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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0198800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0198800.1 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ABC1 protein kinase; TAIR: AT5G24810.1 ABC1 family protein; Swiss-Prot: sp|P73627|Y1770_SYNY3 Uncharacterized protein sll1770; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RN26|A0A0S3RN26_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0198800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:41844277..41873702) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGGAAACATCTTCTTTTCCAGTTTTCTTCGCACATTTCCGTGTGGAAAGTTTTATGTGGGCCCCCTGTTTCAGTTTTCCA TTTTGAACAACTTTCCATGGTAACCGTAATCACACATAATCACTCGCTTCCCTTTTCTTTCCCGTCATTTTCAACCCAAG AAAACAGTGTTAATCCCCCCAAATTCAGAATTGGAACCCTAATTCCACCCAATCTCACTCAATTCTCTCACTTTCACTAT TCCATAGCTCCTGCCCAACCCACTTCCAGCACCGCTCCGCCCATTCCCGACCACCTGCTGCCGCGTGACCACCGGTCTCC GGCCACCGCATTTCTGCTCGATCAAGCTCTCAGGTACTGTTTTCTCTGTTGAAAGACTTAACCTTTTGCTGGGTGTATGG GACTTAATATCTATCTATCTATATCTTTGATATTGAGCCTATATCTGATGAAATAAGTTGTTACTAGTTAGCAGAATTTT TATTTGCTGTATTGTATAATTGCATTATCCAGGTTTTTTAATGTGTGTATGAATAATTGTGTATATATATATATATAATT TTTTTTATAGATAATTGTTGTATTGTATACTTTTTATATCTATAATTATTTATTAAGGCTGTCATGGCGTCCGCCATATC CGCCATAGAATTATGGCGGTATTTTGGCTTTCCGCCATGACCCGCCATACGCAAATGATAACACTGGTTTGCGGTGTGTA ATTGATTCCTTCAAACATAAGTGTGATAGATTTGTCTGATTCATTGGATAAATGCTGAATGATCAGCAAAGAGTTTATAT GTAAGACTGAGTTCCTCTAACTGCATACAACTATTGACTAACATCAAACTAACTGTGTATAGGAGAAAACTGTACAGCTA AGCAATCCTAACAAATTACTAACCGAAAAAAAATGAGAAGGATATAACATGAATACAACTTACATTCTAACAGCTTTCCA 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ACATATAAAGTTACTAATATGTTAAATGCCATACTTTTCAATAAATACTTTTTATTTCTTGATTCCTCAATCTTTTTTTC AAGAGATTCATTGGTAATTCTTATTGCTTACTTTATACGATTCTTGTTAAAGAAAATTTTCATTGGATCTTAGTTTCTTT GTAAATTGTAACCATGCATCTTTGCTCATATTTTAGGGGTGGAAGCACGACTTGCAGCTCTGACTGTAGATACAGATGAT TTAAGCAAGCTGTCAGCAATTCCTACCCGTCCTGACCTTCCTTCCACCTTCCAACCGCAGCAAATAGCCCGATCAGCAAC GACTCTGCCTGCTGTTTTCAACACACTGCATGTTCGGCGTGCCATCATACCAGCTGCTAATGGACATTTATCTGCCCGGG CACTTGCACGCTATTATGCAGCCCTAGCTGATGGTGGTAAGATACCACCACCTCATTCTTCTGATTCTAAGCCAGTACTC GGAAGTCATCCGCACATCCCCAAATTATCTTCTCAGAAGGCTCCCCAAAATAGGAAATGTTTTAGGCGGAAGGAAGCAAC TTTACCTTCCATGAGCAATACTAGAAGTTACGAAAAAGTCTCTAGTTCTGAAAATTTTGAGGTTAGTGAGGGCAGAAATA CTTGCAGAGATAATAACAGTAGCGATGATTCCAGTAGTAGCAACGTGGATAGTAATCTGCGCACCTGTGTTCCTGGTAAG GTCTATAGAAATCCGAGGATTATTGATGAATTCTTGGGTGCAGGAGAGTGTGAGAATTTAGCTTTACCAAATGGGGGTTT CGGCCTAGGATTTAAGAGATTGAGTTCTAACAATGGGTCTTCCATTGCGTTTGGTCACTCTGGAATGGGTGGCTCCACAG GGTTTTGTGATGTCACTAACAGGTTTGCCATTGCTGTGACACTAAACAAAATGTCCTTTGGTGGTGTATCGGCAAAAATT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0198800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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Protein sequence (LotjaGi1g1v0198800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVTVITHNHSLPFSFPSFSTQENSVNPPKFRIGTLIPPNLTQFSHFHYSIAPAQPTSSTAPPIPDHLLPRDHRSPATAFL LDQALRLPVRMGWGNIYRRRIRVFTMALAIYLDYKGVQQREKWTNKSRQPVLWEKAHERNAKRVLNLILEMEGLWVKLGQ YMSTRADVLPAAYIRLLKQLQDSLPPRPLEEVYGTIQKELGKSMDELFSVFINEPLATASIAQVHRATLLNGQEVVVKVQ HDSVKTVILEDLKNAKSIVDWIAWAEPQYNFNPMIDEWCKEAPKELDFNHEAENTRTVAKNLGCRNKYDGNISSNRVDVL IPDVIQSTEKVLVLEYMDGIRLNDLDSLEAYGVNKQNIVEEITRAYAHQIYVDGFFNGDPHPGNFLVSKESPHRPILLDF GLTKKLSTTIKQALAKMFLASTEGDHVALLSAFAEMGLKLRLDIPEQAMEVTTIFFRETTPANESYKTMQSLSDQRTKNM KVIQEKMNLDQKEMKRFNPVDAFPGDIVIFGRVLNLLRGLSSTMNVHIVYMDIMRPFAESVLSGYISRGPSVNDRWIFDS PVHSNVEAKLRQLLIELANNDKILGIQVCAYKDGKVIIDTSAGVLGKYDPRPVTPDSLFPVFSATKGITAGMMHWLVDNG KLNLEENVANIWPGFGSNGKDVIKVHHVLNHTSGLHNAMADLNQENPLLMLDWDECLKRICMSVPETEPGKEQIYHYLSF GWLCGGIIEHASGKKFQEILEEAIVRPLHIEGELYIGIPPGVEARLAALTVDTDDLSKLSAIPTRPDLPSTFQPQQIARS ATTLPAVFNTLHVRRAIIPAANGHLSARALARYYAALADGGKIPPPHSSDSKPVLGSHPHIPKLSSQKAPQNRKCFRRKE ATLPSMSNTRSYEKVSSSENFEVSEGRNTCRDNNSSDDSSSSNVDSNLRTCVPGKVYRNPRIIDEFLGAGECENLALPNG GFGLGFKRLSSNNGSSIAFGHSGMGGSTGFCDVTNRFAIAVTLNKMSFGGVSAKIVQLVCSELQIPVPDDFLRFMAQQSG QDEQLSLGRPLIN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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|---|---|---|---|---|---|---|
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| PANTHER | 99 | 915 | 817 | 0.0 | – | |
| CDD | 179 | 433 | 255 | 9.7253E-89 | – | |
| SUPERFAMILY | 181 | 403 | 223 | 6.71E-20 | ||
| Pfam | 198 | 302 | 105 | 2.5E-28 | ||
| Pfam | 331 | 391 | 61 | 2.1E-4 | ||
| SUPERFAMILY | 565 | 848 | 284 | 7.37E-53 | ||
| Gene3D | 565 | 879 | 315 | 5.0E-76 | – | |
| Pfam | 573 | 847 | 275 | 3.2E-43 | ||
| MobiDBLite | 844 | 926 | 83 | - | – | |
| MobiDBLite | 882 | 926 | 45 | - | – | |
| Gene3D | 941 | 1024 | 84 | 5.3E-7 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0198800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…