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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0410000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0410000.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Calcineurin-binding protein cabin-1; TAIR: AT4G32820.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9Y6J0|CABIN_HUMAN Calcineurin-binding protein cabin-1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PM30|A0A0B2PM30_GLYSO Calcineurin-binding protein cabin-1; Found in the gene: LotjaGi1g1v0410000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:90036711..90067328) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATAAATTAAATAAAAAATAGTTAGCGCGACGTCGTTTGTGGAACGGTGAGAAGGGCGTTTTATGTTTCCTAAAATAAAAG CTGAGAAGTCCGTTATGCGACGTCGTTTGTGGAACGGTGTTGAAGGGCGGTTCTGAGAGCGCGCTCACTCTCCCTCCCTC CCTCACAACTGGAGAATAAATTGGAACCCAAAATTCAACAACGCCGGAACCCTAATTCCACACAACAAGATCACGCGAAC AAACACAGTCAGTCACATTCCGATCATCAAATCATGGTGAGTTCACAACAAACGCATCTTCTTCATCACTATCAACCACA TTTGAATTTCTCTACTACCTATCAAGTTGTTTTCATGCTGATGAAGCAAGCGGCTTCGTTTTTGCTTTTTCCAGTTCTCT ATTGCAGCTATCAACGATACCGATACTAAAACCCAGTGGGAACCGCTAGCTCCCACCAAAGAAGCCCAGGCACGTTTCTC TCAAGATTTCGTGTATTAGGGTTCTTAATTTCTCTGCATGTTCGTTGCATTGCCGTTTCTCATTCAAATATAGTGTTTTG TTTTGGTTATGTTATTTCAGGAATTTCATCTTTCTCAAACTTATCATGATGGACTTCTCAAGCTACAAGCCAAAGATTAT GAGAAGGCTCGCGAGCTCTTGGAATCTGTCCTTAAAGATCCTCTTGTTGCTAATGCTCAGGTTTTGGTTTCTGCGTAACA CGATTTTTTTTTTAAATTTTTTATTTTTTTTCTATTGCATTTGTGATGTTATTATCTGTTTTTCAGGTGGAGAGCAGTGC AAGTGACGGTCATCTGTTGCAACTCAGGTTTCAATCTGCATTGTACTATATATATTCTTTGTCAAGTTATTCGTGGTCGT CGTTGTTGTATTTCTAGTACAGTCTCCTCTTTCAATCTGTAGCCTATTCAAGTAAAATTAGACACTAATTTGTTGCAATG 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0410000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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CGGCTTGAAAGGCTCCGGAGTCGTAAACCGGGGAATGAAGAATCTGATTCTTGTGGCAAGGACTGTGCCAAGGTAGTCAG TCAATATCTAGAATCTTTTATTGCTGGTGGATTGAGCGGTCGAGATACTATTAATGGTGATACCACGACACTATCTTGTT TAGGAAATTCTGAATATAATAATGTTTGTGCATTTTTAAGAGAAACTTCAAACAATTATGGTTCCTACCATATGGGGCAC TTGCTTCTAGAAGAGGTTGCAAGACAAGGCCTGAGATATCAGGATGCTTTTGTCAAATTTCTGGAGTTGGAAAAGTTGAC TAGGCATTGGGGAAAGGAGAGAACGGCTGAATGTAATATTTTTCTTGCTGAGCTGTATTATGACTTTGGGTTATGCTCCA CCAATGGTTCTAAACAATCAGAATTTTTATCAGAGGCATCTTATCATCTCTGTAAGATCATAGAGTCTGTAGCTCTTGAG TATCCTTTTCACTTGACCCATGCCCAGAATGAAAGTTGTTTTCTGATTGATGATTTCCAAATGGCTAGTGGAACATCAAT AGATACCTCCACTGAGAGCAGTTCACATTTAGACAGCTCACTTCTGATGAAAAACAGTTCATTCTGGGCTCGATATTTCT GGCTAAGTGGGAGATTGTCTATTTTTGATGGCAACAGGGAAAAAGCTTGTGAAGAACTTTGTACTGCTTTGTCACTTTTG GCAAAGAGGGATAATATGGAACATTCTCCAGGTCCAGTCTGCCGCCCACATTGCAAGGGTGTAAAAGAGCTAAACATTGA CAGAGTTCGTTACGAAATTAACATATTAAAGGTCAATTTCTTGATGGAAAAGTCTGTCATTAAGATGATGGAACAAGAAA AGTTTCTTGAGTGTGTATCCCTGCTTTCTCCACTTATGTTTTCCACACAGGATGTCTACGTCGATTCATTTTCTTTATTC 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TTGTGCAATGACTCGATTGAATGTGAAAACGAACTTTCAGAAGATGAAAGGGATGAACTTGAGTCTAAAATTGACAGTGC CTTAGATCAGTGCTTTTTCTGTTTATATGGATTAAATCTAAGATCGGATTCATCATATGAAGATGATATGGTGACACACA AAAATACAAGCCGAGGAGACTATCAAACCAAGGAACAGTGTGCTGATGTTTTCAAGTATGTTCTTCCCTATGCAAAGGCA TCTTCTAGGACTGGACTGGCCAAACTTCGTAGAGTTTTAAGAGCTATACGGAAGCACTTTCTGCAGCCACCAGACGATCT GTTGGAAGGAAATCCTATAGACAAGTTTCTGGATGATCCTAATCTATCTGAAGAAAATCTCTCAGAGGAGGCTGGGGCTG ATGGTTTTCTTGAAACTCTAACTAAGATCATGTTCCCTGATGCGGGAGGCCTTGCACAATATAAAACAACACTATTGAAG AGGTCTGAGCCATATTTGGAGGTTTACTGTAACTTGTATTATTTCTTAGCTCTGTCCGAGGAAATGAGCGCAACAGATAA ATGGCCTGGATTTGTGCTGACCAAGGAAGGAGAAGAATTTGTTGAACAAAATGCAAAGCTCTTCAAATTCGACCTCGTAT ACAATCCGTTGCGCTTTGAAAGCTGGCAACGGCTTGGAAATATTTATGATGAGGAAGTAGATTTATTGCTAAATGATGGT AGCAAGCACATCAATGTGGTAGGATGGAGGAAGAATCCTACTTTATCTGAGAGAGTGGAAACAAGCCGGAGGAGGAGTAG ACGGTGCCTACTAATGAGTTTAGCTTTGGCAAAGACATCTGCTCAACAGTGTGAGATACATGAGCTTTTGGCATTGGTTT ATTACGACAGCCTTCAAAGTGTAGTCCCCTTTTATGATCAGAGATCTGTTTTGCCCTCAAAGGATGCAACATGGGTGATG TTTTGTGAGAACTCAATGAAACATTTTAAGAAAGCCTTCTCATTGAAGCAAGATTGGTTGCATGCATTTTACTTGGGTAA ACTCAGCGAGAAGCTTGGATATTCACTTGAAATTGCATTATCGTACTACAACAATGCTATTGCTTTGAACACATCAGCTG TTGATCCTGTGTATAGGATGCATGCCTCACGCTTGAAGCTATTATTTAAGTCAGGAAGACAGAATTTGGAGATTTTGAAG GTTCTTTCATTAAACTCCTTTAATCTATCTGTAAAAGAAGCCGTTGCGAGTATCCTTGGTGATATGGATAGCTCGTTCAT AGATACTAAGGAGGAATGTGTTCATGCCAATTCTGTGGAAGCGAAGCATGAAGGGTTGCTGAAATTGGATAAAGTATGGT CCATGCTTTACAGCGATTGCCTTTCTGCGCTTGAAACTTGTGTAGAGGGGGATCTCAAACATTTTCATAAGGCCAGATAC ATGCTGGCTCAAGGGCTGTATAAAAGGGGTGAAAGTGGTGATATAGAAAGGGCAAAAGATCAACTATCATTCTGCTTCAA ATCTTCACGCTCATCATTTACAATAAATATGTGGGAAATTGATAGCACAGTAAAAAAGGGAAGGCGCAAGACACCTGGTT CTGCTGGGAACAAAAAAGCCCTTGAGGTTAACTTACCTGAAAGTTCTCGAAAGTTCATTACATGCATTCGAAAGTATGTG CTGTTTTATCTCAAACTATTGGAGGAGACGGGAGATAGAGGTATTCTTGAACGTGCATATGTTTCTCTTCGGGGAGATAA GCGGTTTTCATTATGTATGGAAGATCTTGTTCCAGTGGCCATTGGAAGATATTTAAGGGCACTGATTTCAACTTTGTGCC ATTCTGAGACTACTGCCTCTGGGTCAGTGAGCAATTCTGATAATGTGCTGGAGAGGATGTTTGCTTTGTTCATCGAGCAA GGGAGCTTATGGCCCGAAATATACAGCTTGCCTGAAATTGAAGGCCCAGAAACATCAGAGACTATCATATATGGATATCT TCATGAACATATTGTCTTGTTGGAAAAGAATGGAAAAGTGGAAACCCTGGAAGCAATAAATGAGAAAATTCGGAGACGTT TTAAGAACCCAAAGTTGTCAAATAGTAGTTGTGCAAAAGTTTGCAGGCACGCTTCTGTTGCTTGGTGCCGATCTCTTATA TATAATCTGGCACAAATCACTCCTTTATCATGTGGATTTTCAAATGGGATTCAGGCCCTTAATTTGACTGATGGTGGGAC GGATAGTAGCCAATTGCTCTGTATTGATTTGCAGCCACGTGAATTATGGGGTACAGCTTTTGAAGATCCAACTCATTTAG AAAAGATTGAAACAAAATGGAGTGCCATTTTATCTAAAGTAAAAAATATAATGATCAAGAAAGTTTCTGATGAAAATTTG GAAACTGCTAGCACTTTGCTCAAAGCTTGCTATAATTTTTACCGGGAGAGTTCTTCTGTGGTGCTGGCGTCTGGCCTCAA CTTTTATTTGATTCCATCCCAATTGGTAACAGAAACACCATTCAACCCAAGTATGGTTGGGATTGAAGCACTTGATCTGA GCATTCCAAGGAAGCTTCTCTTGTGGTCCTATGCATTATTGCATGGACGTTATGCAAATATCTCGGTTGTTGTAAGGCAT TGTGAAGAAATTTCAAAGTCGAAGATTAAAAGAGGAAGTGGAACCTCACCTGCGTTTTCAAGCACACCTGCTTCTACCTC TACTCATCCAGGTAGTGGCAAAAGTGGACCAAACTCTGCCGGAGGAACTGATGTTGATTGCACTCCATTTTCTAGCAGTA ATAATACCACTAACGTTGTGAATTCCTCCAATGAGATTCAGAAGAATCTCTTTGGTTCTCCCCAATTGCATCCATGTACC ACCAATGATGATGCAGAAAGAAACAGTTTGAAGGCACATGAAGTAGATAATGTCCAAGATTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0410000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLFQEFHLSQTYHDGLLKLQAKDYEKARELLESVLKDPLVANAQVESSASDGHLLQLRFLALKNLATVFLQQGSTHYENA LHCYLQAVEIDSKDSVVWNQLGTLSCSMGVLSISRWAFEQGLLCSPNNWNCMEKLLEVLIAIGDEVACLSVAELILRHWP SHSRALHVKNTIEESEPLSFAPKGIDKLEPKHVRLKFPDKRKATKENLDEDVPYKKLKQNKDLHLKEASWVALADALLET LLPLNLQSSDMDSEKASYSPDIRISIKLTCGSEAVMNTVEVKGSNSESSGFIDGNIDRSSIPKAKEANIQEEQPHERRSS RLERLRSRKPGNEESDSCGKDCAKVVSQYLESFIAGGLSGRDTINGDTTTLSCLGNSEYNNVCAFLRETSNNYGSYHMGH LLLEEVARQGLRYQDAFVKFLELEKLTRHWGKERTAECNIFLAELYYDFGLCSTNGSKQSEFLSEASYHLCKIIESVALE YPFHLTHAQNESCFLIDDFQMASGTSIDTSTESSSHLDSSLLMKNSSFWARYFWLSGRLSIFDGNREKACEELCTALSLL AKRDNMEHSPGPVCRPHCKGVKELNIDRVRYEINILKVNFLMEKSVIKMMEQEKFLECVSLLSPLMFSTQDVYVDSFSLF LADKKDEKITSVELMALDILTEACQKSRSMDVEMYFNCHYRKLKILMAMMGLNKCVTSFNSSDQTLGLSASSNSGIDSNE SSNKHFSHLVVEEVKALSDCISKVKEVIDHQGDSDALIVSTSSICHLQSLLLLIMSYFANVLVCNKASAQVISDPVKSSC FVDAAIIFCKLQHLSPNTPIRTQVDLIVATHDLLAEYGLCCVGEGGKGEEGTFLRFAIKHLLALDMKLKSRFNLLDKKSM HCEEVPEDAIVNLSVEDLKSNTSDIWNKVDDVNSVKKDVSEGIMSEGISSCKVHDKDSKEVEFGNHGGSQTDSEFVKGEN LCNDSIECENELSEDERDELESKIDSALDQCFFCLYGLNLRSDSSYEDDMVTHKNTSRGDYQTKEQCADVFKYVLPYAKA SSRTGLAKLRRVLRAIRKHFLQPPDDLLEGNPIDKFLDDPNLSEENLSEEAGADGFLETLTKIMFPDAGGLAQYKTTLLK RSEPYLEVYCNLYYFLALSEEMSATDKWPGFVLTKEGEEFVEQNAKLFKFDLVYNPLRFESWQRLGNIYDEEVDLLLNDG SKHINVVGWRKNPTLSERVETSRRRSRRCLLMSLALAKTSAQQCEIHELLALVYYDSLQSVVPFYDQRSVLPSKDATWVM FCENSMKHFKKAFSLKQDWLHAFYLGKLSEKLGYSLEIALSYYNNAIALNTSAVDPVYRMHASRLKLLFKSGRQNLEILK VLSLNSFNLSVKEAVASILGDMDSSFIDTKEECVHANSVEAKHEGLLKLDKVWSMLYSDCLSALETCVEGDLKHFHKARY MLAQGLYKRGESGDIERAKDQLSFCFKSSRSSFTINMWEIDSTVKKGRRKTPGSAGNKKALEVNLPESSRKFITCIRKYV LFYLKLLEETGDRGILERAYVSLRGDKRFSLCMEDLVPVAIGRYLRALISTLCHSETTASGSVSNSDNVLERMFALFIEQ GSLWPEIYSLPEIEGPETSETIIYGYLHEHIVLLEKNGKVETLEAINEKIRRRFKNPKLSNSSCAKVCRHASVAWCRSLI YNLAQITPLSCGFSNGIQALNLTDGGTDSSQLLCIDLQPRELWGTAFEDPTHLEKIETKWSAILSKVKNIMIKKVSDENL ETASTLLKACYNFYRESSSVVLASGLNFYLIPSQLVTETPFNPSMVGIEALDLSIPRKLLLWSYALLHGRYANISVVVRH CEEISKSKIKRGSGTSPAFSSTPASTSTHPGSGKSGPNSAGGTDVDCTPFSSSNNTTNVVNSSNEIQKNLFGSPQLHPCT TNDDAERNSLKAHEVDNVQD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 4 | 1927 | 1924 | 0.0 | ||
| Gene3D | 5 | 172 | 168 | 1.4E-12 | ||
| SUPERFAMILY | 12 | 147 | 136 | 1.63E-12 | ||
| ProSiteProfiles | 59 | 128 | 70 | 11.046 | ||
| MobiDBLite | 283 | 339 | 57 | - | – | |
| MobiDBLite | 304 | 339 | 36 | - | – | |
| Coils | 963 | 990 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 1849 | 1940 | 92 | - | – | |
| MobiDBLite | 1850 | 1923 | 74 | - | – | |
| MobiDBLite | 1924 | 1940 | 17 | - | – | |
| Coils | 1935 | 1940 | 6 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Biological process | DNA replication-independent nucleosome assembly | The formation of nucleosomes outside the context of DNA replication. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0410000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…