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LotjaGi1g1v0599300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0599300
Transcript ID LotjaGi1g1v0599300.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description E3 ubiquitin-protein ligase BRE1-like 1; TAIR: AT2G44950.1 histone mono-ubiquitination 1; Swiss-Prot: sp|Q8RXD6|BRE1A_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase BRE1-like 1; TrEMBL-Plants: tr|K7LQS9|K7LQS9_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0599300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:114009477..114052380) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GAAAATTACAAAACACCTTCAATTTTCTCTCTCTACCTTTGGGTTCCATTCATTCAGCGAAAGAGAGAATATGCAGAGAA CTTCTAGAGAGAGAGAGAGAAGAACGAACGAACTAAGACATTGAAATTCTCATGCTCTGTTCATCACAACTAGCTATCGA AGTAACAGAGAGAGGAAAACGAACGAAAACAGCGAGAAAATCTTCAAATTTTTCTTCTTCTTCTTCTTTGTATTTTTTTC AATGTTTTGGGTTCACTGGAGGGGTTTGAATTAGGGTTTTGATTGGGCTTTGATTTTGAATTTTTGTTTATGGTTGTGTT TTGGTGGTAATTGGGGCAAATTATGAAGGATTGAATCTCTGTGATATGAGTGGAGTGTGTGTTTTCTAGGGTTTCAATGG GGAGTATGGGTGACTCAGACAGAAAACGGCGTCACTTTAGCTCCTTATCTCCTACACCTGCAGCTGCTGCAACTGCCAAG AAGCTTCCCTTTTTGCCCATTTCTGAAGACAAAAAGGTATTCCATTTTTTGTTTGTTTCCATGGTTTATTGATATCTGAA GCTTGAGTTTCAAATGTTGAATATTTTCCTGTTTTTTTGGTTGATTTCTGACCATGAGTTTATAATTGTCGTTTGCTGCG TGAATTTCATTGGTTACACATAGGATCATGTATAAAGGTTGTAGAAATTTGTATGAGTAAAATATCATTCTGAAAATTAC TTACTTTTCCCTTTTGTACTGCTCATTTTTGTTTGTTAAACTAGTGGCTAATGGTCAGTTCTTTGTCCTTTGATAAACAC AAAAAGGGTTTTTAATCTACTTATGTGTAAACTGGTTCATATTAGCTTTGTTGCTCTTAATTTGGGAGGTAGTACTTATA CTGGTCCAAACACCGCAAATCCTTTAACTTCATTGATTGATTTGATTCCTTGATTAGCAAAGAAAATTAAATACATGCAG 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TGCAGCCAGTGTAGGATCAAAATAGTATAGTCTGTTACAGTTAGTTTTGGTTAGTTGTTCCAGCTGTCAAAGCTCTTAGA CCTTAGCTATGGGTAGCTTAGCATAGCTACCATCTATGGATATTTATCTTGTAATCATTATTTGAAAAATTAATTAGTGA GTTATAATTTTCTCTTGATTCTCACAAATCTATAGAGCCTAATTTTTTTCGGAAGTCATGGCCAACACTGCTTTCTTCCC CACCGTGCCGAGAATCGGTATGGTGAAGGGACTGTAGCACTCCCCTTCACTAGTTGCATAGTATCGATTATAGCTTTTGT AAACTGTTGCAAAATATATAGTTTGTTACAGGTAGTTATGATTAGTTGTTCCAGCTGTCAAAGCTGTTAGACCTTAGCTA TGGGTTAAACATAGCTGCAGTCTATAAATGTATCTCGTGATCATTCTATGAAAAATCAATCAGTGGGAATGCTTCTTTTT GCTGAATATTCATCAATCTATTAGAACCTATGATAACAGTTCACAGCATCACCAACCTGGCACTGAACGTTATCCCAGCT TCTTCCAAAGTGTCTGCCTCTCCTCTGAGAGGACTGGCTCTTGCTTCCTGAGAATTGCTATGAGGAAATGGCTGCAGAAA CTTAGTAGAATACTGACTGACCTGAGCTCGAGCTCGTGATGAGGGTTGTTGTTGTGTTAGATTCATTGCGGTACTTTCAG CAAACAGTTCTTATTTATCTCAATTCTACCCTCATGTGGTGGCATTAAGCATATCATCTCTTCCAACTGAAACATTTAAG ACTTGCCACTTCTTTATGTGACCAATGGTTCAAACTCTGAAGGTTAACCCCAATGCATAACTTCTAACTGTTCTCTGAAG GTGATAGGATCTCCAATGCTGGTAAACAAGTCATCCATAGCTTTTATGCAAAGTAGATAATAAAAAATAGAATGATTTCC 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ATAGTTCTGCTGCATCTTTGTTAGTGAGTGTTAGGTTGATTGTTAAATATGGGGAACTGTATAGTTGAGGAATTGTGAAG AGAGTGAAGTGTTTGAGCTCAGTTCTCAAGGGGCGTTCCTGGTAAAGGAGTATTCTCTTGTTCATTCATTCGACGATGAT TGATACATCATTCTTTATTCAATCTTCCATTCTTGTCTTTTCTACATTATCATTTCATTGGTTTTTCGCCATTTGGAGAT TCTTCTAACTTCAGAATCCTTACAACCTTTCAAAGAAATGTGAATTACTTTATTATAGAATTGAGTTCAGAGCAAAAAAA AATACTTGGTTTGGTAGTGTACACGCCATTTTGAAAGACCATGAATTGGAAGAAAATGGACTTGAATGTTTTCTGTCAAA TTTTCTGTTGTGCTATACATGGATATTTGTTATTCTTGAAGACCGACATATACATGTTTATTTTTGTTGATTATATATTG ATATTTATATTGCATTTGGCCAGCTTGTTTTAGAAGGTGTAAGGGCGAGACAGAAGCAGGATTCTTTAATTATGGAGAAG CGAGTAATTGAACAAGAGATCCATCAAGCAAATGTATCCCTGAATCTATATGATGTGAAAGCTGCAAGAATTGAAGACCA GGTAGCTTTGTCTTAATTTAAATCGCACTTCATATATGAAATTGGAATTGACTTGTGTACTTGATATGCAGTTGAGGCAT TTTTCAGATCAGATTCAAAAACTTACAGAAGATAAGCTTCAAAACTCTGTCACTTTTGAAAATACACAAAGAAGGCTTGC AGATATTAGATCATCAACTCAACAGGTTAGGGATACAGTGGTGGAACAGCAATGCAAAATTAGTAGTAGTCGAGTGACTT ATATGGAGTTACAAGTGGAAGTCGAGAAAGAAAGGTATTTAGTCTTCATGTATACAAGTTATTTTCTTAAAATGTTTTTA GTACACAATAGTTTTTAACCTTTTTGTCTTTTCGTTACTAGGTTTGCCAAGAAAAGATTTGAGGAGGAGCTTGAGGTTGC TAGGAGAAAGTTTTCACGCCTTAAAGTACAGAATGAGGGTTCCTCGTTAACTGAAAAGCTTCAACAGGAATTGGGAGAAT ACAAGGAAATTATCAAGTGCAGTATCTGCCAAGACAGGACAAAGGAGGTATTTTATTATTATTTATTTTTTTGATCTGAG GTAATAGATGGGTTTCACATGAGTTTTCTCAAGCTGTAAACTAATGCTTGGGAGCATCAGCTGTGAGCTGGGAGTGAGAT GATGAAGATGAAGGAGGAAGATTAAAAGAGTTCTTTTGTTATGTTATTTTAATTAATAATTTTTATTTTATTTTAAATGA TGTGGAATGGTTTATACTAAATGAAAAAATAAAATTACACATCATTTAATTAAATGACGTGGCAGTGCCAAATAGGCACG GTGGTGACAAATAAGCATGTTGGCTGGAGCCACCACTCTAGAGGGACCATTTCCGGAAGTACGCCGGCGAGGGACCAAAA CCAGCCCTCGGTCATAGTTCAGGGACCATTTTCATATTTATCCCTAAATTTAAAGTCATGCTAGGTTTTCAAATTAGAGT CATTTCTGATTTACCTTGACCTTCACCAGAGGTATTTGAAATTGCAGTTTTGTTGTAGAGTTAGTAGATTGTTTTTGTTG TTTTTTTTTTTTTGATATTAAAAGAATTGATTAGTGAGAAAAGGTGAAATGACAACTAGGCTGGGGATAACATGGCCTTT AAAACAGACTAATATGATTTGGAAAAAAAAAATGTAGAATCCAGATCTGCTTCCCATTCTCTATTTCAGAGAACAAGCTC TTTTGAAACAGCATAAATGGCTAACGTTAACTTAAGGGAAGCTATAAATGTAGTTGTTTCCTATGAAATGTTTAGGGTTA GGGAACCTTTGAAAATGCTAGCAATCCTCATTCAAACGCATTAAAAACTGCAAACACACTCCACAAGATTCTAGCCTGAG TATTTTCCCTCAAAATTTTATCTTAACATTATTAATTTTTGACTTAATTTCACTTTGGCCCTAGTAGTTTCAACTATGTG TAATTTTAGTGCTTCTAGTTTTTTCCGAGTAAATTAAGTCCTTCTATTTTTTAAAATAATCAAATTTAGTTTCCTATCCA AATATGCAGGGGGGTTCACAATGGATTTGAAATGTAATACAGTTTCAAAGATTTGGAATTCAGAATTTAGTAGAAACTTA ATAAAATTTGAAGCATTTTGTTGGATGCAAAGATAGGGTTTGAAAAGTGGAAATTGTTGAGATATTTTTAATTTTTCAAT TTTAGGTGATACAAGGCATTTATTTACAAGCTGTATAAATAAGAGTAAACCTTGATTTAGGGATTGAAAGAGATCACAGC TGTATCAATCTACTCTATAATCTAATCTGGAAATAAAACGAATTAAAGAATACAATGTAGAGAAGCGTTTCAGTCTTGGA GAGATGCTTTTTGCAAAATGACGAAAGTTTCAGTGTAGGAAAAATAATGTAAAAGCAGCATTTTTTTAGGTAACTTTGTA CGTGTCTCAATTGCACTTATTTTGGATTAATATCATATGCATGATTAAGTTAGACATGTGAGACATAAATCCATATATGT TCTGGTTTTCCACATATCTTACATTGATGCTTTGCTGCATTGGCTTTCTTTTTGGCTGAAAACACTCATGTTCATTCTCT ATTTTTTTTTGTCAGGTGGTTATTACAAAATGCTACCACTTATTCTGCAACACGTGTATGCTGAAAGTTACTGGGAGTAG GCACCGCAAATGTCCACAGTGTGGTACAAGCTTTGGGGCTAATGATGTCAAGCCTGTTTATTTGTAACTAGGAAATTGGT TCTATCGTGCTTTTTAAGAAGATGCCGGTGTTCTTTTAAATGATCTGGTTTTTGGATACCATGGTTCAAATTGTATGCTT ATGCCAACTGTTGTGATAGGAAACAATGGCAGCGATCAATTAGTGCCAGTCTCCTTTCATTGGACCAAAAATGATTATTT TTGCTGGTACTGTTTCTTAGTACCACCTGTACTCTTTTGAATCTGGGATGTTTAGCATTTGAGTGAGAGAACATGGAGCC GTTGAAACTTGATATTATTTCTTTGCAGATTTATCATAATACATCTTCCAATGCGATTTGGAGAGATCATGAAGGTTGTT CTTTGACTGTGGAATTAATAATTCAAATTATTCTAAGCCTGGCATGATGGTTATTTGCCTTGGAAGTTGACTCCTTTGAG TACAACGACAATGCCTTACATCAATAGTTCTGTTTCCTGCTGAAATGGCAGAAACACAAATTTTTGCTTCAGAAGATTTT GTATATATGTTAGAAGTAGCCTTTCAATTTTGTTCATCACAGCCTGTAATATGTGTATTATTAGATGATGTGTCACGATA TCAATTGTAATTGGTGTTGTGTAATGATAAGAATGCCAAATAATCTTTTAATGTACTTATTTGCCAATCTTCCTGAAGTG TTTTCTTCTGAATGTTGCTTTGTTTCTGTTCTTGAAATACAGCAATCTCTGTGCAACCCCTCACTATTGATAAAAACGTT TTAATTAGGACAGGGCAATGTTTAATTGCATGGATGCAGTCACTGGCATTTGCCCACAACTTCTGATGGGAATTATAGTC ATGTGATAAACATCAATTGCTTCTATCTATTGAAGGACAATAGTAACCATGATGGTGGAATATGCTATTATTTAGCAAAG TGCCCAAAACTACAGAGGTTTTAAACCCTCGTCTGTTTATTTTTTCCAAAACATTAGTGCATTTGACCAAGTTTGTTATG TGGATTCAAAGATCCGAGGACTTTAATGTTACGAGGGCTCAAGGTTCTGAGACCTTAATAGTGCTTGAATGATTTTGTTC CTGAAATCTCAAACCACCATGGTTAAGTACTTGCGTACATGATATCCTTATGACTTATACATTGCTATCATTAAAATATA CTTAAGAGATTTTTAGGTATTTATGTTTTACTAAACAGCATTGACATTTGAGACGACTCAATTAGACTGTATAACCTGCA ATCAAAGTTAAATTATAAGTTAATAAGAATCAATATTACTTATTGCAAGGCCACATGAAGAATCGTCGGTAGGCCACATG GAGGAGGAGATCCATCTCTATTGATTTCAGAACTACGAATACGTCTACTACTCACAATCAGCACCATCATCCGTTTGAGA TGCTGATGGTGGTGTTGAACCAATAACAACACCGCTATTATGAGACCTAGTGCATGACTTCTTCTACGAAGAAGACCTGT GTACTTTGCCCTTCCATCACGTAGGGTCTCTAGAAGGATTGCTTGATGACATTTGCTTAATTTGCAATACAAGTTATATC TAACATAATATGTCATGTAATATGAAAATGTCATATAAATGCTCAAACATGAACTAAACAAATAAATATCAATAGCTAAC CTCTGTGAAATCTCAAATAGTAAG 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0599300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGAGTATGGGTGACTCAGACAGAAAACGGCGTCACTTTAGCTCCTTATCTCCTACACCTGCAGCTGCTGCAACTGC CAAGAAGCTTCCCTTTTTGCCCATTTCTGAAGACAAAAAGCTTGATATTGCTGTACTCCAGTATCAAAATCAAAAGCTTT TACAGAAATTGGAAACCCAGAAGTTAGAATATGCAGCTCTTGAGAATAAACTTTCTCAACTGAATGAGAGTCAACATTCA TATGATTCTGCTTTAACAGTGGTCAAGAAGTCTTGGGAGCAGATGGTTAATGATTTAGAGTCAAGTTCTGAAGGCACACG AGAGTCTAGCTGCAAATCAGATTCCAGATTTGCATCAGTTATGAATGATTGTAGTTCATCTACTGTTCAGGATGTTTTTC TTAGCCGATTAATGCAAACTGGTGCAACTGAAAGTTCCTCCACGTATCGCTTTGCAAACCAGATGGAAGAGCATAATGAA ATTACTGCTGAAAAAGCTAAAAGCATTTTAAAAAATGTAGTGACAGCTACTAATAACCTTTGGGGTATGAAGGATGGATT GCATACTGCATTACTGAAAAAGCTTCCAGGAGATGTTTCATGTCGGCAGAAGTTGTCCGCTGATCTAGAGGTGGAAGTTA AGAACCTGAGATTGGCGTTCAGTGAACTTCACTTGAAGCACAAGTCTTTGGCAAGTGAGTTACAATTTCAGAAAGATCAT GATGCCAAAAATAAAGCCGATCTTAAGCGATTAAAAGGGGAACTAGAAAGCACGATTGCAGAGTTGGAAGAAAGCAATCA CAAACTTGCAACGCTGAAGGAAGAGAGGGATGCAGCAAAAGGGGTAGTTCTCCCTGTGTTAAATGTTGGAAATGCTCAGA CTCCCAACGATAAGATCAGAGACAAGCAAAAGGATTTGCAAGATATGGAATCTACTCTGAAGGAGCTATTGGACCAAGGC TCAACTCGATTAGTGGAACTGAAAACTCTTCATGAGGAAAGAATAAGAATATTACAGCAGTTGTGTGATCTACAGAACTC ATTGAAGAATTTGAAGTGCATTACCTCTTCCAATGCTTACCAATTGGTTAGAGATCAGATAGAAAAATCAAAATCAGAAG TTCGGGAGTATCAGGCCTTATATGAGAAAGTACAGGTTGAGAAGGATAATCTTGCTTGGAGGGAGAGGGAGTGGTACATT AAAAATGACTTAGCAGATACTTTTCAAAGACCTGTAGCAGTTTCTGACTTGAGAGTGGCTGATATACGCTCCGAGATACA AAATAAGATAGATGCGAGAAATTTGATTGAAAATAAGCTGAAAGAGGAAGCAAGAGAACCAGGAAGGAAACAAATTATTG CAGAATTTAAATCTCTGCTTTCTTCATTTCCTGAGGAAATGGGATCTATGCAAAGTCAACTAAGTAAGTATAAAGAATCA GCTTCAGATATCCATTCTCTGCGTGCGGATGTGCAGTCTATTTCTAGTATTCTTGACAGGAAGGTAAAAGAATGTGATCT ATTATCGGTTAAGTCTACTGGTCAACTAGCTGAGATAAAGAAGCTACATGCTATGGTTAAAGATTTGAGACAGACTGATA AGGAATTGAAGTTGTTTTGGGAAATGTTTAGACGTGAGACCATTGATTCAAGGGATGTCATGGAAGCAAGGGATGCAGAA TACAGAGCATGGGCACATGTTCAAAGTTTGAAATCATCTCTTGATGAACACAACTTGGAACTTCGAGTTAAGATGGCTAA TGAAGCAGAGGCCAGATCTCAACAAAATCTTGCTGCTGCTGAAGCTGAGATAGCAGACATGAGAAAGAAGTTGGAAGATT CTAAAAGGGAGATGTTAAAATTGTCGGATGTCTTGAGATCTAAAAATGAAGAAAATGAAGCTTTCTTATCCGAAATAGAG ACTATAGGACAAGCCTATGATGACATGCAAACTCAAAACCAACATCTGTTACAGCAGATTACTGAGAGGGATGATTATAA TATTAAGCTTGTTTTAGAAGGTGTAAGGGCGAGACAGAAGCAGGATTCTTTAATTATGGAGAAGCGAGTAATTGAACAAG AGATCCATCAAGCAAATGTATCCCTGAATCTATATGATGTGAAAGCTGCAAGAATTGAAGACCAGTTGAGGCATTTTTCA GATCAGATTCAAAAACTTACAGAAGATAAGCTTCAAAACTCTGTCACTTTTGAAAATACACAAAGAAGGCTTGCAGATAT TAGATCATCAACTCAACAGGTTAGGGATACAGTGGTGGAACAGCAATGCAAAATTAGTAGTAGTCGAGTGACTTATATGG AGTTACAAGTGGAAGTCGAGAAAGAAAGGTTTGCCAAGAAAAGATTTGAGGAGGAGCTTGAGGTTGCTAGGAGAAAGTTT TCACGCCTTAAAGTACAGAATGAGGGTTCCTCGTTAACTGAAAAGCTTCAACAGGAATTGGGAGAATACAAGGAAATTAT CAAGTGCAGTATCTGCCAAGACAGGACAAAGGAGGTGGTTATTACAAAATGCTACCACTTATTCTGCAACACGTGTATGC TGAAAGTTACTGGGAGTAGGCACCGCAAATGTCCACAGTGTGGTACAAGCTTTGGGGCTAATGATGTCAAGCCTGTTTAT TTGTAA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0599300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGSMGDSDRKRRHFSSLSPTPAAAATAKKLPFLPISEDKKLDIAVLQYQNQKLLQKLETQKLEYAALENKLSQLNESQHS YDSALTVVKKSWEQMVNDLESSSEGTRESSCKSDSRFASVMNDCSSSTVQDVFLSRLMQTGATESSSTYRFANQMEEHNE ITAEKAKSILKNVVTATNNLWGMKDGLHTALLKKLPGDVSCRQKLSADLEVEVKNLRLAFSELHLKHKSLASELQFQKDH DAKNKADLKRLKGELESTIAELEESNHKLATLKEERDAAKGVVLPVLNVGNAQTPNDKIRDKQKDLQDMESTLKELLDQG STRLVELKTLHEERIRILQQLCDLQNSLKNLKCITSSNAYQLVRDQIEKSKSEVREYQALYEKVQVEKDNLAWREREWYI KNDLADTFQRPVAVSDLRVADIRSEIQNKIDARNLIENKLKEEAREPGRKQIIAEFKSLLSSFPEEMGSMQSQLSKYKES ASDIHSLRADVQSISSILDRKVKECDLLSVKSTGQLAEIKKLHAMVKDLRQTDKELKLFWEMFRRETIDSRDVMEARDAE YRAWAHVQSLKSSLDEHNLELRVKMANEAEARSQQNLAAAEAEIADMRKKLEDSKREMLKLSDVLRSKNEENEAFLSEIE TIGQAYDDMQTQNQHLLQQITERDDYNIKLVLEGVRARQKQDSLIMEKRVIEQEIHQANVSLNLYDVKAARIEDQLRHFS DQIQKLTEDKLQNSVTFENTQRRLADIRSSTQQVRDTVVEQQCKISSSRVTYMELQVEVEKERFAKKRFEEELEVARRKF SRLKVQNEGSSLTEKLQQELGEYKEIIKCSICQDRTKEVVITKCYHLFCNTCMLKVTGSRHRKCPQCGTSFGANDVKPVY L 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 15 15 -
PANTHER 1 881 881 0.0
MobiDBLite 1 24 24 -
PANTHER 1 881 881 0.0
Coils 43 77 35 -
Coils 245 282 38 -
Coils 299 319 21 -
Coils 360 387 28 -
Coils 426 446 21 -
Coils 583 631 49 -
Coils 709 729 21 -
Coils 772 806 35 -
Gene3D 810 881 72 3.8E-18
SUPERFAMILY 821 880 60 6.45E-14
CDD 827 868 42 7.75865E-16
Pfam 828 869 42 2.6E-8
SMART 829 867 39 6.0E-7
ProSiteProfiles 829 867 39 11.412
ProSitePatterns 844 853 10 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Ubiquitin-protein transferase activity Catalysis of the transfer of ubiquitin from one protein to another via the reaction X-Ub + Y --> Y-Ub + X, where both X-Ub and Y-Ub are covalent linkages.
Biological process Histone monoubiquitination The modification of histones by addition of a single ubiquitin group.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0599300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…