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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0173400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0173400.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein; TAIR: AT2G06105.1 aspartyl protease gag-polyprotein; Swiss-Prot: sp|Q754R2|DDI1_ASHGO DNA damage-inducible protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A1B5Z879|A0A1B5Z879_TRISU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0173400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:33100395..33124022) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCTCTACTCACCATCCTCGACGTCTTCTTCCCCCCACTTCTCTTCATTTTCGTTTCTTTTCTTCTCCTTCTAATATATTA CATATCTGCGTTTCTTCCTCTCATTCTTCTCACTCACGATTTCCACTCCCTACAGCACTAGATCCTCATCATTTTTCCTC ATTTCCCTTTGTGCAAGCCACACCAACGGCCATCACCATACCACCTTCTTCTTCATTCAATTTATTGTAACATCCACCAT CATTTTCTCCTCTTGGCTGTGGGTTCCTCGAGAGAAAGAAAGGGAGAAGAATTTGCTCACAACTTGCTCATTCCTTGCTC AAATCTTGTGATTCTTAAGGGCTTTGAAAGGTAACAACCTCCTCTTCACTCTCTTAGCTTCCATTTCATCTATTGGAGTC TATTTTTCATCAAGCTTTTGAACCCTAATTTCGTGTTTTTGAGTTTGAGGCATGTTTAGCTTAAATTCTGGTTTCATTTA GCTTCTATGCACGCTCTAATGATCATATTGGTAGCTAATTTGCATATGTGATTGAAGTTGTTGATGATTGTGATGAATTT GCTCTAAAAACCCATTTTGGCTCAAATGTTAACTTGAATTATGTTAGAGTCATACCCATGCTAAATGTATTCACGTTAGT TGTTAGTAGATGTCTAAGAATGAGCTATGTGCAATCAATTTAGAGAAAACATCAACTTTGGATTTTTAGGTTTCAATTGG GCATGGAAAAATGTTAATTCACAAATGAAGTTGTATGAGTGTTTGGATGGTTTTCCTACCTTAGTTAGGGAATAAATGTG CCTAAGAATTAATTGGTTTCAAAAGAAAAGTTGGATTACCCTATTTTTGGAGGGGGGTCCGTGAGCTTGCTTGTGTGTTG AGGGGAGGAAAATCCCTCTTTTAAAGATTAGAATTGAATCAATTGATGCATGTTTTTAGGATATGTTTTGGAGTAAGCTT 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ACCACTTTCCCCTCCCTTTTATTGATCAGATGCTTGATAAATTATCGGGGCACAAATATTATTGCTTTCTTGATGGTTAT TCTGGATATAATCAAATTTGTGTTGCCCCTGAGGATCAAGAAAAAACAGCTTTCACTTGTCCATATGGAGTCTTTGCTTA CAAGAGAATGCCTTTTGGGTTGTGTAATGCACCCGCCACATTTCAAAGATGCATGTTTTCTATTTTTTCTGATTTAATTG AGCATTGCATTGAAATTTTTATGGATGATTTCTCTGTGTTTGGTCCAACATTTGATGGCTGTTTGGAAAATTTAGCATTA GTTTTAAAGAGGTGTCAAGAGACTAACCTTGTTTTGAATTGGGAAAAGTGTCAGTTCATGGTTAGGGATGGGATTGTCCT TGGACACCGTGTGTCTGAGGATGGGCTAGAGGTAGATAAAGCAAAAATTGAAGTAATTGAGAAACTACCTCCTCCCACAA ATGTGAAAAGTGTTCGGAGTTTCCTTGGACATGCAGGCTTTTATAGGCGATTCATAAAAGATTTTTCTAAAATTTCCAAG CCTATGACTAATCTTCTTGAGAAGGACTCTCCTTTTATTTTTGATGAAGCTTGTGTGAGTGCATTTAAACTGATTAAAGA GAAACTGGTCACGGCACCTGTGGTTGTGGCGCCTGACTGGTCTCTGCCATTTGAAATAATGTGTGATGCAAGTGATATTG CTCTTGGTGCTGTTTTGTGTCAAAGGAAAGAGAGAGTGCTTTATACCATATATTATGCCAGTAAGGTTTTGAATGAAGCA CAAAAGAATTATGCTACAACAGAAAAAGAGTTATTAGCTGTGGTGTTTGCTTGTGAGAAATTCCGGTCATATATTATTGG TTCTAAAATTATTGTGCATACTGACCATGCTGCTTTGAGGCATTTATTTTCTAAACAGGATTCCAAGCCGAGGTTAATCA GATGGGTCCTACTCTTACAAGAGTTTGACTTGGAGATCATAGATAGAAGAGGCAAAGACAATGGAGTGGCTGATCACCTA TCCAGGTTGGAAGGTGAGAATTCAAGCATTGTGCCAGTCAAAGAAGAATTCCCAGACGAGCATTTGTTTGCTCTCAATGC ATCCGACACACTCCCCTGGTATGTTCACTTTGCCAATTTTAAAGCTGCTGATGTGTTGCCATCTGAGTTAACCTGGCAAC AAAAGAAAAAGTTCTTGCATGATGCTAAATACTACCTCTGGGACGAACCTTATCTTTTTAAACAGTGCTCTGATGGAGTA CTTCGAAAATGTGTTCCAGAGGAAGAGGTTGAGCAGATTCTGTGGCACTGCCATAGTTCTGAGTATGGGGGCCATTTTAG TGGAGAGAGAACCGCAGCAAAAGTTTTACAAAGCGGATTCTATTGGCCCTCCATATTCAAGGACAGCAGGAAGTTTGTTG AAAGTTGTGATAGATGCCAAAGGACTGGCAACATATCTAGGAAGAATGAGATGCCCCTAAATAACATTTTGGAAATTCAG TTGTTTGACGTTTGGGGCATTGATTTCATGGGACCTTTCCCACCTTCATATGGATGCCAGTACATTCTTGTTGCTGTTGA TTATGTTTCAAAATGGGTTGAGGCAACCGCACTTTCAACAAATGATGCCAAGGTTGTTGTCAATTTTCTAAAGAAAAATA TATTCACAAGGTTTGGAGTGCCTAGAGCTATAATCAGTGATGGGGGTACACATTTCTGCAACAAAGCTTTTGATTCCCTT TTGGAAAAATATGGTGTAAAACATAAAGTTGCTACCCCCTATCACCCCCAAACCAGTGGGAAAGTGGAAGTTTCCAATAG AGAGCTCAAAAGAATTCTAGAAAAAGTGGTAGGTCATCTAGAAAAGATTGGTCTAGAAAATTGGATGACACACTTTGGGC TTACCGCACTGCGTTTAAGACACCTATTGGAACCTCACCTTACCAATTGGTATATGGGAAGTCTTGTCACCTACCTGTTG AATTGGAACATAAAGCCTAGTGGGCCATTAAGCTTTTGAACTTTGATTTGAAAGATGCTAGCGAGAAAAGGCTTTTACAA ATTAATGAATTAGATGAGTTTAGGCTTCAAGCTTATGAGAATGCTAGAATCTACAAAGAGAAAACGAAAATTTGGCATGA CAAAAAGATCACCAAGCGAGAGTTTGAGCCTGGGCAACAAGTGTTGTTGTATAACTCTAGGTTAAGATTGTTCCCTGGTA AGCTCAAGTCTCGTTGGTCAGGACCATACGTGGTTACTAAGGTCTCTCCCCATGGTGCTGTTGAGATTGAGAACCCAACC TCAAAGTATAATTTCACCGTCAATGGACAGAGGTTGAAACTCTACCATGGGGGAGAGATATTCAGAGGGAAGACAACTCT GCAACTTGACCCTCCCAACTGAATAGGGAGGAGAGTCTAACAAAGACTATAAAATTGTGCTCTTTGGGAGACAACCCAAG TATTAAAAAATAAAAAATAAAAAAAAAACCAAAAAGATTTTCCTTTTAGTTTGAGTCTTTATTTTATGTTGAGTCATAGT GTCTCATTGAATTAATTGAGTTATGTTGTGGTATTTTAATTTGTGTGCTCATTTTTGCAAGGACTAAGTGACTTTACAGG AATTAATTGAGCTGGAGGGCCTAGCTGACAGTGTCCTGGTGCTATCACTTTTTGCACCTAACCTGAGTACAGGGAGTTTT ACTAAACCACTCATATCTCATTTAATTTTCTGAACATGCATTTAGAATTTAGTTATTTAGTTGCACACACTAGTATGCAC ATGCCTTGAATTCCTGGTAATCACATTTTTATGCTTGAATAATGCTTGTTGGTATTTTTAATATTTATTCTTGGTTTGTT GCTAGTTATTTTAATGAAAAGTGTTTGATGCATGAGTGTGAGTGAAACTTGAGGAACATGTGGAGAGTTAGGTGATAAAG ACTTAAGTGAGTTTTGGAAAAGTGCAGTGAGGTTATTAAGATGTCAGGTTAGTGGGAATAATGCATAAGATGTAGTTTTC CTTTTAATCTTTATATTGAGTCTACACTCTTTTTGGCTGTGAGGTTAAAAAAAAAAGGGGCACACATGTGAGAGTAAAGC TGAAGTGCTAAAAGTGGGAAAGGATGTGAGTAAGGGAAGTATTTGCACCACTAAGCATACCCCCAATCATATCCTGACCT TGTCAAAAAAGAAGAGAAAAGAATTACACCCTGAGTTGGTAATAACTGTGACGGGTAGAGAAAGAAAAAATTGAAAAGAA AGAAAAGAACATGTGCGTGCTCTGAATAAAATAAAACTGGTGGCCATCATTAGTGGATTCTCAATATGGGGTTGGGGAAT TATGAATAAAATGTAAAACCCCACATCTTGGCATTTTCTATATTTCTTGTTTGCACTTACTAAAGGTCACTCGATTTTTA AAGCTTCATTCTCTGCATAAACTTTTAAGGAATTCATCTCATGTATCTCTTGTGAAAATGTGTATACTAGCATCTTACTT GGAATTGTGTTCTTGAGCTTGAGGACAACCAACCTTAAGTTTACGCTTGAGGACAAGCTGTCGTTGGGTATAGTGGTGTG ATGACCCAGGATTTAGAGCTATTTTCCTAGTTTATTGTCATTTAGTTTAAATATTTTTTAGGACATTTCAATCATTTTAG GACACTTTAGGCTTATTTCATGCATTTTATTATTTTTGCTTGGTTTTAGTATTTTTCTACATTTTATATTATTTTTCAAG ATATTATTAGGTTTTATTATTTTAATTTAGAATTAGATAAGTTTATTTTAAGTTTTTATCTTATTTTATCTTCTATTAAT TTTATTTTATTATCTTTTAATTATTTTTTTCCTATTTTTATTGTTGTTTTAGGGGAAGATTTGGAAAAGATAGAAAAAAT TCAGAATTAAAAAAGAATTCTGGAGGCTGGAATTATGTGCCGCGCGATCGCGCGAAGTTACCGTGTACTTCTGGTGCGAT CGCGCCACTTGTCAGCGTTCTGGAATTAAACGCACCAGATTTCGTGCCACTTTGGCTTACAGCGTGCGCAACCGCACCGG ATCACGTCTTCAGCAGAAAAGACAAAAAAGGGGTCCCAGCTCCCTGCTTCGCGCACATGTGATCACTGTGTACATCACCC ATGTGCACCATTTGATTGGAATCCGACGCCAGGAATTGCGAGGGTGCATGTTCTTACGCTGAACCCCGCCACACTGGATC TCAGCCCCTCCAGAACGTAGAAAACACTCTAAATAGCGTTTTAAACCTAATTTTTCATGTTCTTTGCACCCTTGGACGAA TTTGAGCAAGCCAGAGACCCAATTTTGGTTCTTGAAGGAATTTTTCCAGGTTTTCTTTGATCTTCTATGTGTTTCTTCTT AGATTCTGAATTATTCCTCATGTTTACGAGGAACTAATTCTCTCTTAGCACTTGGGATGCCTAGTCCTTTGGATCTTATG CTTTAATTTGTACTTTGGTTGTGTGTTGGATTTCTATTATGATTTATGAATTCCGTTTCAGTTATAATTTTATTTGATTG CAAGCAAATACCTTACTAATTTCTGTGAGACTTGGAAGAGTGATTAGAAATTAGGGATTTAAGAGAACGGAATTTATTAA CTTTTCTCTACGACCTTAGGAATGAGGGTAGGAGTTAATAGTGGTGGCCGGAATTATAACTTTATCTTTAATCTGTTGGT TTAGGTGCTCGTAAAACAGACTTAATATTCAGATTAAAAGTCTGTCTTGTTTAAGGAATTAGCAAGTTCAGAATTTAGGC TAGATCACCATAGAGAGTAATTTTTATTTCACACAAACAAGTTTGATTAGGCATAAGTGATAATTGGCGAAGCTAACCCA GGTGCTATTTTTCCAAATTAAGTTTCACAAATTATATTAGCTTTCTCATTTTTCCCTGCAATTGAACAATTAAATCAAAA CCCCCAATTCTTATTTTACTTCTGCTTACTAAATCATAGAATTAGTCTGAATCGATAATTGAACACAATCCCTTGGGTAC GATATCTTTTATATTACTACGGGCAAATCTGTATACTTGCAGATTGACTTATCACATAACAAGTCAATTTGGTTCTCATC ATTTTCACAAAATAACAGGGTGTCGTCAGCAAACTGTAGATGGTTCAAGGCTAATCCAGGTCCAATTCTCACCCCGCTGA AATTGGAGTCATCTAGGAGCTGGTTCAACAAACAAGACAGCCCATTAATGAAGGTATGAAAAACGGTAGAAAGGGGGGGT TTGAATAACGTTTTCAGTACAAAACTTCCACCTTAAAGATTTTGGCAAATCTTTCGAGAACTTAAGTGCTAAAGATAAGA GATAGAAAATGTAAGGCCCGAGTTTTTA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0173400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCGAGGTACTGTAGATCCAAATTCTCTACTTTTTGATCCTGAGATCGAGAAGACTGCTCGCAAGAACAGAGCTCAACA AAGAAGAGAAAAAGCAAGAGAAAAGGCCGAAAGTACCATGGCTGCAGAGTCACCAGCTGAGATGGAGGCAAGGCTCCGTG GTCAATTAACTGCAGAATTTAATGAACGTATGGAAGCTGAATTACAGGCTCGTTTGATTCAGAATCAAGAGAATGAGGCT GCATTGGAGGCCGAGAGATCCCTGAAAGACCTTAATGCACCTCAAATCAGTTTCAGATTTGAGGGAAGCATTGTCAATCC AACAGACCTACCAAGAGGTTTCAAAATTCCACCACACATAATGCACTCGATAGCACAGAATCAATTCGGAGGAAGCGTAC TGGAGGATCCATATGCTCACATGGATCGATTTACTATGCAGGTGTCCCCCGTGGTATCTGAACAAGTAAGTCTGGATGAT GTCAGACTAACACTCTTCCCCCACTCTCTGAGGGATGCTGCTGAAGAGTGGTTGAGGGCTCAACCTCAACAGAGTATAAT TTCTTGGGATGATCTAGCCAAGAAGTTCTCAGAAAAGTTTTTTCCTAGCTCTCGCATGAGGCAACTGAAGCATGACATCA ATACTTTCTATCAAAAGGAATCAGAGAATCTTTATGATGTATGGGAAAGGTTCAAGGGACTTCTTAGAAAGTGTCCAGGC CACAATTTGAAAGAATCAGCACAGGTAGACAGGTTCTATGCAGCTCTCAACAGAGATACAAGAGTCAAGTTGGACCTTGC GGGCAAGAATGGAGCTTTTGATCATCTGTCAACTAAGGATTCGCTTGAAATCATCAACAATCTGGCTGAAAGGGAAGCCC ACTCTAGCTATGATAGATGCAACAAGAGCAGCATCAATGAAATTCAGGCATATGACAATGTAATGGCGTTTAACAAGGCA CTGTCAGAGAAGATGGATGTCATGTTCAAGAGGATGGATGATCGCAAGATGAGCGTTGAGAATGAGGCAATGGATGAAGA GATCAAGTATATGAGAAGCTCTAGGCATGATCCACCTACTGGTACATACAACCCCAGTTGGGCCAATCATCCTAGTTTTT CTTACAGAAATCAAGATGGATATGCACAGCAAGGAAATTCTAAGCAGTACTCCAATCCACAAAGGGGCCAATATCAAGAT CAGAGGCAACAACCTCAACAGGATCAGAACTCTGGGAAAAGGAGCTTGGAAGACATTGTGGGGCAACTATCTCAAACCAC TGAATCTTTCATGACTGAAACCAGAAATACCAACAAAAATCATGAGGCTTCCCTTAGGAATTTGGAGAATCAAATGGGTC AGATTGCAAAACAGCTTTCAGAAAGGAGTCCAGGTAAGTTACCTTCTGACACTATTGAGAATCAAGCTAATCTTTCTACT ATAACTACTAGGAGTGGTAAAATTTTAAAAGATGCTGAAAGAAAGATAGTAGAAAAGAGGGGTGAGGAAGTAGAAAAATC TAAGGAAGAGAGTAGGGAAGTAAGTGCGAAGAAAAAAAATAATGATAAATTCAAAGAAAAGAAAGATAAAGAGAGCACCA CTTTCCCCAATGACAAGAGTTGTTGCAAGGTACCTTTTCCAAAAGCTTTAGTGAAAAAGAATTTAGAAAAGCAATTTTCT AAATTTCTTGAGGTTTTCAAAAAGTTACAAATAAACATTCCATTTTCTGAAGCTTTGGAACAGATGCCTGCATATTCTAA ATTCATGAAAGAGATACTCTCTAGGAGAAGAAAGCTGAGTGAGGTAGATGAGACCATAATGATGAGTGAAGAGTGTAGTG CTATCTTGCAAAGGAAACTTCCACAGAAAATGAAAGATCCTGGAAGTTTCACACTTCCTGTGGAAATTGAAGGTCTACCT GCTGCTAAGGCTCTCTGTGATTTGGGAGCAAGCATTAATTTGATGCCTCTCACCATGTTTGAGAGGTTGGGTTTAGGAGA GGTCACTCCTACCATGATCAACCTACAACTAGCTGATAGGTCACTCAAAACTCCTTATGGGATCATAGAGGATGTTCTTG TTAGGGTAGACAAATTTATTTTCCCTGTGGATTTTGTCATATTAGATATGGAAGAAGATACTAGAATACCTCTCATCCTA GGAAGACCCTTTTTAGCAACTGGTAATGCAAAAATTAATGTGAGGAAGGGAATTCTTTCTTTGAAAGTAGGAGAAGAAAA AGTGAGGTTTAATGTTTTTGAGTCGTTGAAACATAGGAATGATGAGAATATCTTTAGTGTTGAAGTAGTGGATGAGTTTG TTTTATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0173400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MRGTVDPNSLLFDPEIEKTARKNRAQQRREKAREKAESTMAAESPAEMEARLRGQLTAEFNERMEAELQARLIQNQENEA ALEAERSLKDLNAPQISFRFEGSIVNPTDLPRGFKIPPHIMHSIAQNQFGGSVLEDPYAHMDRFTMQVSPVVSEQVSLDD VRLTLFPHSLRDAAEEWLRAQPQQSIISWDDLAKKFSEKFFPSSRMRQLKHDINTFYQKESENLYDVWERFKGLLRKCPG HNLKESAQVDRFYAALNRDTRVKLDLAGKNGAFDHLSTKDSLEIINNLAEREAHSSYDRCNKSSINEIQAYDNVMAFNKA LSEKMDVMFKRMDDRKMSVENEAMDEEIKYMRSSRHDPPTGTYNPSWANHPSFSYRNQDGYAQQGNSKQYSNPQRGQYQD QRQQPQQDQNSGKRSLEDIVGQLSQTTESFMTETRNTNKNHEASLRNLENQMGQIAKQLSERSPGKLPSDTIENQANLST ITTRSGKILKDAERKIVEKRGEEVEKSKEESREVSAKKKNNDKFKEKKDKESTTFPNDKSCCKVPFPKALVKKNLEKQFS KFLEVFKKLQINIPFSEALEQMPAYSKFMKEILSRRRKLSEVDETIMMSEECSAILQRKLPQKMKDPGSFTLPVEIEGLP AAKALCDLGASINLMPLTMFERLGLGEVTPTMINLQLADRSLKTPYGIIEDVLVRVDKFIFPVDFVILDMEEDTRIPLIL GRPFLATGNAKINVRKGILSLKVGEEKVRFNVFESLKHRNDENIFSVEVVDEFVL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 48 | 48 | - | – | |
| Coils | 15 | 42 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 15 | 40 | 26 | - | – | |
| Coils | 65 | 85 | 21 | - | – | |
| Pfam | 165 | 257 | 93 | 2.4E-17 | ||
| MobiDBLite | 352 | 415 | 64 | - | – | |
| MobiDBLite | 357 | 415 | 59 | - | – | |
| Coils | 431 | 458 | 28 | - | – | |
| PANTHER | 491 | 763 | 273 | 8.5E-66 | – | |
| PANTHER | 491 | 763 | 273 | 8.5E-66 | – | |
| MobiDBLite | 500 | 537 | 38 | - | – | |
| MobiDBLite | 500 | 536 | 37 | - | – | |
| Gene3D | 608 | 752 | 145 | 3.7E-25 | ||
| CDD | 632 | 726 | 95 | 3.14985E-18 | – | |
| Pfam | 633 | 724 | 92 | 9.5E-6 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0173400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…