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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0613200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0613200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein ZINC INDUCED FACILITATOR-LIKE 1; TAIR: AT5G13750.1 zinc induced facilitator-like 1; Swiss-Prot: sp|Q94BZ1|ZIFL1_ARATH Protein ZINC INDUCED FACILITATOR-LIKE 1; TrEMBL-Plants: tr|I3SEY1|I3SEY1_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0613200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:115884040..115901452) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACACAATAAAGTTTTGCCACGAGGAAACTTTATACTAAATTTTTTGTTGAAGTATCGGAAAATGGAATCTTCACGTGGTG GCCCAATGCAGTCAGATCTGTAACAATTTCTAAATAAATGTATGTATTTTAATAATTAATATCTCACTCATTTATTATTT ATATAGTCCAAGAGAAATGAAAAAGAAAAAAAACAAAACAAAACATTCCCATGAAATTGGAGCTCCAAGAGACTCTCCTG TAATAGCTGTATGTTTGTTTTCTCAACCTTTTGGGTTTTTCCCTTCTTTCTGATTATTCATTTTTATTTTTTATGCTGCA CATGTGAAGTGTTATAGATAAGAGGGACACTTCACAAACATGGAGAATCAGATTATGAAAGAGCCATTGTTGGAGAAGAA GTACTATAAGGACTGCCCAGGTTGTAAGGTGGATCAAGCAAAAGAGCTGAAAAAGGGTGCATCAGTTCTAAATCTTTTAA TTATATGGATGTTGATGATATGTGCATGTAAGCATTTTACTCTAATTTCATTTTAATCCTTTTGGCAAAAACTGTAATAT TACCAGTGTTTCTGTATCTTAGATGTCTGGAATTGTGTGAACCTAGCTCAAAAGAGGAGTGTCCTATCTGGGTGGGTGGT GTGGGAAAATTGAATTTAATAATGTTTTATGGAATTTTCAATCTAATATATATTTTGAAAAGATAAAATAAATAAGTGTT TGATGTCTTCCTCTAACAGTTGAACTGTCTTTTTATCTGTCTTGTGCAGCACTACCTATATCATGTCTCTATCCATTCCT ATATTTCATGGTGAGTTTAACTATCTAGCTACTATGAACAGCTGGGGATTTAATTTTTATATATTGAGTATTTCAAGTTG AAGTTCAATTTCAGTTTATATTTTATTTTAGAGATAAATTAAAAGTGATTGTCGATTGCTTCCTACTGAACATATACACT 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GCCAAGTTTGTGTGGCTAGTATATATGTTCTGTTCATTATTGGCACAATGGAGCCTATTATTATATTTTAATGTTATATT TCCTTTGTCTTTAAAAAAAATAAATTCTTATGAGTGATAATCGAGACGCCAAC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0613200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGAATCAGATTATGAAAGAGCCATTGTTGGAGAAGAAGTACTATAAGGACTGCCCAGGTTGTAAGGTGGATCAAGC AAAAGAGCTGAAAAAGGGTGCATCAGTTCTAAATCTTTTAATTATATGGATGTTGATGATATGTGCATCACTACCTATAT CATGTCTCTATCCATTCCTATATTTCATGGTAAAGGACTTCAATGTTGCGAAAACAGAGGCTGATATTAGTACTTATGCT GGTTATGTGGGATCGACATTGATGCTTGGTAGAGCCTTGACATCTGTAGGCTGGGGATTGTTTTCTGATCGTTATGGTAG AAAACCTGCTTTAATTGTTGGGGTTATGTCAGTTATCATTTTCAACACACTATTCGGCCTTAGTACAAATTTTTGGATGG CCATTATCACCAGATTTCTTCTAGGATGTGGTAATGGTATAATTGGACCAGTAAAGGCATATGCTACTGAACTTTTTAGA GAAGAGGATCAAGCTATAGGACTCTCTACAGTCAGTGCAGCTTGGGCTATAGGCCTGATTATTGGCCCAGCATTGGGAGG CTATTTGGCTCAGCCCGTAGTGAAATACCCGCACATATTTCCAAAGGACTCTTTTTGGGATAAGTTTCCATACTTTTTGC CCTGTTTTATAATATCAGGACTAGCAATTCCAGTTCTTATAGCCTGTATTTGGATTCCGGAAACACTTCATAATCACAAA GGTGGAAATGAGTGCACAGATGATGCTGAAGCTTTAGAAAATGGAAGCAATAGGATTAACAAAGGAAATACAACCCAAAA GAATGAAAACCTCTTAATGAATTGGCCCTTAATGTCGTCTATCATTGTTTATTGTATTTTCTCACTTCATGACATGGCTT ATACAGAGGTTTTCTCTTTATGGGCTGTCAGTCCACCAAGCCTGGGGGGTTTGAACTTCACAACTGATGTTGTTGGTAAT GTTCTTGCAATATCAGGTCTTTTACTTATTATCTACCAGCTTACCCTATACCCATATGTGGAAAAAGCTTGTGGACCTAT TCGGATTTCCCGCATTACAGGGATCTTATCCATACCACTTCTGCAAAGTTACCCTTTTATAGCAATGTTGTCAGGCGTAA CACTATACACTGTGATAAGTGTTGCTTCTATTCTGAAGAATATCTTGTCTATGACCATCATAACTGGTTTATTTATTTTG CAAAATAGAGCAGTGAAACAAAACCAGAGGGGGGCAGCTAATGGCATTTCTGTGACTTGTGTGTCCCTATTCAAAGCTAT TGGCCCTGCTGTAGGTGGTGCCTTATTAACTTGGACACAAAAGCGGATGCATGCTTCTTTCCTGCCAGGCACACATATGA TCTTCTTTATAATGAATTTAGTTGAAGGACTTGGAATACTAATGATGTTTAAACCATTCCTTAATGAAGAGAAGAAAACA CACTCAGATATGTTACACTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0613200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MENQIMKEPLLEKKYYKDCPGCKVDQAKELKKGASVLNLLIIWMLMICASLPISCLYPFLYFMVKDFNVAKTEADISTYA GYVGSTLMLGRALTSVGWGLFSDRYGRKPALIVGVMSVIIFNTLFGLSTNFWMAIITRFLLGCGNGIIGPVKAYATELFR EEDQAIGLSTVSAAWAIGLIIGPALGGYLAQPVVKYPHIFPKDSFWDKFPYFLPCFIISGLAIPVLIACIWIPETLHNHK GGNECTDDAEALENGSNRINKGNTTQKNENLLMNWPLMSSIIVYCIFSLHDMAYTEVFSLWAVSPPSLGGLNFTTDVVGN VLAISGLLLIIYQLTLYPYVEKACGPIRISRITGILSIPLLQSYPFIAMLSGVTLYTVISVASILKNILSMTIITGLFIL QNRAVKQNQRGAANGISVTCVSLFKAIGPAVGGALLTWTQKRMHASFLPGTHMIFFIMNLVEGLGILMMFKPFLNEEKKT HSDMLH
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 35 | 35 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 486 | 486 | 8.5E-275 | – | |
| PANTHER | 1 | 486 | 486 | 8.5E-275 | – | |
| Phobius | 36 | 59 | 24 | - | – | |
| Gene3D | 36 | 465 | 430 | 5.4E-54 | – | |
| ProSiteProfiles | 38 | 477 | 440 | 21.948 | ||
| SUPERFAMILY | 38 | 475 | 438 | 1.01E-51 | ||
| TMHMM | 39 | 61 | 23 | - | – | |
| CDD | 42 | 471 | 430 | 5.04382E-65 | – | |
| Pfam | 42 | 286 | 245 | 7.1E-26 | ||
| Phobius | 60 | 78 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 76 | 98 | 23 | - | – | |
| Phobius | 79 | 101 | 23 | - | – | |
| Phobius | 102 | 107 | 6 | - | – | |
| Phobius | 108 | 125 | 18 | - | – | |
| TMHMM | 110 | 129 | 20 | - | – | |
| PRINTS | 111 | 135 | 25 | 2.8E-5 | ||
| Phobius | 126 | 130 | 5 | - | – | |
| Phobius | 131 | 154 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 134 | 156 | 23 | - | – | |
| Phobius | 155 | 165 | 11 | - | – | |
| Phobius | 166 | 189 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 168 | 190 | 23 | - | – | |
| PRINTS | 168 | 190 | 23 | 2.8E-5 | ||
| Phobius | 190 | 208 | 19 | - | – | |
| Phobius | 209 | 232 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 210 | 232 | 23 | - | – | |
| Phobius | 233 | 280 | 48 | - | – | |
| TMHMM | 271 | 293 | 23 | - | – | |
| Phobius | 281 | 301 | 21 | - | – | |
| Phobius | 302 | 320 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 318 | 340 | 23 | - | – | |
| Phobius | 321 | 340 | 20 | - | – | |
| Phobius | 341 | 351 | 11 | - | – | |
| PRINTS | 342 | 362 | 21 | 2.8E-5 | ||
| Phobius | 352 | 370 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 352 | 374 | 23 | - | – | |
| Phobius | 371 | 375 | 5 | - | – | |
| Phobius | 376 | 400 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 378 | 400 | 23 | - | – | |
| Phobius | 401 | 411 | 11 | - | – | |
| Phobius | 412 | 438 | 27 | - | – | |
| TMHMM | 421 | 438 | 18 | - | – | |
| Phobius | 439 | 449 | 11 | - | – | |
| Phobius | 450 | 470 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 453 | 475 | 23 | - | – | |
| Phobius | 471 | 486 | 16 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Transmembrane transporter activity | Enables the transfer of a substance, usually a specific substance or a group of related substances, from one side of a membrane to the other. | ||
| Biological process | Transmembrane transport | The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0613200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…