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LotjaGi5g1v0244300.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0244300
Transcript ID LotjaGi5g1v0244300.2
Related isoforms 8
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Histone-lysine N-methyltransferase; TAIR: AT4G02020.2 SET domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9ZSM8|EZA1_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase EZA1; TrEMBL-Plants: tr|K7LGU2|K7LGU2_SOYBN Histone-lysine N-methyltransferase; Found in the gene: LotjaGi5g1v0244300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:55266538..55281091) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTCCTGCTTTGTCAGTCTTCTCGTACGAGATGTCATTATTACAGGAAAGTCTCCTCAAGTGAGAAGTTCTCATGTGAAAG TCAATCTCATCAAAGAGAGAACAACTCCATAATTGCAATGTCTCACTTTTTCCACCTTGATAGATTAGCACATCCAAGTT TGTCAAATTCTTTTGTAGAACAAGAACATAACATGCATCAATTGTTTGAAGTATTTAATGAGAGATTAAAAGACACAAAA AAGATAAAGATGTGACATGAAGAGGGTGCTTTTCAAAAAAGATAAATTGGAAGGAATAAGAAATGGTGGCCGTAGATAGT GGCGGAAAAGAACAACACGGACACAGCAGCTGAAATTACGTTCCGATGTAGTAGGCCATGTCAGATATTTACCAACAAAA ACCACCATTTACAGAGCGAGTGTGCGTTTTTCTCTCTCGTTCTTCTTCTTCCTCCTTTGATCAATTGACTCACTCTGATC CCTTCCATTTCCATGGTGTCCAAACCTACGGACTCTGCTCTCAAACTTCCTCGAGTTAGTCTCTCTCCCTCTTTCTTCCT CGAGTTTGATTATTACCTTTCTAGATTATTGAATTGAATCAGATAGTTCAGAATTCTCTGTAATGTTCTCTACTTGAAAC ACTACAACAGCTATTCAATTCACTAGTAGTAGGGCTTTTCGATCACCCTTTATCTTCAATTTCAACCTGTGTTTCGTTCA TGCTAATTCCTTTTCAAAAAGATACACTGTCAATATATAGTGCCAAGTGATTATTTGTTTTTTAAATGTATGTAACTCTG TGTTTTCTATGATAATATGATATTGACAGAAACAGCATGAAGAGCCAGAAAATTATGCTGTTGGTGTTGGGAACAACTTG TACACCAAGATAAATCAGCTGAAAAAGCAAATCCAGGAAGAGAGAATTGTATACGTTAAAGTAAGTTTGTAATTGGGTGT 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AAGATATTTACTTCTCGTGGTCGTATGTTGGTTTGTTTGTATTAGTGTGTGGAATCTAAGCACATATGATGAAGTCCAAT GAGATTGATCCGGATAGACGATCAAATAGGGTTTTACTTGATTAGCTAAGCTTCCGAACTCAAAAACAAGAAATGATCAT TCATTTCTAAATGACAAGAAATATGTAACTTACTATCTGTTAATATTTTGTTATTTCTTCAAAACATTTTTCCAAGTTTG GCAAAGCTCCTATAAAATGTATTTTCAAGTTAACTTGTGAACTGTTCTGTAGAATCATGTAACATCATTGTTGACAAATT GTGATTTAAATAATAATTTCTTATACCTGCAGTTGTTCAAAGAGCTGCAAAAACCGGTTCAGAGGATGCCATTGTGCCAA GAGTCAATGCAGAAGCCGACAATGTCCATGCTTTGCTGCTGGACGTGAATGTGACCCAGATGTCTGTCGAAATTGCTGGG TTAGGTAATGTGCCAAATATTTTCACTGTGAACTTGATTTTATGCCTGTAGACTTTTTTGGATTTACATTTCTCAACTAA ACCTTTCACAATTCCTGCACTGACCACAGAAACCTAAGTTACAACTTTGTGATAATATTATTTATGTATGGTTTTTTTTA ACTGATTTATTTATGGTTTATACAAGTATTATTGTTTCAGCAAATATTCACCGGTCCATATGACAGCTTCATGCATCAAA AGTTCAGCACACTATTTAAATATTAATATTTAGCAGCTATGCTTCAGAAAATTTATCAATTAAATAAATGCTTCAATGCG AGATGGTTGAAGATGACCTTTGGGTACTTTATTGTTATACCCCATTCCCATTAAGAATGAAAGAGGGATTAAACATGTAG GGTGCATTTGGCTGTGGTTCACATATGAGAAATGACAAACGGTGACCTTGTGCAATATCCATCTTGTCTGATATCAGTGT 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CTTTTTGACTTAAATGATCAGGCATGTGTCTCATTGTCTCAGCATGGTCTACTTTTACTTTTTTCTCTTAACATCGGCTA CTCTGGCTTTTCTCAAATTGCTGTGAGCTTCCTTGTAATTTATAAGTGTGTCATCATATATTGATTTGTTATACTTCTTT TTCCCTCGTGTCAAGCTATAACATGTTGGGATTTCAAACTGTTTATTTTAGACCTTAAATCTGCTATCTGTTTCTTCACA GTACGTTCTCGATGCTTATCGCAAAGGAGACAAGTTGAAATTTGCAAACCACTCATCAAACCCCAACTGCTATGCAAAGG TGAGTCCATAAACTCAAGTTTTTGGGAGTTTTAAAACTTGCCCTTTGTGCTTAGTAGCGTGTACATGATCTTAGAAATTG TCACAATAATTGGCCTATTGCACCACTTTCATAGGTAATGCTGGTTGCTGGAGATCACCGAGTAGGGATATTCGCCAAGG AACACATTGAAGCTAGTGAGGAGCTCTTCTATGATTATCGCTACGGTCCAGATCAAGCGCCCCCATGGGCTCGTAAACCA GAGGGTTCCAAGAGAGATGAATCAGCAGTTCCTCAAGGCAGAGCAAAGAAACACCAGTCTCATTGATGATGAGCCATGGC CAAGGTCCAGCATGTACACACATTTTTGGCTTCTACCTGTATATTCTATACACAGATAAAGTTGTGACATCACACCAGAA GACTCAAGCAACTGTGACTGAATAAGGAAATGAGTAATTGGTATGCTGATGCTAATATACCTTAAGTTATGGAGATATGA CATGGTTATACAATAAAATGGGTAAGAGATGAAGCAAATACAAATGTTGAGGGCAATAAGCTAGAAATTAGCCTAGCAGT GGTAACAAAAGTATAGAATTTCCTTTTGGATGTATGCTTATTTGGCATCTTTTTCTTTTTTCCATGAATAAGGTAAATCT TTGCTATTTGCTAATAGTGAAAATAAGGAGTGCTATATATACATATACATGCACAATTACAGTTTCCTGGGACTTAAATT CAAGACAATTTCAAAATGAAATATGCTAGTAAGACTCACTTTAGCACTACTTTCCCAACACTTTCTTATTGATTGATTGA AATTTATGTAAGGTTCACTAAAAAACAAGTGAGTTAATGGGAAACCATTGAGGACAAGAAGTGCTTCAAAACCATACATT ATAAGCAGGCTAAGGCACACCAAAATCCAGACAAATGCAGCTTATATTTGAGGAAAGTATCAAGATCATGCTACAAGACC GAAATTAAAGAGAAGGTTACAACAGATTTCAATCAAACGCAGTTCAGATTTCTGCAAAGTATCAATTAGAAAACAGCCTC AACAATAGCATGCTTCTTTTTGGGGTATCCCATTCCAAGCATGTGGTTCAAGTACACCTTGCCATCTTTCACAGTTGCTG CTGTGGCCAAACGGTGCTTAGGCCCTGAGAATGTTGCCACAACAGAAGCTGTGTCCCACCCATCTGCACTCTCCACTAAT CTCCCTGAAGGGCTCCCAGCAACTACAAGCTTATTAGGAGACAACAGTTCTAAACCATCACCAAAATAAAGAGGCCCTCC TTCTACCTTTATTATCTTCACTTCCTCTCCTTTGGCTAAATCAATCTTGAACAAATTGCCGCTGAAAGTGTGGATCACTA TCAAAAACCCATCTGGGTGGTAAACGATGCCGTTTAGCCCAAAAAAGGTCTTGTACCACTCTTTTGGGGTGAAAAGTGGG TTTCTAATGATGGATAGAAGCTCTCCATCCACCCCAACTTTCCATATTTTACTGCCTTTTACATCAGTGACATAGGCATT GCCTTCTGCATCTACTGCAACATCGTCAGCAAAGGACTTCTCATCACCTGCAGGCGACGGAAAACCGACATTAATGAAAC 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TAATATTGCTTCACCAAGTTAGATATTTTTTATGAGATTAATTTCTATGCACCGACGGTGTAAAAAGTTTTACATCATTA TTCAATCACAACCTTTCATTTTTTATTTTAGATAGTATTAAATTCAAAATCAATTGTGAGCTAACAAAATGGAG 

CDS sequence (LotjaGi5g1v0244300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTGTCCAAACCTACGGACTCTGCTCTCAAACTTCCTCGAAAACAGCATGAAGAGCCAGAAAATTATGCTGTTGGTGT TGGGAACAACTTGTACACCAAGATAAATCAGCTGAAAAAGCAAATCCAGGAAGAGAGAATTGTATACGTTAAAGAAAAAC TTCAAAAGAATGAGAAGATGCTAGAATGTCATATTTCAAGAGTCGTGTCAGCAATATCAACCAGGGACTCTTCACAGACG GAGGAAAATAGGACACATTCACTTCTTTCCTCCAGGATCGGCCATCCTTTATGTAAACTTAATGGTTTCTCTCAGGCTTC AGGGGACAAAGACTATAACAATCAAGATGTATCATCTGCTACAAGCATCAAGATTCCACATATTGAAAGATTACCACCAT ATACATCTTGGATATTTTTGGACAAAAATCAGAGAATGGCTGAAGATCAGTCAGTTGTTGGAAGAAGACGTATCTACTAT GATCAACATGGAAGTGAAGCACTGATATGTAGTGACAGTGAGGAAGAGTTAACAGAACCTGAGGAAGAAAAACATGAATT TTCTGAGGCTGAAGACCGTGCTATATGGATGGCATTTGAGGAACATGGAATAAATGAGGAGGTATTGAATATTGTTAGCA AGTTTGTTGGGGGCACCAGTTTAGAAATTCAGGAGAGGTACAAAAGTATCAAGGAAAATAACAATGGTAGGTTAGGCCGT CATTCAGAAGGCTCAGGAGAATACAAATCTCATATTGGCATATGTCCAGAGAAAAGTTTGAGTGCTGCATTAGATTCTTT CGATAACCTTTTCTGTCGCCGGTGCCTGATTTTTGACTGTCGCCTGCATGGATGTTCTCAACCTTTAATATATCCTAGTG AAATGCAGACAGTTTTGCCTGGGCCTGAAGGTGACAGGAAACCATGCAGTGATCAGTGTTACCTTCAGCAGTTAAAGGTT ATCAAAAGTGTGTCGGGAGATTCAACTCGTGAGTCTTTTCAGGATAAAAAAACTACAATTATAGAAGAGGCTGACGGGAT ATTGGCACCCTCCAGTGCAGGGGAACTTGGTAATCAGGGTGCTACACTTCCGACAGAAATGGCTGGTCATGAAAATCTCA ATTTGAATGTTCCTGTCTCAGAAAATTTGGGGAAACGGAAGGTCACAAATCAATCAGATACAGCACTATGTGACTCCTCT ATATTACCTCCTGATGATTCTCACAATTCTTGTAAAAAGCTGAAGAGAATCTCCGATGATACAGTCACTGCAATAAGTGA TAATAACGAGAACCTTAATTTGGACGCATGTGGTGAAAGTAAACATGGAGTTTCGGGAAAATCTGTAGAACATCCTTCAA ATAAATTAATATTTTCTTCTAGCACTTGCCATGGTGAGCATGATGAGAGTGTCAAGGATGGACCAAAAGATGTCACAAAT GAGACAGAATTTAATAAGTTGTTCAATTCAATGGGAGGGCAAGTTGATGGGATGCTAAGTCTCTCGGACTGGAAACCTCT GGAGAAAGACTTATACTTGAAGGGAGTAGAAATGTTCGGAAGAAACAGTTGTCTCATAGCAAGGAACTTGCTTTCTGGTT TGAAGACTTGTATGGAAATAGCTAGTTACATGCATGCTGGAGGAGTGTTGATGCCCTACGGGTCTTTTGCTGCATCTAGT TCAATCATGGACGACAAGGGAAAATTTGATGCAGAGTGCCAAGACCAAGACATATCATCTAGGTCACGGACGCTGCTGAG AAAGAGGGGCAAAACAAGAAAGTTTAAATATTCTTGGAAGTCTGCTGGCCATCCATCAATATGGAAAAGGATTGCTGATG GAAAGAACCAATCTTGCCAGCAGTATACACCATGTGGATGTCAGTCAATGTGTGGAAAGGATTGTTCTTGTATGAATGGT GGAACTTGCTGCGAAAAATATTGTGGTTGTTCAAAGAGCTGCAAAAACCGGTTCAGAGGATGCCATTGTGCCAAGAGTCA ATGCAGAAGCCGACAATGTCCATGCTTTGCTGCTGGACGTGAATGTGACCCAGATGTCTGTCGAAATTGCTGGGTTAGCT GCGGGGATGGTTCGCTAGGGGAGCCACCTCGGCATGGAGAAGGTCAATGCGGCAATATGAGGCTTCTGTTAAGGCAACAA CAGAGGATTCTCTTGGCAAAGTCTGATATTGCTGGATGGGGAGCCTTCTTGAAGAACCCTGTTAACAAAAATGATTACCT AGGAGAGTACACTGGTGAACTGATCTCCCACCGAGAAGCTGATAAACGTGGGAAAATATATGATCGTGCGAATTCATCTT TCCTTTTTGACTTAAATGATCAGGCATGTGTCTCATTGTCTCAGCATGGTCTACTTTTACTTTTTTCTCTTAACATCGGC TACTCTGGCTTTTCTCAAATTGCTGTGAGCTTCCTTGTAATTTATAAGTGTGTCATCATATATTGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0244300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVSKPTDSALKLPRKQHEEPENYAVGVGNNLYTKINQLKKQIQEERIVYVKEKLQKNEKMLECHISRVVSAISTRDSSQT EENRTHSLLSSRIGHPLCKLNGFSQASGDKDYNNQDVSSATSIKIPHIERLPPYTSWIFLDKNQRMAEDQSVVGRRRIYY DQHGSEALICSDSEEELTEPEEEKHEFSEAEDRAIWMAFEEHGINEEVLNIVSKFVGGTSLEIQERYKSIKENNNGRLGR HSEGSGEYKSHIGICPEKSLSAALDSFDNLFCRRCLIFDCRLHGCSQPLIYPSEMQTVLPGPEGDRKPCSDQCYLQQLKV IKSVSGDSTRESFQDKKTTIIEEADGILAPSSAGELGNQGATLPTEMAGHENLNLNVPVSENLGKRKVTNQSDTALCDSS ILPPDDSHNSCKKLKRISDDTVTAISDNNENLNLDACGESKHGVSGKSVEHPSNKLIFSSSTCHGEHDESVKDGPKDVTN ETEFNKLFNSMGGQVDGMLSLSDWKPLEKDLYLKGVEMFGRNSCLIARNLLSGLKTCMEIASYMHAGGVLMPYGSFAASS SIMDDKGKFDAECQDQDISSRSRTLLRKRGKTRKFKYSWKSAGHPSIWKRIADGKNQSCQQYTPCGCQSMCGKDCSCMNG GTCCEKYCGCSKSCKNRFRGCHCAKSQCRSRQCPCFAAGRECDPDVCRNCWVSCGDGSLGEPPRHGEGQCGNMRLLLRQQ QRILLAKSDIAGWGAFLKNPVNKNDYLGEYTGELISHREADKRGKIYDRANSSFLFDLNDQACVSLSQHGLLLLFSLNIG YSGFSQIAVSFLVIYKCVIIY 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 790 790 -
MobiDBLite 1 20 20 -
ProSiteProfiles 1 803 803 210.316
PANTHER 33 782 750 5.7E-225
PANTHER 33 782 750 5.7E-225
Coils 35 55 21 -
MobiDBLite 459 478 20 -
SUPERFAMILY 592 785 194 2.45E-28
ProSiteProfiles 608 707 100 21.924
Gene3D 622 796 175 7.9E-40
SMART 656 693 38 2.5E-11
Pfam 660 691 32 1.7E-9
Phobius 791 815 25 -
TMHMM 793 815 23 -
Phobius 816 821 6 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component PcG protein complex A chromatin-associated multiprotein complex containing Polycomb Group proteins. In Drosophila, Polycomb group proteins are involved in the long-term maintenance of gene repression, and PcG protein complexes associate with Polycomb group response elements (PREs) in target genes to regulate higher-order chromatin structure.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0244300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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