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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0777700 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0777700.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | WD repeat-containing protein-like protein; TAIR: AT3G05090.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q05B17|WDR48_XENTR WD repeat-containing protein 48; TrEMBL-Plants: tr|K7KGT9|K7KGT9_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0777700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:134979914..134990558) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTACCAGAATAAATTTGGACACCCATGTCCGATACCCTTCACTTTCTCTCTCCTCCATGTTAATCTGCAAAATCACTTTC TCTCTCCATAGTTGAAACTTCAGCTTCTTCAGAACAACAAAACCAAGCAGAAAAAAAGTGCTTCAAGTTCATCACTGATC ATCACGGTTAGTGCTTCACCTTTCGCTTCCACTGTTCCATCTTCTCCTTCTGCAGCTTGATTTCGTTTCTTCAGATTGTT CACTCTTTCCGATTCTAGACAAGATTTTCTTTTCTTTTTGCATCTTGTACTAAGCTGGTCTTAGCTCACAGCGTTGAACT CATGATCGAGCTGGTTAATCTGTGTGAAAGTTTGTGCTTTTTTGTTTTTCTGACATTTTTTCCCTTCTACTTCTGTATCG GGTATGATTTGGGGTATTGGGTAGCTTCATCTGGTTCAGCCTGCTATGTCTTATAGGTTTATGTTTGGTGATTCATTAGA AAAATTTGGCTTTTTGGTTTAATTCAAACTGGGTCCTGGTGGTTTTGATATGCAATTGCCAATTGTGCTTTGACTGGTTG TTCAGAATCTCAGGTAGTATAGAAAATATGGTTTTGGATTTCAGCTGGATACTGAGGTTACTATGGTATGGTTGCAAGAG ATGAACTAGTTGATGAAGGGATTGGAATTGTAGATTTTGGTGACATTAGTTGGGATATTGGGATTTGAGAAGACCATGGT AGAAAATAAATGATACTACTACTTAGTACTTAGCTACTGATACAAAGATTTATCAGTGGTAGTTTATTTAATCTAAGAGC TTCAGGTTATGCGGTTTGGCGGGTTTTCCTAATGGCTAATGCATGTCTGAATATGGCTTCAGTTGAGGTGTTTGGATTTG TCTTTATTGCATCCCTTGAAATGTTTCTAAGTAGGTTTCTTTAATTGGAAACTTGGAATTGTTTTATTTCATTTTTACTC 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ATCTTAAGATGACATTATTTTAAGAACATCTGGAGTCTGGAGCACAGAAAGACTTTATTGACATGTGCATAGCAAAATAA GATACAGTTGGTTAGATAAATGTTATTTTTATTCTTGCAGGTTAATGATGCTGTTCTTGTTGGTGATAATACACTCGTTT CTTGTTCTTCAGATACAACTCTTAAGGTTTATTGATTGCTAAATTTTATTTGATCTGATCAGTCCTTGCTACTGCAATGG TACCAGTACTAAAATGATTTACTCCTTTTGTTTTCGCTGGGTTGCTGTGTGTTAATGCTAGACATGGAATGCCTTCTCTG TTGGATCTTGTACCAGGACGCTCCGCCAACACTCTGATTACGTTACTTGTCTTGCAGCAGCAGGAAAAAATGTAATGTTC TTCAGGCTTCATAGTTTTCTTAGGTGTATCAAGAAAGAGTTCCTTATATTGTTTTTGCATGAAACACATGTAATCTGATG GATATTTTGGTTGAATTATAACTTTGTATTGTATATTGTCAAATCCATTCTCTGATCCTTTAATAGTGTTATGCATTTTA GTGCAATATTGTTGCCTCTGGTGGCCTTGGTGGGGAGGTTTTTATATGGGATCTCGAAGGTGCGCTTGCTCCAGTCTCTA AGTGCAATGATGCTGCGGTTGATGAATCCTCAAATGGGATCAATGGTTCTGGCAACTCACTACCTTTGTCAAACATACGT ACTATCAGCTCAAGCAATAGTATATCCGTGCACACTACTCCAACTCAGGGGTACATTCCAATTGCTGCCAAAGGACATAA GGAGTCTGTTTATGCATTGGCAATGAATGAAGGTGGAACAGTTCTTGTCTCTGGTGGCACAGAAAAGGTACAAATGGAAT ATGCTCTGACAGTCCGACTTATTGAGCCTTCTTTACTTTTGGAATGTTAAGACGAGGTTATTGTCTGAAGTATAGTAGCT TGAATTTTGTTGGGTTGATTATGGGAGACCTTGACAATTTCTTCTTTTATTTATTTATTTCTTTGGGGGATTTCTAGGTT ATTCGTGTCTGGGACCCAAGATCAGGATCAAAGACTTTAAAGCTAAGAGGGCATGCAGATAACATCAGGGCCCTGCTTCT GGATTCTACTGGCAGGTTGTAGAGTGGTTATCTAAGTTTAGCTGCAAATTTTCAGTTGACATTTATATTTTGAAGTTAGT AACTTGCTTTGTCCTTTACTTATTTGTAATTTTTTATTTTCATAAACTCTCTCTCTCTCACACACACACACACAGAAGAT CTTTATTTTATGCATTTATATGTTTTCCTACAACATATAGATAACTATGCTCATGAGCGACGTATAATACTTTAATTGGC TGTTACAGTGTACTGCTATTTAATAGTCAGTATGGTGAATGAAATGCTGTTGGGTTTTGTTTGCTACTGTAGGCTGCCAT GCCTCCTTTCATTGGATAGAATTGCTAGCGCAAATTAAGTATTTTTTTTATAAATAACATGTCTGCTATAATATTTGTAA CATTCATTACTGCAGGTATTGTTTATCAGGATCTTCAGACTCTATGATAAGGTAATGATTCATATGGCGTGCAAGTATTT CTTTTGATTTTTTGTGTGGTTGAGTTTTAACCTGTCCAATTTTCCTCATAGGCTTTGGGATATAGGTCAGCAAAGATGTT TGCATACTTATGCTGTTCATACAGATTCTGTTTGGGCCCTTGCCAGCACCCCAACATTTAGTCATGTTTATAGCGGTGGG AGAGACTTTTCAGTGAGTTCGACTTTTCATTAAAATAGCATTCATGCTATTTTTCCATTACCGTAACTCTAATATATGTG ACATCTCATTCTATTTAACTAGTGAAGCTCATATTCTAATGCCTAATACTTTTATACCTTAAGTTATACTTGACAGACTT GCAAACAAGAGAGAGTAGTTTACTTTGCACAGGCGAGCACCCTATTCGTCAATTGGCTTTGCATGATGATAGCATATGGG TTGCATCAACGGATTCTTCAGTTCATAAATGGCCTGCTGAAGGATCCAACCCTCAAAAGATTTTCCAAAGAGGCAATTCT TTTTTAGCTGGAAACTTGTCATTTTCAAGAGCAAGGGTGTCACTAGAAGGATCTACCCCTGTATGTTACTTTTATTTGAG AAACAAACCGTCCATATTAATTTTCTATTATTTCATCTTCAAAATGTTGTGTTCCTCTTGGAAGTAATAATACCTGTTTC ATATGTAAATGGAGAATGCTAGTGAGTGCCCTAGGAGCACTTGTTAAAGAAACAATATTCAAGAAAATGAAAATTATCTT GAAAATGAAAAAAAAAATCAAATTTAACTCTTTTAAAGGTCCTAAATAGATTTATACATGAAGAATGGTAGTTTACATAT CCCATTTCCCATATTATTGCTTTGTGAATATGAAGGAGTTTGTATTCTAAGCAAGTTTTGTTAAGAAAAGAAAAAATCGT TTTGGTTCTTTCTGTTTTGGGGAACTAATATTGTCCATTTTGTTTACAAATTGTCAATAGGTTCCTATATATAAAGAACC TGCCTTAACTATTGTTGGCAACTCTGCAATTGTGCAACATGAAGTTTTAAATAATAAAAGACATGTGCTGACGAAGGTAA TAATGGTGTTTTTTTCATGCCATTAGGCCATCCGTGCTTATACTGTCTGTTAATAATCTTTGTCTGTTATGACTCTTGGT GTAGGATACATCTGGTTCAGTGAAGTTGTGGGAGATTACTAAAGGTGTTGTGGTTAAAGATTATGGAAAGGTGACAACCG GTTGCATTTTCATTTGGTAACTTACGTTGCGATCCGTTTGCTTATGAAGGAGCTTTGCTTTAATGAATGATATTTGCAAA 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CAAAAGTTGAGGTTGATGGTAGTTCTGAGAGTGATGCTATGGTCTATCCTCCATTTGAATTCTCAGTTACTTCCCCTCCT TCCATTGTTACTGAGAGCACTCATGGAGCTCCGTGGAGAAAAAAGATTACTGATTTAGATGGAACAGAGGATGAGAAAGA CTTCCCCTGGTGGTGTCTGGACTGTGTTTTGAATAATCGGTTAACTTCTAGAGAAAATACGAAGTAATTTTTTGCCTTCC TCTTCATTTTTCCCTCCCTAAATGGTTGCATTGATGCGTGGTGGTTTTTGAAAGGAAGAAACCACACTCATGAAAATTTC AATACTTTTTCAATGAAGCACAATTGTTGCTGAATTCTATGATAGTGATGATCATAGACAATGTTTTGATGATTCATAGT TTCTGTGAGCCTTGTTTTCTGAATGTGAATTTGACTCAAGTTATATGGTGGTACTTAACGCTGCTTTTCTAATTGACATC AATTGCTGTGGTTAACTTAGTATATATTGCTCGTCTTTCTATGTGTTGGTCACGGCTATATCTTACTTCTGTAGATATAG ACCAATGGAAATTGTCTATGAAGAAGTATGATAGCATTTTTTAGCATGATTATCATTGGTCTCAGATCAGTTACGAAATG TTCTTTTTTATATAGTTTCTTTTGTGATAACCTCTGCAGGTGCAGTTTCTATTTGCATCCATGTGAAGGCTCTCCAGTCC AGATCCTCACACAAGGGAAGCTAAGTGCCCCACGTATATTAAGAATAAACAAAGTGAGTTTTGATTTTCATATTTATATT AATTGACAATTCAGAAATATTAATTTTGTTAATAATTTTTACATGTGTCGTTTATTTTGGTCATGCTTTCCAAAAAGGAT TAGTATGTTTTATTTCGAAAATCAGTTTTTTTTTGGGTGTTTGCGTGGACTCTGTAGGCATATTTTCCCCAGTTGATAAT ACATTTCTGAATGATCAACTTAGCTTTCCTTTTTTGTTGCTTAGGTTATTAATTATGTAGTAGAAAAGATGGTGCTCGAT AAACCTTTAGATAACTTACATGCCGATGGTAGTTTTGCCCCTGGACTTGCTGGGTCACAGTCACAGCATCTAGCAGTTGG GGATGGATCTTTCAGATCTGGATTTAAGCCCTGGCAAAAGCTTAAACCTTCTATCGAAATATTGTGCAACAATCAGGCAA GTTCTTTGTTCTCTTACATGCAGTCTTATGACAGTGGATATAAATAGTTTTCTGGATGCTGAAATCTAGCAAGTTCATGC TTTAGTTTTCTCTAGCTGGCTTACTTATCAATTCACGTATATGCTTTCTAGATTCTTTTCCATTCATGCATATACCATTT ATGGTCTCCCACTGTGGTGTTTTCTGTATGTCATTGAGTACATCATATATCCTGAAAATTATGTACTTTCGCATTTTAGA TCATAAACTTATAGTTGCAACTTTGACTAACTTCTAGAATCATGATGTAGGATGAATTGACAATCTTTTCAGTAGCCTTA AATCTGCTTTAAATATTCTTGGTTTTATTATTCCTAAAATCAGCTCAATGTGCCTTTTACCTATGATTTCAAATGATTGA TTGACAACTGTGCTTCATTTCCAGCAACAAACATGCTTCTTTTAGCACACATTTATAGTCTGATTATTGGATGTGATAAG ATGAGGATATAATGAGACTTCTTTAGACTTAAATTCTTCATCTGTTCTGTTGATATGCCTTCGATTATGAAGTTCTGTTC CTGCCTGATGTTGTACGCATCTAGGTGAAGCCTAATGATGGTTATATTGTAGTCTTAAAATTTAGGCTTAAATAAGTTTT TGGTCCCTAACCTTTACCAAATGCTTGGTTTTCGTCTCTCACCGGAGCAAAGGTGGGCTTTAGTCCCTAACCTTTGTCAA AACGTTTGGTTTTCATCCCTCCGGAACTCTGGGTCAACGCCGGAGCTCCGGTGGCTCATGTGGCAATGCCACATGGGATT AATGAGGCCAGGTGTTAATTTTTTTTTTAATTAATAACAAATTAACTCACTAATTAAAAACACTTAACCCACTAATTAAA AACCTCAAAGAAACTAAACACACTTTCTTCATTAGATCTGGAAAAATCTCTTCATCTTCATATGCCCATTCATCCTTAAT CCTCCCCCGCTTATAAAAAAAAAAAAATCCTTAATCCTCCCCCTTCATCCCTTTTCTCTGATAACTCTAAATTAAATAAT AAAACCCCACCTTCAAACCTCAATTTCAATCTGTTCATCTTCAAACCCCATTTCATCACATGTTTTGGGTCAATTTTTTC AACCAAAGGGAAAAGCTTCAAGTATCCACCGTCTTCACCATCAACACAGTCCTCCTCCATCTTTTTCATTCTGATCCCAA ATGCTTTGAAGGTCACACCTTTCCTCTTCAACCCTTCAAATCCCAACTCAAATGCATCCAAACCCATCAAACCCTTCTAA GCCATCGTTTCCCCGGAGCTCGCCTCACCAAATCCATAAACAACCAAAGGCCAGATTGTCCCCACCGTGACTCTAACAGA TCAAGAACCAGGACGAAGAAATCGAGCAGACCGAGAGCCTGGTTCTCTATTTTCTCTTCTCTGTTCGATTTTCTGGGTTT TTGGTGAAGCTCGATGGTCATGGTGGTGGAACAAGGTGGCTTTAGTGAGAAAGGGGTGACTTTCTGACGGAGGAGGCGTT ATGTTGGTGAAGTCGCGTTCTGGAGGGCTGGTGGTTTTGATGTGCGTTTGTAAAAACGCATAAACACAGATCTGTAGCAA AACTTGCCTTCCAGCGAAAGGGATAAATTTGAGCGGTGGGTGTTGGGCGTTGGCGTTTGCACACATCTGTTCGCATACCT CTGTGTAGCTTTTCGTATGATTTGGGGTGGCAAATTCATTGTTGTTCTGTTGAGAATTTTAGGAGAGGGGCCTCTCCACA TCTTGATTCAGTCTGTTTCAATTCAGTTCGCTTGATTCAATTCAGTTCTAGCACATTTTCCATGTATTATGCTTGATTCA ATTATGTTTCAATTGGATTTGGTTGAAGGAAAGGGAAAAATTGGTTTTTGTTTCTTGTTGTTTTTGGATTTCTTGATGCT TCTTTATTTGTTTCCAGATTTTGTGTTGTTGATTTATTGGAGATTAATATGAAGGAGAATTAGATATTAATGATTTAATT AAAATTAAGATAAATAAGTTAATATTTTTTTTATTTTTAGAATTTTAAACAATTTTTTAAAAAAAATTAATTAGTTTTTT TGTTAATTTAAATGAAAAAACAAATTCCACGTCAGCTTATTAATCTCATGTGGCATTGCCACATAGGCCACCGGAGCTCC GGCGTTGACCCAGAGCTCCGGAGAGATGAAAACCAAACGTTTTGGTAAAGGTTAGGGATCAAAAACTTATTTAAGCCTAA AATTTATCATAGAGTTCCTGTTTGTACTTCCGTTTAATTATTCTTGTGTATGTTCTAATTAAGTTTTTGAACTTATAATG ACAGAGCTCTCTTTTTTAGTGAAAGAAAATATTATTGACTAGATGGTGTTTTATTTTATTTACACTGGTCATTTCTTTAA GTAAGGTAGATTTAGTGAACTGTTTTGTTTATTTCCAGGTGTTATCTCCTGAAATGAGCTTAGCCACAGTACGAGCTTAT ATATGGAAGAAATCAGATGACCTGGTCCTAAATTACAGAGTGGCTCAAGGCAGGTGATCACAAATTGCATATGCATCAGA GGTGGGTAATCTTGAGCTTTGCTTAGCGTTTATAAACTACAATATGATATTGATGCTTTAATGGCTTTCACTCCTTTTGT TTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTAATATAGTTTACAGCAAGGAGAAGTTCTTTTTTGGGATAGTATTTCTTTTTTCAATTGA TGTATATGTCGATAAAAGAAATCTGAGGTGATGAGAGACCTAATCTTTGTCAAACAATCTGCTCTGCTCAAATTGGATGA AATAATTACTACAAGTTTTACATGTGTGCAAACGGTCATTATTGGTATCACAAATAACTAAAATGTTTTGGATGAATTAC TTAACCATTTTTTTTTTCTTACAATGCTTTAAGTTTTATCAATAAAAGAACAATAATTAGTTTTATTTTCTTTCTATTAA AATATATATACTTGATTTATGTTGTCTTAGCATGAGATGCAGACTATATTATGATTTATACTTGCAGGTTTTCTATGCTT GTGTAAAATACCCCCAAGCACCGGTTCTTCTTTTGTTGCGTGCATTGGTTGGTGGCATCGTAAGAATTTTGTAAATTCTG AGCTCTTATTTATCACCAAATTTAGTAACATTCTCTAAACCTGCTTGGATAGTTTTTTTCTTTAGTGGAGAGCTGTTACT GTAAATTTTGAATATATCTAGCTGGTGTGCATAATCTTCATCTGGCATGATCAAGATTTTTAATCGATTCTGTTGAGAAT CACTGGGAGTCATACTGGTATATTGGTTTTTTTTAGGAATCAGGTAGTAAATTTAGAGATGACAACTAAAACATTGTAAA TCTGAATTGTGCGTTAAATACCTGGCCTTTGAAATTCTGTTCTCCAGGCTCCAGGGCATGTTCGCATCCCTCCGGACATT TTCCTTAATAAAATTTGTTCATTGTTAATTGCTATCAATATTGTTATCAAGTTCAAATTAGTCATTTAGTGGAGTTCTCA GCTAATCCTTTATTTTTATCCTGTATTTTCCCCCCTTTCCTGTGTATGTATATTTGAGTATATTCAATATGCTATCCTAA GATGAGGCACTGTTATTAGGCATTAAAATTTAGTGAAGCTATGACTGTAGTAGTTGTAGCGTTAGCATTATTGGCTTTGA AATTT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0777700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCACCGCGTGGGTAGTGCGGGTAACACAAGCAATTCAACTCGCCCTCGTAAGGAGAAGAGATTTACCTATGTGTTGAA TGATTCTGATGGTACAAAGCATTGTGCAGGCATAAATTGTTTGGCTCTACTTACATCTGCGGCATCTGATGGGTCTGATT ATCTCTTCACTGGGAGCCGTGATGGAAGGCTAAAACGATGGGCGCTGGCTGAGGATGCAGTGACATGCTCTGCTACCTTT GAATCTCATGTGGATTGGGTTAATGATGCTGTTCTTGTTGGTGATAATACACTCGTTTCTTGTTCTTCAGATACAACTCT TAAGACATGGAATGCCTTCTCTGTTGGATCTTGTACCAGGACGCTCCGCCAACACTCTGATTACGTTACTTGTCTTGCAG CAGCAGGAAAAAATTGCAATATTGTTGCCTCTGGTGGCCTTGGTGGGGAGGTTTTTATATGGGATCTCGAAGGTGCGCTT GCTCCAGTCTCTAAGTGCAATGATGCTGCGGTTGATGAATCCTCAAATGGGATCAATGGTTCTGGCAACTCACTACCTTT GTCAAACATACGTACTATCAGCTCAAGCAATAGTATATCCGTGCACACTACTCCAACTCAGGGGTACATTCCAATTGCTG CCAAAGGACATAAGGAGTCTGTTTATGCATTGGCAATGAATGAAGGTGGAACAGTTCTTGTCTCTGGTGGCACAGAAAAG GTTATTCGTGTCTGGGACCCAAGATCAGGATCAAAGACTTTAAAGCTAAGAGGGCATGCAGATAACATCAGGGCCCTGCT TCTGGATTCTACTGGCAGGTATTGTTTATCAGGATCTTCAGACTCTATGATAAGGCTTTGGGATATAGGTCAGCAAAGAT GTTTGCATACTTATGCTGTTCATACAGATTCTGTTTGGGCCCTTGCCAGCACCCCAACATTTAGTCATGTTTATAGCGGT GGGAGAGACTTTTCATTATACTTGACAGACTTGCAAACAAGAGAGAGTAGTTTACTTTGCACAGGCGAGCACCCTATTCG TCAATTGGCTTTGCATGATGATAGCATATGGGTTGCATCAACGGATTCTTCAGTTCATAAATGGCCTGCTGAAGGATCCA ACCCTCAAAAGATTTTCCAAAGAGGCAATTCTTTTTTAGCTGGAAACTTGTCATTTTCAAGAGCAAGGGTGTCACTAGAA GGATCTACCCCTGTTCCTATATATAAAGAACCTGCCTTAACTATTGTTGGCAACTCTGCAATTGTGCAACATGAAGTTTT AAATAATAAAAGACATGTGCTGACGAAGGATACATCTGGTTCAGTGAAGTTGTGGGAGATTACTAAAGGTGTTGTGGTTA AAGATTATGGAAAGGTTTCATTTAAGGAGAAAAAGGAAGAGCTATTTGAGATGGTAAGCATTCCCGCATGGTTCACAGTG GATACCAGGCTTGGAAGTTTGTCAGTCCATTTGGACACTCCCCAATGCTTTTCTGCGGAGATGTACTCAGTAGATCTTAA CATTGCAGGCAAGGCTGAAGATGATAAGGTTAATTTGGGTCGAGAAACCCTTAAAGGACTATTGGTTCATTGGTTGAGAA AACGAAAGCAAAGAATGGGATCCCCAGCTCCAGCTAATGGGGAATTATTATCTGGGAAGGATATTGCCTCTAGAAGTATT ATCCATTCAAAAGTTGAGGTTGATGGTAGTTCTGAGAGTGATGCTATGGTCTATCCTCCATTTGAATTCTCAGTTACTTC CCCTCCTTCCATTGTTACTGAGAGCACTCATGGAGCTCCGTGGAGAAAAAAGATTACTGATTTAGATGGAACAGAGGATG AGAAAGACTTCCCCTGGTGGTGTCTGGACTGTGTTTTGAATAATCGGTTAACTTCTAGAGAAAATACGAAGTGCAGTTTC TATTTGCATCCATGTGAAGGCTCTCCAGTCCAGATCCTCACACAAGGGAAGCTAAGTGCCCCACGTATATTAAGAATAAA CAAAGTTATTAATTATGTAGTAGAAAAGATGGTGCTCGATAAACCTTTAGATAACTTACATGCCGATGGTAGTTTTGCCC CTGGACTTGCTGGGTCACAGTCACAGCATCTAGCAGTTGGGGATGGATCTTTCAGATCTGGATTTAAGCCCTGGCAAAAG CTTAAACCTTCTATCGAAATATTGTGCAACAATCAGGTGTTATCTCCTGAAATGAGCTTAGCCACAGTACGAGCTTATAT ATGGAAGAAATCAGATGACCTGGTCCTAAATTACAGAGTGGCTCAAGGCAGGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0777700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MHRVGSAGNTSNSTRPRKEKRFTYVLNDSDGTKHCAGINCLALLTSAASDGSDYLFTGSRDGRLKRWALAEDAVTCSATF ESHVDWVNDAVLVGDNTLVSCSSDTTLKTWNAFSVGSCTRTLRQHSDYVTCLAAAGKNCNIVASGGLGGEVFIWDLEGAL APVSKCNDAAVDESSNGINGSGNSLPLSNIRTISSSNSISVHTTPTQGYIPIAAKGHKESVYALAMNEGGTVLVSGGTEK VIRVWDPRSGSKTLKLRGHADNIRALLLDSTGRYCLSGSSDSMIRLWDIGQQRCLHTYAVHTDSVWALASTPTFSHVYSG GRDFSLYLTDLQTRESSLLCTGEHPIRQLALHDDSIWVASTDSSVHKWPAEGSNPQKIFQRGNSFLAGNLSFSRARVSLE GSTPVPIYKEPALTIVGNSAIVQHEVLNNKRHVLTKDTSGSVKLWEITKGVVVKDYGKVSFKEKKEELFEMVSIPAWFTV DTRLGSLSVHLDTPQCFSAEMYSVDLNIAGKAEDDKVNLGRETLKGLLVHWLRKRKQRMGSPAPANGELLSGKDIASRSI IHSKVEVDGSSESDAMVYPPFEFSVTSPPSIVTESTHGAPWRKKITDLDGTEDEKDFPWWCLDCVLNNRLTSRENTKCSF YLHPCEGSPVQILTQGKLSAPRILRINKVINYVVEKMVLDKPLDNLHADGSFAPGLAGSQSQHLAVGDGSFRSGFKPWQK LKPSIEILCNNQVLSPEMSLATVRAYIWKKSDDLVLNYRVAQGR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 764 | 764 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 764 | 764 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 18 | 184 | 167 | 8.9E-22 | ||
| SMART | 19 | 68 | 50 | 2.7 | ||
| ProSiteProfiles | 31 | 339 | 309 | 35.541 | ||
| SUPERFAMILY | 34 | 452 | 419 | 3.34E-62 | ||
| CDD | 34 | 368 | 335 | 4.67312E-49 | – | |
| SMART | 73 | 111 | 39 | 9.1E-4 | ||
| ProSitePatterns | 98 | 112 | 15 | - | ||
| PRINTS | 98 | 112 | 15 | 1.7E-5 | ||
| SMART | 115 | 155 | 41 | 1.7E-5 | ||
| Pfam | 116 | 155 | 40 | 0.0052 | ||
| ProSiteProfiles | 122 | 157 | 36 | 8.537 | ||
| SMART | 207 | 246 | 40 | 9.4E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 214 | 255 | 42 | 14.418 | ||
| Pfam | 215 | 246 | 32 | 0.012 | ||
| PRINTS | 233 | 247 | 15 | 1.7E-5 | ||
| SMART | 249 | 288 | 40 | 2.3E-6 | ||
| Pfam | 252 | 288 | 37 | 2.3E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 256 | 297 | 42 | 14.585 | ||
| PRINTS | 275 | 289 | 15 | 1.7E-5 | ||
| ProSitePatterns | 275 | 289 | 15 | - | ||
| SMART | 291 | 330 | 40 | 3.0E-4 | ||
| Pfam | 293 | 328 | 36 | 0.1 | ||
| SMART | 333 | 369 | 37 | 120.0 | ||
| Pfam | 613 | 759 | 147 | 4.0E-28 | ||
| CDD | 634 | 759 | 126 | 3.77775E-38 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0777700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…