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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0785100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0785100.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Exportin-4; TAIR: AT3G04490.2 exportin-4 protein; Swiss-Prot: sp|Q499Y0|XPO4_XENLA Exportin-4; TrEMBL-Plants: tr|K7N067|K7N067_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0785100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:135759537..135777979) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAGAGAGAGAGAGAGAGAATAACCCAAGCCCAGCCCAGCCGCACTATTTCATTTCTCTCTCATATTACAAGCACTGCTAC TTGTTCTCTCTTCACTCTCACTCCCCCACACCCGCACTCACATTCACAGTCACTGCATCAATTCAACTTCCTCCGCTCTC TCTCCTGCGATTCAATTCCCAACTTCACCATCATCATCATCAAAGCTAGTTACTCATCCATGTTCACCTTCTCATTCATC CATGCTAACAACTGAAAACTAATTGTATCCCAACAACAACTCAATCACTTCGAATTGTTCCTTTTCGTGTGAACAAGATG CAAGGGTTTCCACCACCTGGTGCTGGAGGAGCTTCTGACCTTCACTCCACCATGCGATCCTTCGAGCTTGCTTGCTCTTC CGTTCAGGTATTGATCATCTTTCTTAAATACTCGTTTTCTCTGTTGTTCATGTGAAATCGGACTCAGAATCGCTATGTTA ATTGCTAAATCTCCTAAATTATTCGTTCCACACTTAGTTACTCAATGTGGTTTGTACCAATTACTATAGCTTCTTCTTCC TGTGTTGAAACAAGCTTGGATTTTTTTACCTGTATTTTGATTTCCATTATTATTCATGCCTTGGTTAGTAGCATTTAATC AAAGATCAGAGGGAGTGGAAATTCATTGATCGTTACAGTGCTTTGTTCCTAGTTGCTGTTTTATGATTATTCAAATCTTA ATTTTTATGGTTAGAATAGAGTTGATTGTTGAAGGTTGAAATAGCATTATCATGTTCACATTTCTATGATCATATTATAT ATACTTACTTACTGCATTATATTTACTTTTTTTATTTATTTATTTCTCAGTCTTCTATTGAGAAAAGGTTTTAAATTGCG GTTGCGGTAACGGTCGAGTCACCGTCCTTCATATTGCGGAAAATTATGAACACACGTGGCTGTTGCCGCCGAAATCACAG 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CACTGGAATTGGAAAGAGGCTCGATTATCAAGGCACTTCCGACAAGTAGTACAAATATGGAAAGGTGTTGACTGTTGATT GCGGGATGCTTGTACGATGCCGTCATATCATATCATTTCATGTCATAAGATAGTAAGATGCAGAGCCAAAGGTTGCTTTT TTTTGAACCGTAGGATCATAAAGTGCATTGAAATCGATTCAAA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0785100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCAAGGGTTTCCACCACCTGGTGCTGGAGGAGCTTCTGACCTTCACTCCACCATGCGATCCTTCGAGCTTGCTTGCTC TTCCGTTCAGATCCCTATTAATCCAGGAGCTACTGAGGCAATTATATTGTCATTAGGCCAGTCTTCTCAGCCATATAAGA CTTGTCAATTCATTCTTGAAAATTCCCTGGTAGCAACTGCAAGGTTTCACGCGGCTGCAGCAATCAGAGAAGCAGCTATC AGAGAATGGGGTTTTCTTAATACTGATGACAAGAGAGGCTTGATTAGTTTTTGTCTATGCTATGCTATGCAACATGCGAG TTCTCCTGATGGCTATGTCCAAGCAAAGGTATCTTCTGTGGCTGCTCAGTTGATGAAAAGGGCTTGGCTTGAGTTTGCAG CAGCAGAGAAGGAGACACTCTTTTATCAGGTGAACCAGGCTATTGTGGGCATTCATGGATTAGATGTGCAGTTTGCTGGA ATCAAATTTCTTGAATCGTTGGTATCTGAATTTTCTCCATCTACTTCAAGTGCTATGGGCCTTCCAAGGGAATTTCATGA GCAGTGTAGGACTTCATTTGAAAAAGACTACCTGAAGACATTCTACCGATGGACACAAGAAGCTGCTTCAAGTGTCACAA GTAGGATTATTGAATCTGACTCTGTTGTACCTGAGGTTAAAGTTTGCACTACTGCACTGGATCTCATGCTTCAAATCCTA AATTGGGATTTTCGTTGCAATACCAGTGACACAAAAATAAATGTAAATATCTTCTCTTCTGGAGTTAGGCAAGACGGGGA TACTCCTAAAAGATCTGAATGTCACCTAGTGCAGCCTGGTTCAGATTGGCGTGACGTGTTGATATTAAGTGGTCATGTTG GATGGCTTTTGAGTCTATACGCAGCATTGAGGCAGAAGTTTTCACGTGAAGGCTACTGGCTTGACTGCCCTATTGCAGTC TCTGCTCGAAAGCTAATTGTACAATTTTGTTCTTTAACAGGAACTGTATTTCTTTCTGATGATAAAAAAATGCATGAGCA CCATCTTCTGCAACTCCTCTCAGGGATAATAGCGTGGGTAGATCCTCCTGAAGCTGTTTCAAAAGCTATTGAATGTGGGA GAAGTGAAAGTGAGATGCTTGATGGTTGTCGTGCACTATTGGCTCTTGCAAATGTAACAAATCCCTGTGTGTTTGACGAT CTCCTAAAGTCCATGAGGCCCATTGGTACCCTTACCTTTTTGTCGATGTTGATGTCTGAAGTAATTAAAGTCCTCATGAC TAACAACACTGAAGAGGAGTCTTGGAGCTATGAAGCTCGTGATGTCTTATTGGATACTTGGACTGCCCTTCTAATGCCAA TAAATACTATCACTGTGAATGCTTTGCTTCCGTCTGAAGGGATACAAGCTGCTGCAAATCTCTTTGGTTTCATTGTTGAA TGCGAGCTAAGAATGGCCTCTGCTTCAGCATTTAATGATGGGGGCGATTCAGATTATCTTCATGGTTCTGTATCTGCCAT GGATGAAAGGTTAAGCTCCTATGCTCTTATTGCACGAGCTGCAATTGATGTTACAATTCCTTTACTTATGAGAGTGTTTT CTGAACGGGTTGCACGCCTTAATCAGGGCAGGGGCATTATGGACTTGACTGAAACTATGGAAGAGCTTTATTCATTGTTG CTTATTATTGGCCATGTAATTGCAGACGAAGGGGAGGGGGAAACACCTCTGGTTCCTAATGCCATACAAACCCAAGTAGT TGTGGATTCTGTGGAAGAAGATAAACATCCTGTTATTTTACTTTCCAGCTCAATCTTAAAATTTGCTGAGCAGTGCCTAA ATCCAGAAATGAGAGCATCAATTTTCAGTCCCCGACTTATGGAGTCAATTATATGGTTCCTTGCAAGGTGGTCTCATACA TATTTAATGTCTTGCGATGGGATTGGGGAGAAAATCTTGGATTCAAGTCATCATTATGAGCATAGTTCAAAAAAGGCTTT GCTTAGTTTCTTTGGAGAGCATAAACAAGGGAGACTTGTTCTTGATATTATTGTCCATATATCCTTGATCACACTTACGT CCTATCCCGGGGAAAAGGATCTGCAGGGCCTCACTTGTTACCTTCTACTTCATTCCTTGGTTCAGCACAAGCATATATGC ATTCACCTTGTTACTCTGAATTCATGGCATGAACTAGCAACTGCATTTTCCGGTGAAAAGACGTTGTTCTTGTTGGACAC TGCTCATCAGCGGTCTCTTGCACAAACACTTGTTCGCTCAGCCTCGGGCATAAAAAATTTAGAAGCATCAAACCAGTATG TAAGGAATCTCATGGGTCATATTGCTAAATATATAGTGGAGATATCCAGCAAGAGTAATTTCAAAAGTATTGCCCAACAA CCAGATATCCTCCTGTCGGTCAGCTGCATGTTAGAACGGCTACGAGGAGCTGCAAGTGCTTCTGAACCTCGAACACAGAA GGCAATCTATGAGCTAGGATTCTCTGTAATGAATCCCATACTAGTTCTTCTTGAAGTATATAAACACGAGTCTGCAGTAG TCTACCTGCTACTTAAATTTGTAGTTGGTTGGGTCGATGGACAAATTACTTACTTGGAGGCCCAAGAAACTGCTGCTGTT GTTGATTTCTGCATGCGCTTACTACAGCTGTATTCATCTCACAATATTGGCAAGATATCGCTTAGTCTTTCAAGCAGCTT ACTTAGTGAGGCAAAAACAGATCAGTATAGAGATTTGCGAGCTCTTCTTCAACTTCTTTCGAGTCTTTGCTCTAAAGACA TGATTGATTTCTCATCAGATTCAATTGAGACCCAAGGCACTAACATATCTCAGGTGGTTTACTTTGGTCTTCACATAGTT ACACCACTGATTTCAATGGACCTCCTGAAATATCCCAAACTTTGTCATGATTATTTTTCTCTCTTGTCCCATATGTTGGA GGTTTATCCTGAAACATTCGCACAACTGAATAGAGAAGCCTTTGCTCATGTACTTGGGACCCTTGATTTTGGCCTTCACC ATCAGGATGCAGATGTGGTTAGTAAGTGTTTGAGAGCTCTTCAAGCTCTTGCTTCCTACCACTACAAGGAGACTGCTAAT GGTAATATAGGCTTGGGTTCACATGCCGTTGGTCTTGAGGATTCAAGTGGTAAGATTCAAGAAGGCCTTCTGAGCCGCTT TCTCCGTTCATTGTTGCAGTTACTCCTTTTTGAGGATTACAGTTCTGATCTAATCAGCGTTGCAGCAGATGCTCTCCTTC CATTAATCCTATGTGAACAAGGCCTGTATCAGAGACTGGGCAATGAATTGATAGAGAGACTAGCAAATCCAACACTCAGA TCAAGGCTCGCCAATGCTTTGCATGCACTAACAAGTGCAAATCAGCTTTCTTCCTCCCTTGATCGAATAAATTACCAGAG ATTTAGGAAAAATCTTAACATCTTCCTTGTTGAAGTTCGTGGATTTCTGAGGACCATGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0785100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MQGFPPPGAGGASDLHSTMRSFELACSSVQIPINPGATEAIILSLGQSSQPYKTCQFILENSLVATARFHAAAAIREAAI REWGFLNTDDKRGLISFCLCYAMQHASSPDGYVQAKVSSVAAQLMKRAWLEFAAAEKETLFYQVNQAIVGIHGLDVQFAG IKFLESLVSEFSPSTSSAMGLPREFHEQCRTSFEKDYLKTFYRWTQEAASSVTSRIIESDSVVPEVKVCTTALDLMLQIL NWDFRCNTSDTKINVNIFSSGVRQDGDTPKRSECHLVQPGSDWRDVLILSGHVGWLLSLYAALRQKFSREGYWLDCPIAV SARKLIVQFCSLTGTVFLSDDKKMHEHHLLQLLSGIIAWVDPPEAVSKAIECGRSESEMLDGCRALLALANVTNPCVFDD LLKSMRPIGTLTFLSMLMSEVIKVLMTNNTEEESWSYEARDVLLDTWTALLMPINTITVNALLPSEGIQAAANLFGFIVE CELRMASASAFNDGGDSDYLHGSVSAMDERLSSYALIARAAIDVTIPLLMRVFSERVARLNQGRGIMDLTETMEELYSLL LIIGHVIADEGEGETPLVPNAIQTQVVVDSVEEDKHPVILLSSSILKFAEQCLNPEMRASIFSPRLMESIIWFLARWSHT YLMSCDGIGEKILDSSHHYEHSSKKALLSFFGEHKQGRLVLDIIVHISLITLTSYPGEKDLQGLTCYLLLHSLVQHKHIC IHLVTLNSWHELATAFSGEKTLFLLDTAHQRSLAQTLVRSASGIKNLEASNQYVRNLMGHIAKYIVEISSKSNFKSIAQQ PDILLSVSCMLERLRGAASASEPRTQKAIYELGFSVMNPILVLLEVYKHESAVVYLLLKFVVGWVDGQITYLEAQETAAV VDFCMRLLQLYSSHNIGKISLSLSSSLLSEAKTDQYRDLRALLQLLSSLCSKDMIDFSSDSIETQGTNISQVVYFGLHIV TPLISMDLLKYPKLCHDYFSLLSHMLEVYPETFAQLNREAFAHVLGTLDFGLHHQDADVVSKCLRALQALASYHYKETAN GNIGLGSHAVGLEDSSGKIQEGLLSRFLRSLLQLLLFEDYSSDLISVAADALLPLILCEQGLYQRLGNELIERLANPTLR SRLANALHALTSANQLSSSLDRINYQRFRKNLNIFLVEVRGFLRTM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 19 | 1164 | 1146 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 19 | 1164 | 1146 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 25 | 259 | 235 | 8.2E-21 | ||
| SUPERFAMILY | 39 | 1133 | 1095 | 7.68E-19 | ||
| Gene3D | 708 | 1165 | 458 | 1.3E-27 | ||
| Pfam | 961 | 1031 | 71 | 4.7E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nuclear export signal receptor activity | Combining with a nuclear export signal (NES) on a cargo to be transported, to mediate transport of a the cargo through the nuclear pore, from the nuclear lumen to the cytoplasm. The cargo can be either a RNA or a protein. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0785100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…