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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0282400 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0282400.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Sister chromatid cohesion protein PDS5 like B; TAIR: AT5G47690.1 binding protein; Swiss-Prot: sp|Q5U241|PD5BB_XENLA Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B-B; TrEMBL-Plants: tr|K7MAX3|K7MAX3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0282400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:59868711..59896165) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CACAGATTTGGATTTCTGATTTCTGAGTGTCTTTCGTTTCGCTGTTCGAAAATCGAACTTCACGTCACGCACACACAAAG AGAGAGAAACAAAAAAACCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTGTTTGTGGAATGAAACACCATTGAAACGACAT CGTTTTATTCGCTGAACACGTGAACATGGCTAAGAAGCCTCACCTTCAGCTTGTGGAGCTGGGATCCAAGCTCGACACCG TTCCCACTTCCAAGGATGCTCTCGTTAATCTCTTGCAGGTTTGAATTTCTCGAATTTTGCCCAATTTTGTTCACTTTTTG TTGTTGTTGTTGTTTTTATGTGAAGAATTTGTTTTGGACTTTTGTGTTTTGGGGTTAGTTATTTTGTCGTTACTTGCTGT TTCGTTATGTTGGGGGTAAAGAGAATGGGGACAATTTTGCTGAATTGGGCAATTTTGAGCTTAAATGCGTCGATTGGTTT CGAGTTCTGTGCTTTTTCGTATTGTATTGGTTTGTAATTGAGGGTTTAGGTTGTGTTAGTTTGCTTGTTGTTGTTTAGGA GAAGCACAATTGGTGGATTTAGTGTAATTTGATGTCAAATTTGGTTAATTTGAAGCAAGTTTGTGGGGAGTTAGGTTTAG TTTTTAGTGTTCATGCAGGTGCTTTAGGTTTTCTCTCTATGGTAAATGGTAATGGATAAGTTGGGATTATCCTGTGCTTT AGTTAAGTTCAATAGGGGATTGCATTTGGGATGCTGCGAAATCTGAGATGGAGAAGGATAAAGCTACTAAGTAGTGCAAC TTTGCATGAGAATGGAGGAAAATAAGTAGAATCAGAAGTAAAAATAGGAGAAATTAACAGCTGCGACTTTCGACCAGTTT TTTTTATTTATAAATCTTATTGTCTAGTTTAGTGAATTACATGAGACGGTATTGGGGTGATAGGATGCATGTCTGGACTC 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CDS sequence (LotjaGi6g1v0282400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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Protein sequence (LotjaGi6g1v0282400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
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| MobiDBLite | 1250 | 1321 | 72 | - | – | |
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| Gene3D | 1363 | 1411 | 49 | 1.8E-7 | – | |
| MobiDBLite | 1383 | 1402 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 1385 | 1402 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 1413 | 1659 | 247 | - | – | |
| MobiDBLite | 1413 | 1442 | 30 | - | – | |
| MobiDBLite | 1469 | 1527 | 59 | - | – | |
| MobiDBLite | 1540 | 1567 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 1575 | 1601 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 1611 | 1647 | 37 | - | – | |
| Coils | 1657 | 1659 | 3 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Mitotic sister chromatid cohesion | The cell cycle process in which the sister chromatids of a replicated chromosome are joined along the entire length of the chromosome, from their formation in S phase through metaphase during a mitotic cell cycle. This cohesion cycle is critical for high fidelity chromosome transmission. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0282400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…