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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0064600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0064600.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | MD-2-related lipid recognition domain-containing protein / ML domain-containing protein; TAIR: AT3G11780.1 MD-2-related lipid recognition domain-containing protein / ML domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q54SW1|Y2179_DICDI Putative phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein DDB_G0282179; TrEMBL-Plants: tr|I3T113|I3T113_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0064600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:8958129..8972428) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTAAGAGTCATAACTTATAAACAAAGCGTAACAAAAGCCTTGCAATCCACGAGTTATTATTATATCATTATTTATTCATG TACAAATGATGCCAAGTACAGTAGTCACCGATGTTCACGCGCTCCATAGCCATGGCGGTTCACTCTACTTCAACGCTTTA CCTTGTTCTCTGCTTATCATCCACCGTTTTGCTGCTACTTTCTTCTTCTCATGCACAAGCTCAGTCCCTCAAATACTGTG GTAATTAACTAAACTAGCTACCTTTACTCTTCAAACTTTTAGTTCATGATTTTGTTTTGTTTATATAATTCTTCAACATT CATCATTGATATGCCTCATACTTAGTTTTGCAATACTTGAGAGCTTCCTGTTTGAGATTGCATGTTGCAAGTAGGGAGAG AAACATAGAGTGACTGACTCAGCTGCCATTTCTGGTATTAATAGCTGAGATGAAAAACGGTAGAAATAGAACCCCTTTGT GGAATTAGGGAACCTGTTTAATTTGCTTGGACAATATAAACCCCTATCAGAAGACATGGGGTCAAAGGCTGTCATGTGCG TGTCACGTGATTACACTGTGTTGTTTAGTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTACAAAGAAATGTTAGTTGTTAGTTATTAGTAA ATTAGTTCCTTTACCAGGGTTTGAACCCTGACCCTTCACCCTTCAATATCCTTCATTTCCCTTAGCTCACCCACCCCACC CACAATGTGTTGTTTAGTGGTTTTGTTGTTGAATTGTTAGTTAGTTTGAAATGTTCACTGGTTTAATTACAAGTGGGTAG TTAAACCAAAATGCAAACTTCTTTGCAATTTGGGTCGGCAACTTGGCATGCCTGGCGGTTAGACCCCGGTTTGAGCCTCA CCCCAAGGGCGCGGGTTTGAATCCCCTAGAGATCTCTGACGCTCCAGCTAGCTACTGGAGTGGGTCTCGACTGGCCTCCA 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TGGGGTAGGGTGAGTGGTGAGTGGTGGGGTAGGGTGTTGAGAGTTAAACAAAACCATTGGAGTGGGTAATTGTTGAAAGT TTGTCGAATTTGAGAAAAAAGATGATGTTGAGTGTTGGGAAGAGAAAAAGTGGGGTAGAAAAGGGTTAAACAAAACATTT TTTGTTTAACCATTGTATATGGTCTCACTTTAGAACTTAGAAGAACTAGACAGGGGTGGAAAAATTTCTCCACGCTATTA GATTTGTGGCGCTTCTTTAGAGTTCATGTTTATTGCACTATTGCAGAACTATCAATTGTCATTAGCCCGGATTTTTCATG CTAAACGTCTTTCATAAAGTAAATTTGATATTGTTGGCCAAGAATCCATAATCCATAGTATATATATTCAGGAAAAGATC TCAGTCCCAAAATGTATGATGTGGCATTCACTGATTGGCTAATATTCTACTGAATCCTATGTGTCACTTCATCCTCCATT CTTCTTTCTCCTCCTTTCTTCTTCTCCCATATTAAATGGGTAATCCTCTTTTATTTTAGGATCTGTTTCTCAGTTTCAAA AAAAGGATTTGTTTCTCTCTTTCTCTCTCATTTTCGGCGTTCTCTCTCTCTCGACATCAATCTGTTTCCTCCCTCGCTTG AGATCACCATCCCTCCATTACCATCCATCCCAGTCGCAGCTCTCCCCACGGTGCGACGTTGACGACCCAACTCTCCTCGC AAAGTCTGTAACAGAGCAAGGTCCTCGACCGAGAATCATCGTCGTCAGAGCTTCTCCTCGCTCTGCTCCAGTAACTCCGT TAGAATCCTTCAAATCTCCGATTTCGATTGTGGATGACAAGGTATGAGTCTACACTCTACACATATTACTATTGCGGTTA CAACTTCAATTTGATAATCCAGATTACTATTGCGGTTACGGCTTCAATTTGATAATCCAGATTACTTCCTTTTGATAATT TTGAGTTCTTTCCTATTTTCGAACAGATTGGAGACTAAAAAATGCAATCCAGAAGTCGCTACTCACAGCCACACTGAGCT CTCACCCCATGGTCCATTAGAACTACTTCAAACCCTAATTTTGAGCCGCCAAGCCCATATATTCTTCCCTAATTTTGGAA CTCCGGCTGAAAATGGAATCCCGTTAGTTTCTCCCGGTAATTCTTCTCTTAGAAATTAGTGTTTTTGAATTCAAATTTGT TCTTGACCGTAAAATACTTCCCCCATTAATTGATTACTTGACTATATTCGCTTTCAATTGTTTCCTTTCTTGAGTGGAAA TTTAAGAAAGTTAATTATCGGTATCAATTAGTTCATATTTATGTTTCTACTTTCTAAGCGCCTATATATATTGCTACTTC TGCATTGTCCTTCGCACATTTGATATTTTATATTTTTCAGATCAGTGTTTATTTTGAGTCTGAGGTTTTGTTTTTCTTTT CTTGACTGTGTTGATTATCGAAGCAGCTTACTAAGGTGTCTGAACGGGAAGAACATTCAGGGTATTCCATGTGAGAACTT GAACATCACAAAATATGATTGAAGACTGAGCATAGGAAGAGCTATACGCAGGTTGAGATTCTCTCAAGACTTCTCCCTTA ATATTCTTTGAATCTGTTGATCTCACTGACTTATCATTTTTCTTTGAATCTTTTACTATCATAAAGGTATGGAGAGACTA CTATTGTGTTTATTTATGCTAAGTATATGTCTCTCATGTAAAATCTTACCAATTCCTTTTACCCTTTTGTCTGTGATTTC GCTGGTGCCCTTTTGGCCAGATGGTTATTCTGACCTTCTTTTACTTATCAGTAAAAACGTTTTCCTTTTGTTCTCTTTTT CTGTTTATAGGTTTATAGGTTGCATTGCATATGTTCTCTGTTTCCATGACTGATTGATTCATGCGTCCTCTTCACTTCTG 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TTTTATAGTATTTTTATCTGCAATCACAAATAGTTTAACTTAACTGATATTAATTGTACATACCTTACTTTTAAAGCTTC AACAGCAAGTTTGACATCTGAAGATCTAACTTTGACCATCAACTCCAATGAGCTCTTTCGTTTGTTTTGCTGAGTTTTTA TGAAGAGTGAATGATGAAAGAGGTCTTGGAGACACCGGGGGAGTAGAGATTCATGTCTATTATGGATGAAAACTAGAAAC AAAGTTATGATGGTGAAGCTCAAACAGTTTCTATGAGTGATCTTTGATTGAAAGGTACTTATTGTTCATTTTGCAGAAAA ACTATAAGGATTGGATTTGAAGGCAATGGTTTTATTAGTTCTTCAATTATTGAATATGTCATGTCCCTTCTGCCTCAATG AATTGGACCATTTCAAGTTGTTACTCTTTTGACTCTTATTTATTTATGATTAGCAGTTAAATATTGTGCTCTCTTTTATT TGTTCTAAAGTTCTTCTCTTCTGTTTTGTATGTTATTGCTTGAAATGCAAAAAATGTTGCAGTAGCTGCGTGTTTAGAAG GAGAAAGCTCTTTAGGACTATGGATCAGCTGCTGGAACAGAAGGAAAATGATCTTGAAAGTCATGGCCTGGAGCAGGAGA AGCTTCACTTTGAGATGTACTGTTTCTGTTGGGGTTAGCTATGTCTACATATATAGAGCTTAACTGGACATGGTAAGTTG GTAGAGTACTTGAAACCTATTCTTCCTATTGATAGTGGTAAAACTGAAATTTAAGATCTGTATGGTTAAAGTGTGATAGG ATCAAGGTTTTATATAATAGTGTGGTTTTGTTGAATTGTTGTAGAATGAGTTCAATTCCATTAATGGAATGGAGAAAAGC TCTCAAATAGATGAGTGTCTGAACCAATTGGAAAGAAATTTCATGTGAGAAGATGAATCTCTACTATGTTACATACATTA 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TTTAGAAGCCAAAAATGCACTAAAAACGCAAATGTGCAAGAACAGTATACAAAGTTCATGACTCCTAGGCTCAATACATT AATCGAACCACAGGCAGCCAGAAGGAACATAACATTATATGAAATTACATGAGGCTTCCCACATAGATGGAAGGTAAGAT ACTATGAAATTGGGTTCGAGACAAAGCTACGTCAACCCAATCATTAGGGGTGTCCAACGGTCGGTTACGGGCGGGTTCGG GCCAAATCGCCGGTTTAGGTCGGGTGAAAATACACCAAACCCTCAAGCCGCCACCGACCGCCGCCGAGCAGCGAGTTACT ACGGTTCGGGTTTAAAATCAGTCGGTTACCGCGGGCGGTTTTATCGAATAGTAGATCCAGGAAAAAAAAATACGATGAGA AGAGAGAAGGAGGCACAGAGATTCATCAGAATTCAGAACTAACAATATTTTAGATCCAAGTAGATACATTACAAAATATA TTCAGATCTGTGAAATCTCAACAGAAAAATCAAAAAAAAACTTTCACAAATTTCCTGATAGATGGAGGCATAGAGGACGC GATTTTCTGAACATGCACAGAAGCCTCTGATGGAGTAGATTTTCTCAGAGAAGGAGGTGATGGTTTGGCGTGCTGGAAGA CAATGATCAAAGAGGAAAAGAATGGTGGATGGAGGCTGTGTGTATAGTGGCTCGCGGTGGGGAAAGGGTGGTGGTGGCTC ACGGTGGGGAAGAGGTGGTGGTGGTGGCTCGCGGTGGTGGTGGCTCGTGGTGGGGAAGAGGCAGCGGTGGGGAAGAGGCG GTGGTGGTGGCTCTGGTGGGGAAGAAGAGAAGAATGTGTGACGGCTGCTGGGTGAATACT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0064600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTCACGCGCTCCATAGCCATGGCGGTTCACTCTACTTCAACGCTTTACCTTGTTCTCTGCTTATCATCCACCGTTTT GCTGCTACTTTCTTCTTCTCATGCACAAGCTCAGTCCCTCAAATACTGTGATAAGAATGCAGACTATGCTGTGAAGGTGA GTGGAGTGGAAATATTACCTGACCCAGTGGTGAGAGGAGTGCCGTTCACCTTTAAGATCGCAGCTTATACTGGTGAACCA ATTCCCAGTGGTGATTTACTATATGAAATTTCATATGCTGGGATAGAAGGAGAACCTGCTACATTTCTCCATGATCTCTG TGAGGAAGCACCTTGTCCTGTTCCTGCAGGCCACTTTAAGCTTGTTCATACCGAATTATTACCCTCGGTTACCCCACCGG ATCTGTTTCTCAGTTTCAAAAAAAGGATTTGTTTCTCTCTTTCTCTCTCATTTTCGGCGTTCTCTCTCTCTCGACATCAA TCTGTTTCCTCCCTCGCTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0064600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFTRSIAMAVHSTSTLYLVLCLSSTVLLLLSSSHAQAQSLKYCDKNADYAVKVSGVEILPDPVVRGVPFTFKIAAYTGEP IPSGDLLYEISYAGIEGEPATFLHDLCEEAPCPVPAGHFKLVHTELLPSVTPPDLFLSFKKRICFSLSLSFSAFSLSRHQ SVSSLA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 37 | 37 | - | – | |
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 37 | 37 | - | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 37 | 37 | - | – | |
| Phobius | 1 | 37 | 37 | - | – | |
| Phobius | 1 | 17 | 17 | - | – | |
| PANTHER | 8 | 135 | 128 | 1.1E-51 | – | |
| PANTHER | 8 | 135 | 128 | 1.1E-51 | ||
| Phobius | 18 | 29 | 12 | - | – | |
| Phobius | 30 | 37 | 8 | - | – | |
| Phobius | 38 | 166 | 129 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 38 | 135 | 98 | 1.21E-12 | ||
| Pfam | 39 | 132 | 94 | 3.8E-8 | ||
| SMART | 40 | 149 | 110 | 6.3E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0064600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…