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LotjaGi1g1v0452200.5

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0452200
Transcript ID LotjaGi1g1v0452200.5
Related isoforms 9
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Regulatory-associated protein of TOR 1; TAIR: AT3G08850.1 Regulatory-associated protein of TOR 1; Swiss-Prot: sp|Q93YQ1|RTOR1_ARATH Regulatory-associated protein of TOR 1; TrEMBL-Plants: tr|V7B2P2|V7B2P2_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0452200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:95185210..95198419) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGCATTGGGTGATTTCATGGCATCACGCTTTTCCCAATCCAGCGTTCTCGTCGTTCCGAATCATCACCACCACCACCA CGATGATTCCGCTACCTCCACTACCCTCGACGACGCCGATTTCGGCCCCCGTCGGGATTCTGAGCCCGCCGTTGCTAGCA GTAGCAGCGGTAGCGCCGCCGCCGCGTATCCTAATGCTGCCACCAGCTTGGCGTACCTTCCGCAGACCGTTGTGCTTTGC GAGCTCCGTCATGATGCCTTTGAGGCCGCCGTTCCCGTCGGTCCCTCCGACAGCGGCCTTGTTTCGAAATGGCGGCCGAA GGACAGGGTATAGCTTTCTCCTTTGCCTGTTGTTTTGTGTTTTCGTGTCTGTGATTCGCGATTTGCTTTTCGGATATGTG TTTTGCATAGTAGGAACTTGGAAACTTAGGTCATTGCAGTTGTTAGTGTATTGGCATTATCACATAACACTTGGAAACTT GAGGTTTTAACAAATAAGGGTTTGGATCCACTCACCAGCAAATGGGTAAAGTGTCGAATGGTAACTATTATTAAGGAAAT CAAGTGTGCGAGTTCTGCTATCCATGATTTTTAACCCAGATGGTTGTATTTAATAGAATAGGATTCTAAATCATTGGAGT TTTTATGAAAGGTTATAAACTTATCACTTTATTTTGTGTGGTGCATTTTGCATTTTTGAGGTTCAATCAATTCAAGGAAT AATAACAAGATTGCATCGGGGGCGGGGGATTTCTTCAGTTAATCTATTTGGCTGAAAAACGACTACAAGATGATCAGTTT TCCTGAAATTGCTTGACTGGAGTAGTGATTTATAGACTGAGTCAAGGAAAATATATTCTTACATTCGCTTCTTAGTATAA TAGGCCTTTTATTAGTCCTGTTACCTAGGAAGTGGCTTGTTCTCATCAATGGGAGGTTGCTAATTTCTTACTTCTGCAAT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0452200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCATTGGGTGATTTCATGGCATCACGCTTTTCCCAATCCAGCGTTCTCGTCGTTCCGAATCATCACCACCACCACCA CGATGATTCCGCTACCTCCACTACCCTCGACGACGCCGATTTCGGCCCCCGTCGGGATTCTGAGCCCGCCGTTGCTAGCA GTAGCAGCGGTAGCGCCGCCGCCGCGTATCCTAATGCTGCCACCAGCTTGGCGTACCTTCCGCAGACCGTTGTGCTTTGC GAGCTCCGTCATGATGCCTTTGAGGCCGCCGTTCCCGTCGGTCCCTCCGACAGCGGCCTTGTTTCGAAATGGCGGCCGAA GGACAGGATGAAGACAGGATGTGTAGCTCTAGTATTATGTTTAAACATTAGTGTTGATCCTCCAGATGTAATAAAGATAT CCCCTTGTGCCAGAATGGAGTGCTGGATAGATCCTTTTTCTATGGCACCACAAAAGGCATTGGAATCAATTGGAAAATCT TTGAGCTGTCAGTATGAAAGATGGCAACCGAAGGCACGCTATAAGTGTCAACTTGATCCAACCGTGGATGAGGTGAAGAA GCTTTGTACTACATGTCGCAGATATGCAAAGACGGAAAGAGTTTTATTCCATTACAATGGGCATGGTGTACCAAAGCCAA CTGTTAATGGTGAAATTTGGGTCTTCAATAAGTATATCCCCTTACCAATCAGTGACCTTGATTCCTGGCTGAAGACCCCA TCAATTTATGTTTTTGATTGCTCTGCTGCGGGGTTAATAGTGAATTCTTTCATTGAGCTTCATGAATGGAGTGCATCTAA CACTGCTGGGGCCACAAGGGATTGCATTTTGCTTGCAGCATGTGAAGCACATGAGACTTTGCCTCAGAGTGTTGAATTCC CAGCTGATGTGTTTACATCTTGCCTAACAACACCTATAAAGATGGCATTGCGGTGGTTCTGTACTCGTTCATTACTTCGT CAGTCGCTTGATTATTCCCTTATAGATAAGATCCCTGGCCGTCCCAATGACCGAAAGACACTTCTGGGTGAATTGAATTG GATTTTTACAGCAGTAACTGATACGATTGCCTGGAATGTTCTTCCTCATGAACTTTTTCAGAGGCTGTTCAGACAAGATT TGCTTGTTGCAAGTCTGTTTCGAAATTTTCTACTTGCTGAGCGAATAATGCGATCTGCAAATTGTACTCCTGTCTCTCAC CCTATGTTACCGCCAACTCATCAGCATCATATGTGGGATGCATGGGACATGGCTGCTGAGCTTTGCCTCTCTCAACTTCC CTCATTAGTTGAGGATCCTAATGCAGAATTTCAGCCTAGTACATTTTTCACTGAGCAGTTGACAGCATTCGAGGTATGGC TTGACCATGGTTCTGAACATAAGAAACCACCAGAACAGTTGCCTATAGTTCTTCAGGTTTTACTCAGTCAGTGCCATCGA TTTCGGGCTTTAGTTCTCCTTGGAAGGTTCCTTGATATGGGGCCATGGGCTGTTGATCTGGCATTATCTGTTGGAATATT TCCTTACGTTCTTAAGCTGCTGCAAACTACAACACCAGAATTACGTCAGATTCTTGTATTCATATGGACTAAGATTTTGG CACTTGACAAGTCATGTCAGGTTGATCTAGTGAAAGATGGAGGTCATATCTATTTTATTAAGTTTCTTGATAGCATGGAA GCATATCCAGAGCAACGAGCAATGGCTGCTTTTGTTTTAGCTGTGATTGTGGATGGTCATAGAAGAGGTCAAGAAGCTTG TATTGAAGCTGGTTTGATCCAAGTCTGCTTAAAGCACCTTCAGAGCTCATCTCTCAATGATTCACAAACCGAACCCCTTT TCCTTCAGTGGCTGTGCTTGTGTCTGGGGAAATTGTGGGAAGACTACACAGAGGCGCAAGCAATCGGTTTGCATGAAGAT GCTACTTCTATATATGCTCCTCTACTTTCTGAACCCCAGCCAGAGGTTAGAGCATCTGCTGTTTTTGCACTGGGCACACT TCTTGATGTGGGATTTGATTCATGTAGAAGTGTTGGAGGAGATGAAGAATGTGATGATGATGACAAGTTTAGGGCTGAAG TTAGTATAGTTAAGAGTCTGTTGAGTGTTGCTTCAGATGGGAGTCCGTTGGTGAGGGCTGAGGTTGCAGTGGCTTTAGCA AGGTTTGCTTTTGGCCACAACAAGTACCTGAAATCTATTGCTGCTGCATATTGGAAGCCTCAGACTAGTTCTTTGATAAA TTCCTTACCCTCATTGACTAATATTAAAGATTCAGTTGGTGGTTTTTCTAACCAGAACCAGCATAAGCCTCATGGAAATA TTGTTTCACCTCAAATTGGTCCTCTCAGGGTTGGGAGTGAGAATTCTAAAGTGGTTCGAGATGGGCGGATCTCATCTAGC AGTCCTCTCGCTAGTTCTGGAATCATGCATGGGTCCCCGATGTCTGATGATTCATCTCATCATTCTGATTCAGGAATATT GAATGATGGTTTCAGTAATGGAGTGGTTAACCACACTGGGCCAAAACCCTTGGATAATGCATTATATTCACAATGTGTAC TTGCTATGTGTACTTTAGCAAAAGATCCATCGCCCCGCATTGCTAACCTTGGCCGCCGAGTACTTTCCATAATAGGTATT GAACAAGTTGTAGCAAAACCATTGAAATCTACTGGTGTTCGTCCTAGTGAAGCTACAGCCACTCCTAGCCTTGCTGGACT TGTTCGCTCATCTTCTTGGTTTGATATGAATGGAGGACACTTGCCTCTAACCTTCAGAACTCCTCCAGTCAGTCCTCCTC GCCCAAGTTATATAACTGGAATGCGCAGAGTATGTTCATTGGAGTTTAGGCCCCACCTGATGACTTCTCCAGACTCAGGA TTAGCTGATCCACTTTTAGGTTCGGCTGGAGCTGCGGGGAGTTCAGATCGCAGTTTTCTTCCACAATCAACTATATATAA TTGGAGTTGTGGGCACTTTTCCAAACCACTTTTAACTGCGGCAGATGATAGTGAAGAAGTATTAGCAAGAAGAGAAGAGA GGGAAAAATATGCATTGGAGCACATAGCAAAATGCCAGCACTCAGCTGTGACCAGACTAACAAATCCTATTGCTAAATGG GACACTAAGGGTACACAAACAGTGTTGCTGCAACCTTTCTCTCCTATAGTGATAGCTGCTGATGAGAATGAACGTATCAG GGTATGGAACCATGAAGAAGCATCACTTCTCAACAGCTTTGATAACAATGATTTTCCTGACAAAGGAATTTCTAAACTCT GCCTAGTGAATGAGCTTGATGATAGCTTGCTTCTTGCTGCTTCATCTGATGGAAATATTCGAATTTGGAAAGATTATACT CTAAAGGGTAAACAGAAGCTTGTATCTGCATTCTCTTCAATTCATGGTCATAAACCTGGTGTGAGGAGTTTGAATGCAGT TGTTGATTGGCAACAGCAATGTGGTTATCTGTATGCATCGGGTGAGATATCATCTATTATGCTATGGGATCTTGATAAAG AGCAACTTCTTAATGCTATACCTTCAGCATCAGATTGCAGTGTGTCTGCATTGGCCGCATCTCAAGTTCATGGGGGACAA TTTGCAGCTGGGTTTGTAGATGGTTTCGTCAGACTCTATGATGTCAGAACACCTGAAATGCTCGTCTGTGGATTACAGCC ACACACACAAGGAGTAGAAAAAGTTGTGGGGATTGGCTTTCAACCTGGGTTGGACCCAGGAAAGATTGTTAGTGCTTCTC AGGCTGGGGATATCCAATTCCTTGATATAAGAAATCACAGCAGCGCCTATCTCACTATTTCAGCTCACAGGGGTTCCCTT ACAGCTTTAGCAGTACATAGACACGCTCCAATTATTGCCAGCGGTTCTGCCAAACAACTCATTAAAGTTTTTAACCTGGA GGGTGATCAACTGGGCACCATTCGTTACTATCCTACCCTAATGGCCCAGAAAATTGGTTCAGTAAGCTGCCTAAATTTCC ACCCATACCAAGTACTACTTGCTGCCGGTGCGGCAGATGCATGTGTATGTATTTATGCTGATGACAGCACTCAAGCAAGA TGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0452200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MALGDFMASRFSQSSVLVVPNHHHHHHDDSATSTTLDDADFGPRRDSEPAVASSSSGSAAAAYPNAATSLAYLPQTVVLC ELRHDAFEAAVPVGPSDSGLVSKWRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIDPFSMAPQKALESIGKS LSCQYERWQPKARYKCQLDPTVDEVKKLCTTCRRYAKTERVLFHYNGHGVPKPTVNGEIWVFNKYIPLPISDLDSWLKTP SIYVFDCSAAGLIVNSFIELHEWSASNTAGATRDCILLAACEAHETLPQSVEFPADVFTSCLTTPIKMALRWFCTRSLLR QSLDYSLIDKIPGRPNDRKTLLGELNWIFTAVTDTIAWNVLPHELFQRLFRQDLLVASLFRNFLLAERIMRSANCTPVSH PMLPPTHQHHMWDAWDMAAELCLSQLPSLVEDPNAEFQPSTFFTEQLTAFEVWLDHGSEHKKPPEQLPIVLQVLLSQCHR FRALVLLGRFLDMGPWAVDLALSVGIFPYVLKLLQTTTPELRQILVFIWTKILALDKSCQVDLVKDGGHIYFIKFLDSME AYPEQRAMAAFVLAVIVDGHRRGQEACIEAGLIQVCLKHLQSSSLNDSQTEPLFLQWLCLCLGKLWEDYTEAQAIGLHED ATSIYAPLLSEPQPEVRASAVFALGTLLDVGFDSCRSVGGDEECDDDDKFRAEVSIVKSLLSVASDGSPLVRAEVAVALA RFAFGHNKYLKSIAAAYWKPQTSSLINSLPSLTNIKDSVGGFSNQNQHKPHGNIVSPQIGPLRVGSENSKVVRDGRISSS SPLASSGIMHGSPMSDDSSHHSDSGILNDGFSNGVVNHTGPKPLDNALYSQCVLAMCTLAKDPSPRIANLGRRVLSIIGI EQVVAKPLKSTGVRPSEATATPSLAGLVRSSSWFDMNGGHLPLTFRTPPVSPPRPSYITGMRRVCSLEFRPHLMTSPDSG LADPLLGSAGAAGSSDRSFLPQSTIYNWSCGHFSKPLLTAADDSEEVLARREEREKYALEHIAKCQHSAVTRLTNPIAKW DTKGTQTVLLQPFSPIVIAADENERIRVWNHEEASLLNSFDNNDFPDKGISKLCLVNELDDSLLLAASSDGNIRIWKDYT LKGKQKLVSAFSSIHGHKPGVRSLNAVVDWQQQCGYLYASGEISSIMLWDLDKEQLLNAIPSASDCSVSALAASQVHGGQ FAAGFVDGFVRLYDVRTPEMLVCGLQPHTQGVEKVVGIGFQPGLDPGKIVSASQAGDIQFLDIRNHSSAYLTISAHRGSL TALAVHRHAPIIASGSAKQLIKVFNLEGDQLGTIRYYPTLMAQKIGSVSCLNFHPYQVLLAAGAADACVCIYADDSTQAR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 1355 1355 0.0
PANTHER 1 1355 1355 0.0
MobiDBLite 22 56 35 -
MobiDBLite 22 45 24 -
PRINTS 108 129 22 7.3E-150
SMART 109 258 150 2.9E-89
Pfam 110 257 148 5.3E-62
PRINTS 152 171 20 7.3E-150
PRINTS 173 194 22 7.3E-150
PRINTS 199 224 26 7.3E-150
PRINTS 293 313 21 7.3E-150
PRINTS 331 358 28 7.3E-150
PRINTS 366 390 25 7.3E-150
PRINTS 442 472 31 7.3E-150
SUPERFAMILY 458 880 423 9.75E-33
PRINTS 473 494 22 7.3E-150
Gene3D 476 758 283 1.5E-27
PRINTS 496 515 20 7.3E-150
PRINTS 520 536 17 7.3E-150
MobiDBLite 796 826 31 -
Gene3D 1018 1182 165 1.4E-14
SMART 1033 1070 38 99.0
ProSiteProfiles 1038 1360 323 18.457
SUPERFAMILY 1043 1352 310 5.66E-36
SMART 1073 1117 45 1.8
ProSiteProfiles 1100 1117 18 8.57
SMART 1173 1214 42 2.2
Gene3D 1183 1359 177 1.2E-20
PRINTS 1198 1216 19 7.3E-150
SMART 1266 1305 40 0.023
SMART 1318 1353 36 17.0

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process TOR signaling A series of molecular signals mediated by TOR (Target of rapamycin) proteins, members of the phosphoinositide (PI) 3-kinase related kinase (PIKK) family that act as serine/threonine kinases in response to nutrient availability or growth factors.
Cellular component TORC1 complex A protein complex that contains at least TOR (target of rapamycin) and Raptor (regulatory-associated protein of TOR), or orthologs of, in complex with other signaling components. Mediates the phosphorylation and activation of S6K. In Saccharomyces, the complex contains Kog1p, Lst8p, Tco89p, and either Tor1p or Tor2p.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0452200.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…