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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0199000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0199000.1 |
| Related isoforms 9 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transcriptional corepressor LEUNIG; TAIR: AT2G32700.1 LEUNIG-like protein; Swiss-Prot: sp|O48847|LUH_ARATH Transcriptional corepressor LEUNIG_HOMOLOG; TrEMBL-Plants: tr|I1LA80|I1LA80_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0199000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:42118110..42136073) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCGGGACTGAACTGAAGCTCGCTAATGTCCGAACCTGAACCTCCTCAGCTTCGGTTGATCGAGGAGCCTGAGCTTCGGAA CCTCATTCATTCAAACTCACCCATCCTCCACCTTCCACTGTTGTAAACCTCTTGAACTAGTTCAAACTCTCTTGTCTTTC CTTGCTCAAACTCTCCATAATTACCTTCCTTTCTCATCACTCACGATCTTTCTTCCAGCGATCAGTGACAACAGGTGCGA AATTTCTATAATTGGCTTCAACGGCTCTGTCTTTTTCAGCGAGAATCGGTTATTCGTGGTTTGTGATCCGCGATTTTTCT TCCGTGGTGGACTGGTCGTTGCTACATGCATCCATCACCGGATTGCTAATGTAGCAGTTTGATCTAGCTATTTGTTGCGT TTCGAGGTTGATCGTGCATTCTGTTGCTCTATGATATGATCAGTTTTATTTTGAGAATTTGTTGAATTCACTTGTTTGAT ATATTGTTGAATTTCGTGCTTTGCTGCAGTTAATTTTGCTTCTGATCTGGAAACTATGGCGCAGAGTAATTGGGAAGCAG ATAAGATGTAAGTAGATGAATTTATGTTTGATTGATGAGTGTAGGTGTAGTGTAGCCAATCCCAATTAATGGTATTTTTT GTTGTTTACTTCAAGTTTCCACTCAGTGTGTCTTCTTTTGCTTCTGCCTGCTAGGCTTGATGTTTACATTTATGATTATT TGGTGAAGAAAAAGTTGCACAATACTGCCAAGTCATTCATGACAGAAGGGAAGGTTTCTCCCGATCCAGTAGGTGAGAGT TCGTTAATATTGTTGTTTAATGCTCTTTAATATTGATCTCCTGATTTTGTTATTCATGACAGAAGGGAAGGTTTCTCCCG AACCAGTAGGTGAGAGTTCGTTAATATGTAGTTTTTAAATTGTCTTTCACATTGATATCCTGATTTTGTTATTTTATTAA 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CGTTTCCAAATTTGCTTCTTGATATCCTCTTGTTTCCAAATTTGCTTCTTGATATCTTTCTTGATTCCTCGATCTCTTTC CCTCAGATATGTTCTTGAGAAGTTCTTCAATATTCAAAGTAGAAAATGATTTAGATAAGAGGTTTGATCTTGTGAAACAA AAGTTTTCAATTTTCAAGGATTTGGGATGGGATTCTTGAAAATCACAAAGGGGCTAGGGTGTATTCTTGTTTTGAATAGC TTAGTTAGTTATGCTACTCTGTCAGTGTGATTAGGGTATTTTGAGCATACGATTTCCCGCCGAATCCAAAGATCCAAGTC CATTTCAACTACCAATCATGGTAAGGGCACTTCGACTTCGGCCTAGAGATCTTGATTGTGTTTGGTATGTATGATTGTGA AATGTTATGGATCTATATGATAGACGAACTTGCTAGTAGGGGAACTTCGGTCTAGAGGTCTTGATTGTGGTTGTTTATTG ATGTTATATGATCATGATATATGTATATGGTAGTAAGATGTTATTATGAACATACCTTATATGATACGTGATACGCAATC CGCAAGTGTGTGGTACGCTCGAAGTAAGTCGGACCAAAGGGATTGTGGGAATCACCGATTCAAAAAATGTAAGAGTTGTT TAGAGCACAAGAAAGTAAAAGATAATATAAATTTGGTTAGGAAA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0199000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGCAGAGTAATTGGGAAGCAGATAAGATGCTTGATGTTTACATTTATGATTATTTGGTGAAGAAAAAGTTGCACAA TACTGCCAAGTCATTCATGACAGAAGGGAAGGTTTCTCCCGATCCAGTAGCAATTGATGCTCCCGGTGGTTTTCTCTTTG AGTGGTGGTCTGTTTTCTGGGATATTTTTATTGCAAGGACAAATGAGAAACATTCTGAGACTGCTGCAGCATATTTAGAG GCTCAACAGATTAAAGTGAAAGAACAACAACAATTGCAAATGCAGCAGATGCAACTAATGCGTCAAGCACAATTACAAAG AAGGGATTCTAATCATTCTTCCCTTGGAGGTCCTGTAAATGCTATCACAACAGAAGGAGTGCTCGGGCAATCTACTGCAA GTGCTTTGGCTGCAAAAATGTATGAGGAGCGGATGAAGCACTCTAACCCCATGGATACAGAGACATCCCAACCACTTCTA GATGCTAGAATGACACTTTTGAAACCAACAAACCATCCTAGTCAAATGGTTCAAGGAAATTCAGGAAGTGTGACAGCAGC TTTGCAGCAAATCCAGGCTCGATCTCAGCAAACCCCTCAGGAGATCAAAAGTGAAGTCCACATGGGCACCATGCAGAGAT CCTTGCCTATGGACCATTCTTCAATTTATGGGCAGGGAGGAGTGCAGTCAAAGCCTGGAATCACAAATGCAGGATTAAAT CCCGGAGTTGGTGGTCTCACATTGAAGGGATGGCCTTTAACTGGCATAGATCAAATTCGTCCTGGCTATGGAGCACAAGT TCAAAAGCCTCTCCTTCAGAATGCAAATCAGTTTCAGCTTTTGCCACAACAACAACAACAGATCCTTGCCCAGGCACAAG GAAATATAGACAATTCCTTGATGTATGGAGATATGGATCCACAGAGATTAAGGGGATTGGCTAGGGGAAGTTTGAATGTG AAAGATGGTCAACCAATTACAAATGATGGATCAATAGGATCTCCAATGCAATCCACATCATCTAAGATCAACATGCCGCA AATCCAACAAACCACTTCCCAGCAACAACAAGATCCTTTGCATCCACAGCAACTGGTGCAGAATTACCGAAAAAGGAAAG GACCTACATCTTCAGGAGCTGCCAACAGTACTGGTACAGGAAATACACACGGCCCTTCTAATTCTCAACCATCGACTCCT TCTACTCATACTCCTGGGGATGGAGTAGCTATGGCGGGTAACTTGCAGAATGTCACTGGTGTATCCAAAGGATTGATGAT GTATGGTACTGAAGGAACTGGTGGTCTTACATCTTCCACAAACCAGCTGTTGCAGGATGACATGGAACATTTTGGAGATG TTGGCTCCTTAGATGATAATGTGGAATCATTTCTCTCACAGGATGATGGTGATGGAAGGGACTTATTTGGCACGTTGAAA CGTAACCCTTCTGAGCATGCTACAGATGCTTCAAAAGCCTTTTCCTTTAGTGAAGTTGGTTCTATACGCAAAAGCAACAG CAAAGTTGTTTGCTGTCATTTCTCTTCAGATGGGAAATTATTAGCTAGTGCTGGACATGACCAGAAGGTTGTTCTGTGGA ACATGGAAACACTGCAAACAGAGAGCACACCAGATGCACACTCTCTTATTATTACTGATGTTCGTTTCAGACCGAATTCA ACTCAACTGGCAACGTCTTCATTTGATACTACTTTGCGGCTTTGGGATGCTGCAGATCCTAGCTTTTCTTTGCAGACATA TAGTGGTCATACTTCACATGTGGTGTCCCTTGATTTCCACCCAAAGAAAAATGACTTTTTCTGTTCGTGTGATGATAACA ATGAGATTCGCTACTGGAATATTAATCAATGTTCCAGCACTCATGCTTTTAAGGGAGGATCTACCCATGTAAGGTTTCAA CCAAGGACTGGACACCTTCTGGCTGCAGCATCTGGCAGTGTTGTGTCTCTCTTTGATGTTGAGACTGACAGGAAGATGCA CACATTACAGGGACACTCTGCAGAGGTACATTGTATATGTTGGGATACAAATGGAGATTTCTTGGCATCTTTGAGTCAAG ATTCTGTCAAAGTGTGGTCACTTGCTACTGGGGATTGCATTCATGAACTTAATTCCAGTGGAAACATGTTTCATTCTTGC GTGTTTCACCCAAGCTACTCTACACTCTTGGTTGTTGGAGGATACCAGTCACTGGAGCTGTGGAATATGGCCGAGAATAA ATGTATGACAATACCAGCTCATGAGTGTGTAATATCGTCTCTAGCACAATCACCACTGACAGGGATGGTGGCTTCTACCA GTCACGATAAATCAGTAAAAATTTGGAAATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0199000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAQSNWEADKMLDVYIYDYLVKKKLHNTAKSFMTEGKVSPDPVAIDAPGGFLFEWWSVFWDIFIARTNEKHSETAAAYLE AQQIKVKEQQQLQMQQMQLMRQAQLQRRDSNHSSLGGPVNAITTEGVLGQSTASALAAKMYEERMKHSNPMDTETSQPLL DARMTLLKPTNHPSQMVQGNSGSVTAALQQIQARSQQTPQEIKSEVHMGTMQRSLPMDHSSIYGQGGVQSKPGITNAGLN PGVGGLTLKGWPLTGIDQIRPGYGAQVQKPLLQNANQFQLLPQQQQQILAQAQGNIDNSLMYGDMDPQRLRGLARGSLNV KDGQPITNDGSIGSPMQSTSSKINMPQIQQTTSQQQQDPLHPQQLVQNYRKRKGPTSSGAANSTGTGNTHGPSNSQPSTP STHTPGDGVAMAGNLQNVTGVSKGLMMYGTEGTGGLTSSTNQLLQDDMEHFGDVGSLDDNVESFLSQDDGDGRDLFGTLK RNPSEHATDASKAFSFSEVGSIRKSNSKVVCCHFSSDGKLLASAGHDQKVVLWNMETLQTESTPDAHSLIITDVRFRPNS TQLATSSFDTTLRLWDAADPSFSLQTYSGHTSHVVSLDFHPKKNDFFCSCDDNNEIRYWNINQCSSTHAFKGGSTHVRFQ PRTGHLLAAASGSVVSLFDVETDRKMHTLQGHSAEVHCICWDTNGDFLASLSQDSVKVWSLATGDCIHELNSSGNMFHSC VFHPSYSTLLVVGGYQSLELWNMAENKCMTIPAHECVISSLAQSPLTGMVASTSHDKSVKIWK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 783 | 783 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 783 | 783 | 0.0 | – | |
| SMART | 8 | 40 | 33 | 2.0E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 8 | 40 | 33 | 9.822 | ||
| Pfam | 10 | 36 | 27 | 1.3E-7 | ||
| MobiDBLite | 317 | 413 | 97 | - | – | |
| MobiDBLite | 321 | 405 | 85 | - | – | |
| Gene3D | 480 | 633 | 154 | 2.4E-32 | ||
| SUPERFAMILY | 495 | 783 | 289 | 1.85E-62 | ||
| SMART | 495 | 534 | 40 | 5.5E-6 | ||
| CDD | 498 | 783 | 286 | 4.44109E-65 | – | |
| ProSiteProfiles | 502 | 543 | 42 | 11.411 | ||
| ProSiteProfiles | 502 | 783 | 282 | 40.471 | ||
| Pfam | 507 | 534 | 28 | 5.6E-4 | ||
| ProSitePatterns | 521 | 535 | 15 | - | ||
| PRINTS | 521 | 535 | 15 | 4.5E-5 | ||
| SMART | 537 | 576 | 40 | 3.7E-6 | ||
| Pfam | 542 | 576 | 35 | 8.5E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 544 | 576 | 33 | 12.614 | ||
| ProSitePatterns | 563 | 577 | 15 | - | ||
| PRINTS | 563 | 577 | 15 | 4.5E-5 | ||
| SMART | 580 | 620 | 41 | 4.9E-5 | ||
| Pfam | 584 | 620 | 37 | 0.0034 | ||
| ProSiteProfiles | 587 | 629 | 43 | 10.809 | ||
| SMART | 621 | 659 | 39 | 72.0 | ||
| Gene3D | 634 | 783 | 150 | 1.5E-30 | ||
| SMART | 662 | 700 | 39 | 4.7E-8 | ||
| Pfam | 665 | 700 | 36 | 6.4E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 669 | 709 | 41 | 9.272 | ||
| SMART | 703 | 742 | 40 | 1.1 | ||
| SMART | 744 | 783 | 40 | 2.4E-4 | ||
| Pfam | 749 | 783 | 35 | 0.017 | ||
| ProSiteProfiles | 751 | 783 | 33 | 12.012 | ||
| PRINTS | 770 | 783 | 14 | 4.5E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0199000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…