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LotjaGi1g1v0342700.9

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0342700
Transcript ID LotjaGi1g1v0342700.9
Related isoforms 10
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Golgi-body localization protein domain isoform 1; TAIR: AT1G58250.1 HYPERSENSITIVE TO PI STARVATION 4; Swiss-Prot: sp|Q6IMT1|SAB_ARATH Protein SABRE; TrEMBL-Plants: tr|I1JV89|I1JV89_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0342700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:80491305..80522567) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGCAGCTTCTCCTGTCAATTTCCTCTTCGGATTCTTGCTGCTTTCTATTACATTGTGGCTTCTCTTCATGTAAGTCCC TGCTTCACTTTTTTGCTTACTGAATTTATCGCATTCGTTGTTTTTTAACTGCTTAGCTGTTTAGGTTGGAGAATATGTTG CTTTTTTAGGGTGGACTTAGTAGTATGACAGTTTGGTATGTAAGGGGCAATCAATTTTACCAGTTAGGTATGTTATCAGG GGGAATTGTTCTAGAATTCTAGCACTTAGCACTACACTACACTGTAGAAGACATCGTATTCATTCTCTGTTTCTAAGAAT AGGGAGTTCCGTTGAGCAGTTTACCATCTAATCGTAATTCAGTCAACAACATTAACTCGCTCAAAAATCCCACCCGGTAA ACCTCAGTGTAGATAAGGACTGGATGCATTAAGACCTGTTGCATAGAACAGACGAGTAGTGCTTGATGAATACTCTTCAA TGTATGTGAGCGTGATCAAATTATATTGAAGATACCAACAAGGTGTAGCACAACTGGTAGATAGTTGGGCTCCTTAACCA TCTAGTCCAGGGTTTGATTACTGGGTGATGCGTATGGAGAAGCATTTGTTGGGAGAGGCCTACCCACTTAACGTGATCTC AGAGCCTCGAGGGATTAGTCTCATGGCTGTCGGCGGTGGGATACCTTAGGAAACAAAAAAAAAATTATATTGAAGATAAT AAAAGAGCACAAATCAAGTTTATAATCTTCGTGCCTACTCATATTCTTTAGCTGACATATGAGGGTTAGACTAGTTTGTA TTAGTTTGTTATGACAGCTGTGTAGCCAGCTTTGCTTGATAAGTACTCTATGATATATATGAGCTTTATCAAATTATATA GAAGATAATGAAAGAGCATATGATATGAGAGTCTGTTAGTGGATGTATATGGTTCGACTGTTATGTTGTTAGACTAGTTT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0342700.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGACTACAGTACACGTTGAACTTGGAGAGTTAAATCTTCATTTGGCTGATGAATATCAGGAATCCTTGAAAGAAAG TGTTTTTGGTGTAGAATCAAATTCTGCCTCCATTATGCACATTGCTAAGGCAAGTTTGGATTGGGGGAAAAAGGACATGG AGTCATTTGAAGAAGATGGTCTTAGGTGTAGATTAGGTTTATTAGTTGATGTGACAGGCATGGGAGTTTATCTAAATTTT AAGCGTATAGCATCACTCATATCAACAGCTATATCATTTCAAGCTCTATTGAAAGGCCTATCTGCTTCGAAGAAAAAATT GACTCCGAGTCGTGGCCATTTATCAAAACCTTCGGGGAAGGGAACTCAGTTGTTGAAATTTAATCTTGAAAGGTGTTCAG TACATGTATGGGGTGAAACAGGCTTGGAAAATACAATTGTTCCAGATCCCAAGCGGGTTAATTATGGTTCACAGGGTGGT AGAGTTATAATAAATGTGTCTGCAGATGGCACCCCGCGTAACGCAAACATAATGTCTACTATTTCGGATGAACTCCCGAA GATCAAGTACTCTGTCTCTTTTGAAATCGTTCAATTTAGTGTGTGTGTGAACAAAGAGAAACAATCCACCCAGATGGAAC TTGAAAGAGCCAGATCTGTCTATCAGGAATATATGGAGGAAAATAGGCCAGTAACAAAGGTGACATTGTTTGATATGCTA AATGCTAAACTTGTAAAGCGTTCAGGTGGCCTTAAAGAAATTGCTGTCTGCTCTCTTTTCAGTGCCACTGACATTACTCT AAGGTGGGAACCTGATGTGCATTTATCACTTATTGAACTTGTTCTCCAGCTGAAATTACTGATACACAAAAGCAAGCTTC AGGAGCACGGTAATGAACACATGGGAGACGTGTCTCATGCACAAGATGCTAATTGGAAACAGGAAACTACCATTGAATCT GGGCATCTGGAAAAGCAGAAAAAGAAAGAATCTATTTTTGCCGTTGATGTAGAAATGTTGAGTATTTCCGCTGGGCTAGG AGATGGGGTTGATGCTATGGTTCAAGTACAGTCAATTTTCTCCGAGAATGCTCGTATAGGAGTGCTCCTAGAAGGACTTA TGCTTAGTTTTAATGGGGCCCGAGTTTTCAAGAGTAGTCGGATGCAAATTTCACGAATTCCTAGTGTCTCTGCTAGTACA TCTGATGCGAAAGGACACGTAATTACAACATGGGATTTGGTAATCCAAGGTCTTGATATTCACATTTGCATGCCATACCG TTTGCAATTGCGTGCTATTGATGATGTCATTGAGGATATGATACGAGGTTTGAAGCTCATAATTGCTGCTAAGACAAATT TGATTTTTCCTGTGAAAAAAGAGAGCTCTAAAGTTAAGAAACCTAGTTCTGTACAATTTGGATGCATAAAATTTTGCATA CGCAAGTTAACTGCTGATATTGAAGAGGAACCAATGCAGGGATGGCTTGATGAGCACTATCAATTGCTGAAGAAAGAGGC TGGTGAGTTAGCTATCCGGTTGAACTTTCTAGATGAATTAATATCGAAGGCCAAACACAGTCCAAAATCTGCTGACACCA TTGAGATTGATGTAAAAGATTCTTCTACTATTGAGTCCACGAGAGAGGAAATTTATAAAAGATCATTCCGATCATATTAC CAGGCATGCCAGAATCTAGTGTTATCTGAAGGGTCAGGTGCTTGTGGAGAAGATTTCCAAACTGGCTTCAAACCTAGTAC TTCAAGGAGATCACTTCTTTCAATATCCGCACAAGATTTAGATGTTAGCTTGAAAAAAATTGATGGTGGGGATGCCGGGA TGATTGATGTTCTGAAGAAGCTTGATCCTGTCTGTTTTGAGAAAGATATACCATTTTCTCGACTGTATGGGGCAAATATT CTCTTAAGTACAGGCTCTCTTGTGGTCCAGCTTCGGAATTACACATTTCCTCTTTTCTCTGGAAGTTCTGGTAAATGTGA AGGTCGTCTTGTTTTGGCTCAGCAGGCAACTAGCTTTCAACCTCAAATATATCAAGATGTCTATGTTGGGAGATGGAGGA AGGTTCGCATGCTTCGATCAGCTACTGGTACTACTCCACCAATGAAAACATACTCAGATTTGCCTTTACATTTCCAGAAA GGTGAAGTGTCATTTGGGGTGGGTTATGAACCAGCTTTTGCAGACGTTAGTTATGCTTTCACCGTAGCACTTCGGAGGGC TAATCTAAGTGTTAGGCATCCTGGTCCACTTATTCTTCCACCAAAAAAGGAGCGGAGTTTGCCGTGGTGGGATGACATGA GAAATTACATACATGGAAAAATTTCCTTGCTCTTTTCTGAATCAAGATGGAATATTTTGGCAAGTACAGATCCTTACGAA AAAGTTGACAAACTTCAAATTGTGACCAGCTTTATGGAAATTCACCAGTCCGACGGTCGTGTTTTTGTTTCTGCTGAAGA TTTTAAGATTTTATTGAGTAGTTTGGAGACTTTGGCAAACAGACGAGGTTTCAGAATTCCAACAGGTGTCTCTGGTGCTT TTCTGGAAGCCCCGGTCTTTACTCTTGAGGTTACGATGGACTGGGATTGTGAATCTGGAAATCCCATGGATCATTATTTA TTTGCACTTCCAGTTGAGGGAAAACCTCGTGACAGAGTATTTGATCCCTTCAGATCCACTTCTCTCTCCCTTCGATGGAA CTTCTCTCTTAGACCCTTTCCTCCTTCATCAGAAAAGCATCCCACATCTTCCATTACTAGTGATAATATTGAAGAAAGTG CCAGTGTATTTGAGCCCCCTCATGTATCTCAGAATGTTTCATCAGTGTCCCCGACCTTTAACTTTGGAGCTCATGATCTA GCATGGATCTTAAGATTCTGGAGCTTGAACTACAATCCTCCACATAAACTGCGCAGCTTCTCTCGTTGGCCTCGTTTTGG AGTTCCAAGAGTTGCCAGGTCAGGCAATCTTTCACTTGATAAGGTGATGACTGAATTTATGCTCCGTTTAGATTCCACAC CGGCCTGCATAAAAAACATGCCTTTACATGATGATGATCCAGCCAAAGGACTGACTTTCGTAATGACTAAACTGAAGTAT GAACTGTGTTATAGTAGGGGGAAGCAAAAGTATACTTTTGAAAGCAAGCGTGACATTCTTGATCTTGTTTACCAAGGTCT TGACCTTCATATGCTCAAGGCTTTCCTAAATAAAGAAGCATCTCCTAGTGTTGCCAAAGTAGTTAACATGGTACTGAAAA GCTCACAATCTGTTTCTCTGGACAAAATCCCCAGTGAAAAAGTTTACATAACAGACAAAAATCGTGATGATGGGTTTCTG TTGTCCTCTGACTACTTCACTATCAGAAGACAATCCCCAAAGGCTGATCCGGCAAGGTTACTAGCATGGCAAGAAGCAGG AAGAAGAAATGCTGAGTTGACATATGTACGCTCTGAGTTTGAAAATGGGAGTGAAACTGATGAACATATGCGGTCTGACC CAAGCGATGATGATGGTTACAATGTGGTAATAGCTGACAATTGTCAGCGCGTATTTGTCTATGGTCTTAAGCTTTTGTGG ACTATTGAAAACAGAGATGCTGTTTGGGCCTGGGTTGGTGGTTTATCCAAAGCCTTTGAACCTCCCAAGCCCTCTCCATC ACGACAGTATGCGCAGAGGAAATTACATGAGGAAAACAAAAGGCATGACGGAGATGATTTTCGACAAGATGATGTTTCCA AGTGCCCTCCCACTGGTAAAATTACCAATTCTCCCTCTTTTCAGGACGCAAGTACTTCTGGATTACTTTCTTCTCCACCT AATTCAGTTAAGGTGGACAACTTGTCGTCTGCTAAAAGCGAGAACACAAATGATTCAGATGGGACCCGACACTTCATGGT GAATGTTATTGAGCCACAGTTTAATCTTCACTCCGAGGATGCAAATGGTAGGTTTCTGCTTGCTGCTGTAAGCGGCCGTG TTTTAGCTCGATCGTTTCATTCAGTCCTTCAAGTTGGTTATGAGATGATTGAGCAAGCACTTGGTACTACAGACGTACAT ATAAGTGAATACCAACCTGAAATGACATGGAAAAGAATGGAGTTCTCTGTTATGTTGGAGCATGTACAAGCTCATGTTGC ACCAACAGATGTTGATCCAGGAGCTGGACTACAGTGGCTTCCGAAAATTCTCAGAAGCTCGCCAAAAGTAATGCGTACAG GCGCTCTTCTCGAGAGAGTTTTTATGCCTTGTAATATGTACTTTAGGTACACAAGGCACAAAGGGGGCACGCCAGAATTG AAGGTGAAGCCCTTGAAGGAGCTCATATTCAATTCTCATAATATAACGGCAACAATGACATCTCGCCAGTTTCAGGTCAT GCTTGATGTGTTGACAAATCTTCTCTTTGCACGCCTTCCAAAGCCTCGAAAAAGTAGCCTGTCATTTCCTGCCGAAGATG ATGAAGATGTTGAGGAGGAAGCAGATGAGGTGGTTCCTGATGGTGTTGAAGAAGTGGAACTTGCAAAAATCAACCTTGAG AAACAAGAGAGAGAACAGAAGTTGCTTCTTGATGATATTCGAGAATTGTCTCTTTGGTGTGATCCTTCTACAGATCTACA TCCAGAAAAGGAAAGTGACTTGTGGATGATAAATGGCGGAAGATCTATGCTGATCCAAGGACTTAAGAGAGAACTTCTAA GTGCACAAAAATCTAGGAAAGCTGCATCTGTATCACTACGGACGGCTCTTCAAAAAGCTGCACAGCTACGTCTAACAGAG AAGGAGAAAAACAAGAGTCCTTCCTATGCTATGCGTATATCATTGCAAATTAACAAAGTTGTTTGGAGCATGCTTGTTGA TGGTAAATCTTTTGCTGAAGCCGAGATTAATGATATGATATATGACTTTGACCGGGATTACAAGGATGTTGGTGTTGCTC AATTTACTACAAAATATTTTGTTGTCAGAAACTGCCTGCCTAATGCCAAGTCTGATATGCTTTTGTCGGCATGGGATCCT CCATCCGAATGGGGAAAAAAAGTGATGCTTCGAGTAGATGCACAGCAGGGAGCTCCAAAGGATGGAAATTCTCCCCTTGA ACTTTTCCAGGTAGAGATTTATCCCCTTAAGATCCACTTAACGGAGACAATGTACAGAATGATGTGGGAGTATTTCTTTC CAGAAGAAGAACAAGATTCCCAACGACGACAGGAGGTTTGGAAGGTTTCAACCACGGCTGGTGCAAGGCGTGTAAAGAAA GGTTCATCAGTCCTTGAAGCTTCTGCTTCAAACAGTCATTCAATAAAAGAGTCTGAGACCTCATCCAAATCTGGCATATC TGCAGTGCTATTTCCTGCAACAAATCAGCCTTCTGTCCATGTTGATTCAGCTCAGGCATCCAAAGCTGAAAATGTCAAAG AAAACTCTGGTACTGGTACAACCCCTGAGTTGAGAAGAACATCTTCTTTTGACCGAAGTTGGGAAGAGACTGTTGCAGAA TCTGTAGCAAATGAACTTGTCTTACAAAGTTTCTCTTCCTCAAAAGATGGTCCATTTGGTTCTACGGAGCAACAAGATGA AGCATCTAAGAATAAATCAAAAGATTACAAAGTTGTTAAAGGTGGTCGTGCATCTCATGAAGAAAAAAAGGTAGCTAAGT CACATGAAGAAAAGAGATCTAGGCCACGAAAGATGATGGAGTTTCACAACATTAAAATTAGCCGGGTTGAGTTGTTGGTT ACATATGAAGGGCAAAGGTTTGTTGTGAATGATCTCAAACTAATGATGGATCAATTTCACCGGCCTGAGTTTACTGGGAC TTGGCGAAGACTATTTTCACGAGTTAAGAAACACATCATTTGGGGAGTCCTGAAGTCTGTAACTGGAATGCAGGGGAGGA AATTTAATAACAAAGGTCAGAGTCAGCCTACCGGAGCTGGTGTTCCTGAAATTGACCTTAATTTTAGTGACAATGAAGGC CAGGCAGGAAAATCTGATCAATATCCACCATCTTGGCCTAAGCGTCAAGGTGATGGTGCAGGTGATGGATTTGTAACATC CATTAGAGGACTGTTCAATACTCAACGTCGCAAGGCAAAGGCATTCGTGCTACGAACTATGAGGGGTGAAGCTGAGAATG ATTTTCAAGGTGATTGGAGTGAAAGTGATGTTGAGTTCTCCCCTTTTGCGAGGCAACTCACAATTACAAAAGCCAAGAAA CTTATTAGGAGGCATACTAAGAAGTTTCGCTCCAGAGGACAAAAAGGTTCAACTTCTCAACAAAGAGAATCTCTACCATC ATCACCAAGAGAGACAACCCCATTTGACAGTGATTCTTCAAGTGGATCCTCACCCTATGAAGATTTTCATGAATAG 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0342700.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGTTVHVELGELNLHLADEYQESLKESVFGVESNSASIMHIAKASLDWGKKDMESFEEDGLRCRLGLLVDVTGMGVYLNF KRIASLISTAISFQALLKGLSASKKKLTPSRGHLSKPSGKGTQLLKFNLERCSVHVWGETGLENTIVPDPKRVNYGSQGG RVIINVSADGTPRNANIMSTISDELPKIKYSVSFEIVQFSVCVNKEKQSTQMELERARSVYQEYMEENRPVTKVTLFDML NAKLVKRSGGLKEIAVCSLFSATDITLRWEPDVHLSLIELVLQLKLLIHKSKLQEHGNEHMGDVSHAQDANWKQETTIES GHLEKQKKKESIFAVDVEMLSISAGLGDGVDAMVQVQSIFSENARIGVLLEGLMLSFNGARVFKSSRMQISRIPSVSAST SDAKGHVITTWDLVIQGLDIHICMPYRLQLRAIDDVIEDMIRGLKLIIAAKTNLIFPVKKESSKVKKPSSVQFGCIKFCI RKLTADIEEEPMQGWLDEHYQLLKKEAGELAIRLNFLDELISKAKHSPKSADTIEIDVKDSSTIESTREEIYKRSFRSYY QACQNLVLSEGSGACGEDFQTGFKPSTSRRSLLSISAQDLDVSLKKIDGGDAGMIDVLKKLDPVCFEKDIPFSRLYGANI LLSTGSLVVQLRNYTFPLFSGSSGKCEGRLVLAQQATSFQPQIYQDVYVGRWRKVRMLRSATGTTPPMKTYSDLPLHFQK GEVSFGVGYEPAFADVSYAFTVALRRANLSVRHPGPLILPPKKERSLPWWDDMRNYIHGKISLLFSESRWNILASTDPYE KVDKLQIVTSFMEIHQSDGRVFVSAEDFKILLSSLETLANRRGFRIPTGVSGAFLEAPVFTLEVTMDWDCESGNPMDHYL FALPVEGKPRDRVFDPFRSTSLSLRWNFSLRPFPPSSEKHPTSSITSDNIEESASVFEPPHVSQNVSSVSPTFNFGAHDL AWILRFWSLNYNPPHKLRSFSRWPRFGVPRVARSGNLSLDKVMTEFMLRLDSTPACIKNMPLHDDDPAKGLTFVMTKLKY ELCYSRGKQKYTFESKRDILDLVYQGLDLHMLKAFLNKEASPSVAKVVNMVLKSSQSVSLDKIPSEKVYITDKNRDDGFL LSSDYFTIRRQSPKADPARLLAWQEAGRRNAELTYVRSEFENGSETDEHMRSDPSDDDGYNVVIADNCQRVFVYGLKLLW TIENRDAVWAWVGGLSKAFEPPKPSPSRQYAQRKLHEENKRHDGDDFRQDDVSKCPPTGKITNSPSFQDASTSGLLSSPP NSVKVDNLSSAKSENTNDSDGTRHFMVNVIEPQFNLHSEDANGRFLLAAVSGRVLARSFHSVLQVGYEMIEQALGTTDVH ISEYQPEMTWKRMEFSVMLEHVQAHVAPTDVDPGAGLQWLPKILRSSPKVMRTGALLERVFMPCNMYFRYTRHKGGTPEL KVKPLKELIFNSHNITATMTSRQFQVMLDVLTNLLFARLPKPRKSSLSFPAEDDEDVEEEADEVVPDGVEEVELAKINLE KQEREQKLLLDDIRELSLWCDPSTDLHPEKESDLWMINGGRSMLIQGLKRELLSAQKSRKAASVSLRTALQKAAQLRLTE KEKNKSPSYAMRISLQINKVVWSMLVDGKSFAEAEINDMIYDFDRDYKDVGVAQFTTKYFVVRNCLPNAKSDMLLSAWDP PSEWGKKVMLRVDAQQGAPKDGNSPLELFQVEIYPLKIHLTETMYRMMWEYFFPEEEQDSQRRQEVWKVSTTAGARRVKK GSSVLEASASNSHSIKESETSSKSGISAVLFPATNQPSVHVDSAQASKAENVKENSGTGTTPELRRTSSFDRSWEETVAE SVANELVLQSFSSSKDGPFGSTEQQDEASKNKSKDYKVVKGGRASHEEKKVAKSHEEKRSRPRKMMEFHNIKISRVELLV TYEGQRFVVNDLKLMMDQFHRPEFTGTWRRLFSRVKKHIIWGVLKSVTGMQGRKFNNKGQSQPTGAGVPEIDLNFSDNEG QAGKSDQYPPSWPKRQGDGAGDGFVTSIRGLFNTQRRKAKAFVLRTMRGEAENDFQGDWSESDVEFSPFARQLTITKAKK LIRRHTKKFRSRGQKGSTSQQRESLPSSPRETTPFDSDSSSGSSPYEDFHE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 2131 2131 0.0
PANTHER 1 2131 2131 0.0
Coils 207 227 21 -
SMART 653 801 149 3.2E-53
Pfam 703 800 98 5.3E-5
MobiDBLite 1159 1179 21 -
MobiDBLite 1161 1176 16 -
MobiDBLite 1220 1300 81 -
MobiDBLite 1230 1253 24 -
MobiDBLite 1256 1300 45 -
Pfam 1420 1966 547 4.4E-107
MobiDBLite 1484 1503 20 -
Coils 1512 1532 21 -
MobiDBLite 1758 1783 26 -
MobiDBLite 1764 1783 20 -
MobiDBLite 1799 1827 29 -
MobiDBLite 1799 1832 34 -
MobiDBLite 1853 1903 51 -
MobiDBLite 1867 1903 37 -
MobiDBLite 1973 2020 48 -
MobiDBLite 2081 2131 51 -
MobiDBLite 2093 2124 32 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0342700.9, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…