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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0679800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0679800.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11; TAIR: AT2G36480.1 pre-mRNA cleavage complex 2 Pcf11-like protein; Swiss-Prot: sp|Q0WPF2|PCFS4_ARATH Polyadenylation and cleavage factor homolog 4; TrEMBL-Plants: tr|A0A072U4Q6|A0A072U4Q6_MEDTR ENTH/VHS-like protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0679800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:124687468..124711985) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CATACATTCTTGCGACTCTCTTGTTCACAATGAGTAAATTTCTCAACATAAAAACCGACAATATAGAAATCCTATGTGAG TACAGTATACATATTTCTTCAACTCCTTAGTAAGACACTCCAGTTGCATAAAGGTTTTTCGAAGGTTTCAAGCCCTGTTT CAGCTGAGAGCATCGATTCCCCTGACACCTCTCTTCCACAACTTAGCACGTTTAAAGAAGGTGCCTACACTTAAGTGTAC AAAGTGGCATAAAGTTAATCTTTTCAACTTCGGTCAGGAGGGACAAAAGAGAGTTGCTTTCTATCAGTCAAAAGCAGAGA TCACCCCCCCATGCTCCCACGGTACGCTTACCGAGGAATACAAAGGAAGGACGGGGGCAGAGCTTGGGTTTGGGTATAGA GTCGTAAGCGCGGGGGGGGGGGGTGGTTGACAGAAAACGTGCTCGTACGGTTCAAAGAAGGGTATGGTCAAATCAACAAA ATCATCAAAAAGGGGTGGTGACAAATGTCAAATGAGACCCTTGTGACTCAAAGCGTGAACGAAAAGAACCGGTTTCGTTT CGTCACCCACTGAAATCGTTACCAAACCGCTAAAAAGTACTTCAACGAAGCATAACTATTTCGCCACTAAATGCAATAAA AAATCATCTTCTTCTACAGAGAAAAGATAAAGAAGAACAAGAAGAAGAAAGATCCACATTCACATTCACATTCACAGCTA GCAATGGTTGACGACAGGTTTTAGGGTTTTGACAATCACCACCACATCGTCCATGGAAATGCCCGCACGAAGATCCAACT ACTCACTCGTCAGTCAAATTCCCGACGACCACTTCGCCGGTACGCCACCACTCATCGATTCTTCCTCCGGCGACGGCAAA ACCAAGTTCGACAGGGCCGCCTTTGACTGGGACTCCCTCTCCGATCACAGGCGGATCGGGAACATCTTCCCCTCGCTCGG 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AAAAAACTTTTATTTTAAAAACGTCACAGTTTGACCCCAAAAAAAGGTGACACAGTTCAATTGAGATGGGGTGGTGCACA CGTGATCCATCCCTATAGCAGGCGCAGCCTTCTTTATATAACAATCAAAACCCCTCTTTTTTTCTTCATCCCTCTTTCAA TCTTCTCACTCTTTTTTATTTTTTCATTAGAATTGAAATTAGGGTTTATCAATTCAATTGTACAATTTTGAATCACAGTT TTTTTTTTATTTTTTTCTCTCCACTTTCGCATTAAGATTAGGATTAGGGTTTTTTCAGATTCATTCTATTTCTAAATTCG ACATGGACAACACGCGTAGATCTTTCGATCGATCCAGACTTCCGGCCGCCAAGAAACCCAGGTTAACCGGAGATCCCAAC GGCGGTTCGAAGTTTCCTCACCGGCAAACGGGATCATCATCTGCGTTTAATGGCCGACACCCTGATGGCGGCGGCGGCGG TGACGACGGCGAGTACCACCCTCAGCCGCTGCCGCATCAAGAGCTTGTGGCTCAGTATAAGACTGCTCTGGGTGATCTCA CTTCTAACCATAAGCTGATAATTACTAATTTGACTATAATTGCTGAAGAGAATTTACCTGCTGCGAAGTCAATTGCTGGG ACTATTTGTGATCACATTCTAGAGGTGAACCTCAGTTTACAGTGTGTCATTTAGAATGATTCTTGTTATGCTATTGCTAT GCCAGTGTAAATATTGATAAATTGGAAATAGTGTATCATGTAAAAAGGTTTATGAATGAATGTGAATGTTGAATAGAAGA AAATACATTTATTATCAATCTTATTTCATTGCATCTGTCAAGAATTTGTAAAATAAAGAAAAGTAGAAGCTAATTTCCAA TTGGGGTTGCAAAGAGAAGGGAAATAACTTTTCTTTTTGCTAGATAATTCTGCTAGTGTTTTCTCGAATTTGTTTGCAAA TTTTATATGCGGAGGGGAATTGAGAATCTACGCGGATGCGAGTTTATTATGTAGGATGTGGGAAAATAAATGAGCACTTA ATGGGTCTTATCTCAATTAACAATGAAGTCCAAAAATGTGATGCTAACTTCTAATTGAAATATATATATTATTGGTTTCT GTTGTTTTCTTGGGTTTGTGGAACTTCTAGCTTTTTGCTCATTTGTGTCTTTCCTCATTTTGGTCATGTTTCATCAAATT GTGTTTATAACTTTCCAGGTTCCAATAGAACAGAAGCTACCATCGCTTTATCTCTTAGACAGTATTGTTAAGAATATCGG GCGGGATTATAAAAGATACTTCACTGCCAGGCTACCTGAGGTCAGAGATCTTTTATCTGTATCTTTTATTGATGCACAGG CCTTTATTTTGGTGTAATTGTTGAATGGTCCATGATGAAAATTTCAGATTGCGAAATGTGAAGTCATGAAATTTTTACAC TGCACTGTTTCAATTTCAGTTGTTTATGATATTTCAAGAATCGTTGCAATTTCGTTTAAAGAGAATCATTTAACTATTAT GGAATGGATACAGTTTTTCCCTTTACATTTTCCGTGTGTGATATGTTTTCTAATTTTACACCTATTTTTAACTAGGTACT TGCCAATTGCTCGTTTACATTATAGGTATTCTGCAAGGCATACAGACAGGTTGATCCTTCTGTCCAGTCTAATATGAGAC GTCTTTTTAGAACTTGGAATGAAGTCTTTCCTCTTCAGACCCTTCTGATAATTGAGAAGGAACTTGGCTTCACTCGTAGC ATCCATGTGAATCCCGAGTATTTCGAAAGGCAGCATCTACAGCAATCCAGCACGGTAGGTGAAATGGATGCACCTAAAAC TAATCCTTTAAAGATTTCAAATGTTGAATTTGATTGAGATAGGTCAAGATTGGAAAGTGTTGCAGATACTTTTTTTTTGT GATGAACTGGAATGTGCAGTCATGTGTTCCTTGGGTGATGGAACAGGACTGGAAGATATGTCATTGGCATAAACATTTTA TCTTCAATTTTGCTTTTTGAAAACCAAAACTTTTCTTGCACAAATTGTATTTAACTATTTTGAAGTTGAACTTTTCAGTA AACTAATTTAAACTTCTTTATTATCCTTAATCATGAACTATCTTAATATTTCTTCTTCTATGAGTATATTCTAGGTTTTG TGATTCTTTTTGTGGTTTGACAAATGGTATATGTGCTTATAATCTTGTTAGCTTTTAATGCAAAATATCTTTGAAATTTG AATACTGCTTCAGTGCTTCATAACAACATATATATTTTAGATTTTTGTTATCACTGTTACTGTATCTTAAAATTTGAACC ACAATTCAAAAAACGGCCTTCTGGTCCACAATACTTATGGTTGATTTTGCAGCTAATCCATACAATGTATGCCTTTAAAA TGTGATAAGTTATTGCAATAGATATCTTGTCATTTCAGTTAGTTATACATGCCTTTTTATTTTCTATATCCAGTACTTAA TACTTTTGTAATGTCCTTTTTCACGCTATGAAGACTAAAGGAGGAGTTAATGATATGGCTGGAGCTCTTTACTCAAATGA GGAGTCAGAGAGGCCAGATAGAGCTTTAGCTGCCAGACGGCCATGGCGGGATCCTAGGGTTAATATGCATGTATGTGAAG TAATTTTTCTTTTCCTTATACTGTTGATTGACTTGATTCTCTCAGTTATTTTAATGTTATATAATGGTGTATATTGCAGA ATAATCAGCTAGTGCATAGAGATGCATTTAATGACTCTGATCCTGAAAGGAGTATTGGTGGACCCTTTGGAGGCAATGAA TATAGTTCAGGTATTTCAAGTAAGTCAGGCTCAGGGGTTGGAAGAAATGAAAATAGGCTCATTGGTGGTGTTGCAGAGAC ATTATCTAGTCAAAGAAATGGATTCAGTCTAAAGCATAGTTTATCGAATCATGAAGCACCGAAGTCCATGAACAAAGATG CACATCATCAGTCAACACAAGCGATAACTGACTTACGTAGCAATGTGATGTCTGGTAACTGGAAAGATTCTGAGGAAGAG GAGTTCATGTGGGATGAGATGAACTCTGGTTTGACTGATAAAGGACGCAATGTCTCTAGCAACTTGAGGGCAGACCCCTG GATGGCTGATGATGAAAATCTGGTAAGCTTGGTAAAATAAAGGGTCAATTGCACTTTAAACCCTAATTCCCAAATTGTAG ACGCATCATAAATTAATTCTATGATCTTAAATTCCATCCCTCCATTCTGCATTATTAATGTTACATACATGTTTTATCTG ATCTACTTGACTGATTTTTTCCCCACATGCAGAAAGGTGAAGATCACCTATTCACATCCAAATCACACCCTTTTGGGGAA AAGGTTGATAGAGAAATATCTACTGGTAAGAAACAACTACCTGCATTTGGGGGCCAGTCATCATTATCATGGCAATTGCA GAAGCCGTACTCAAGGGATAAGTTGAATCTGAAGCCAGGTCACTCTGAAGGATCTGTTTCCACCCTTGGTGGCTTACCTG GAAATATAAATTCGTCAGCTGTAAAGATGAGGAATCGGTCTTTTATGCCGAATGCAACGACAGGAGTGGCCAAAAGTATG GGACATCCGCAATTTGATTCTGGGGGAGCTGAATCTCCTTCCGGACAGTCACCTTTGAGAACCCAGTCTCCATCACTGTC TGTAAGCACACACCTCCCTCATTCAGTGCGAAATTTGGCTGAGCAAGATTATCCTCCGATTCCTAAAACATCTCAATTTT TGGGAAGCCAATATAATCCCTCCCCTGCCCTTCCTCACAATGTTAAGGTTGGTAACTTGCGAAAATCACAGGACCAGGAC ATGCATGGTCCACTATCTTCTGTAACTCCTCGCACTGATGTTACTCTTAAAACTAAGAAGGCACCCCAATCTAAAGTTTC TTTAGCCAGTGAAACGTCAGCGAAGTCAACCACAAATAGTCTTTCAGCTGCATCTGTGAAGACTGGAATCATCCCCAACA AATCAACTGCCAGTAGTCTTCCTGCTACAAGTTGTCTGGATGGAAGGAGTCTTCCATCTCAATCAGTGGTTCGGCCTGCT AGGTCAGGTGGTCCTTCCCCTACCACATCAATACCTCAAAGAAAGGCTGGTCAACCACAAAGGGGTTCTACTCAACCAGT TTCCTCTAATGTGAACAATGCCTCAGTTTTGAGCTCAAATACCACCAATAAGAATGCCTTGAATCCAATTGAAAACCTTT TAAACTCATTAGTCGCAAAAGGTTTGATATCAGCAAAAACAAAGTCAGCAACTATAGTACCAAGTGACCTGTTGGTGCGA TCAGAGGACCAAACTGAAAACATTGCCACCAGTAGTTCTTTGCTAGTTCCTTCAGTTACAAGTTCTGCAGTTGTCCCGGA ACTATCTTCCAGAGATGATGTAGATGATGCTGCAAAAGCATCTCAATCAACTAGCGTAGAAGTTAAAGATCTTATTGGCT TTGATTTTAAACCTGATGTAATTCGAGAAATGCATCCACATGTGATCAGGGAATTATTGGATGATCTCCCGCATCATTGC AGAATTTGTGGTGTTAGGCTTAAACAGCAAGAACAGTTTAATAGACATTTGGAGTGGCATGCCACAAGAGAGAAAGAACA AAATGGTCTAATTTTGGCATCAAGAAGATGGTATGCAAACTCAAATGACTGGATTGCTTGCAAGTCTGAATATCAATCAG AGAATGAGTCTACTGATTCTGTAGATGTACATGACAAAAAGACCGACGGTAGTCAATGGGATACTATGGTTCTAGCAGAT GAAAACCAGTGCTTGTGCGTATTTTGTGGCGAGCTATTTGAAGATGTGTACTGTCAGGAAAAGGACCAGTGGATGTTCAA AGGGGGTGTTTACCTGAACAATTCAGATAGCAAACTTGAGATGAAAAGTAGAAACGTAGGCCCCATTGTTCACGCAAGAT GTTTATCAGAGAACCCAATGTCCAATATCACCAATACAGTAAGGCATAAGATCTGATGTTTGTGAATTGTGAATGGAATG TATGTTTATTGAAGGAGTATTTAAATTATTGGTTGTAATTGATTGAACTTGTTCCATTTATGCAGGAGCATGATTAATGC TTTACCCCTATAGCTTTGAAGCTTTGGTGTAGTCAGAAGCTATAAAGGTACCCAGGTTCACTCTGCATACACCAAATCTT GATCCCATTTCAAATTTATTGCCTCTAACTAGTCTCTAGAGCGTTCAAACAAATTTTGTGCTCTTTTTTTTTTTTGTTTT GTACTCAGAAAAAGAAATTACTGTAACAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAATTACAATGTTCAAAATATATAAATGCAA GATAGTTTTTTTGCATCTAAACTTGCTCCTTGATATGATTGTGTTATTTGTTTTACCATGGTGAAGCGGGTTTGCGCATT TAACGCATCTGGGGATAATACGGGGCAAAGCACCAAAGCCTTTGTTCATTCAAATGTCGGATAATGCTGTGTCATTAAAA TAACTAGGATTTTAACACCATCTTTCAATTTTCTGTTGTTAAATTCTAGTTTTTCTCTTTTTTCTTTTGGGATTGGAAGT TCTTCAGAATTTCTCAGTTTCATAGACTGTAATGGGTCATTGTGTTCTTTTCTTGCTGACTGGTGACTTATTTTTGGTTG TCGATTTGGCTGATGAGAAGTATGTTCTTCTTGTTGGATAGCTGAGCCTTTGTTTAACGTAGCCCTCTGGTACCTGGTTA TCATTAGAATTTTAATTCTTGACAATTTTATATTTTAATTACTTAGTCTTATTTATTTTGTAACAAAAAAATCCGTGCAA GGATACTCTATTTATTGAAAAATAGGCTTATAAGCGTCATCAAGTCAATGCGGTTGCTGTTGAATACACATGTTAGAAAA TTATGGTAACCTATACTTTAGTCCATTTCTAGTTTATTTCTGCATAGCAGCCAGTTTGAATTATTAGAAACTTTGAGCTT TGAACAAGTTTTCTCAAAGGTCTTTTTCTGTTTTTAATTCATCATGAAAAGAGTACGTACCTAATTGTAACTTCGAAAGT GAACCTGAAGAAATCAAATATAATCAGAATTCTAAACATCCACAAACTATCTAGAAACTTGGACTCTTAGCGTTTTGACC TTATTGGCCTAAAGTGAAAAGTGATACATTCACGAGTCTAATCTCAAATAGTCACGGACTCACGGGCGTTTGTACAATAG AATTTTCATATAGTTTAAGGGGGAAAAATAGGTCTATA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0679800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGACAACACGCGTAGATCTTTCGATCGATCCAGACTTCCGGCCGCCAAGAAACCCAGGTTAACCGGAGATCCCAACGG CGGTTCGAAGTTTCCTCACCGGCAAACGGGATCATCATCTGCGTTTAATGGCCGACACCCTGATGGCGGCGGCGGCGGTG ACGACGGCGAGTACCACCCTCAGCCGCTGCCGCATCAAGAGCTTGTGGCTCAGTATAAGACTGCTCTGGGTGATCTCACT TCTAACCATAAGCTGATAATTACTAATTTGACTATAATTGCTGAAGAGAATTTACCTGCTGCGAAGTCAATTGCTGGGAC TATTTGTGATCACATTCTAGAGGTTCCAATAGAACAGAAGCTACCATCGCTTTATCTCTTAGACAGTATTGTTAAGAATA TCGGGCGGGATTATAAAAGATACTTCACTGCCAGGCTACCTGAGGTATTCTGCAAGGCATACAGACAGGTTGATCCTTCT GTCCAGTCTAATATGAGACGTCTTTTTAGAACTTGGAATGAAGTCTTTCCTCTTCAGACCCTTCTGATAATTGAGAAGGA ACTTGGCTTCACTCGTAGCATCCATGTGAATCCCGAGTATTTCGAAAGGCAGCATCTACAGCAATCCAGCACGACTAAAG GAGGAGTTAATGATATGGCTGGAGCTCTTTACTCAAATGAGGAGTCAGAGAGGCCAGATAGAGCTTTAGCTGCCAGACGG CCATGGCGGGATCCTAGGGTTAATATGCATAATAATCAGCTAGTGCATAGAGATGCATTTAATGACTCTGATCCTGAAAG GAGTATTGGTGGACCCTTTGGAGGCAATGAATATAGTTCAGGTATTTCAAGTAAGTCAGGCTCAGGGGTTGGAAGAAATG AAAATAGGCTCATTGGTGGTGTTGCAGAGACATTATCTAGTCAAAGAAATGGATTCAGTCTAAAGCATAGTTTATCGAAT CATGAAGCACCGAAGTCCATGAACAAAGATGCACATCATCAGTCAACACAAGCGATAACTGACTTACGTAGCAATGTGAT GTCTGGTAACTGGAAAGATTCTGAGGAAGAGGAGTTCATGTGGGATGAGATGAACTCTGGTTTGACTGATAAAGGACGCA ATGTCTCTAGCAACTTGAGGGCAGACCCCTGGATGGCTGATGATGAAAATCTGAAAGGTGAAGATCACCTATTCACATCC AAATCACACCCTTTTGGGGAAAAGGTTGATAGAGAAATATCTACTGGTAAGAAACAACTACCTGCATTTGGGGGCCAGTC ATCATTATCATGGCAATTGCAGAAGCCGTACTCAAGGGATAAGTTGAATCTGAAGCCAGGTCACTCTGAAGGATCTGTTT CCACCCTTGGTGGCTTACCTGGAAATATAAATTCGTCAGCTGTAAAGATGAGGAATCGGTCTTTTATGCCGAATGCAACG ACAGGAGTGGCCAAAAGTATGGGACATCCGCAATTTGATTCTGGGGGAGCTGAATCTCCTTCCGGACAGTCACCTTTGAG AACCCAGTCTCCATCACTGTCTGTAAGCACACACCTCCCTCATTCAGTGCGAAATTTGGCTGAGCAAGATTATCCTCCGA TTCCTAAAACATCTCAATTTTTGGGAAGCCAATATAATCCCTCCCCTGCCCTTCCTCACAATGTTAAGGTTGGTAACTTG CGAAAATCACAGGACCAGGACATGCATGGTCCACTATCTTCTGTAACTCCTCGCACTGATGTTACTCTTAAAACTAAGAA GGCACCCCAATCTAAAGTTTCTTTAGCCAGTGAAACGTCAGCGAAGTCAACCACAAATAGTCTTTCAGCTGCATCTGTGA AGACTGGAATCATCCCCAACAAATCAACTGCCAGTAGTCTTCCTGCTACAAGTTGTCTGGATGGAAGGAGTCTTCCATCT CAATCAGTGGTTCGGCCTGCTAGGTCAGGTGGTCCTTCCCCTACCACATCAATACCTCAAAGAAAGGCTGGTCAACCACA AAGGGGTTCTACTCAACCAGTTTCCTCTAATGTGAACAATGCCTCAGTTTTGAGCTCAAATACCACCAATAAGAATGCCT TGAATCCAATTGAAAACCTTTTAAACTCATTAGTCGCAAAAGGTTTGATATCAGCAAAAACAAAGTCAGCAACTATAGTA CCAAGTGACCTGTTGGTGCGATCAGAGGACCAAACTGAAAACATTGCCACCAGTAGTTCTTTGCTAGTTCCTTCAGTTAC AAGTTCTGCAGTTGTCCCGGAACTATCTTCCAGAGATGATGTAGATGATGCTGCAAAAGCATCTCAATCAACTAGCGTAG AAGTTAAAGATCTTATTGGCTTTGATTTTAAACCTGATGTAATTCGAGAAATGCATCCACATGTGATCAGGGAATTATTG GATGATCTCCCGCATCATTGCAGAATTTGTGGTGTTAGGCTTAAACAGCAAGAACAGTTTAATAGACATTTGGAGTGGCA TGCCACAAGAGAGAAAGAACAAAATGGTCTAATTTTGGCATCAAGAAGATGGTATGCAAACTCAAATGACTGGATTGCTT GCAAGTCTGAATATCAATCAGAGAATGAGTCTACTGATTCTGTAGATGTACATGACAAAAAGACCGACGGTAGTCAATGG GATACTATGGTTCTAGCAGATGAAAACCAGTGCTTGTGCGTATTTTGTGGCGAGCTATTTGAAGATGTGTACTGTCAGGA AAAGGACCAGTGGATGTTCAAAGGGGGTGTTTACCTGAACAATTCAGATAGCAAACTTGAGATGAAAAGTAGAAACGTAG GCCCCATTGTTCACGCAAGATGTTTATCAGAGAACCCAATGTCCAATATCACCAATACAGAGCATGATTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0679800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDNTRRSFDRSRLPAAKKPRLTGDPNGGSKFPHRQTGSSSAFNGRHPDGGGGGDDGEYHPQPLPHQELVAQYKTALGDLT SNHKLIITNLTIIAEENLPAAKSIAGTICDHILEVPIEQKLPSLYLLDSIVKNIGRDYKRYFTARLPEVFCKAYRQVDPS VQSNMRRLFRTWNEVFPLQTLLIIEKELGFTRSIHVNPEYFERQHLQQSSTTKGGVNDMAGALYSNEESERPDRALAARR PWRDPRVNMHNNQLVHRDAFNDSDPERSIGGPFGGNEYSSGISSKSGSGVGRNENRLIGGVAETLSSQRNGFSLKHSLSN HEAPKSMNKDAHHQSTQAITDLRSNVMSGNWKDSEEEEFMWDEMNSGLTDKGRNVSSNLRADPWMADDENLKGEDHLFTS KSHPFGEKVDREISTGKKQLPAFGGQSSLSWQLQKPYSRDKLNLKPGHSEGSVSTLGGLPGNINSSAVKMRNRSFMPNAT TGVAKSMGHPQFDSGGAESPSGQSPLRTQSPSLSVSTHLPHSVRNLAEQDYPPIPKTSQFLGSQYNPSPALPHNVKVGNL RKSQDQDMHGPLSSVTPRTDVTLKTKKAPQSKVSLASETSAKSTTNSLSAASVKTGIIPNKSTASSLPATSCLDGRSLPS QSVVRPARSGGPSPTTSIPQRKAGQPQRGSTQPVSSNVNNASVLSSNTTNKNALNPIENLLNSLVAKGLISAKTKSATIV PSDLLVRSEDQTENIATSSSLLVPSVTSSAVVPELSSRDDVDDAAKASQSTSVEVKDLIGFDFKPDVIREMHPHVIRELL DDLPHHCRICGVRLKQQEQFNRHLEWHATREKEQNGLILASRRWYANSNDWIACKSEYQSENESTDSVDVHDKKTDGSQW DTMVLADENQCLCVFCGELFEDVYCQEKDQWMFKGGVYLNNSDSKLEMKSRNVGPIVHARCLSENPMSNITNTEHD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 17 | 17 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 191 | 191 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 191 | 191 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 1 | 62 | 62 | - | – | |
| MobiDBLite | 29 | 43 | 15 | - | – | |
| Gene3D | 61 | 189 | 129 | 1.7E-38 | ||
| ProSiteProfiles | 64 | 192 | 129 | 33.544 | ||
| SUPERFAMILY | 65 | 189 | 125 | 2.83E-37 | ||
| SMART | 67 | 189 | 123 | 8.2E-39 | ||
| CDD | 69 | 182 | 114 | 2.5173E-51 | – | |
| Pfam | 120 | 174 | 55 | 2.9E-9 | ||
| PANTHER | 192 | 953 | 762 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 192 | 953 | 762 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 260 | 294 | 35 | - | – | |
| MobiDBLite | 277 | 291 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 440 | 465 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 479 | 679 | 201 | - | – | |
| MobiDBLite | 496 | 523 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 536 | 550 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 566 | 679 | 114 | - | – | |
| ProSitePatterns | 807 | 827 | 21 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleic acid binding | Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0679800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…