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LotjaGi1g1v0265900.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0265900
Transcript ID LotjaGi1g1v0265900.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein translocase subunit SecA; TAIR: AT1G21650.2 Preprotein translocase SecA family protein; Swiss-Prot: sp|D8WUA4|SECA2_ARATH Protein translocase subunit SECA2, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|K7KUK2|K7KUK2_SOYBN Protein translocase subunit SecA; Found in the gene: LotjaGi1g1v0265900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:64962558..64985717) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GAATTTTTAAAAAAATATGGGGTGACATTTCTAATGTTTGAGGTGGCAAATCCAAGCCCCGAATCATAACTCTACTTTTT CCCATGAAAAATTGATTAATGAGGAATCATTTTCTATAGACAATGCTGACTCTTTTCAAGGAGGCTGTTGGTTTGGATTG AAGTTCAGAACTCACATTCAAGACAACCGAACCCAGCTTAGCCATCGTTGGTATGCTAAGCTGCACCAACCACCCTTCCT TCATGGCAGCGCTCTCATTCCCACCACCCTTCTTCGCCGTTCAGACAACCGCTTCGACTTCAACTTCAAGCTCAACTCAC GCCAACTCCTTCTTCATTCGACCCTCTCATCCCCTTCCTCCCTGGCCTCGCTTGCGACGCCGCCGTCGCGCTCCCTTATT CGTCGCCGCCGCTTCCGTGAAGGTGCGTTCGCGCTCGTGCCTGTTAACTGTTCGACGAAATGCCTGCGTGTGTGTGAATG ATTGACTCTCTTGGTTGCAGGAAAATCTCGGTCGCGCTCGAAAGACTCTCACTGACTTCACAATCTTGAACTACTGGGTC GTTCGTGACTACTACCGCCTTGTTAGCTCCGTCAACGCCTTCGAGCCGCGGATTCAGTTGCTGTCGGATGAAGAGCTGGC CGCTAAAACCCCGGAGTTTCGCCGCCGGCTCGAGCGAGGGGAGACCCTTGCGGATATCCAAGCTGGTTGGTTCGCTGTTT TTTTCACTCTGCTGCGTCGTTGTTTGGTTAATCTTTGTGTGAACTGTGTTTTTTGATGGAATGCTGTGATGAATTTTGCA GAGGCGTTTGCTGTTGTTCGTGAAGCTGCGAGAAGAAAGCTTGGAATGCGCCATTTTGATGTTCAGGTTTCACTCTTTCA CCATCTTGCATATGTGTAGCTATACGATAATGAATTTTGACGCTGATTTCCATTACACCACGGGTAATGATATATACACA 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AATCAAACTTATAAGTCAACCCATCCTTTGGCACCAGAACTAGAGTACAGTTTTTACAGATATTTTTCGGTTGAGAAAAG AAATTCAGAAAATCACTTTTAAAAAAAACCCCCCTTGGCAATATTCCACAACCTTGAAAACAGCCATGGTAAAACCTTCA GGACTAAGTGCTTTACCCTTACTGAATTCCCAGACAGCTCTCTAAATTTCTTCCTCTTAGAAGGTCTCTAATCAAACAGC CTTGTCATCTGAAGTCGGGCACCAATCCAAACCCTCCTTAAAAGGTCTACTACAGTTCTCTTCCAAAAAAAGATTAAAGC AGAAATGGGTAACTTAATCTTAAGGTCTACCTCAAATCTTATACAATAGTCGTGTGATTAAACTTATAAGAGTAATACTC TTTTTCATGGTCTAGAATACCACCACTCTATTAAGAATTTAACTCAGACTTTATCTTGAAATTTGTGAATAATCTCTATT AACTAATTTGCTGCTGTATTTATTATGTAATCAGGTGCAACGGAAGCATGTTTATGATCTAAGGCAGTTAATCTTAACCG GAGATGATGAAAGCTGTTCTCAACACATATTTCAGTGAGTGCCTTTAGATTTGTACTGATTAGGTCTAATCTAGGAGATG GTTCCTCTTGTAATTAAAACTGCACATAGTATAAATATCAACCTCTGGATTAATTCAACAACCGTCTTCTAAATCTATAA TGCCCACTCTCATATGCCTATCCTATCTGACAATATCTTTCATGTATGATGAATCATGTTCTGTTAAGGAGTTCAATTAA GTTCTTGTGTCATTGATACATTCCACAGGCTGTATTGGGCACCTTATTTTTGTCAAGTTCTGAGCTTTAGGGCATTTTAG TCTTATATTATTGTTCAAAATTGTGATTAAATTCATGCAAGGAAGCATCATACTTGCATCTTTCAGACTGGATATCTATT GAGTCCACCATTTCTTTGGATCATGAACGATTTCAGTTCTTAACATGAATCATAGTTCCGACGTAGAAATTGTTCTTTCT TTTCTATCCGTTTATTTTAGAACCAGCCTAATCCTTAGTTTCCGCTAATCAGTAAAAATCCCAAGTCTTAACGCTAGGCC CTAATGTTCTTCCATATGTCCTATACTATTAACAGTCTTTATTGTATGATATACATTACTACGTGGCCGTCAATATGGCT AAATAGGCATTATAAAATGTGGATGGGAATATCACCTAAAGTACTTCTCGATGGTATGAGATACATAGGCATGTGCAATG TTAGCTATTTCTTTCTTTTTATAATAGTATTTATCTTTTATACCATAAAAAAAGAGAGAGAAACTAGTTATAATGATCCA GACCTGAAGGCCGTTTGTCTAGACAAGTAGGCTGAATCAGCTGGGGGCAGGGGGGGGGGGACTTTATACTCTCAGATTTT TGACTGTCAAGAACTGGATAAAAGCTCTGGTTACACATTAGAGCCCCATATAATTGGAAACTTTCAAGACATTGCAACTC GAAGATGACTTTGGTTGCCACATATTGGCATCTTGTGGAGAGTGAAGATTATAAATTGATGTGTGCCTAACATGTGGATA CGGAAATGCTTAATTTCATGCTCATTCTATTTTTCTTCTCATGCGTTTCTTGGTTACATTTTAGCATGAAATAATGCACA ACCATTATAGAATTTTATTAAAAACAAGTAGCAATATGTTGAGAAAAAGAGAAAAGAGAAGTATATGCTGAAAACCCTGT GTCTCAACCACAACAGACTCAATATTAAATATTGAAGGTAATGAATACAAAAACAAATTTTCCAATTACTATTTTGACAT GATACATTGAACCTAGACATTTACATAGTAATACACATTTTAGAACCTAATATTTACTCTTATCTATGTGCAACTATAAT TAGGTTAGAGTACTCAGTTTTGGTCCACTTTTCATGATATAGGTGAATTCTTATGTAATTATACTTATATTTCCTCTTCT ACTGCTCATTCCTTTTTATATTTGCATGTACTGCTCATAGGTACATGCAAGCAGTTGTGGATGAGATTGTCTTCAGTAAT ACTGATCCGTTGAAGGTGGTTCATTCCCTCTGGCATGTATATTTCCTCTATGCACAAATTCCTTTTATTTATTGCTTTTG AATTGATTTTGTAGCATCCACGTAGCTGGGGTTTGAATAATCTCTCGAGAGAGTTTATGACAATTGGTGGCAAGCTGTTG CATGGTAGGCTCATTGGCAATAACTGCGGTCCTTCCATTCCATCTCCACAGTTATTTGATTCTCTTCATTTTCTGTTTTT GCTCAGTCAACTTATGTAATCATTATTAATATGCTCAAATGGCTTCTAGCAGAATCATTTGGAGTGATTAGTGATGACAC TTTACTAAATTCACTTGGGCAACTGAGTGAAGTGAGTTCAGTTGATATTGTCAACTTCTCCCTTCCAAATTTGCCAGCAC CTCCAAATGCTTTCAGGGGTATTCGCAGGAAGAGCTCTTCATTGAGACGATGGCTTGCTATTTGCACTGATGATTTAATT GAGTGAGCTTGTTTGTTTTTTTGACGGTAGAGTGAGTTTGTTATTTTACTGTAGATATACGAAATTTAATAGAGTTCTAA TTAACTATATGTCTAATACAGGAATGGGAAGTATCAAACAACTTCTAATCTCCTTCGCAAGTATCTTGGAGATTTTCTAA TAGCTTCCTATTTAAATGTTGTTGAAGAGTCTGGTTATGATGAGAGATATGTAAAGGAAATTGAGGTCAGATATTCTTTT TAACTGTTTTTTTTCTTAAATGAAAATTTTGGTTGCCATTTTTCGATGCAGATAATAGCTGCAGGCCTACAGCACTATGC TAATATCAAATGTTAATCGTGTCTTGTCACACTAAATTTGCATCCAGGAATTTTAAATCAAGTACAAAAAGTATACCTTA TTGGTTTCCACTTTCCAGGGTTGGATTGTGTAATCAGTTGCAATAAGGCATTGTACTTCTTGCCAAGTCAAATTCTGGAA TCATTAATGATTTCATAGATTTATTTTAGAATCAACTAGTTTCTAAATTTCAGTAATAATAGTAAACGAATTATTGATTT ACATGTCTATCACATTCACGTCATAGCATGTTGATATAATGACCTGGGAAGGATATAAAAAGAGCCTACTTGAAGTTAAG AGGAAATGGAAGGGAGTGTGTTTACACCATTTGCAGCATTATTATTATGTACTCAAATTTTTTCCCAGAATATTCACATT CACACATGATGCATTAATATTAAGTCTTTAGTTTAGGAAGAGGAAAAACGAATATAAAGAATATTGATATAATAAATTGG ATGCAATCTTACAAAAGACAAATCACCCACCCTTATTTATAGTAATGTGTAGACTCCTAATTCTAATTAAACATGGAACT AATTAAGACTCCTAATCCTAATTAAATAAAAAGCAAATAAATATAAATAAGGAAATAAAGAAACCAATCCTAAGGCATAA TCTAATTACCTTAAATTACTCTAAAGTCTAAAGATATCATCAAGATGTAATACATTATCTTTCTATATTTTAACACCCCT CTAAAATATTAAAGGTATTTTAAGATTTTTTTTATATTCTAGCAACACAATGAAAATTAGACAGCTGACGATCACTTGGT GATATTGGCTTTACTAAGTTATGATCTAAACTCTTTAATTTGGGGAAAATGATACTACAATGGTAGCTAAAATGTCTCTG CCTTCTCTTAAAAGTAGAAATAGAAGGCTTTTTGCTATGGGAATTCTTCTCTCCCTCTATTGATTTAAGAGGATTTGGAT ATGAACGTGGGGCTCTTTCATTTGCTTATTTGGAGAACTTTTGTTGTATATTTTCCAAAGAGCACTGCTATACAGTGCGA ATGAAAGCATGTAAGAAAGCACCGAAACTTTTAATTGACCAATCAAAAGTCTTGGAGAAGAAAAAACCACTTAGAAATCA CGGATGTAGTCACGTACCTATTCTTACTTTTCATCGAAGACAATTTTGTAACATTAAGCATAATTGGTAAACTATGGATT GGAACCAAGCATATGCATAGGGAGATTGTGGATTTCTGTTGTATGTTTTTGCTCACTGCATTTTAATTGCTTCTTGTTCA TGAATTTCTTGGAAATTTTAAGCTTCCCTCTCTCTTTTTTGTTAAGTGAGTATTTATTTTATTTTGTGAAATACAGAGAG CTGTTCTTTTGAAAACTTTGGATTGTTTCTGGAGAGATCATCTTGTAAACATGAATAGGCTCAGCTCTGCGGTAATTTTT CCTCTTTGCTCTGATTAATCTTTTTGGCGTTCTTAACAGCTAATGACATATCTTGAGTTGTGGCAGGTTAATGTTAGGAG CTTCGGCCATAGAAATCCTCTGGAAGAGTATAAAATTGATGGTTGTCGGTTTTTCATCTCAATGCTCAGTGCAACTCGAA GGTTAACTGTGGAAGCACTCTTGCGACACTGGACATCTCCGATTGAATCCCAAGAACTATTTTTATAATAACCGTTCCAT GGTTCTTAGATTAAAGATAGATAATTTAAGCAGAAGAATTTCCAACTTCCCCCAAGGACTAATAAGAAGGCGAATTCTGC AAGGCTAATTTTCTGTACAATGTTCTTGCCTTCTTGGTGTTTCAATTAGTCAATAGGATGCCTGGTGTAGATATCATAAA ATGGGGGACTGTAGATTGGTTTTAGCTAGGACTCAGGGTTGCTTTATCTCCCAGTTCTACCCTTTTTTTTTCTGGTTTGT CGAACTCACAGGAAAGATTCATGTAGATGGCCACAAAAGTAATTTATCATATGAGCATCCTTTAAAAGAGGTAACGCTTC AATAAATTTTGCACTATTACCTTCAAACTGAGGCATGGAAAATGTTTTTAAGGTGAGTTTTTTGTTTGTTTTACTTTATA ACAGGGAGCAATCAAAGGGACAGATCCTATTTATTCCAGTCCTTTTGCTTGGATCACATGATTTTTGTTGCTTGATTGAA TTGCAGTTAACCTGTTCATGGTTCCTAGTACTTACAAGAGGTTTAGCAAGAGATGTGCTAGCAAATGTCCTTTCTGTTCT TTTGGGTCTTCTGAAACAATAAGCCAACTTTTCTAGCACAGTTTCTGGGCATTGATCTGATAATGGAGTTGAGGGCCATA AGGAAAGTCATAGTTGCTCATGTATTCTCAGGCTTGAATGTAATTTTAAATTTTGTCAGTGTTGCTATAAATACAGCATG TAAAATATGAAGCATGTTTGAATTGTATATAATGAATTGCAATTGCAGTAATACGAAGGAACTCATGGGGATTGTTTGGT AGCTGCTAGAAGGAAAACACCATTAAAAGAGAGTGAAATTTGCTATATATGCTTGTCAAATTAAGTTTCAATTAATCTGA ATTATTGCAAATAAGAGCCCATTTGGATACGGAGTTTAGCAATTATTAAAAGCATTGAATAAGCTTCAATAAGTTCTATT TAGTATTTAATCCGCATCCAAACAACCTCTAAACTCATTAAAGACATAAAACTCTTCGAGCACCTATTTTTCTCTTCAAG CTTCTACTTTTTTTTTTATTATAAACTCGAACTCGAGAAGTTATTTGTGAAAAAACTGAACTCTTTTTCGCTTGGTAGAA TTTTAATTGAAATAAGAGCAAATTTATTTCAAAACTACTTCATCCTATAATTAAAGTTAAATACTTAAAGACATATTAAT AGAAAATAACAAAATTGAATGATAAATATCATAAAGAACATGGAGATTCTTAACCTATAAAAGGAGATACTTTTTTAATT AACTCTTTAATTTCAAAGATGCAAAAAGTTTGATAAAGAT 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0265900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCTAAGCTGCACCAACCACCCTTCCTTCATGGCAGCGCTCTCATTCCCACCACCCTTCTTCGCCGTTCAGACAACCGC TTCGACTTCAACTTCAAGCTCAACTCACGCCAACTCCTTCTTCATTCGACCCTCTCATCCCCTTCCTCCCTGGCCTCGCT TGCGACGCCGCCGTCGCGCTCCCTTATTCGTCGCCGCCGCTTCCGTGAAGGAAAATCTCGGTCGCGCTCGAAAGACTCTC ACTGACTTCACAATCTTGAACTACTGGGTCGTTCGTGACTACTACCGCCTTGTTAGCTCCGTCAACGCCTTCGAGCCGCG GATTCAGTTGCTGTCGGATGAAGAGCTGGCCGCTAAAACCCCGGAGTTTCGCCGCCGGCTCGAGCGAGGGGAGACCCTTG CGGATATCCAAGCTGAGGCGTTTGCTGTTGTTCGTGAAGCTGCGAGAAGAAAGCTTGGAATGCGCCATTTTGATGTTCAG ATTATTGGGGGAGCTGTGCTGCATGATGGGTCCATTGCTGAGATGAAAACAGGGGAGGGAAAAACCTTGGTTTCCACACT GGCAGCATATCTTAATGCCCTGACCGCTGAGGGTGTACATATTGTAACTGTCAATGATTATTTAGCTCAACGGGATGCTG AATGGATGGGGCGTGTTCACCGTTTCTTAGGTCTTTCTGTTGGTCTTATTCAGAGGGGGATGAATGCTGAAGAACGGAGG CGCAACTATAGATGCGATATAACATATACCAATAATTCGGAGCTTGGCTTTGATTACTTGCGAGATAATCTTGCTGGAAA TCGTGAACAGCTTGTGATGAGATGGCCAAAGCCGTTTCATTTTGCAATTGTTGATGAGGTGGATTCTGTCCTGATAGATG AGGGAAGAAATCCTCTGTTAATCAGTGGTGAGGCTAATCAAGATGCTGCACGATATCCTGTTGCTGCAAAAGTGGCTGAA CTGCTTATACAGGAGACTCATTACAAAGTGGAGCTTAAGGATAATTCAGTGGAGCTGACTGAGGAAGGAATCACTCTTGC TGAAATGGCTCTTGAAACTAGTGACCTTTGGGATGAAAATGATCCCTGGGCTAGATTTGTGATGAATGCTTTAAAAGCTA AGGAATTCTATCGCCGAGATGTGCAATACATTGTCAGAGATGGAAAGGCTTTAATTATCAATGAGCTGACAGGAAGAGTT GAAGAGAAAAGGAGATGGTCCGAGGGAATTCACCAGGCTGTGGAGGCAAAGGAAGGTTTGAAGATTCAGGCAGATTCTGT TGTTGTGGCACAGATCACATACCAGTCATTGTTCAAGCTCTATCCTAAATTGTCAGGAATGACCGGAACTGCAAAAACAG AAGAGAAAGAGTTCTTGAAAATGTTCCAGATGCCAGTCATTGAAGTGCCCACAAATCTTCCTAATATTCGGAAAGATTTG CCTATTCAAGCATTTGCTACTCTTCGTGGGAAATGGGAGCAAGTTCGTCAAGAAGTTGAATATATGTTCAGACAAGGTCG TCCTGTCTTAGTTGGGACAACTAGTGTAGAAAATTCTGAACTTTTGGCTGGTTTGCTTAGGGAATGGAATATTCCCTATA ATGTTCTGAATGCTCGACCGAAGTATGCTGCAAGAGAAGCTGAAATTGTTGCACAGGCAGGGCGGAAACATGCCATTACC CTTTCTACTAATATGGCAGGCAGGGGAACAGATATAATCCTTGGAGGAAATCCAAAAATGCTTGCCAGAGAAATTATAGA GGATAGCATACTTCCATTTTTGACGCGAGAGGATCCAAATCTTGAACTTGCTGGTGAGGCTATTTCAGAAAAGGTTCTTC CAAAGATTAAAGTTGGACCATCATCATTAGCCTTACTCGCTAAGACAGCCTTAATGGCGAAATATGTATCCAAAAGTGAG GGTAAAAGCTGGACATATCAGAAGGCTAAATCTTTTATCTCGGATGCTGTTGAAACGAGTCTTTCATTTAGTTTGAAAGA GCTGGAGGAGCTTGCTAATGAAGAATCTGAGGTTTACCCTCTTGGTCCAACAGTAGCACTTGCCTATCTCTCAGTTTTGA AGGATTGTGAAGAACATTGTTTACGGGAAGGATCTGAGGTAAAAAGGCTTGGCGGCCTTCATGTGATTGGTACATCTTTA CACGAGTCCCGGAGAATAGACAACCAGCTTCGGGGCAGAGCAGGAAGGCAGGGCGATCCAGGATCAACACGATTTATGGT CAGCTTGCAGGATGAGATGTTCCGAAAGTTCAATTTTGATACTGAATGGGCTGTGAGACTTATCTCAAAGATCACTAATG ATGAGGATCTGCCAATAGAGGGTGATGCCATTGTAAAACAGCTCTTAGCATTGCAAATCAACGCAGAGAAGTTCTTTTTC GGTATAAGAAAGAACCTTGTTGAGTTTGATGAAGTATTGGAGGTGCAACGGAAGCATGTTTATGATCTAAGGCAGTTAAT CTTAACCGGAGATGATGAAAGCTGTTCTCAACACATATTTCAGTACATGCAAGCAGTTGTGGATGAGATTGTCTTCAGTA ATACTGATCCGTTGAAGCATCCACGTAGCTGGGGTTTGAATAATCTCTCGAGAGAGTTTATGACAATTGGTGGCAAGCTG TTGCATGAATCATTTGGAGTGATTAGTGATGACACTTTACTAAATTCACTTGGGCAACTGAGTGAAGTGAGTTCAGTTGA TATTGTCAACTTCTCCCTTCCAAATTTGCCAGCACCTCCAAATGCTTTCAGGGGTATTCGCAGGAAGAGCTCTTCATTGA GACGATGGCTTGCTATTTGCACTGATGATTTAATTGAGAATGGGAAGTATCAAACAACTTCTAATCTCCTTCGCAAGTAT CTTGGAGATTTTCTAATAGCTTCCTATTTAAATGTTGTTGAAGAGTCTGGTTATGATGAGAGATATGTAAAGGAAATTGA GAGAGCTGTTCTTTTGAAAACTTTGGATTGTTTCTGGAGAGATCATCTTGTAAACATGAATAGGCTCAGCTCTGCGGTTA ATGTTAGGAGCTTCGGCCATAGAAATCCTCTGGAAGAGTATAAAATTGATGGTTGTCGGTTTTTCATCTCAATGCTCAGT GCAACTCGAAGGTTAACTGTGGAAGCACTCTTGCGACACTGGACATCTCCGATTGAATCCCAAGAACTATTTTTATAA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0265900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLSCTNHPSFMAALSFPPPFFAVQTTASTSTSSSTHANSFFIRPSHPLPPWPRLRRRRRAPLFVAAASVKENLGRARKTL TDFTILNYWVVRDYYRLVSSVNAFEPRIQLLSDEELAAKTPEFRRRLERGETLADIQAEAFAVVREAARRKLGMRHFDVQ IIGGAVLHDGSIAEMKTGEGKTLVSTLAAYLNALTAEGVHIVTVNDYLAQRDAEWMGRVHRFLGLSVGLIQRGMNAEERR RNYRCDITYTNNSELGFDYLRDNLAGNREQLVMRWPKPFHFAIVDEVDSVLIDEGRNPLLISGEANQDAARYPVAAKVAE LLIQETHYKVELKDNSVELTEEGITLAEMALETSDLWDENDPWARFVMNALKAKEFYRRDVQYIVRDGKALIINELTGRV EEKRRWSEGIHQAVEAKEGLKIQADSVVVAQITYQSLFKLYPKLSGMTGTAKTEEKEFLKMFQMPVIEVPTNLPNIRKDL PIQAFATLRGKWEQVRQEVEYMFRQGRPVLVGTTSVENSELLAGLLREWNIPYNVLNARPKYAAREAEIVAQAGRKHAIT LSTNMAGRGTDIILGGNPKMLAREIIEDSILPFLTREDPNLELAGEAISEKVLPKIKVGPSSLALLAKTALMAKYVSKSE GKSWTYQKAKSFISDAVETSLSFSLKELEELANEESEVYPLGPTVALAYLSVLKDCEEHCLREGSEVKRLGGLHVIGTSL HESRRIDNQLRGRAGRQGDPGSTRFMVSLQDEMFRKFNFDTEWAVRLISKITNDEDLPIEGDAIVKQLLALQINAEKFFF GIRKNLVEFDEVLEVQRKHVYDLRQLILTGDDESCSQHIFQYMQAVVDEIVFSNTDPLKHPRSWGLNNLSREFMTIGGKL LHESFGVISDDTLLNSLGQLSEVSSVDIVNFSLPNLPAPPNAFRGIRRKSSSLRRWLAICTDDLIENGKYQTTSNLLRKY LGDFLIASYLNVVEESGYDERYVKEIERAVLLKTLDCFWRDHLVNMNRLSSAVNVRSFGHRNPLEEYKIDGCRFFISMLS ATRRLTVEALLRHWTSPIESQELFL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SignalP_GRAM_POSITIVE 1 22 22 -
PANTHER 66 1064 999 0.0
PANTHER 66 1064 999 0.0
Hamap 68 1056 989 17.743
ProSiteProfiles 76 780 705 132.62
SMART 83 459 377 7.6E-230
SUPERFAMILY 83 472 390 2.33E-71
Pfam 91 458 368 2.9E-117
Gene3D 96 472 377 9.5E-163
TIGRFAM 101 872 772 9.2E-266
CDD 115 471 357 3.86782E-126
PRINTS 136 160 25 9.8E-61
PRINTS 174 188 15 9.8E-61
PRINTS 190 200 11 9.8E-61
PRINTS 243 263 21 9.8E-61
SUPERFAMILY 303 424 122 4.84E-37
SMART 304 415 112 1.3E-42
Gene3D 305 425 121 9.5E-163
Pfam 311 415 105 3.1E-27
PRINTS 396 418 23 9.8E-61
PRINTS 433 450 18 9.8E-61
PRINTS 470 483 14 9.8E-61
SUPERFAMILY 474 761 288 6.75E-41
CDD 477 748 272 1.32807E-59
Pfam 778 1052 275 1.0E-44
Gene3D 783 895 113 5.1E-13
SUPERFAMILY 784 1062 279 7.76E-39
Gene3D 924 1053 130 2.2E-20

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein targeting The process of targeting specific proteins to particular regions of the cell, typically membrane-bounded subcellular organelles. Usually requires an organelle specific protein sequence motif.
Biological process Intracellular protein transport The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell.
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.
Biological process Protein import The targeting and directed movement of proteins into a cell or organelle. Not all import involves an initial targeting event.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0265900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…