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LotjaGi1g1v0337000.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0337000
Transcript ID LotjaGi1g1v0337000.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein; TAIR: AT2G06105.1 aspartyl protease gag-polyprotein; Swiss-Prot: sp|Q4WGS4|DDI1_ASPFU DNA damage-inducible protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A151R7N2|A0A151R7N2_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0337000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:79718852..79743612) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TGGCGGAGCTTGACAACAAACTTTAGAGGGGCTAAACCAAACCAAAATTTCAATCCATGTGCTAGACTAATTAATATGTG ATATTTCAATCCTCTTTACAAATTTCTTCCCCATTGAATCAGTCATTGAATCAATTTACGTATTGATTCAAAGTTAAAAC AGTTGAATCAAAGTTGAGCCGTTGTGAAACTCATAATTATTACATATTCTTTCTAATCCTTAATATCTATCACTTTAAAA TTTGAGCACATGTATTAACGAATTGTTTCTATCAAAATTGTTATCTAACTTCCTAATATATTTTTTCTCTCTTCTTAATT TTTTCAATTTTTCTATAACATTAAATGATACAATTAGTAAAATATAGTACTACTAATTGAACCAATCTTCTCTCTCCATT TATTCATTTCTCTCACATAATACTAATTAAAGAGTTTTCTCTCTCCATCTTTTCCCCTCACTCCTGTTTCGTTCCCGTCT TCTGGTTCAGGTCCAGCAATGGCATTATGGCAAGTTTTGATTTTTATTTACTCTCATATATCTCCCTTAAAGTTTCAATT TTTATTCACTTTTCCTTCTTCATTTGATTGCATACCCATCTCATTCTGGTGTGCACACCTCCAAAACAGATTTGACATTT GGATAAAAAAAAATTATGAAAAGTTGCAGAAATTTTAGGAGGGCTGAGAACCTCCTATGTCCCCAAGAAGATCCGCCACT GACTACCTCTGCCTTTAAGAACACCAACCAAGTGTTTCAGAGAACAAAATTAAGAGGCCATGTACCAGAGTACGATGATC ACGCACTATGAACCTTATAATTAATTAGCTAGTCCCACCAATCCAATAATATACTAAAAAAATGGACATACATGTTCAGT TATTCAAATTAAAAAGTATCAAATTAAATGAAATTGAATGAGTATTTGGTTGTTTTAACGGATACTGGAGGGATTTAAGT 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AGCTGCGTTTTTTTGTTTTTGCTTAAAGCTTACTTGGTTCTTTGTCAAGATTTTGAGGTTTGGCTTGAATTTTTATTTGT TTCCATGACTATGTCAGGCTAAACTCCCTTTGTGTTAGGGTGATTGATCTAGTTTTCCTTTAAACTATGTTTTGATCCAA GTTTCAGTTATGATTATGATTCCTATTTTAGTTCTTGAATTTTTCCTCTATTTTAATTGATACTTTCTATTGCAATAGTT TGTCACACTATTTTCTATGCAATTGGAAAATTGGTAGAATTTAGGGATTTGGGGAGGAATTGAGCAAGGGTCTTTACACC TTAGGGATAAGGGTAACAAATTGCTTGTGTTTGCCTGATCTAAATTGAACTTTTATCTCTGATTAATTAGGATTAGGTAC TAAGGAATTAGCTATCACTAATTAATTGGAAGGGACACTTATGCAAGGAATTGATAAGTGGACAATTAAGCTTAGCACCT TGAAACTTAATTTGATACATAATTATAACTGATTGGGGAGATACATAGGGAGAAGGTTAATGAAATCAGGATCCCTAGCA CGCTTTTAAATTGAATTCATTTCAACAGTGTTATTTGCTTTCTTTAATTTTATTGCAGTTAAGTTACTTACGAAAAATCA ATCATCTCTTTATTTGTATTTTTATTTTTACGTCCTATCATTCTAAGTTTAGTTAATTTAGAGTATAAACTACGCAATCC TTGTGGTTCGATCTTTTTATTACTTCGAGCAATCTGTACACTTGCAGATTCGCTATCAAGTTTTTGGCGCCGTTGCCGGG GATTGTGTTTAGTTTATTCTCTAATTTTTCTGAATCTATTTGTTAGGATTTTTACTTTAATTCTCTTGTGCGGGTATTAC TAACTTCTGTTTGTTAGTGCATGCGAGGTACAATCAGTCTTGAATCTTTGTTGTTTGATCCAGAAATTGAAAGAACTTAT CGATCTAATCGTGCACAACAGAGGAAGAAGAAGGGCCAAGCCAAAGCTACCGCTGCAATGGAAGAAACACAAGCTGAAGC AAGAAATCGAGCTGAGTATGAAGCGAGAGTGGAAGCTGAAGTTGAAGCTCGGATTCTTCGCCAGAAAGAAGAAGAACTTG TACGTGATGCTCAGAGACCATTGAGGGAAATCACTGCCCCTCGTATGAGCTATACATATGAGGGCAGCGTTGTCCTTCCA GCAGACATACCAGACAACTTTCAGATTCCACATCATTATATTCAGTTGGTGAGCCAGCATCAGTTTGGAGGTAAAGCTAC TGAGGATCCGCATGCTCACATGGACAGATTCACCAGACATTGTGAGTCTCTGAAAAGGCGTGAAGTCAGCTTGGATACAG TCCGGATGATTCTTTTTCACTACACTTTGAAGGATGTTGCAGAAGATTGGTTGAGGTCACAACCCCCTAATAGCATTCGA ACATGGGAGGACTTGGCGGAAAAATTTATCACCAAATTCTTTCCATCCACACGCATCAGAAAGGCGAAGCAAGAAATTTA TGCATTCAAACAAAACAAATCTGAAAATTTGTATGAGGCTTGGGAGCGGTTCCAAGAACTTCTGAGGAAGTGTCCAGGTC ATAATATTTCTACTGGTGAACAAGTGGACAAATTTTACTCGTCATTGCTTGAGTATGCGAGAGGGATGTTGGACGCAGCA GCCAATAGTGCATTTGATTCATTGCCTGCACACAGAGCTCTTGAGATCATTGACAATTTGGCCACTAGATCTTCACTATC AGATTATGATAGAGAGAACCGAGAAAGTGTGCATGAAGTTGGAACAAATGATGATGTTCTCGCCTCCAACAGGAAGTTGT CACAAAAGATGGATGCAATAGTACAATGTTTAGATGGTCGCAAACTGAGTTCTGAAGATGCTGCATTTGATGAGGAAGTG 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GTTGGAGAGCTGAAGCCAACAATGATGATGCTTCAACTAGCAAACCGCTCCATGGTGACTCCTTGGGGAGTTGTTGAAGA TGTGCTAGTGAGAATAGGAGAGTTTGAGTTCCCGGTGGATTTTGTGATAATTGATATGGACGAGGACTCTAAAATACCAT TGATTCTGGGAAGACCGTTCCTAGCCACTTCACAAGCGAAAATAAATGTGGGAAAAGGAACAATATCTTTAAGGGTAGCT GATGAGAAAATCACTTTCACCATATTTGACCTGAAGCCAAAGCAAATTGAGAAGAATGATGCATTCTTGGTAGAGATGAT GGACGAGTGGAGTGATTAGAAGTTGAAGCAGTTCTTCCTTAAAGAAAAAGCTGGAGCATCAAATAAGAAGAAAAAGAAAA ACACGCAGAGCGACCAAACTGAGAAAGTCTACTCAATGAGCATGGTTGTCAACTCAGAGCAGAAGGAGGAGAACCTGGGA AATCAAGCTGAACCAGTTCATCTTGAAAGCGTTGTGGCTAACATGGAGCGGAAAAAGGAGAAAGCCAAAGGAGAGTCCTT CATATGGAAGCCAAAACATAAGAAAGATGAGAAACCTCCTATCCCTTTTAACTCCAAATTGAATAACTGTGTTCACGCTT TTGAGATTGCTTGCAAGAACATGGTGAAAATGTGTGTTGAGTTTAAGGAACCTGGAAGTGCAATGCACTATGGGGTAAAC CCCTGATAGAATTCTTAGTCCGGTGAAGTCTAACAAAGACTATAAAATTGTGCTTCTTGGGAGACAACCCAAGCGGTAGT TTTAGTTTTAATTTCATTTTCGTTTTGCTTTCTTAATTTTAATAATTTTTCTTTTTTTTTATTTCCGGTTTCGTAGTGTT AGTTTTGAAAAAAAAAATGATAGAAAACGTTTCTGGAATTTCCTGCGCGGATTCTGCGCGGTTCCCAGGTATAAGTTCGC GCAAATGCGCAACAGGAAACCATTCTGGAATTTTTTGCGCGAGAATCTCCTCCCTTTTCGTGCAAATGCACGGCCATACG TGGTTCTGGAAAATTTTGCGCGAGTTTTGCCTGGGCTACTGTGTTAAATATGGCGCAATTACGCCAAAAGTTTTTTTTTT TATGTTATTTTAAAAAAAAAAATCAAAAACAAAAAAAGATATATGCTTTTTAGTTTGAGTCTTTATTTTCTGTTGAGTCT TAGTATTCTCATGAGTTATTTGAGTTATAATTGTGGTAGTTTAATTGTGTGTTCATTTTTACAAGGACTAAGTGATTTAC ATGATCAGAATTGAGCTGGAGGGTCCAGCTGACAGAGTCCTGGTGCTATCACTGTTTGCACCCAATCTGAGTACAGGGAG TTTTACTGAACCACTCATCTCTCATTTAATTTCATGATCATGCATTTAGCATTTAGTTATTTAGATTGCACACACTAGTA TGCACATGCATTGGATTCTTGGTATTCACACTTTTATGCTTGAATAATACTTGTTGTTGTTTTTAATATCTGTTCTGGGT TTAATGCTAGTTGTTATAATAAAAAGTGTTTGATGCATGAGTGTGAGTGAAACTTGTGGAACATGTGGAGAGTGAGGTAA TAGAGACTTGAGTGAGTTTTGGGAAAGTGCAGTAAGGTTATTAAGATTCCAGGTTAGTGGGGATAATGCATAAAATATGT AGTTTTCCTTTTAATCTTTATATTGAGTCTACACTCTTTTTGGCTGTGAGGTTACAAAAGAGGCACACATGTGAAAGTAA ATCTAAAGTGCTAAAAATGAAAAAAATAGGGAAAGAATGTGAGTAAGAGAATGGGAAGTATTTGCACCACTGAGCATACC CTCAATCATACTCTGACCATGTTAAATAAAAGAAAAGAATTTCGCCCTAAGTTGGAAATAACTGTGAAGGGTTGGGAAAA AGCTAAACTGAAAAAGAAAGGAAACATGTGTGTGCTCAGAATAAAATAAAATTGTTGGCCATCATTAGTGCATTCTCAAT ATGGGGTTGGGGAAATAGGAATAAAATGTGAAAACCCCACATCTTGGTATTTTCTATAATTCTTGTTTGCACTTACTGAA AGTTACTTAGTTTTTTTAAGCTTGATTCTCTGCATGAACTATTTTGAGGAACTCATCTCATGCATCTTTTGTGAAAATAT GTATAATAGCATCTTACTTTGAAATGTTTTATTGAGCTTGAGGACAAGCAACCTTAAGTTTACGCTTGAGGACAAGCTGT CGTTGAGTATAGGGGTGTGATGACCCGGGATTTAAGGCTATTTTCCTGGTTTATTTGCATGTAGTTTAATATAGTTTTTA GGATATTTCGATCATTTTAGGACACTTTAGGCTTAGTTCATGCATTTTAATGTTTTCATTTAGTTTTAGTATTTTTCTAT ATTTTTTATGTTATTTTTATAGATTTCATTAGGATTTAATCAAGTTATTTGAATTCGGTATCTTACTCTATCTTCTAGTT AATCTCTATTATTGGTTTTTAATTATGTTCCTTTATTATTATTGTTATTTTAGGAGAAGATGTGGAATCAATGAGCAAAA AGGGAGACAGCCAAGAATCTCGAAGTCTGGAGCAATCTGGATTTCTTTGCGCCAGTTCTGCACCAATCTCCTGTTGCATT TCGCGCAGACGCGCCAAGGAAGTAGCTGCTGGAAAATTCTGCGCCAGTCTTGAGCGAGTTCCTTCACGAAGTTCGCGCAT TTGCGCGAAATATCTGTCAAACTCTATTTAAGTGCGTTTTAAACCTAATTTAGATACTTTTTCACGTTAGAACTTGGAGA GCTGCGTTTTTGGATTTTTGCTTAAAGCTTACTTGGTTCTTTGTCAAGATTTTGAGGTTTGGCTTGAATTTTTATTTGTT TCCATGACTATGTCAGGCTAAACTCCCTTTGTGTTAGGGTGATTGATCTAGTTTTCCTTTAAACTATGTTTTGATCCAAG TTTCAGTTATGATTATGATTTCTATTTTAGTTCTTGAATTTTTCCTCTATTTTAATTGATACTTTCTATTGCAATAGTTT GTCACACTATTTTCTATGCAATTGGAAAATTGGTAGAATTTAGGGATTTGGGGAGGAATTGAGCAAGGGTCTTTACACCT TAGGGATAAGGGTAACTAATTGCTTGTGTTTGCCTGATCTAAATTGAACTTTTATCTCTGATTAATTAGGATTAGGTACT AAGAAATTAGCTATCACTAATTAATTGGAAGGGACACTTATGCAAGGAATTGATAAGTGGACAATTAAGCTTAGCACCTT GAAACTTAATTTGATACATAATTATAACTGATTGGGGAGATACATAGGGAGAAGGTTAATGAAATCAGGATCCCTAGCGC GCTTTTAAATTGAATTCATTTCAACAGTGTTATTTGCTTTCTTTAATTTTATTGCAGTTAAGTTACTTACGAAAAATCAA TCATCTCTTTATTTGTATTTTTATTTTTACGTCCTATCATTCTAAGTTTAGTTAATTTAGAGTATAAACTACGCAATCCT TGTGGTTCAATCTTTTTATTACTTCGAGCAATCTGTACACTTGTAGATTCGCTATCATACAGTTTATAATCGTTTGACAA AATTAGTTATTTCAAGTGCAAAGAGTTGCTTTGGAAAATAG 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0337000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCGAGGTACAATCAGTCTTGAATCTTTGTTGTTTGATCCAGAAATTGAAAGAACTTATCGATCTAATCGTGCACAACA GAGGAAGAAGAAGGGCCAAGCCAAAGCTACCGCTGCAATGGAAGAAACACAAGCTGAAGCAAGAAATCGAGCTGAGTATG AAGCGAGAGTGGAAGCTGAAGTTGAAGCTCGGATTCTTCGCCAGAAAGAAGAAGAACTTGTACGTGATGCTCAGAGACCA TTGAGGGAAATCACTGCCCCTCGTATGAGCTATACATATGAGGGCAGCGTTGTCCTTCCAGCAGACATACCAGACAACTT TCAGATTCCACATCATTATATTCAGTTGGTGAGCCAGCATCAGTTTGGAGGTAAAGCTACTGAGGATCCGCATGCTCACA TGGACAGATTCACCAGACATTGTGAGTCTCTGAAAAGGCGTGAAGTCAGCTTGGATACAGTCCGGATGATTCTTTTTCAC TACACTTTGAAGGATGTTGCAGAAGATTGGTTGAGGTCACAACCCCCTAATAGCATTCGAACATGGGAGGACTTGGCGGA AAAATTTATCACCAAATTCTTTCCATCCACACGCATCAGAAAGGCGAAGCAAGAAATTTATGCATTCAAACAAAACAAAT CTGAAAATTTGTATGAGGCTTGGGAGCGGTTCCAAGAACTTCTGAGGAAGTGTCCAGGTCATAATATTTCTACTGGTGAA CAAGTGGACAAATTTTACTCGTCATTGCTTGAGTATGCGAGAGGGATGTTGGACGCAGCAGCCAATAGTGCATTTGATTC ATTGCCTGCACACAGAGCTCTTGAGATCATTGACAATTTGGCCACTAGATCTTCACTATCAGATTATGATAGAGAGAACC GAGAAAGTGTGCATGAAGTTGGAACAAATGATGATGTTCTCGCCTCCAACAGGAAGTTGTCACAAAAGATGGATGCAATA GTACAATGTTTAGATGGTCGCAAACTGAGTTCTGAAGATGCTGCATTTGATGAGGAAGTGAAGGCTATGGGTAATCCTCA AAACAACCCTTACTCAAATACTTATAATCCGGGTTGGAGAAATCACCCTAACTTTTCATGGAGAGATCAAGACAAGTCTG GAAATTCAAGGGAGTACTGTAATCAAAGGACTTATGGTCAAGATCAGAAACCTCAACCCTATCAAGAGCAAGGAAATGGG AAGAAGAGCCTAGAAGAAATTGTGGGAGAACTGGCCCAAGCTACTAGCAAGCTTCAAGTATCCACAAATAGCTTCATTAA TGAATCCAGAAATAACTTCAAAAATCAGGAGGCTTCAATCAAAAATTTGGAGAATCAGGTCGGTCAAATTTCCAAACAAT TATCTGAGATATCTCCAGGTATGTTTCCTAGTAACACTGTGCCTAATCCTAGGGAGAATATTTCTGCTGTTACTCTAAGA AGTGGAAAAGTTATGCATGAAATTGAAAAGAAAAAAAATAATGAAAAGAATAAGAGTGAGACTGGGAATAAAAGTGAATC TGAAGTGATAAGTAAGGAAAAAGAACAGAGTGAAGATAGGATAGTGAAAGAGAGAAAAGTAGATTTAGAAAGTAATAAGT TTACAAAAGTTCATTTTCCCCCTTTCCCCACTAACATAGCAAAGAGGAGGTTGGAGAAGCAATTCTCCAAGTTCGTTTCT ATGTTTAAAAAGTTGCGTGTAGACCTCCCATTCTCTGAAGTTTTAGAAAAGATGCCTCAATATGCCAAGTTCATGAAGGA GATACTTTCTAAGAAAAGGAAGTTGGGTGAAGAGAATGACATCGTTCAGCTTACTGAGGAGTGTAGCGTTATTCTGCAAA AGAAGCTTCCACCTAAACGAAGGGACCCAGGTAGTTTCACTCTACCTGTTAATTTTGGGGCTTCAAAGGAAGTGAGAGCT TTATGTGATTTGGGGGCAAGCGTCAACTTAATGCCCCTATCAATGTTCGAGCGACTTAATGTTGGAGAGCTGAAGCCAAC AATGATGATGCTTCAACTAGCAAACCGCTCCATGGTGACTCCTTGGGGAGTTGTTGAAGATGTGCTAGTGAGAATAGGAG AGTTTGAGTTCCCGGTGGATTTTGTGATAATTGATATGGACGAGGACTCTAAAATACCATTGATTCTGGGAAGACCGTTC CTAGCCACTTCACAAGCGAAAATAAATGTGGGAAAAGGAACAATATCTTTAAGGGTAGCTGATGAGAAAATCACTTTCAC CATATTTGACCTGAAGCCAAAGCAAATTGAGAAGAATGATGCATTCTTGGTAGAGATGATGGACGAGTGGAGTGATTAG 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0337000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MRGTISLESLLFDPEIERTYRSNRAQQRKKKGQAKATAAMEETQAEARNRAEYEARVEAEVEARILRQKEEELVRDAQRP LREITAPRMSYTYEGSVVLPADIPDNFQIPHHYIQLVSQHQFGGKATEDPHAHMDRFTRHCESLKRREVSLDTVRMILFH YTLKDVAEDWLRSQPPNSIRTWEDLAEKFITKFFPSTRIRKAKQEIYAFKQNKSENLYEAWERFQELLRKCPGHNISTGE QVDKFYSSLLEYARGMLDAAANSAFDSLPAHRALEIIDNLATRSSLSDYDRENRESVHEVGTNDDVLASNRKLSQKMDAI VQCLDGRKLSSEDAAFDEEVKAMGNPQNNPYSNTYNPGWRNHPNFSWRDQDKSGNSREYCNQRTYGQDQKPQPYQEQGNG KKSLEEIVGELAQATSKLQVSTNSFINESRNNFKNQEASIKNLENQVGQISKQLSEISPGMFPSNTVPNPRENISAVTLR SGKVMHEIEKKKNNEKNKSETGNKSESEVISKEKEQSEDRIVKERKVDLESNKFTKVHFPPFPTNIAKRRLEKQFSKFVS MFKKLRVDLPFSEVLEKMPQYAKFMKEILSKKRKLGEENDIVQLTEECSVILQKKLPPKRRDPGSFTLPVNFGASKEVRA LCDLGASVNLMPLSMFERLNVGELKPTMMMLQLANRSMVTPWGVVEDVLVRIGEFEFPVDFVIIDMDEDSKIPLILGRPF LATSQAKINVGKGTISLRVADEKITFTIFDLKPKQIEKNDAFLVEMMDEWSD 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 19 47 29 -
Coils 56 76 21 -
Pfam 158 249 92 3.5E-16
MobiDBLite 340 401 62 -
MobiDBLite 345 363 19 -
MobiDBLite 377 399 23 -
Coils 426 453 28 -
MobiDBLite 486 517 32 -
PANTHER 505 742 238 6.0E-61
PANTHER 505 742 238 6.0E-61
Gene3D 606 748 143 2.1E-23
Pfam 631 720 90 5.9E-6
CDD 635 722 88 1.42603E-18
SUPERFAMILY 635 729 95 2.11E-5

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0337000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…