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LotjaGi1g1v0614000.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0614000
Transcript ID LotjaGi1g1v0614000.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein ZINC INDUCED FACILITATOR-LIKE 1; TAIR: AT5G13750.1 zinc induced facilitator-like 1; Swiss-Prot: sp|Q94BZ1|ZIFL1_ARATH Protein ZINC INDUCED FACILITATOR-LIKE 1; TrEMBL-Plants: tr|I3SEY1|I3SEY1_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0614000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:115958690..115972196) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATACTTTCTCACTCTTATTTTTTCTTTTCTTCCTATCTCTCTCTTCCTCCACCTTATTCCACCTCATTTTGAGCTGTAAA TAAATAATTATTGGATCTGTAACAATTTCTAAACAAATGTTTATATTTTAATGATCAAGATCTCATTCGTTTATTATTTA GTACAAGAGAAATGAAAAAGAAAAAAAACAAAACAAAACTTTCCCATGAAATTTTAACACTTGTGACAACATTTTCATTT CATACGCATACAAAATTGGAGCTCCAAGAGTTTCTCCTGTAATAGCTGTATGTTTGTTTGCTCAACCTTTTTGGGGTCTA TTCCTTCTTTCTGATTATTCATTTTCACTTTGTGTGGTGCATGTGATGAAGGGTTATAGATAAGAGGGACACATACAACA ACATGGAGAATGAGATCATGAAAGAACCATTGTTGGAGAAGAAGTACTATAAGGACTGCCCAGGCTGTAAGGTGGATCAA GCAAAAGAGCTGAAAAAGGGTGCATCAGTTCTAAATCTTTTAATTATATGGATGTTGATGATATGTGCATGTAAGCATTT TACTCTAATTTCATTTTAATCCTTTTGGCAAAATCTGTAATATTACCAGTGTTTCTGTATCTTGGATGTCTGGAATTGTG TGAACCTAGCTCAAAAAAGGAGTGTCTTGGTGCCTTCTATATGGGTGGTGTGGGAAAATTGAAGTTAATAATCTTTTATG GAATTTTCAATCTGATATATATTTTGAAAAGATAAAACAAATAAATAAATAAGCGTTTGATGTCTTCCTCTGCCAGTTGA AATGTCTTTTTATTTTGTCTTGTGCAGCACTACCGATATCATGTCTCTATCCATTCCTTTATTTCATGGTGAGTTTAACT ATCTACTATATGAACACCTGAGGATTTAATTTTTTTTATATATTTTGAGTATTTCAGTTCAAGTTCAATTTCAGTTTTTA 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CAGCCATAATCCATATCTACTTAGCTCTGATACCAATTGCTGAATTTAATTGACTCAAATAGATCATATAGATAGATACA AATTATAGCATGTTCTGATTCAATAATGAAAAAAAAAAGGAATTGTACACCTGAAAGGATTGAAGAATACATGAGTCTGT TGTTTGACCAAAGAATGTTAGTGGAAAGACACCAGAGGGGTTGAACTGCTCTCTTCACCTGGTAATACGTTCTCTAGATA AACTGTCTTATGGGGCAGCAGTTTATATATCACCAGTTGAGACCAGGGTCCCTCATTAGGCAAAGTTAACTGACCTAACC CATCATATGTCAGTTACTAACAAAAGCCTAATTTATCATCCATCATAATACATGTAATTGACTTAATTTAATAATTCACA TAATTGATATTAATGACCAAACAAAATATATTCTAATTAATTGATAATGTTAATCCACATAACAAAAAAGAGAGTTAATT ATAAATAAATCTAACATGAAAAACACATAGTACAATATTTTTTTCGTGACTGATAATGTGCTGTGAGTGATAGACAAAAA TATAAAAACTCGAAAGTGTACCATAGAATTGCTCGGATAACTGAATTGCAATACTTAATCTCTAAGAAATAAAGAAGATA GATTAAACAATATGATAATCTTAATCTAAAAGAATCCAAACAATATCTTTGTCTGTGTATATAGGTAATGGCACACATTT ATGTGTAGTTTTTCCATTTGCGCCTCTAATAAAGGAAATTTCTTATTGCAGCCTGTAATGAAATACCCCCACATATTTCC AAAGGGCTCTTTTTGGGATAAGTAAGTGGAATTCTCCTGCAGTTTATTTGATTTTGGCTCCCATCTTTGTCTTTCTATCA ATTTATCATTTAATAATATGTGAAATTTTTTTTGCCAAAAATACAAATCATTTTGCAGGTTTCCATACTTCTTGCCCTGC TTTATAATATCAGGACTAGCATTTCCAGTTCTGATTGCCTGTATTTGGATTCCGGTATGTAACACAGGTTCTGACATATC TGTTCATTAGCCAACATGTTTCTGTTTAGGGCCTGATTGTTTACAGTTTTCAGTTTTTTAAAACTGAACACCTGTTTGAT ACGACTTGTTCTCATATTCAGTTTTTAAAACTAAAACAACTAAAAAATGCTTTCAGTTTTTATTTTTAGTTTTCATATAT CAGTTTTCTAAATGTTGGAAAAAATGTTAATCAAACTGCTTTCTTCTTCTGAAAACTGTTTCTGAAAATTGTTTTAAAAA TTGAAAACTAAATAAGCAATTAAACTGCAATTAATGTTTTGTTGATTTTAGTTTTAACACTTTTATGATGATTTTTTTGT TTATTGATTTTTGGGTCATTTTGTCTCTTTTATACTAGTGTTATTAAACTCGGCCCGGTGATCGACTCGGTCAGGCAACT GGGTCACTGATTCGAATGCTTGACTCGGTGTATATTAAAAAATTATAAAATAGTCCAATACGATATAAAGTTAATATATA AATAATAAAAGAGGTTTTTAAAACATTAAACAAAATGATGGTGTAGTGGTTAACATTTCTTCACATTTTCTCAAGGTCCT ATGTTCAAACCCCTATTGTAACAACTTTTTAGATAAATATAACATTTTTATACTACTTTACAATAAATAAATAAAATTGG TCGAAATTTTTTTGAAAAGGCTTAAATTCTGCACATCTCCTAAATGGGCTCCCATGTACGACCCATTAACAACATCATAA AAAAATTAAAAACAAAAGTGGGTTGCTTTCTGTGTGGCTTCAATCCGTTACATGTACTTACCCTTTGAGTTTGGGCCCGG CCCAGTTCTTCTCTTGGAATCAAATCAGCACTTTCAACCAAAAAAAAATAAATAAGTGACTCGCTGGTTCAACTAAAAAT CAGCTGAGTCACCGATTTTTCATCTAAACCGGCCGGTTTGAATGCATGGACGATTCGATTGTTCAACTCGTACCGGCTAG TCACCGGTTCACAATCGGACCGGTTCGACCGGCCGGTCTAGTCCAAGTTTCATAACACTGTTTTATACCCTCCTTTTGTC TTCATTGTTTGCACGGTCTTGTATGTCTTACTGTCTCCTTCATTGATAATTTTTTTTTAAATACTTGCAGGAAACACTTC ATAATCACAAAGGTGGAAATGAGTGCACAGATGAGGCTGAAGCTTTAGAAAATGGAAGCAATAGGGTTAACAAAGGAAAG ACAACCCAAAAGAATGAAAACCTCTTAAAGAATTGGCCCTTAATGTCATCTATCATTGTTTATTGTATTTTCTCACTTCA TGACATGGCTTATACAGAGGTATCATTTCTACCTAATGAGGTTATCCATATATCAATGCCTGGGGGGTTTGAACTTTACA ATTCATTCCTTCAATTGTCTTCAGGTTTTCTCTTTATGGGCTGTCAGTCCTCCTAGCCTGGGGGGTTTGAACTTTACAAC TGATAATGTTGGCAATGTTCTTGCAATATCAGGTGCATCTCTGAAACCTATAATGATGGTTTATCAATGTTGGGCATATT TATTTCCTTACTAAATTTCCATGGTATACTTTCTTGTTTTTCATTTGGTTCGGTAATCTGTTAAAATTACTAATTCTTTT TTTGCATAGTGACAAGTGACTATATGTTTACATTTAGCGTTAATCTTTGTATCTGATACCCTATAAGATAGTAGATATTT AGTTTAATTACTCTCAAATTGTCAGGTCTTCTACTTATTATCTACCAGCTTATCCTATACCCATATGTGGAAAGAGCTTG TGGACCTATTAGAATTTCCCGCATTACAGGGGTTAGTTGTTATTTAATTGTTGCAATACTATTCAACATGTCAATATTTA TTATTTGAAATATGTGATGTTAATGTGGTTCCATATGCAGATGTTATCCATACCACTTCTGCAAAGTTACCCCTTTATAG CAATGTTGTCAGGCGTAACACTATACATTGTGATAAGTCTTGCTTCTATTCTGAAGAATATTTTATCTGTGAGTACCCTC TTTTTACATATTTAAACATTCATGAGTAATAATAAGATTTTACAGTAAACTGAACTATATTCAGTGTGATTCACTATAGC ATGTTTGGATCAACTTCTCTTTCCTTAAAACTAAGTCTAGCATTCATAAGCTACTCGCATAAACTTCCACCTAGACTTGA TTTTGCTTTTAAAAATAATTGTAGAAAGGATTTTCCACCTCTGAGTTTAGTTTAATTGATTCTTACAAGGTTCTCTATGT TACAAATGTGATTGACTGTAATTTTATTTTTTTCAGATGACCATCATAACTGGTTTATTTATTTTGCAAAATAGAGCAGT GGTAAGTTTTCAAATAATTTTATTCTTCTTTTTTCCACAAGAAGTTTGAAATTATTTTTTGTTAGGTCACCACCATATGT TATGTTTATTTTGAAAACAGAAACAAAACCAAAGGGGGGCAGCTAATGGCATTTCTGTGACTTGTGTGTCTCTATTCAAA GCTATTGGCCCTGCTGTAGGTGGTGCCTTGTGAGTATTCCTTTGATCTCTTCTGCTTTTAATTATTTGACTTGTTGTAAT TAAAAATTGTGAATGTAGATCTCTTCCAGTGATGCTTGCTATAAAACTAACAGATTAATGTAAAGATCTTATATGTTTCA TCATATAGCTTGATTTGATTTATGTTCGGCTAATACTTAATGTCGAGTTCGTAAATATTTAGGGTTTAAATCCACCACCA AAGCTAGTTCAAAGGTGATGATTGACTTCTTTACCCTTTATAAGGACTTATTTAGATACATCTCTAACTAATATGGAAGA CATTCGTATCCTTTTATCTGTCAATGTATACCTTGATCAATTATTTGTGTAATAAGAGTTAACTGAAATTACTTACTCCA CTTTGATCCATTCTAAGTTGACAAATTTTTTAATAGTAGAAGTTTTAATACACATGTTAATATGTTATCTGATTAAAAGT TGGATATTTAGAAAACGATCTTCAATTTTCTTCTTATTGTCTTGAATCTTGACAATGCAGATTAACTTGGTCACAAAAGC GAATGCATGCTTCTTTCCTGCCAGGTATGATGTTCAACTAGCTCGTTTGAGCCGATTCATATGTAATTACTTGCAACTTA TACTTGTACATTTAACTGCAGGCACACATATGATCTTCTTTATAATGAATTTAGTTGAAGGACTTGGACTGCTAATGATG TTTAAACCATTCCTTAATGACGAAAAGAATACACACTCAGATCAGTTACACTGACATCAATCAACTTTAATTTGCCTGAG GTGTGGTAGCACCAACCAAGGAAGGGTTCCATTATTGAGGACGATGAGGGTAACTAGGTTCTTAACGTTTTCATCAATGT GACCCCTGGCTTTGTATTACATAAGGTTGTTGTGTGCTTTGTGAAAAAGGAAGAATGAACAAAACAGAAATCGGAAAAGC ATGGGGGATGAATAAAGAGAAATACCATATGTTGTTTTGCTTTTCTTAAGATGAAAGTGTCAAATTATATTCTACTTCTA GCTTTGCAATACATAAAGTTGTTGTTTGCTTAGTAAAAAAGAATAATGAACAAGACAGAAATCGGAAAAGAATGAGAGAA ACAGTAAAGAGAAATACCAAATATTGATAGGCGTTTCTTAAGATGAAAGTGACATACTTACATTCTACTTCTGATTTTGT AATAGACTAGTATAGCAGCCCGTGCCATGCACGGGTAGCTTTTTTTGAAATTTTGTAAAATTATTATATTTAAAATAATT GTGGTAAAATTATATCTGAACTAATTATAATATATTTCTAATCTTTAAATTTTCGTGTGCATGAAAC 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0614000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAGAATGAGATCATGAAAGAACCATTGTTGGAGAAGAAGTACTATAAGGACTGCCCAGGCTGTAAGGTGGATCAAGC AAAAGAGCTGAAAAAGGGTGCATCAGTTCTAAATCTTTTAATTATATGGATGTTGATGATATGTGCATCACTACCGATAT CATGTCTCTATCCATTCCTTTATTTCATGGTAAAGGACTTCAATGTTGCGAAAACGGAGGCTGATATTAGTACTTATGCT GGTTATGTGGGATCTACATTGATGCTCGGTAGAGCTTTGACATCTGTAGGCTGGGGACTGTTTTCTGATCGTTATGGTAG AAAACCTGCTTTAATTGTTGGGGTTATGTCAGTTATCATTTTCAACACACTATTCGGCCTTAGTACAAATTTTTGGATGG CCATTATAACCAGATTTCTTCTAGGATGTGGTAATGGTATAATTGGACCAGTAAAGGCTTATGCTACTGAACTTTTTAGA GAAGAGGATCAAGCTATAGGACTCTCTACGGTCAGTGCAGCTTGGGCTATAGGTCTGATAATTGGCCCAGCATTGGGAGG CTATTTGGCTCAGCCTGTAATGAAATACCCCCACATATTTCCAAAGGGCTCTTTTTGGGATAAGTTTCCATACTTCTTGC CCTGCTTTATAATATCAGGACTAGCATTTCCAGTTCTGATTGCCTGTATTTGGATTCCGGAAACACTTCATAATCACAAA GGTGGAAATGAGTGCACAGATGAGGCTGAAGCTTTAGAAAATGGAAGCAATAGGGTTAACAAAGGAAAGACAACCCAAAA GAATGAAAACCTCTTAAAGAATTGGCCCTTAATGTCATCTATCATTGTTTATTGTATTTTCTCACTTCATGACATGGCTT ATACAGAGGTTTTCTCTTTATGGGCTGTCAGTCCTCCTAGCCTGGGGGGTTTGAACTTTACAACTGATAATGTTGGCAAT GTTCTTGCAATATCAGGTCTTCTACTTATTATCTACCAGCTTATCCTATACCCATATGTGGAAAGAGCTTGTGGACCTAT TAGAATTTCCCGCATTACAGGGATGTTATCCATACCACTTCTGCAAAGTTACCCCTTTATAGCAATGTTGTCAGGCGTAA CACTATACATTGTGATAAGTCTTGCTTCTATTCTGAAGAATATTTTATCTATGACCATCATAACTGGTTTATTTATTTTG CAAAATAGAGCAGTGAAACAAAACCAAAGGGGGGCAGCTAATGGCATTTCTGTGACTTGTGTGTCTCTATTCAAAGCTAT TGGCCCTGCTGTAGGTGGTGCCTTATTAACTTGGTCACAAAAGCGAATGCATGCTTCTTTCCTGCCAGGCACACATATGA TCTTCTTTATAATGAATTTAGTTGAAGGACTTGGACTGCTAATGATGTTTAAACCATTCCTTAATGACGAAAAGAATACA CACTCAGATCAGTTACACTGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0614000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MENEIMKEPLLEKKYYKDCPGCKVDQAKELKKGASVLNLLIIWMLMICASLPISCLYPFLYFMVKDFNVAKTEADISTYA GYVGSTLMLGRALTSVGWGLFSDRYGRKPALIVGVMSVIIFNTLFGLSTNFWMAIITRFLLGCGNGIIGPVKAYATELFR EEDQAIGLSTVSAAWAIGLIIGPALGGYLAQPVMKYPHIFPKGSFWDKFPYFLPCFIISGLAFPVLIACIWIPETLHNHK GGNECTDEAEALENGSNRVNKGKTTQKNENLLKNWPLMSSIIVYCIFSLHDMAYTEVFSLWAVSPPSLGGLNFTTDNVGN VLAISGLLLIIYQLILYPYVERACGPIRISRITGMLSIPLLQSYPFIAMLSGVTLYIVISLASILKNILSMTIITGLFIL QNRAVKQNQRGAANGISVTCVSLFKAIGPAVGGALLTWSQKRMHASFLPGTHMIFFIMNLVEGLGLLMMFKPFLNDEKNT HSDQLH 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 35 35 -
PANTHER 1 486 486 1.3E-275
PANTHER 1 486 486 1.3E-275
Phobius 36 59 24 -
Gene3D 36 469 434 1.4E-55
ProSiteProfiles 38 477 440 22.245
SUPERFAMILY 38 472 435 2.22E-52
TMHMM 39 61 23 -
CDD 42 471 430 2.4184E-61
Pfam 42 288 247 5.9E-27
Phobius 60 78 19 -
TMHMM 76 98 23 -
Phobius 79 101 23 -
Phobius 102 107 6 -
Phobius 108 125 18 -
TMHMM 110 129 20 -
PRINTS 111 135 25 1.9E-5
Phobius 126 130 5 -
Phobius 131 154 24 -
TMHMM 134 156 23 -
Phobius 155 165 11 -
Phobius 166 189 24 -
PRINTS 168 190 23 1.9E-5
TMHMM 168 190 23 -
Phobius 190 208 19 -
Phobius 209 232 24 -
TMHMM 210 232 23 -
Phobius 233 280 48 -
Phobius 281 301 21 -
TMHMM 281 303 23 -
Phobius 302 320 19 -
TMHMM 318 340 23 -
Phobius 321 340 20 -
Phobius 341 351 11 -
PRINTS 342 362 21 1.9E-5
Phobius 352 370 19 -
TMHMM 352 374 23 -
Phobius 371 375 5 -
Phobius 376 400 25 -
TMHMM 378 400 23 -
Phobius 401 411 11 -
Phobius 412 438 27 -
TMHMM 413 435 23 -
Phobius 439 449 11 -
TMHMM 445 467 23 -
Phobius 450 470 21 -
Phobius 471 486 16 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Transmembrane transporter activity Enables the transfer of a substance, usually a specific substance or a group of related substances, from one side of a membrane to the other.
Biological process Transmembrane transport The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0614000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…