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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0555700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0555700.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | TATA-binding protein associated factor-like protein; TAIR: AT3G54280.1 ROOT GROWTH DEFECTIVE 3; Swiss-Prot: sp|B5BT18|BTAF1_ARATH TATA-binding protein-associated factor BTAF1; TrEMBL-Plants: tr|K7LS80|K7LS80_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0555700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:97329741..97344713) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTGCATGGATTGCATAAACATAATTTTATGCTTTGTTCCCTTTCAGGAATATGATATTGGAAATGATAATTCAAAGAACC CGAAGGAGCGATTGGTTCGCCAGAAGCAAAATCTTCGACGTCGATTAGGTTAGTAAGTTTGTTTCAAGTTGTAATATGTT ATCACTTATCACCTATCATAGTAGTCAATAGCGGCAAATAGCGGCGCTATAGCGGCGTAGCGGAGCGGAGCGGCTCCCTG CCGCTATTGAGATGAAATAGCGGCCAACTTCACAATAGCGGTCGTAGCGGCGCGAATAGCGGCCAAAATAGCGGCAGATC GCGGCCAATAGCGGGAAATAGCGGCGCTATATGAACGAAGGAGAAAATGACTCAAGCCTCTTTGTTTTAAATCGTTGGGG AACCTTTTTATGGGCATGTTAGGACTTCTCAGGGCCATTATAGGTCAAAATTGAAAGAATTAAGCTTCATTCTTCATTCA GATTTGCAAATTCGACTTCTTTACCTTGCTTTTGAGAAGTTATTAGTTGTGTGTTATTGTTCAAGACTTATGATTTTTAT TTCTATTATGAATGTTATGAATTTTAGGCAATATTTGACATTGTTTGCTATTTATATGTATATAGTATTAAACTATTAAT GATATAAAATTACATAAAAAAATTCAGAATAGCGGCCATCCCGCTATGCGCTATCACGCTATCCCACTTTTGGGGCCGGC CGCTACGCGCCGCTATCCGGGATTGACTACTATGTCACCTATGAGTTAAAATGAAATAATGACTTTAAATAAGTAGGTAG TTGCTCAACATTTATGGCTTATTAAGTATCAACCCTAGTTGATGTAAATGGACACTTGTTGAGCACAACCCAAACTCTAG AAAACCACCACAAAATCAGCTTACTGAAGAAACTGGAATGGATGAGGCTTTAGAGTTTCACCATAAATATCAATAGGTTG 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0555700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATTGCATAAACATAATTTTATGCTTTGTTCCCTTTCAGGAATATGATATTGGAAATGATAATTCAAAGAACCCGAA GGAGCGATTGGTTCGCCAGAAGCAAAATCTTCGACGTCGATTAGGTTTGGATGTCTGCGAACAATTTATGGATATCAATG ATGTAATAAGAGATGAAGATCTTATGGCACCGAAATTTGAATCACAGATCAATGGAATAGATCATAGAGTTTTTACATCT TGTTCTGTACATAATATCCAGAAAATGGTTGCAAAAATGGTTCCTAGTGTTAAGTCTAAGTGGCCAAGTGCAAGAGAACT GAATCTTTTGAAGCGCAAAGCAAAAATAAACTCAAAAGACCAAACTAAAAGCTGGTGTGAAGATGGAAGTACAGAGGCAT CAGGTGCTCAAAATTTGACTTCAAAAGGCATATGTGCGGATACAGTAAATTATGGCAAGGCATTCGTGGATGCTAATCAT GATGATGACGGCTTGGATCATGATGGGGATGGACAATGGCCTTTCAATACTTTTGTTGAACAACTTATTATAGATATGTT TGATCCTGTTTGGGAGATACGGCATGGTAGTGTGATGGCATTGAGAGAGATTTTAACACATCAAGGTGCTTCTGCTGGAG TATTTAAACATGATTCACGGTTCGGTGGGACCTTGTTTGTTGAATTAGAGGACAAAAGTATACCAAAAATATTGAAGAGA GAGAGGGAAATTGATTTGAATATGCAAGTTTCAGCGGATGAGTCTGTATCAAACTTGAAGAAGCCAAAACTTGAAGATTT ATCATCATCAACTTCTTTGGATAGTGTGATGACTAGCAGCAATGAAGGTGATATTGAAATCAGCATTTGTTCTGAAACCC ATGGAAGCGATATACCTTTGGACAATGTGAATGGGAAATTTAATGGTAATTCTGTTGCCATGGATCTGGAATCTCCCTCT GACTCTTTACATGATGCATACAACGAATCTGCTAATTTAGCAGAGCAGAAGGGTTATTCTGATGACAGTAATATTCCTTC TGGAAACCCTAATGTGCTGAGAAATCTTCCTCAGAATTGTGAGCTGATGAACCTGGTTAAAGTGGCTAGGAGTTCCTGGC TTCGAAATTGTGAATTTCTTCAAGATTGCGTGATACGCTTTTTGTGTGTTTTGTCACTTGATCGCTTTGGAGATTATGTA TCTGATCAGGTTGTTGCTCCTGTGCGTGAAACCTGTGCACAGGCATTAGGTGCTACGTTTAAGTATATGCATCCAGCACT AGTAAATGAAACACTGAACATATTATTGAAAATGCAGTGTAGGCCAGAATGGGAGATTCGTCATGGCAGTCTTCTTGGTA TCAAATATTTGGTTGCTGTGAGGCAGGAGATGCTTTCTGATTTGCTTGGACGTGTTCTTCCTGCATGTAAATCTGGGCTG GAGGACCCAGATGATGATGTTCGAGCAGTTGCTGCTGATGCTTTAGTCCCAGCTGCAGCTGCAGTTGTTGCTTTACAGGG TCAAACATTGCATTCAATTGTGATGCTGTTGTGGGATATATTGCTTGATTTGGATGATTTAAGTCCATCCACCAGCAGTG TGATGAATCTTCTGGCAGAAATTTATTCTCAAGAAGAGATGATCCCTAAGATGTATAAAGTTTTTAAATTGGGAGACAAT GAAATAGAAAACGCAGATGGTGGTTGTGGTGATGATGACGGAGAAGAAAATCCTTATGTGCTTTCAACTTTGGCACCGCG CTTGTGGCCTTTTATGAGGCATAGCATCACATCTGTCCGTTATTCAGCAATACGGACTCTGGAGAGGCTACTTGAAGCTG GATATAAGAGAAACATGTCTGAGCCATCTAGTGCTTCATTTTGGCCCTCTTCTATATTTGGAGATACCCTTCAAATCGTC 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TCTGCTGTTGCTGCAGCTGTTGTTTGGATGGCTCAATTTCCTACACGACTCACCCCTATCATTTTGCCTTTGATGGCTTC AGTCAAACGAGAGCAGGAGGAAATAATTCAAGTGAAGTCAGCTGAGGCCCTTGCTGAGCTAATGTATCACTGTGTTACTC GTAGACCTTGCCCCAATGATAAATTAATTAAAAATATATGTAGTTTAACTTGCATGGATCCCTCTGAGACTCCTCAAGCT AAATCCATCTGTTCCATTGAGAGTATTGATGACCAAGGTTTGCTATCGTTTAAAACTCCCGTGAGCAAACAGAAGTCTAA GGTCCATGTTCTAGCTGGTGAAGATCGATCGAAGGTCGAGGGATTTATAAGTAGACGTGGATCTGAGCTATCCTTGAGGC TTCTATGTGAGAAGTTTGGTGCTTTGTTATTTGATAAGCTTCCTAAGCTGTGGGATTGCCTTACTGAGGTTCTTAAGCCA AGCTCCTCTGAGTCCCTACTTGCCACTAATGAAAAGCAAGTTACTGCTGCTATTGAGTCTATCTGTGATCCTCAAACCTT GATTAACAATATCCAGGTGGTGCGGTCTGTTGCTCCCATGTTAAATGAGGAGTTGAAACCAAAACTTTTGACACTTCTCC CATGTATTTTCAAATGTGTTCAGCATTCACATGTTGCAGTTAGATTAGCTGCTTCACGCTGCATTACTTCAATGGCCCAC TCAATGAAAGTGAAAGTTATGGGAGCTGTGGTTGAAAATGCTATCCCTATGTTGGAAGATGCATCATCAGTTCATGCTCG GCAAGGAGCTGGCATGTTGATTAATTTTCTTGTTCAGGGTCTGGGTGTAGAGTTAGTCCCTTATGCTCCTCTATTGGTGG TTCCACTTCTAAGATGCATGAGTGATTGTGATCAGTCTGTCAGAAAGAGTGTGACCCATAGTTTTGCTGCTCTTGTACCT TTACTTCCTTTAGCGCGAGGTCTTCCCCAACCAATTGGATTAGGGGAAGGTGTATCTAGAAATGCAGAAGACTTACATTT TCTGGAGCAACTCCTTGACAACTCTCATATTGAAGATTATGAGTTGTGCACTGAATTGAAAGTAACATTGAGAAGATATC AACAGGAAGGCATAAATTGGTTAGCTTTTCTAAAGCGTTTCAAGCTTCATGGAATTTTATGTGATGATATGGGGCTTGGA AAAACACTTCAAGCATCAGCCATTGTAGCCTCTGATATAGCAGAGCATCGAACTCCAATTGGGAATGATGATCTTCTGCC ATCTTTAATTATTTGCCCATCAACACTAGTTGGGCACTGGGCCTTTGAGATAGAGAAGTATATTGATGTTTCAGTGATAT CTAGTCTTCAGTATGTTGGTTCTGCTCCTGACCGAATGCTTCTCCGTGATAATTTTTGCAAGCATAATGTCATTATAACA TCATATGATGTTGTCCGTAAAGATATTGATTATTTGGGACAGCTGTTCTGGAATTACTGTATTTTAGACGAAGGACATAT AATCAAGAATGCTAAGTCTAAGGTTACACTTGCTGTAAAGCAGTTGAAAGCCCAGCACCGTTTAATATTGAGTGGGACAC CAATCCAGAATAACATAATGGACTTGTGGTCTCTTTTTGATTTTCTGATGCCTGGATTTCTTGGAACAGAGAGACAGTTC CAAGGAACATACGGAAAACCACTTTTAGCTTCTAGAGATCCAAAGTGCTCTGCTAAGGATGCTGAAGCAGGAGCACTTGC TATGGAGGCATTGCATAAGCAGGTCATGCCTTTCCTCCTTCGAAGGACTAAGGATGAAGTCTTGTCTGATTTGCCGGAGA AGATAATTCAAGACAGATACTGTGATTTGAGCCCTGTACAACTTAAACTTTATGAACAGTTTTCTGGTTCTCGTGCAAAG CAAGAAATGTCATCTGTTGTAACGACAAATGAACCTGCTGCAGCAGAAGGAAGTAGCCGTAATACTAAAGCGGCTTCACA TGTTTTCCAGGCACTCCAATACTTGCTAAAACTCTGCAGTCATCCATTGCTTGTCTCTGGTGGGAAGATTCCAGATTCAT TCTCTGCCATATTCTCGGAACTGTTTCCTGCTGGCTCTGATGTCATTTCGGAACTTCACAAACTCCATCACTCCCCAAAA TTAGTCGCTCTTCATGAGATTCTTGAAGAGTGTGGAATTGGAGTTGATGCTTCAGGTTCTGAGGGTACAGTCAGCATTGG GCAGCACAGGGTCTTGATATTTGCTCAACATAAGGCTTTCCTTGATATAATTGAAAGAGATTTGTTTCAGACACACATGA AGAATGTCACATATTTGAGGCTGGATGGATCAGTTGAGCCAGAAAAGCGTTTTGAAATCGTCAAAGCTTTCAATTCAGAC CCTACCATTGACGTCTTGCTGCTTACAACACATGTTGGGGGGCTTGGTCTGAACTTGACATCTGCAGACACCCTTGTTTT TGTGGAGCATGACTGGAATCCTATGCGTGATCATCAGGCTATGGATAGAGCACACAGGCTTGGCCAGAAAAAAGTAGTTA ATGTCCACCGTCTAATAATGCGTGGTACTTTGGAAGAGAAAGTTATGAGCCTACAAAGGTTCAAATTGTCGGTGGCCAAT GCTGTCATTAATTCAGAAAATGCCAGTATGAAAACAATGAATACAGATCAGTTGCTTGATTTATTTGCATCTGCAGAAAT CTCCAAGAAGGGGGCTTCTGTCGTGAAAAGTTCAGAGGACAACTCTGACGGAGACACTAAATTAGTAGGCAGTGGGAAGG GGTTGAAAGCAATACTTGGGGGATTGGAGGATCTATGGGACCAATCACAATATACAGAGGAGTACAATCTGAATCAATTC TTGGCAAAGCTTAATGGCTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0555700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDCINIILCFVPFQEYDIGNDNSKNPKERLVRQKQNLRRRLGLDVCEQFMDINDVIRDEDLMAPKFESQINGIDHRVFTS CSVHNIQKMVAKMVPSVKSKWPSARELNLLKRKAKINSKDQTKSWCEDGSTEASGAQNLTSKGICADTVNYGKAFVDANH DDDGLDHDGDGQWPFNTFVEQLIIDMFDPVWEIRHGSVMALREILTHQGASAGVFKHDSRFGGTLFVELEDKSIPKILKR EREIDLNMQVSADESVSNLKKPKLEDLSSSTSLDSVMTSSNEGDIEISICSETHGSDIPLDNVNGKFNGNSVAMDLESPS DSLHDAYNESANLAEQKGYSDDSNIPSGNPNVLRNLPQNCELMNLVKVARSSWLRNCEFLQDCVIRFLCVLSLDRFGDYV SDQVVAPVRETCAQALGATFKYMHPALVNETLNILLKMQCRPEWEIRHGSLLGIKYLVAVRQEMLSDLLGRVLPACKSGL EDPDDDVRAVAADALVPAAAAVVALQGQTLHSIVMLLWDILLDLDDLSPSTSSVMNLLAEIYSQEEMIPKMYKVFKLGDN EIENADGGCGDDDGEENPYVLSTLAPRLWPFMRHSITSVRYSAIRTLERLLEAGYKRNMSEPSSASFWPSSIFGDTLQIV FQNQLLETNEDILQCSERVWSLLVQCSVEDLEAAARSYMSSWIELASTPFGSALDSSKMYWPVAFPRKSQLRAAAKMRAV KIGNEYGGDPGLDSTKLTILQDKNRDVALNSVKIVVGADMDTSVTHTRVVTATALGIFASKLPEGSLKYVIDPLWSSLTS LSGVQRQVASMILISWFKEIKNMSLSKIPDGIPAALRDWLLDLLACSDPAFPTKGSHLPYAELSRTYSKMRGEAGQLLNA VKSSGMFNELLETTKIELDSVSVDDAIGFASKIPAFCNDSSTNESLGKNTMDDIESSKQRLLTTASYLKCVQSNLHVTVT SAVAAAVVWMAQFPTRLTPIILPLMASVKREQEEIIQVKSAEALAELMYHCVTRRPCPNDKLIKNICSLTCMDPSETPQA KSICSIESIDDQGLLSFKTPVSKQKSKVHVLAGEDRSKVEGFISRRGSELSLRLLCEKFGALLFDKLPKLWDCLTEVLKP SSSESLLATNEKQVTAAIESICDPQTLINNIQVVRSVAPMLNEELKPKLLTLLPCIFKCVQHSHVAVRLAASRCITSMAH SMKVKVMGAVVENAIPMLEDASSVHARQGAGMLINFLVQGLGVELVPYAPLLVVPLLRCMSDCDQSVRKSVTHSFAALVP LLPLARGLPQPIGLGEGVSRNAEDLHFLEQLLDNSHIEDYELCTELKVTLRRYQQEGINWLAFLKRFKLHGILCDDMGLG KTLQASAIVASDIAEHRTPIGNDDLLPSLIICPSTLVGHWAFEIEKYIDVSVISSLQYVGSAPDRMLLRDNFCKHNVIIT SYDVVRKDIDYLGQLFWNYCILDEGHIIKNAKSKVTLAVKQLKAQHRLILSGTPIQNNIMDLWSLFDFLMPGFLGTERQF QGTYGKPLLASRDPKCSAKDAEAGALAMEALHKQVMPFLLRRTKDEVLSDLPEKIIQDRYCDLSPVQLKLYEQFSGSRAK QEMSSVVTTNEPAAAEGSSRNTKAASHVFQALQYLLKLCSHPLLVSGGKIPDSFSAIFSELFPAGSDVISELHKLHHSPK LVALHEILEECGIGVDASGSEGTVSIGQHRVLIFAQHKAFLDIIERDLFQTHMKNVTYLRLDGSVEPEKRFEIVKAFNSD PTIDVLLLTTHVGGLGLNLTSADTLVFVEHDWNPMRDHQAMDRAHRLGQKKVVNVHRLIMRGTLEEKVMSLQRFKLSVAN AVINSENASMKTMNTDQLLDLFASAEISKKGASVVKSSEDNSDGDTKLVGSGKGLKAILGGLEDLWDQSQYTEEYNLNQF LAKLNG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 14 | 1858 | 1845 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 173 | 1369 | 1197 | 6.34E-56 | ||
| Gene3D | 378 | 539 | 162 | 9.0E-7 | ||
| Pfam | 659 | 1113 | 455 | 3.3E-103 | ||
| Gene3D | 1112 | 1285 | 174 | 5.7E-9 | ||
| Gene3D | 1302 | 1561 | 260 | 1.5E-69 | ||
| SUPERFAMILY | 1309 | 1562 | 254 | 4.35E-56 | ||
| SMART | 1326 | 1522 | 197 | 1.1E-27 | ||
| CDD | 1330 | 1562 | 233 | 4.67614E-139 | – | |
| ProSiteProfiles | 1342 | 1512 | 171 | 20.468 | ||
| Pfam | 1348 | 1644 | 297 | 4.6E-60 | ||
| SUPERFAMILY | 1563 | 1864 | 302 | 1.34E-58 | ||
| Gene3D | 1572 | 1888 | 317 | 3.7E-75 | – | |
| CDD | 1677 | 1819 | 143 | 1.01609E-53 | – | |
| ProSiteProfiles | 1680 | 1854 | 175 | 13.691 | ||
| Pfam | 1708 | 1808 | 101 | 1.3E-13 | ||
| SMART | 1722 | 1808 | 87 | 2.7E-16 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0555700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…