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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0452200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0452200.1 |
| Related isoforms 9 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Regulatory-associated protein of TOR 1; TAIR: AT3G08850.1 Regulatory-associated protein of TOR 1; Swiss-Prot: sp|Q93YQ1|RTOR1_ARATH Regulatory-associated protein of TOR 1; TrEMBL-Plants: tr|V7B2P2|V7B2P2_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0452200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:95184181..95198713) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATATTTGCTTTACAAAATCGCAATTTCATCTCACTGAGAAGTGAGAACCCGTTTTCCATTCGAGGAGAGACAACAGACAG TGCCTGCCGCCACTGTTCTATGCGCCTCCATCATCCTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCACATCC ATCACCATCTTCTTCATCTTCATCTTCAGCTAAACGAACCCTTCGTATCGAGAAAACCTAGGGTTTCACTCTTCCCCCAA AACCCTCTCCTCTTCTTCAACCCGATGAACGATCGCTGAGGGTTTCCGATTTGGATGGCATTGGGTGATTTCATGGCATC ACGCTTTTCCCAATCCAGCGTTCTCGTCGTTCCGAATCATCACCACCACCACCACGATGATTCCGCTACCTCCACTACCC TCGACGACGCCGATTTCGGCCCCCGTCGGGATTCTGAGCCCGCCGTTGCTAGCAGTAGCAGCGGTAGCGCCGCCGCCGCG TATCCTAATGCTGCCACCAGCTTGGCGTACCTTCCGCAGACCGTTGTGCTTTGCGAGCTCCGTCATGATGCCTTTGAGGC CGCCGTTCCCGTCGGTCCCTCCGACAGCGGCCTTGTTTCGAAATGGCGGCCGAAGGACAGGGTATAGCTTTCTCCTTTGC CTGTTGTTTTGTGTTTTCGTGTCTGTGATTCGCGATTTGCTTTTCGGATATGTGTTTTGCATAGTAGGAACTTGGAAACT TAGGTCATTGCAGTTGTTAGTGTATTGGCATTATCACATAACACTTGGAAACTTGAGGTTTTAACAAATAAGGGTTTGGA TCCACTCACCAGCAAATGGGTAAAGTGTCGAATGGTAACTATTATTAAGGAAATCAAGTGTGCGAGTTCTGCTATCCATG ATTTTTAACCCAGATGGTTGTATTTAATAGAATAGGATTCTAAATCATTGGAGTTTTTATGAAAGGTTATAAACTTATCA 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TTAATTGTTGCAAAATATCTCATTGTTTCATTTTTTCTGAATTGCAACGGGAGAAAGTAGACGAAACATGGGAAGTATGA GGAAAAAATGTTAATGAAAGCTTTTTTTTGAAAGAGAATAAAATAGTTGCCCC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0452200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCATTGGGTGATTTCATGGCATCACGCTTTTCCCAATCCAGCGTTCTCGTCGTTCCGAATCATCACCACCACCACCA CGATGATTCCGCTACCTCCACTACCCTCGACGACGCCGATTTCGGCCCCCGTCGGGATTCTGAGCCCGCCGTTGCTAGCA GTAGCAGCGGTAGCGCCGCCGCCGCGTATCCTAATGCTGCCACCAGCTTGGCGTACCTTCCGCAGACCGTTGTGCTTTGC GAGCTCCGTCATGATGCCTTTGAGGCCGCCGTTCCCGTCGGTCCCTCCGACAGCGGCCTTGTTTCGAAATGGCGGCCGAA GGACAGGATGAAGACAGGATGTGTAGCTCTAGTATTATGTTTAAACATTAGTGTTGATCCTCCAGATGTAATAAAGATAT CCCCTTGTGCCAGAATGGAGTGCTGGATAGATCCTTTTTCTATGGCACCACAAAAGGCATTGGAATCAATTGGAAAATCT TTGAGCTGTCAGTATGAAAGATGGCAACCGAAGGCACGCTATAAGTGTCAACTTGATCCAACCGTGGATGAGGTGAAGAA GCTTTGTACTACATGTCGCAGATATGCAAAGACGGAAAGAGTTTTATTCCATTACAATGGGCATGGTGTACCAAAGCCAA CTGTTAATGGTGAAATTTGGGTCTTCAATAAGAGTTATACGCAGTATATCCCCTTACCAATCAGTGACCTTGATTCCTGG CTGAAGACCCCATCAATTTATGTTTTTGATTGCTCTGCTGCGGGGTTAATAGTGAATTCTTTCATTGAGCTTCATGAATG GAGTGCATCTAACACTGCTGGGGCCACAAGGGATTGCATTTTGCTTGCAGCATGTGAAGCACATGAGACTTTGCCTCAGA GTGTTGAATTCCCAGCTGATGTGTTTACATCTTGCCTAACAACACCTATAAAGATGGCATTGCGGTGGTTCTGTACTCGT TCATTACTTCGTCAGTCGCTTGATTATTCCCTTATAGATAAGATCCCTGGCCGTCCCAATGACCGAAAGACACTTCTGGG TGAATTGAATTGGATTTTTACAGCAGTAACTGATACGATTGCCTGGAATGTTCTTCCTCATGAACTTTTTCAGAGGCTGT TCAGACAAGATTTGCTTGTTGCAAGTCTGTTTCGAAATTTTCTACTTGCTGAGCGAATAATGCGATCTGCAAATTGTACT CCTGTCTCTCACCCTATGTTACCGCCAACTCATCAGCATCATATGTGGGATGCATGGGACATGGCTGCTGAGCTTTGCCT CTCTCAACTTCCCTCATTAGTTGAGGATCCTAATGCAGAATTTCAGCCTAGTACATTTTTCACTGAGCAGTTGACAGCAT TCGAGGTATGGCTTGACCATGGTTCTGAACATAAGAAACCACCAGAACAGTTGCCTATAGTTCTTCAGGTTTTACTCAGT CAGTGCCATCGATTTCGGGCTTTAGTTCTCCTTGGAAGGTTCCTTGATATGGGGCCATGGGCTGTTGATCTGGCATTATC TGTTGGAATATTTCCTTACGTTCTTAAGCTGCTGCAAACTACAACACCAGAATTACGTCAGATTCTTGTATTCATATGGA CTAAGATTTTGGCACTTGACAAGTCATGTCAGGTTGATCTAGTGAAAGATGGAGGTCATATCTATTTTATTAAGTTTCTT GATAGCATGGAAGCATATCCAGAGCAACGAGCAATGGCTGCTTTTGTTTTAGCTGTGATTGTGGATGGTCATAGAAGAGG TCAAGAAGCTTGTATTGAAGCTGGTTTGATCCAAGTCTGCTTAAAGCACCTTCAGAGCTCATCTCTCAATGATTCACAAA CCGAACCCCTTTTCCTTCAGTGGCTGTGCTTGTGTCTGGGGAAATTGTGGGAAGACTACACAGAGGCGCAAGCAATCGGT TTGCATGAAGATGCTACTTCTATATATGCTCCTCTACTTTCTGAACCCCAGCCAGAGGTTAGAGCATCTGCTGTTTTTGC ACTGGGCACACTTCTTGATGTGGGATTTGATTCATGTAGAAGTGTTGGAGGAGATGAAGAATGTGATGATGATGACAAGT TTAGGGCTGAAGTTAGTATAGTTAAGAGTCTGTTGAGTGTTGCTTCAGATGGGAGTCCGTTGGTGAGGGCTGAGGTTGCA GTGGCTTTAGCAAGGTTTGCTTTTGGCCACAACAAGTACCTGAAATCTATTGCTGCTGCATATTGGAAGCCTCAGACTAG TTCTTTGATAAATTCCTTACCCTCATTGACTAATATTAAAGATTCAGTTGGTGGTTTTTCTAACCAGAACCAGCATAAGC CTCATGGAAATATTGTTTCACCTCAAATTGGTCCTCTCAGGGTTGGGAGTGAGAATTCTAAAGTGGTTCGAGATGGGCGG ATCTCATCTAGCAGTCCTCTCGCTAGTTCTGGAATCATGCATGGGTCCCCGATGTCTGATGATTCATCTCATCATTCTGA TTCAGGAATATTGAATGATGGTTTCAGTAATGGAGTGGTTAACCACACTGGGCCAAAACCCTTGGATAATGCATTATATT CACAATGTGTACTTGCTATGTGTACTTTAGCAAAAGATCCATCGCCCCGCATTGCTAACCTTGGCCGCCGAGTACTTTCC ATAATAGGTATTGAACAAGTTGTAGCAAAACCATTGAAATCTACTGGTGTTCGTCCTAGTGAAGCTACAGCCACTCCTAG CCTTGCTGGACTTGTTCGCTCATCTTCTTGGTTTGATATGAATGGAGGACACTTGCCTCTAACCTTCAGAACTCCTCCAG TCAGTCCTCCTCGCCCAAGTTATATAACTGGAATGCGCAGAGTATGTTCATTGGAGTTTAGGCCCCACCTGATGACTTCT CCAGACTCAGGATTAGCTGATCCACTTTTAGGTTCGGCTGGAGCTGCGGGGAGTTCAGATCGCAGTTTTCTTCCACAATC AACTATATATAATTGGAGTTGTGGGCACTTTTCCAAACCACTTTTAACTGCGGCAGATGATAGTGAAGAAGTATTAGCAA GAAGAGAAGAGAGGGAAAAATATGCATTGGAGCACATAGCAAAATGCCAGCACTCAGCTGTGACCAGACTAACAAATCCT ATTGCTAAATGGGACACTAAGGGTACACAAACAGTGTTGCTGCAACCTTTCTCTCCTATAGTGATAGCTGCTGATGAGAA TGAACGTATCAGGGTATGGAACCATGAAGAAGCATCACTTCTCAACAGCTTTGATAACAATGATTTTCCTGACAAAGGAA TTTCTAAACTCTGCCTAGTGAATGAGCTTGATGATAGCTTGCTTCTTGCTGCTTCATCTGATGGAAATATTCGAATTTGG AAAGATTATACTCTAAAGGGTAAACAGAAGCTTGTATCTGCATTCTCTTCAATTCATGGTCATAAACCTGGTGTGAGGAG TTTGAATGCAGTTGTTGATTGGCAACAGCAATGTGGTTATCTGTATGCATCGGGTGAGATATCATCTATTATGCTATGGG ATCTTGATAAAGAGCAACTTCTTAATGCTATACCTTCAGCATCAGATTGCAGTGTGTCTGCATTGGCCGCATCTCAAGTT CATGGGGGACAATTTGCAGCTGGGTTTGTAGATGGTTTCGTCAGACTCTATGATGTCAGAACACCTGAAATGCTCGTCTG TGGATTACAGCCACACACACAAGGAGTAGAAAAAGTTGTGGGGATTGGCTTTCAACCTGGGTTGGACCCAGGAAAGATTG TTAGTGCTTCTCAGGCTGGGGATATCCAATTCCTTGATATAAGAAATCACAGCAGCGCCTATCTCACTATTTCAGCTCAC AGGGGTTCCCTTACAGCTTTAGCAGTACATAGACACGCTCCAATTATTGCCAGCGGTTCTGCCAAACAACTCATTAAAGT TTTTAACCTGGAGGGTGATCAACTGGGCACCATTCGTTACTATCCTACCCTAATGGCCCAGAAAATTGGTTCAGTAAGCT GCCTAAATTTCCACCCATACCAAGTACTACTTGCTGCCGGTGCGGCAGATGCATGTGTATGTATTTATGCTGATGACAGC ACTCAAGCAAGATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0452200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MALGDFMASRFSQSSVLVVPNHHHHHHDDSATSTTLDDADFGPRRDSEPAVASSSSGSAAAAYPNAATSLAYLPQTVVLC ELRHDAFEAAVPVGPSDSGLVSKWRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIDPFSMAPQKALESIGKS LSCQYERWQPKARYKCQLDPTVDEVKKLCTTCRRYAKTERVLFHYNGHGVPKPTVNGEIWVFNKSYTQYIPLPISDLDSW LKTPSIYVFDCSAAGLIVNSFIELHEWSASNTAGATRDCILLAACEAHETLPQSVEFPADVFTSCLTTPIKMALRWFCTR SLLRQSLDYSLIDKIPGRPNDRKTLLGELNWIFTAVTDTIAWNVLPHELFQRLFRQDLLVASLFRNFLLAERIMRSANCT PVSHPMLPPTHQHHMWDAWDMAAELCLSQLPSLVEDPNAEFQPSTFFTEQLTAFEVWLDHGSEHKKPPEQLPIVLQVLLS QCHRFRALVLLGRFLDMGPWAVDLALSVGIFPYVLKLLQTTTPELRQILVFIWTKILALDKSCQVDLVKDGGHIYFIKFL DSMEAYPEQRAMAAFVLAVIVDGHRRGQEACIEAGLIQVCLKHLQSSSLNDSQTEPLFLQWLCLCLGKLWEDYTEAQAIG LHEDATSIYAPLLSEPQPEVRASAVFALGTLLDVGFDSCRSVGGDEECDDDDKFRAEVSIVKSLLSVASDGSPLVRAEVA VALARFAFGHNKYLKSIAAAYWKPQTSSLINSLPSLTNIKDSVGGFSNQNQHKPHGNIVSPQIGPLRVGSENSKVVRDGR ISSSSPLASSGIMHGSPMSDDSSHHSDSGILNDGFSNGVVNHTGPKPLDNALYSQCVLAMCTLAKDPSPRIANLGRRVLS IIGIEQVVAKPLKSTGVRPSEATATPSLAGLVRSSSWFDMNGGHLPLTFRTPPVSPPRPSYITGMRRVCSLEFRPHLMTS PDSGLADPLLGSAGAAGSSDRSFLPQSTIYNWSCGHFSKPLLTAADDSEEVLARREEREKYALEHIAKCQHSAVTRLTNP IAKWDTKGTQTVLLQPFSPIVIAADENERIRVWNHEEASLLNSFDNNDFPDKGISKLCLVNELDDSLLLAASSDGNIRIW KDYTLKGKQKLVSAFSSIHGHKPGVRSLNAVVDWQQQCGYLYASGEISSIMLWDLDKEQLLNAIPSASDCSVSALAASQV HGGQFAAGFVDGFVRLYDVRTPEMLVCGLQPHTQGVEKVVGIGFQPGLDPGKIVSASQAGDIQFLDIRNHSSAYLTISAH RGSLTALAVHRHAPIIASGSAKQLIKVFNLEGDQLGTIRYYPTLMAQKIGSVSCLNFHPYQVLLAAGAADACVCIYADDS TQAR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1359 | 1359 | 0.0 | ||
| PANTHER | 1 | 1359 | 1359 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 22 | 45 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 22 | 56 | 35 | - | – | |
| PRINTS | 108 | 129 | 22 | 8.6E-163 | – | |
| SMART | 109 | 262 | 154 | 4.0E-95 | ||
| Pfam | 110 | 261 | 152 | 5.8E-68 | ||
| PRINTS | 152 | 171 | 20 | 8.6E-163 | – | |
| PRINTS | 173 | 194 | 22 | 8.6E-163 | – | |
| PRINTS | 199 | 224 | 26 | 8.6E-163 | – | |
| PRINTS | 226 | 250 | 25 | 8.6E-163 | – | |
| PRINTS | 297 | 317 | 21 | 8.6E-163 | – | |
| PRINTS | 335 | 362 | 28 | 8.6E-163 | – | |
| PRINTS | 370 | 394 | 25 | 8.6E-163 | – | |
| PRINTS | 446 | 476 | 31 | 8.6E-163 | – | |
| SUPERFAMILY | 462 | 884 | 423 | 9.05E-33 | ||
| PRINTS | 477 | 498 | 22 | 8.6E-163 | – | |
| Gene3D | 480 | 762 | 283 | 1.5E-27 | ||
| PRINTS | 500 | 519 | 20 | 8.6E-163 | – | |
| PRINTS | 524 | 540 | 17 | 8.6E-163 | – | |
| MobiDBLite | 800 | 830 | 31 | - | – | |
| Gene3D | 1022 | 1186 | 165 | 1.4E-14 | ||
| SMART | 1037 | 1074 | 38 | 99.0 | ||
| ProSiteProfiles | 1042 | 1364 | 323 | 18.457 | ||
| SUPERFAMILY | 1047 | 1356 | 310 | 5.66E-36 | ||
| SMART | 1077 | 1121 | 45 | 1.8 | ||
| ProSiteProfiles | 1104 | 1121 | 18 | 8.57 | ||
| SMART | 1177 | 1218 | 42 | 2.2 | ||
| Gene3D | 1187 | 1363 | 177 | 1.2E-20 | ||
| PRINTS | 1202 | 1220 | 19 | 8.6E-163 | – | |
| SMART | 1270 | 1309 | 40 | 0.023 | ||
| SMART | 1322 | 1357 | 36 | 17.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Biological process | TOR signaling | A series of molecular signals mediated by TOR (Target of rapamycin) proteins, members of the phosphoinositide (PI) 3-kinase related kinase (PIKK) family that act as serine/threonine kinases in response to nutrient availability or growth factors. | ||
| Cellular component | TORC1 complex | A protein complex that contains at least TOR (target of rapamycin) and Raptor (regulatory-associated protein of TOR), or orthologs of, in complex with other signaling components. Mediates the phosphorylation and activation of S6K. In Saccharomyces, the complex contains Kog1p, Lst8p, Tco89p, and either Tor1p or Tor2p. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0452200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…