHER | 32 | 246 | 215 | 1.2E-58 | – | |
| PANTHER | 32 | 246 | 215 | 1.2E-58 | ||
| Gene3D | 32 | 247 | 216 | 9.5E-63 | ||
| SMART | 34 | 248 | 215 | 1.7E-20 | ||
| SUPERFAMILY | 34 | 247 | 214 | 9.55E-49 | ||
| Pfam | 40 | 246 | 207 | 5.9E-57 | ||
| ProSiteProfiles | 43 | 246 | 204 | 25.525 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0193800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…