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LotjaGi4g1v0080700.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0080700
Transcript ID LotjaGi4g1v0080700.3
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Uridine kinase; TAIR: AT2G01460.3 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q54R62|UCKC_DICDI Uridine-cytidine kinase C; TrEMBL-Plants: tr|I1KM57|I1KM57_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0080700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:10515499..10538082) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGATGATGAAGTTGTTCAGCGCGTTTTCCATGAAGGAGGACGCGATTACTTCCAGCAACAACCTTCAACTTCATCGTC TTCTTCCTCCTCCATCCTCCAATCTCTCCCTCTCCATGTGGTATGCATTTTCTTCTTCAACTTCAATTTTTAGGGCTTCA AGCTTAATTTCATGTTTTCTGTCTTGATTTTGATAATTAAGCATATCGATGAGCACGCCAAATAGCTGAGTAGTAAAATT GATTTCGTTTTGATAATTTAATTGTGTATTTGTTTGTTTGTGAGTGAGTGAGAGAGATTTTCTGATTATTTTGAATGTTG TTGATGTTCATGTGAATTGAAATTCTTTGTGGTTTAATTCTCATGATCCATGAAATTTTTGTGGAAAGGATTACTAAAAT GTGGGTGAAAATTGTGCAGTCTTTTGATCATGGATATTATTTGTTGGTAAAATCGATCCAAGAACTTCGAGAGAAAAAGG ATGGTCTTGTTACAGTTGGCATTGGTGGTCCAAGTGGTTCTGGTAAAACAAGGTAAGGTGTTATTTATATTGTGGTCAAT GTATTGTTTAGAATGTGTGGTTTATGGCTTAATGTGTTTTCAATTTCATGTTTCGTGAAGCTTAACGGAAAAGGTGGCAT CTGTTATTGGTTGTACTGTTATATCAATGGAGAATTATTGTGATGGAGTTGATGAAAGGAATGATCTGGATTCTATAGAT TTTGATACCCTGATCAAGAATCTTGAGGTGTGCATTTGCTTTTCTCTCATTTTACAACGTCTAAGATGCTGTACTGGCCT TTTCTTGAGTTTTATGGTTGAATTGGCTTTGATGGGTTAGCATGGCTGATATTACAAACCCCTTAGATTTTACACCTTCA CTTTGTTACCTTCTCAAGCTTTTTATGTTTATATTGGCAAAATGCAACTTCCTGAGATATTTGTCCTTGATTACTCTTTA 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CTCCGGCAGCAGCAGCTTCTCAAGTTAATTATATTTGTTACAAGCTATGCATATGACAAATATGCTCTAGCTTGAGGGGT AGATCTGGATATTGTTAAATCTTAATTATATTTGTTACAAGCTATGCATATGACATATATGCTATAGTTTGAAGGGAAGT GTTGGATATTGCTAAATATCCTAATAGAGACCACAGTCAACCACCGCCGACAATCGTTATCCTTGTTGCTGGTTTGGTGG AGGGTGTATTCAAGAAGTGTTTGGTTGGATCTAATTGTATTGCGCTGCATTGTTCTCGCTGGTCCTATTTGTGTTTCGGC CAGGTTTGGTTTTTAAGGTCCTCTATTTGACGTGTGTTGTGGCGCCACCGTTAATGGTCGTCCGGTCTTCCTCTTCCAGT TTGGTTTGTGGGTCTTCTGTGTTTTCTCATCTGCGATGTTTCTTGCTGTTTGAGTTCTTAGTTTGCGTGTCATGGTTCGT GATGCTCTTATTATATTGATCTTGGCTGACTTTATGCAATTTGGTTTTGTTTGGTTTTGAAGGTGACAGTGTCACCTTCG TTTGTTTTGTCTCGATTGTTTGGTTTTCTGGTTTTAGGGCTTCAACTGCAAGTTGCGCTGGCCCACTCTCTAGTTGAGAG TTATTGGTTTTGGTTTTAGGGCTCTAGCTGCGAGTTGCGCTGGCCCGCTCTCTAATGTTTGAGAGTTGTCTGTGTCAAAG TTGACACCATTGTTTGTCTTAGAAGCCATCAATCGATCGACCTCAAGTATGTTTTATTTCTGTGTGGTTGTTGTTGGTGA GTTGTTGCTTCAGCCTTGTTCAGTCCTGGACGTGAGGGGGTGTGTTAGAAGTCCCACATTGGCTAGAGATAGAGCATAGA TAGCCTTTATATATGGTTGTGCAAACCTTAACTCTTGAGCTAGCTTTTGTGGTTGAGTATAGGCCTCCCAATTTCTAATA ATATGCACCAAACTTGTTACATATTTAACTAATTCTAGGACCTCTCAAGGACTTAGTAAAGACATATGCCAATTGATCGT TTGATTTCCATTAGCAGTTGATTGTTAGATATATAAATAACTAATTCTAGTGCCTATGTTTCATTCTGTTAGCCATTGTG AATTTTCAAGAGGTCCAACATTCACCCAACACTTAACATATCATGTTGACTTCATGCTTTAGGCAAGGGAAACCAGGGTA TAGATTTGAGTTTTACCAAGTTCCAGAACTTAGATTGTGTCAGCCTGCTGTTCCTATTGCATTTGAATTAAGAATCTGGG TTTTCCAAGGTACTCAGATCAATTGGATAAGGTGGGGGCATGAACAGATTTGGAGGTATTTCCTTCTCAGTTTCAAAGAT TGGGCGATTCTTAGGTTGCAAGTTTGCAAATCATGGTCATTAGAGAAGACATCCAATCAGAAATCTATTACTGATTTGCA TGGACTATTTGAGGTGTGATAAGAAGCATTGGTTGGGAGTAGTACGAGCTGAAGAAGAAAGATTTGGTAACTCTACAGCA AAAACAGCCTCTTTTGCTTCTAATCTTAGCAGGGAATGAACTACCAGTACAGCCTGGACAAGTGTTGACAGCAACTCTAG GTTCTCCAGTTGAATTACAAGGATTGGTTACAGGCATAATCTGCTGGAACAAGATGGTTTGGCTGTTGGCTCAAAGGGAA ATTGTGGTCTCTCATTTTCCCTCTGCTTGTCATGTTTTAAATAGTGGGATCGTGGTGGTATTTTGTTTATAGTTATCAGT ATTTTATTATAAGTACAACATGTATCTTGATACCATACAAATTCTTGAAGCAGCGATACGTATCGCAGTATGAATCTAAA ATGAACTTGCATCTCATTTTGTATCTCTGAGTCGGAGCTGAATCTTACGATTCACGGTTCACTGTTGAATCTTACGATTC AAAGTTGTGTACAGGTTGCACTCCAGTCAAGTCAGGTTGTGTGACTCGTATGTGAAGATAAGAGATACAGAGAGAAAACA AAAATAACAGAAAATAGAAATTGAATGTAACTTGTATTCAAATTCTGAAGTCATTACAAAGAGTAGACTTATATAGCATA CTATTACTAACTGTAAGTACATGTGCAAACCACATGTTAACTAGCTAGTGCACATGCACAGCATAGCTGGCACTTATAGG TGTGGGTATCGATACGGCCATATATGTACTTAGCACCTATGAGATTAAAGTTGCTACTTACAGAGGTAAAGGAATGAGTA TGGTTATTTTAAATTACCGGTTTGGGGATGAGTACGATAATACCCTACCCAAACCTTGCCCGTTATCACCCCTAACTTAT ATTTGTCAAAATGATAGATACCTCTTGCAGATTTCTTTCTTAAACTTGTCTACAGTTGGTGTGTTTAGGTATTATTATTG ATTGGAAGCACGTTTGTGTCAGGTACCATGCAGTTGCGTACATTGAAGCATCCGCATTCATCTATCAGGATGGAAAGGTC ACATGATTTATATTATCTCTTGCATTTGGGTTAAAATGAATAATAATTAGTTGATAGAAGTTGCAAGGCCAAAATGAACT TGTTCGTGTTTCTCTAGCTCCCTGCTTCCTTAAACCTAAACTTGGCTGATTGAGAACCATGATAATTCAAGTCGTTTTCA ACTTTTGAATTTTATAGTGAATTGTGTTCATCAGAACTCATGTTCAGATTTATGATGATGAATTCTTGAACTGTTGGCCA AAAATAAATAGTGAATTGTGTTCATCAGAACTCATGTTCAGATTTTATAATGAATTCTTGGACTGTTTGGTGTAAGTATT GTGAATTTCAATGATGCAACTGAAGATTCCATGATTATTATCTGTAAAGTATACTTGAACATCACACTTTTATAATAGAA CCGGGATTTGAAATAAGTTATACTGTTGAAGGATAAAGTATCTTTGAAGTGAGTTTGTCTCTAAAGTGGACAAGAAGGTA TATCCACCATTGTTTAATCTGTAATCTTAACTCATAAAATCTAGGGGTTCATACACACTCTTAAATTGTGTTAAGCCTAA CTCAACCCTATATGCTAGCTCATGAAATGAGAATTATTCAAGCCTTTATAAGCACTACTGGGGCTGTATTTCTTGTTCAT ATGAGATCTTTGCCACACTCACCCCACATTGAGAACCGGTCAAATGGAGCATGGAGATTATAGGACTTACCGGTTAAGCT GAAGGACTGGGTTCATTGCAGTGGGAAAGTCGTCGGGCCAGGTGGACTTTTAAACAACGGTGGGTGACCCAATGTCGGAT CTTTTGATCCAAGTCTAGTTCAATCCCAAAATTTAGCTTGTGCAATTAGGATTTCCCAAGTCTTTAAAAGCTCTAGTTTG ACCATACCTCTAGTCAACATGGAATCTTAAGGCACCCTTTTTCTTAATAGACACCCTTCTTTTTCTTAATAGACAACCTC ACTTTAGAGGAGTTTTTCCATTATGAAAAACAAAAAAGAGATGCAAGATATGTTGAATATTCTTTTAATAATTACATAGA ATGGTTACTTATGACCGTTAGATATGCTTTGATCGGACAATGTCCCTTCTTTTTTGGCGTACTTCAAATAACTAATTGCT TTCTAAGTTTCCTAATCGGTCCAGTGTAATACTATATTATGCAATTTGGGATGATTATTAAGAATTTATTGATTGACCAT GTCTTACTAATAATAGGTGAATGGTGAGTACTTGTGGATTTTGATGTAAAATTTCATGTTTAGTTTGTGATCAAGAATTC TGATTGGGTCTTACTGATATTTGCAATGCATCACTTTTTGTTTGATGATTGATAGCTCAGTTTTGCAGCTACAAAGATTA CCTTTTGTACCACTTCTTCAATTTCCTTTTGAGCCACCACTCAAATTTGTTGCATATGCACATTGGAATAATTAAGTTAT GATATTCTATTGTGTGGGGGAGGGGGCGGGGGGGGTCACTTCTAGGCTTATCTATGATTAATTTGCTTCTGAGTTGCCGC TGATTTTTTTTTTTCTTTCTATTTTCTTGTGTAGATTCTGATTGAGGTTGATCATCTACAAGATGTCTCTGGCCCATACA TCCAGATAAAGGGTGTCAATAAAGATGCTGTGGCAGCAGCTGGTTCAATGCTTAAATTGGATGGTTCATATACTACTAAG GTATTGACTTTCTTCCTTTATTATAGTTCCCTTTTTGTGTCTGGTGCATAATTCAGGCGCTTAATCAATCTAGTCTGTCA TGTCTTGATGGTGCTTAACTTATTGTTCTTGTTCATTTTTTTGGTAGAGTTATCTTGAAATAGTCTTGGAAAGACTACCA GCAATAGAGAGAAACTCTGGTGGGATTCACTCTCAGCAATCAGCAAAGTTGCAAGAGATTGTTGAATTTATTCAATCTCA GGTAGCATTTATTATTTGGACAGATTTTAGTCTATTTTTTCGGGGCTTCATCAAATATTAGCCATCTAAGTATTTGACTC TATTGAAATTATATTGGTTTAGTTAAAGGAGGAAAAGATAGATAAAAGAATTTGCGGATATTTTGATGCATCATATCTTT TTATACAATAGTGAAGCCAAGAACATGCAAACATCCTACGGGGTATAGCCGCATGACCTGATTGATCCTAAACTCTTTGG GTTTTGATTTATTCACACTTCATTTTCTCTTCCATTCCATCTTCACCAACTTTCTGTTTCTATCTTTTCATATCACATCA CCTATCATATCATTCATTTCTCTCCCTTCCTTCTCTTCCTTCATCTCTCTAGGTGTTGGTGAATTTTTTTGTGTGAATGA AGTTCTATCCATACTCTATAGTACCTAGGGATCTACTCCTTTTTAGTCTACACATCTTGCGTCATGCTAATGCTAAGCAA ACCTACACTGCACTGGACTCCTGGATTGGTCCAAAGCTACTGCATTCCTGAATGTAGCGAACCTTTTTTGCATTTGTGAA GCATTTAATGTAATTTTTTAGGCATAATCATTTAGTGGAAATATGTTGGAACAAACAGGGAGGTAGCTCTTCTTCAGAAT CCTCACCAAGTACGGGAGTCTCTCCAATTGAAGGTGTTATTGAAGAGATGCAATCAAGGATTAGAAGGCTTGAAAAGTGG CTTGCTATAAATACGGTACTCCCAAAGCCTTACCCTATTCTCAAAGTGCTTGCTTTCTTCGAATTCACTTTAACTGTTGC ATGATTTTATTAATTTGTTTATTTGAAACTGTGCGCAGGTTCTATGGACATTTCTGATGTCTGCCCTTGTTGGTTATTCA CTGTATCAAAGGAGGCGTCAATGA 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0080700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATGATGAAGTTGTTCAGCGCGTTTTCCATGAAGGAGGACGCGATTACTTCCAGCAACAACCTTCAACTTCATCGTC TTCTTCCTCCTCCATCCTCCAATCTCTCCCTCTCCATGTGTCTTTTGATCATGGATATTATTTGTTGGTAAAATCGATCC AAGAACTTCGAGAGAAAAAGGATGGTCTTGTTACAGTTGGCATTGGTGGTCCAAGTGGTTCTGGTAAAACAAGCTTAACG GAAAAGGTGGCATCTGTTATTGGTTGTACTGTTATATCAATGGAGAATTATTGTGATGGAGTTGATGAAAGGAATGATCT GGATTCTATAGATTTTGATACCCTGATCAAGAATCTTGAGGATTTGACAACAGGTGATGATACATTAATTCCAGAGTTTG ACTATCAGCAAAAGAGATGTATTGGCTTTAAAGCAATAAAGAGTACTTCATCTGGGGTGGTAATTGTTGATGGTACATAT GCATTACATGCAAAACTAAGGTCTTTACTGGATATTCGAGTTGCTGTGGTTGGTGGTGTTCATTTTAGTCTTCTTTCTAA AGTCCGCTATGACATTGGAGATTCTTGTTCTCTGGATTACCTTATAGATAGCATTTTCCCGTTGTTTAGAAAACACATTG AGCCAGATCTTCATCATGCACAGATCAGAATTAATAATAGCTTTGTCTCATCGTTTAGAGAGGCAATCTACAAGGTTAAA TGCCGAAGCGAGTCTTCAGAGGGGCATTCAGATTCTGTCTTTCAAGGAAATGAAACCCAAACAGATAATTTTATTGAAAT GTACCTTAGACCACCTTCAGCTAGTGAAGAAGCAAGAATAAACGACTGGATCAAAGTGCGGCAGTCTGGAATTAGGTATT ACTTATCACTTGGGGACCAGAGGATTGTTGACAAAAATTTCATAATCAGGCCTAAAGCAGAGTTTGAGGTTGGACGAATG ACATTGGGTGGATTGCTGGCTCTTGGGTACAATGTTGTGGTTAGTTATAAACGGGCATCCACAACTGTCAATTATGGCAA GGTTTCAATGTCTTATGAAACCATTGATGCTCTTGGTGAGACATTCTCAGTGATGAGAGGAACTAATAGGAAGACTGTTG GAACAGAAGCTTTGAGGATGGGTATCAATGGACCTTGGATTACTAAATCCTACCTGGAACTGATTCTTGAGAGAAAAGGC GTACCCCGTCTTAGTACACCGCCACTTGTGTCTAATACAACTGTGATTGGTAGTCAAGAAACCGCAATCGTTGCACCAAA GCCAATTCGTCTTACTCCTAACCTTGTTACTGGGCTTGAGGATGTATCTCAGCCGTGGACTCGATCCCCAACTAAATCGA AAATAGAACCTGTTATGGCTGCATGGCATTTCATATCTTCTGAATCTTCCCAGCCTGACAACTCAGTACTAGATCCATCT TTCAGGGACAACATTAGGCTTGCTCCAATGCCTGATTCATATGACTTGGATAGGGGATTGCTTTTGGCTGTTCAAGCAAT ACAAGCTTTGTTGGAGAATAAAGGTGTCCCAGTCATAGTCGGAATTGTAGGTAGAGGTCCTAGTGGGTCTGGAAAGACTA GTTTGGCTCATAAAATGGCAAATATCATTGGTTGTGAAGTAGTTTCTCTGGAAAGCTATTATAAACAAATAAAGGATTTT AAATATGAAGACTTCAGCTCCCTTGATTTATCTTTGCTTACAAAGAATATTGATGACATACGAAATGGTCGAATAACAAA AGTACCTATATTTGACTTGGAAAGTGGTGCTCGGATTGGCTTCAAGGAACTAGAAGTTTCTAAAGATTGCGGAGTGATTA TATTTGAAGGCGTGTATGCTTTGCATCCTGATATCCGAATATCACTCGACTTGTGGATTGCTGTTGTAGGAGGTGTTCAT TCACATTTGATTTCAAGAGTTCAAAGGGATAAGAGTAGAGTGGGATGTTTTATTTCCCAAAATGAGATCATGATGAGAGT TTTTCCTATGTTCCAGCAGCTTATTGAGCCTCATCTTGTTCATGCACACCTTAAAATTCGAAATGACTTTGACCCTGTGC TTTCTCCTGAGAGTTCATTGTTTGTACTAAAGAGTAATAAAAAAGTAGCTTATCAAGATATTCTAGCAATTCTTGATCCA GCAAAGTTTTGCAGTTCTGTTCAGAAATTTATTGATATATATATACGGCTTCCTGGAATTCCTTCTAATGGAAAGTTGTC AGACAGTGATTGTATTCGAGTCAGAATATGTGAAGGCAGATTTGCATTACTTATACGTGAGCCTATCAGAGAAGGAAACT TCATAATTCAGCCTAAAGTGGATTTTGATATTGGCATTAGTACGGTTGCTGGTCTTCTTAACCTTGGGTACCATGCAGTT GCGTACATTGAAGCATCCGCATTCATCTATCAGGATGGAAAGATTCTGATTGAGGTTGATCATCTACAAGATGTCTCTGG CCCATACATCCAGATAAAGGGTGTCAATAAAGATGCTGTGGCAGCAGCTGGTTCAATGCTTAAATTGGATGGTTCATATA CTACTAAGAGTTATCTTGAAATAGTCTTGGAAAGACTACCAGCAATAGAGAGAAACTCTGGTGGGATTCACTCTCAGCAA TCAGCAAAGTTGCAAGAGATTGTTGAATTTATTCAATCTCAGGGAGGTAGCTCTTCTTCAGAATCCTCACCAAGTACGGG AGTCTCTCCAATTGAAGGTGTTATTGAAGAGATGCAATCAAGGATTAGAAGGCTTGAAAAGTGGCTTGCTATAAATACGG TTCTATGGACATTTCTGATGTCTGCCCTTGTTGGTTATTCACTGTATCAAAGGAGGCGTCAATGA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0080700.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDDEVVQRVFHEGGRDYFQQQPSTSSSSSSSILQSLPLHVSFDHGYYLLVKSIQELREKKDGLVTVGIGGPSGSGKTSLT EKVASVIGCTVISMENYCDGVDERNDLDSIDFDTLIKNLEDLTTGDDTLIPEFDYQQKRCIGFKAIKSTSSGVVIVDGTY ALHAKLRSLLDIRVAVVGGVHFSLLSKVRYDIGDSCSLDYLIDSIFPLFRKHIEPDLHHAQIRINNSFVSSFREAIYKVK CRSESSEGHSDSVFQGNETQTDNFIEMYLRPPSASEEARINDWIKVRQSGIRYYLSLGDQRIVDKNFIIRPKAEFEVGRM TLGGLLALGYNVVVSYKRASTTVNYGKVSMSYETIDALGETFSVMRGTNRKTVGTEALRMGINGPWITKSYLELILERKG VPRLSTPPLVSNTTVIGSQETAIVAPKPIRLTPNLVTGLEDVSQPWTRSPTKSKIEPVMAAWHFISSESSQPDNSVLDPS FRDNIRLAPMPDSYDLDRGLLLAVQAIQALLENKGVPVIVGIVGRGPSGSGKTSLAHKMANIIGCEVVSLESYYKQIKDF KYEDFSSLDLSLLTKNIDDIRNGRITKVPIFDLESGARIGFKELEVSKDCGVIIFEGVYALHPDIRISLDLWIAVVGGVH SHLISRVQRDKSRVGCFISQNEIMMRVFPMFQQLIEPHLVHAHLKIRNDFDPVLSPESSLFVLKSNKKVAYQDILAILDP AKFCSSVQKFIDIYIRLPGIPSNGKLSDSDCIRVRICEGRFALLIREPIREGNFIIQPKVDFDIGISTVAGLLNLGYHAV AYIEASAFIYQDGKILIEVDHLQDVSGPYIQIKGVNKDAVAAAGSMLKLDGSYTTKSYLEIVLERLPAIERNSGGIHSQQ SAKLQEIVEFIQSQGGSSSSESSPSTGVSPIEGVIEEMQSRIRRLEKWLAINTVLWTFLMSALVGYSLYQRRRQ 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 927 927 -
PANTHER 2 244 243 4.2E-261
PANTHER 2 244 243 4.2E-261
SMART 62 212 151 0.33
SUPERFAMILY 64 177 114 1.2E-12
Gene3D 64 239 176 2.9E-26
CDD 65 227 163 2.64982E-52
PANTHER 497 559 63 4.2E-261
PANTHER 497 559 63 4.2E-261
SUPERFAMILY 504 689 186 2.92E-15
Gene3D 516 694 179 1.5E-28
SMART 516 662 147 0.08
CDD 519 689 171 1.78457E-46
Pfam 526 686 161 2.1E-11
PANTHER 565 953 389 4.2E-261
PANTHER 565 953 389 4.2E-261
SUPERFAMILY 727 861 135 4.58E-7
Phobius 928 949 22 -
TMHMM 928 950 23 -
Phobius 950 954 5 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0080700.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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