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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0053500 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0053500.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Regulator of chromosome condensation (RCC1) family protein; TAIR: AT5G16040.1 Regulator of chromosome condensation (RCC1) family protein; Swiss-Prot: sp|Q9FN03|UVR8_ARATH Ultraviolet-B receptor UVR8; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7FQ68|A0A1J7FQ68_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0053500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:10595570..10607606) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AACTAAAACACCTTAAACCCGAACCAACTCGGTTGAAGTATATCCCTAGTCGCAACACACTTGAGTCGTCAACGTGAAGC GAGCAAGTGTCAAATATCAAGCTGATTGATCACACTTTTTCTCATTCACTTGTGTTTTCTCACTCTCGCTCTCGCTCTCA ACTCTCAACTCTCAACTCTCAACTCTCAACTCTCAACTCAACTCAAGTCATGGATTCCAATTCACCCATCATTGCTTGGT CTCTCTTCTTCCCATTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTCTTTCCACACACTCACCGTTCTCCACTTTTCAGGGGCT CCGGCGAAGATGGCCAACTCGGAATCGGTAACAACGAAGACAAGGAATGGGTTTGCGTCGTCCAAGCTCTCGCCTCTCGT TCAGTTCGCTCTGTCGTCGCTGGTAGCAGAAACTCCCTCGCCATCTGTGACGATGGCAAGGTGCGTGCGTCCAATTCCAT CAATTTCTCAATCCATTTTTCTGTTTTTCAGGGTTGATTATGATCAATATTAATTTTCATTGCTATGAATTCTTGGTGTA GTTGTTCACATGGGGTTGGAATCAAAGGGGAACACTTGGACACCCACCTGAGACCAAGACTGAAAACATTCCCAGCCAGG TCAAGGCACTTTCCCATGTTAAAATTGTTCAGGTATTTTCTTTATTACACAACCCTCATTTCATTTTAGTGTCTTGCTGC TTATGTTTGTGTTTTGAATTTGCAGTTATATGTGTTGATGATTGATATGTGTTTGTTGTTTTGTTTTTTTATTTATTTAT TTTGTTTTCGATGTTAGGCGGCTATTGGTGGGTGGCACTGTTTGGCTGTTGATGATCAGGGCAGAGCTTATGCCTGGGGT ATGAATTTCATACCATACCACCATCTCTAACTTTATGTCTTTTAGCTTCTAACATCCTCTATGAGAATATGGAGGGCTTT AGTTTTTTTTTTGATCAGCGAAATTTTCCCTTCAGGGATTGATCCCTGGACCTTCCCCTCCCCAACTCACATGTCCCCTA ACTCTTACCACTTGAACTATTATTCGGGGACGAGGGCTTTAGTTTTCTTGATTCTTAGAATTGGCATGATACAAAGTGGC AATGTAGGTATTAAACACATTGGAATGTTTTCTTATTTTTCTACTTCATTGATTGCATACCCTAATTTCTTTTCTTATGT TCTCTCATTTGTTGAGCGACTATTTGGACAAAATTGAGATAAGTGTCAGGGTTTTAAATTGCTGTCGTGGTTGCAGATGT GGTAATGTCGCGGAGTTGCAGACAAATACCAGTTTTTGCGGCTGCGATTGCGGTGGTGACATGAAAACTGTGTACATTGT GGTTGCCTCTGCGGACCACAATTTAGAATCCTAATAAGTGTCACGCACACAAATTGGCTTTTGAAAAATCAGAAAGAGTT TGGCTAACTTCAATTGATCTATATTAATAAAAAGTAATTTTTTGAAGAATGAGTAAAATGCTATGTTATTTTTTTTGTTT CTTTTAACTCCTAAAAATCAGAAATTCCTTTAATACGATTTAATTGATGCTCGTGTTATCTGAATGCTAAGAGGAAATAT AATTGATGTCAGGTGGAAATGAGTATGGGCAGTGTGGTGAAGAACCTGAGCGCAAGGATGACACCGGTAGACCTCTGAGG AGAGATATAGTGATCCCTCAGCGTTGTGCTCCTAAGCTTGTTGTTCGCCAGGTAACTTGTGTATTCCAATACCATGCAAC GATGGAACAAAAGATGATTTACCTTTGTTCTGTTTTTTTTCATTAATTTGTATGTAACTATTATAATTCCTTCATAAATC TTCATTTACCTGATTACCTCTAATTATTGGGATATCCTCCTTTTAGTCAACTTTAAGTGAAACCATTATTGTGTGTGTAA 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TATATAGCTCCAAAACGTTTTACTAGTCTGTTTAGTCTATTCAGTATTTGGTCCATTTGGGTCAGACGGCCATAATTGGT ATTACCTCCCTAACTCCAATCGTGTGGCTAAGTAAATTGGTATTAATTCCTCATTCTTGACCCATTGTGCAATATAGTCC TACTGTGCTTGGATTTGTATAGGAACTGCGGCATCTCTGTCTTAATGAACACAGCATCTGAGTATTTGATGCCATAAGCT TTGTTAGATTGCTGTTTAATATTTTTCTAATTGCTTGAGGTGCAGGTTGCTGCAGGAGGGACTCACTCAGTGGTACTTAC ACGTGAAGGGCATGTATGGACATGGGGTCAGCCGTGGCCTCCTGGTGACATGTAATTTTTCTTTTGGTTTTAAGAAAAAA TTTATTGAGATATGAGAATGAATTACAAAGAGAAAAGAGCAGAAGGAATCCTCCTAAACAAAAACAAAAATAGGAAGCAA CTAAGGAAAAATGAACATCAACATAGGGTTCATATCTTTGTACTTTTTTAACAGAAAAATGCCATTTTAATTAAAAAACA TGTTTAAAAAATTGATAGTTATTTGATAATTTTTTCCCCAAGAAAATTGTAGTTTAGTGCCTTTATCAGAAACAAAAGAG AGGAGCTTCTATAAAAGCTCAAAAAGATGTCATAAATCTCTTTTATCTAAATATAACAAAATGCACCCATAGTAAACATA TCTTTTCGTGAAATCCTGTTTAAAAGGCTATGTACTTTACTCCAAATAGATACCGAAGGCCTGATCTTATATCCAATCAA GTGGCTTGCCAAAGAAGCCTCCTTAAAAACACAACAGTTCTGCTCCAACCAAATAAACCAAATTTTAGCTTAGATTTCAC ATTGCTACAAAAAAATTGTTTACTTCTACCAAAAATCAGTTAAGGCTCCTCATGTAACCACAGTGCGATTCTCTAAGTAT GAATTCAAATGATGTGTTTGGATGTTTCTCTGCTTTTTACGTAAGTAAATAGTTTGTGCTCTGATAATTTCAAAATTATT TGCTTCATTTTATAGTAAGCAGATTTCAGTCCCTGTTCGGGTGCAAGGTCTCGAAAATGTGAGGCTTATTGCAGTTGGGG CATTCCATAATTTGGCTCTTCAGGAGGATGGAACTTTATGGGCATGGGGTAATAATGAATATGGACAACTTGGAACTGGA GATACCCAGCCAAGATCACAACCTATTCCGGTGCAAGGGCTTTCTGGACTTACTCTGGTGTGTATCTTATTTTCCAGTGT CATCTTGTTGATTTCAAGTTCTCTTCGTGTCAACATAAAAAATAATATATTTTTCTATGTACAACAAGAACAAGAACAGC CAAAGTTTTTTTTATAGGATTCCAAGGCTGATCCATGTCAACAAACCAGAAAAGCTAAACAGCAGGGGTCAACTGTCTGG GCAGTTATGATTAGGAACAAAACCTCTTCTAATAGAGTCTGAGAGGCGCTATTGGATAATTGTAAAGGATCCTAACTTGT AGCTTGGTATTATTGTAACTAAGGATGGAGTTTATCAGCTGTAGCCGGCCAGCGTAGGATAGGCTTCTACCCTTCCAATG TTTAAGTTTGGATGGTTTTCTGTCCACAATTACTTTGCAATCTGATAGAACCCAGCCAAATCTGATATTATTCAATGGTA AAACCCTAATTCCCAAATAGGAATTGGGGGAGAGATACAAGGAAAAAGGGATCCCAAACACCCTCCCTAGAACCAGAGAG ACCCAACGCTCTCTAAACCCTAATTCCAAAGTGAATACAAAGATAACCTAATGCTCTCTAATCACTCTTATTTATAGGCA ACATGCCTCTTAAACCCTATAACTAAATAACAAACTACTGACCCTGCTTAACTACCAACTAGCTAACCTGTGTACCTATC AATACTCCCCTCTGAAAATTCACCTTGTCCTCAAGGTGAAGGACTTGGATCCAAATGCTGAATATTCGCAGCTATTCCAC CCGGATCCCATTGCTGAAACTGCAAATAGTACACATTGCTTGAAGTGTTGAGCCAGTTTCCCACATAACTGAGGGAAAAT AGTCCCCCTGGATCCCACACCATTCTCCTTGGATTCACAAAATCCTTGATAGAATGAATTTGACCCAATGAATCCAAACA GTGATACCCTTCTTCAGCTCTCCAATTTTCTTCAACTTTTTCTGCCTTCCAAACCCACCTTTTGTCTTCCATTTTAAGAC ATGGGCTTGACCCACCTTTTCTCTCCCACAAGTAGCCCTAACAAAGATGCTAGGCCCAGGATTGTCACTCCAATGTGGCA CTTGGCACTGCTTGGGTCATGTAAGGCAAGCACCACTTTTTCTTCCTGCCTTGTGTCAACTCTTACTGGCTCCTGCAGAA GGTTTTTGGCAGTTGGAAAGCAAACCCGTTTGCTGTTTCTTCCATGCGCTGCCAGCAAACAACTTAGAGAATTTGGCAAC ACGACACCTGGCTCAATGTCCTCTTTATTGAAGACTTAAGCTGTTGACTTCTGCCAGACCACATAAGTATTCAACAACAA AAATGTGACACTGAATGTGAACCTGTGTCCCACTTGCAGGATGAAACCTTGAGCTGTTTGCCTTTCTAAGGCTAAAATCG TCTCTGCCACCATGTGCATATAGTTCTCTAGTGACTCAAGCGGTGGTTGCTGGACTGGCATGCCTCGCCTTGCCTTGCTT GCTATTACGAGGGCAGCTTGGGTCTCCATAGGCATCTCAAAATACGGAGGTTCTTGCAGAAGAATTATAGAACCGCCTCC TTCACAGTGGCCTCGATCACCGGCGAAATGTCAACCACCCTGGTATGGCGGTTTTGACGGCAGTCGTTCACAGTACTGCT GTTGTTGCAACAGAAACGTCACCAACTCCTCCATCCTCGTCGCCCACCAAGCCTCGTCGTAAGGTGGTTTCGGTGGAGGT CTTTTGAGCCCTCCCATATTTCTCTCGCCCAACAACTTATCTCTACGCGTGCGAAGTGCGCCGCTGACGGTACCTTGGTC GTTCCTCTATTCAGCGCCGGTGGCGGTTGATGCTTGCATTTCTCCGTTGCCTTCAGTTGCTGACCTCTTCTTTCATCCAT TGCTTCAGATTCCTTAACTGAATCAGGTTCAGATTCTTTTCACAACGCCTCCGTCGCTACTCGTTCTTCCTCCGCCGCTT CAAGATTGGGTTTCAGCCTCTCCTCAAACGTCAAGACTTCCTCTGCTACAGATGCTTGCTCAGCCACCGTAGCGTCTCTT TCTTCTTCCCATGCAGTCCCCGTTCCTTCTAGCGACGCCTCTGCCGCTGTTCGCTCTCCCACGGTTGGTGACTCCGGTTC GCTCCTTTCTCATTCCATCTTCTGCCTTCGCTCATCGAGATCTCTCCGCTGCTCTTTAATTGACTCGTGTTCCTTTCTGC TCTCAGCAAACTCCTTCTTCAATTCCTCTACAAGAGCAAATATCTCCCTCCTTTCCTCACGTGGAAATGAATCCATGAAT GCTGTTGCGGTTAAATCTTCTTGTTGGCCAGAGCACCTGAATTAGTGCTCTGATACCAATGATAGAACCCAGCCAAATCT GATATTATTCAATGGTAAAACCCTAATTCCCAAATAGGAATTGGGGGAGTGATACAAGGAAAAAGGGATCCCAAACACCC TCCCTAGAACCAGAGAGACCTAACGCTCTCTAAACCCTACTTCCAAAGTGAATACAAAGATAACCTAGTGCTCTCTAATC ACTCTTATTTATAGGCAACATGCCTCTTAAACCCTATAAGTCTATAACTAAATAACAAACTACTGACCCCGCTTAACTAC TAACTAGCTAACCTGTGTACCTATCACAATCATTAGCTTTGAGCTTTGTCGTAAGTTGGGGTACCCCTAATTACCTTACG GGAAGTTTTCCCTCCTTGTAACCCAGCATGTTCGTGATCTGATCCTTTGTGGTTTCCTTTACTAAAAAGAAAACCTCACT CTTAGCCGGATTTGGGGTGAGACCAGAAAGATGTTGAATATATGGAGGACATTGTTGATAATGGAAGTTTTTTTTTTGAA AGGAGTTCGCATTCCGTTAATAGTGTTAGTTATGTGGACTTAGTTCATTACACTTGTATAAATAGCAGCCCTCTGTACAA TCAATTCAATCACAAGATTTTCTCTAAAGCTTTCCAAGTTCCAACAGTTCTCATGTTCTCTAATTTCGTGTTCAATGATT TCAATCACTGGCCTTTGGTTTCCTTCAGTGTAACCATCGCACTTGTGAGAAGTGTGACAAACACATGCACTAGCTAATTG TGCATTTGAGTGGTTGGTGCTATCTTATTGGGTGGGTTGGTTTCTGTGTGACTGAGTGGTTATCAGATCATTGATCCACA ACTTAACCAGTAGTTTCAAGTTTGAACCCTGGGTATGCAGCCGGATCATATACTTGAAGGGAGAGATTTGGTGCCCATAG TTGTCCTAGCTAGCTTGAGCAGGATTGCTTCACATGGAGAATATATGTGGTCCCAAACATTTAAAGAAAATATATTTAGG AGATGTATCAAGCTGGAAGACTATTTTATGAGAGTTGGAGGAGTAAATATTAAACATTATATGTTATCATGAATATGAGG GGTTAAGAATAAAGCATTTAGTCATCTAACTAATATATCATGTGATCATCAAATAAATTAATCTTGACAATCCATGCTTT GACAATATTTCCTCATCTCAACTCTAATATAAAAATACCTCCCCAACACTCACAAAGGGATAGAGCTATTTTTATATGAT AGAGAAACAAGCTTAAAACTTTTTTATTAGTAATGAAAATTGTTCGTAAGAAATTCCAGGCCCTTTTTGGTGATTCATGT TGGAAATTCATATGAAAGGAATTTAAATTTGGTTTAGCTGATTTTTTCTCAAATATGTTGTTAATTGTACTATAAATCCA TATTTTCAGTGGCATACATTTGGTTTCGTGGGTGTTTTATTTTTGGGTGAGGAGAGATCATTAAGTATTTGTACTCTGTA TGATGACATCCTTTTATTATAGTTGAAAATTGGAAGTCATTGCAATGATAATATGGTCAGATATATTTGTTTTGTTGTTC ATTCATATGTAAAATAGCTTATCTAATTTCTTTTCTTATTGTGTTTGGAAACTTAGGTTGATATTGCAGCTGGTGGATGG CACTCTACTGCATTGACAGATGATGGAGAGGTGCTCTATTTATGTCTTTCTCAAATCTATTAATTTTTAATTTCAAGACA CCCATGTTAGTTTTGATTTTTGTTTCATTCGAGATGCGATTTTGATTATGTATGGGAATGCATTTTGTTCAAATGTGCAT TATGAATTTTGTTGTAACCTCTATTTATTATTTTTTCTCATTATATTTCGTTGACGCATGGGTTTCAGCATATATCTCTA GTTTTTATCTTCCATGAGCCAGCTTCTGTATAGTTGTCATAAAGCCAATAGAAAATAATATCTTGATTTCCTATTGCTAG AATTAGTTACTGCAGCCCCATTTTCTGTGTCTGTCAAGCATGTAGCTTGTTTCTGGAACATATCATTCAATTGAAGTGGA GAAAATAAAAAAAGTCAGAAAAGTGGAATTTATGGATGTGTGCGTATATATTAAGGTAGTGTTTTCAGTTTAGATAGTCA ATTATGAATCTAGATTCTTAGTTTACAAATTAAAGAACTGTGGCGACCTAAACATGACAGGCTGTGTGACTTTCTCTGAA GCATGGGCACACCTGAGAAGGGAAGTGTCCGCATGTCGGACACGCGTGCAACACCGACATGAGATTACACGTATCCATCA CGTGTTGAAGTGTCCGAGTAATTTTTTTTCCGGCTTGGACACAACTTGAAATCTTGAATACTAAGCCGACACTCCTTCAT GGGGTAGACACCCAAAGTGTGAGTTATGTTCATGGGAGTTTTGTGTGCTGTTTTTTCCCATAAGTTTTGTGTTTAGTTCT GTGTTCACATGATTTCTCTCATTCTTGTGATTTTTACTGGTTTGTTTGAACTTTGAACCCAATAGACTATTTTTTTCTCT GCCCCATTCCCCTGTTTTTCAAAAAGCATATTAATTTTATATTTTAATATATATAAGCCGTGCCCAGTGTCCTACCTTTT GGATTTTAGGCGTGTTGCCATGTCCGTGTCGGAGTCCGTGCATCATAGGTGACTTGTGGGCAATGAATGGAGATAAGCTA TATGCTTAGTTGCTTATTTGATTTCATAGTGTGTATTATGGGATATGCATGAATTGGAAAGTTAAAGTGCCAAAGATTCA TTTGGAATATTTTTTAATAGCCACATTTTTCGATGAGTAGATTGTATATTTATCTTTGTTTTTATTTTTGTTTCAGGTAT ATGGCTGGGGAAGAGGAGAACATGGTAGGCTTGGATTTGGTGATAGTGACAAGAGCAGTAAAATGGTACCCCAGAGGGTT CAACTTTTAGCCGGGGAGGATATTGTTCAGGTACTATCTCTCGTTGTAACTATCTACTCTCTTGATCAGGTTAACCAAGG TGTGGAGCATGGTGTCATGGCTAAGAAACAATAACAATAACCACTTCTTTTGAAGTTTAGGCACTTCTCGTCATGTGCCC TATTAAATTGCATTCTAAACATCACTAACAAAAAATAGGAGTTAGTGAATACAAAATAAAGTTAGTCTTCTAAAATTGTG ATATTAATTTAAGTTTAAATATGTTTTTGGTTCGTGTATGATTAGAAATTATTGTGATATCCTATATTTTATATGTTGTT AACATGTCTATGTCTGTGTGGTTTCCAGTGTTGAGCTTAGGAATTACCTTTCAAATATTTTCTTTAACCATCTTATCACC CATGATTAGCTTCCATTGAATTACAAATTTACAAGGGATCCCTAAAAAATTGACATATTTTGGGTTTAGTCCATATTACA GTTTTAGCCACTATAAAATATAAACGTCGTGAGGTTTTAGTTTTGTATTTTCTAAGGACTAAAATCGAATAAAATATTTC TTAGGGACCAAAACCAAACATTACAAATTTTACAGAGAAAATCAATGTACAACTACTTCATTGATGAAATATCTGTTTCT ATTCTAAAACTGTGCTTATTGAAGATATTGATGTAATTATGTCTTTAAATACAATAAAAAGCTACATATCACAAGAAAAG TGATAAAATCATTAAGCATCAATCTTTTAAGCTTGAGATCCGTCTACATTTTATCTCATTTTGACATCATTGATGCTCCA AAAAATGGAGAATACAAATATCCAGAACTTGGAAAATATATACCCTTGTAAAGAATACAATTTGACATGTTTCTCCATTT ATTTTAAATCTGAAGTTGTCAAATTTGCTTCTCACGTGTGAACCTTTTTGATATCCATATTGTTTTTTACTTCGTATCTC CTACTAAGCATGGCATCTTCCATATGAATAAGAACAAATGGAATAAAAAAATTAAATGTTTGGTAAATGATAATTTATAG TTAATTATTTGTTGTTTGACATGAAGTTTATTGATATGTGGTCAGGTGTCTTGTGGAGGTACTCATTCAGTTGCATTAAC CAGGGATGGACGCATGTTTTCTGTAAGTTTTTATTTATAACATCTTAACTGCATTTTCCATAATTTGTTCAAATAATAGG ATGCCTCAAATCCAGCTTTATTACATTGATTATTGGAAGTCTTCATTTTGTAATTTTTTTGGCTAATGTTCCATTGGCAT TTTTATGAATTAATCATATATCGTGTTAGAACTGGTAATCTCAGTGTATAGGAAAACCAGTAGAAATCACAGAAAAGAAC AGCCAGAATCCATGGAGGTTCTGTAGAGAGAAACAGTGAAGAACAGGCAGAAAGAGATACAACTGAAAGAGAGATAAAAT CCCCAACTGATCCCAATGATCAGTTCTAACCAACTCTAACAACCAGATAACTCCCTATTGAGGTGTATAGCCTCTTATAT ATAGCTATTTCTGTAACTAACTTAGTTATTTTCCTTTGCTGCCAGCTTGGCGCCTAACATACACATGCTTAATAGGAGGC TTAGCTGGCCTCACTTCAATACTAACCCTATCATATTAGGAGGCTTTAGCGCTTAGGAGGCTTTAGCGCTTATGTAAGTG TTTGAGAGAACTTATGTAAATAGCTTATAGCCTACCTATAAGCTGTTTTGAGTTTATTTTCATTAGTTGTTCATATTAGC TTATGAATAAGATCTAATGCTTATCCATGACTTATTTTCAATTTATTAAAATAAGTTTCTTAAATTAGCTTATGAAAAAG CCATGATTTTTTGTCATAAGCACTTAAATAAGCTGTTTAACCAAACACACCCTAATTCTATTTTGTTTGAACTATTGGCA GTTTGGTAGAGGTGACCATGGCCGTCTCGGATATGGGAGGAAAGTCACCACCGGTCAGCCAATTGAGGTACCTATAAACA TCCCTCCTCCACAGAATCTCAGCGGCAATGAAGCTGATGAGGGACATTGGATATCCAAACTAGTTGCTTGTGGTGGCCGT CATACTCTGGCAATAGTAGAATGGAAAGTAGACGAACCTCAAGTTGACTCGTAAATTGAAACTGGAAAGTAGATGAAGCT AGTAACTGATTTGGAACTCAGTTCAGGTCATAGAATTCTTGTGTTGTGTCCAGTATGATAGTGTCTCATGGCACAAACAC ATTAATAATAAGCATAGTAATGGCGTTTGGCATGGATGGTCATATATAACCATATACAGCCCAAACACATAAAAAAAACC GTTTCTCTAATCTAATTAACCTTGGTTGGCCCACAACATGGAATTGCTTCTCGCCCTTAATTCTTTTCAGTTCTATGGTC TGTTTATTGTTATTGTAGTTGTTAAAACCATAACAGTCGATCCAACGGATCGGGAACTGGTTAAGTGACAAGTAATCTGA TGAAAACCAGTTAAGAACCAGGTGAAAATTGGTGCTATTGAACCTGTCTGAACCAATACAAAACCGGTCATAATTCAACT TTTTGCAATTTTTGTTTTAAATTTTATAAAAATTATTTTTATTTAAATAAAGGTCAAATACAATATGCAACTTTTTTACA TTATTACTCTGATGAGTATTTATTCAAACAAGAACAA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0053500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATTCCAATTCACCCATCATTGCTTGGGGCTCCGGCGAAGATGGCCAACTCGGAATCGGTAACAACGAAGACAAGGA ATGGGTTTGCGTCGTCCAAGCTCTCGCCTCTCGTTCAGTTCGCTCTGTCGTCGCTGGTAGCAGAAACTCCCTCGCCATCT GTGACGATGGCAAGTTGTTCACATGGGGTTGGAATCAAAGGGGAACACTTGGACACCCACCTGAGACCAAGACTGAAAAC ATTCCCAGCCAGGTCAAGGCACTTTCCCATGTTAAAATTGTTCAGGCGGCTATTGGTGGGTGGCACTGTTTGGCTGTTGA TGATCAGGGCAGAGCTTATGCCTGGGGTGGAAATGAGTATGGGCAGTGTGGTGAAGAACCTGAGCGCAAGGATGACACCG GTAGACCTCTGAGGAGAGATATAGTGATCCCTCAGCGTTGTGCTCCTAAGCTTGTTGTTCGCCAGGTTGCTGCAGGAGGG ACTCACTCAGTGGTACTTACACGTGAAGGGCATGTATGGACATGGGGTCAGCCGTGGCCTCCTGGTGACATTAAGCAGAT TTCAGTCCCTGTTCGGGTGCAAGGTCTCGAAAATGTGAGGCTTATTGCAGTTGGGGCATTCCATAATTTGGCTCTTCAGG AGGATGGAACTTTATGGGCATGGGGTAATAATGAATATGGACAACTTGGAACTGGAGATACCCAGCCAAGATCACAACCT ATTCCGGTGCAAGGGCTTTCTGGACTTACTCTGGTTGATATTGCAGCTGGTGGATGGCACTCTACTGCATTGACAGATGA TGGAGAGGTATATGGCTGGGGAAGAGGAGAACATGGTAGGCTTGGATTTGGTGATAGTGACAAGAGCAGTAAAATGGTAC CCCAGAGGGTTCAACTTTTAGCCGGGGAGGATATTGTTCAGGTGTCTTGTGGAGGTACTCATTCAGTTGCATTAACCAGG GATGGACGCATGTTTTCTTTTGGTAGAGGTGACCATGGCCGTCTCGGATATGGGAGGAAAGTCACCACCGGTCAGCCAAT TGAGGTACCTATAAACATCCCTCCTCCACAGAATCTCAGCGGCAATGAAGCTGATGAGGGACATTGGATATCCAAACTAG TTGCTTGTGGTGGCCGTCATACTCTGGCAATAGTAGAATGGAAAGTAGACGAACCTCAAGTTGACTCGTAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0053500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDSNSPIIAWGSGEDGQLGIGNNEDKEWVCVVQALASRSVRSVVAGSRNSLAICDDGKLFTWGWNQRGTLGHPPETKTEN IPSQVKALSHVKIVQAAIGGWHCLAVDDQGRAYAWGGNEYGQCGEEPERKDDTGRPLRRDIVIPQRCAPKLVVRQVAAGG THSVVLTREGHVWTWGQPWPPGDIKQISVPVRVQGLENVRLIAVGAFHNLALQEDGTLWAWGNNEYGQLGTGDTQPRSQP IPVQGLSGLTLVDIAAGGWHSTALTDDGEVYGWGRGEHGRLGFGDSDKSSKMVPQRVQLLAGEDIVQVSCGGTHSVALTR DGRMFSFGRGDHGRLGYGRKVTTGQPIEVPINIPPPQNLSGNEADEGHWISKLVACGGRHTLAIVEWKVDEPQVDS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 179 | 179 | 6.4E-46 | ||
| PANTHER | 3 | 390 | 388 | 9.5E-244 | – | |
| SUPERFAMILY | 3 | 386 | 384 | 2.35E-94 | ||
| PANTHER | 3 | 390 | 388 | 9.5E-244 | – | |
| ProSiteProfiles | 5 | 56 | 52 | 12.112 | ||
| Pfam | 9 | 53 | 45 | 5.0E-6 | ||
| Pfam | 56 | 106 | 51 | 3.8E-13 | ||
| ProSiteProfiles | 57 | 109 | 53 | 15.107 | ||
| PRINTS | 58 | 74 | 17 | 6.5E-17 | ||
| PRINTS | 93 | 106 | 14 | 6.5E-17 | ||
| Pfam | 110 | 166 | 57 | 2.2E-8 | ||
| ProSiteProfiles | 110 | 169 | 60 | 14.584 | ||
| PRINTS | 112 | 128 | 17 | 6.5E-17 | ||
| ProSiteProfiles | 170 | 215 | 46 | 9.559 | ||
| Gene3D | 180 | 391 | 212 | 3.6E-62 | ||
| PRINTS | 202 | 218 | 17 | 6.5E-17 | ||
| Pfam | 215 | 264 | 50 | 2.6E-14 | ||
| ProSiteProfiles | 216 | 267 | 52 | 17.418 | ||
| PRINTS | 218 | 232 | 15 | 6.5E-17 | ||
| Pfam | 267 | 318 | 52 | 1.1E-17 | ||
| ProSiteProfiles | 268 | 321 | 54 | 19.83 | ||
| PRINTS | 311 | 329 | 19 | 6.5E-17 | ||
| Pfam | 321 | 384 | 64 | 2.0E-11 | ||
| ProSiteProfiles | 322 | 387 | 66 | 12.313 | ||
| ProSitePatterns | 374 | 384 | 11 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0053500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…