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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0342700 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0342700.11 |
| Related isoforms 10 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Golgi-body localization protein domain isoform 1; TAIR: AT1G58250.1 HYPERSENSITIVE TO PI STARVATION 4; Swiss-Prot: sp|Q6IMT1|SAB_ARATH Protein SABRE; TrEMBL-Plants: tr|K7KU85|K7KU85_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0342700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:80497885..80522567) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGGTATCCAGTTGAAAAGCACCAAATCACGATCCACTGAGGATGTTGGGGAGAGTACACGCCTTGATTTTCAAGTGGA GTTTAGTGAAATTCATGTATGGAGTGTGGCTTTTGACTTTGGTGAAGCTCTTGTAATATGATTTCTACTTGTCAAGTTGT TTTGTTCCTTGCTGACAAGGTTTCTCTTGCCTTATTGATATTACAGCTTCTTAGAGAAGCTGGTTCTTCCATCCTGGAGA TATTGAAGGTGGACTTGATTTCTTTTGTGTATATCCCAGTACAGGTGTGTTTCTTAAAATCCGCATTAAGTAGGCTTTGC ATCACTGTAAAATTGGTATTGCTTTGTGTTTACTCCACCTGGTTAAATGCACTCAAAATTAAGAGTGGAAATACTAATAT TGCAATCCATAAACATAGAGGTATCCTTTATGCAGAGAAATTTATGGCAAAGCTAACTTAAATTTGAAGTCTCGACCTAT AGTTACCACCTGAGTTGATGACTACACAATGGCTGGTTTTATGCTTGAAGTTATCATTAAAGTTCACATCATATTGTAGA AGCATTTCTTCTGAAATTTATTTATATATGGCACATTCCAATGCTTTGATAATAAGCAGCAGAAAATATCGCACCTGTGG TTTTTTTATGTAATAGAGTGTTCTCCAATTATAATGAAGTATATATGTGTAGTTGGACTTTTAGGAATTTTGCCTATTTA CTTTTCAGAAAACTGCTGCTTCTTTTTCATTAAGGAATGCAACTCTAAATGAATTATTTTAATTTTAATTGTAACATTTT TTTTATTTGCATATGGGATTTGAATATTCCTTTTTGTATTTGCTGTGGCAATTTAATGTTGTTATTGGGGATGCTTCTTC TGCATCAGCCAATTTCACCTGTTAGAGCTGAAACTGAAATCAAGCTAGGAGGCACTCAATGCAACATCATAATGAGCAGG 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Protein sequence (LotjaGi1g1v0342700.11) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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| MobiDBLite | 1915 | 1940 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 1921 | 1940 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 1956 | 1984 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 1956 | 1989 | 34 | - | – | |
| MobiDBLite | 2010 | 2060 | 51 | - | – | |
| MobiDBLite | 2024 | 2060 | 37 | - | – | |
| MobiDBLite | 2130 | 2177 | 48 | - | – | |
| MobiDBLite | 2238 | 2288 | 51 | - | – | |
| MobiDBLite | 2250 | 2281 | 32 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0342700.11, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…