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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0785100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0785100.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Exportin-4; TAIR: AT3G04490.2 exportin-4 protein; Swiss-Prot: sp|Q5ZMR9|XPO4_CHICK Exportin-4; TrEMBL-Plants: tr|K7N067|K7N067_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0785100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:135760506..135772400) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCAAATTTTAAGAACATAATTCTCTGGTCTTCTTTATCTTGTTCTTCATCTCGATACAAATTTTGTTATGACATCCATCC ATCTTTAATTTTTTCTTGAACATCCACTTTTCATTCATGCCTGACAGTTTCACATACTTCAGGTGAACCAGGCTATTGTG GGCATTCATGGATTAGATGTGCAGTTTGCTGGAATCAAATTTCTTGAATCGTTGGTATGTAATACTTCATTTTATTATAA AGAAACTCTGTCCATTCCTAGTTATTCATTCAGCTGTTAAATATACCGGTTTTTTATACTATTTTTTATTTAATATCTAC AGGTATCTGAATTTTCTCCATCTACTTCAAGTGCTATGGGCCTTCCAAGGGAATTTCATGAGCAGTGTAGGACTTCATTT GAAAAAGACTACCTGAAGGTCCTTCCAATTTCAAATATTTATGCTGCATATCACTTTCTAACCCTTGAGTTAATCAAAGT TTTACTATCAAAAAGTTATTTATGCTTTACAGTCAATTCCTGAACTAATGTTAATTTTCTTCCTAATTTATTTATTTTGC AATATGATAGACATTCTACCGATGGACACAAGAAGCTGCTTCAAGTGTCACAAGTAGGATTATTGAATCTGACTCTGTTG TACCTGAGGTTAAAGTTTGCACTACTGCACTGGATCTCATGCTTCAAATCCTAAATTGGGATTTTCGTTGCAATACCAGT GACACAAAAATAAATGTAAATATCTTCTCTTCTGGAGTTAGGCAAGACGGGGATACTCCTAAAAGATCTGAATGTCACCT AGTGCAGGTAATCAGTTGGTTTGCTTCTTAACAGTTTACATACATTTGATAATGAAAGATAACAGAGTGATCATTGCTGC ACATTAGACAAAACATCAGAATCAAATCATCACTATAAATTCAGGCTATAAATCTCTCGGTGACGGGCCTTTGTTCTGTT 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AAGACTTCTTTTTGACTTCCGTGTTCTAAATTGTTTGGGTGCATTCAGTAATTATCATAAAATTGAATTAAATAAAAAAG ACCTATGTAAATGGTTTTTCGACCTCTCATTTAAAAGGTTTCTTTATCCTTTTTTCTTTAGGAATTTTATTATCTGGTGA AACAATCTTCTAAGTTGTATCCTCAAACTCCCTCTTTAGAGAAAAAAAAAATTTACTAATGAAGTTTCAATCTAGTTGAA GTTTGAACCCATGTATGTCCGAATCTTGAGATTAGATAGTTGGAGAAGACTATCTTTTGAATGCTATTACTGCAGTATTA TCAATACACCTTTATTACTTCTAGTATGAGTCATAAGAGATACAAAGTCATACTTATTTACATTTCATTTCTTTTGCTTT GCATTTATTTTTTTATCCCAATAATTCAACAATATAACTGCTTTGATCATATTATGTAAAGTCAATATGTTATTGTTACC AGTAAAAAAAAACCTATGGTCATTCCTAGTTTTCCTTTTGTTTTTCATTATTTTAAATATTTCCTCTCTCATCTCCCTCT TTGCACTTTTCTCAGATATCGCTTAGTCTTTCAAGCAGCTTACTTAGTGAGGCAAAAACAGATCAGTATAGAGATTTGCG AGCTCTTCTTCAACTTCTTTCGAGTCTTTGCTCTAAAGACATGGTAAAGATTTTCTGTAAATTAGAGTAGTAGTTGGAAA TAGATCTACGGTCTACCTGTCTCTCATATTCCTACTTAAAATTCAACTTAACTTATGAATACTTACTCTGGCAGATTGAT TTCTCATCAGATTCAATTGAGACCCAAGGCACTAACATATCTCAGGTAGCATCATTATTACATTTCTGTATTTCGTGTAA ATAAAATTAGTCAATTTCTAATGCATTGATCTTGTAGGTGGTTTACTTTGGTCTTCACATAGTTACACCACTGATTTCAA TGGACCTCCTGAAATATCCCAAACTTTGTCATGATGTAAGAGTTTTATGTGCTATGTAGAATAGTATAGGAAAAGTTACT GTTCAAAAGCTGATACTGTACAATTTATTTTGCAGTATTTTTCTCTCTTGTCCCATATGTTGGAGGTTTATCCTGAAACA TTCGCACAACTGAATAGAGAAGCCTTTGCTCATGTACTTGGGACCCTTGATTTTGGCCTTCACCATCAGGTAATATAATA TATTTGAATGTGGATTTTCTTCTTTAATAATCAATAATATTTCATGGATCAGGAAGACACTACAAAGATTAGACAGACAG ATTAACTTCTAAGCTTAGAAAATTTTGACTAGTTTAGCATTCTCTTCCAACATCTTTAATGAATTTCTTCTCTTGGAAAA GGAAAAGCAAGAAAATTTCTCCAGTGTTCTACACTTTCCATATATAAATAATTATCTCCAGTTTTCTAACTTGTGATTGT ACTTGCTAAGAATTGTATCCTTACTGATTTTGCAGGATGCAGATGTGGTTAGTAAGTGTTTGAGAGCTCTTCAAGCTCTT GCTTCCTACCACTACAAGGAGACTGCTAATGGTAATATAGGCTTGGGTTCACATGCCGTTGGTCTTGAGGATTCAAGTGG TAAGATTCAAGAAGGCCTTCTGAGCCGCTTTCTCCGTTCATTGTTGCAGTTACTCCTTTTTGAGGATTACAGGTGAGAAT GCAAATGAACTTTACCCTTTTACCCAACCCTGCCAATGATTGGGCTTCCGATAGGAGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTCTCTGTTTTATCTATGCAAGCACAGAATGAACAATTTGGGTATAATTTGGTTACCGTGACTAGATTG CATTTTAAAGCACATTCACATGCTTTTTATCAGTATTTCTTATGAATATATAACTAATGTTGGATGATTTAGACTTGCAA ACACATTCAAATGCCTCATGTCCTGGTTCTATTCTATTAAAAGGCAATATATCATTTCGTAATTAATACTGTTGCAAAAC TACATTGTGATTAACTAATGGAATTGCCTTGTCATTTCAGTTCTGATCTAATCAGCGTTGCAGCAGATGCTCTCCTTCCA TTAATCCTATGTGAACAAGGCCTGTATCAGGTATGCCTCTGTTAGAAATCCTAAGTTAGAACCACACAACACCACAAAAC CTTAGGCTTAAGGCAATGGGTGTGTGTGTTCTTTATTATATATGCACTTGTGCACTTGCTAATCTTGGCAATGTGGGACT AATTTGAGTCACCACTTTATTATCTCTATTACTCCCCCTCAATTGGGACTCCATTCATTTTTTTTTTTGCCTGTGCCTTG CACTCCAGCGGGAACATCAGTGGTCGTCGGACTTGTGCTCCTTCGTCTGAGTCTGCCTTTCGACTTTCTTTGTCTGGGCT AGTACTCTAGCGGGAACATCGGAGTTCCTTGGACTTGTGCTCCTTCGTCTGAGTCTGAGGTCTTGGCTTGCGCAAATGGG ACTGCCATTTTTGCTGCTGCTTTTTTTCAGCCTCCCTAACTCTAATATAGTATCAGAGTCTGTCCTAGATCCATTTGTTG ACTCCCCATATTTGGGTAGTGCAAACCTCAACTCTTGAGCTAGCTTTTCGGTTGAGTTAGGCCTCCCTAATTCTTGATTA CTTAATTGTTTAAGCCTTGATTAGTACTGTATAAAAAGTGAACGACAGATGAACTTATGTTGCTTTTTCTCTTCAATGAC GAATATACAATTTACTTTTCACATCAGGATTATGTTTTCAAGATTTTTGTTCTCTTTCAAATCAAACATAGATTCCTTAA TGCTCTGTTTTTTGTGAATAATTATAACATTATTTTGAAGATAGCATATTCATTGTCTTTTGTGGTCTTTTTCAGAGAGG AACATCCATTATGAATCAGCATATATTCCTATTTTTTGTGTTACCCAAAATTTTAGAAGTTCGTAAATAATCACTAGTCC CGATACACTATTGTACTGCATATCCAAGTATTCCTGCCATGATTTTCATCCTCCATTTAATAAATGGTTCCTGAATTTGA GAGGTTTTGGGTATATTTCTTTGCAGAGACTGGGCAATGAATTGATAGAGAGACTAGCAAATCCAACACTCAGATCAAGG CTCGCCAATGCTTTGCATGCACTAACAAGTGCAAATCAGCTTTCTTCCTCCCTTGATCGAATAAATTACCAGAGATTTAG GAAAAATCTTAACATCTTCCTTGTTGAAGTTCGTGGATTTCTGAGGACCATGTGA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0785100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGCCTTCCAAGGGAATTTCATGAGCAGTGTAGGACTTCATTTGAAAAAGACTACCTGAAGACATTCTACCGATGGAC ACAAGAAGCTGCTTCAAGTGTCACAAGTAGGATTATTGAATCTGACTCTGTTGTACCTGAGGTTAAAGTTTGCACTACTG CACTGGATCTCATGCTTCAAATCCTAAATTGGGATTTTCGTTGCAATACCAGTGACACAAAAATAAATGTAAATATCTTC TCTTCTGGAGTTAGGCAAGACGGGGATACTCCTAAAAGATCTGAATGTCACCTAGTGCAGCCTGGTTCAGATTGGCGTGA CGTGTTGATATTAAGTGGTCATGTTGGATGGCTTTTGAGTCTATACGCAGCATTGAGGCAGAAGTTTTCACGTGAAGGCT ACTGGCTTGACTGCCCTATTGCAGTCTCTGCTCGAAAGCTAATTGTACAATTTTGTTCTTTAACAGGAACTGTATTTCTT TCTGATGATAAAAAAATGCATGAGCACCATCTTCTGCAACTCCTCTCAGGGATAATAGCGTGGGTAGATCCTCCTGAAGC TGTTTCAAAAGCTATTGAATGTGGGAGAAGTGAAAGTGAGATGCTTGATGGTTGTCGTGCACTATTGGCTCTTGCAAATG TAACAAATCCCTGTGTGTTTGACGATCTCCTAAAGTCCATGAGGCCCATTGGTACCCTTACCTTTTTGTCGATGTTGATG TCTGAAGTAATTAAAGTCCTCATGACTAACAACACTGAAGAGGAGTCTTGGAGCTATGAAGCTCGTGATGTCTTATTGGA TACTTGGACTGCCCTTCTAATGCCAATAAATACTATCACTGTGAATGCTTTGCTTCCGTCTGAAGGGATACAAGCTGCTG CAAATCTCTTTGGTTTCATTGTTGAATGCGAGCTAAGAATGGCCTCTGCTTCAGCATTTAATGATGGGGGCGATTCAGAT TATCTTCATGGTTCTGTATCTGCCATGGATGAAAGGTTAAGCTCCTATGCTCTTATTGCACGAGCTGCAATTGATGTTAC AATTCCTTTACTTATGAGAGTGTTTTCTGAACGGGTTGCACGCCTTAATCAGGGCAGGGGCATTATGGACTTGACTGAAA CTATGGAAGAGCTTTATTCATTGTTGCTTATTATTGGCCATGTAATTGCAGACGAAGGGGAGGGGGAAACACCTCTGGTT CCTAATGCCATACAAACCCAAGTAGTTGTGGATTCTGTGGAAGAAGATAAACATCCTGTTATTTTACTTTCCAGCTCAAT CTTAAAATTTGCTGAGCAGTGCCTAAATCCAGAAATGAGAGCATCAATTTTCAGTCCCCGACTTATGGAGTCAATTATAT GGTTCCTTGCAAGGTGGTCTCATACATATTTAATGTCTTGCGATGGGATTGGGGAGAAAATCTTGGATTCAAGTCATCAT TATGAGCATAGTTCAAAAAAGGCTTTGCTTAGTTTCTTTGGAGAGCATAAACAAGGGAGACTTGTTCTTGATATTATTGT CCATATATCCTTGATCACACTTACGTCCTATCCCGGGGAAAAGGATCTGCAGGGCCTCACTTGTTACCTTCTACTTCATT CCTTGGTTCAGCACAAGCATATATGCATTCACCTTGTTACTCTGAATTCATGGCATGAACTAGCAACTGCATTTTCCGGT GAAAAGACGTTGTTCTTGTTGGACACTGCTCATCAGCGGTCTCTTGCACAAACACTTGTTCGCTCAGCCTCGGGCATAAA AAATTTAGAAGCATCAAACCAGTATGTAAGGAATCTCATGGGTCATATTGCTAAATATATAGTGGAGATATCCAGCAAGA GTAATTTCAAAAGTATTGCCCAACAACCAGATATCCTCCTGTCGGTCAGCTGCATGTTAGAACGGCTACGAGGAGCTGCA AGTGCTTCTGAACCTCGAACACAGAAGGCAATCTATGAGCTAGGATTCTCTGTAATGAATCCCATACTAGTTCTTCTTGA AGTATATAAACACGAGTCTGCAGTAGTCTACCTGCTACTTAAATTTGTAGTTGGTTGGGTCGATGGACAAATTACTTACT TGGAGGCCCAAGAAACTGCTGCTGTTGTTGATTTCTGCATGCGCTTACTACAGCTGTATTCATCTCACAATATTGGCAAG ATATCGCTTAGTCTTTCAAGCAGCTTACTTAGTGAGGCAAAAACAGATCAGTATAGAGATTTGCGAGCTCTTCTTCAACT TCTTTCGAGTCTTTGCTCTAAAGACATGATTGATTTCTCATCAGATTCAATTGAGACCCAAGGCACTAACATATCTCAGG TGGTTTACTTTGGTCTTCACATAGTTACACCACTGATTTCAATGGACCTCCTGAAATATCCCAAACTTTGTCATGATTAT TTTTCTCTCTTGTCCCATATGTTGGAGGTTTATCCTGAAACATTCGCACAACTGAATAGAGAAGCCTTTGCTCATGTACT TGGGACCCTTGATTTTGGCCTTCACCATCAGGATGCAGATGTGGTTAGTAAGTGTTTGAGAGCTCTTCAAGCTCTTGCTT CCTACCACTACAAGGAGACTGCTAATGGTAATATAGGCTTGGGTTCACATGCCGTTGGTCTTGAGGATTCAAGTGGTAAG ATTCAAGAAGGCCTTCTGAGCCGCTTTCTCCGTTCATTGTTGCAGTTACTCCTTTTTGAGGATTACAGTTCTGATCTAAT CAGCGTTGCAGCAGATGCTCTCCTTCCATTAATCCTATGTGAACAAGGCCTGTATCAGAGACTGGGCAATGAATTGATAG AGAGACTAGCAAATCCAACACTCAGATCAAGGCTCGCCAATGCTTTGCATGCACTAACAAGTGCAAATCAGCTTTCTTCC TCCCTTGATCGAATAAATTACCAGAGATTTAGGAAAAATCTTAACATCTTCCTTGTTGAAGTTCGTGGATTTCTGAGGAC CATGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0785100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGLPREFHEQCRTSFEKDYLKTFYRWTQEAASSVTSRIIESDSVVPEVKVCTTALDLMLQILNWDFRCNTSDTKINVNIF SSGVRQDGDTPKRSECHLVQPGSDWRDVLILSGHVGWLLSLYAALRQKFSREGYWLDCPIAVSARKLIVQFCSLTGTVFL SDDKKMHEHHLLQLLSGIIAWVDPPEAVSKAIECGRSESEMLDGCRALLALANVTNPCVFDDLLKSMRPIGTLTFLSMLM SEVIKVLMTNNTEEESWSYEARDVLLDTWTALLMPINTITVNALLPSEGIQAAANLFGFIVECELRMASASAFNDGGDSD YLHGSVSAMDERLSSYALIARAAIDVTIPLLMRVFSERVARLNQGRGIMDLTETMEELYSLLLIIGHVIADEGEGETPLV PNAIQTQVVVDSVEEDKHPVILLSSSILKFAEQCLNPEMRASIFSPRLMESIIWFLARWSHTYLMSCDGIGEKILDSSHH YEHSSKKALLSFFGEHKQGRLVLDIIVHISLITLTSYPGEKDLQGLTCYLLLHSLVQHKHICIHLVTLNSWHELATAFSG EKTLFLLDTAHQRSLAQTLVRSASGIKNLEASNQYVRNLMGHIAKYIVEISSKSNFKSIAQQPDILLSVSCMLERLRGAA SASEPRTQKAIYELGFSVMNPILVLLEVYKHESAVVYLLLKFVVGWVDGQITYLEAQETAAVVDFCMRLLQLYSSHNIGK ISLSLSSSLLSEAKTDQYRDLRALLQLLSSLCSKDMIDFSSDSIETQGTNISQVVYFGLHIVTPLISMDLLKYPKLCHDY FSLLSHMLEVYPETFAQLNREAFAHVLGTLDFGLHHQDADVVSKCLRALQALASYHYKETANGNIGLGSHAVGLEDSSGK IQEGLLSRFLRSLLQLLLFEDYSSDLISVAADALLPLILCEQGLYQRLGNELIERLANPTLRSRLANALHALTSANQLSS SLDRINYQRFRKNLNIFLVEVRGFLRTM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 986 | 986 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 986 | 986 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 368 | 954 | 587 | 5.23E-8 | ||
| Gene3D | 528 | 987 | 460 | 9.2E-28 | ||
| Pfam | 784 | 853 | 70 | 4.3E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nuclear export signal receptor activity | Combining with a nuclear export signal (NES) on a cargo to be transported, to mediate transport of a the cargo through the nuclear pore, from the nuclear lumen to the cytoplasm. The cargo can be either a RNA or a protein. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0785100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…