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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0682500 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0682500.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | E3 ubiquitin-protein ligase; TAIR: AT3G53090.1 ubiquitin-protein ligase 7; Swiss-Prot: sp|Q9SCQ2|UPL7_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase UPL7; TrEMBL-Plants: tr|A0A151TVC8|A0A151TVC8_CAJCA E3 ubiquitin-protein ligase UPL7; Found in the gene: LotjaGi1g1v0682500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:124987550..124999477) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAGGTGTCACTGAGAGGAGCGAGTGCGAAGGAGATAACGAGGGATGATCTTCTCCAGAAAGTCTCCCGCGAAAGAGAGCT TCGCAATTATGCAAAACGCGCTGCTGCTGCTGCTCTCTTCATTCAGGTCCATCATCTTTTCATAGGAAAATTTCCATATT GAACTTGCTATTGTTTCTTATAATCGAATTAGCAATCTACTTTTGTGATTTTGTCAGTTTTGTCTTTGTGACTGTAATCA AAATGCTCTATCTCAAACATAGCTTCATTGATATTGGATAGTGTGTTTATGACTTTATGGTATGTTCTCCGGTTTAGATG CATGAGTTCACTTAGGGTGAGTCTTAAAGTTTTATTAGGTTCTTTCGCTTGATGCTTTAGTTTTAGGTAAAAATGCTCGA TTCTATTTTTGTTCAATTGATGAGTCCAATATTGTGTACCCGGGGCCTACTTCATGGTAAACTTGACATTAGAAAGTTAT GAACCGCAGTTTGTAAATCTCTTCGTTGTTTGCATTTAAATCTCGTGTTTGTGTTGAAACTTGTTGTGGAGAAATAACGT CTCTTTCTTAATGTTGAAAAAGAGGGTATGGAGGCGCTTCAAGGTTATGAAGATGGTTTCCTTGCAGCTTCAGCAGGAGT GGGAGACAATGGTGAATAATTATAGTGGGGTGAAGACAGCCGTTTGGATTTCAGACAATTTGTTGAGACCATTTTTGTTC TTTATGATAAGCTCCTCAACTAAGCATCAGAAGATCCATAGGAAGAAGATAGACTCTGTGAAGATTTGCTTTACAATCCT TTTGGAAAGCCTGAAATCTTCTGGTATATTTCGTTTAGATGTTCTTTTGTTGGATTTCAAGTTCACGTTCTAATTATGTT ACTCATTTTAGTGTGATAGCATGCCAGATACTTTCTGTTGCTCTATTTTTTCTCAGATTTGAAAGTTCATAGGACCTTTT TTTATTCTTGTTTAACATACCTACTTAATACATTTCTACTTGATATTTTTGTTTTGTTTAGATTCAAAGCAGAACTATTG CTTTCTGGCAATTGGTACAACTGAAGAGAGAAGAATATGGAGTTACCAGGTGCAGCAGCTGACTTCTCTTGGTTTTCTGA TTCTTTCGGAGTTTAGTGAATGCAACTCAGGGGCTGAAGATATTACTATTGTTACATCCCTGGCAATGCGTGTCCTTGTT ATGTTAACTGATTTGAAAGGATGGAAAGGCATTACAGATGACAATCGCTTAGATGCAGATTTAGCAGTGAAAGATTTAAT TCAGTTCTTGGGGAGTAGTAAAAGTGGTAGTTATGTTTCTATTGCCAGATATATTAGTGCATTGGATAATTATTCTTCTA AGTCTAGAATTATCACCCAGGCAGACGAAAACTTTTTCATTACAACAAGTGCAATAACTTTAGCTGTGCGGCCATTTCAT CTGACAAACTTCAATGTCGAAGGGCCTGGAATGCTGGATGTCAACCATGCTGTTAAGCAGTATATTGTATATCTACTGAC TATTCCTTGGCTTGTGCAACATCTTCCACCTGTTCTCCTCCCTGCTTTGAAGCACAAATCTATTTTGTTCCCATGCTTCC AGAATTTATTGGTAAGAATCATTGGAGTAGAACAATTTCACCTGCAAAATGACTCTACTCTTTTATTTTAATGACAACTT GGTCTCTTTTATTCTTTTTTATTCTGTATGAACTTCTTGATTTTTTTTCTTTTTTTTGAAGTCGCCAATAGATCATGCAA ATATAATCCATATGTATTCTTTAATGGAAGTAGTTCCAAATTTTGACTTTGGATTTTTCTTGATTATTCTGTGTGCACAT TGGATTTTTCTTTGCATAAGTAATTTGTTTGATGTTGTAGTTCTAAGTTTACTGTAGACAAGCCTTTCATTCCAAATAGC 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TGGGAGGTATTGTTACCACATGTGTGTACCTAATAATATCTTGGCACCTCTGTGTGTGTGTGCGACTTTGAATTCTGTAG AGTTGCTTGCTGGGCATGCATGACTGTTTATCATATTTTCTTCAAACTCGGCTAATGCACCATGAAAAAGTGAGCTGGGC ATGCATGACTGTTTATCATATTTTCTATAAAGAGCTGCTTGACAGCCACACATGCCAGAATTTGGGGAGCAAAGCAAAAG TAAAAACAAAAAAGTGAATTGTTACAAGGTAGGTTGATAAGAACCTTGGGAGAACTATTGGATCCCAATCCATGACCGTG CGGGCCAGTTGTGCAGTAGCCCTTTGATTAGTCCCTCTAGTCCGGGTGAACACTGCAATACCAACATCACCACCCACACT GCTCGTTTGCTGTGTCGATTGATAATAACCTCGGGAAAACAATACCACAAAAGCTAGGTGTTGTAGTTGGAGAGTCCAAT GCCTTGTAAACCCCACACTAGAATCCCATGCTTCCAATGTGAGACTCAAGTCTCATATGTTACCTTACAATTGGATCCTA ACATAGGTAAACTAGGATTGCTGACTTGATGCAAAAAGTTGCCTTTTATTTTATTATTTTCAATATATTTCCATATATGT TGGACTTAATGATTCCATTCAACAATAATGGAGAATTTCTTTATGTCAAAATTTGATATAGCTTGTTCTTCTAGAATTTA ATACAGGTAATACAATTGGATGGTTGACAAGAGTCAATGTTGTTTCTGTATATTTTCTGCTGTTTGAGATTGTTGAATTA CTAATGAAGTGAATCCTTTGGTTAACGTATCAGGGGTCACCCTCTTCCCCTTTCCCTCTTCAAGTAGAGGCCTTCTGTTC TTTCTTTTTTTCAGTGAATTAGGTTGAATTACGTCTCCTCTTAGTACCTGATTCTTACAAATTTGCTAGTGTGTAAATTT TGTGCATGTCAATTACTGAAGAATGTGACATTTGACCTTTATTTTCAACCTCATGATTCGTATTGAAGAGTTTATGCATG CTATTTATGCAGGTGCCTATTTTAATACATCAATAATCATTTTCTGCTTTCTGCCAACTGTTTGCAGGTGATTAAAGGTT TTGAACCCGAAGAGCGTTGTATGCTTCTTAAATTTGTCACCAGCTGTTCTCGTGCTCCATTACTTGGATTCAAATATTTG CAGCCACCTTTTACCATCCATAAGGTATGTTCTTGACCATCTATGGGTATTAAAATCATTTATTCTAGCACCTCTATTAT CCCATTTTCTTTATTTCTGGTAATGAAATAAGGGATGGCTTGTAACTTTTCTTCACTCGAGCAGTACATTAAGCACAACA ATAGAGTTAAGAAGAACACCTTACACTTCTAATCAGTACCTGGAATAATTTGTTCCCCTAGATGGATTTTTATGTGCTAA GCAGTATATAATATATGCTTAGTGCTTTAATTGCTTGCTATCCATTGAAAGATTGTCTACCTACCCCATGTCGACTTTCA ACATTATAAATCCCAAAATACAACGAGAATCTATATTTTTACATTTTATGCATGCAACCAAATCTTTTTAATTCATAGTG CTGGAAAGAGAAACAAGAAATTTAAAATGTCCATATAAGCTTTTTCTGAGGCTCTACTAATAACATAATGGGAAGTCTAA GAAAGGAACACTTTGGTTCTAACTTCTAATACCTAATAAGATGACATGATGAACTCTGTTTTACATGCGCAACAATCACC TAGCATTGTAGTCCAAAGTTTTACTTTTATCCTTCTGAGAAGGGATTCCTTGCAAATTTTCGAGTCCAATGGCTTTGATG TTCAGCATCACCCTCACCAAGTAGGGGCTTCTAGAGTGCTTTATTTTGCTTCTTGGATGAGGTTTTCATTTTCAGCAGTT ATCTTGACATTCTTTTTAAGAATTCAACATGGTTGTTAAAACCGGACCGGCCGGTTCGACCGATCGAACCAGGAACCGGA CCCTTGGCCGGTCCAAAGTAAGCACTAAACCGCATGGTTAGAAAACCGGAGCTGAACCGGACGAACCGGTCAAAGCCGGC AAAACCGGGAAAAACCGGCCGGTTGGCGGTTTCAGCCAGTCCAACAAAAAAAGGTATTTTTTGCGTTTTTTACTTTTTTT TTGGACAAATTGGGAAGGTGGGCTCAGCCCAGGATACATCCAGTCCACAAAAAAAGGGGAGTTACTAGTCTTCCAACTAG AATCAAACCTGGAAAAAAAAAAACTAGAATCAAACCCTAGTCTTCAACCTCTTCAGTCTTCACCTTTGATCTGCCGTTGC GCCATGCGCCGCCGTCGCCAGAGTTCTCCGCACGCCGCTGTTGCTGCAAGCCACGCCTTCCTCTTTTCTTTCACTTCAGT CTCTTTCTTTACTCTTCAATTGATTCTTGGTTTATTAACAAAGAAAGAAGGTCTGAGAATGAGAAATAGATTTACCCAAT TATAGATCTCTGTTTGGGCATTTCGGTTTGGGATTATAGGTGATTGTGATGAAATCAAGCTTGTGGGGGACGGCTAATTA GAGGAAAGAAAATTGATGCTCTGGGTCTGATGCTATGCTCGTATGATATGCCTTGGTTGCTTTCATTAATGGGATTGAAT GATTGAAGGATTAGCCTTGTTCGACTTTCAAACTTCACAGGAAAGGATATAGACATTTAGTGCTGAATTAGAAGTGCTTC TTGTTAAGGGTTGTGATTCTCTCCTCTCTAAATTGTTAATATGTTGTTTTTTTTAACAGTAGACTTTGTTAATTGTTTTT TTACGGGACTTTGTTAATTGTTATTGTTATGGTGTTGTTGTTTTTCATTTCAGTCAAGTTTGGATATGATATTTGAAGTA GGCTTTGTTAATTTGTTCTTTTTTTTTATTCAATTTAACAACCCTATATACCTTATATATTATATATTTATTTTAAAATA ATATTATTTAGTTTACATCGGTAATACCGGTTGGACCACGGTTCAACTACGGTTGAACCAGTGAACCTTGAACCAGTGCC CTCACCGGTTTAATTACCGGTCCGGTTTTAATAACCTTGGAATTCAATAATCCGTTTAAGAACGAAAATATTTGGCCTCT CGTAGCAAGCTTTTGATTTTGAGGACTTTTTCTGCCCTTTGTCCCTTCTTTATTATTGCCTTTAAAGTATCATTGATCCT ACAGTGGAATTAGAAGAGTCCCTGGAAGTAATGCATTTTTTTTAATGAGTACTAAAATATCTTGATTTCCTTGATTGATG TCACTTGCTCTCTTTGTTTACCTAGGTTGCATGTGATGTCCCACTTTGGGCAACGATTGGCGGACAAGATGTAGAGAGGC TTCCATCAGCTTCAACTTGCTACAATACTCTTAAGGTACCACTAATAGAGTAATAGGGGAACACATTCTTGACCATATGC TTGGAGACATTTCGTGTGATAGGGTCCTGCTTGCAAGTATTTTTCAAAAAATCTATGAATAAATGTATTTGGGATTTGGC TGAGATATTTGAAAGTTAAGATTTCATGTTGGCTAAGTTATGGCGTATAGCATGGGGAAATGTCATACCCAAAAATATCA TATAGATAGGTTTTTCGGTGATATATTGACACTTTTGTCACAGTGATATATGTATATGGGATTTTGGATATCCCTTTAGT GATTTAGCCAGGTCATTGAGACAAAAGTGTTGGTTTTAAAGGAAATCTCTTTTCATAGGTTTGAATTGTTCACAATGGTT TTCTCCTTTCAATGATTACAGCTTCCAACATACAAACGTTCAGGCACTTTGAGAACAAAGCTTCTATATGCTATCAGTTC AAATGCAGGGTTTGAACTTTCTTGATTTGCTACAGGTGGTCAGTATTTCTTTTCATTGTATAATGAAGTCATCCCAATTT CTGTTGCATCTGCTTTGATAAATCATGCTCTGCAAGATTATTGCATGTTTCTATGCTTCTGTTCACCTGTCCTGGATTTT AACTTCATTGATTTGCTTGAGGTGGTTGGTATTTTTTTCAATATATAATATAATGAAATCTTGCCAATTTCTGCTGCATC AACGTTGATAAATTATGAAAGCAAGAATAGGACATGTTTTTATGCTGTTCAAGTATTCCAGTATTTGGTTGTTTATTGGC TGTGCCCACTCTAGTGTGAATAAAGTTCTTATGTCTTAATTTCATTCAATAAAAAATCCATTGGAAATTGGGAGATAATG TTGGCATCAAAGATGTTCTGAAGAGACAAGCATTTAGTTTTGGAGGGAAATTTAGAAACAAGCCAAAATAAGAGAGAGAA CTGTTTCAATAATAAGGTTACTGGGATATATAAATAGGAAGTCTGAAGTCCAAATGACCTTATTCTGAAAACATTCTTCT CTCTTATTTGGCGTGTTTCTTAATTGCGATCTTAAGAGGTAAAATTGACCTTCTATTCCCTCTTCTCATACACTCCCACT TTCACATGGTGCTCTTTGTATCTATATTATGTGTGTCTAAAAATCATTCATTGGATTGTGACTTAACAGAAATTTAATGC AGCTATTGGTCTAATTAATCACATGCAATCTTTTGCAGTTTAGTTCTTATTCAAGGAGTTCGAGAATAGTCTATTTGTCT GTGCGACTTTTATATGCCAACTTTCAGTCAAGTAAATTGTTATTGAGCCTGGTGATCATGTTCCAAAGAGGCAGTATAGA TCAAGCACCACAAGTTAGACCAAGGAATCTTTCAGACGTGCTGTTTTTGAAAAAGAAAATAGCATTCTGGTCTAGTCTGA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0682500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGATGGTTTCCTTGCAGCTTCAGCAGGAGTGGGAGACAATGGTGAATAATTATAGTGGGGTGAAGACAGCCGTTTG GATTTCAGACAATTTGTTGAGACCATTTTTGTTCTTTATGATAAGCTCCTCAACTAAGCATCAGAAGATCCATAGGAAGA AGATAGACTCTGTGAAGATTTGCTTTACAATCCTTTTGGAAAGCCTGAAATCTTCTGATTCAAAGCAGAACTATTGCTTT CTGGCAATTGGTACAACTGAAGAGAGAAGAATATGGAGTTACCAGGTGCAGCAGCTGACTTCTCTTGGTTTTCTGATTCT TTCGGAGTTTAGTGAATGCAACTCAGGGGCTGAAGATATTACTATTGTTACATCCCTGGCAATGCGTGTCCTTGTTATGT TAACTGATTTGAAAGGATGGAAAGGCATTACAGATGACAATCGCTTAGATGCAGATTTAGCAGTGAAAGATTTAATTCAG TTCTTGGGGAGTAGTAAAAGTGGTAGTTATGTTTCTATTGCCAGATATATTAGTGCATTGGATAATTATTCTTCTAAGTC TAGAATTATCACCCAGGCAGACGAAAACTTTTTCATTACAACAAGTGCAATAACTTTAGCTGTGCGGCCATTTCATCTGA CAAACTTCAATGTCGAAGGGCCTGGAATGCTGGATGTCAACCATGCTGTTAAGCAGTATATTGTATATCTACTGACTATT CCTTGGCTTGTGCAACATCTTCCACCTGTTCTCCTCCCTGCTTTGAAGCACAAATCTATTTTGTTCCCATGCTTCCAGAA TTTATTGATTTTGAAAGAGAATGTTTTAATGGAGATGTCAGAGTTGGACAAGTCAGAGAATGTTGTCTCTTTCAAGGCAA TTCCACCAGTTGGTTGGGCTCTTGCTAACATCATATGCCTTTCAAGGGGGAATGAGAATGATTCTATTGACTCTGGATCC TTCAATCAAGGTTTAAACTATGCATTATATGTCCATGTTGTTATCATTCTAGCAGAAAGCTTACTGGCTTGTCTTGATAA TATTGGATGGGTTAGGAAGAGGAAGGCCCTTCAAACTGATGTTGAAAGCTCAAGGCAGCCAGTTGATTTGGTTCGACATG AGGGTGAGGCAACAAATGAGTCATTAATAATGTCATTCATGGATCAGTTTAGGCCTGTTTGTCAGCAGTGGCATCTCACA AATCTTTTGGCATCAATAAATAGAGATGCCTCCAACAAGGCTGAGACTTTGCTCTCAAATAGTGTGGAATCTTTGGGGAA GCTAGATTTGTGTGATATTGCACTTTTTTACTCCAACTTAATTAGAATTTTTTCGGTCTTGAGTCCAATTCGTGGCTCAT TACCAGTCCTCAATATGCTATCGTTCACTCCTGGATTTCTTGTGAAATTGTGGGGTGTACTGGAGGTTTCCTTTATCTCT GGAGACAAACATATTTCTGATAATCACAAAAGTGGAAATGTAAAACAAAAAGCTTTAGAGAAGATGCAAAAACAGGTAAG TAAAGATGGGACTAATAAGTGGGTCAGCGTACTTCATAAGTTTACGGGCAAGTCACAAACTGCAACAGGTGATACAGATC CCACTGGGAATCACTCTGAGCCCAGCAGAGTGAATGAGGATTCATCAGATATATGGGACGTAGAACCTATGAGGCATGGC CCACAGGGCATTCCAAAGGATATGTTTTCTTTGCTTCATCTTTTCTGCGCGACCTATTCTCATCTGCTTTTAGTTCTTGA TGACATAGAATTCTATGAGAAACAGGTTCCATTCAAATTAGAGCAGCAACGAAGAATTGCATCAATGCTGAATACCCTAG TGTATAATGGCCTGTCCCATGTTAGTAGTCATCATAATGGGTTCCTCATGGATTGTGCTGTCAGATGCTTACATTTAATG TATGAAAGGGATTGCAGACACCCTTTTTGTCCTCCTGATTTGTGGCTTTCTCCTGCTAGAAAAAGCCGGCCTCCAATTGC TGTTGCTGCCAGAACTCATGAAATATTATCAGCCAACCTGAGATTTGATGATTCATCAGCCTCCCTGAGTGTAGGTTCCG TTATCACCATGACTCCTCATGTGTTCCCTTTTGAAGAGAGAGTTGAGATGTTCCGTGAATTCATCAAGATGGATAAAGCC TCCCGAAAAATGGCTGGTGAAATTTCTGAACCTGGTTCACGAGCCGTTGAGATAGTAGTACGTCGAGGTCATATTGTTGA AGATGGATTTCGGCAATTAAATTCCCTTGGACCAAGGTTGAAGTCATCCATCCATGTATCATTTGTCAGTGAATCTGGCC TTCTGGAAGCTGGTCTAGACTATGGAGGATTATCTAAAGAGTTTTTAACTGACATATCAAAAGCTGCATTTTCCCCTGAA TATGGACTTTTTACACAAACCTCAACTTCAGACAGGCTGCTAATTCCAACTGCATCTGCAAGATATTTGGACAATGGTTT TCAGATGATTGAGTTCCTTGGAAGAGTAGTCGGTAAAGCTCTTTATGAAGGAATATTGCTTGATTACTCCTTCTCGCATG TTTTTGTAGAAAAGTTATTAGGACGATATAGCTTTCTGGATGAATTGTCAACACTTGATCCAGAGCTATACAGGAATCTT ATGTATGTCAAGAATTATGATGGTGATGTCAAGGACCTCTGTCTTGATTTCACAGTTACTGAAGAATCATTTGGAAAAAG GCATGTGGTTGAGCTCAAGTCTGGCGGCAAAGATATTTCTGTGACAAATGAGAACAAGATGCAGTACATCCATGCAATGG CAGACTACAAACTTAATCAACAGATACTGCCCTTTTCAAATGCATTTTATAGAGGATTAACTGATCTTGTATCTCCATCC TGGTTGAAGTTATTCAATGCGAATGAATTTAATCAGTTGCTTTCAGGTGGCAATTACGATATTGATGTTGATGATTTGAA AAATAACACGCGATACACTGGCGGTTACAATGAGGGAAGTCGGACAATCAAGATCTTTTGGGAGGTGATTAAAGGTTTTG AACCCGAAGAGCGTTGTATGCTTCTTAAATTTGTCACCAGCTGTTCTCGTGCTCCATTACTTGGATTCAAATATTTGCAG CCACCTTTTACCATCCATAAGGTTGCATGTGATGTCCCACTTTGGGCAACGATTGGCGGACAAGATGTAGAGAGGCTTCC ATCAGCTTCAACTTGCTACAATACTCTTAAGCTTCCAACATACAAACGTTCAGGCACTTTGAGAACAAAGCTTCTATATG CTATCAGTTCAAATGCAGGGTTTGAACTTTCTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0682500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKMVSLQLQQEWETMVNNYSGVKTAVWISDNLLRPFLFFMISSSTKHQKIHRKKIDSVKICFTILLESLKSSDSKQNYCF LAIGTTEERRIWSYQVQQLTSLGFLILSEFSECNSGAEDITIVTSLAMRVLVMLTDLKGWKGITDDNRLDADLAVKDLIQ FLGSSKSGSYVSIARYISALDNYSSKSRIITQADENFFITTSAITLAVRPFHLTNFNVEGPGMLDVNHAVKQYIVYLLTI PWLVQHLPPVLLPALKHKSILFPCFQNLLILKENVLMEMSELDKSENVVSFKAIPPVGWALANIICLSRGNENDSIDSGS FNQGLNYALYVHVVIILAESLLACLDNIGWVRKRKALQTDVESSRQPVDLVRHEGEATNESLIMSFMDQFRPVCQQWHLT NLLASINRDASNKAETLLSNSVESLGKLDLCDIALFYSNLIRIFSVLSPIRGSLPVLNMLSFTPGFLVKLWGVLEVSFIS GDKHISDNHKSGNVKQKALEKMQKQVSKDGTNKWVSVLHKFTGKSQTATGDTDPTGNHSEPSRVNEDSSDIWDVEPMRHG PQGIPKDMFSLLHLFCATYSHLLLVLDDIEFYEKQVPFKLEQQRRIASMLNTLVYNGLSHVSSHHNGFLMDCAVRCLHLM YERDCRHPFCPPDLWLSPARKSRPPIAVAARTHEILSANLRFDDSSASLSVGSVITMTPHVFPFEERVEMFREFIKMDKA SRKMAGEISEPGSRAVEIVVRRGHIVEDGFRQLNSLGPRLKSSIHVSFVSESGLLEAGLDYGGLSKEFLTDISKAAFSPE YGLFTQTSTSDRLLIPTASARYLDNGFQMIEFLGRVVGKALYEGILLDYSFSHVFVEKLLGRYSFLDELSTLDPELYRNL MYVKNYDGDVKDLCLDFTVTEESFGKRHVVELKSGGKDISVTNENKMQYIHAMADYKLNQQILPFSNAFYRGLTDLVSPS WLKLFNANEFNQLLSGGNYDIDVDDLKNNTRYTGGYNEGSRTIKIFWEVIKGFEPEERCMLLKFVTSCSRAPLLGFKYLQ PPFTIHKVACDVPLWATIGGQDVERLPSASTCYNTLKLPTYKRSGTLRTKLLYAISSNAGFELS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1104 | 1104 | 0.0 | – | |
| Phobius | 1 | 326 | 326 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 1104 | 1104 | 0.0 | – | |
| Phobius | 327 | 345 | 19 | - | – | |
| Phobius | 346 | 567 | 222 | - | – | |
| MobiDBLite | 524 | 542 | 19 | - | – | |
| MobiDBLite | 524 | 549 | 26 | - | – | |
| Phobius | 568 | 586 | 19 | - | – | |
| Phobius | 587 | 1104 | 518 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 736 | 1097 | 362 | 1.01E-108 | ||
| CDD | 737 | 1102 | 366 | 1.04359E-147 | ||
| Gene3D | 738 | 976 | 239 | 6.1E-75 | – | |
| SMART | 754 | 1104 | 351 | 3.8E-119 | ||
| ProSiteProfiles | 760 | 1104 | 345 | 84.159 | ||
| Pfam | 791 | 1104 | 314 | 1.5E-92 | ||
| Gene3D | 862 | 941 | 80 | 6.1E-75 | – | |
| Gene3D | 979 | 1104 | 126 | 9.6E-40 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Ubiquitin-protein transferase activity | Catalysis of the transfer of ubiquitin from one protein to another via the reaction X-Ub + Y --> Y-Ub + X, where both X-Ub and Y-Ub are covalent linkages. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0682500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…