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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0430600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0430600.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Subtilisin-like protease; TAIR: AT1G20160.1 Subtilisin-like serine endopeptidase family protein; Swiss-Prot: sp|Q9LNU1|CRSP_ARATH CO(2)-response secreted protease; TrEMBL-Plants: tr|V7AU13|V7AU13_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0430600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:92549928..92583885) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTGAAGCCTAAGTGCAGTGCGCCTAACTGCATAAGCAATACGCATGCCATGATTCTCCACCACCGATCACAGATTGCAA CTTAATTACTTTTACCGTAGATCATGAATCATGATGATCAGCTGCTGACACAATTAAGCACTGACTAGTAGAAGCCACAT TAATTGATTTTGATATATATTTACCAATTATGCATGCTCCTGACTCCTCAATGTCATGGTGTGTGTGAGCTGAGTTCTAT ATATAGGTGTGAGGTTTTACGCATCTACACAAATTGAGCACCAACAAAGTGCAACATGAAAGGACATTCAGTTCTATTGC TATTATTCAACTCTCTCATCCTTTTTAATCTTGGAATCATTGAAGCAGGGAGTGGTAATGGTGCCACTAAAAGTAATCAC AATGAGGTTTATATTGTGTACATGGGAGCTGCAGATTCAACAAATGCTTCCCTCCGGAACGACCATGCTCATGTTCTGAA TACAGTGCTAAGAAGGTACAACATATAATTGCACACACACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATAT ATATATATATATATATTATAGGACACATAACTGAATTTGATATATATGTCACTTAATTAAGGTATACTTACACTAATTAC ATAAATTATGAAAGGAATGAGAGGGCTCTAGTACACAACTACAAACATGGTTTCTCAGGATTCGCTGCTCATTTATCAAA AGAGGAGGCAAGTTTAATTGCTAAGAAACCTGGAGTGGTGTCTGTTTTCCCTGACCCCATTCTGAAACTGCACACAACAC GTTCTTGGGAATTCCTCAAGTACCAAACTCATGTCAAAATTGACACTGACCCAACCGTCACCAATTCTTCTTCATCATCA GACATCGTCATTGGCATCATAGACACAGGTTAGTTATAAACTTATAATTACTTTTAAACGTACATTTATTTTATTTGTAT 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GTATTGTTTTTTCTCAATTTTGGAAGACCCTTTCCTGCGTTTGCTTGTTTTTCTTCATTTATGTGAAGTTTGCCATGTTT TGCACCTGCTTGAAGTTGAAAAAAACGTGTAATTTCCTTGCTATCTTGCTGCCACATAGTATATTATGGTATTTTGATTT TTTTTATTGTCAACCGAGTCAAACGGTTCAACCAGTGACCCAGTGGTTGAACCATTGACTCATTGACCCAGTGCCTCGAC CGAGTCGATCACCGGTCCGAGTCTGATAACACTGCTATCAATGGTCTAAAACCGTCATAAAGTCTCGTCATTATCAACGA TTATTTTGTCTAAGAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0430600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAAGGACATTCAGTTCTATTGCTATTATTCAACTCTCTCATCCTTTTTAATCTTGGAATCATTGAAGCAGGGAGTGG TAATGGTGCCACTAAAAGTAATCACAATGAGGTTTATATTGTGTACATGGGAGCTGCAGATTCAACAAATGCTTCCCTCC GGAACGACCATGCTCATGTTCTGAATACAGTGCTAAGAAGGAATGAGAGGGCTCTAGTACACAACTACAAACATGGTTTC TCAGGATTCGCTGCTCATTTATCAAAAGAGGAGGCAAGTTTAATTGCTAAGAAACCTGGAGTGGTGTCTGTTTTCCCTGA CCCCATTCTGAAACTGCACACAACACGTTCTTGGGAATTCCTCAAGTACCAAACTCATGTCAAAATTGACACTGACCCAA CCGTCACCAATTCTTCTTCATCATCAGACATCGTCATTGGCATCATAGACACAGGTGTATGGCCTGAGGCGGCAAGCTTT ATGGACAAGGGTCTGGATCCTGTTCCATCAGGTTGGAAAGGCACCTGCATGAAATCACAAGATTTCAATTCATCTAACTG TAACAGGAAGCTAATCGGTGCAAGGTATTACCCTGACCCACAGTCAGACGATGACAGTGCCAGCACAGCAAGAGACTCAA ACGGGCATGGGACCCACACGGCATCCACAGCGGTGGGAGCCACCGTGCTCAACGCCTCATTCTACGGTCTGGCGGAGGGG ACCGCCAGGGGTGGGTCCCCTGAATCCAGGTTGGCGGTTTACAGAGTGTGCTACGACTTCGGCTGCCGTGGCTCCGCCAT CCTCGCCGCGTTCGACGACGCCATCGCTGATGGAGTGGACGTGCTATCCCTCTCGCTCGGGTCGCCGTCGTATCTCCGAC CAGAATTGACCACGGATCCAGTCGCCATCGGAGCGTTCCACGCCGTGGAGCGCGGCATCGTGGTGGTCTGCTCCGCCGGG AATGATGGACCGGATGTGAACACCGTTGTGAACGACGCTCCTTGGATCTTAACCGTTGCAGCCACCACCATTGACCGTGA ATTTCAGTCTAATGTTGTCTTGGGTGGTAACAAAGTGATCAAGGGTGAAGCTATAAATTTCTCACCTCTTTCAAATTCCC CTGACTATCCATTGATATATGGTGAGTCTGCCAAGGCAAGCAGTGCAAAATTGGATGAGGCAAGGCAGTGCCAGAGTGAT TCATTAGACGGGACTAAAGTTAAAGGAAAGATTGTGATATGCAATGGCAAAGGTGACACATCTTCAACTAGAGAATTAAT TGACACGGTGAAATCAATAGGAGGATCAGGTCTTGTTCACATTACTGACCAAAATGGAGCAGTGGTATCAAATTATGGGG ACTTCCCAGCAACTGTGATAAGTTCAAAAGATGCCACCACAATCCTTCAGTATGCCAATTCAACCAGCAATCCAATGGCA ACAATTCTACCAACAGTTTCTGTCACTGATTACAAGCCTGCACCAATGGTGGCATATTTTTCATCAAGAGGGCCTTCAAC GCTATCAAAGAACATTCTCAAGCCTGACATTGCAGCACCAGGAGTTGACATTCTTGCAGCATGGATTGGCAATGATGCAG ATGATGTTCCAAAAGGAAAAAAGCCCTCACAATACAACATCATTTCAGGGACTTCCATGTCATGCCCTCATGTTTCAGGC CTTGCAGGCAGCATTAAATCTCGCCACACCACTTGGAGTGCCTCTGCCATCAAATCTGCCATCATGACCTCTGCAACTCA AAACAACAATTTGAAGGCTCCCATGACAACAGATTCAGGGTCAGTAGCCACACCTTATGACTATGGAGCAGGGGAAATGA CAACCTCTGCATCATTTCAACCAGGGCTAGTTTACGAAACGAGCACCACTGACTACCTAAACTACTTGTGTTACATTGGA CTTAATGTAACCACGATTAAGGTCATTTCCAGAACTGTCCCTGATAGCTTCACTTGCCCCCAGGATTCAAGTGCTGATCA TGTTTCCAACATCAACTACCCTTCCATAGCAATCACCAATTTCAATGGGAAAGGAGCAATAAACGTGAGTAGAACTGTTA CAAACGTTGGTGAAGAGGATGAAACAGTTTACTCCCCCATTGTTGATGCTCCCAGTGGGGTAAACATCAAGTTAATTCCA GAAAAACTCCAATTCACAAAAAGTAGCAAAAAACTAAGCTACCAAGTTATTTTCTCTTTGACTTCTTCGACCTCGCTGAA AGAAGATCTATTTGGATCCATTGCCTGGAGTAATGGTAAATATATTGTTCGAAGTCCTTTCGTACTAGCTAAGTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0430600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKGHSVLLLLFNSLILFNLGIIEAGSGNGATKSNHNEVYIVYMGAADSTNASLRNDHAHVLNTVLRRNERALVHNYKHGF SGFAAHLSKEEASLIAKKPGVVSVFPDPILKLHTTRSWEFLKYQTHVKIDTDPTVTNSSSSSDIVIGIIDTGVWPEAASF MDKGLDPVPSGWKGTCMKSQDFNSSNCNRKLIGARYYPDPQSDDDSASTARDSNGHGTHTASTAVGATVLNASFYGLAEG TARGGSPESRLAVYRVCYDFGCRGSAILAAFDDAIADGVDVLSLSLGSPSYLRPELTTDPVAIGAFHAVERGIVVVCSAG NDGPDVNTVVNDAPWILTVAATTIDREFQSNVVLGGNKVIKGEAINFSPLSNSPDYPLIYGESAKASSAKLDEARQCQSD SLDGTKVKGKIVICNGKGDTSSTRELIDTVKSIGGSGLVHITDQNGAVVSNYGDFPATVISSKDATTILQYANSTSNPMA TILPTVSVTDYKPAPMVAYFSSRGPSTLSKNILKPDIAAPGVDILAAWIGNDADDVPKGKKPSQYNIISGTSMSCPHVSG LAGSIKSRHTTWSASAIKSAIMTSATQNNNLKAPMTTDSGSVATPYDYGAGEMTTSASFQPGLVYETSTTDYLNYLCYIG LNVTTIKVISRTVPDSFTCPQDSSADHVSNINYPSIAITNFNGKGAINVSRTVTNVGEEDETVYSPIVDAPSGVNIKLIP EKLQFTKSSKKLSYQVIFSLTSSTSLKEDLFGSIAWSNGKYIVRSPFVLAK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 29 | 29 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 24 | 24 | - | – | |
| Phobius | 1 | 5 | 5 | - | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 24 | 24 | - | – | |
| Phobius | 6 | 17 | 12 | - | – | |
| Phobius | 18 | 29 | 12 | - | – | |
| Gene3D | 23 | 113 | 91 | 4.2E-24 | ||
| PANTHER | 25 | 769 | 745 | 1.5E-269 | – | |
| PANTHER | 25 | 769 | 745 | 1.5E-269 | – | |
| Phobius | 30 | 771 | 742 | - | – | |
| Pfam | 38 | 113 | 76 | 1.4E-16 | ||
| CDD | 110 | 586 | 477 | 1.00068E-127 | ||
| SUPERFAMILY | 113 | 618 | 506 | 1.07E-70 | ||
| ProSiteProfiles | 117 | 619 | 503 | 27.539 | – | |
| PRINTS | 141 | 160 | 20 | 7.1E-12 | ||
| Pfam | 142 | 588 | 447 | 2.8E-46 | ||
| Gene3D | 143 | 633 | 491 | 2.0E-170 | ||
| MobiDBLite | 198 | 222 | 25 | - | – | |
| PRINTS | 212 | 225 | 14 | 7.1E-12 | ||
| Gene3D | 345 | 489 | 145 | 2.0E-170 | – | |
| CDD | 351 | 482 | 132 | 4.38932E-29 | – | |
| PRINTS | 549 | 565 | 17 | 7.1E-12 | ||
| ProSitePatterns | 550 | 560 | 11 | - | ||
| Gene3D | 636 | 771 | 136 | 6.8E-31 | – | |
| Pfam | 670 | 768 | 99 | 2.8E-24 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Serine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a catalytic mechanism that involves a catalytic triad consisting of a serine nucleophile that is activated by a proton relay involving an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine). | ||
| Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0430600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…