Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0743500 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0743500.1 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Carbon catabolite repressor 4-like protein; TAIR: AT3G58580.1 DNAse I-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9M2F8|CCR4B_ARATH Carbon catabolite repressor protein 4 homolog 2; TrEMBL-Plants: tr|I1JQF1|I1JQF1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0743500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:131705857..131712995) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAGCTGAGTGAGAAAATTTAGTTTATGCACGAGAGGATGAAGATGAATGTGTATGTAGATAACCTTAAACATGAATTTT TTTGGAGTAGTTAATAATACGAGGACTATAATAGTAGCGACTCTTCTCTCTCTCTCTCTGTCTTGGCAATTCGCAATCGC ATCATCAAAAAGGAACCACATGCGATTTTTTCACACTTCCTCTGTAAAACCCTAATCTCATTTCCCTGTTCCTCTTTCTC TCTCTAAAAACCTCGCTTTCTCTCTCAACACATCAAATCTCGATCCCTCCCTCTCCGATTCATTGCCCCAAATCCCTAAT CCGCTATCAATTCGGGTCTGTCAAGGCTGGCGGCCATTCGGGTCAAGTAAATGGCGGATCCGCCAGGTGTCCGCCCTCTT AGCAGCTTCAAACGCGGTGCTCCGGGAGCCGACGGAGTCGTTTGTTCTCGTGTTCGATTGGTTTCGGGGTCCTTGATAGG GTTACAGTGCCGTGACGATTGCCAAGAGTAAAGCATGCTGAGCGTGCTGCGTGTGCACCTTCCCTCTGACATTCCTATTG TTGGCTGTGAGCTCACGCCTTACGTGCTCCTCCGCCGGCCTGACAAGACTGTTACCACCGATGATGCTCTCGAAACTGCC CCTCTAGACGGCCATTTCTTGCGCTACAAGTGGTGCGTGCTGTTCCATTTACTCCCTCTTCCTATTTGAATTTTGAATTT TGTTTGCGAATGTTGAAAATGGTTCCTGCCTATCATTTTTTTATCGTTGTGCATAATGGGTATTTAAGCTTCAATATGTA GTTCTTGGGAGTTAATCAGTTATGCTAGTTTGTTACTATTTGAAAATTGGAAGAGTATGAAGTGAAGTGTAAATGCTCAT ATGTTTAGTTTTGGTTTAGTAGAAGGCATAATATAGTTTATCCCATAGTTATCGATAGCGCGCGATAACGGCGCTTCGCG CCAAAATCCCGCTATTCCCGGCCATCCCTTGTGCCATCCCTTGTATGGGATTTCATTTTTGGGGGTCATCCGCGACATGC CGCAATCCGCAATTGACTACTATGGTTTATCCACCATGTTAGCTTATTACTTTTTTCTTCACTCCTGTGGCTAATGCATT TGTATCAAATAATCCAAATAGCAACACTTGTTTCATTCCTCTTTCCTTGATGTTAATTTTGTTTGCGGTGCTAAAAAAAT TTAAGGATAGTGAAAGCTCGTGTAACACGTTGTGAATTGACTAAAGTAATTGATTTTTTTAAGTGCTTAGAGGATGCCGT TGCAGTGTTTTATTAAGGAAAAAGTATCTCTTGATTGTCTAATGTCTGGTGATGATCACTAGGCGACAAAGGATTATAGA ATGTGGATTAATACTTGCACATTGTATAATTTGTTTCCTTCTACTTTACTTTTATTTGTAAATTAATTTGAATATTCATT ATCATCAATTCTTGTGATAATTCTAGTGCTGGACTTCATTATGAACTGATTTATTTCTTGTTGATAACTTTATCCTCGCA TTCAAGTCACAGTCTTCTCCTTAGTGGTTCCGACCTGCAGAATTTTTAATTCACTTATATGGAAATCCCAATTTGTAATG TTATAACCAGTGTTAGCGGATTTTTGGCTAATCGCGACGCCGCTATTGCCCACTATAGCCCGCTATTCGCCGCTAAATAG CGGCCGAATTAGCGGATTTTTGGCTCACCGCGATGGTCCGCGTTCGCGATTTGACAACACTGGTTATAACATATTCTCAG TTCTGAATAAATCACATGACATTTAAATTTTGGCTATAGACTTCAACTGCAGGGTGTGGAATTTATATTTTCTTTCACAT ATGTCTTTATGGTGTGACGATTGTATATATAAAATATGTGAGATTAGTCATTAGTTCACCTGAAGTTCATGAGTGTTAGT TAAAATAACATATAGATTCCATCAATTCCAAAACAAGATTAGCAATCCTAGATTTTCTGTTAGCGATGGGACGTCATCTC GATTGGCGTCTTGTGCTGATCATAAGAATCTTCAATACTCTGAAGTATCTAGTCCAGTTATTAATGTTAGTGGAATTTTT TATGGGATATGTTTTGAATGTTATCAGCTTTTGTCGTTTGTGTAATTTAGACATTGATGGAATTATTGAAGATTATGCCC TTATGGATATTTGGACCAATGTTGCGAGAATTTCCTTAGTATCACAAAATTGATTGCTTAAACAGTTGCTTGCGATTATT TTATTATGTTAAATACCAATTTGATCCCAAATATACTGCCTTAAATCTGATTTCCCTATTCATCTGATCAAAAATTTAGA ACTTTATGTATTTACTATTTGACACAATCATTGGGTCCCCCTTTTTGTCAGGTATCGTGTACAAAGTGATAAAAAGGTTG CGGTTTGTAGTGTACATCCATCCGAGCAGGCCACACTGCAGTGCCTAGGTTGTGTTAAGGCTAAAATACCTGTTTCCAAA AGTTACCATTGCACTCCAAAGTGTTTTTCAGATGCATGGCAGCATCATCGTGTTTTGCATGACCGTGCTGCTAGTGCAGT TAATGAAAATGGAAATGAGGAAGAGGAAGTATTTGGGCGATTTAATAATGCTGGGTCTGGGTCAATAAATACCAGCTTAT CTGCCTCTGCATCAAGTGGTAGCTTGACAAATGGGTCAGCACCTCTGTATCCAGCAGCTGTTACACAACGAAGTGGTGGT GAAACTTGGTTTGAAGTTGGACGGTCTAAGACATATACCCCAACAGCTGATGACATCGGTCATGTCCTTAAATTTGAGTG TGTTGTAGTTGATGCAGAGACAAAACTTCCTGTGGGACATGCAAACACTATACTAACTTCTCGTGTTATTCCTGCTCCCT CTCCTAGTCCACGCCGACTGATACCTGTTGACGGGATGGGGAATGTAGATGCAGATGGGCGTGTATCATCTTCGGGAACT TTTACTGTTTTGTCATACAATATATTGTCTGATTCATATGCTTCAAGTGATCTATACAATTACTGCCCTTCATGGGCTCT TTCTTGGCCATATCGGAGGCAAAATTTGTTGCGCGAAATAGTTGGTTACCGTGCTGATATCATTTGTCTTCAGGAGGTAC GGTGCATAAATATGTCTTTTGGCTTTGGGTTTTGTTGTGAAGAAAGTTAATAACTGTTATACAACTCATCTCATTTTCAA AGTTTCTTTAGACTAGTGTTGAATAAGAATTCTATTTCACTGTCCTAAAGTCTTACTTAATCTTCAATAGCAGATGGTTT TTGTAAAAGCTTGATTATGGACCCGGGGCGCAAAGTAATGCTGCCACTGGTAGCTCATTCTAATTTTAATATTTTATAAC TTGGATGGCTATCAGTTGTTAATGAACTTAAATAAACGATACCTTAATTTCTATGTTTTTATGTTGGTATTTTTCGAGGG ATGTGGTATTGTGGTATCATGGTCCAGTGTATCCTAACCATTTTGAGATAGAATCTATTTCTTCTCCACTTACCACTGGA TCCCTTAGAATTACACAATTGCATATTATATTCTAATGGTTTCTCTATCAGCTAACATCCATTCTGTTTCCCTCCAGGTT CAAAATGACCACTATGAAGAGTTTTTCGCTCCTGAGCTGGACAAACATGGCTATAATGGTCTTTACAAAAGAAAAACAAA TGAGGTTGTTACACTAGTCTGCTATCTTGTGATCGTAAACTCATAATTTGTAAAACTCTATTGAAACCTCTTTTTGGCGG GCTCACAGGTTTTCAATGGCAATATTAATACAATTGATGGTTGTGCTACATTTTTCCGAAGAGACAGATTTTCACATGTG AAGAAATATGAGGTTGGAAATTGTTTTTATGTGTATAGTGGTACTCTTTAGTTTGTGCATAACATATAATGGTGTCTCCT TGCATGCAGGTTGAATTTAATAAGGCTGCACAGTCTTTAACAGATGCCATGATTCCAACCACTCAGAAGAAATCTGCTTT GAATCGACTGGTTAAGGTGATTTATTGCACAAAATATTGCATATTACTTTTGCCTTCCAAAATATATGGTCGTCTCTTGT GTATCTTGTGCTTACTGATTTTAATTTATGTTCTTAGGATAATGTTGCGCTAATAGTGGTTTTAGAAGCAAAAGTTAATA ACCAGCCTGTTGATAATCCAGGAAAAAGACAGCTTCTTTGTGTGGTAAGCTCTTTTATTTTGCTTTTATTTGTTACTGTT AGGTCTTGTGTGCTCATGCCTTCAAGGCCTGCGATGTGTATTTTATATCTACACTTATGCCTTTTATTTTATCATTCCTC ATTTCCCCGATTGTAGTTGCATTGTATGTTTAATGATAGGGCTTTTTCAGCCTTGTGCTTCATGTATGCTCCTTTCTTTA GAAGGCTTGTTTTTCTCAAGCAGAATTAGGTTTAGAAGATTTTCCATGATGACTAATTCTAGCTTTATTATTTTGCTGAT GGTGGTTGGTCTTGTGTAAGAAATCTAGATTGTTAAACTTCTGAGGTGTTCTATATTTTCATAAATTAACTCTAAAATCT CACGCTGAAACAACTGAGCTATATGTGGTTTTAAGTTTTTTTTGTAAACTTTATTTGGATCTCTCAGAAAATTTATTATA TTTCTTTGTTTCCCCTGCCTTTTTCTTTTGTTGTTGTAGGTCAAAACTACTTCTTTAGTAATATAACTATCTAAACTAAC TCATATATTGCTTGTGGACATCAGGCGAATACACATGTAAATGTCCACCAAGATTTAAAGGATGTCAAACTCTGGCAGGT TAGTCATTTCTTTTGCTTCCTCACATTTATTGGAATGTTTATTTTGATCATTACAGTTATAAATTTCCTTCCATTTTTAG GTGCACACTCTCCTGAAAGGATTGGAGAAAATTGCTGCAAGTGCAGATATTCCAATGTTAGTTTGTGGGGACTTCAATTC AAATCCGGGAAGGTTCGATTACTTTTATTTTTGTATAATTTTGGAAACTTGTGTTCGGCATGGGTCTTTTGTTAGTATCA GCAAATTGTTTCTTATGGTTATATTCTCACTTTGTTGCAGTGCTCCTCATGCACTTCTTGCTATGGGTAAGGTTGATCCA TCACATCCTGATTTAGCGATTGACCCACTTAGCATATTGCGTCCTCACAGCAAGTTAGTTCACCAGTTGCCTCTGGTAAT GTATTGCAGCCATTGAATGGAATAACTTATCTAAAATTGTCTACTGTCTCCACTTCTCCCACCTTTATTTTGCTCCTTAG TTTTTGTTCCTGATTATAGTTTATGGGTTGTATTACTTCAATTTTAGGTCAGTGCTTATTCTTCATTTGCAAGGACAATT GGTCTTGGATATGAGCAGCATAAGCGAAGACTTGATAGTGCAACAAATGAACCTTTATTCACAAATGTCACAAGGGATTT TATTGGCGCTCTTGACTACATATTTTACACAGGTGAGCTATCTTGCCATGTTACCTCATTTCTAAATTTAACATCACTGT CGCGTATTTATGTTGTGTTCCTTTGCTTTTCTTTTTTGTTTCAGCTGATTCATTGGTTGTGGAGTCATTATTGGAGCTAT TGGATGAGGAGAGTTTGAGGAAAGACACAGCACTCCCTTCTCCTGAATGGTCATCAGATCATATAGCTCTCTTAGCAGAG TTTCGCTGCTGCAAGAATAGATCTAGGCGTTGACTCATAAGGTACCAGCCCCCCCCCCCCCCTCCTTTTTCCAACAATCA TTCTCTATATATCATATTCTTATTTTATGCCTGATTGGCATTAGTCTGTTGAAAGGTCAGCTTCTCATTTAGCAATTGTT TTGTTAAGAGGTTAGTGACTCGACGGCATTGCATTTTATTTTCAATTGATTGACAGCATAATTTTTTTCTTATACCTAGT TGTCAAATTGGGATTTGAATTGTGAATTGAAAGGGCAATTTTCCTAATTGTGAATGAAATGTGATATACTATTCATGATA AAAGAATATAAAGTCATATGCATCCTCCACATCCAAATTGACTACTTCTATTGTAATTTCCTTCTTAATTATATGAGAAA AGAGGCATATTGCCCCTGATTTCAAAATGTTCATTACAATCTTCATTTTTGATAATTTTAAATTTTACTTAAAATTGGTT ACCTAAATGATTGAAATTATGCATTTCTTTCTTTTATCTTCCCTTCCCTTCTCTTCTTAATGAACCGTAGAATCTTTACT GCTTAAGACTACCCTAATGAAGTGGTGGTTGTCTTCTTCCTGAGTGGTTAGTGGTTTTTTTTTTAAGTCTAGCTAGCATG TTACTTCTTTATTGATTACAGTTTCTAATTTTTGTAGGTCAGGTCCAGAGACCATGTAAACAAGATTGAAAGAAGCATTC AGTCGATAAGTTATTGTAAAAGTGGTAGATCATGCCTTTGTCTTTTTCCTTGGTATCTCCATGTGGGGGGGTCCTTGCAA TGATCTGCTTTGTATTATGCCACCTGTTTCATAGAAAAGTTATGATGATGCCTCACTGATTTACCCACCTCGTTCCCAAT CTTTTTACTTATAAATTAAAATCTTTCTTATATTTTCGCGGGCTCTTGGTCATCCCTTTCTCGATATGATACCGTTCAAT CTTGTGGTTGATAGTGACAAAAAAAAAATCTTGTGGTTGATGAGCCTTGGCATTAATATCTCATAGTTTATTTTGTATTT TTGCTACTTTCAGCAAAAATACCACCAAGATGAGGTGAATTTTCTAAATGGGCTTGAACTATGAACCGGAACCGTAAGTC AGAAGAGTTCCTTGTTATTGATAGAGCGACCCAGAAAAAATTGTCATACAGGATACAATTTTAATACTTTTTCTCCAATG TATGGACATTGATAGCAATTGATGTGAAAATTGCTATTTGCATGTTTTCCAAATCAATCATTTAAATCGTTAGAATACAA TATTTTCTTTTGTCATTCATTCATTCATTCATATTTTCTTATATTATAGTAAATTGGTCCTTGAAAATTCATGTTGCTGA CTACATCTTCGCAAGAAATACAAGTATTAGTCATCTAGCTGGGTTGGAGAAAATTATAGGGACCTAATAATAATAAAATG GTGAATTTAGTTGGATGCG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0743500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTGAGCGTGCTGCGTGTGCACCTTCCCTCTGACATTCCTATTGTTGGCTGTGAGCTCACGCCTTACGTGCTCCTCCG CCGGCCTGACAAGACTGTTACCACCGATGATGCTCTCGAAACTGCCCCTCTAGACGGCCATTTCTTGCGCTACAAGTGGT ATCGTGTACAAAGTGATAAAAAGGTTGCGGTTTGTAGTGTACATCCATCCGAGCAGGCCACACTGCAGTGCCTAGGTTGT GTTAAGGCTAAAATACCTGTTTCCAAAAGTTACCATTGCACTCCAAAGTGTTTTTCAGATGCATGGCAGCATCATCGTGT TTTGCATGACCGTGCTGCTAGTGCAGTTAATGAAAATGGAAATGAGGAAGAGGAAGTATTTGGGCGATTTAATAATGCTG GGTCTGGGTCAATAAATACCAGCTTATCTGCCTCTGCATCAAGTGGTAGCTTGACAAATGGGTCAGCACCTCTGTATCCA GCAGCTGTTACACAACGAAGTGGTGGTGAAACTTGGTTTGAAGTTGGACGGTCTAAGACATATACCCCAACAGCTGATGA CATCGGTCATGTCCTTAAATTTGAGTGTGTTGTAGTTGATGCAGAGACAAAACTTCCTGTGGGACATGCAAACACTATAC TAACTTCTCGTGTTATTCCTGCTCCCTCTCCTAGTCCACGCCGACTGATACCTGTTGACGGGATGGGGAATGTAGATGCA GATGGGCGTGTATCATCTTCGGGAACTTTTACTGTTTTGTCATACAATATATTGTCTGATTCATATGCTTCAAGTGATCT ATACAATTACTGCCCTTCATGGGCTCTTTCTTGGCCATATCGGAGGCAAAATTTGTTGCGCGAAATAGTTGGTTACCGTG CTGATATCATTTGTCTTCAGGAGGTTCAAAATGACCACTATGAAGAGTTTTTCGCTCCTGAGCTGGACAAACATGGCTAT AATGGTCTTTACAAAAGAAAAACAAATGAGGTTTTCAATGGCAATATTAATACAATTGATGGTTGTGCTACATTTTTCCG AAGAGACAGATTTTCACATGTGAAGAAATATGAGGTTGAATTTAATAAGGCTGCACAGTCTTTAACAGATGCCATGATTC CAACCACTCAGAAGAAATCTGCTTTGAATCGACTGGTTAAGGATAATGTTGCGCTAATAGTGGTTTTAGAAGCAAAAGTT AATAACCAGCCTGTTGATAATCCAGGAAAAAGACAGCTTCTTTGTGTGGCGAATACACATGTAAATGTCCACCAAGATTT AAAGGATGTCAAACTCTGGCAGGTGCACACTCTCCTGAAAGGATTGGAGAAAATTGCTGCAAGTGCAGATATTCCAATGT TAGTTTGTGGGGACTTCAATTCAAATCCGGGAAGTGCTCCTCATGCACTTCTTGCTATGGGTAAGGTTGATCCATCACAT CCTGATTTAGCGATTGACCCACTTAGCATATTGCGTCCTCACAGCAAGTTAGTTCACCAGTTGCCTCTGGTCAGTGCTTA TTCTTCATTTGCAAGGACAATTGGTCTTGGATATGAGCAGCATAAGCGAAGACTTGATAGTGCAACAAATGAACCTTTAT TCACAAATGTCACAAGGGATTTTATTGGCGCTCTTGACTACATATTTTACACAGCTGATTCATTGGTTGTGGAGTCATTA TTGGAGCTATTGGATGAGGAGAGTTTGAGGAAAGACACAGCACTCCCTTCTCCTGAATGGTCATCAGATCATATAGCTCT CTTAGCAGAGTTTCGCTGCTGCAAGAATAGATCTAGGCGTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0743500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLSVLRVHLPSDIPIVGCELTPYVLLRRPDKTVTTDDALETAPLDGHFLRYKWYRVQSDKKVAVCSVHPSEQATLQCLGC VKAKIPVSKSYHCTPKCFSDAWQHHRVLHDRAASAVNENGNEEEEVFGRFNNAGSGSINTSLSASASSGSLTNGSAPLYP AAVTQRSGGETWFEVGRSKTYTPTADDIGHVLKFECVVVDAETKLPVGHANTILTSRVIPAPSPSPRRLIPVDGMGNVDA DGRVSSSGTFTVLSYNILSDSYASSDLYNYCPSWALSWPYRRQNLLREIVGYRADIICLQEVQNDHYEEFFAPELDKHGY NGLYKRKTNEVFNGNINTIDGCATFFRRDRFSHVKKYEVEFNKAAQSLTDAMIPTTQKKSALNRLVKDNVALIVVLEAKV NNQPVDNPGKRQLLCVANTHVNVHQDLKDVKLWQVHTLLKGLEKIAASADIPMLVCGDFNSNPGSAPHALLAMGKVDPSH PDLAIDPLSILRPHSKLVHQLPLVSAYSSFARTIGLGYEQHKRRLDSATNEPLFTNVTRDFIGALDYIFYTADSLVVESL LELLDEESLRKDTALPSPEWSSDHIALLAEFRCCKNRSRR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 35 | 595 | 561 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 35 | 595 | 561 | 0.0 | – | |
| Pfam | 71 | 110 | 40 | 6.3E-8 | ||
| Gene3D | 219 | 599 | 381 | 4.1E-114 | ||
| SUPERFAMILY | 246 | 594 | 349 | 4.32E-38 | ||
| CDD | 252 | 593 | 342 | 4.02825E-160 | – | |
| Pfam | 253 | 584 | 332 | 4.6E-30 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0743500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…