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LotjaGi1g1v0718700.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0718700
Transcript ID LotjaGi1g1v0718700.2
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description ARM repeat protein interacting WITH ABF2 protein; TAIR: AT5G19330.1 ARM repeat protein interacting with ABF2; Swiss-Prot: sp|B9DHT4|ARIA_ARATH ARM REPEAT PROTEIN INTERACTING WITH ABF2; TrEMBL-Plants: tr|M1AZA4|M1AZA4_SOLTU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0718700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:128756410..128767221) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTCATTTTGGGTACCAAACCTTAATCTTGCCCGAGCAATCTAACACCTAGATCCGTCCCTGATCCCAGTTGCAAAGTTTG TATTAAACCATTCACGATCTTCCTATCTCTCTCGTTCGTACTTTCCATCTACAGATTGCAATACACAGATGGATTCTCCA CTTGACAAGATTCCCCAACATGTTCTTGTCCTGAATTCCGCCCCCTCACCCTCTCTCTCAGATCGTGCTGCGGCAACAAC GGCCCTTTATGTTTTAAATGGTGCCATTGCCAGAGAAGATCAAGATTCTCCACGAGTTCTACTTGACAAGATTCTCCAAC ATCTTCGTATCATCAATTCCGACCAATATTGTAATACAGAGACACAGACGAAGGATTCTCCACGACCACGAGATCTACTT GACAAGATTCTCCAACATGTTCTTATCCTCGACTCCGCCCCCCCACCCTCTCTCTCAAGCCGTGCTGCTGCTACTACTAC GTTCGATGTTCGAAATGGCCCTCGCAGAGACGGTACACTTTCCACTCTTGTCCCCAGTTTCTATTTTGTTTGCGTAATGT TTTCATTTTATTGTCATGTAGCGGAGCTTGCGGATATACTGAATTGTCATGCTGTCCCTGTTATTATGAGACTTCTTTTT TATTTGAGAGATGAAAATAGTGGTCAAGGCTTTTCCGATACCTTCAAATATGATGTGCAGAGAGGATGTGCTTTGGTCCT CACCCTTCTATCTTTTCAAGTAATTGATTTCTTATGTTTTTGAACTGTGCAACATCAAGTTGTATTAATTCCTGACTTTA TATATTTGAGCTTATATATCTTTATCTTCAAACAGCCAAAGTATCAACGACTCATTGTTGATGCTGGAGCCTTGCCTCAT CTTGTTGATTTGTTAAGGGTGCACAAGGCTGGTGTCATGTCTCAAGCACTTCTTGGTATTCTTAAGACAACAGCAGGCGC AATAACCTATCTTGCCTATGAAAACTCCAACATTAAGACCCTTGTTAGGTTGTCCTTCCTTTCATACGTTAGAGATATAT GCTGCAAATCTTCTACCCTCTAGTCTTACACGGATATGGCGTGTTCAGGAATGAAGGTGGTATTCCTCCTCTTGTTGAAT TGCTTGAATTCAATGATTCAAAGGTACAGGTTGCAGCTGCAGGGGCCTTGCGAATTCTTGCATTCAGAAATTATGACAAC GCAAATCAGGTAGTTTACTTTGCACTGTGAATTGGTATGGTGGGTTCTATTGTCATAGTTGTTTAAGTGAATGAAATTTT TTGCAGATTGTTGACTGCAATGCATTGCCCACTCTTGTACTAATGCTTGCACCAGATGACCCTACTATACATTATGAGGC GGTTAGTCACTAATGAATTTCGATAATCCTTTGTATTTAATTTTGTTAGTTTCAGAGTTATAAGCTTTTAGCACTAGCTG AATTAGCGGTTTTTGCAGGTTGGTTTAATTAGAAATCTGGTCCACTCTTTGCCGAATATTAAGGAAGCTCTTCTTGAAGC TGGTGCTTTACAACCAGTGATTTGGTTGTTGAGGTAACATTGCACATAGGTCTTCCTTTTATTGTATCCAATACACATGA GAATGATGTGTTTGTCAAACATGTTAGCTACTTTGCTGCGAGTGAGCAATACCTTTTCTCCCTAATTAATCTATGCAAGT TCATAATTTTCATGATAGTTCCTCATGTTTGAAGAGCCAAAGAGAAGCAACTCTTTTACTTGGTCAGTTTGTTGAATTGG GTCGGGCTACTAAGGTGGATCAAGTTTTGTGCTTTTTGCTAAATACCACAATTCTATCATTCATGGAATAATTCTCGTGT TAATTTTCATACCTTGTGGTTCATGCAGGTTCAGATTGCCGAAAGAGGGGCTGTAAGACCTTTGGTTGACATGCTTACGT CCTCAGATGAACAACTTAGTGGAATGTCAGCTTTTGCTCTTGGGAGGTTAGCACAGGTGATTATTACTAGCAGCAAATAC TTGGTTGTCTGTTACGAAATTGATGAATATAAAGTGAAGTTGGGTAATTTTTTGGATGTATGTTGGAATTGATTTTTTAG ACCTATTTCTTATATAATATAATTCAACTGTTAGGACCCTGACAATCAAGCTGACATTACTTATAATGGAGGTATAGAGC CTCTACTCAATCTTCTTGGCTCAAAGAGTTATTTTGTCCAACACAATGCAGCCTTCACTCTCTATGGTCTAGCTGTTAAT GAGGTGGGAGTTAGTTTCCTTGTTCGTTACTTGGTCAAAACCTTGATTGTATGCTGCCACTGATATCATTGCTTGTTTTA TAGGACAATGTCGCAGATATTATTAAGGCTGGTGGTCTTCAAAAACTTCTTGATGGACATTTTAATACTATTGTATGTTA ATTAAGTGCATGTTTGAATAGACAGTGGAAAACCATGTTGAAGCAAACTTCATTGTCTACCTTGATTTTGTTCTCACTGT GGTTTTCCACCTTGTATCCAAACATGCACTTAGTCTCTTTTTTAGTGAAGTAATTTACATTCGGTTTACTTGTATTTCTT GATTATTTTATTTATTTATCAAGGTTCGCTAATAGAACTCCTTTCTCTCACTAATTTATTAATTGGGATATTACAGCCTA CTAAAAAGTGTGTAGCAATAACATTAAAAAAATTAGAGGACAAGATGCATGGGCAAGTGAGTTTTCTAGCACATTATCAA ATTTCTATGGCCACTGATTGATTATAGTCAATTTTGAGATTTGTAATCTATTTTAATACTTTTTTTCTTGCATAATATGA TGTGATTATTGTGTCATTTCCTCTTTTGTAGGTACTAAAACACCTGATGAATCTTATGCGCTTTGCAGACAAAGGTGTTC AAAGACTTGTAGCTATTGCTCTTGCTCATTTATGTTCTCCCAATGATCGTAAAACTATATTCATTGTTAATAATGGTAAA GATCTTAAATCTGTCCATTTTTGTCATTTCTCACTCACAATACTCGGAAAATATTTTCATTCAATAAGCTCCTAAATCTT TAGGACTAGAATTGCTTCTGGATCTTCTTGAATCTGCCAACCTAAAGCATAAGAGTGATGCTTCAACAGCGCTTTACAAG TTGGCTACCAAAGCCACCCGTGTCTATTGTGTTTTCCATGCTCCTCCATCATTCAAGGTATTTTACCATCATGCGTTCAA GCACTTATTCTAGGTTATCATAATTGCATCACTCATAGTTGAAATTGAGTTGTTGTTCATGTTATATGGATGACAATGAA CTAAACAGGATATTTGTTATTCACATTTTCTGTTATTTATTGTTGGTTGTATTTTCTGTAGTTGTACTCAGGCGAACAAT ATGTGAACAATCCTAATGTCTCTGATGTCACATTCTTAGTTGAAGGTGGATAAGTTGTTGCCAAATTGCTATTGCTTTCT ATTACTTTGTTTATATGCTTAATAATTTTGACATATGTACTAATTTACTTTGTTTTCCTTTCTTCAGGTAAAAGGTTTTA TGCTCATAGAGGTTCTTTAAAGGCTTCTTCTGATGTATTTCGTGCAATGTTTGATCAGTGTTATATGGTAATTTTTAATT AATCTTGGGACTTTGTTTTAAGCTTTGTTTTCTCTTCCATTCTGACCTGCCTGTGATGACTAGTCACTTTGCAATTGAAA TAGGGCTAATGGATCTGCGAAACTAAAGCATAAATATCTGCAATAATGGCTTAATATATGTATAATGCAGGAAAGTGATG CCCAAGATATAGAGATTCCAAATATTAAATGGGATGTCTTTGAGTTGATGATGAGGTATCGTGGTGCAAAGTGCAATACC TATTGTTCTTATTTCTAATATACTTTTTTATAATAAGCCTATGTATTAACTGGTTTTCAATTGGACTCTAGATTTATTTA CACTGGAACAATAGATGTCAATTTGGATATTGCTGAGGACCTCCTCAGTCTTGCAGATCAATATCTTCTGGACAATCTTA AGTCTCTTTGTGAACATGCTATTTCTCAGGTGGACCAATATTTCTTATACGCTTGTAGAATTTTTTTTATTGTTTGATTT AATCCAATGACTTTGAAATTATTCTTATAGGATATTTCAGTTGACAATGTTTCACTAATGTACGAGATGTCAGAGGCTTT CAATGCTACATCATTAAGAAATGTGTGCATATTGTTTTTTCTGGAGCAATTTGATAAGTTGAGTGTCAAACCATGGTATG TACAATCTTTACAACTTGAACAACACTTTAATAGTTGTTGTATTGTGAGGTTATAACTCATTGTTAGCATGAGCGGGGAC ATATATATTTTTTACATACACAACATTGAACATAGAGTAAACCATTCTAGTGAAGGACATCATACTAAAGTTTTGGGTGA AAGATGTGTCATCACTAATGGGATTTACTCCTTGTCCCATATGGTGTATTAAAAATATTTTCATGCCTCTTCTCATGCTA AAACAGTGAAAGATAACCTCACAACAAAACAACACTGACATCAGAGCGGATTGAGCCGCTTAACCTTTTTCTTATCAATA CTAACTACAATAGTGAAGACTTCTTCTGTTCTTCAGTGCAACAATAATAAATGAATGATCTTGAGTGAGCTTCTTTATTC TTCTAAAAGAAGCAATTATTGATATAGGAACACATCCTTCTTTGTTCTTCTTTACAAAAAACTCAATAGGTACTTATAAG TGAGCAGATTTTCTTTGTTGAAATAATACTCCACGTGCTTAATGATCTTAATTAAGCTTGAGGTCCTCATGGTGGTCATA 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ACCTAATTAAACCACACAAGAATATTCGTATGCCTTGTTGAAACTGAAAGGATGACCATGAATTTCTCAAACAAAAACAT CATGATTTATGAGATGAACATCTTCCCATAATTGTGATGTTAGTGTGGGATAACTGAAGGTAGTAGCTGCTCTGTTGATG TAGGTAAAATTTGATAGATAAATTTGGCTTAAAAGCGCGTGACACGTAATTAAACAAAATTTTGAACTTGAAAAAAGTGG TGAGGAGATTCAAACCCCCGAGACCTTGAACTAACAAAATACCCACTTTACCAGTTGAGTTACACAATCAATTGGTTAAA TCATAACCAATGTTTTATTTGTATCATACTTATTCATCATCATTCCCCTAGTTCTTCTCTGATTCTTCTTCATCATCTAC CTTATCTCATCATTTTCTTCATCATTTTCATCCCCAACCACATTGAAACCCAGATTTTTCCATCTTCAAGATCAAAGAAA AAAAAACATGCATTTCTTCATCATCATTCATCCCTAATCACATTGAAACCCACATTGAGATGATAGAGTGTGCAAAATAT ATCTTTGATTTCAAAATCAAGCTATGGATTTTGATTTAATTTGATTTTACTCTTTTTAGCTTGAAAAACCCAGTACGTTT CACTTTCTCCTGACTCCTCTTTTCTTTTCAATCAAATCTATTCCCATAGTTTCAATCTCAGGTTTCCATGATCAATTTCA AAATATGATGGATTTCTGAAATTTAATTACCCTAATAGCGCATCGCATCTTATGTGTTTGATATTATGCCTCACCGATTG AACATGTTTAATGCCCATAAACGTTGCATTTGATAGGGTTTTGATGAGAGTGTGCTTAAGAAAGGGTCCTCTTTCTTGTT CTGAGGAGGGTTTGGATTCTGAAGTAAGATATATTGTTGGGTTCGCAATATTTGTTATGAGTATTGGCCTTGTTTGTGTT AGTCGTTTCCTATCTGCAGTTGGCGTCAAGTTTATTTTATTTTGTACTTGCTGTGCTCATATCAAAGTGTTAAATTGTCT TGTATTTCTATACTCTTTTTTTAATTGATAAGAAGAAGAAACCTTGAAGATGATGATGATGAAGAAATGCATGTGGGTTT CAATGTGGTCGGGATGAAGATGATGATGATGAAAAAGAAATGCATTTTGTTTTTATTTGATATTTGGAGATAGAAAAATC TAGATTTGAATGCGGTTGGGGATGAAGATGATGAAGAAGAATCGGAGAAGGACAAGGAGAATGATGATGAATAATTATGA TATAAATAAAACTTTGGTCATGATTTAACCAATTGATTGTGTAGCTCAACTGGTAAAGTGAGTGTTTTGTTAATCTAAGG TCTCGGGTTCAAATCCCCTCACCACTTGTGGCATTTAACGGCAACGTTGTCCATTTTTTAACGTCGAATAGGAGAGAAAA AATTTGAGTATTCAAATTAAATAGGGTTAAACCTGAAAACCGTCCCTGAATTTTGAGCGAATTTGATTATCGTCTCTCGT CGGAAAATCTTCCTATGGACGCCCTCGAGCTTAGTTTTTTTTTGGAAATTGTCCTTGTCGTTAAAAAGCTCCGGCCGCCG TGTCCAAGTGTCTATTTTGGGCCTATGTGGACTTGCCACGTCATTTCATTAAATGACGTGTAATTTTTTTAAAAAATAAA TAAAAACTAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCCCCCAATTATTTTCTAATTAAAACTCTAACCCTAAAACTAACACTAAC CTAACTTCATCTCCTAATAAAATCATATTAAAACCCCTCATTTCATCTCTATTGATATTCATATTCAATGATCTTCATCA TCATCTTCACCATTAAGAACAAGAAATGCAGAATATAAATTTAAAAAATAAAAAACATATGAATGTTTATTTTGTTCATC ATCATCATCTTCATCTTCTCCATCCAAAATTTAAAAAATTAAAAATCAATCTCAGATCTAACAATCAGTAATTACTTCTC CTTTTTCTTCAAACTGCTTGAATTGGCCAATGTTAACAGCTACTTGTGCTGGATGTGCGACAAGCCACACGAGAATCTTG CAAATGAACACACCCACTCTACATGACATGCCTTCTCTTTGTCTACAATTGCAACTTGCAAATAAACAATTGCAAGTGAA CACAGTCTAATTGAAATATTGTACTGTTTCTTTCTAACCCAAACACTAAAAGGAAATTGAAATCTAAAAGCAAATTGAAA GTGTATACAAAACACTGCAGTCCAAATTCCAAAACCTATGCTCGGCTCAAGAGAAGACGCGTGCTGAGTCTTGGCTATTT TGTATGAAGTTATATTAAGCAAAGAACATAATATAACTCTACCTGTTCATACTGCAAACAACTTCAACATCACAACACAA CCACAGATCCTCCAGCCGCTGCCCACCACCGTCCGTGACACACCCCTGTGCACCGCTCCTCCGGACGCCGCCGGCCATTT GCCTTCTTCGCGAGCCCAACGCCGCCACTGGTCCTTGCTTGTGGCCTCCCCACGCTCGACCCCAAGTGCCGGCACTCCTC ACTCTGCATCGCCGCACTTCTTGCAGCAACCGCGCCTCCTTCCTTGTCCGGCGTCACTCAGATTTGCCCCTTCTTCCTTG TTCGACGCCTCTCCTACTAGCCAAAACCTGCGACCCAGACCTTCCAGCAACATCTCGCTCTCATAACCCCATCTCTTTCC CCAATCAACACCCTTTTGAGTGAATGAATAGAAAATGGGGGGTTTTGATCTGATCTGAAGGAGGAAGGGGTAGAAAATAG GTTTTAGTTGATTATTAGTTTCAGGGTTAGAGTTTTAATTAGAAAAGAATTGGGGGACTTAATTAAAATTAAAATTTTTA GTTTTTATTTATTTTTTAAAAAAATTTACACGTCATTTGTCCACATAAGCCCAAAACGGACACCTGGACACGGCGGCCGA AGCTTTTTAACGGTAAGGACGGTTTAAAAAAAAGCCAAAGTTCAAGGGCGTCCTTAGGAAGATTTTCCGACTAGGGATGA AAATCAAATCTCGCTCAAAGTTCAAGGACGGTTTTCAAGTTTAACCCAATTAAATAAGTTTGTGTAAGCAAAATTACTAA AAACTCAACTATTTCTTGAAATAGAAAAAGTGAAGGGCTGGTTTTGTCCTAGTGAAAAAGTGTTGTATGCTAACTTACTC CTTTTAAAAAATAAGTGGGAGTTAGTTAGCTATATATATATATATATATATATATATGAGAAAGGTAATCTTATGTGAGA AAATGAGAATAAATCACGACCGTTAGATCTAACCATCAATGGTCAAGATTAAAACATTAAGTCATGTGACTTTTTTAAGT GATCATGTGACAATCACATGACCATTAAATTCTTTTAATCTTAACCGTTGATTGTTAGATCTAACGGTCGTGATTTATTC TCATTTTCTCACATAAGATTACTTTTCTCATAAGATACATCCCCATATATATATATATGTATCTATATATATATATATAT ATATGTATATATATGTGTGTGAGATGTATCTCATAAGAAATGTGATATTATGTGAGAACCTGAGAACGAATTAAAACTGT TAGATTTAATTATGAATGATGTAGATTAAAATAATTAATAGTCATGTGATCACTTAAGTCATGAAGTCACATGACTTCAT GTTTTAATTTATATCATTCATGATTAGATCTAACGGTCGGTTGTGATATATTATATATATATATATATATATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATCATAAAAAACAATATGTACTAATAAAGTGATAAAAAAAGGGCAAAACTTATG TGCTGTTTTTGCTGTTCACCAATTAAAATTGGACATGTGTATTATTAATCCAAGTCATTAAATATTAAATACCAAATTAT CTGACACCGTCATTCCTTCTTGAACTTGTGCAAACAGCCAAATAACACCGATGGAAAAAAAAGGGTTCCATGAAGAGAAG CTTAACCAAATCAGAACGAGATCTGAGAAATTCACCAGAATAGTGACAAAAGTTTCACAAAATGTAGAATTAGATTCACA ATTGGCCATAAGCAATCACTAAATCTTCAATAATAATAAAAACACCCACAGATGGTGTCTTGTGCCAAGAGGCGTTTCTC GGACGCCATTAATGGAGGTTCTGGAAAATGGGTTCTCTATAGGAGTTGTGGATCTGAGGTGGGTTCAGGTAAAGATGGTG GATCTGCAATCTCCCTAGGCATTGAATTTCTAATCCTGCTGCAAAGCATCATCTTCCTTTTCGTTCATCTTACTTATCTC CGTACTTCTTGTTTTGTTTTTCATACTGTTTCTTCTTCCACTTTTAAATTACCTTATGACGTGGATTAGTAATACACATG TCCAATTTTAATGGGTGAACAGCAAAAACAGCACCTAAGTAACTGCATCTAAGTTTTGCTCATAAAAAAAACCGATTTCT AAAGTCAAGTCATAAAGAACATCTCAAATACATTGAAATTTAAATTCTAATGCAGTGTTGATTATAAAAGGATTAATCAA CGTAATATTATCATAATTTGAAAACAAATGCAACAATATCTTAAAAGATGAACAAACTTTAAAAAACTAAATATCTCCTG CAACTATTATAAGTGCATCGCCAATAATCGTTCATTGTTTTATCGATCATATTTTTTTACCATCTGCTGCTCAATATGCA GGTATTCTCGCCTAGTTTGTCGCATTGCACCAGGCATACGCAAATTTTTCTCAGATTTATTTGAGAAGTACGATTCAGCT GACTCTTGAGGATTCTTAAACTTTAAAAAAAGTGAAAAATGTTCAAAAGATGTAACTGATTTATTTAGTTAGAAATAGAA GTACATATCATTTTTTTATAGAAATCTTTTGGGATGAGGAAGAGTCATTTCATGTAGCATTGAGCTATAAGGGGCCTTTT GTTATAAGATTGGGAAATACGTATCCGAGAATATGAAAATTGGGAATGTATATTCCCGCGTTTGTTATAAGGTTGGAAAT TTGATGTCTGGG 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0718700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATTCTCCACTTGACAAGATTCCCCAACATGTTCTTGTCCTGAATTCCGCCCCCTCACCCTCTCTCTCAGATCGTGC TGCGGCAACAACGGCCCTTTATGTTTTAAATGGTGCCATTGCCAGAGAAGATCAAGATTCTCCACGAGTTCTACTTGACA AGATTCTCCAACATCTTCGTATCATCAATTCCGACCAATATTGTAATACAGAGACACAGACGAAGGATTCTCCACGACCA CGAGATCTACTTGACAAGATTCTCCAACATGTTCTTATCCTCGACTCCGCCCCCCCACCCTCTCTCTCAAGCCGTGCTGC TGCTACTACTACGTTCGATGTTCGAAATGGCCCTCGCAGAGACGCGGAGCTTGCGGATATACTGAATTGTCATGCTGTCC CTGTTATTATGAGACTTCTTTTTTATTTGAGAGATGAAAATAGTGGTCAAGGCTTTTCCGATACCTTCAAATATGATGTG CAGAGAGGATGTGCTTTGGTCCTCACCCTTCTATCTTTTCAACCAAAGTATCAACGACTCATTGTTGATGCTGGAGCCTT GCCTCATCTTGTTGATTTGTTAAGGGTGCACAAGGCTGGTGTCATGTCTCAAGCACTTCTTGGTATTCTTAAGACAACAG CAGGCGCAATAACCTATCTTGCCTATGAAAACTCCAACATTAAGACCCTTGTTAGGAATGAAGGTGGTATTCCTCCTCTT GTTGAATTGCTTGAATTCAATGATTCAAAGGTACAGGTTGCAGCTGCAGGGGCCTTGCGAATTCTTGCATTCAGAAATTA TGACAACGCAAATCAGATTGTTGACTGCAATGCATTGCCCACTCTTGTACTAATGCTTGCACCAGATGACCCTACTATAC ATTATGAGGCGGTTGGTTTAATTAGAAATCTGGTCCACTCTTTGCCGAATATTAAGGAAGCTCTTCTTGAAGCTGGTGCT TTACAACCAGTGATTTGGTTGTTGAGTTCCTCATGTTTGAAGAGCCAAAGAGAAGCAACTCTTTTACTTGGTCAGTTTGT TGAATTGGGTCGGGCTACTAAGGTTCAGATTGCCGAAAGAGGGGCTGTAAGACCTTTGGTTGACATGCTTACGTCCTCAG ATGAACAACTTAGTGGAATGTCAGCTTTTGCTCTTGGGAGGTTAGCACAGGACCCTGACAATCAAGCTGACATTACTTAT AATGGAGGTATAGAGCCTCTACTCAATCTTCTTGGCTCAAAGAGTTATTTTGTCCAACACAATGCAGCCTTCACTCTCTA TGGTCTAGCTGTTAATGAGGACAATGTCGCAGATATTATTAAGGCTGGTGGTCTTCAAAAACTTCTTGATGGACATTTTA ATACTATTCCTACTAAAAAGTGTGTAGCAATAACATTAAAAAAATTAGAGGACAAGATGCATGGGCAAGTACTAAAACAC CTGATGAATCTTATGCGCTTTGCAGACAAAGGTGTTCAAAGACTTGTAGCTATTGCTCTTGCTCATTTATGTTCTCCCAA TGATCGTAAAACTATATTCATTGTTAATAATGGACTAGAATTGCTTCTGGATCTTCTTGAATCTGCCAACCTAAAGCATA AGAGTGATGCTTCAACAGCGCTTTACAAGTTGGCTACCAAAGCCACCCGTGTCTATTGTGTTTTCCATGCTCCTCCATCA TTCAAGTTGTACTCAGGCGAACAATATGTGAACAATCCTAATGTCTCTGATGTCACATTCTTAGTTGAAGGTAAAAGGTT TTATGCTCATAGAGGTTCTTTAAAGGCTTCTTCTGATGTATTTCGTGCAATGTTTGATCAGTGTTATATGGAAAGTGATG CCCAAGATATAGAGATTCCAAATATTAAATGGGATGTCTTTGAGTTGATGATGAGATTTATTTACACTGGAACAATAGAT GTCAATTTGGATATTGCTGAGGACCTCCTCAGTCTTGCAGATCAATATCTTCTGGACAATCTTAAGTCTCTTTGTGAACA TGCTATTTCTCAGGATATTTCAGTTGACAATGTTTCACTAATGTACGAGATGTCAGAGGCTTTCAATGCTACATCATTAA GAAATGTGTGCATATTGTTTTTTCTGGAGCAATTTGATAAGTTGAGTGTCAAACCATGGTATTCTCGCCTAGTTTGTCGC ATTGCACCAGGCATACGCAAATTTTTCTCAGATTTATTTGAGAAGTACGATTCAGCTGACTCTTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0718700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDSPLDKIPQHVLVLNSAPSPSLSDRAAATTALYVLNGAIAREDQDSPRVLLDKILQHLRIINSDQYCNTETQTKDSPRP RDLLDKILQHVLILDSAPPPSLSSRAAATTTFDVRNGPRRDAELADILNCHAVPVIMRLLFYLRDENSGQGFSDTFKYDV QRGCALVLTLLSFQPKYQRLIVDAGALPHLVDLLRVHKAGVMSQALLGILKTTAGAITYLAYENSNIKTLVRNEGGIPPL VELLEFNDSKVQVAAAGALRILAFRNYDNANQIVDCNALPTLVLMLAPDDPTIHYEAVGLIRNLVHSLPNIKEALLEAGA LQPVIWLLSSSCLKSQREATLLLGQFVELGRATKVQIAERGAVRPLVDMLTSSDEQLSGMSAFALGRLAQDPDNQADITY NGGIEPLLNLLGSKSYFVQHNAAFTLYGLAVNEDNVADIIKAGGLQKLLDGHFNTIPTKKCVAITLKKLEDKMHGQVLKH LMNLMRFADKGVQRLVAIALAHLCSPNDRKTIFIVNNGLELLLDLLESANLKHKSDASTALYKLATKATRVYCVFHAPPS FKLYSGEQYVNNPNVSDVTFLVEGKRFYAHRGSLKASSDVFRAMFDQCYMESDAQDIEIPNIKWDVFELMMRFIYTGTID VNLDIAEDLLSLADQYLLDNLKSLCEHAISQDISVDNVSLMYEMSEAFNATSLRNVCILFFLEQFDKLSVKPWYSRLVCR IAPGIRKFFSDLFEKYDSADS 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 74 735 662 2.8E-290
PANTHER 74 735 662 2.8E-290
Gene3D 93 211 119 7.4E-6
SMART 121 173 53 22.0
SUPERFAMILY 127 208 82 3.26E-5
SMART 174 222 49 0.028
ProSiteProfiles 185 235 51 10.517
SUPERFAMILY 211 545 335 1.15E-51
Gene3D 212 352 141 1.4E-30
SMART 224 264 41 4.8E-8
Pfam 227 263 37 2.2E-7
ProSiteProfiles 235 266 32 11.392
SMART 266 306 41 2.1E-6
Pfam 268 305 38 8.4E-5
ProSiteProfiles 277 319 43 9.572
SMART 308 348 41 9.6
SMART 350 390 41 16.0
Gene3D 353 555 203 5.8E-29
ProSiteProfiles 361 403 43 10.062
SMART 391 431 41 6.0
ProSiteProfiles 402 444 43 11.322
SMART 506 546 41 8.8
SUPERFAMILY 555 670 116 5.02E-29
CDD 563 678 116 6.8724E-60
Gene3D 567 710 144 8.6E-41
Pfam 569 671 103 3.6E-25
SMART 576 673 98 2.0E-25
ProSiteProfiles 576 643 68 18.617
CDD 672 735 64 5.70083E-23

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0718700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…