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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0554200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0554200.3 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Callose synthase; TAIR: AT5G13000.1 glucan synthase-like 12; Swiss-Prot: sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH Callose synthase 3; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QTX7|A0A0B2QTX7_GLYSO Callose synthase 3; Found in the gene: LotjaGi1g1v0554200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:108616289..108641390) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGAGAGAGAATGTCGTCGTCTTCCTCAAGGGGGCCGTCGGAACCACCGCCTCCACGGCGGATCACGCGGACGCAGACTGC AGGGAACTTGGGAGAGGCCATTTTTGACAGTGAGGTCGTTCCTTCCTCTCTCGTCGAGATTGCACCCATTCTTCGTGTTG CTAATGAGGTTGAGAAGACCCATCCCAGAGTTGCTTATCTATGTAAGGAAACCGGAATCAATTAACTCATCATACTAGTT ACTTATGTATGTTATTTATTTATGTTTACTGATCTCTGAGTTTTGTTCTTGTTTTTAGGTCGCTTTTACGCCTTTGAGAA AGCTCACAGATTGGACCCTACCTCCAGCGGTCGCGGTGTTCGCCAATTCAAAACCGCGCTTCTTCAACGCCTTGAAAGAG TAACCATTTCTCATCCAATTTACTTTATTTGGCACCCAGCTTGGGTTTTAGCCTATAGGAGCTTGTTAGTCGAGATATTT ATTTGAATCCTAACTTCTCTCATAAGTTGAAATTAGCATCCTCACCTAACTTCTCCAATAGCACCTGTAAACTTGTGAAG TCTTTTCATAAGTAAGGAAGCCAAATACTTATCTCATTTGAGAAGCTCCTATACACTCGAAGCTAATCTAAACTGAGCAT TGATGGTATATAGAATGAATAGTTTGCTTAGTGAGATTGGATGGTCCTTGTATTAATTCTAACTCTATATTTTTCTTTTG GTCAATTTGTTCTTTAATTGTTAGGAAAATGATCCGACCCTGAAGGGAAGGGTGAAGAAAAGCGATGCTCGTGAAATGCA GAGTTTTTATCAGCATTACTACAAAAAATATATACAAGCTTTACAAAATGCTGCTGATAAAGCTGACCGGTATGTTCCCT AGATAATTTCAATTTGATATTATCTGGCTATTGTATGAACTATAGTTTGTCTGTTCTTGCAGTGCACAGCTTACCAAGGC 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0554200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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AAGGTTTACTACTCTTGCTTGGTGAGGGCTATGCCAAAATCCAGTAGTTCTTCAGAGCCTGAGCAGAATCTGGACCAGGT CATATATAAGATAAAGCTTCCTGGACCAGCAATTTTAGGTGAGGGTAAGCCTGAAAATCAGAATCATGCCATAATTTTCA CACGTGGAGAAGGCTTGCAAACAATAGACATGAATCAGGATAACTATATGGAAGAAGCATTAAAAATGAGAAATTTGTTG CAAGAATTTCTTAAGAAGCATGATGGGGTGAGGTTCCCAAGTATTCTTGGACTTAGGGAGCATATATTTACTGGAAGTGT TTCTTCCCTTGCATGGTTCATGTCAAATCAGGAGACAAGTTTCGTGACAATTGGTCAAAGATTGTTGGCTAATCCCCTGA AGGTTCGTTTCCACTATGGTCATCCCGATGTCTTCGATAGGCTTTTTCACCTGACAAGAGGGGGTGTCAGTAAAGCCTCC AAGGTTATCAATCTAAGTGAAGATATTTTTGCTGGCTTCAACTCTACACTCCGGGAAGGAAATGTTACCCATCATGAGTA CATACAGGTTGGGAAGGGAAGAGATGTGGGTCTCAACCAAATTTCTATGTTTGAAGCAAAGATAGCTAATGGCAATGGAG AGCAAACACTAAGTCGAGATGTATACCGACTTGGGCACCGCTTTGACTTCTTCAGAATGTTGTCCTGCTATTTCACCACA GTTGGATTTTATTTTAGCACTCTTATAACTGTTCTCACTGTATATGTATTCCTTTATGGTCGGCTCTATCTTGTTCTCAG TGGGCTTGAAGAGGGTTTGAGTACTCAAAAAGCCATTCGGGACAATAAGCCCCTTCAAGTGGCTCTTGCTTCTCAGTCAT TCGTTCAGATTGGGTTTTTAATGGCGTTACCCATGCTGATGGAAATTGGCTTGGAAAGGGGCTTCCGAACTGCACTTAGT 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Protein sequence (LotjaGi1g1v0554200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 485 | 485 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 21 | 21 | - | – | |
| PANTHER | 10 | 1952 | 1943 | 0.0 | ||
| PANTHER | 10 | 1952 | 1943 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 29 | 182 | 154 | 8.2E-19 | ||
| Pfam | 44 | 171 | 128 | 7.8E-22 | ||
| Coils | 124 | 144 | 21 | - | – | |
| SMART | 319 | 435 | 117 | 1.3E-74 | ||
| Pfam | 321 | 433 | 113 | 6.1E-38 | ||
| Phobius | 486 | 503 | 18 | - | – | |
| Phobius | 504 | 522 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 521 | 543 | 23 | - | – | |
| Phobius | 523 | 545 | 23 | - | – | |
| Phobius | 546 | 556 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 555 | 577 | 23 | - | – | |
| Phobius | 557 | 580 | 24 | - | – | |
| Phobius | 581 | 599 | 19 | - | – | |
| Phobius | 600 | 624 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 605 | 627 | 23 | - | – | |
| Phobius | 625 | 635 | 11 | - | – | |
| Phobius | 636 | 652 | 17 | - | – | |
| Phobius | 653 | 663 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 662 | 684 | 23 | - | – | |
| Phobius | 664 | 684 | 21 | - | – | |
| Phobius | 685 | 714 | 30 | - | – | |
| TMHMM | 710 | 732 | 23 | - | – | |
| Phobius | 715 | 732 | 18 | - | – | |
| Phobius | 733 | 737 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 737 | 754 | 18 | - | – | |
| Phobius | 738 | 757 | 20 | - | – | |
| Phobius | 758 | 1515 | 758 | - | – | |
| Pfam | 1056 | 1765 | 710 | 1.3E-244 | ||
| Phobius | 1516 | 1538 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 1517 | 1539 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1539 | 1566 | 28 | - | – | |
| TMHMM | 1565 | 1587 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1567 | 1586 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1587 | 1597 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1598 | 1619 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 1602 | 1619 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1620 | 1660 | 41 | - | – | |
| TMHMM | 1656 | 1678 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1661 | 1678 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1679 | 1684 | 6 | - | – | |
| Phobius | 1685 | 1709 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 1688 | 1710 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1710 | 1762 | 53 | - | – | |
| TMHMM | 1762 | 1784 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1763 | 1782 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1783 | 1793 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1794 | 1811 | 18 | - | – | |
| TMHMM | 1794 | 1816 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1812 | 1830 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 1828 | 1850 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1831 | 1851 | 21 | - | – | |
| Phobius | 1852 | 1857 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 1855 | 1877 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1858 | 1879 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1880 | 1898 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 1898 | 1920 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1899 | 1920 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1921 | 1956 | 36 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | 1,3-beta-D-glucan synthase complex | A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain. | ||
| Molecular function | 1,3-beta-D-glucan synthase activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1). | ||
| Biological process | (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds. | ||
| Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0554200.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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