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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0547400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0547400.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase family protein; TAIR: AT5G38210.1 Protein kinase family protein; Swiss-Prot: sp|Q8VYG0|LRL13_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.3; TrEMBL-Plants: tr|A0A151TD85|A0A151TD85_CAJCA Putative serine/threonine-protein kinase family; Found in the gene: LotjaGi1g1v0547400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:107720410..107739945) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGGGATAGCTCGAGGGCTAGATTACTTACATCAAGGATGCAATACAAGGATCTTACACCTTGATATCAAACCTCAAAACA TTCTCTTGGATGAAGACCTATGCCCCAAAATAGCTGATTTTGGACTAGCTGATTTTGCACTTTCCAAATGAACTCCCTGC TGATTCTCCTCCCTCCTATCTCCATTCTTCAACTCACACTCCTCTTGATACTGATTCACACACCTCTACCTTCAACCTCC AATGATTATTACAGAGATTGCAACAATCTATTTAGTTGTGGTGATATAAGAAACATTGGTTTTCCTTTCTGGGGAAAAAA TCGCCCAAATGGGTGTGGCCACCCTCTTTTGCATCTCACCTGTGAAGAAAATCCCAGCTACATGAACCTCAATGATGTCA GGTACAAAGTTTTGGAGGCCAAACCTGATGAAAAAAGTTTGAGAGTCACCAGAGTTGACTACTTGCAAGAACTCTGCCCT TCAATATTTGTCAACACAAGCCTTGACCCTAAGCTATTTGTTTTGGAGTCTCAGTATCAAAATCTTACTCTCTTCTATGA CTGTGTTGTTCCAAATGCTGTACCCTTTCCTTGTGTCCCAAATTCGGGTTCTGGTCAACATGTTTATGCTCAGTTGGGGT CTTTTGATTTTACCTCTATGTTTTGTAAACAAAGTGTGGTTGTTCCTGTCCCTAAGGTGTTTGTTGATATTACTGATGTC AACAAAACACTAAGTGCAATCAGAAATGGTTTTGTGGTGAATTGGATAGCAGGAATTCAAGAATGTGAAGAGTGCAGAAA AGCAGGAGGAGTGTGTGGCTATGACTCAATTAGACCAACCTGCTACTGCAGAGAAAGAGATCAAACTTGTCCTGAAGAGC TTCCATCTTCAGGTTTGTTGTCTAAATTGAGAATTTATGATCACTGCCAACTGCATTTTTCTGTTCTCTATAAGTATCAA 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GCAGATTCTAGAAATGGAAGCTGATAGGCTTGTAAAAACACGTTCTTTGCTTAGGGAGATTTTGATGAAGGGGTTTCATG TGAATTTTAGAAATCCTTATGAGGATGAATGCTCTGAGTGTCTTCGTTCTGGTGGTCAGCAATGTGGGTTTGATTCTGAA CCCATTTGTATTTGTGGTGATCGGTTGTGTTCATTTCCAGGTATGAATCCCAGCTTTTCTTTTGCTAAATTATGGTGTAG GAAAATGATTCGTGGACATCTGCATAGTGCAGAGACATGGAGAGTGAAAAATAATAGATGTGAAAAGAAGACAAACATAG AGAGAAAAATATAGTGTATGTGGTGTGTCTAACTGTTTGGATGTCAAAGTATCATTACTGACCAAACGAATTTTCTGATT GTGATTCTTATTTCATGCATATTTAATGGTTTTAAGGGATGATTTGTTTGTATCACTAGAAGTTAATAGGTTGTGATGTT GTGTATGCTAGTGCTAGTAGTTACAATCTCAGTATTGTATGCTAATGATGCTTTATTCCAACCCAAACAACATTGACAGC TTCTATTTTTCTTTGGGGAAGGTAAAATCCTATGCCATTTGGCAACTAATGATGAATTGGTCAACTTTCATTCCGTAACT TTAAGAAGATTTATATATGTTTGAAATAGCTACTTCTTAGAATCAATTCTAGTTATCAAAAGCTACTCACGAAAGCTTTT CCCCATAATGGATTTTGGCTTTAGAATCAATTGGTGAAGGATTTCTAAATGGTTAACTTTCTCCAGCAACTAAAATTTTT GCAGTTAGAATGAAGTTACAAGTCCATTGTTAATCCAAGGATAAGGGTAATAAAAAAAAGTTGTGTGAATGAATTATCTT TGTAAGGAAGAGAAGATGAGGCTCATTAGTTTTTTGTTCATATCTGTAATTTGAACTTGAGTACTTTTTTCATGCCTTTC CCATCCTTTTCTTATTCCTTGTTCTGAAATTTTGCAGGTAAAGGCGGTTCTACCAAAGTAGGCGTTATAATAGGTAACTA TCATTTTGTTGATAGAGGGATTAAATTTGGAAATAATATCTTACTTATGCCTATCATTATTTCCTTCAGGTGTTGCTGCA GGAGTTGCAGTCCTTGTTGGCCTTCTTTGCTGTGGGTTCTTTATGTTCCGACGAAAGAGAAAAATGGCTAAGCAATCAAC AGGCAAGGACCTCCTCATGCCTACTACTACTTCAAGGCCAAGCAGTTTCACTCTCACCTCTGCCACTAACTCTTCTCAAA GTGTCTCTTCTTACCCCTCTTCCACGTCTGGCACAGTGCCTCCCAAAAGTTTCTACTTTGGCGTCAAGGTGTTTACCTAT GAAGAACTAGAGGAAGCTACAAACGGTTTTCACACTTCCAGAGAACTTGGTGAAGGAGGTTTTGGCACAGTTTACAAAGG TAACAAAACAAAATAATCAGAGTCTGTTGGATTATTGCTTTGTAAAGTAGTTTTTAGTTTTCAAAAACAGAAAATGGAAA AAACTTGTTTGATACAAACTGTTTTAAAAAGTTGTTCTGAATTTGATTTGCTGTTTTTTAAAATTAAAATCTCAAAAAAT CTCTGAGATGTTTTGGGGATTTTTTCTTAGTGTCCAAGTCACAAGTGTTTCAGCTTTGCAAAACATCTCGTTTAAACTTT TTTTCTTTTCTTTTCTTCTGAAAAAAAAGGTTTCAAAAACAGTTTTTGGAAACAGTTTATAAATTCAGAAAACTGAGAAG GGAATCAAACAAGTCCTCAGTTTCTGTGTGTTCCTACCAATTTCTTACATAAATATTTTCCCTGGTGTATGTTTCTGTTT TTTTTTAAACTCTGTATCTTCTGATTGTTAATCAGGTGAACTCCAAGATGGACGTGTGGTTGCCGTGAAACGCCATTATG AAAGCAATTTTAAACGTGTTGAGCAGTTCATAAATGAAGTTAGGATTCTAGCTACCTTACGGCACAAGAACCTGGTGACA CTCTATGGATGCACCTCTAGACATAGCCGAGAGCTTCTCCTTGTCTATGAATTCATATCTAATGGAACAGTGGATGATCA TCTTCACGGGAAACGGTCGAAGTCCGCTTTACTTCCTTGGCCTGTCCGATTGAACATTGCAGTAGAAACAGCTGAAGCAC TAGCCTACCTCCATGCAAATGATGTCATACACCGCGATGTTAAATCCAACAACATCCTCTTAGATGATAAATTTCATGTT AAGGTTGCTGATTTTGGTCTCTCGCGGTTGTTCCCCACTCATGTCACTCATGTGTCAACTGCTCCACAAGGAACACCTGG TTATGTTGACCCTGAGTATTATCAGTGCTACCAACTCAATGATAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGGGTTGTCTTAGTTG AGCTCATATCATCATTACAAGCTGTGGACGTTAGCCGGCACCGCAGTGACGTGAACTTGGCGAACATGGCCATCAATAAA ATTCAGAACCAAGAATTACATGAGTTGGTGGATTTGGATCTTGGATTTGAAAAGGACGATGGTGTGAGGAGGATGATGAC AGGAGTGGCGGAATTAGCCTTTCGATGTTTGCAACAGCAGAAAGAAATGAGGCCCAACATGGATGAGGCGGTGGAAATCT TGAGAGCAATCAAGAGTGATGAGCTTGACACAAGGGAAGCAAAAGTAGTGGATGTTGTGACAGATGAAGTTGTGCTTCTG AAGAAGGTTCCTTCACCAGTTTCACCAGATTCAGTTGCTGATAAATGGGTTAGCAGCTCTACTGCATCTAATTCCTTATA GATTCTAATACACTTCCTCTGTATTGGTGCCAATGAGCTAGTACAAAGCTCATATTGGCCTTCACATTTCTTTTGTCTAA ATGTTTCCATTTCAAGTTTACATGTATGTTATCATGGCAATAGTAGTAGTAGCTTTGAGAGGTAGATTTCACTGTTGATC CAAAAACAAGGAATACACATAGGAGAGAGAATTTTCAAATATTTATGATGTAAATACTCCCATATATCTTAAGTATATAT CTTTGATGTGTTTAAAAATGTAACTGATATATACTTTGGATTCAGCGTATTTACACTGACATCCAATGATTGTTTGCCAA ATCAGAACATTGACATCATGTTACAGTTTAAGGTGATGTTAGCTAATAACCATTGAATGTCAGTGTAAAGAAGTTTTACA TCCATGAAAATTAAAC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0547400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAACTCCCTGCTGATTCTCCTCCCTCCTATCTCCATTCTTCAACTCACACTCCTCTTGATACTGATTCACACACCTCT ACCTTCAACCTCCAATGATTATTACAGAGATTGCAACAATCTATTTAGTTGTGGTGATATAAGAAACATTGGTTTTCCTT TCTGGGGAAAAAATCGCCCAAATGGGTGTGGCCACCCTCTTTTGCATCTCACCTGTGAAGAAAATCCCAGCTACATGAAC CTCAATGATGTCAGGTACAAAGTTTTGGAGGCCAAACCTGATGAAAAAAGTTTGAGAGTCACCAGAGTTGACTACTTGCA AGAACTCTGCCCTTCAATATTTGTCAACACAAGCCTTGACCCTAAGCTATTTGTTTTGGAGTCTCAGTATCAAAATCTTA CTCTCTTCTATGACTGTGTTGTTCCAAATGCTGTACCCTTTCCTTGTGTCCCAAATTCGGGTTCTGGTCAACATGTTTAT GCTCAGTTGGGGTCTTTTGATTTTACCTCTATGTTTTGTAAACAAAGTGTGGTTGTTCCTGTCCCTAAGGTGTTTGTTGA TATTACTGATGTCAACAAAACACTAAGTGCAATCAGAAATGGTTTTGTGGTGAATTGGATAGCAGGAATTCAAGAATGTG AAGAGTGCAGAAAAGCAGGAGGAGTGTGTGGCTATGACTCAATTAGACCAACCTGCTACTGCAGAGAAAGAGATCAAACT TGTCCTGAAGAGCTTCCATCTTCAGGTAAAGGCGGTTCTACCAAAGTAGGCGTTATAATAGGTGTTGCTGCAGGAGTTGC AGTCCTTGTTGGCCTTCTTTGCTGTGGGTTCTTTATGTTCCGACGAAAGAGAAAAATGGCTAAGCAATCAACAGGCAAGG ACCTCCTCATGCCTACTACTACTTCAAGGCCAAGCAGTTTCACTCTCACCTCTGCCACTAACTCTTCTCAAAGTGTCTCT TCTTACCCCTCTTCCACGTCTGGCACAGTGCCTCCCAAAAGTTTCTACTTTGGCGTCAAGGTGTTTACCTATGAAGAACT AGAGGAAGCTACAAACGGTTTTCACACTTCCAGAGAACTTGGTGAAGGAGGTTTTGGCACAGTTTACAAAGGTGAACTCC AAGATGGACGTGTGGTTGCCGTGAAACGCCATTATGAAAGCAATTTTAAACGTGTTGAGCAGTTCATAAATGAAGTTAGG ATTCTAGCTACCTTACGGCACAAGAACCTGGTGACACTCTATGGATGCACCTCTAGACATAGCCGAGAGCTTCTCCTTGT CTATGAATTCATATCTAATGGAACAGTGGATGATCATCTTCACGGGAAACGGTCGAAGTCCGCTTTACTTCCTTGGCCTG TCCGATTGAACATTGCAGTAGAAACAGCTGAAGCACTAGCCTACCTCCATGCAAATGATGTCATACACCGCGATGTTAAA TCCAACAACATCCTCTTAGATGATAAATTTCATGTTAAGGTTGCTGATTTTGGTCTCTCGCGGTTGTTCCCCACTCATGT CACTCATGTGTCAACTGCTCCACAAGGAACACCTGGTTATGTTGACCCTGAGTATTATCAGTGCTACCAACTCAATGATA AGAGTGATGTTTACAGCTTTGGGGTTGTCTTAGTTGAGCTCATATCATCATTACAAGCTGTGGACGTTAGCCGGCACCGC AGTGACGTGAACTTGGCGAACATGGCCATCAATAAAATTCAGAACCAAGAATTACATGAGTTGGTGGATTTGGATCTTGG ATTTGAAAAGGACGATGGTGTGAGGAGGATGATGACAGGAGTGGCGGAATTAGCCTTTCGATGTTTGCAACAGCAGAAAG AAATGAGGCCCAACATGGATGAGGCGGTGGAAATCTTGAGAGCAATCAAGAGTGATGAGCTTGACACAAGGGAAGCAAAA GTAGTGGATGTTGTGACAGATGAAGTTGTGCTTCTGAAGAAGGTTCCTTCACCAGTTTCACCAGATTCAGTTGCTGATAA ATGGGTTAGCAGCTCTACTGCATCTAATTCCTTATAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0547400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MNSLLILLPPISILQLTLLLILIHTPLPSTSNDYYRDCNNLFSCGDIRNIGFPFWGKNRPNGCGHPLLHLTCEENPSYMN LNDVRYKVLEAKPDEKSLRVTRVDYLQELCPSIFVNTSLDPKLFVLESQYQNLTLFYDCVVPNAVPFPCVPNSGSGQHVY AQLGSFDFTSMFCKQSVVVPVPKVFVDITDVNKTLSAIRNGFVVNWIAGIQECEECRKAGGVCGYDSIRPTCYCRERDQT CPEELPSSGKGGSTKVGVIIGVAAGVAVLVGLLCCGFFMFRRKRKMAKQSTGKDLLMPTTTSRPSSFTLTSATNSSQSVS SYPSSTSGTVPPKSFYFGVKVFTYEELEEATNGFHTSRELGEGGFGTVYKGELQDGRVVAVKRHYESNFKRVEQFINEVR ILATLRHKNLVTLYGCTSRHSRELLLVYEFISNGTVDDHLHGKRSKSALLPWPVRLNIAVETAEALAYLHANDVIHRDVK SNNILLDDKFHVKVADFGLSRLFPTHVTHVSTAPQGTPGYVDPEYYQCYQLNDKSDVYSFGVVLVELISSLQAVDVSRHR SDVNLANMAINKIQNQELHELVDLDLGFEKDDGVRRMMTGVAELAFRCLQQQKEMRPNMDEAVEILRAIKSDELDTREAK VVDVVTDEVVLLKKVPSPVSPDSVADKWVSSSTASNSL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 31 | 31 | - | – | |
| Phobius | 1 | 3 | 3 | - | – | |
| Phobius | 1 | 31 | 31 | - | – | |
| Phobius | 4 | 23 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 5 | 27 | 23 | - | – | |
| PANTHER | 15 | 675 | 661 | 1.9E-272 | – | |
| PANTHER | 15 | 675 | 661 | 1.9E-272 | – | |
| Phobius | 24 | 31 | 8 | - | – | |
| Phobius | 32 | 255 | 224 | - | – | |
| Pfam | 169 | 236 | 68 | 1.4E-11 | ||
| Phobius | 256 | 280 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 258 | 280 | 23 | - | – | |
| Phobius | 281 | 678 | 398 | - | – | |
| MobiDBLite | 291 | 329 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 293 | 329 | 37 | - | – | |
| Gene3D | 331 | 430 | 100 | 6.6E-31 | – | |
| SUPERFAMILY | 333 | 632 | 300 | 1.08E-77 | ||
| Pfam | 354 | 624 | 271 | 5.3E-49 | ||
| SMART | 354 | 629 | 276 | 1.0E-45 | ||
| ProSiteProfiles | 354 | 629 | 276 | 39.128 | ||
| ProSitePatterns | 360 | 382 | 23 | - | ||
| Gene3D | 431 | 650 | 220 | 9.1E-54 | – | |
| ProSitePatterns | 474 | 486 | 13 | - | ||
| MobiDBLite | 658 | 678 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 664 | 678 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0547400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…