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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0115800 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0115800.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase; TAIR: AT1G71710.1 DNAse I-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q8H0Z6|IP5P3_ARATH Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 3; TrEMBL-Plants: tr|K7MHP2|K7MHP2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0115800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:42789041..42811670) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCCTGAAAGTGTACGCCGCCTTCAACTTCATCCCTAAACTTTCAAAATGACGCCCGTGGTCCCTGAATGTGCAAAATCTC CTTCATCAGCAATCCCTGGGTTAAAAACAGCTGACGGCGTTAACGGATGTGTGACTTCGATTTTTTTTTTTTTTTGTCAA AGTTGAAGCTTATGTGGCATTTGACTCTTGAGGAAATTTTAAAAGTTTCAATTTAGTCCTGGATCTGAAAAAATTCTTTC TCTCCACCATCTTCCTCTACCTCTCCCCACCACCATCACTCTCTCTCCATCTCCATCTTCTTCATCCTTCTTCTTCTTCC CACCCTCATCTCCTCCCTCTCATGCTCTGACGCTCTCCCTCACCCCAACCCTTTCTCCCTTCCAAAAACCAAAATCCTTC AACTCAAAATCACAAAACCAAAAAACCCACAAACCCACCCTCACCTATTGAAAATCCATCGCAACCCACAAACTTAGGAT TGTGTTTTTTCACTTTTGGTTTCTGAATAATAAGGAGGATTGACTTGTGCTGGTGAAAACTTGTTGAGGTGATTTGTCTG CAACTTTGCATGGTAACTGAATGAATTTTGTTTCATTATCTGAGCAAAGTAAATTGGAAAACTGACAACTATGTGCATAT GATGTTGAGTGATTGATGTTCATACTTGATGCTTTGATTTCCTGGTAATTATTCTTGTGTATTATGTGAGCATGAATGAA ACATCATTATTTTGTGATCTAGAGTCTCGTAATTGGTGGAGCATGAATTTTGAGTGATTGAGGAGGGTTATTCATTGGAT TATGGCGATTGGTTACATATGTTAGGATTATCCAGGAAAATGAGGCAGATTGGAATATTTTCCGTGTTTAGTTCTTTTGA ATTTGTAATATGCAAGAGATGGGCATGTTATAGGAATCAAATTCTTCTTTGCAAGAGAGAGGGAGGGGGATGAGGGTGGG 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CAAAACAGGAAACGTTACCAGATAAAAGGGCCGTAATAAGACGCCTAGGGTTTTTTCCGCAGAAGCAGAACTCCCAAGAT CGGGAGCTCTGATACCAACTTGAAAGTAGGAGAAATTGTATTATTACTTCTTAATCAGAATACAAAGGGTAATTACATTA TATAGAAGAAGACTAATCCTAAATAAGGAAATAACTAATTATGTACACAATCTCCTAATAAGAGAATAAATCTCCTAATA CTGAATATAATCTTCTAATAATAATTCTTATATTAATTCCTTATTTATTTACAACATGAAGCAAATTTAGGTATCTGGAA TTAGCTTCTTAATTAGAACAGGTGAGTATCTTCATATACCATACATAATAAGCTTGCCTTCCATGTTTGAATGGATTATT CTTACTGTCAAGAGACAAGAGTCAATATATTTTTCAACTGCTATGACTTGCATCAATCAACTCTTGTTACTCACGATTTG TTGAGAAGTCTCACATTGAGTAGAAATATGGCCAAATAAGTGTTTATAAAGGGCAGAGCAACCCTCACCACTAAGTTAGC TTCTTGGGTAGAGTTAGGTTTAACACATTCTAACACGACTATCAACTTCATATATGAAACATCTTGGAAATCATGCTCTT GATGTATACGTGTCCTATTTTCTGGTGCAGGAATACATCACAAGTTTTGAGTTGTAAAGGAGGTCAAGTATTTGCAGAGT TTCAAGTAGTAGCAGCGGCGGTAGCTGCTGGCTGCTGCAACTTCTAACACTCACATTTGCTACTACAAGATATTAAAATT CTTTCATTTGTTTTTTCTCTTCTAATTTTTCACGTAAATATATGTAGAGGAAATAACCTATGATTTGTCTTGGAGGGACT TTACCAATAGGATCAAGAGCTAGTGTTTGATTGCTTCTATCATGTATATGTGTGGTTTCTGTGATTGAGGCGTGTATTGT ATGTAATGTAATCAATGTAATTAAAGGTATATTTAGTTAAGATGGTTTTGATTGTCCAATGTCTCCTGCTCATTGTTGTC AAATAGCGGCGTAGCGCTCTGAGGGCCACTGCTATCTGATATGACATAGCTAGATTTTTGGCTTTTTGCTATTTTCCGCG ATTAACAACACTGCTCCTGCTTTTAATGTTACTCCTTGATCTTTGATCAACAGCAATAAAATACAGATTTGCTAAAATTT GAATACATTGAGAAATACCCATCTACATTTCTTTTCTTTTTTTACTGTATCTTTCTTTTACAGTTAAGTCTGTTTAGAAT CATGGAGGCAGTGGTGGTAATAAAATCTGTTCTTATTGTGGTAAGCTTAGGCATACAATAGAAACATGCTACCGAAAGCA TGTAGAATAGTTACACCAGTGTTATCAATTGAAATATAGAATTAAATTCATATTGATACATAATACATTTATATTGGCAC TTGAATTTAAATTTATCTGCTTTACTACTTGATATTATAATTCATATAAATTTTACCTAATAAATAACTCTCAAACTTTT GGATAAATTTCCTTTTCTGGAGACTAATATGACCAATTAGTGGTAAAACAAATTGTGTTTCTGGCATAACAAAAATCTGA AATCGAGAAAGGGACATGGGATATTTTGTATGATCAGATTTTCCTCTCCATTGCCCACCAAAGTCCAAAGTTCAGAACAA GATATTTTATAGAAGAAAATCTTCCACTCATTATAGCAACACACTTGAACCAAACCAGTGTTAGCTCATTGATTAGTTAA GGTAGGAACAGAAATCACTACCAATCTATCTACTACTCGTTCTTTCTTCTATCAACTCCTCCAATGTTTCTCTCTCACTA CCACCATCACCATCTTCTCTTCTCAAACCTCCCTGTTCCTCTAACACTGACACACCATCACTCATCCTTTTCACACCCTC CACCATCTCATCTTCTTCATTTTCTCCACAGACCCACAATTATTCCTCATACTATTTCAGCCATTCCTCCAACACTTTCA TCATGGCTAACCGAACTCACCACCGGAACAGATGACCCTTCTTCTACCATCCAAGTCACTTCCACCATTCTTGTGACCGG AGCCATCACTCTCTTCTTCTTTCGCACTCTCCAGCGCCGAGCAAAAAGAGCCAAAGAATTGGTAAACTCTGTTTTGCTTC ACACTGATAGAATATGAAATATTCTTCCAGTAATTACGCCTAATTTATTGTAATTATATTTATTCCTAGGTTAACTTTAC ATGTATATATACTCTTGTTACTGATCAATGAAAGACACCAAATTATTCCATAATCTTACATGTAGGAAATATTCTTCTAG TAATTATGCCTAATTTATTGTAATTATATTTATTCCTAGGTTGACTTTACTTGTATATATACTCTTGTTGATGATCAATG AAAGACATCAAATTAGGCCCTGTTTGGATAAACAGCTTAATTAAGCGCTTATGGTCATAAGCGCTTATGACATAAGCGCT TATTCATAAGCTATTTTTAAAAATTTATTGAAATAAATTAAAAATAAGCTGTGTATAAGCATAAGCTGTTTTTCATAAGC TATCCTGAGTAGCTTATGAAAATAAGCTGAAAATAGCTTATGGCAGACCATAAGCTGTTTGCATAAGCTCTCCCAAACAC TGGCATAAGAGCTTATGCTGTCAGATAAGCTCAAATAAGCTCTTCCAAACTGGGCCTTATTCCATAATCTTACACACACA AATTACAACTACAACTATTTCATTATATCGTACATGTTTGGAATAAAAAACCACCCGAAAATCATAGGCAATAGCTTATG TCCACATTGATTTTAACTTCACCGTTATGATTTTTGAACAAGTTCCCAAACATCCACTTAACATCAAAATTTATGTTCAG CTATTCTTAGAAACATGTGTAAACATCTCAATGAATATTATTTTAAGTTAAATTTTTCACATAATATTGTCACTTCAAAT TTTTTTCGTATTGAAATTTCAATAAGTTCTTACTATGGTTTTAAGTTGTGTGGTTGTGGGCATTTTTGGAATCCAGGAAA ATGAGCTTATGTGGCTGCAATTGCAATCACGACAGGATCGTGCCGATACCTTCTAAACCTTAATGTCGCGATTACGGAAC TTGATTTAAATCTCTATGAAGTTCTTTCGTATTATCTATAAAAAAAACACACATAATACGAATGTTAACATGAGAAAACC ATAATTTCAATTTTCACATATACACACACAAATGAGTTCAAATCAGGAACTTGTAAATTAAAAATAAAAAATGCCATCTA GCTTTGTTGATTTGCATTTTCATGTTAACTAGTTGATATGTGATGTTATGGTTAAGTTTGAGTCTATATTGTTTAATGAA ATGAGTTGTTGTCTTTAGAAATTTAGGTCCTCTGGAGTGAACAAGTCATTGGCTTCAACTTCCATTAAAGCTAAGAAACG ACCTTCACCTGATCAAGCATTGTTGGGAGCAATTATAGCAGGTGTTATTGCTGTTATTCTCTATAGGTTCACTACAAGCG TAGAGGCAACTCTGTATCGCCAAACAATTTCAGATAATTTCTCGGTTTGTATCATGTCCTTTTTCTCTGTCCTTACTTAT TCTTTACTAAAAACAATTTTGTTCCTGTATTATTGAAAATGGCATGCTTTTCAGGTCCGCCAGGTCACAATCACCATAAG GTTCCTACCATAACTTATCTCTCATATGGTTTCATTTTATTAAGCTTCTAACAAAAAAATCATCTGAAATTTTCTCACAG GACAATAATAAACGGCTTGTGCTACCTTGCTACATTTGTCTATGGCATAAATTCTGTTGGTTTATTGCTCTATTCTGGTC AGCTTGCCATGAACACTTTTGAGGGAGGACCAAGTGGAAAGGAAACTGAAAAAAGAATCCTTGAGCAGTCAGGCTCATCA AATTCATCAACTGATAAACTAAACAGCACAAAGGAAGATGAAAATTCCAATAATTCACAACAATGAAAGTCCATTGGGAA AGTAATTCACGATTAGAAGTGATCAAGTTCATGTTGGTCTGTAAAGAGGTTCTTTGTAAATACAGCATTGTTCAAAAATA GTGGTGGACTTGACTAAATCCAGTTAAATGGTGGTATCAATGTTTCAATTATATGGTAATCTCTTGACTTAGGTATTGAT CTGAATATTGCGCAAATCTATATACCTCGTTTGTTGATAGTTTGAAAAACCGATTACTGGTTCTGTACACCTGCATGATG TCTCTGTTGACTGTTTTGGCATGCCTGAAGGAATTTCAATTTTGCAATCCAATTGATCGGTATGTTTCTCGTACTAAAAA AGCATTGAGGGTTGTCGGCACAAAAGAGGTGTTTAAAATTATGGAAATCATCACATTGAACATTAAAGAG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0115800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCGCAAATGGCTCAACATGCGGACCAACGAGTCTGATTACAGTGCTGATCCTGAGGATGATGATGATGATGAAAGTGA TTCAGACAATGAAGAGTGGGGAAGACAGTCGCGGTTTATGGTCAACAGAGGTGGTGAAGCTCCACTTGAATCAAATGATT TTGTTCCAAGGTTAAGGAGACAAAAGTCATCAACTTATAGATCTCAGTATATAAACACGAAGGATTTGAGGGTATGTGCT GGAACATGGAATGTTGGAGGTGAACTTCCACCTGATGACCTAGATATTGATGAATGGCTTGGTGTCAGTGAACCAGCTGA CATCTATGTCCTCGGTCTTCAAGAGATTGTACCCTTGAATCCTGGTAACATATTTGGTGCAGAAGATACTGGTCCTGTTC AAAAATGGGAGAATATTATTCGGGAAGCACTTGATAGAGTTCGACCTACAGCATCAAGGATAAAATGCTTCAGTGACCCT CCATCTCCATCAAAATTTAAGCCATCAGATGATATCCCAGATATAGAAGATGAATTATTATTTGAAAGTGATAGTGATGT TGGCGAGGAAATCCATCCTTTGGTTGAAGAACAGACTATTTGTGATGGAGGTACAAATGGATTAACCACAGGTAAAATCG TGAAAGCCAATTTATTGGCTTCCAATGCCACTGATACTGCCAACTCTCGTATTCCGGTTAACATTGATTTACGGAGACAG TTTTCTTTTCCAAAGAGGTTTGATAGGCTACAAGTTTCATCAGAAAATATGGATACATCATTTTCCCAACAGACCACTAA ATTAACCAGAATGCTAAGTGGGTCTGAAAGAATTGGTTTGAGCTGGCCAGAGCCTCCGCTACATCTTCTATCCCAGCGTG TTTTGGAGAGACCAACTTCTTTTAAATCAGTCAAATCCTTTAAATCATCGAAGTCATTTAAAACATATAGTTCTTTCAAG TCAATTATGGATGAAATACCAGTAATAGGTTTTCTTCCTGAAGTTGATCTTGAAGCTTTAATGAAGCGGAAAAGAAGATC ATCATATGTAAGGATTGTGAGCAAGCAGATGGTTGGAATTTTCATCACCGTATGGGTTCGTCGGAGCTTGCGCAAACATA TTCAGAATTTAAAGGTTTCAACTGTTGGTGTCGGTCTTATGGGCTATATTGGTAACAAGGGATCAGTATCTGTCAGCATG TCCATATATCAGACGCTTTTTTGTTTTGTATGCAGTCACCTTACATCTGGTGAAAAAGAAGGAGATGATCTTAAAAGAAA TGCTGATGTTCATGAAATTCATCGTAGAACACATTTTCAATCACTCTCTTATATTGGACTTCCCAAAACAATCCTGGATC ATGAAAGGATAATTTGGTTGGGTGATCTGAATTACCGAATCAACTTATCAAATGTGGAAACAAGAGCTCTCGTCTCAAAA AAACAGTGGTCAAAATTGATTGAGAAAGACCAGCTTATACGAGAACTCAGAAGTGGTGTATTTGGAGGATGGTCAGAAGG CATATTAAACTTCCCACCAACTTATAAATATGAGGTTAATTCCGATAAGTACTATGGAGATGATCCCAAGGTTGGGAAGC GTGCACCAGCATGGTGTGATCGTATTCTTTCATATGGCAAGGGGATGAGGTTACTGAGTTACAGAAGGTCTGAGCTCAAA CTGTCTGATCACAGACCCGTGAGCGCCACATATGTGGTCGAGGTTGAGACGTTCTCTCCGAGGAAGCTACAGCGAGCCCT GACTTTTACTGATGCGGAGATCGAAAATGAAGCAAATTTAGGTATCTGGAATTAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0115800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MRKWLNMRTNESDYSADPEDDDDDESDSDNEEWGRQSRFMVNRGGEAPLESNDFVPRLRRQKSSTYRSQYINTKDLRVCA GTWNVGGELPPDDLDIDEWLGVSEPADIYVLGLQEIVPLNPGNIFGAEDTGPVQKWENIIREALDRVRPTASRIKCFSDP PSPSKFKPSDDIPDIEDELLFESDSDVGEEIHPLVEEQTICDGGTNGLTTGKIVKANLLASNATDTANSRIPVNIDLRRQ FSFPKRFDRLQVSSENMDTSFSQQTTKLTRMLSGSERIGLSWPEPPLHLLSQRVLERPTSFKSVKSFKSSKSFKTYSSFK SIMDEIPVIGFLPEVDLEALMKRKRRSSYVRIVSKQMVGIFITVWVRRSLRKHIQNLKVSTVGVGLMGYIGNKGSVSVSM SIYQTLFCFVCSHLTSGEKEGDDLKRNADVHEIHRRTHFQSLSYIGLPKTILDHERIIWLGDLNYRINLSNVETRALVSK KQWSKLIEKDQLIRELRSGVFGGWSEGILNFPPTYKYEVNSDKYYGDDPKVGKRAPAWCDRILSYGKGMRLLSYRRSELK LSDHRPVSATYVVEVETFSPRKLQRALTFTDAEIENEANLGIWN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 348 | 348 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 52 | 52 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 599 | 599 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 599 | 599 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 15 | 30 | 16 | - | – | |
| Gene3D | 54 | 158 | 105 | 1.7E-15 | ||
| SUPERFAMILY | 55 | 592 | 538 | 1.33E-65 | ||
| Pfam | 81 | 564 | 484 | 2.2E-12 | ||
| SMART | 246 | 579 | 334 | 2.7E-53 | ||
| Gene3D | 318 | 600 | 283 | 4.5E-88 | ||
| Phobius | 349 | 366 | 18 | - | – | |
| Phobius | 367 | 604 | 238 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Phosphatidylinositol dephosphorylation | The process of removing one or more phosphate groups from a phosphatidylinositol. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0115800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…