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LotjaGi1g1v0198800.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0198800
Transcript ID LotjaGi1g1v0198800.3
Related isoforms 4
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description ABC1 protein kinase; TAIR: AT5G24810.1 ABC1 family protein; Swiss-Prot: sp|P73627|Y1770_SYNY3 Uncharacterized protein sll1770; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RN26|A0A0S3RN26_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0198800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:41847762..41873193) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTGGCCTTAAAATAACCTTCATTCCGTGTTTTAGGTTGCCTGTGAGAATGGGGTGGGGAAACATTTACAGAAGACGTATT AGAGTATTCACCATGGCCTTAGCAATATACCTAGATTATAAGGTAAGCTACAACGGTTGCTCAAATTTCTTTTGTTTTTT TGTCCATATAATTAAATTACACTTCTTACTTTCTGTTATTTGTCTCTGTAGGGTGTACAACAACGAGAGAAATGGACTAA CAAATCTAGACAACCTGTACTGTGGGAGAAGGCTCATGAGCGCAATGCTAAGCGGGTTCTAAATTTGATACTAGAGATGG AAGGTTTGTGGGTGAAACTTGGGCAATATATGTCAACACGTGCAGATGTGCTTCCTGCAGCTTATATACGTCTTCTGAAG CAGTTACAGGACTCTCTTCCTCCTCGCCCCTTGGAAGAGGTTATTCTCTTAATGTTTTTTTTATAAATAATGATACTTAA GTTTAAGAAATCGAAGACAAGAAATATGCTTTTCGGAAATGATTTACTGTATAAGCCTATTAGGTTTGATAAGAAAATAA TGTTTCTCATTTTTAAGCTACATTGAATGGACTGTGTAATGCACACTTTGTTTGATGAAAATAAACTTGTTAGTTTGGAG TTTGGACTTCACAATCCATGATCAAGAATAAGGGGCCTTCATTTGCTAATCAACATAAGAATTTCAATTTTTTTCCTACT GTCGCCATCTGTCCACTAGACTTTTCTCAATGTAGTTTATGTTTGCAAGGTCTATGGCACGATACAGAAAGAGTTGGGGA AATCAATGGATGAGCTATTTTCTGTTTTTATCAATGAACCTTTGGCAACAGCATCGGTAAGACCATTGACTCCTGAGAAT TTTTTGCTACTAGAGGATGGTTATTCGACTTAAATCATCTTTATAATTTAAGTATTTCCCTCGCCTGAGTTGAGTCAATC 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ACCTTTTGATCTTGTTCACTCTGATGTGTGGGGACCTTCGTCCATTTCTAATGTTTCTGGTGCAAAATGGTTTGTTACTT TTATTGATGATTGTACTCGGATTACATGGGTTTTTCTTATGAAAGATAAGTCTGAGGTGTTTCAATAATTTGTTAACTTT TTCCACATGATTAGAACACAGTTTGGGAAACCTATTAAGAGGTTAAGGTCAGACAATGGGAAAGAGTATGTTAACAAGAA TTTTTATGAATTTCTTACAAAAAATGGTGTGGTTCATGAGTTGACTTGTGTTGACACCCCACAACAAAATGGGGTTGCTG AAAGGAAAAATCGTCATCTTCTTGAAATCACTCGAGCTTTACTCTTTCAAATGAATGTTCCTAAGTTTTATTGGGGGGAA GCTGTCTTGACTGCTGCTTATTTAATTAATAGGTTACCTTCTAGGGTTTTATCTAGTGTTAGTCCTGTGCAGGTTATGAC TAGCTTCTTTCCGTCTGTGCCCATTAAGTCAGGTCTTAAAAGTCGTGTATTTGGTTGTTCCGCCTTTGTCCATGTTCACG GTCATCATCGGGGTAAGTTAGATCCTCGGGCTATTAAGTGCATCTTTATAGGATATGCCTCAGATAAAAAGGGCTACAAG TGTTATCATCCTCCTAGTCGTCGTGTCTATATATCCATGGATGTTACTTTTCAAGAATCAGAGTCTTTTTATCCCAATCC TCAGCTTCAGGGGGGGAATACTCAGGAAGTTGAGTCTCCAGAATTGTCTGTTATTCCTCTTCTACAGGATCCCTTGATGC CTTCCTCTATTCCTATCACTGAGGACAGTGATGATGATGACAATGGTCCTGAACTAGTACCAAATCAGAATGATGACAAT GGTCCTGAACTAGTACCAGATGAGAATGATGACAATGGTTCTGAAGTAGTACCAGATCAGAATAATGTTGACAGGTTCAG GATAAAGTACCAGCGGAAAGTAAAACTCGTCCTGATCCAACAACAAGTCCAATCGTCTGATCCTGAGGTAAGTGTTGCGA ACCCTGAGCCTAGTAATTCCTATGAGCATAACCTTGATGACTTACCTATTGCCTTACGAAAAGGAAAACGTTCTTGTGCC AAGTACCCTATATCCCAGTTTGTGTCTACTCAAAATCTTTCTGTGCAGCATCAGAGTTTTATTTCAGCTATTGACTCTAT TAGAGTCCCTACATCAGTACAAGAAGCATTAAAAGATAAGAACTGGATTCAAGCCATGAATGAAAAGATGCATGCACTGG ACAAAAATGGAACTTGGGAGATTGTTGAGAAGCCAAATGACAAGAGGACAGTAGGTTGCAGGTGGATTTATACCGTGAAG TACCGATCTGATGGCACACTTGACAGGTATAAGGCGAGGCTAGTTGCAAAGGGATACACCCAGACCTATGGAATTGATTA TGAAGAGACATTTGCTCCGGTAGCAAAAATGAACACTGTAAGGATCATTCTTTCCTTAGCAGCTCATTTTGATTGGGAGT TGCAACAGTTTGATGTTAAAAATGCTTTCTTGCATGGAGATTTGGAGGAAGAGGTGTATATGGAGATTCCACCGGGGTAT GACCCTACTTCAGGAAGAAATAAGGTGTGCAAACTGAAGAAGGCCCTATATGGGCTCAAACAGTCACCCCGAGCTTGGTT TGGGAGATTCACTAATGCTATGGTGTCTCTGGGTTATAAACAAAGCCAAGGTGATCATACCCTCTTTATCAAACATACTC AAAATGGTAAACTCACTATTCTGTTAGTCTATGTAGACGATATGATCATTGCAGGTAATGATGAACTTGAGAAGCAGAAT CTGAGGAAACAGTTGGCAGCCCAATTTGAAATGAAGGATCTTGGAAAACTGAAATATTTCCTAGGTATGGAGGTGGCATA CTCGAAGCAAGGGATTTTCATATCTCAAAGAAAGTATGTCCTTGATCTTCTCAAAGAGACTGGTAAATTGGGTTGTAAGC CCATTGGAGTGCCTATAGAGCAAAACCACAAGATTGGAAGTAGTGAGGAGGACCTTAGGGTTGATAAGGCTCAATATCAG AGACTTGTGGGGAAGCTCATTTATCTATCTCACACTAGGCCTGACATAGCTTATCCTGTTAGTGTTGTCAGTCAATTCAT GCATGACCCACAGGAGAGACACTTACAGGCTGTGGATAGAATCTTGCAGTATCTGAAGGCAAGTCCAGGGAGAGGTCTGC TGTTCAAGAAGAGTGAGCAGTTGTCTATGGAGGTTTATACTGATGCAGATTATGCAGGGTCAATTGTTGACAGGAGATCC ACTACAGGATATTGTATGTTCTTGGGTGGAAATTTAGTTACATGGAGGAGCAAGAAGCAGAATGTAGTTGCCAGATCAAG CGCAGAGGCAGAGTTTAGAGCCATGGCTCAAGGAGTTTGTGAACTGTTGTGGATGAAGATCATACTGGATGATTTGAAAA TAAAGTATGAAGCTCCCATGAGACTCTTCTGTGATAATAAATCTGCCATTAGTATTGCTCATAATCCAGTCCAACACGAC AGAACAAAGCACATAGAGATAGACCGGCACTTCATCAAAGAGAAATTGGATAGTGGTCTAATATCTACACAGTATGTCCC CTCAGGACTTCAGTTGACTGATGTGCTCACCAAAGGACTTCCCTTGGAGCGGTTTCGAGAGCTTACTTGCAAGCTGGGAA TGATAGATATTCATTCACCAGCTTGAGAGGGGGTGTTGTAAATAAGGAATTAATATAAGAATTATTATTAGAAGATTATA TTCAGTATTAGGAGATTTATTCTCTTATTAGGAGATTGTGTACATAATTAGTTATTTCCTTATTTAGGATTAGTCTTCTT CTATATAATGTAATTACCCTTTGTATTCTGATTAAGAAGTAATAATACAATTTCTCCTACTTTCAAGTGAAACATTCACA TTCACATGAGAAGGGAGGTTTTGCTCAATCTTACAGAAGTTTCGAACGCTGGTGAGTTCAGTTGAGTGATAGGGATGAGG CTATTCATGTAATTTCACTACTCCCTCCGTTCCTTTTTAAGTGTCGTTTTAGAAGAATTTTTTTGTTCCTATTTAACTGT CATTTTGATGTTTTAAGGTTCTATTTGTCAATTATACCCTTACTTTTTCAATAACTCCACTTCACATTTTCCATTAAACT CTCATTTCTCAATAACTATGAAGAGCTTTATGACTTTATGATTGGGTGAGAGTGGTAGATGGTTTAATGATATGAGAGAG TGGGAAAAAAACTAACAATTCACTATCTTGATTGGAGAGCTTTATGACTTTATGATTAAGGCGTGAGAGGGTAGAATGGG AAAAAACACTTTAACAATCCACTATCTTGGTTGGAGAGCTTTATGCTAAAATGACACTTTAAAAGGAACGGAGGGAGTAA TAATTAGTTTCCTCCTAACTGTTTTACTGCCTTTTTGCATGCCTGAGTTATTTGAGCAAGAATTGATATACCATGGAATT TATTTGTTTTACAGTAAGTTGAGTTATAAATACCACCAAAGCACACATGTTGGTGCTATGGTTTGTCAGAAGTGTATACT TCTTTGATTGACTGTAGCGTCTGTTCCGTGTTGTTATTAAGTTAAACTTTTTACCATCTTACAGTATATCACATCCTGTA CATTCACATTCCGTGCGGTTACCCTGAAATAATTATTTACCTGCTTATTATCTTGCAGAAAACTAAACCTTGAAGAGAAT GTTGCAAACATTTGGCCAGGATTTGGATCAAATGGGAAAGATGTTATTAAGGTCAAATATTGATTTTTTCCTCCTAGCTG TAGCTCTGAAGCTATTATTTTAAAGAATGTTTTGGTCGTCTATTTCAGGTTCATCACGTGCTTAACCATACATCTGGTTT GCACAATGCAATGGCAGACTTAAATCAAGAAAACCCTCTTCTGATGCTTGATTGGGATGAATGTTTGAAACGCATTTGCA TGTCAGTACCTGAGACCGAGCCTGGCAAGGAGCAGATTTATCATTATTTGTCATTTGGTTGGTTGTGCGGTGGAATCATT GAGGTATGAATGCTTGCCCAACTGTGTCAATTTTTTTTTATCTACCAAAAAAACGATTATTTGCTTAAGCCCATTATAAG GACTAAGGAGTAACAGAAAATTTGTGAAAGCAAGGAACAGTAATAAAATGATATATTTGAGTAATGTTACGGGGTGGGTG AAGGGCCACTTTCGTCCCTAAAGTTACAAGCGTCGGGCATATTAGTCCCTATTCTATGGAAATGTCGCCCGTAGTCCCAG ATGTTGCAAAATGTCAAGCACGTTAGTCCCTGGCTTGGCTCCCGTTAATTCCACACCTGAGATAGGACTTTGTCAATTTC AGCAACTCCACACTCTACATCTCCTTCTCCCTCACTTTTCATAACTTCATCACACCTTTGCATCATCTCCCTAATAAGAT CCTCGATCACTCTCAGCTTCTTGAAGCACATCCAAAACAATGAAAACAGAGAAAACCCATGATTACCAACGCAAAAAAGT TTTTTTCTTTCTTTCAAGAAATGCATGTTCAATAATTTTACACACACCCCAGAACAAGAAAGCGAAGAAAACCCAAGTTC GAAAACCAAAAAAGATTATAACTTTACTAAGAAACTCGGAAAACCCTCTATCATACTGTTGAACCAGGGGTGGTTTCTTC AGAGCTCAACGAACGAGGGGAGGCTTTAACCGGCGAAGGAGAGAGATCAGAGACAGTTCTCCTGAGGCTCGGAGGCAGAG GGGGCAAACCAGACCTTCTTGCCGGCGGCGTGGAATACCTTGGCTAGTACGCCGCCAGATAAGGTGAGGCAGAAACCGTG CGGCGAAGAACGTGGAAAGGAAGAGAAATGGCGGAGAACCCATGGCGGGTGAGATCTTCCTGGTCAGAGAACAACTTCTT GGCGCTCGGTTCCCTGGAGGAAGAAGAAGACGACGTCGAGCAGCGCTTGTTGGCGGATGCGTGGAAACGGCGGCAGCGGC GTCGCTTGCAGGCGCTGCAGCTGTTGAGGTGCATCATGGAGAACTGGCTGGTGGTGGGGTCCACCGCTCTGCCGGTGGTG CTGGTGTTAAGAATGGGTTCTTGTTGTTGGCTTTGACTCTGATCACCGCACATTTGACACTTCGGATTCAGAACCCTAAT TGCAATGGTGGGTTCTTCTTGTTGGTTCTGAATCTGTTGGTGCACTTCACCCATTCTTGAACCCTAATTTCGTTTTTTCT TTTGGTTTTGTTTTGTTCCTCGCTCAGAAATGTTTGGTTTTGGAGTGAGGAGGAAGAAGATGATGGAGAGATTGAAGCTT TTCTGATTTGGGGATTTTGGACAGGGACTAAATTGAAGTTTTTAAGTTTTCCCAAAAAATTTCCCAATATTTAAATCCAC GTGGAAAGTCCACAGGGGCACATAACGTGCCAAATCACCCTTCTCGTTAACGTTCACTGACGGGAGCCAAGCCAGGGACT AACGTGCTTGACATTTTGCAACATCTGGGACTACGAGCGACATTTCCATAGAATAGGGCCTAAATTGCCCGACGCCGGTA ACTTAACGGACGAAAGTGACCCTTCACCCAATGTTATGCTTGTGTATAGCTTATCTACAAACGAGCCTATGGCATGTCTC ACCAATTTGTTGATGGCAGTGTATATAAGAGTTTTTTGTGATAGTGTTTTGATAAAATAGGAACCTTAGTGAGGTTGCAT TCCACCCCCAATTCTCAGTGATCAAAAGTTGCTAAACCAAGTACTAGTAATTTGTTTGTCCCGGTAAGATTTCTATCTGA TTATTTATTTGGATAAAACAGCATGCCTCTGGTAAGAAATTTCAGGAGATTCTTGAAGAAGCAATAGTCCGTCCCCTACA TATTGAAGGCGAGCTATATATAGGGATTCCCCCAGGCAAGTTTTGATGAATTTATTCTTTTTATAAGATGATATTAAAGT TGTATTTGTCTATTTGGCTTGCATATGAAATCGTTTTAGTTTATAACAGCCGCTAGTGAGTGTCCTTGACACTAATTAAA GAATCGAAAGTAGAAAGCATTTATAGAAAAGTATAACATATAAAGTTACTAATATGTTAAATGCCATACTTTTCAATAAA TACTTTTTATTTCTTGATTCCTCAATCTTTTTTTCAAGAGATTCATTGGTAATTCTTATTGCTTACTTTATACGATTCTT GTTAAAGAAAATTTTCATTGGATCTTAGTTTCTTTGTAAATTGTAACCATGCATCTTTGCTCATATTTTAGGGGTGGAAG CACGACTTGCAGCTCTGACTGTAGATACAGATGATTTAAGCAAGCTGTCAGCAATTCCTACCCGTCCTGACCTTCCTTCC ACCTTCCAACCGCAGCAAATAGCCCGATCAGCAACGACTCTGCCTGCTGTTTTCAACACACTGCATGTTCGGCGTGCCAT CATACCAGCTGCTAATGGACATTTATCTGCCCGGGCACTTGCACGCTATTATGCAGCCCTAGCTGATGGTGGTAAGATAC CACCACCTCATTCTTCTGATTCTAAGCCAGTACTCGGAAGTCATCCGCACATCCCCAAATTATCTTCTCAGAAGGCTCCC CAAAATAGGAAATGTTTTAGGCGGAAGGAAGCAACTTTACCTTCCATGAGCAATACTAGAAGTTACGAAAAAGTCTCTAG TTCTGAAAATTTTGAGGTTAGTGAGGGCAGAAATACTTGCAGAGATAATAACAGTAGCGATGATTCCAGTAGTAGCAACG TGGATAGTAATCTGCGCACCTGTGTTCCTGGTAAGGTCTATAGAAATCCGAGGATTATTGATGAATTCTTGGGTGCAGGA GAGTGTGAGAATTTAGCTTTACCAAATGGGGGTTTCGGCCTAGGATTTAAGAGATTGAGTTCTAACAATGGGTCTTCCAT TGCGTTTGGTCACTCTGGAATGGGTGGCTCCACAGGGTTTTGTGATGTCACTAACAGGTTTGCCATTGCTGTGACACTAA ACAAAATGTCCTTTGGTGGTGTATCGGCAAAAATTGTCCAACTTGTTTGTTCAGAGTTGCAAATTCCGGTACCTGACGAT TTCTTAAGGTTTATGGCTCAGCAAAGTGGACAGGATGAGCAGTTAAGTCTGGGGAGGCCTCTGATTAATTGA 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0198800.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGTGGGGAAACATTTACAGAAGACGTATTAGAGTATTCACCATGGCCTTAGCAATATACCTAGATTATAAGGGTGT ACAACAACGAGAGAAATGGACTAACAAATCTAGACAACCTGTACTGTGGGAGAAGGCTCATGAGCGCAATGCTAAGCGGG TTCTAAATTTGATACTAGAGATGGAAGGTTTGTGGGTGAAACTTGGGCAATATATGTCAACACGTGCAGATGTGCTTCCT GCAGCTTATATACGTCTTCTGAAGCAGTTACAGGACTCTCTTCCTCCTCGCCCCTTGGAAGAGGTCTATGGCACGATACA GAAAGAGTTGGGGAAATCAATGGATGAGCTATTTTCTGTTTTTATCAATGAACCTTTGGCAACAGCATCGATAGCTCAAG TCCACCGTGCAACTTTGCTCAATGGACAGGAGGTGGTTGTGAAAGTACAACATGATTCTGTCAAGACAGTCATATTGGAG GACTTAAAAAATGCAAAGTCTATTGTTGACTGGATTGCATGGGCTGAGCCACAATATAACTTCAATCCTATGATTGATGA ATGGTGCAAAGAAGCTCCCAAAGAACTTGACTTCAATCATGAAGCTGAAAATACTAGGACAGTGGCTAAAAATCTTGGCT GCAGAAACAAGTATGATGGAAATATTAGTTCCAATAGAGTGGATGTGTTGATCCCAGACGTAATTCAGTCTACAGAAAAA GTCCTTGTTTTAGAATACATGGATGGCATTCGGTTGAATGATTTAGACTCACTGGAAGCTTATGGAGTAAATAAACAAAA TATTGTTGAGGAGATTACTCGTGCCTATGCCCACCAAATATATGTTGATGGATTTTTCAATGGTGATCCTCATCCAGGAA ATTTTCTTGTAAGCAAGGAATCTCCACATCGTCCCATTTTACTTGACTTTGGGCTTACAAAGAAACTATCAACCACCATT AAGCAAGCACTTGCAAAGATGTTTCTGGCGTCAACTGAGGGGGACCATGTGGCCCTTCTCTCTGCCTTTGCTGAAATGGG GCTTAAGTTGCGTCTGGACATACCGGAGCAGGCAATGGAGGTAACGACTATATTCTTCCGTGAAACGACGCCAGCAAATG AATCCTACAAAACAATGCAATCTCTATCCGATCAAAGAACAAAAAATATGAAGGTTATACAGGAAAAAATGAACCTTGAC CAGAAAGAAATGAAACGCTTTAATCCCGTTGATGCATTTCCTGGTGATATTGTAATATTTGGAAGGGTTCTTAATCTTCT AAGAGGGCTTTCTTCTACCATGAACGTACACATAGTATATATGGACATAATGAGGCCGTTTGCAGAATCAGTTTTGAGTG GGTATATTAGTAGGGGACCATCAGTTAATGATAGATGGATTTTTGATTCACCAGTCCATTCCAATGTTGAAGCCAAGCTG AGGCAACTTTTAATAGAGCTGGCAAATAATGATAAAATACTTGGGATCCAGGTATGTGCCTACAAAGATGGAAAGGTTAT TATTGACACTTCTGCTGGAGTGCTCGGTAAATATGATCCCCGTCCAGTTACGCCCGATAGCCTTTTTCCAGTGTTCTCCG CTACAAAGGGTATCACAGCAGGAATGATGCATTGGCTGGTTGATAATGGAAAACTAAACCTTGAAGAGAATGTTGCAAAC ATTTGGCCAGGATTTGGATCAAATGGGAAAGATGTTATTAAGGTTCATCACGTGCTTAACCATACATCTGGTTTGCACAA TGCAATGGCAGACTTAAATCAAGAAAACCCTCTTCTGATGCTTGATTGGGATGAATGTTTGAAACGCATTTGCATGTCAG TACCTGAGACCGAGCCTGGCAAGGAGCAGATTTATCATTATTTGTCATTTGGTTGGTTGTGCGGTGGAATCATTGAGCAT GCCTCTGGTAAGAAATTTCAGGAGATTCTTGAAGAAGCAATAGTCCGTCCCCTACATATTGAAGGCGAGCTATATATAGG GATTCCCCCAGGGGTGGAAGCACGACTTGCAGCTCTGACTGTAGATACAGATGATTTAAGCAAGCTGTCAGCAATTCCTA CCCGTCCTGACCTTCCTTCCACCTTCCAACCGCAGCAAATAGCCCGATCAGCAACGACTCTGCCTGCTGTTTTCAACACA CTGCATGTTCGGCGTGCCATCATACCAGCTGCTAATGGACATTTATCTGCCCGGGCACTTGCACGCTATTATGCAGCCCT AGCTGATGGTGGTAAGATACCACCACCTCATTCTTCTGATTCTAAGCCAGTACTCGGAAGTCATCCGCACATCCCCAAAT TATCTTCTCAGAAGGCTCCCCAAAATAGGAAATGTTTTAGGCGGAAGGAAGCAACTTTACCTTCCATGAGCAATACTAGA AGTTACGAAAAAGTCTCTAGTTCTGAAAATTTTGAGGTTAGTGAGGGCAGAAATACTTGCAGAGATAATAACAGTAGCGA TGATTCCAGTAGTAGCAACGTGGATAGTAATCTGCGCACCTGTGTTCCTGGTAAGGTCTATAGAAATCCGAGGATTATTG ATGAATTCTTGGGTGCAGGAGAGTGTGAGAATTTAGCTTTACCAAATGGGGGTTTCGGCCTAGGATTTAAGAGATTGAGT TCTAACAATGGGTCTTCCATTGCGTTTGGTCACTCTGGAATGGGTGGCTCCACAGGGTTTTGTGATGTCACTAACAGGTT TGCCATTGCTGTGACACTAAACAAAATGTCCTTTGGTGGTGTATCGGCAAAAATTGTCCAACTTGTTTGTTCAGAGTTGC AAATTCCGGTACCTGACGATTTCTTAAGGTTTATGGCTCAGCAAAGTGGACAGGATGAGCAGTTAAGTCTGGGGAGGCCT CTGATTAATTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0198800.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGWGNIYRRRIRVFTMALAIYLDYKGVQQREKWTNKSRQPVLWEKAHERNAKRVLNLILEMEGLWVKLGQYMSTRADVLP AAYIRLLKQLQDSLPPRPLEEVYGTIQKELGKSMDELFSVFINEPLATASIAQVHRATLLNGQEVVVKVQHDSVKTVILE DLKNAKSIVDWIAWAEPQYNFNPMIDEWCKEAPKELDFNHEAENTRTVAKNLGCRNKYDGNISSNRVDVLIPDVIQSTEK VLVLEYMDGIRLNDLDSLEAYGVNKQNIVEEITRAYAHQIYVDGFFNGDPHPGNFLVSKESPHRPILLDFGLTKKLSTTI KQALAKMFLASTEGDHVALLSAFAEMGLKLRLDIPEQAMEVTTIFFRETTPANESYKTMQSLSDQRTKNMKVIQEKMNLD QKEMKRFNPVDAFPGDIVIFGRVLNLLRGLSSTMNVHIVYMDIMRPFAESVLSGYISRGPSVNDRWIFDSPVHSNVEAKL RQLLIELANNDKILGIQVCAYKDGKVIIDTSAGVLGKYDPRPVTPDSLFPVFSATKGITAGMMHWLVDNGKLNLEENVAN IWPGFGSNGKDVIKVHHVLNHTSGLHNAMADLNQENPLLMLDWDECLKRICMSVPETEPGKEQIYHYLSFGWLCGGIIEH ASGKKFQEILEEAIVRPLHIEGELYIGIPPGVEARLAALTVDTDDLSKLSAIPTRPDLPSTFQPQQIARSATTLPAVFNT LHVRRAIIPAANGHLSARALARYYAALADGGKIPPPHSSDSKPVLGSHPHIPKLSSQKAPQNRKCFRRKEATLPSMSNTR SYEKVSSSENFEVSEGRNTCRDNNSSDDSSSSNVDSNLRTCVPGKVYRNPRIIDEFLGAGECENLALPNGGFGLGFKRLS SNNGSSIAFGHSGMGGSTGFCDVTNRFAIAVTLNKMSFGGVSAKIVQLVCSELQIPVPDDFLRFMAQQSGQDEQLSLGRP LIN 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 9 825 817 0.0
PANTHER 9 825 817 0.0
CDD 89 343 255 3.6703E-89
SUPERFAMILY 91 313 223 6.13E-20
Pfam 108 212 105 2.2E-28
Pfam 241 301 61 1.9E-4
Gene3D 475 789 315 4.2E-76
SUPERFAMILY 475 758 284 6.28E-53
Pfam 483 757 275 2.7E-43
MobiDBLite 754 836 83 -
MobiDBLite 792 836 45 -
Gene3D 851 934 84 4.7E-7

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0198800.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…