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LotjaGi6g1v0167800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0167800
Transcript ID LotjaGi6g1v0167800.1
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Callose synthase-like protein; TAIR: AT1G06490.1 glucan synthase-like 7; Swiss-Prot: sp|Q9SHJ3|CALS7_ARATH Callose synthase 7; TrEMBL-Plants: tr|G7IXI4|G7IXI4_MEDTR Callose synthase-like protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0167800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:45304801..45328043) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGCTAGCTCCAGTGGCACAAAGGGTCCTTATGATTTGCCCAGGCAACCATCAAGGAGGTTGGTTAAGGCACCAACCAG GACTGTGGAGTTGCCAAATGAGGAGAATATGATGGACAGTGAGATTGTGCCTTCCTCTCTTGCTCTCCTTGTGCCAATTC TCAGGGCAGCGCTTGAGATTGAAGAGGAAAATCCCAGAGTTGCCTATCTTTGTGAGTAAATTTTTTAATGGTTTTTCAAC TTTCATGTTTCAGTTTTTCCTTAATCATGGCAAAATGGTGTTAAATGTTGTATTGTGGTAGTAATGTTCACCAGGGATGT TTTCTGGTACTATGATTGTGGTGAGTATGGAAGTGTAGATATTAATGGTATATATACAATGAGGATTTCCTTGGCTGTTT TGTGCAAATTTCAATTTTCAATGCATAAATTTTGTTCTAGAAGAGAAGAGAAGATGTTTTTTAGGGCTGAGATATCCTAA TTTTGAGTCACCAAAAGCAAAAATGAACAACCAATGGGAAAACAGAAAATCTAAGATTTGTATCCACATGTTATTGCATG TATATAATTTTTTTTGGAGAGGTTTATGGTCGGACAAAGAAGAAGAGGTTAGAAGTGGTGGTGGATAAGATATCCTTCTT AGAAAAGAAGAGGTTCCTTTGTCATTTCTTCCAACGCCATTGAAGTTGATCAAAAGATACTGATCCAAATTGAGAGGGCA CATCCAGGACACACCTCATGCATTAAATAATCTTAAGGATTTGGCTGTAGGGCAACACGAGCAAGTTGGAGACTACATCA GAGCTAAAATCACATCTCTAAATTTCCAATGGGTCTTTAGTGTTCATTTTGTGGTGAACCAATATCCAAATGAAAAAATA TATATTATATTGGCGGGGAGCTTTGTTGACCACTGACCCCTACTGGACTTTGCAAGAGTTATGTAATAAAGAGAAATACT 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ATTTGTCAGTGGGCATCTTACAGAGGGCAGACACTCTATCGAACAGGTCTTGATCATAGTGAATAATATTTTTCTTGCTA GATTTGTGTATATATTCCATGATGATATATTCTAATTCATCTTCACTTGTTCTGTTTATTTTTTCTTTTAGTGAGAGGAA TGATGTACTACTGGGAAGCTTTGACCCTTCAGTGCACGATGGAAAATTCTGGAGACAATGGTTAGTTCTTTATTTTACAT GCTTTTGTTTCAAATCCCAAGATTTGGCAGGAACCATCTATTTACGAATGAACTATACACCGTGACTCGTGCAGCTATCT CTGAAGCCTACCGGACAGTGGATTTCACTGAAAACGATAAGAGGCTTCCTGAACAAGCACAAGCTCTGGCTGATTTAAAG TTTACCTATGTTGTTTCTTGCCAATTGTATGGTGCTCACAAAAAGTCAAAAAATACTGATGAGAGAAGCTGCTATACCAA TATTCTCAATCTGATGTTAACGTGAGTGAATACAACCATTTTGCTGTATTTTAAGGTCCTTGTATATTTTAAACTAAAAA TGGGATTGACAATGGGAAAATGGCACATTCCACACAGATATCCAGCCCTTCGTGTTGCTTACCTTGATGAAACAGAAGAC ACAAAGGTTGGAAAGAAAGTTTATTACTCTGTTCTTGTCAAAGGAGGGGAGAAGTATGATGAGGTATGGGCAAAAAGTTC TTGTTTTGATATTTTTGCTTGAATTCTGCTTCAGACATATTTATTAAAAGAACTTAAAAATTACATTCTAGTTTTAATCT GGTCCGTTCATGATTAGATCTAACAGTCATGATTTATTCTCATGTTCTCATATAAGAACATCTTTCTCATATGATACATA TGTATATATATATGTATATAAATATATATATATATATATATTGGCAAACCTACCCACCTATCTTATATGAAAGTCTTCTG TGAAATCTGATAAATATGTGATAAGTCATTGCAAACGTGGAAATGTTAGAGTATCTCAAGAGTCTTTCTTTTGGGCTTTT GGCACACTAGCAAATGGCATGGCTTTTTAGCTGTCATCTATGGATATTAATTAATTAATTTAATAATATAACATCAGTTT GGATTAGGTTAATCAATTTTGTTGAGTTGATTTAGGGTTTTGATACAAATGATTCTATGTTACATTAATAGGAAATATAT CGGATCAAGCTTCCTGGTCCTCCAACAGAAATTGGTGAAGGAAAACCTGAAAACCAAAATCATGCCATTATATTTACTCG TGGGGAAGCCTTGCAGACCATAGACATGAATCAGGTAACTTTTCATTCGACTTCAATAAATTTAATATCCGTTAAGCAAT ACTTTCTGTGAAATTAAATGCTCTTAATTTACATTTTGTGAAGGATAATTACTATGAAGAAGCTTTCAAAATGAGAAATG TATTGCAAGAATTCCTGAAAAGTTATAGAGGGCAACAAAAACCCACCATATTGGGTCTAAGGGAGCATATATTTACTGGA AGGTCTGCCTTGTTACAATATCTAGTATTTATATAATAATTTACTTCATGACCAAGAAGATATGTTTTTTATTATCAAAC TTGAAATGGTGCCAGTTATTTACATGTTCATTGTTTTGCAGTGTTTCATCACTGGCTTGGTTTATGTCAAACCAGGAGAC CAGCTTTGTGACCATTGGCCAACGAATTTTGGCAAATCCTCTAAGGTTAGTCTCAATTGGTTTGTCCTGAACTGCTTTTG ATAAAATTCAGAAGATGAGTGAAAATGTTAGTCTGTATTTGTAACAGAGAGGATACATGTATTCATAACTAGTCTAATTG AATTCTAATTTGTTGCAACAGTAGTTGCTACTGTACAGAAAATAAGAAATAAAGAAAACATTCACTCATCAATAGGATAC ACCTTGTTGTATTCCTTGCACCGTAAACTTTTTTGTTTACTTTAGTTAAGTAATCCATATTCCTGAATTTGCAGGGTCCG ATTTCATTATGGTCATCCTGATATATTTGACAGAATCTTCCACATAACCAGAGGAGGCATAAGCAAAGCATCAAAAATTA TCAACCTAAGCGAGGATATATATGGAGGTACTTAAAGTTTGACTAGAAATGTCTATCTGATGGATGGAAATGTTTTACTA ATTGTGCTTAACATCCTTAGGGTACAATTCAACTCTACGTCAAGGATTTATCACGCATCATGAGTACATACAAGTAGGTA AGGGGCGTGATGTAGGCCTGAATCAGGTTTCACAATTTGAGGCTAAGGTTGCAAATGGAAACGGAGAACAAACACTTAGC CGTGATGTTTATCGTCTTGGACGACGATTTGACTTCTTCCGGATGTTGTCATTCTACTTCACAACAGTTGGTTTCTATTT CAGTAGCATGGTAATTAATCAAACCTCCTTTTTGGGGATCTTGTCTTATAGTTGATAACTATACTAATAGCACATTATCG AAATCTGCTTTGCACAATTGGAGTGTATGGTGTTTTCTTCCAATATAGGAAACAGCTTTCATTACGTCACTGCCTAGTTT CACAACGACATAAAATAAAAATAATCGAAATCATCCTAATATATGACTTGTGAATGGATTCTGCTGTGATCTATCATTGA AGAAAGGTCTACTACTTAAAAAGTTTAAATGAAACAGGATATTGGAAGCATATGAGCATAGAAATCTAATTGCTATTTTT TTCATGAAATGGATGTTCTTGTAAGACATAATTTAAGCACTTCTCTTAGGTGTGTCTAGACACCTGCTACAACATGAAAC AAGGACATCTTATTCCAGTATTTATTTGATATATATGATTCATTTGGTTGGTTTGGTCTAGGCTCATTTAAGACGGTGTT GACCTATTGAAAATGGAGGCTAGATAAAAGGAAAATGATTTGTAGATATCCGCATAGTGCAGACATCTAACAAACACCCG AAGTAAGAAAGGAAGAGAAGAGAGAAAGCAATTGATGTGATATGTGATAGAGGAAAGAGATAGAGAGAAAAATGAGGTGT ATGATGGATGTATGCACTATTTGTATGCCTGAATATCATTCCTGTAGATAAAAAGCATATCATTTATCAAAATCACATTG CTTAGTCTGGTATTAGGTATGAAATAAATTCCTAAATTTTAACGGTATCATCAACAATTAACTTAGTCTGAGTTAGCTAA TTTATATGACTATAAAAATATAATGAAAAATGTAATAAGTACAATACAACCACAGTTATCACTACACAACTACATATGAT ACGCTAACACCAGTATTTGGATGTTATGAATTTTTCAGATAACAGTGATTACTGTATATGTGTTCTTGTATGGACGTGTA TATATGGTATTGAGTGGAGTTGAGAAAAGTATTCTTCAAAGTCCAATCTTACATCAGAACAAAGCCCTTGAACAGGCATT GGCAACCCAGTCTGTTGCTCAATTAGGCATACTCCTGGTGCTGCCCATGGTTATGGAAATTGGCTTGGAGAAGGGATTTC GCACGGCTTTGGGCGATTTTATCATCATGCAGCTGCAGCTAGCCTCTGTGTTCTTTACTTTCCAACTTGGAACCAAATCT CATTATTATGGAAGAACACTCTTGCATGGGGGCTCTAAATATAGATCAACTGGCCGTGGGTTTGTTGTCTTCCATGCAAA GTTTGCTGACAACTACAGGATGTACTCACGTAGTCACTTTGTGAAGGGCGTGGAGATACTTATACTATTGATTGTTCATG AAGTCTACGGGCAATCATACCGGAGCACAAGTCTTATTTTCTTCATCACAATGTCAATGTGGTTTTTGGCTGTTTCCTGG TTGTTTGCTCCTTTCTTGTTCAATCCTTCTGGTTTTGAATGGCAAAAAACCGTGGATGATTGGACCGATTGGAAGCGGTG GATGGGGAATCGTGGTGGTATCGGTATCCCGTCTGAAAAAAGCTGGGAGTCTTGGTGGGATGAAGAAAATGAGCACCTGA AATACTCAAATATCAGGGGGAAAATACTTGAGATCGTTCTCGCGTTTCGCTTCTTTATCTACCAATATGGAATTGTCTAC CAGCTGAACATTACTCATCGTAGCAAAAGTATTATGGTAGAGCAACTAAATTCTGTGTTCTCCAATCCTATTAATGGTTG CAAGTTTCATGGCACCATCTTACTACCTTAAGTTTTTTCTTGTAGGTATTTGGACTTTCTTGGGGAGTTTTGTTAATAGT CCTTATTGTCTTGAAGGTATGTAAATGCTACCCGGGGATCAAGAGTGAGTTTCTACTACTCCGTTGATATTTGCATCAAT TTATGCCTAATCAGTTGTCTTCTTTTGTTTGTATGAATTTCCACAGATGGTTTCCATGGGTAGACGAAGATTCGGAACCG ACTTTCAGCTCATGTTTCGTATTCTCAAGGCACTTCTCTTTCTCGGCTTCTTGTCAGTCATGACTGTATTGTTCGTGGTA TGTGCACTGACTATATCAGATTTGTTTGCTGCCTTTCTTGCCTTCATGCCTTCCGGATGGGCCATTATTTTGGTAAGTTA AATCTTCTGCATCTTACAGAAGCACTTGTTCATAACAATTTTCTTTTCTCTTTTTGTCTAACATGTCTTATGCAGATTGA AGAAATTTTGCTATCTATTCAACTTCTACAGCATCCTAAAATTGCAGGCACTATTCCATCTAAATACTTCATTCAAACAA AACCACTGATGTTTCCTCCTTTTTCTTTTTGCAATCAAAGATTGCACAAACATGCAGGGGACTCTTAAAGGGAGCTAAAC TATGGAATTCAGTTAAAGAGCTCTCCAGAGCATATGAATATACAATGGGATTGATAATCTTCATGCCGGTAGCCGTTTTG TCATGGTTCTCGTTTGTGTCAGAGTTCCAAACCCGGTTGCTATTCAATCAAGCATTCAGTAGAGGGCTCCAGATTTCAAT GATTCTTGCTGGAAAGAAGGACACATATAATAAAGTTAAATGA 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0167800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCTAGCTCCAGTGGCACAAAGGGTCCTTATGATTTGCCCAGGCAACCATCAAGGAGGTTGGTTAAGGCACCAACCAG GACTGTGGAGTTGCCAAATGAGGAGAATATGATGGACAGTGAGATTGTGCCTTCCTCTCTTGCTCTCCTTGTGCCAATTC TCAGGGCAGCGCTTGAGATTGAAGAGGAAAATCCCAGAGTTGCCTATCTTTGCCGCTTTCATGCATTTGAGAAGGCTCAT ACAATGGACCCAACATCAAGTGGGCGTGGTGTTCGTCAGTTCAAGACTTATTTGTTGCACAAACTCGAAAGGGAAGGGGA GCTTACAGAAAAACTCTCTAAAAGAAGTGATGCTAGGGAGCTACAGGCCTACTATCAAGCATTCTATGAGAAGAGAATCC GGGATGGTGAATTTACCAAAAAACCGGAGGAGATGGTTAAGAATGTTCAGATTGCCACAGTGTTGTATGAAGTGCTGAAG ACTATGGTAGCTCCTCAGAGTATTGAGGAGAAGACAAAAAGATATGCTGAAGATGTTGAGAATAAGAAGGGACAATATGA ACACTATAATATCCTTCCATTATATGCTGTTGGTGTTAAACCAGCAATCATGGAACTACCTGAGATCAAAGCAGCAATTG CTGCTTTATGGAAGGTGGACAATCTTCCAATGCCTATCATTCGTCCAAGACAGGATGCCTTTAATGGTGATGATTCTACA ATGCCTATGGAGAGGGTTAAAAATGTGAATGATATACTTGATTGGATTTCCTTAATTTTTGGGTTTCAGAAAGGAAATGT GGCAAATCAAAGAGAGCACCTTATACTATTACTTGCCAACATTGATATAAGGAATAGGACTGAATCTTATGAGATCCGTG AAGAAACTGTAGAAAAGTTGATGGCTACAACTTTCAAAAATTACAATTCATGGTGTCATTATGTGCGTTGTAAATCCAAT CTTAGGTTTCCAGCCGAGCTTGACAAACAACAAATAGAACTCATTTACCTTGCACTTTATCTTTTAATATGGGGAGAGGC TTCAAATATTCGCTTTATGCCCGAATGCATTTGCTATATTTTCCATCATATGTGCGATGATGTCTTTGGGATTTTATATA GCAATGCCTATCGTGTGAGCGGGGATGCGTACCAAATTGTAGCGCGTGATCATGAACATTTTCTCAGGGAAGTTATCACA CCAATATTCGATGTTTTAATGAAGGAAGCGAAGAGAAGCAACAAAGGCAAGGCAAGTCATTCCAATTGGAGAAATTATGA TGATCTAAATGAATACTTTTGGTCTGAAAAATGTTTTAAGCTAGGTTGGCCAATGGATCTCAATGCAGATTTTTTTAGGC CTTCAGATGAGACACAAACAGCACACCGGGCCACTAGCAATGCCAGCACTGGAGCTGGGAAGAAGAAGGCCAAAACAAAT TTTGTTGAAGTTCGTACATTTTTGCATCTGTATAGGAGCTTTGATCGAATGTGGATATTCTTTATATTGGCTTTACAGGC AATGATTATTATTGCATGGAGTTCCTTGGGACCTGTTGGAGTTCTTACTGATGCAGATGTCTTCAGAGATGTCACGACTA TATTTATTACATATGCTTTTCTCAATTTTCTTCAAGTAACTATTGATATTGTTCTTACCTGGAATGCTTTGAGGAATATG AAATTCACTCAGTTGCTTCGGTATTTTCTGAAATTTGTGGTAGCAGCTGTTTGGGTTGTGGTTTTGCCAGTCAGTTATTC TAGTTCTCTACAGAACCCATCAGGGCTAATAAAATTTGTCACCAGTTGGGCTGGGGATTGGGGGAACCAGTCACTTTATA CCTATGTTGTCGTGATATACATGTTACCAAACATAGTGGCTGTGATGATATTTTTTCTTCCACCTATGCGGAGAACATTG GAGCGCTCAAATATGCGAATCATTACCCTTTTAATGTGGTGGGCTCAGCCAAAATTGTATGTAGGTAGGGGCATGCATGA GAGCATGTTATCACTGCTGAGGTACACCCTCTTCTGGATCATGCTGCTAATAAGCAAGTTAGCATTTAGTTACTATGTGG AGATATCGCCCCTTGTTGGACCCACAAAAGTAATTATGGGAATGAATATAGATAACCACGAGTGGCATGAATTCTTTCCA GAACATAAGATTCACAATATGTCTGTTATTGTTGCAATATGGGCTCCAATCATCCTGGTTTATTTTATGGATACTCAAAT ATGGTATGCCATTTATGCCACATTATTTGGTGGGATTATTGGTGCCTTCAGCCATTTGGGTGAGATAAGGACACTTGGAA TGCTCCGCTCCAGATTTCAATCTGTACCACTAGCTTTCAGTAAGCGCTTTTGGACTGGAGGAAACAGCACAAATATACAG GAGGACTCGGATGATTCATATGAACGGTATAATATTGCATACTTCTCTCAGGTCTGGAATAAGTTTATAAACTCTATGAG AGAGGAAGATCTCATCAGTAACAGGGATAGAGATTTGCTTCTTGTTCCATACAGTTCAATTGATGTTTCTGTCATTCAGT GGCCTCCATTCTTGCTTGCTAGCAAGATTCCTATAGCTGTTGACATGGCAAAAGATTATAAGAAGGAGGACGATGCAGAT TTGTTTAAAAAGATTAGGAATGATGGATATATGTATTCAGCAGTTGTTGAATGTTATGAGACTCTCAAGGAGATCATTCT GAACCTTCTGCGAGATGAACAAGATAGGCAGGTTATAGAGCGTATATGCAATAAAGTAGAAGACTGCATAGAACAAGAAA AATTTGTCAAGGAGTTCAAGACAAGTGGCTTGCCTTCACTCAGTGAGAAGTTGGAAAAATTCTTATCTCTATTGCGATCT GAAGATGGCAAACTTGAGTCCCAGATAGTCAATGTCCTGCAGGATATTGTAGAAATCATCATACAGGATGTTATGGTTGA TGGCCATGAAGTTCTACAAACACCCCAGCATTATATTGTAGAGAGAGGGCAGAGGTTTGTTAACATTGACACTTCTTTTA CACACAAGAACTCAGTGATGGAGAAGGTTATTAGGCTTCATTTGCTTTTAACAGTCAAGGAATCAGCCATAAATGTGCCC CAAAATCTGGATGCCCGCCGCCGTATTACATTCTTTGCAAACTCATTATTTATGAATATGCCAAAGGCTCCCAAAGTTCG GGACATGTTGTCCTTCAGTGTTCTAACACCATATTACAAAGAAAATGTTCTATATTCCACTAATGAAGTCAATAAGGAAA ATGAAGATGGAATATCAATTTTATTCTACCTGACGAAGATATATCCTGATGAATGGGCCAATCTCCATGAGCGTGTAACA AGTGAAAATCTTGAAGAAAATTTGGAGGATTTAATTTGTCAGTGGGCATCTTACAGAGGGCAGACACTCTATCGAACAGT GAGAGGAATGATGTACTACTGGGAAGCTTTGACCCTTCAGTGCACGATGGAAAATTCTGGAGACAATGCTATCTCTGAAG CCTACCGGACAGTGGATTTCACTGAAAACGATAAGAGGCTTCCTGAACAAGCACAAGCTCTGGCTGATTTAAAGTTTACC TATGTTGTTTCTTGCCAATTGTATGGTGCTCACAAAAAGTCAAAAAATACTGATGAGAGAAGCTGCTATACCAATATTCT CAATCTGATGTTAACATATCCAGCCCTTCGTGTTGCTTACCTTGATGAAACAGAAGACACAAAGGTTGGAAAGAAAGTTT ATTACTCTGTTCTTGTCAAAGGAGGGGAGAAGTATGATGAGGAAATATATCGGATCAAGCTTCCTGGTCCTCCAACAGAA ATTGGTGAAGGAAAACCTGAAAACCAAAATCATGCCATTATATTTACTCGTGGGGAAGCCTTGCAGACCATAGACATGAA TCAGGATAATTACTATGAAGAAGCTTTCAAAATGAGAAATGTATTGCAAGAATTCCTGAAAAGTTATAGAGGGCAACAAA AACCCACCATATTGGGTCTAAGGGAGCATATATTTACTGGAAGTGTTTCATCACTGGCTTGGTTTATGTCAAACCAGGAG ACCAGCTTTGTGACCATTGGCCAACGAATTTTGGCAAATCCTCTAAGGGTCCGATTTCATTATGGTCATCCTGATATATT TGACAGAATCTTCCACATAACCAGAGGAGGCATAAGCAAAGCATCAAAAATTATCAACCTAAGCGAGGATATATATGGAG GGTACAATTCAACTCTACGTCAAGGATTTATCACGCATCATGAGTACATACAAGTAGGTAAGGGGCGTGATGTAGGCCTG AATCAGGTTTCACAATTTGAGGCTAAGGTTGCAAATGGAAACGGAGAACAAACACTTAGCCGTGATGTTTATCGTCTTGG ACGACGATTTGACTTCTTCCGGATGTTGTCATTCTACTTCACAACAGTTGGTTTCTATTTCAGTAGCATGATAACAGTGA TTACTGTATATGTGTTCTTGTATGGACGTGTATATATGGTATTGAGTGGAGTTGAGAAAAGTATTCTTCAAAGTCCAATC TTACATCAGAACAAAGCCCTTGAACAGGCATTGGCAACCCAGTCTGTTGCTCAATTAGGCATACTCCTGGTGCTGCCCAT GGTTATGGAAATTGGCTTGGAGAAGGGATTTCGCACGGCTTTGGGCGATTTTATCATCATGCAGCTGCAGCTAGCCTCTG TGTTCTTTACTTTCCAACTTGGAACCAAATCTCATTATTATGGAAGAACACTCTTGCATGGGGGCTCTAAATATAGATCA ACTGGCCGTGGGTTTGTTGTCTTCCATGCAAAGTTTGCTGACAACTACAGGATGTACTCACGTAGTCACTTTGTGAAGGG CGTGGAGATACTTATACTATTGATTGTTCATGAAGTCTACGGGCAATCATACCGGAGCACAAGTCTTATTTTCTTCATCA CAATGTCAATGTGGTTTTTGGCTGTTTCCTGGTTGTTTGCTCCTTTCTTGTTCAATCCTTCTGGTTTTGAATGGCAAAAA ACCGTGGATGATTGGACCGATTGGAAGCGGTGGATGGGGAATCGTGGTGGTATCGGTATCCCGTCTGAAAAAAGCTGGGA GTCTTGGTGGGATGAAGAAAATGAGCACCTGAAATACTCAAATATCAGGGGGAAAATACTTGAGATCGTTCTCGCGTTTC GCTTCTTTATCTACCAATATGGAATTGTCTACCAGCTGAACATTACTCATCGTAGCAAAAGTATTATGGTATTTGGACTT TCTTGGGGAGTTTTGTTAATAGTCCTTATTGTCTTGAAGATGGTTTCCATGGGTAGACGAAGATTCGGAACCGACTTTCA GCTCATGTTTCGTATTCTCAAGGCACTTCTCTTTCTCGGCTTCTTGTCAGTCATGACTGTATTGTTCGTGGTATGTGCAC TGACTATATCAGATTTGTTTGCTGCCTTTCTTGCCTTCATGCCTTCCGGATGGGCCATTATTTTGATTGCACAAACATGC AGGGGACTCTTAAAGGGAGCTAAACTATGGAATTCAGTTAAAGAGCTCTCCAGAGCATATGAATATACAATGGGATTGAT AATCTTCATGCCGGTAGCCGTTTTGTCATGGTTCTCGTTTGTGTCAGAGTTCCAAACCCGGTTGCTATTCAATCAAGCAT TCAGTAGAGGGCTCCAGATTTCAATGATTCTTGCTGGAAAGAAGGACACATATAATAAAGTTAAATGA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0167800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MASSSGTKGPYDLPRQPSRRLVKAPTRTVELPNEENMMDSEIVPSSLALLVPILRAALEIEEENPRVAYLCRFHAFEKAH TMDPTSSGRGVRQFKTYLLHKLEREGELTEKLSKRSDARELQAYYQAFYEKRIRDGEFTKKPEEMVKNVQIATVLYEVLK TMVAPQSIEEKTKRYAEDVENKKGQYEHYNILPLYAVGVKPAIMELPEIKAAIAALWKVDNLPMPIIRPRQDAFNGDDST MPMERVKNVNDILDWISLIFGFQKGNVANQREHLILLLANIDIRNRTESYEIREETVEKLMATTFKNYNSWCHYVRCKSN LRFPAELDKQQIELIYLALYLLIWGEASNIRFMPECICYIFHHMCDDVFGILYSNAYRVSGDAYQIVARDHEHFLREVIT PIFDVLMKEAKRSNKGKASHSNWRNYDDLNEYFWSEKCFKLGWPMDLNADFFRPSDETQTAHRATSNASTGAGKKKAKTN FVEVRTFLHLYRSFDRMWIFFILALQAMIIIAWSSLGPVGVLTDADVFRDVTTIFITYAFLNFLQVTIDIVLTWNALRNM KFTQLLRYFLKFVVAAVWVVVLPVSYSSSLQNPSGLIKFVTSWAGDWGNQSLYTYVVVIYMLPNIVAVMIFFLPPMRRTL ERSNMRIITLLMWWAQPKLYVGRGMHESMLSLLRYTLFWIMLLISKLAFSYYVEISPLVGPTKVIMGMNIDNHEWHEFFP EHKIHNMSVIVAIWAPIILVYFMDTQIWYAIYATLFGGIIGAFSHLGEIRTLGMLRSRFQSVPLAFSKRFWTGGNSTNIQ EDSDDSYERYNIAYFSQVWNKFINSMREEDLISNRDRDLLLVPYSSIDVSVIQWPPFLLASKIPIAVDMAKDYKKEDDAD LFKKIRNDGYMYSAVVECYETLKEIILNLLRDEQDRQVIERICNKVEDCIEQEKFVKEFKTSGLPSLSEKLEKFLSLLRS EDGKLESQIVNVLQDIVEIIIQDVMVDGHEVLQTPQHYIVERGQRFVNIDTSFTHKNSVMEKVIRLHLLLTVKESAINVP QNLDARRRITFFANSLFMNMPKAPKVRDMLSFSVLTPYYKENVLYSTNEVNKENEDGISILFYLTKIYPDEWANLHERVT SENLEENLEDLICQWASYRGQTLYRTVRGMMYYWEALTLQCTMENSGDNAISEAYRTVDFTENDKRLPEQAQALADLKFT YVVSCQLYGAHKKSKNTDERSCYTNILNLMLTYPALRVAYLDETEDTKVGKKVYYSVLVKGGEKYDEEIYRIKLPGPPTE IGEGKPENQNHAIIFTRGEALQTIDMNQDNYYEEAFKMRNVLQEFLKSYRGQQKPTILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQE TSFVTIGQRILANPLRVRFHYGHPDIFDRIFHITRGGISKASKIINLSEDIYGGYNSTLRQGFITHHEYIQVGKGRDVGL NQVSQFEAKVANGNGEQTLSRDVYRLGRRFDFFRMLSFYFTTVGFYFSSMITVITVYVFLYGRVYMVLSGVEKSILQSPI LHQNKALEQALATQSVAQLGILLVLPMVMEIGLEKGFRTALGDFIIMQLQLASVFFTFQLGTKSHYYGRTLLHGGSKYRS TGRGFVVFHAKFADNYRMYSRSHFVKGVEILILLIVHEVYGQSYRSTSLIFFITMSMWFLAVSWLFAPFLFNPSGFEWQK TVDDWTDWKRWMGNRGGIGIPSEKSWESWWDEENEHLKYSNIRGKILEIVLAFRFFIYQYGIVYQLNITHRSKSIMVFGL SWGVLLIVLIVLKMVSMGRRRFGTDFQLMFRILKALLFLGFLSVMTVLFVVCALTISDLFAAFLAFMPSGWAIILIAQTC RGLLKGAKLWNSVKELSRAYEYTMGLIIFMPVAVLSWFSFVSEFQTRLLFNQAFSRGLQISMILAGKKDTYNKVK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 496 496 -
PANTHER 2 1909 1908 0.0
PANTHER 2 1909 1908 0.0
Gene3D 35 179 145 7.1E-13
Pfam 51 176 126 1.7E-11
SMART 331 446 116 1.4E-63
Pfam 334 444 111 3.5E-36
Phobius 497 516 20 -
TMHMM 497 519 23 -
Phobius 517 535 19 -
TMHMM 534 556 23 -
Phobius 536 556 21 -
Phobius 557 567 11 -
Phobius 568 586 19 -
TMHMM 568 590 23 -
Phobius 587 611 25 -
Phobius 612 633 22 -
TMHMM 612 634 23 -
Phobius 634 644 11 -
Phobius 645 661 17 -
Phobius 662 672 11 -
TMHMM 671 693 23 -
Phobius 673 693 21 -
Phobius 694 723 30 -
Phobius 724 743 20 -
TMHMM 724 742 19 -
Phobius 744 748 5 -
TMHMM 747 769 23 -
Phobius 749 769 21 -
Phobius 770 1477 708 -
Pfam 1039 1127 89 8.8E-28
Pfam 1135 1727 593 1.7E-205
Phobius 1478 1500 23 -
TMHMM 1478 1500 23 -
Phobius 1501 1530 30 -
Phobius 1531 1549 19 -
Phobius 1550 1560 11 -
Phobius 1561 1581 21 -
Phobius 1582 1648 67 -
Phobius 1649 1671 23 -
TMHMM 1649 1671 23 -
Phobius 1672 1725 54 -
TMHMM 1726 1748 23 -
Phobius 1726 1743 18 -
Phobius 1744 1754 11 -
TMHMM 1755 1777 23 -
Phobius 1755 1775 21 -
Phobius 1776 1795 20 -
TMHMM 1792 1814 23 -
Phobius 1796 1816 21 -
Phobius 1817 1821 5 -
TMHMM 1819 1839 21 -
Phobius 1822 1840 19 -
Phobius 1841 1859 19 -
TMHMM 1859 1881 23 -
Phobius 1860 1880 21 -
Phobius 1881 1915 35 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component 1,3-beta-D-glucan synthase complex A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain.
Molecular function 1,3-beta-D-glucan synthase activity Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1).
Biological process (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds.
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0167800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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